NA ----> NA
Intron 1 GTAGTGCTGA ... TGGAGTCAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 68.32 | 32 | 48 | 90 |
| A2 | 74.32 | 15 | 33.8 | 53 |
| A3 | 66.34 | 24 | 44.6 | 50 |
| A4 | 55.26 | 34 | 35 | 49 |
| A5 | 70.38 | 8.4 | 22.8 | 17 |
| A6 | 59.67 | 73 | 93 | 123 |
| A7 | 60.93 | 134 | 165 | 253 |
| A8 | 60.36 | 171.7 | 212 | 311 |
| A9 | 62.52 | 122 | 198 | 209 |
| A10 | 62.21 | 87.7 | 118.7 | 170 |
>TRINITY_DN110697_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoformCTATTGGCAATTCTTCCTTTTTGCATTCATCAAGCACCAATTTGTCATGCTTATTTAACTTTTAAATGGTATTTAATTAGAATCTTGTCATCACTTTTCCTTTTACCCTTACATACAATCTCTGCACTAGCAAGAGCACCTTGTTTCTCCAACTTTTATTTACTTTTACTTTGTTGAAAGGTTTATTTAGGATTTCTAGC
ATGAAAATAGTTCCTTACTCTTGGCCTTCACCTTTTCAACAATATATTTCAATGGGAGGTAATGATGAACTAGTGAATATTTGGGAGTGAACCCATAGCTTCCGCCTGACTGTTTAAAAGTTTGTTGGTCACTATCTTTGATTGTTGATTGGTCTTCTGCTATGATCCCTCTAGCCATTATAAGGGGTTGTTCACATAAG
TTAACTGTAGCTTAGCCTAGAACTGAGCCCACATGTGTAATGAGTGAGAACTAGTGGATATTGGAGATTATTATAGTCATTCACACACAAATTTATATGATTCTCTGATGTTATCACCTTTTGAGGTTGCTGGGAGATATTCTCCTATTTCTTAGGAGTTTTTTTGTTATAATACCAAACACTCTTTATTGATGTCTTGT
TTACGTATATATAGGTATTAGGTTTAATACATTTATGTATGATTTTTTCTAACATATATTACAATCTCCATCTAATATGCATTGTTTATAAAATTCTTTTGAATTTGAAATTTTTATTTGAAACACAATGGGTTGCAGAGCCATTGAAGCAGCAGAACAACTCAAGGGACAAGTTAATGACAATATATGGATGAAGGGGT
TTCCTAAGTGCCATTAGAATGGTGGCAAGTGGACGTGCCTGAAGTTTAATTCATGTGTTGATGTGGAACGCAGCAAAAGTTTTCTGTGGGTGTCAATGATGTAACTCGCACATTGGAGAGAATGCCCATTGTGAAAGCCATTCGGAGCATTACACCTGATATCAAGCACCCAGAACTTGTGCCAGAAACTTTTGACCACC
TAACCACAACAGAGGATGGAGATGTTGGACCTAATAAACAATCTTGTAGTAGCTTGAAGACAACTGGAAAACAAGCTGTCCTTCTTCAAGTTGGACAATCTACGATTAACAAAGCTATTGAGGACATTATTGATCATCAGTCAAGGGGGCATAATGACAAGGTGGCTGTAAAAGCGAAAGATATAGCTTCAGATTGAAGG
AAATTTTGTCATATTTAAATTTTAAATCGAGTCAATCATTGGGAGACTTTGGATTGTCACTAATGCAATTGAAAGATGGTCTTTGGGTCCTAATACACTTTGGGTCCTAATACATATAGTCAGATTATAGAGTATACAATTGAAATATGGCCTTTGGATTACTGGTACGATCAGATAGATTATAGTCTTACAATCCATGT
AATATTTTTATGGGAATTTGTTACGGAAATGATATCAGGTAGAGTGCCACTGTGTAGAGAGCCACTGTGCTTTGGTGTTTCACTTCCGTGCAACATGACAAGCAGTTACAAAGAGGAGGCTTTGCCAAGCTAAGAAACACTGTGAAAGAAGCACGCACCTTGATTAACTGTAATTATTATTGCGGAAAACATTCTTTTAA
GTAACAGTATAACTTTCTACCTAGCTAATTTTTAAAGCAGATAGGGTTCCTTGTAACCATTTGCAGTAGCTTTGTGTTTTAAATGGAGCTGTAGGGTAAAGGCATTGGGAAGGTGACGGATGAGAAAAAAGGTTTTAATTAAAATTGAAATGTTGCATCTATAGAACTGGCAGTTTATCATAAAGCTGACAAGACCTCGA
ATTTATTCTCTTTTATGTGCAGCATTGCATACTTTTTGGGGTCTTGGTTAATATTCAAATTTATCTTTGTCAACATTTTATGCAACATTGTTCTAGTGCATATTTTTTTTTCTTCATACATTCTGGGGCCAATAAAGATCACCCATTGATTGTTATATCTGGGAATTTTGTCACTTCTGTTTGGAGGTCCAATGTTCAGT
TCTTCAGTTCACCGGAATTAAAATATGGATTTTATGGACGTCATAGAAAAGCATCATGCACCTTTGGACGTGTATTGACTGAAAAGGGTTGCATGCTTCCCTCATTTAACTATTATGTACTTTTTATGGTATGTATATTTTGCGAGTTCCACTAATGTAATATATGGGTGGCATGCGATTGGTTACAGATTACACCTTTC
