NA ----> NA


Intron 1 GTAAGTTTAA ... CTATGTCTAG

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A252658
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A1037.3121421



>TRINITY_DN43105_c0_g1_i4 from sample A8 / Example spliced isoform
GAACAAGATTACATGATGTGTGATCAAATCAACACAATGTGGTGGAAATGTGGCGTGAACTAATGAACTTTTAGTCTGCTCTTCACAGAAAAGAAGCGTCAGAGTGCTTGTATTACAAGGGGAGAGATTGTTTTACCAAAGGGTCCGAGTCCGTATCCGCTGCAACTTAGTTTCCGTATCCACTACAACTTCACTGTCAT
TTCCCTTCCTATCTGCATCTCTATTGCAACAACTTGGTAATCTTGTAGCTATGAAATGTCGACTTCAACATCTCATCCTCCAATGGGTTGGAGTTTGAACTGAAAGCATACCATCAATTCAAATCAAATAGGATACACCCATGATTGGTTCTCTTTCTCTGTAGATCAATAATGCTTTATTGTCATTAACCTAAACCTCT
CTCTGTGAAATGATATCTTACATCATAGCTAAGCTAAGTTAATGTTCATGTCCTGAGAAGTTTTTGGAATCATACCCACCATCCCCATTCCCTTTTCCTCCCATTGATTCAAAGGTAGGACTGAAGCTATGGCTTTACCTCTAATCTCCAGGGTAAGGGCAAGTGTAAGGGATTTAGGGTTAGGGCTTGGGTTACAAAAA
GAAGGATTGAAGGTACGCGCAGGGTCAGCTAGGGTTTTCTTTAAGAAGGGGATAACTCGGATATCATGGAGTTCTATGGTTAGTGTTTGGTTCTTAGAAGGATTTGATGCTTCTGTTCCTGGTGTGGGAATTCAGTTTAAGGAGGATTTTTGTGTGTGCGAAAATGGCTGGAAATGACAAGGGCAAGAGCATTGCCGAGT
GCCATGGCAATGACGATACGGTGGATGCTGTGGTGGCGGGCACGGTAGTGGAAAATGTTGTTTTGGATGCTGCCGCTCCATGTAATATCATGCCTTTTCATACAATGGAGGCACTAGGTTTAAAACCCACACAGCCTACTACTAGGCTTCTCTGTCTTCCTGCCGACATCGACCTGGGGAGTGCGAGTCTAGCAGGTCTG
ATTGATGGCATTCCTGTTGATATTGGCCCGGTTCGAGTTTTATCGACATTCCAAATCCTGAGAATGCAAGGTAACAACTCCTACCCTCTGCTGCTTGGCGCTCCATATATGATTGCTGCCGAGGATTTCTTGGTTCAAACAGCAGCTACACTTTCCATTGAGGGGTTGGTTATAAAGCATGGCAAGGCTGTTAGGTTTCC
TTTTTCTCAACAACAGAAGAGGGAAAAACGCAGGGCCTTACAATGCCATTCTATTAAGATGCACGACACTGGCGATGTTCAAGGTGCTGATTTACCACAGCCATCGGCAGGTCCGGGCATTGTGTCCAATTCACCCGAGCAACGCAAGGGCTTAGGATACAACCCTATTGAGATAGAGGACGCTGACCATGTTCAAATTG
CTGGCTTACCACAGCCATCGGCAGGCCCAGGCATTGTGTTCAAATCACCTGAACAACGCAGGGGCTCACAAGATTATCCAATCGAGATATCAGAGACTGTGGATGTAGAAGTTGATGACTTACCACAGCCATCGGCATGCCCTGGCTTTGCGTCCGTTTCACCAGAGCAACACATGGGCTCACAATACAACCCCATCGAG
ATACTGGACACCATTGATGTTGAAGGTGATGACTTAGCACAGCCATCGGCAGGCCCCTCCATTGTGTCCGATTCACTTCACCATTCTGCAGCATTTATAGAGTCTGGAAAAGAGAAAAACCAATCTACGATGCAAATGTTGGGCAAGGCATACAAGTTACAAATACAATCCTGAGTTGGAGGCTTGGACGATTTTCATGG
GACTGTAAGAAAACAAGTAGATGATGCAGGACCGTCGAGTGTTGTGGAGCATGCAGCTGAGGATTTATGTATAGATCCCATTGTTGCACCTACTCCAAATTAGGTACAGAATGATCCACTTACTGTGCTGCTCAACTCACAGGAAGGACCAGCAGCACTGCTGAGACTGCATCATCACAACAAGCACCAGGATTGCCTTG
