NA ----> NA


Intron 1 GTATTTTTAC ... TCCTCCACAG

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A161.545610
A281.441520
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>TRINITY_DN38758_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform
CACGTTTATTGCTTCAGTCACAGACAGTTGGAAAATGGAAAATTAAGCGATTAGTTCCTCGTGTAATGGATGTGACCAGGGGGCAATCTGGTGGCCCGGATAAAATTAGACATGTATATTTGGAGAAAGTAAGAAACCTGTGGGAGAGATGTCCCGAACCAATAAAAGTCTTTCCATGGGGCAGAGCCTACAATAATTTT
TTTCACCGCTTATTCAGGCTCACATTTGAGGTGGCGAAGTGGCTGTTCATTCCTGTCCTGTTTGTGTCATCTCTAAGTGAGATGACCTACTGTGGATGGCAAAATAAGGAGCTGCTTATACCTATTGGCATGTTAGCTGGCATTTATCTTGCAGGAATTTTTAAGGAAACTGCAATCGAATTATCAGAGAATCTTCAGGA
AGGAGGGTTTCCATGGCATCTTGTCATAATAGGGGCCTTTTTTGCATTGATCAAGTTTCCTGGCCCTTATTATCCATATTGGGGACGCATATTTCTTCCACACTTCGCGAATGGTGGGTTGTGGAGAACACTTTGGTTTGCCCACATCTGGTATAAAGGTCAATTCACGACAGCAGAAGGAGAAACCAACCTTGGGACAA
ACTTTGAATAAAAATACTGGTCAGGCACAGGAAAAGGCTGGGAGTCTAAGGAGATGGTTTGGGAGAAGGAATTATTGACTATAGAGAATATCGAGCAGGCAAAACTGCAAAGATATATTGAAATTTGGTACTTTACGAGTCCTGATACTTGTAAGAATTTTGCAGAGACAGTTTAGCTGGTCAGAGGTTCCTAGGATGCA
ATGCTGTACCTCTGCTTCGCATGTTAGACCAAGGAGAGCATATCGTTTTTATGGTATGCACCAATTTCTTTTACATAACTGAGGGATACAATAAATTGACAGGGAAATCTTTCTGGAACAAGTTGACAGGGAAATCTGTCTGTATTCTTGTTCTCTGTCAGAGTATTTGCAATTAATTTGTAAATGTTAAACACAAAGGT
ATCTTCTGCTTTCTTGTAGTGAATTTCTGTGACAGCAATCTTTATGGGAGTTTTGGTATGGATTTATCTACTTGGAGCTAATAAATCTACATAAATGCAACGTGCTATATCTGTCATATCTTTTGCATCTCAAACAAAATTAGACCATTTCAGCAGAACTGTATAATATATCAATATGTCAGGAAGAGAATCTGCAGAAG
TTGCCATGATAAGATATAATCAATACAGTGGCTCTATGCAGGCTCGATTCTTGGCAAGGTTTATTTTGTTGTTGCATGTAGGTTTTTGTTCTATGGGCCCTGCTCCTTTGTTAAATATTCTGGACTTCATATTGATTATATGATTATATCCCCTTGAATTTTATTACATGAGCTAGATGACTTAATGACGAAACCCTAGA
TAGGGTTGAGCCACATCACTGCAGATAAATGAGAGATTACACAATAACACATTATTATATTATGAAAATTAC


>TRINITY_DN38758_c0_g1_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:
TTTGGATAAATTACACTGTATCATTATCCTTGTTTACCTTTTGACAATTAAAACCCAATATACTCTGTTTATAGATATAGTAGCTCTGAAGCGCTCGTATTCCCCTAGCACTGGTCACTGCATGAAGGACACTCAGGTTTACTAGTAGAGATTAACCAACTCACGCGAGCGAGACTATTAAGAATCCACATTAGCAATTC
ATTTCAAGTTACCTTTATACACTTCATTAATCCTATCCAGGGAAAAGCAGCAGAGAAGAAAACAATGGCGCTGCAAAACCCTACTTCACAGCTCTCAGTGCCACCCAACAATCTTATCGTAACAGCTGGAATGAATTTTGGAAGCAGACACTCACGTTTATTGCTTCAGTCACAGgtatttttactcctgttcttttggg
