NA ----> NA

Intron 1 GTAATGCAGT ... TTGAATACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	50	2	0	2
A2	28.57	10	1	4
A3	35.71	9	0	5
A4	0	1	0	0
A5	47.06	9	0	8
A6	50	5	0	5
A7	59.32	24	5	35
A8	28.57	30	1	12
A9	32.26	21	6	10
A10	64.71	18	1	33

>TRINITY_DN43348_c1_g2_i3 from sample A8 / Example spliced isoform

ATTAACTACCGCTATTGACAGTATGAATAAAGTTTAGAATTCAATAATGCAGCATAACCCGACGATGCCAAATACTATAGAGTTATAACACGATGTCAAATACTATAGAGTTATAACACTTTCAGCCTCCTTATCGATACCAACTGGCAACTAATTGTCAGATTTCTAGTGCATGCGCTTTGAGCTGTCCATCGAATGTG
CTCTCCCAAGCAAATTCTGGGTAATTGGAAAGAGTAGCGTCGACGGGCTTGCTAAGAATAGCGATGGACTCGCTACGCCATCTGCTTCCATCAAGCTTTTAAGATTTTAACTATGGAGTCACTACTTTTTCTACTTTTTGTTTCCGTAACAGTTATGAGGATTTTTCAGAGATTTTAAAATCCGATCCGATTTTTGGAAT
TGGAATTTTTTTCGAATCCGCTCCTATGGCGGTGGACGAGGGACGACATGCATATATATATGTCTGCTTTTCCATTGCTGGGTTTGTTTACCTCCACTCCTATGTCACTAGCACGGTCGAGT

>TRINITY_DN43348_c1_g2_i8 from sample A8 / Example unspliced isoform:

ATTAACTACCGCTATTGACAGTATGAATAAAGTTTAGAATTCAATAATGCAGCATAACCCGACGATGCCAAATACTATAGAGTTATAACACGATGTCAAATACTATAGAGTTATAACACTTTCAGCCTCCTTATCGATACCAACTGGCAACTAATTGTCAGATTTCTAGTGCATGCGCTTTGAGCTGTCCATCGAATGTG
CTCTCCCAAGCAAATTCTGGGTAATTGGAAAGgtaatgcagtggatcaatttttgttaatttgggcggatcaattcttggctgagtgaatctttggcagcctttcttaagcttcaatttttcagccttcgttggcagcctttcttaagcttcaattttcatttgaatacagAGTAGCGTCGACGGGCTTGCTAAGAATAG
CGATGGACTCGCTACGCCATCTGCTTCCATCAAGCTTTTAAGATTTTAACTATGGAGTCACTACTTTTTCTACTTTTTGTTTCCGTAACAGTTATGAGGATTTTTCAGAGATTTTAAAATCCGATCCGATTTTTGGAATTGGAATTTTTTTCGAATCCGCTCCTATGGCGGTGGACGAGGGACGACATGCATATATATAT
GTCTGCTTTTCCATTGCTGGGTTTGTTTACCTCCACTCCTATGTCACTAGCACGGTCGAGT