CTGACTAGTCCACACAAGCTATTGCGGTAGATTGCCTTGCTGACTAGTCCAGACATGCTATTGCAGTAGATTATGTCTTAGGAGCCTAGATATTATACCACATGGGTTACATGTGCATTTTTGTACACATTCGGACATTATATCTCATGGTATGCACAAGGGCATTTGTGTACATGATGACTAGTCATATGTGTACTTTG
AGACATGTGTACATGAGATTAAGATATATATATGTTCACCATGTAGCTAAGATTCCTTGCTTTGCTTATCGTTTTCATGCAAAGATGTCTTCCTCGATTTTTATTGCTCTAAATTTCTATATTTTATTCTGACAGTTAATATTTCCCTTGTACCTTTTTCATATATATTTTATCTTTCTGGACTTTGTGGGTCTTAACTT
CTGCACTGTTGATCGACACAATATGCAGA


>TRINITY_DN43105_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:
GAACAAGATTACATGATGTGTGATCAAATCAACACAATGTGGTGGAAATGTGGCGTGAACTAATGAACTTTTAGTCTGCTCTTCACAGAAAAGAAGCGTCAGAGTGCTTGTATTACAAGGGGAGAGATTGTTTTACCAAAGGGTCCGAGTCCGTATCCGCTGCAACTTAGTTTCCGTATCCACTACAACTTCACTGTCAT
TTCCCTTCCTATCTGCATCTCTATTGCAACAACTTGGTAATCTTGTAGCTATGAAATGTCGACTTCAACATCTCATCCTCCAATGGGTTGGAGTTTGAACTGAAAGCATACCATCAATTCAAATCAAATAGGATACACCCATGATTGGTTCTCTTTCTCTGTAGATCAATAATGCTTTATTGTCATTAACCTAAACCTCT
CTCTGTGAAATGATATCTTACATCATAGCTAAGCTAAGTTAATGTTCATGTCCTGAGAAGTTTTTGGAATCATACCCACCATCCCCATTCCCTTTTCCTCCCATTGATTCAAAGGTAGGACTGAAGCTATGGCTTTACCTCTAATCTCCAGGGTAAGGGCAAGTGTAAGGGATTTAGGGTTAGGGCTTGGGTTACAAAAA
GAAGGATTGAAGGTACGCGCAGGGTCAGCTAGGGTTTTCTTTAAGAAGGGGATAACTCGGATATCATGGAGTTCTATGGTTAGTGTTTGGTTCTTAGAAGGATTTGATGCTTCTGTTCCTGGTGTGGGAATTCAGTTTAAGGAGGATTTTTGTGTGTGCGAAAATGGCTGGAAATGACAAGGGCAAGAGCATTGCCGAGT
GCCATGGCAATGACGATACGGTGGATGCTGTGGTGGCGGGCACGGTAGTGGAAAATGTTGTTTTGGATGCTGCCGCTCCATGTAATATCATGCCTTTTCATACAATGGAGGCACTAGGTTTAAAACCCACACAGCCTACTACTAGGCTTCTCTGTCTTCCTGCCGACATCGACCTGGGGAGTGCGAGTCTAGCAGGTCTG
ATTGATGGCATTCCTGTTGATATTGGCCCGGTTCGAGTTTTATCGACATTCCAAATCCTGAGAATGCAAGGTAACAACTCCTACCCTCTGCTGCTTGGCGCTCCATATATGATTGCTGCCGAGGATTTCTTGGTTCAAACAGCAGCTACACTTTCCATTGAGGGGTTGGTTATAAAGCATGGCAAGGCTGTTAGGTTTCC
TTTTTCTCAACAACAGAAGAGGGAAAAACGCAGGGCCTTACAATGCCATTCTATTAAGATGCACGACACTGGCGATGTTCAAGGTGCTGATTTACCACAGCCATCGGCAGGTCCGGGCATTGTGTCCAATTCACCCGAGCAACGCAAGGGCTTAGGATACAACCCTATTGAGATAGAGGACGCTGACCATGTTCAAATTG
CTGGCTTACCACAGCCATCGGCAGGCCCAGGCATTGTGTTCAAATCACCTGAACAACGCAGGGGCTCACAAGATTATCCAATCGAGATATCAGACACTGTGGATGTTGAAGGTGATGACTTAGCACAGCCATCGGCAGGCCCCTCCATTGTGTCCGATTCACTTCACCATTCTGCAGCATTTATAGAGTCTGGAAAAGAG
AAAAACCAATCTACGATGCAAATGTTGGGCAAGGCATACAAGTTACAAATACAATCCTGAGTTGGAgtaagtttaaaaaaccgtatacttgtattccaaatcagatggctttcatgcaaaatgagtgaagggccagttggaatcaaatagagttaaatcagtataagaatgggcacagaataacttataaatttttccac
ttcaattggcttgttatttttatttatgtatttagtttttgtggttttcatctatatagcagtagactgcaactttgaattgctgcattctctctatcaaagatatagtttttcctattacgaagtatatgcacatataagttaagttttacattttcacatatctctgtactacgcacacctatcctacaatccatcca
