NA ----> NA
Intron 1 GTTGTCTTAA ... CCCTATGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 52.94 | 8 | 7 | 11 |
| A2 | 60.98 | 8 | 11 | 14 |
| A3 | 58.33 | 5 | 7 | 7 |
| A4 | 93.1 | 1 | 16 | 11 |
| A5 | 64.71 | 3 | 6 | 5 |
| A6 | 61.5 | 42.3 | 69 | 66 |
| A7 | 55.13 | 49.3 | 48 | 73 |
| A8 | 61.9 | 28 | 47 | 44 |
| A9 | 54.76 | 38 | 39 | 53 |
| A10 | 54.49 | 34.3 | 46 | 36 |
>TRINITY_DN42053_c2_g4_i1 from sample A6 / Example spliced isoformGACAGAAATGGCGGTGCAAGCTAAACATATTCTTGTAATTTCAGGGTTTTGTGAAAGACTGTCATCACTGGATGCCTGGTCGATTGAATGTATTTGGTTTGTGTTAATATAACATGTGACGGGGATGGGATGCTTCTCGCTAGAGCTCCTCTCCTCACAGCAAGGAGCGACTAGATTAAATGTCGTAGATTCCATTGTGA
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>TRINITY_DN42053_c2_g4_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:GACAGAAATGGCGGTGCAAGCTAAACATATTCTTGTAATTTCAGGGTTTTGTGAAAGACTGTCATCACTGGATGCCTGGTCGATTGAATGTATTTGGTTTGTGTTAATATAACATGTGACGGGGATGGGATGCTTCTCGCTAGAGCTCCTCTCCTCACAGCAAGGAGCGACTAGATTAAATGTCGTAGATTCCATTGTGA
ACGTCACACAGCAAAATCCTGCCTGTTGATGGCGCTCATTATTCCACCAACTGCTCTCTCACTGTTCTTCCTCTGTGGAGACGGGCGAGTAGAGTAGTGGGAGAGTAAGAAGAAGCCTCCTGGCAGAGGAATGTTATATTCTATGGCCCTGGGTATTGCGGCATCGTTGCTATGACCCCTTGGGACAGGCCATAACATTC
ACATTATATTGCAGATATACGCATCTGTTGAGTCCCAGgttgtcttaatttaagttgttttatttccctttgtatgttgttcagggaattatttttctgtctaaccgaaatcgctaccctatgaagGCGTTTTCTAGGGTTTTGACGCGGGGTTTATTTGCTGAATCATTTGATCATTGAGTGGTGGAATATATTGGACA
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GCTAAACTACAGATGAACAATAATTAACATTCCTGTAAATACAGGCCGATGGGAATGTTAATTGTTTCACTGTCTAGACATATTACATTGGATTTACAATAATGAAATTCCTTGAACCCTTTTAACTGTGTAGTGGAATATTACTTTGTTTTGTCCCCTAATTCCTATATTGGTTGGGAATTCTATTTCTTCATTTTCCA
TAATAAATGGGCCTTCCAACTATTGTGGGTTGCTTTGGCCATTGAGTTGCAGCAAACAGTTAATTACTTATAGTTTAAGAAACTTAATATGGTGTTATTATTCTTACTTTTTCTTTATGCGATCTCCTTCTCGGATTTACAATAATGAAATTCTTTGAACACTTTTAACTGTGTAGTGGAATAT