sp|Q9M3B4|RID3_ARATH ----> Protein ROOT INITIATION DEFECTIVE 3

Intron 1 GTAAGAATAT ... TGCATATCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	54.48	61	73	16
A2	55.14	48	59	9
A3	51.43	51	54	15
A4	59.14	38	55	21
A5	53.49	20	23	6
A6	50.53	93	95	10
A7	54.35	126	150	14
A8	53.53	112	129	18
A9	52.75	129	144	11
A10	53.85	102	119	15

>TRINITY_DN48623_c0_g3_i2 from sample A10 / Example spliced isoform

TGGGACACTTGTTGACCACAGATCTAGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTGGTAGATCCTGGTGAGTATGCACTTTATGCTGGATGCACTGATGGCAGAATATACATTGCTGCTTTGAACGTTGGAACAACATCTGACAGCATACATGGAGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGGAGATGAAGAAACATTCG
GTTAATTTTAGGATTTATGATGCTTTTTGAAAACATTTTCATTGTATTTGGAAAGTGATAACATTCTTGATATTTGTTGTGGATTAATAGCACTGGATTGCTTTGTTAATTATGATTCAAGGAGTAGAAGTAAATAAG

>TRINITY_DN48623_c0_g3_i6 from sample A10 / Example unspliced isoform:

GCCATTTGCTCACCTAGCAGATCCTGAAGTGGAGATCTGGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGTAGCATTTAATGCTACTCTGGTAGATCTTGGTGAGTATGCACTTTATGTTGGATGCACTAATGGCAAGAATATACATTGCTGCTTTGAACGTTGGAACAACATCTGAAAGCATACAT
GGAGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGATCTAGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGTAGCATTTAATGCTACTCTGGTAGATCTTGGTGAGTATGCACTTTATGTTGGATGCACTGATGGCAAGAATAAACATTGCTGCTTTGAATGTTGGAACAACATATGGTAGATCCTG
GTGAGTATGCACTTTATGCTGGATGCACTGATGGCAGAATATACATTGCTGCTTTGAACGTTGGAACAACATCTGACAGCATACATGGAGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGgtaagaatatcagtgatctttgaaatttgtttctaaaatatcagctctatttgcatgcatacctaaatcttatgtattc
caaattgtctatgttgaactgcatcaaactgattctagcaagttttccaaagaggtcaattcaatttgatttccttgttctttttttttcgattcttcaacagtcggaagcattatagagataatcgttaacctaataatgcttgcatgcatatcagGAGATGAAGAAACATTCGGTTAATTTTAGGATTTATGATGCTT
TTTGAAAACATTTTCATTGTATTTGGAAAGTGATAACATTCTTGATATTTGTTGTGGATTAATAGCACTGGATTGCTTTGTTAATTATGATTCAAGGAGTAGAAGTAAATAAG

Intron 2 GTGGTTGTTG ... TGAAGTGGAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	39.78	42.4	5	28
A2	57.26	11.2	8	15
A3	51.8	24.2	0	26
A4	48.48	26.6	1	25
A5	52.66	7.2	0	8
A6	48.33	31	6	29
A7	53.86	45.4	6	53
A8	50.7	49.6	8	51
A9	52.94	48	12	54
A10	52.72	31.4	11	35