tccatccatccatgtactgttagtttattacccttcattgttgcacgcttgcctccaggcatcttttctaaatttatattatgcatgagtttaatgcgatcagcattaatatgatgacagatatttatatagttatcttttctaaacgtagcggttgcaatttttgataaaatttgtcattcatatatattggggtctgc
aggagaggttgcaatgtctctatcatatagcacacaagcataaacagcgcaaattatcagtgagtataattttttttattattattgttatatctacatataagttcaagtattatattttcacataactctgttctatgcatgcctgtcctgcaacccatcaatccacatgctgttagtttcttaccctgtattgttgt
aggcttgtcttcatgcatgttttctaaatttatattatgcatggattaaataaggccaccattaatatgattgcaggcaattaatgatgtgactgtttttattttataatactatggaagatccttctattaactgaaaacagaggttacatcagagaaaaactgggcaactaaagcaaaatatactgtcgttgctgatg
gcacccaattttcaaaaagataggaaaacagtctactgaaccatatagtttcaaaaaccaagtccaagaaatagcagtctgcctctgggggaaaccagactataaaacagagtttgaaaaattagattaaacctccatgatagagaagtcttatgcatgctagtcctatcaaaatttaagcagtctgaggtgattataag
ctatcctacgccttctatacttgaataaacagagagaaattaagggttgtctttatcagagaaaaggatgacctggctgcttcgagcctgctgagcttgctgagtctgctgagtttgctgcgtctgctgggctggaggagtcatgttgttagctcttccttctgttgcatgagccatcaaatggagcatttcttcaaagt
tggtcattgcccttatcaggataatcagcttcttagtgaaagtccccatctgagtctgcatttggtccattctgacattcagattccccacttgggtcttcatttgaactgtacttgcattctgactccccatctggtggtggagttgagccatatctgcttccatttggtcgagctgttggaagacttcttttttgtcc
tcttccactcatgatgatactgttaatatatgtactgaatcacctttatattgttatcatttcagcgaagttaataagttaatgcagctgcatcaggttagaaattagtactcgtttctaatgaaaaatcagtgtgtgtttgaaggttttgacactgtactaatgaagaaatctatgtctag
GGCTTGGACGATTTTCAT
GGGACTGTAAGAAAACAAGTAGATGATGCAGGACCGTCGAGTGTTGTGGAGCATGCAGCTGAGGATTTATGTATAGATCCCATTGTTGCACCTACTCCAAATTAGGTACAGAATGATCCACTTACTGTGCTGCTCAACTCACAGGAAGGACCAGCAGCACTGCTGAGACTGCATCATCACAACAAGCACCAGGATTGCCT
TGCTGACTAGTCCACACAAGCTATTGCGGTAGATTGCCTTGCTGACTAGTCCAGACATGCTATTGCAGTAGATTATGTCTTAGGAGCCTAGATATTATACCACATGGGTTACATGTGCATTTTTGTACACATTCGGACATTATATCTCATGGTATGCACAAGGGCATTTGTGTACATGATGACTAGTCATATGTGTACTT
TGAGACATGTGTACATGAGATTAAGATATATATATGTTCACCATGTAGCTAAGATTCCTTGCTTTGCTTATCGTTTTCATGCAAAGATGTCTTCCTCGATTTTTATTGCTCTAAATTTCTATATTTTATTCTGACAGTTAATATTTCCCTTGTACCTTTTTCATATATATTTTATCTTTCTGGACTTTGTGGGTCTTAAC
TTCTGCACTGTTGATCGACACAATATGCAGA




Intron 2 GTGAGTATAA ... CTATGTCTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A120441
A253.33728
A336.36724
A446.15746
A533.33613
A641.5131122
A729.4136115
A834.9454129
A94030320
A1043.7527121



