sp|O49817|LEA2_CICAR ----> Late embryogenesis abundant protein 2

Intron 1 GTGAGCAGAA ... TGTGAGACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	89.74	408	3567	6
A2	90.42	443	4183	7
A3	89.93	562	5017	2
A4	88.09	278	2056	2
A5	88.98	242	1954	0
A6	90.42	5641	53224	9
A7	90.09	4913	44653	21
A8	90.58	6100	58651	17
A9	90.69	6123	59654	6
A10	90.03	3426	30946	10

>TRINITY_DN48972_c1_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoform

AGCAGGGGAAGGAGCAAACTGGCTCTTTCTTCCAACAGGCAGGGGAGAAGGCGAAGGGTGCTACGCAGAGCGTGATGGAGGCTGTGAAGAGCCCCTTTGGTGGTACCGAGCAGAACAACTGATCACCGTTACGGTCTCATGGTATAGGGTGTAGAAGGGACTCTAAAGAATTCAGGACAGAGAGAGATTTAGAATGGCCA
CTGCTCGCAAGGAATCCATCTATTTCGGTTGTCTCCAGTGGCATTGTTGAAAAAAACACTTTATTTTCAAAATCATTATGAAAACATCAAACAATACGTTGATGTTTTTTCATTTTCAAATTCCATATGTTGATGCTTTTTATTTTCAAATTTAATATCGACGATATCAAGAAAGTGCACATAAATA

>TRINITY_DN48972_c1_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:

AGCAGGGGAAGGAGCAAACTGGCTCTTTCTTCCAACAGGCAGGGGAGAAGGCGAAGGGTGCTACGCAGAGCGTGATGGAGGCTGTGAAGAGCCCCTTTGGTGGTACCGAGCAGAACAACTGATCACCGTTACGGTCTCATGgtgagcagaacaagtgatcaccaccacggtctcatgctaagccttactgtaaatgcaga
ttgtaataattttcccatgtttatcaataataaaatgacatgacaagcagatgttgagattgtgtctatgagacgaatattttgaaattttgctctatttttctttcgatttccaacattagttttgctacttttataaagttttcaacatggattatgttaatttgatctaccatttgcctatacaatttgatgtacaa
atgatttatttagtttccattcccatatccacgaggatttacggtgatcctttaataatctccgtaaaattcattgctgtccataaatgagtgtagctagcgattcatcagcatctgagaagtaacacgtcatttgggtttatgtgtagtttgatgtgtatttcaagagtgcgtctagcggtatgtgaactttgctatgt
agggttccttttcttgttaacaattaataacatacatgtgagatgtcacacattccaggtcactgtaattttaagcatacataagcattacaatgccaattacatttcattcatttttccagcgtgcatacacattacgatggcaattttaattgattaataataaatcaattaacagagtttcattagtctgaatggca
attgtaatttttattgataataatcaattaacatcatttcattaattgtgagacagGTATAGGGTGTAGAAGGGACTCTAAAGAATTCAGGACAGAGAGAGATTTAGAATGGCCACTGCTCGCAAGGAATCCATCTATTTCGGTTGTCTCCAGTGGCATTGTTGAAAAAAACACTTTATTTTCAAAATCATTATGAAAAC
ATCAAACAATACGTTGATGTTTTTTCATTTTCAAATTCCATATGTTGATGCTTTTTATTTTCAAATTTAATATCGACGATATCAAGAAAGTGCACATAAATA

Intron 2 GTCTCATGCT ... TGTGAGACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	100	0	1671	6
A2	99.74	5	1924	7
A3	99.82	4	2223	2
A4	99.77	2	869	2
A5	100	0	793	0
A6	99.95	16	31358	9
A7	99.92	20	24552	21
A8	99.94	21	35826	17
A9	99.97	10	35763	6
A10	99.78	33	14755	10

>TRINITY_DN43057_c1_g4_i1 from sample A6 / Example spliced isoform

TGGTGGTACCGAGCAGAACAAGTGATCACCACTACGGTCTCATGCTGAGCAGAACAAGTGATCACCACCACGGTATAGGGTGTAGAAGGGACTCTAAAGAATTCAGGACAGAGAGAGATTTAGAATGGCCACTGCTCGCAAGGAATCCATCTATTTCGGTTGTCTCCAGTGGCATTGTTGAAAAAAACACTTTATTTTCA
AAATCATTATGAAAACATCAAACAATACGTTGATGTTTTTTCATTTTCAAATTCCATATGTTGATGCTTTTTATTTTCAAATTTAATATCGACGATATCAAGAAAGTGCACATAAAT

>TRINITY_DN43057_c1_g4_i4 from sample A6 / Example unspliced isoform:

TGGTGGTACCGAGCAGAACAAGTGATCACCACTACGGTCTCATGCTGAGCAGAACAAGTGATCACCACCACGgtctcatgctaagccttactgtaaatgcagattgtaataattttcccatgtttatcaataataaaatgacatgacaagcagatgttgagattgtgtctatgagacgaatattttgaaattttgctcta
tttttctttcgatttccaacattagttttgctacttttataaagttttcaacatggattatgttaatttgatctaccatttgcctatacaatttgatgtacaaatgatttatttagtttccattcccatatccacgaggatttacggtgatcctttaataatctccgtaaaattcattgctgtccataaatgagtgtagc
tagcgattcatcagcatctgagaagtaacacgtcatttgggtttatgtgtagtttgatgtgtatttcaagagtgcgtctagcggtatgtgaactttgctatgtagggttccttctcttgttaacaattaataacatacatgtgagatgtcacacattccaggtcactgtaattttaagcatacataagcattacaatgcc
aattacatttcattcatttttccagcgtgcatacacattacgatggcaattttaattgattaataataaatcaattaacagagtttcattagtctgaatagcaattgtaatttttattgataataatcaattaacatcatttcattaattgtgagacagGTATAGGGTGTAGAAGGGACTCTAAAGAATTCAGGACAGAG
AGAGATTTAGAATGGCCACTGCTCGCAAGGAATCCATCTATTTCGGTTGTCTCCAGTGGCATTGTTGAAAAAAACACTTTATTTTCAAAATCATTATGAAAACATCAAACAATACGTTGATGTTTTTTCATTTTCAAATTCCATATGTTGATGCTTTTTATTTTCAAATTTAATATCGACGATATCAAGAAAGTGCACAT
AAAT