>TRINITY_DN45035_c2_g1_i5 from sample A9 / Example spliced isoform

TCATGGCCAAGAAGGGGGAGTTTACCATTACAAGAGGACTGCCTACTCATGCGATTTTCAGATCTGGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGTAGCATTTAATGCTACTCTGGTAGATCTTGGTGAGTATGCACTTTATGTTGGATGCACTAATGGCAAGAATATACATTGCTGCTTTGAAC
GTTGGAACAACATCTGAAAGCATACATGGAGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGATCTAGAGTTTGGCTTTGGGTGGGACACTTGTTGACCACAGGTAAGAACCATTAAGTTTCCAGCAGCAGTTAATGCTGCTGTGGTAGATCCTGGTGAGTATGCACTTTATGCTGGATGCACTGATGGCAGAATATACA
TTGCTGCTTTGAACGTTGGAACAACATCTGACAGCATACATGGAGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGATTATCGTGATGCACTTCGGAAGAAAATAGTATACCAAGGGGGAGTGGGGAGGTGGTTGAAGATTTTTTTTATCAAGGATCTTTTTTTTCTACTGCACGGTGAATGAAACAGCCGGGCAGTCAC
ATCATTGGCATTTAGCATGGATGGAGTTCTGTTAGTTTCTGGGTCTGAAGACTGCACTGTTCGTGTTTGGGATACTGTAAGTTGCCAGGTTCTTCGGATTTTCAAGCATGCCAAGGGGCCAATAAGCAGTCTTATTATGGTGCCACTTTCTTCACGTGGAATTTTTGCAGATAATCAAGTTAGTTTCCATAACAAGGGCA
GATCTTTCCTCTTACCATCACCATTGAAGAAATATAGAGAGCCAAGGGCAGGGGATCCTGGTTATGACATCTCTAATGGCCCATCAGTAATTCTTCCTTCACATGAAGTCGACTCTGTAGATGGTAGTTGTTTCAATACTCTTCTTGCCATGAAGCAACAAATCAAAGAGTTGCAGCAACAAGGTTCTTCGACCTCTATT
CAAATGGAGTTGGAAAGGCTCAGATCAGAATACAGGCGGTCTTTGAACATGATACAACAGTGGGAACAAGTTTATCAAGACCTCCACTGCTTCTGTGTGACTGAGCTTATGGGTGGTAATAAAGCTGGGGAGGATGATGAGGAAGCTGATAGAAATAATGAGAAAGGAAAAAAGGGAAGAGGGAAGGCCACTGTAAGGAA
ATGAATGCAACTTGCGGGTTAGCTGATATGTACGGACTTTACTTGCTTCAAGTGTGTTTTGTAGTCAGCAAGGTTGGTTCAAGTCTATTCATTCTAGCAGATTGCATTTGTTCTATTTTTATGCCTTTGGGGAGTAAATGTTTTTTGTGCATACCCCACTGGGCACATGTATTGAGTCAAGGTCAATACTTAACAAGTTA
AAAGTGGTCATAGGAATCTTTTTAGACGGAACCTTTGTTAATTATTTATGTTTCTTTATTGAATTCAAAGCTTGAAAATATCTGTACTCTGGGCAACTTGCAATTATTCCAATCCATTTCAATTTTCCTTTATATACCGTTTGTTTATTTCTATTCTAATTATCGACCTTCGAATTAGTTTAACAAAGTACCGGAAACAA
GGCTTGTATGGTAGTTGAGTTTCCTTAATATGTTTGGGAAAGCTCAGCGGGAGAGTGCATGAATTTCTATTTAAATATTTAAGCAACATGAGCTCACATGCTTAATATTGTAAAACTATATTTGATTTAGGGCTAGTATGCACTATTTTGTAAGTTGAGTAAATTTAAGTAGATTACATTTTGCAGAGTAATTATTTTAA
AGCAAAATGACATTTCTTAAAAGTGGATCAGAAAGTGCTTTAAGATACCGTGGTATTTAGTCAAGTTTTGTGATATTAGCTTTTTCAATATTTAAGCCAGTCA

>TRINITY_DN45035_c2_g1_i11 from sample A9 / Example unspliced isoform:

TCATGGCCAAGAAGGGGGAGTTTACCATTACAAGAGGACTGCCTACTCATGCGATTTTCAGgtggttgttgatgaagaacaattcaaggttgcaggaagaaagccatttgctcacctagcagatcctgaagtggagATCTGGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGTAGCATTTAATGCTA
CTCTGGTAGATCTTGGTGAGTATGCACTTTATGTTGGATGCACTAATGGCAAGAATATACATTGCTGCTTTGAACGTTGGAACAACATCTGAAAGCATACATGGAGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGATCTAGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGTAGCATTTAATGCT
ACTCTGGTAGATCTTGGTGAGTATGCACTTTATGTTGGATGCACTGATGGCAAGAATAAACATTGCTGCTTTGAATGTTGGAACAACATATGACAGCATACATGGAGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGGTAAGAATATCAGTAATCATTGAAATTTGTTTCTAAAATATCAGCTCTATTTGCATGCATAC
CTAAATCTTATGTATTCCAAATTGTCTATGTTGAACTGCATCAAACTGATGCTAGTAAGTTTTCCAAAGAGGTCAATTCATTTTGATTTCCTATTCTTGTTTTTTTCTTTTCTTCAACAGACGGAAGTGTTATAGAGATAATCATTAACCTAATAATGCTTGCATGCATATCAGGAGATGAAGAAACATTCGGTTAATTT
TAGGATTTATGATGCTTTTTGAAAACATTTTCATTGTATTTGGAAAGTGATAACATTCTTGATATTTGTTGTGGATTAATAGCACTGGATTGCTTTGTTAATTATGATTCAAGGAGTAGAAGTAAATAAGAAGACTTTATTGAAGAAATTTGGCAATATCTTTACTTCCGAGAATTCTAGTATTCATGGATATTAAGACT
TGTTTGCTAAAATGTTTTTGGCACAAAGCACCTTATTATAATTTCCAGTTGTTGATTTTGAGAGGTATTTTATGATCATCATATTATTTCTGAAGCTTATTGACTATTGAATCAGATCTAGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGCAGTAGTTAATGCTGCTCTGGTAGATCCTGGTGAGT
ATGCACTTTATGCTGGATGCACTGATGGCAGAATATACATTGCTGCTTTGAACGTTGGAACAACATCTGACAGCATACATGGAGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGATTATCGTGATGCACTTCGGAAGAAAATAGTATACCAAGGGGGAGTGGGGAGGTGGTTGAAGATTTTTTTTATCAAGGATCTTTT
TTTTCTACTGCACGGTGAATGAAACAGCCGGGCAGTCACATCATTGGCATTTAGCATGGATGGAGTTCTGTTAGTTTCTGGGTCTGAAGACTGCACTGTTCGTGTTTGGGATACTGTAAGTTGCCAGGTTCTTCGGATTTTCAAGCATGCCAAGGGGCCAATAAGCAGTCTTATTATGGTGCCACTTTCTTCACGTGGAA
TTTTTGCAGATAATCAAGTTAGTTTCCATAACAAGGGCAGATCTTTCCTCTTACCATCACCATTGAAGAAATATAGAGAGCCAAGGGCAGGGGATCCTGGTTATGACATCTCTAATGGCCCATCAGTAATTCTTCCTTCACATGAAGTCGACTCTGTAGATGGTAGTTGTTTCAATACTCTTCTTGCCATGAAGCAACAA
ATCAAAGAGTTGCAGCAACAAGGTTCTTCGACCTCTATTCAAATGGAGTTGGAAAGGCTCAGATCAGAATACAGGCGGTCTTTGAACATGATACAACAGTGGGAACAAGTTTATCAAGACCTCCACTGCTTCTGTGTGACTGAGCTTATGGGTGGTAATAAAGCTGGGGAGGATGATGAGGAAGCTGATAGAAATAATGA
GAAAGGAAAAAAGGGAAGAGGGAAGGCCA