gtttggtatctcttttctgctggatttgcctcgctgcactattatttgttattgtagtttaaattttagatttaggttgtagggtataaagcgaggctacagagcaaaatgtcaaattgaattatagagaagtagcctttaacttttgttggcatacaactctctcccttcttcaaccaaaatacccgttataccaattg
ttgataaacgacttactcatgaactggcatcaggtcttccattggaaaaaatgaaagtatatacttttaagctaacattgaattacgaatacgactctacacaaattcacaattcgaattctaactcacaggttggaatcagaatctgtcatcttaagcatgacattgcacacgtttgaaaagtctccttataagcctaa
atcagcactgggttatggttatccattaattgagttcagttacaacgaagcagaccggagtccaatttcaaatcaatgttgcatagtaacagctagtccccaacttatgaatggatacagtgagttgggtaatttggcttgtcaccgccaagcccagtggcacgttttccatcttcctagtttcaacttttctctgagct
tatgtttggggtaaatgtagacatcgactttctaggtagtcgtgaaactagttagctgctccggagtcaatcgttaatctgttttcgaactcttttgcttttagactgtcctgcatttaatctggttctgttttatttctctcgaaaagcagcttgctcacttccgaaaggtctcatcagtttcaagtcctccacagACA
GTTGGAAAATGGAAAATTAAGCGATTAGTTCCTCGTGTAATGGATGTGACCAGGGGGCAATCTGGTGGCCCGGATAAAATTAGACATGTATATTTGGAGAAAGTAAGAAACCTGTGGGAGAGATGTCCCGAACCAATAAAAGTCTTTCCATGGGGCAGAGCCTACAATAATTTTTTTCACCGCTTATTCAGGCTCACATT
TGAGGTGGCGAAGTGGCTGTTCATTCCTGTCCTGTTTGTGTCATCTCTAAGTGAGATGACCTACTGTGGATGGCAAAATAAGGAGCTGCTTATACCTATTGGCATGTTAGCTGGCATTTATCTTGCAGGAATTTTTAAGGAAACTGCAATCGAATTATCAGAGAATCTTCAGGAAGGAGGGTTTCCATGGCATCTTGTCA
TAATAGGGGCCTTTTTTGCATTGATCAAGTTTCCTGGCCCTTATTATCCATATTGGGGACGCATATTTCTTCCACACTTCGCGAATGGTGGGTTGTGGAGAACACTTTGGTTTGCCCACATCTGGTATAAAGGTCAATTCACGACAGCAGAAGGAGAAACCAACCTTGGGACAAACTTTGAATAAAAATACTGGTCAGGC
ACAGGAAAAGGCTGGGAGTCTAAGGAGATGGTTTGGGAGAAGGAATTATTGACTATAGAGAATATCGAGCAGGCAAAACTGCAAAGATATATTGAAATTTGGTACTTTACGAGTCCTGATACTTGTAAGAATTTTGCAGAGACAGTTTAGCTGGTCAGAGGTTCCTAGGATGCAATGCTGTACCTCTGCTTCGCATGTTA
GACCAAGGAGAGCATATCGTTTTTATGGTATGCACCAATTTCTTTTACATAACTGAGGGATACAATAAATTGACAGGGAAATCTTTCTGGAACAAGTTGACAGGGAAATCTGTCTGTATTCTTGTTCTCTGTCAGAGTATTTGCAATTAATTTGTAAATGTTAAACACAAAGGTATCTTCTGCTTTCTTGTAGTGAATTT
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AGTGGCTCTATGCAGGCTCGATTCTTGGCAAGGTTTATTTTGTTGTTGCATGTAGGTTTTTGTTCTATGGGCCCTGCTCCTTTGTTAAATATTCTGGACTTCATATTGATTATATGATTATATCCCCTTGAATTTTATTACATGAGCTAGATGACTTAATGACGAAACCCTAGATAGGGTTGAGCCACATCACTGCAGAT
AAATGAGAGATTACACAATAACACATTATTATATTATGAAAATTAC



Intron 2 GTATTTTTAC ... CGAAAAGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A12524610
A226.32421515
A322.3147216
A424.48542411
A546.67877
A621.171214718
A719.542107131
A824.841154729
A919.561834940
A1019.361774045



>TRINITY_DN38758_c0_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoform
TTTGGATAAATTACACTGTATCATTATCCTTGTTTACCTTTTGACAATTAAAACCCAATATACTCTGTTTATAGATATAGTAGCTCTGAAGCGCTCGTATTCCCCTAGCACTGGTCACTGCATGAAGGACACTCAGGTTTACTAGTAGAGATTAACCAACTCACGCGAGCGAGACTATTAAGAATCCACATTAGCAATTC
ATTTCAAGTTACCTTTATACACTTCATTAATCCTATCCAGGGAAAAGCAGCAGAGAAGAAAACAATGGCGCTGCAAAACCCTACTTCACAGCTCTCAGTGCCACCCAACAATCTTATCGTAACAGCTGGAATGAATTTTGGAAGCAGACACTCACGTTTATTGCTTCAGTCACAGCTTGCTCACTTCCGAAAGGTCTCAT
CAGTTTCAAGTCCTCCACAGACAGTTGGAAAATGGAAAATTAAGCGATTAGTTCCTCGTGTAATGGATGTGACCAGGGGGCAATCTGGTGGCCCGGATAAAATTAGACATGTATATTTGGAGAAAGTAAGAAACCTGTGGGAGAGATGTCCCGAACCAATAAAAGTCTTTCCATGGGGCAGAGCCTACAATAATTTTTTT
CACCGCTTATTCAGGCTCACATTTGAGGTGGCGAAGTGGCTGTTCATTCCTGTCCTGTTTGTGTCATCTCTAAGTGAGATGACCTACTGTGGATGGCAAAATAAGGAGCTGCTTATACCTATTGGCATGTTAGCTGGCATTTATCTTGCAGGAATTTTTAAGGAAACTGCAATCGAATTATCAGAGAATCTTCAGGAAGG
AGGGTTTCCATGGCATCTTGTCATAATAGGGGCCTTTTTTGCATTGATCAAGTTTCCTGGCCCTTATTATCCATATTGGGGACGCATATTTCTTCCACACTTCGCGAATGGTGGGTTGTGGAGAACACTTTGGTTTGCCCACATCTGGTATAAAGGTCAATTCACGACAGCAGAAGGAGAAACCAACCTTGGGACAAACT
TTGAATAAAAATACTGGTCAGGCACAGGAAAAGGCTGGGAGTCTAAGGAGATGGTTTGGGAGAAGGAATTATTGACTATAGAGAATATCGAGCAGGCAAAACTGCAAAGATATATTGAAATTTGGTACTTTACGAGTCCTGATACTTGTAAGAATTTTGCAGAGACAGTTTAGCTGGTCAGAGGTTCCTAGGATGCAATG
CTGTACCTCTGCTTCGCATGTTAGACCAAGGAGAGCATATCGTTTTTATGGTATGCACCAATTTCTTTTACATAACTGAGGGATACAATAAATTGACAGGGAAATCTTTCTGGAACAAGTTGACAGGGAAATCTGTCTGTATTCTTGTTCTCTGTCAGAGTATTTGCAATTAATTTGTAAATGTTAAACACAAAGGTATC
TTCTGCTTTCTTGTAGTGAATTTCTGTGACAGCAATCTTTATGGGAGTTTTGGTATGGATTTATCTACTTGGAGCTAATAAATCTACATAAATGCAACGTGCTATATCTGTCATATCTTTTGCATCTCAAACAAAATTAGACCATTTCAGCAGAACTGTATAATATATCAATATGTCAGGAAGAGAATCTGCAGAAGTTG
CCATGATAAGATATAATCAATACAGTGGCTCTATGCAGGCTCGATTCTTGGCAAGGTTTATTTTGTTGTTGCATGTAGGTTTTTGTTCTATGGGCCCTGCTCCTTTGTTAAATATTCTGGACTTCATATTGATTATATGATTATATCCCCTTGAATTTTATTACATGAGCTAGATGACTTAATGACGAAACCCTAGATAG
GGTTGAGCCACATCACTGCAGATAAATGAGAGATTACACAATAACACATTATTATATTATGAAAATTAC


>TRINITY_DN38758_c0_g1_i5 from sample A8 / Example unspliced isoform:
TTTGGATAAATTACACTGTATCATTATCCTTGTTTACCTTTTGACAATTAAAACCCAATATACTCTGTTTATAGATATAGTAGCTCTGGAGCTGACACTCAGGTTTACAAGTAGAGATTAACCAACTGACGCGAGCGAGACTATTAAGAATCCACATTAGTAATTCATTACGAGTTACCTTTATACACTTCATTAATCCT
ATCCAGGGAAAAGCAGCAGAGAAGAAAACAATGGCGCTGCAAAACCCTACTTCACAGCTCTCAGTGCCACCCAACAATCTTATCGTAACAGCTGGAATGAATTTTGGAAGCAGACACTCACGTTTATTGCTTCAGTCACAGgtatttttactcctgttcttttggggtttggtatctcttttctgctggatttgcctcgc
