NA ----> NA

Intron 1 GTAAGTCTTT ... ATCCAAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	83.82	20	70	129
A2	84.54	10.5	63	51.5
A3	81.91	13	54	59
A4	89.03	10	80.5	79
A5	89.44	5.5	49	40
A6	100	0	4	1
A7	-1	0	0	0
A8	100	0	3	1.5
A9	-1	0	0	0
A10	-1	0	0	0

>TRINITY_DN124886_c3_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoform

TGAAGAGATATGAATTTTTGAAGTTGGTGTACCCCACCTTTTTGGGTGAGCCGACCTAACAAAAGAAAATTTAATAATTTGTAATTTTGAATAGCAGGTCGGCCAGCTAAAAACATTTATTTTTCCTCCACGATTTTACATATATATACACGAGTTATTTACACAAAACGGGAGTGTAATTTATGGGTGAAGTGGAGCTC
TGAAAATTCGGGTGTACAGTGACAGAGGTTGCAGCAGTAATACAAAAGAACAACACAGAATTCGGTGGTAAAATTTTGGATGAGCTCTGAAATTC

>TRINITY_DN124886_c3_g1_i4 from sample A2 / Example unspliced isoform:

TGAAGAGATATGAATTTTTGAAGTTGGTGTACCCCACCTTTTTGGGTGAGCCGACCTAACAAAAGAAAATTTAATAATTTGTAATTTTGAATAGCAGGTCGGCCAGCTAAAAACATTTATTTTTCCTCCACGATTTTACATATATATACACGAGTTATTTACACAAAACGGGAGTGTAATTTATGGGTGAAGTGGAGCTC
TGAAAATTCGGGTGTACAGTGACAGAGGTTGCAGCAGTAATACAAAAGAACAACAgtaagtctttcctcattgatttttgggtggcagcagttgaagttttggttggtgaccttagtgctagaagactgaccctctagggtatccaaacagCAGAATTCGGTGGTACAATTTTGGATGAGCTTTGAAATTCGCTGGAATA
GAGAGAGCCCTAAAATTTGGAGAAGTCTGAGGAAGTTCGGGTACTGTAGCAGCAACAGTAGACTGAAATTTTTTTTATTTTGGTATGTGGAATTTGTGTGGAGGAAGAGCTCTTAATTTCGTGGGTCTCTGAAGCAGCCACAATAAAATCAGGTGTGCATTTTATTGTTGAAGATCAAGCTCTGTTGAATTCGGATTGTT
TGCCACCTTTAAAATTCGGCCAGCCTCAGAATTTCGGATTGTCAGGCTACTTCAAAATTCGGACTGCCTTCCTTCTGATAAACTCAGGCTGTCTTTTCTCTATTCTGGACTATCTCTGTAAGATTTTTGGGTTGCTTCCATGATGATTGATTTAAGAGTAGACTTTGACAGTGTCTGAGGGTGCATTCTATGTCCTCTAA
TCAAAATCGTGGGATTGATATCTTCAAGCATTCTGCTGCCATGTTTGTTGAAATCACAATTCAATGAGGAACAACTCTATGGGAAAGTTTCATTGTTAATTACATTGTGACTGGGAATTCCTTTTGCAAATCGTAGTAATGGTTATGGTGTTACTAAGTGCAATGGAGGACTGATCTTTCACTTTTATTGAAGTTTGGAT
TTCACTCTTTGTTAGGACAGACCTCACACTCAATCTTGGGCACAAAAGGCTTTCAATTTAGCTCAAATGAACAATGGGCACAACAACCATAATCTTCAGATCTGAAATCACCATTAAAACGCCATTGTATGCTTAATCTGCTACAGAATTCAAAGTTGAGTGTCTTATTATTTCTCCTAAGTGTACATCATTCGTCTGGG
AAACAAGATTACATGATTGGGCTATCCCTCCTATAAGGACGCATTCATGGTTAACATACTGATTGGAATAGTCAA