>TRINITY_DN43105_c0_g1_i5 from sample A8 / Example spliced isoform
GAACAAGATTACATGATGTGTGATCAAATCAACACAATGTGGTGGAAATGTGGCGTGAACTAATGAACTTTTAGTCTGCTCTTCACAGAAAAGAAGCGTCAGAGTGCTTGTATTACAAGGGGAGAGATTGTTTTACCAAAGGGTCCGAGTCCGTATCCGCTGCAACTTAGTTTCCGTATCCACTACAACTTCACTGTCAT
TTCCCTTCCTATCTGCATCTCTATTGCAACAACTTGGTAATCTTGTAGCTATGAAATGTCGACTTCAACATCTCATCCTCCAATGGGTTGGAGTTTGAACTGAAAGCATACCATCAATTCAAATCAAATAGGATACACCCATGATTGGTTCTCTTTCTCTGTAGATCAATAATGCTTTATTGTCATTAACCTAAACCTCT
CTCTGTGAAATGATATCTTACATCATAGCTAAGCTAAGTTAATGTTCATGTCCTGAGAAGTTTTTGGAATCATACCCACCATCCCCATTCCCTTTTCCTCCCATTGATTCAAAGGTAGGACTGAAGCTATGGCTTTACCTCTAATCTCCAGGGTAAGGGCAAGTGTAAGGGATTTAGGGTTAGGGCTTGGGTTACAAAAA
GAAGGATTGAAGGTACGCGCAGGGTCAGCTAGGGTTTTCTTTAAGAAGGGGATAACTCGGATATCATGGAGTTCTATGGTTAGTGTTTGGTTCTTAGAAGGATTTGATGCTTCTGTTCCTGGTGTGGGAATTCAGTTTAAGGAGGATTTTTGTGTGTGCGAAAATGGCTGGAAATGACAAGGGCAAGAGCATTGCCGAGT
GCCATGGCAATGACGATACGGTGGATGCTGTGGTGGCGGGCACGGTAGTGGAAAATGTTGTTTTGGATGCTGCCGCTCCATGTAATATCATGCCTTTTCATACAATGGAGGCACTAGGTTTAAAACCCACACAGCCTACTACTAGGCTTCTCTGTCTTCCTGCCGACATCGACCTGGGGAGTGCGAGTCTAGCAGGTCTG
ATTGATGGCATTCCTGTTGATATTGGCCCGGTTCGAGTTTTATCGACATTCCAAATCCTGAGAATGCAAGGTAACAACTCCTACCCTCTGCTGCTTGGCGCTCCATATATGATTGCTGCCGAGGATTTCTTGGTTCAAACAGCAGCTACACTTTCCATTGAGGGGTTGGTTATAAAGCATGGCAAGGCTGTTAGGTTTCC
TTTTTCTCAACAACAGAAGAGGGAAAAACGCAGGGCCTTACAATGCCATTCTATTAAGATGCACGACACTGGCGATGTTCAAGGTGCTGATTTACCACAGCCATCGGCAGGTCCGGGCATTGTGTCCAATTCACCCGAGCAACGCAAGGGCTTAGGATACAACCCTATTGAGATAGAGGACGCTGACCATGTTCAAATTG
CTGGCTTACCACAGCCATCGGCAGGCCCAGGCATTGTGTTCAAATCACCTGAACAACGCAGGGGCTCACAAGATTATCCAATCGAGATATCAGAGACTGTGGATGTAGAAGTTGATGACTTACCACAGCCATCGGCATGCCCTGGCTTTGCGTCCGTTTCACCAGAGCAACACATGGGCTCACAATACAACCCCATCGAG
ATACTGGACACCATTGATGTTGAAGGTGATGACTTAGCACAGCCATCGGCAGGCCCCTCCATTGTGTCCGATTCACTTCACCATTCTGCAGCATTTATAGAGTCTGGAAAAGAGAAAAACCAATCTACGATGCAAATGTTGGGCAAGGCATACAAGTTACAAATACAATCCTGAGTTGGAGAGAGGTTGCAATGTCTCTA
TCATATAGCACACAAGCATAAACAGCGCAAATTATCAGGCTTGGACGATTTTCATGGGACTGTAAGAAAACAAGTAGATGATGCAGGACCGTCGAGTGTTGTGGAGCATGCAGCTGAGGATTTATGTATAGATCCCATTGTTGCACCTACTCCAAATTAGGTACAGAATGATCCACTTACTGTGCTGCTCAACTCACAGG
AAGGACCAGCAGCACTGCTGAGACTGCATCATCACAACAAGCACCAGGATTGCCTTGCTGACTAGTCCACACAAGCTATTGCGGTAGATTGCCTTGCTGACTAGTCCAGACATGCTATTGCAGTAGATTATGTCTTAGGAGCCTAGATATTATACCACATGGGTTACATGTGCATTTTTGTACACATTCGGACATTATAT
