sp|Q9LVQ0|PME31_ARATH ----> Pectinesterase 31


Intron 1 GTTGAAGAGG ... CCGAAACCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A129.0939239
A222.394723.14
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A421.852227
A521.8825113
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A724.532239451
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A920.98213.370.343
A1026.33136.96829.9



>TRINITY_DN114466_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
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CCTCTCCGCAATAACGAGAGAATTACCATCGATGTCTGGCCCGGGGTTTACAGGCAGCCAATATACGTGCCCAAGACAAAGAATAATATCACATTACGCGGATTTTGTGCAGAGGACACCGTTTTGACATGGAATAACACAGCCACTCGCATTGAGCATCATCAGGCAGCCAGTGTAATAGGTACAGGAACATTTGGATG
TGGTACTGTTATTGTCGAAGGAGAGGATTTTATTGCTGAGGGAATCACATTTGAAAATGCTGCTCCACAGGGTTCAGGTCAAGCTGTGGCTATTCGTGTAACAGCTGACAGGTGTGCTTTTTATAGTTGCAGATTTTTGGGATGGCAGGACACCGCTTATCTACATTATGGCAAGCACTACTTGAGAGACTGTTACATTG
AAGGCAGTTGTGACTTTATTTTTGGTAATGCTACTGCATTGCTAGAACATTGCCACATTCATTGCAAGTCACAAGGTTATATTACCGCACAAAGTCGAAAATCTGCTCAAGAATCAACAGGCTATGTATTTTTAAGGTGTGTGATCACTAGCAATGGAGGAAGCTCTTACATGCATCTTGGACGTCCATGGGCACCATTT
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TTTCATTGATCCAGATCAACAAAAGCCGTGGTTGATGAACAATATGTCAGTGAAAATACCACTGTCAGCTTATTCTTAAAGCTAGTTGGAAGACGGTTGTTTAAGCATGTTCGAGGTTAAAAGTATCTCTTTCTAGTATGTCATACTATCTACTGAGTTGTGGGTTTCAACCATTATATTTAGATGAAGTCTCATGTACA
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ACCATGTTCTATTGTCAAAGAAACTGCTATCCTACTTGAATTTACTTTTAGG


>TRINITY_DN114466_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GGTAGCCCGGCAGAGATCTATGTTTTTGGGGACACAGATTATGGTATTCCGACCCAAGTCCTTAAATAAGCCATTTCATCGCACAAATCGAATTACAGAGCTCCTGACAACAATTTTGATTAAAAAATGGTTGAAAACGGCCTAGTGCCGAATGTTCTCCGTTTCAAAATGGCATCATAAACACTCTGGGATATTTCTGC
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CCTCTCCGCAATAACGAGAGAATTACCATCGATGTCTGGCCCGGGGTTTACAGGCAGCCAATATACGTGCCCAAGACAAAGAATAATATCACATTACGCGGATTTTGTGCAGAGGACACCGTTTTGACATGGAATAACACAGCCACTCGCATTGAGCATCATCAGgttgaagaggaaagaatttcaagtgcgcccaagca
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AAGCTGTGGCTATTCGTGTAACAGCTGACAGGTGTGCTTTTTATAGTTGCAGATTTTTGGGATGGCAGGACACCGCTTATCTACATTATGGCAAGCACTACTTGAGAGACTGTTACATTGAAGGCAGTTGTGACTTTATTTTTGGTAATGCTACTGCATTGCTAGAACATTGCCACATTCATTGCAAGTCACAAGGTTAT
ATTACCGCACAAAGTCGAAAATCTGCTCAAGAATCAACAGGCTATGTATTTTTAAGGTGTGTGATCACTAGCAATGGAGGAAGCTCTTACATGCATCTTGGACGTCCATGGGCACCATTTAGTAGAGTAGTATTTGCATATACATGGATGGATGCATGCATCAAACCAGATGGCTGGAATAATTGGAATAACCCTGAAAA
TGAGAAAAGTGCATGCTTCTACGAATACAGGTGCTCGGGTCCGGGGAGTAATCCATGTAAACGAGTTAGTTGGGCAAGGCAGCTGATGGATGATGAGGCAGTACAATTTATTTCTCAGTCTTTCATTGATCCAGATCAACAAAAGCCGTGGTTGATGAACAATATGTCAGTGAAAATACCACTGTCAGCTTATTCTTAAA
GCTAGTTGGAAGACGGTTGTTTAAGCATGTTCGAGGTTAAAAGTATCTCTTTCTAGTATGTCATACTATCTACTGAGTTGTGGGTTTCAACCATTATATTTAGATGAAGTCTCATGTACAAATCATCAAAGACAAGGATTTAAAGTAAGTGAAATCTATAATATATATTGTCTAATTACAGACACCAGTTTTTAATGTTT
AACAAGTTAAAATTCGAAGTTCTCATGATTGATTTTCCATGGATAGTTAAGATCGACAGTAGATACCAAATCGGTCTGAGACTCTGAAATATGGTTAATGTTTTGCAAGCATAGCAGGGAACCATGTTCTATTGTCAAAGAAACTGCTATCCTACTTGAATTTACTTTTAGG