tgcactattatttgttattgtagtttaaattttagatttaggttgtagggtataaagcgaggctacagagcaaaatgtcaaattgaattatagagaagtagcctttaacttttgttggcatacaactctctcccttcttcaaccaaaatacccgttataccaattgttgataaacgacttactcatgaactggcatcagg
tcttccattggaaaaaatgaaagtatatacttttaagctaacattgaattacgaatacgactctacacaaattcacaattcgaattctaactcacaggttggaatcagaatctgtcatcttaagcatgacattgcacacgtttgaaaagtctccttataagcctaaatcagcactgggttatggttatccattaattgag
ttcagttacaacgaagcagaccggagtccaatttcaaatcaatgttgcatagtaacagctagtccccaacttatgaatggatacagtgagttgggtaatttggcttgtcaccgccaagcccagtggcacgttttccatcttcctagtttcaacttttctctgagcttatgtttggggtaaatgtagacatcgactttcta
ggtagtcgtgaaactagttagctgctccggagtcaatcgttaatctgttttcgaactcttttgcttttagactgtcctgcatttaatctggttctgttttatttctctcgaaaagcagCTTGCTCACTTCCGAAAGGTCTCATCAGTTTCAAGTCCTCCACAGACAGTTGGAAAATGGAAAATTAAGCGATTAGTTCCTC
GTGTAATGGATGTGACCAGGGGGCAATCTGGTGGCCCGGATAAAATTAGACATGTATATTTGGAGAAAGTAAGAAACCTGTGGGAGAGATGTCCCGAACCAATAAAAGTCTTTCCATGGGGCAGAGCCTACAATAATTTTTTTCACCGCTTATTCAGGCTCACATTTGAGGTGGCGAAGTGGCTGTTCATTCCTGTCCTG
TTTGTGTCATCTCTAAGTGAGATGACCTACTGTGGATGGCAAAATAAGGAGCTGCTTATACCTATTGGCATGTTAGCTGGCATTTATCTTGCAGGAATTTTTAAGGAAACTGCAATCGAATTATCAGAGAATCTTCAGGAAGGAGGGTTTCCATGGCATCTTGTCATAATAGGGGCCTTTTTTGCATTGATCAAGTTTCC
TGGCCCTTATTATCCATATTGGGGACGCATATTTCTTCCACACTTCGCGAATGGTGGGTTGTGGAGAACACTTTGGTTTGCCCACATCTGGTATAAAGGTCAATTCACGACAGCAGAAGGAGAAACCAACCTTGGGACAAACTTTGAATAAAAATACTGGTCAGGCACAGGAAAAGGCTGGGAGTCTAAGGAGATGGTTT
GGGAGAAGGAATTATTGACTATAGAGAATATCGAGCAGGCAAAACTGCAAAGATATATTGAAATTTGGTACTTTACGAGTCCTGATACTTGTAAGAATTTTGCAGAGACAGTTTAGCTGGTCAGAGGTTCCTAGGATGCAATGCTGTACCTCTGCTTCGCATGTTAGACCAAGGAGAGCATATCGTTTTTATGGTATGCA
CCAATTTCTTTTACATAACTGAGGGATACAATAAATTGACAGGGAAATCTTTCTGGAACAAGTTGACAGGGAAATCTGTCTGTATTCTTGTTCTCTGTCAGAGTATTTGCAATTAATTTGTAAATGTTAAACACAAAGGTATCTTCTGCTTTCTTGTAGTGAATTTCTGTGACAGCAATCTTTATGGGAGTTTTGGTATG
GATTTATCTACTTGGAGCTAATAAATCTACATAAATGCAACGTGCTATATCTGTCATATCTTTTGCATCTCAAACAAAATTAGACCATTTCAGCAGAACTGTATAATATATCAATATGTCAGGAAGAGAATCTGCAGAAGTTGCCATGATAAGATATAATCAATACAGTGGCTCTATGCAGGCTCGATTCTTGGCAAGGT
TTATTTTGTTGTTGCATGTAGGTTTTTGTTCTATGGGCCCTGCTCCTTTGTTAAATATTCTGGACTTCATATTGATTATATGATTATATCCCCTTGAATTTTATTACATGAGCTAGATGACTTAATGACGAAACCCTAGATAGGGTTGAGCCACATCACTGCAGATAAATGAGAGATTACACAATAACACATTATTATAT
TATGAAAATTAC