CTCATGGTATGCACAAGGGCATTTGTGTACATGATGACTAGTCATATGTGTACTTTGAGACATGTGTACATGAGATTAAGATATATATATGTTCACCATGTAGCTAAGATTCCTTGCTTTGCTTATCGTTTTCATGCAAAGATGTCTTCCTCGATTTTTATTGCTCTAAATTTCTATATTTTATTCTGACAGTTAATATT
TCCCTTGTACCTTTTTCATATATATTTTATCTTTCTGGACTTTGTGGGTCTTAACTTCTGCACTGTTGATCGACACAATATGCAGA


>TRINITY_DN43105_c0_g1_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:
GAACAAGATTACATGATGTGTGATCAAATCAACACAATGTGGTGGAAATGTGGCGTGAACTAATGAACTTTTAGTCTGCTCTTCACAGAAAAGAAGCGTCAGAGTGCTTGTATTACAAGGGGAGAGATTGTTTTACCAAAGGGTCCGAGTCCGTATCCGCTGCAACTTAGTTTCCGTATCCACTACAACTTCACTGTCAT
TTCCCTTCCTATCTGCATCTCTATTGCAACAACTTGGTAATCTTGTAGCTATGAAATGTCGACTTCAACATCTCATCCTCCAATGGGTTGGAGTTTGAACTGAAAGCATACCATCAATTCAAATCAAATAGGATACACCCATGATTGGTTCTCTTTCTCTGTAGATCAATAATGCTTTATTGTCATTAACCTAAACCTCT
CTCTGTGAAATGATATCTTACATCATAGCTAAGCTAAGTTAATGTTCATGTCCTGAGAAGTTTTTGGAATCATACCCACCATCCCCATTCCCTTTTCCTCCCATTGATTCAAAGGTAGGACTGAAGCTATGGCTTTACCTCTAATCTCCAGGGTAAGGGCAAGTGTAAGGGATTTAGGGTTAGGGCTTGGGTTACAAAAA
GAAGGATTGAAGGTACGCGCAGGGTCAGCTAGGGTTTTCTTTAAGAAGGGGATAACTCGGATATCATGGAGTTCTATGGTTAGTGTTTGGTTCTTAGAAGGATTTGATGCTTCTGTTCCTGGTGTGGGAATTCAGTTTAAGGAGGATTTTTGTGTGTGCGAAAATGGCTGGAAATGACAAGGGCAAGAGCATTGCCGAGT
GCCATGGCAATGACGATACGGTGGATGCTGTGGTGGCGGGCACGGTAGTGGAAAATGTTGTTTTGGATGCTGCCGCTCCATGTAATATCATGCCTTTTCATACAATGGAGGCACTAGGTTTAAAACCCACACAGCCTACTACTAGGCTTCTCTGTCTTCCTGCCGACATCGACCTGGGGAGTGCGAGTCTAGCAGGTCTG
ATTGATGGCATTCCTGTTGATATTGGCCCGGTTCGAGTTTTATCGACATTCCAAATCCTGAGAATGCAAGGTAACAACTCCTACCCTCTGCTGCTTGGCGCTCCATATATGATTGCTGCCGAGGATTTCTTGGTTCAAACAGCAGCTACACTTTCCATTGAGGGGTTGGTTATAAAGCATGGCAAGGCTGTTAGGTTTCC
TTTTTCTCAACAACAGAAGAGGGAAAAACGCAGGGCCTTACAATGCCATTCTATTAAGATGCACGACACTGGCGATGTTCAAGGTGCTGATTTACCACAGCCATCGGCAGGTCCGGGCATTGTGTCCAATTCACCCGAGCAACGCAAGGGCTTAGGATACAACCCTATTGAGATAGAGGACGCTGACCATGTTCAAATTG
CTGGCTTACCACAGCCATCGGCAGGCCCAGGCATTGTGTTCAAATCACCTGAACAACGCAGGGGCTCACAAGATTATCCAATCGAGATATCAGAGACTGTGGATGTAGAAGTTGATGACTTACCACAGCCATCGGCATGCCCTGGCTTTGCGTCCGTTTCACCAGAGCAACACATGGGCTCACAATACAACCCCATCGAG
ATACTGGACACCATTGATGTTGAAGGTGATGACTTAGCACAGCCATCGGCAGGCCCCTCCATTGTGTCCGATTCACTTCACCATTCTGCAGCATTTATAGAGTCTGGAAAAGAGAAAAACCAATCTACGATGCAAATGTTGGGCAAGGCATACAAGTTACAAATACAATCCTGAGTTGGAGTAAGTTTAAAAAACCGTAT
ACTTGTATTCCAAATCAGATGGCTTTCATGCAAAATGAGTGAAGGGCCAGTTGGAATCAAATAGAGTTAAATCAGTATAAGAATGGGCACAGAATAACTTATAAATTTTTCCACTTCAATTGGCTTGTTATTTTTATTTATGTATTTAGTTTTTGTGGTTTTCATCTATATAGCAGTAGACTGCAACTTTGAATTGCTGC
