sp|O22193|PUB4_ARATH ----> U-box domain-containing protein 4


Intron 1 GTATGTAGAC ... TTGATTTTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A157.58142216
A251.1915.511.521
A332.14381719
A446272323
A528.571575
A626.3420938.5111
A728.0817150.583
A825.45165.53281
A916.98189.517.560
A1028.0115132.585



>TRINITY_DN107008_c0_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoform
CGCGGGGTGAAGCTCAATTTCACTATTTGTTTCAAAGAATTGTGCCATCACCCGCCTGTAGCGTGCATATGGAGGTTTGGAAACTGTTTGATTGTTCATCTCAGGAGGGTTTTGAAAGCATTGAAAGGAATCTTAAAACCAGTTTCACGCCTCAGTACGCAAATGCTTGAATTCGATCCATTGTCCATACTTTCAAGCAA
ATTTTAGGGTTTACATTTGACCGCTCCTTAGACTATCAAAAGCTTGGTTCAGTGTTTCATGAGCCCAATGGTATGAATTGGTTGTTTAACCAATGGTATTGTTGATTTAAAATCCTCTCATTCAAAAAATGAAGAAGACCTAAATTTATTTGACTAATTTTGAAGCTCAAAGACTACTGGAAGTATTCATCCTGTCGACC
CAAGATTCTAACCTCAAATTGTCGGAAGTTTTGATGACATGATTGTCAAAGAGTTGGTTTCAATTTTGAACCTAAAGTCATAAGTTATCTCCAGTAACTCAAAATATCATAACTTGATTTTACTTACGGCGCTCTAATGCATTATCTCGAAAGCCTTTAGGGTTTTGTTTGATCAAAA


>TRINITY_DN107008_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CGCGGGGTGAAGCTCAATTTCACTATTTGTTTCAAAGAATTGTGCCATCACCCGCCTGTAGCGTGCATATGGAGGTTTGGAAACTGTTTGATTGTTCATCTCAGGAGGGTTTTGAAAGCATTGAAAGgtatgtagaccgacaatatactctatatcaaataatgaaattgcaagatagtttattttggctctagttgacc
agcatattgcttggactactgttaatatgcttgaaataaatgatttggatttaaatttgatggtgtttttcatagttgaaatgttggtaaatgtctgtatacaatatgaaatattggtcacagtcattgtttggcttgaaagcatcgttggttgagttactgatttagaaatgagtttactgatgttgcataaaagagtt
taaaaccctccctgcttggtgcagactatttcatttcatgtacaaactattatgagacactgttgaagaaaattgttgaaataaactgttgagggtttgtacgtcattgtcattttgaaatacagtcaatcattaagtttatacgatgactaacagtttttccctctcgacttacgagagttggtcactattacttgatt
ttag
GAATCTTAAAACCAGTTTCACGCCTCAGTACGCAAATGCTTGAATTCGATCCATTGTCCATACTTTCAAGCAAATTTTAGGGTTTACATTTGACCGCTCCTTAGACTATCAAAAGCTTGGTTCAGTGTTTCATGAGCCCAATGGTATGAATTGGTTGTTTAACCAATGGTATTGTTGATTTAAAATCCTCTCATTC
AAAAAATGAAGAAGACCTAAATTTATTTGACTAATTTTGAAGCTCAAAGACTACTGGAAGTATTCATCCTGTCGACCCAAGATTCTAACCTCAAATTGTCGGAAGTTTTGATGACATGATTGTCAAAGAGTTGGTTTCAATTTTGAACCTAAAGTCATAAGTTATCTCCAGTAACTCAAAATATCATAACTTGATTTTAC
TTACGGCGCTCTAATGCATTATCTCGAAAGCCTTTAGGGTTTTGTTTGATCAAAA