TTTCCAGATCATAATATACTATCAACGAAGTATGCTAGTATCAGTAATCATTTTTTGCCCAGTCCATGTAATGACCGAGGCCATTGTCTAACACTACCTCGTGGTGTACATGGGATACTCAAAAACAAATTATGGAAGTTATTGAAGTATTGATATTGTCTAACACTACCCCG
>TRINITY_DN110697_c0_g1_i5 from sample A3 / Example unspliced isoform:TATTAAATCACCGAAAAAGAAAGGTTACTTGGTTCTGCATTCCACACCTTTGAGTGTGGCAGAGCGGGGCATTCTCGCCACCCCTGCGTACACTACATTCATAGAAGATTGCTTAGTTCCACACTAAGGACCGTCGAATTCATAAAGAAAAGATTCGAGGCAAGGTGAACAATGGGAAAGAAGAGGAGGATTTTAGCTTC
TAGAGCAGCCCCCAAAACAGCGGAATTAACCTCTCAGCAACTCAAGAAGCCAAATCCAAAAAGAAAAGACCTGGGAGCAAGGCGAACAATGGGAAAGAGGAAGAGGAAAGCAGCAGCAGGTAGAACAGACCCAAAAACAGCGGAGTTAGCCTCACGGCATCTCAAGAAGCCAAAAACATCGCACTCTCAGCTCGCAGAGA
GTCCTGGCGGTGAATCAAAAGCCAACAGCGGGCTCAACAACCTGCTTGCAAATGAAAACCAGAAACTGGAAACCCCCTTGTCCGCTGAGAATGTTAAGAAGAAGAAAAAAAAAAGCAGGAAGAAGCCCAAAACATCACACTCTCAGCTCGCAGAGAGTCCTGGCGGTGAATCAAAAGCCAACAGCGGGCTCAACAACCCA
CTTGCAAATGAAAACCAGAAACTGGAACCTCCCTTGCCCATTGAGAATGTGGAGAAGAAGAAAAACAAAAACAAGGTTACGAAAAATTCAGTGAATAGGGAAATCTTCAAGCAACAGTTGAATAAGGGAGCGATTATTTATTTCAAAGGAGGGCCTCTTGATGAATTGCTTGAAAAGTTGTCAACCCCCTTGTCCGCTGA
GAATGTTAAGAAGAAGAAAAAAAAAAGCAGGAAGAAGCCCAAAACATCACACTCTCAGCTCGCAGAGAGTCCAGAGCCATTGAAGCAGCAGAACAACTCAAGGGACAAGTTAATGACAATATATGGATGAAGCAAAAGTTTTCTGTGGGTGTCAATGATGTAACTCGCACATTGGAGAGAATGCCCATTGTGAAAGCCAT
TCGGAGCATTACACCTGATATCAAGCACCCAGAACTTGTGCCAGAAACTTTTGACCACCTAACCACAACAGAGGATGGAGATGTTGGACCTAATAAACAATCTTGTAGTAGCTTGAAGACAACTGGAAAACAAGCTGTCCTTCTTCAAgtagtgctgactgcaattgattgccatcctcgattgcttgtcagtcatcttc
ctggcttagcttcaagcagggatgtacctttaatttgtattgcagaccatggaagaggttcactgcgattaggtcaacttttgaaattaaaacgggcaggtgctattggagtcaagGTTGGACAATCTACGATTAACAAAGCTATTGAGGACATTATTGATCATCAGTCAAGGGGGCATAATGACAAGGTGGCTGTAAAA
GCGAAAGATATAGCTTCAGATTGAAGGAAATTTTGTCATATTTAAATTTTAAATCGAGTCAATCATTGGGAGACTTTGGATTGTCACTAATGCAATTGAAAGATGGTCTTTGGGTCCTAATACACTTTGGGTCCTAATACATATAGTCAGATTATAGAGTATACAATTGAAATATGGCCTTTGGATTACTGGTACGATCA
GATAGATTATAGTCTTACAATCCATGTAATATTTTTATGGGAATTTGTTACGGAAATGATATCAGGTAGAGTGCCACTGTGTAGAGAGCCACTGTGCTTTGGTGTTTCACTTCCGTGCAACATGACAAGCAGTTACAAAGAGGAGGCTTTGCCAAGCTAAGAAACACTGTGAAAGAAGCACGCACCTTGATTAACTGTAA
TTATTATTGCGGAAAACATTCTTTTAAGTAACAGTATAACTTTCTACCTAGCTAATTTTTAAAGCAGATAGGGTTCCTTGTAACCATTTGCAGTAGCTTTGTGTTTTAAATGGAGCTGTAGGGTAAAGGCATTGGGAAGGTGACGGATGAGAAAAAAGGTTTTAATTAAAATTGAAATGTTGCATCTATAGAACTGGCAG
TTTATCATAAAGCTGACAAGACCTCGAATTTATTCTCTTTTATGTGCAGCATTGCATACTTTTTGGGGTCTTGGTTAATATTCAAATTTATCTTTGTCAACATTTTATGCAACATTGTTCTAGTGCATATTTTTTTTTCTTCATACATTCTGGGGCCAATAAAGATCACCCATTGATTGTTATATCTGGGAATTTTGTCA
CTTCTGTTTGGAGGTCCAATGTTCAGTTCTTCAGTTCACCGGAATTAAAATATGGATTTTATGGACGTCATAGAAAAGCATCATGCACCTTTGGACGTGTATTGACTGAAAAGGGTTGCATGCTTCCCTCATTTAACTATTATGTACTTTTTATGGTATGTATATTTTGCGAGTTCCACTAATGTAATATATGGGTGGCA
TGCGATTGGTTACAGATTACACCTTTCTTTCCAGATCATAATATACTATCAACGAAGTATGCTAGTATCAGTAATCATTTTTTGCCCAGTCCATGTAATGACCGAGGCCATTGTCTAACACTACCTCGTGGTGTACATGGGATACTCAAAAACAAATTATGGAAGTTATTGAAGTATTGATATTGTCTAACACTACCCCG