ATTCTCTCTATCAAAGATATAGTTTTTCCTATTACGAAGTATATGCACATATAAGTTAAGTTTTACATTTTCACATATCTCTGTACTACGCACACCTATCCTACAATCCATCCATCCATCCATCCATGTACTGTTAGTTTATTACCCTTCATTGTTGCACGCTTGCCTCCAGGCATCTTTTCTAAATTTATATTATGCAT
GAGTTTAATGCGATCAGCATTAATATGATGACAGATATTTATATAGTTATCTTTTCTAAACGTAGCGGTTGCAATTTTTGATAAAATTTGTCATTCATATATATTGGGGTCTGCAGGAGAGGTTGCAATGTCTCTATCATATAGCACACAAGCATAAACAGCGCAAATTATCAgtgagtataattttttttattattatt
gttatatctacatataagttcaagtattatattttcacataactctgttctatgcatgcctgtcctgcaacccatcaatccacatgctgttagtttcttaccctgtattgttgtaggcttgtcttcatgcatgttttctaaatttatattatgcatggattaaataaggccaccattaatatgattgcaggcaattaatg
atgtgactgtttttattttataatactatggaagatccttctattaactgaaaacagaggttacatcagagaaaaactgggcaactaaagcaaaatatactgtcgttgctgatggcacccaattttcaaaaagataggaaaacagtctactgaaccatatagtttcaaaaaccaagtccaagaaatagcagtctgcctct
gggggaaaccagactataaaacagagtttgaaaaattagattaaacctccatgatagagaagtcttatgcatgctagtcctatcaaaatttaagcagtctgaggtgattataagctatcctacgccttctatacttgaataaacagagagaaattaagggttgtctttatcagagaaaaggatgacctggctgcttcgag
cctgctgagcttgctgagtctgctgagtttgctgcgtctgctgggctggaggagtcatgttgttagctcttccttctgttgcatgagccatcaaatggagcatttcttcaaagttggtcattgcccttatcaggataatcagcttcttagtgaaagtccccatctgagtctgcatttggtccattctgacattcagattc
cccacttgggtcttcatttgaactgtacttgcattctgactccccatctggtggtggagttgagccatatctgcttccatttggtcgagctgttggaagacttcttttttgtcctcttccactcatgatgatactgttaatatatgtactgaatcacctttatattgttatcatttcagcgaagttaataagttaatgca
gctgcatcaggttagaaattagtactcgtttctaatgaaaaatcagtgtgtgtttgaaggttttgacactgtactaatgaagaaatctatgtctag
GGCTTGGACGATTTTCATGGGACTGTAAGAAAACAAGTAGATGATGCAGGACCGTCGAGTGTTGTGGAGCATGCAGCTGAGGATTTATGTATAGATCCCATTGT
TGCACCTACTCCAAATTAGGTACAGAATGATCCACTTACTGTGCTGCTCAACTCACAGGAAGGACCAGCAGCACTGCTGAGACTGCATCATCACAACAAGCACCAGGATTGCCTTGCTGACTAGTCCACACAAGCTATTGCGGTAGATTGCCTTGCTGACTAGTCCAGACATGCTATTGCAGTAGATTATGTCTTAGGAG
CCTAGATATTATACCACATGGGTTACATGTGCATTTTTGTACACATTCGGACATTATATCTCATGGTATGCACAAGGGCATTTGTGTACATGATGACTAGTCATATGTGTACTTTGAGACATGTGTACATGAGATTAAGATATATATATGTTCACCATGTAGCTAAGATTCCTTGCTTTGCTTATCGTTTTCATGCAAAG
ATGTCTTCCTCGATTTTTATTGCTCTAAATTTCTATATTTTATTCTGACAGTTAATATTTCCCTTGTACCTTTTTCATATATATTTTATCTTTCTGGACTTTGTGGGTCTTAACTTCTGCACTGTTGATCGACACAATATGCAGA




Intron 3 GTAAGTTTAA ... GGGTCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A113.396.514
A262.5350.5
A330732
A440320.5
A550332
A634.4819104.5
A733.0218.594
A819.58399.510.5
A938.2421135
