NA ----> NA
Intron 1 GTAATAATTT ... TTTTGTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 8 | 23 | 0 | 2 |
| A2 | 30.91 | 38 | 0 | 17 |
| A3 | 23.26 | 33 | 0 | 10 |
| A4 | 30 | 21 | 0 | 9 |
| A5 | 13.33 | 13 | 1 | 2 |
| A6 | 27.91 | 31 | 1 | 12 |
| A7 | 27.7 | 31.3 | 0 | 12 |
| A8 | 20 | 36 | 0 | 9 |
| A9 | 32.91 | 53 | 0 | 26 |
| A10 | 33.93 | 37 | 1 | 19 |
>TRINITY_DN42307_c2_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoformGTCGGCCGCTTGGGGTTATTACGCAAGTTAGAATGTATATGCTCTCGGATCGGAGAGAAGACCAAAAAAAATTAGGATGTAGTGCCCGGGGATTTCTCTCATATATAATCAAACGAAGTCATAACGCGGAAAACACCACTAGTGAGGTTCTTCTGATGGAAGAGGGGACGAAAATGCAATGCAGGCTATGGTGGCCGTGC
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GAGCCTCCTAAAGTTTGTTTACGGCATAGTGGAAGCTCTTCTTCAGTCCCTCAGTGGATGGTTGATCTTGAGCAGCAACGGGAACCTTCTAATCTTGATGTGGTTATGTTAGCAATGAATAATGCATCTGCTGTACAATGTATAGTCCAAGAATCACTGAAACCTCTAGTATGATAAGTTACATATGGAATATGACAGCT
GCAAGTATCGCGTTTGTTGCCACATTATTCTACATCAGTCTTCAGCTTGCTGCCAGGATTCTGAGTAATAGAGCATTCTTGTTTCTGAACATAATCTTTCTGAAATTATTCAGAAATACATGGATAAATTTACGTGTCCGCAGTCGTCAGTTGGTATATTGGCCCGTCATTCTTGTAGGAAGTGGTTGCCGGTTTCAACC
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AAGATTGCATAGCTGATATTCATGTTTCCAAAGAATCTCCCTCACAATCAACTCTGATTACTCGAAAAGGTTTAGATTGCATGGTATTCATCTCTCGAAGAATTTCAGTAAATCAGTTGATTTCATATCGTCTTGGGTCTCAAAATTTGTCTAAAGGAAGATGGCCTTCATTTGAAGAAAGTCCATAGTCTGGATATTTT
GGCCTGGAAGATAAATTGTAATTTTGAAACAATGAAGTTGTTTCTGTATGCTATGTAGCCAAATATGAATATTATTGCTTGTAGATAACAATATGAGATTTTGTAGTCCGTTAATCTTGGTAAAATATAACAGGGTGACATTGGGGAGCACAGTTAGAATTAAAATTTATG
>TRINITY_DN42307_c2_g1_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:TCTTGTAGGAAGTGGTTGCCGgtaataatttttatcttacaactttgcaagttgcttcagcacaaactcttatacacatcccttctatattggttttcaatgtttggaccttgtcttatacacatcccctctatattgaagctttttctgaattaaggttatattttgtgtagGTTTCAACCGAGTGTAGCTGTTGCTCA
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CTTCACAATTCTAAATACTGTAGTCAGCTTAGTATGCATTGGTTTCCAGTTTTTGATATCAATCCTTCATGCATTTCCGTATGCTGAAATAGCCATCTGGCTGTTCCATCCAAAGAGATTTCCTTCTGGAATATGGTTTAAACAAATATGGACACAGAGTTCATCAGGTACTAGATTCAGTGGACCAAAAAAAGTAAATG
TTACAGATTCAGTGACATTGATAGCTTCTGGTGGAACTGTGAAGGAGTCATCTGCTCATCTGATCAATGCAGAGTCACCACCTGGATGTCAACCATTTGATTCTCTCTCTCATGGTTCAGAGACTATCATTTCTGTCCTAGGCACCAATATTGCAAGTTTAGGTGAAGTTATTTCTGCACATCTTGGTAAAACTCTCAAG
GGGTTGTCATTATCATCCGGTGTTTCATGTGCTTACAAAGTCTTCAGTGGAGGAAGAATCCCATCTTATCTGAATTTTGGAACAGCTCCACTCCTGCCCTGGATGTCAATTAGCTTCAAAGAGTTTTGGTGGCTAACGTATGAAGCAGTGCTAGCTTGCCTTTAGACTCTGGAAGTATTTTGGGTTGATTTTTTTATCCA
TATGGATGTTCCAAGTTTATTCCAAACCATCAGATGCGGTAGCAGTTCTTCATTTTTCCCTGCCTCATTTGCTCATTATTTTTGATATTCCCATCCTCGAGATATTGGAATGGCAGGGCTTATGCCCTGGATGTCAATCAGCTTCAAGGAATTTTGATGGCTGATGTTTGGAACAGTGCTCGCTCGCCTTTAGACTGATT
TTGGTGTTTCCTGGGTTGATTCTTCTATTTGATCATCTTACAAGTGGACTTCATATCGTCATATGCGGCAGCAGTTCCCCATTTTGTCTGTGGCGATTCACTTGAGATTTGGTCCTCGATTATATCCTACAGTTTCATTGTGACAAAAAGCTAATTTTTGCCAATTGGAACATAGAGTTGCTATTTGGTCTTAATTTTGT
TTTGCAATATGTTTTATTTTGTGATGATGGCACTTTTCAGATTGAGAGTTCAATTGCAAATAAAATCAAGATTGCCAAACAGACGCATTTAGATTTTTCTGCTCATATTGGATGCCTGCATATTTTGAACTGTCACATGAAGGCATCTGGGATGGAATTCTGACAGATCACCATATATTGTGAGTACTCTTACTCTGTAA
TGGTGGCGTGTATTCAACTTGTGCTAGGTTTTATGCGATCTAACTTGTGTCCATATAACTGCACTTTAAGAGTTGAGTCTACTATCCTGTAATTTACAGTAGGTAGCAGAATGATCTACCTTTAATCTAGTCACTAGATAAGGTTATTGAAGTATCTGTTTCTACATCGTGATATTGGGGACAAGATTGCATAGCTGATA
TTCATGTTTCCAAAGAATCTCCCTCACAATCAACTCTGATTACTCGAAAAGGTTTAGATTGCATGGTATTCATCTCTCGAAGAATTTCAGTAAATCAGTTGATTTCATATCGTCTTGGGTCTCAAAATTTGTCTAAAGGAAGATGGCCTTCATTTGAAGAAAGTCCATAGTCTGGATATTTTGGCCTGGAAGATAAATTG
TAATTTTGAAACAATGAAGTTGTTTCTGTATGCTATGTAGCCAAATATGAATATTATTGCTTGTAGATAACAATATGAGATTTTGTAGTCCGTTAATCTTGGTAAAATATAACAGGGTGACATTGGGGAGCACAGTTAGAATTAAAATTTATG