A1018.181843.5



>TRINITY_DN42745_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform
AATCAAGACACTGGTGGAAATGTGGCGTGAACTAATGAACTTTTAGTCTGCTCCTCACAAAAAAGAAGTGTCAGAGTGCTTGTATTACAAGTGGAGAGATTGTTTTACCAAAGGGTCCGAGTCCGTATCCGCTGCAACTTAGTTTCCGTATCCACTACAACTTCACTGTCATTTCCCTTCCTATCTGCATCTCTATTGCA
GCAACTTGGTAATCTTGTAGCTATGAAATGTCGACTTCAACATCTCATCCTCCAATGGGTTGGAGTTTGAACTGAAAGCATACCATCAATTCAAATCAAATAGGATACACCCATGATTGGTTCTCTTTCTCTGTAGATCAAAAAATAATAATGCTTTCTTGTCATTAACCTAAACCTCTCTCTGTGAAATGATATCTTAC
ATCATAGCTAAGCTAAGTTAATGTTCATGTCCTGAGAAGTTTTTGGAATCATACCCACCATCCCCATTCCCTTTTCCTCCCATTGATTCAAAGGTAGGACTGAAGCTATGGCTTTACCTCTAATCTCCAGGGTAAGGGCAAGTGTAAGGGATTTAGGGTTAGGGCTTGGGTTACAAAAAGAAGGATTGAAGGTACGCGCA
GGGTCAGCTAGGGTTTTCTTTAAGAAGGGGATAACTCGGATATCATGGAGTTCTATGGTTAGTGTTTGGTTCTTAGAAGGATTTGATGCTTCTGTTCCTGGTGTGGGAATTCAGTTTAAGGAGGATTTTTGTGTGTGCGAAAATGGCTGGAAATGACAAGGGCAAGAGCATTGCCGAGTGCCATGGCAATGACGATACGG
TGGATGCTGTGGTGGCGGGCACGGTAGTGGAAAATGTTGTTTTGGATGCTGCCGCTCCATGTAATATCATGCCTTTTCATACAATGGAGGCACTAGGTTTAAAACCCACACAGCCTACTACTAGGCTTCTCTGTCTTCCTGCCGACATCGACCTGGGGAGTGCGAGTCTAGCAGGTCTGATTGATGGCATTCCTGTTGAT
ATTGGCCCGGTTCGAGTTTTATCGACATTCCAAATCCTGAGAATGCAAGGTAACAACTCCTACCCTCTGCTGCTTGGCGCTCCATATATGATTGCTGCCGAGGATTTCTTGGTTCAAACAGCAGCTACACTTTCCATTGAGGGGTTGGTTATAAAGCATGGCAAGGCTGTTAGGTTTCCTTTTTCTCAACAACAGAAGAG
GGAAAAACGCAGGGCCTTACAATGCCATTCTATTAAGATGCACGACACTGGCGATGTTCAAGGTGCTGATTTACCACAGCCATCGGCAGGTCCGGGCATTGTGTCCAATTCACCCGAGCAACGCAAGGGCTTAGGATACAACCCTATTGAGATAGAGGACGCTGACCATGTTCAAATTGCTGGCTTACCACAGCCATCGG
CAGGCCCAGGCATTGTGTTCAAATCACCTGAACAACGCAGGGGCTCACAAGATTATCCAATCGAGATATCAGAGACTGTGGATGTAGAAGTTGATGACTTACCACAGCCATCGGCATGCCCTGGCTTTGCGTCCGTTTCACCAGAGCAACACATGGGCTCACAATACAACCCCATCGAGATACTGGACACCGTTGATGTT
GAAGGTGATGACTTAGCACAGCCATCGGCAGGCCCCTCCATTGTGTCCGATTCACTTCACCATTCTGCAGCATTTATAGAGTCTGGAAAAGAGAAAAACCAATCTACGATGCAAATGTTGGGCAAGGCATAAAAGTTACAAATACAATCCTGAGTTGGAGAGAGGTTGCAATGTCTCTATCATATAGCACACAAGCATAA
ACAGCGCAAATTATCAGGCTTGGACGATTTTCATGGGACTGTAAGAAAACAAGTAGATGATGCAGGACCGTCGAGTGTTGTGGAGCATGCAGCTGAGGATTTATGTATAGATCCCATTGTTGCACCTACTCCAAATTAGGTACAGAATGATCCACTTACTGTGCTGCTCAACTCACAGGAAGGACCAGCAGCACTGCTGA
GACTGCATCATCACAACAAGCACCAGGATTGCCTTGCTGACTAGTCCACACAAGCTATTGCGGTAGATTGCCTTGCTGACTAGTCCAGACATGCTATTGCAGTAGATTATGTCTTAGGAGCCTAGATATTACACCACATGGGTTACATGTGCATTTTTGTACACATTCGGACATTATATCTCATGGTATGCACAAGGGCA
TTTGTGTACATGATGACTAGTCATATGTGTACTTTGAGACATGTGTACATGAGATTAAGATATATATATGTTCACCATGTAGCTAAGATTCCTTGCTTTGCCTATCGTTTTCATGCAAAGATGTCTTCCTCGATTTTTATTGCTCTAAATTTCTATATTTTATTCTGACAGTTATTATTTCCCTTGTACTTTTTTCATAT
ATATTTTATCTTTCTGGACTTTGT


>TRINITY_DN42745_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:
AATCAAGACACTGGTGGAAATGTGGCGTGAACTAATGAACTTTTAGTCTGCTCCTCACAAAAAAGAAGTGTCAGAGTGCTTGTATTACAAGTGGAGAGATTGTTTTACCAAAGGGTCCGAGTCCGTATCCGCTGCAACTTAGTTTCCGTATCCACTACAACTTCACTGTCATTTCCCTTCCTATCTGCATCTCTATTGCA
GCAACTTGGTAATCTTGTAGCTATGAAATGTCGACTTCAACATCTCATCCTCCAATGGGTTGGAGTTTGAACTGAAAGCATACCATCAATTCAAATCAAATAGGATACACCCATGATTGGTTCTCTTTCTCTGTAGATCAAAAAATAATAATGCTTTCTTGTCATTAACCTAAACCTCTCTCTGTGAAATGATATCTTAC
ATCATAGCTAAGCTAAGTTAATGTTCATGTCCTGAGAAGTTTTTGGAATCATACCCACCATCCCCATTCCCTTTTCCTCCCATTGATTCAAAGGTAGGACTGAAGCTATGGCTTTACCTCTAATCTCCAGGGTAAGGGCAAGTGTAAGGGATTTAGGGTTAGGGCTTGGGTTACAAAAAGAAGGATTGAAGGTACGCGCA
GGGTCAGCTAGGGTTTTCTTTAAGAAGGGGATAACTCGGATATCATGGAGTTCTATGGTTAGTGTTTGGTTCTTAGAAGGATTTGATGCTTCTGTTCCTGGTGTGGGAATTCAGTTTAAGGAGGATTTTTGTGTGTGCGAAAATGGCTGGAAATGACAAGGGCAAGAGCATTGCCGAGTGCCATGGCAATGACGATACGG
TGGATGCTGTGGTGGCGGGCACGGTAGTGGAAAATGTTGTTTTGGATGCTGCCGCTCCATGTAATATCATGCCTTTTCATACAATGGAGGCACTAGGTTTAAAACCCACACAGCCTACTACTAGGCTTCTCTGTCTTCCTGCCGACATCGACCTGGGGAGTGCGAGTCTAGCAGGTCTGATTGATGGCATTCCTGTTGAT
ATTGGCCCGGTTCGAGTTTTATCGACATTCCAAATCCTGAGAATGCAAGGTAACAACTCCTACCCTCTGCTGCTTGGCGCTCCATATATGATTGCTGCCGAGGATTTCTTGGTTCAAACAGCAGCTACACTTTCCATTGAGGGGTTGGTTATAAAGCATGGCAAGGCTGTTAGGTTTCCTTTTTCTCAACAACAGAAGAG
GGAAAAACGCAGGGCCTTACAATGCCATTCTATTAAGATGCACGACACTGGCGATGTTCAAGGTGCTGATTTACCACAGCCATCGGCAGGTCCGGGCATTGTGTCCAATTCACCCGAGCAACGCAAGGGCTTAGGATACAACCCTATTGAGATAGAGGACGCTGACCATGTTCAAATTGCTGGCTTACCACAGCCATCGG
CAGGCCCAGGCATTGTGTTCAAATCACCTGAACAACGCAGGGGCTCACAAGATTATCCAATCGAGATATCAGAGACTGTGGATGTAGAAGTTGATGACTTACCACAGCCATCGGCATGCCCTGGCTTTGCGTCCGTTTCACCAGAGCAACACATGGGCTCACAATACAACCCCATCGAGATACTGGACACCGTTGATGTT
GAAGGTGATGACTTAGCACAGCCATCGGCAGGCCCCTCCATTGTGTCCGATTCACTTCACCATTCTGCAGCATTTATAGAGTCTGGAAAAGAGAAAAACCAATCTACGATGCAAATGTTGGGCAAGGCATAAAAGTTACAAATACAATCCTGAGTTGGAgtaagtttaaaaaaccgtatacttgtattccaaatcagatg
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Intron 4 GTAAGTTTAA ... GGGTCTGCAG

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>TRINITY_DN47130_c0_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoform
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