Intron 3 GTAAGAATAT ... TGCATATCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	53.2	43.8	49.6	16
A2	54.03	30.2	38	9
A3	50.34	39	39	15
A4	56.85	26	37.4	21
A5	52.69	14	15.6	6
A6	49.49	58.6	55.8	10
A7	51.01	84.4	88.6	14
A8	51.73	79	83.2	18
A9	50.72	75.8	77.4	11
A10	50.27	71	70.2	15

>TRINITY_DN45345_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoform

AAAGCGTTCGTGAAATGGAGTGAGGTCGAGTGAACAACTGTCCCTAAACCAAAATTTTAGACTTCGTATAAGTAGTTACCACCTTTTTTTCGGATTGTCTTTCTTTCCCGGTCTGAGCAACGAACGCCAACCGCGGTACGCTTCAGACTGGTCAAGTTCTTGCACTTCTTCCTCCTTTGTAATCTTCATATAGCTGCTCC
TTACGAGGGCACTCATGTCAACCAAGGGAGTATAGGGATATGGCTGTCCCCAATTGAGCGACGCTACTTCAGGCAGGAATGACTCGTTTGCTTTCAGGGTGATGCAAAAAGTATGAGTAGGAATAACCATTCTACAAGAAGATTGGCATGAAAAAAAATATTGGCATTCTACAAAAAGATTTTAATAACCCCAACCCGGC
AATTTATACGAATGAACCTGGTAAACAACGGGGTAAACACAATTTCGATCTGTGACCATCCCGAATCCAGTGCCCAAAGCAGATTCACGAGCAAAACACCCAGGTCCGGCTTGCGCCTACTCTATTCCGGTAAGAAGTGCCTGTCTCTTGAGATACAAGCAGGCAGAAGAGGATTAAGCTAAGCACAATATAACTCTATG
CTCAGATATATCTTGGAGTCGCCTTCGCCTGCCTGCTGAAGATAGCGTCCTTCGGTCGCAGACCTCTGCCCTTTCGCATGAATGAATGATCTAAGTGTAGCTGTCCCTGCCTGCTGAAGAGTCTGCAAATCGTCGAACTCTGTGTAAGGGTTTGTAAATTAGGTATTTGAAAGCTGGGAAGCTGTGACGGCCTCTGGCCG
TGACTGGATGGGATAAGCTGGCGTCCCCAGGAGAGTTGGTGCTCGTTGCCTCACCTGTCGATGCTGGTATCACCGGTTGGGATTTATCTACCGGCGCAGAGCGCGTGCGCCTTCGGTCTTGTGCATCGCCTCGGCATGGATTAACAACAGTTGGACAACACTTTGTAGTAGCATCACAGATTCAGAAAACTTCTGCTGGC
GGTTGTTTAATTTACTGGGCATGGAATAAGCCACAACCTGAAATTAAGAGTTTTCCTGTAGAGCCTATTGGGCCAGTTGCTTGTAATAGCGATGGCACGTTCATTGTTGGTGGAGGGTCATCAGGAAGAATTTATCTGTGGGAGGTAGCAAGTGGAAGACTCCTTAGGGTGTGGTCTGCCCATTACAAGGCTGTCACACG
CTTGGTCTTCTTTGACGATGAATCTCTTCTAATATCTGGAGCTGAAGATGGATTCATTAAGGCTTGGCCTCTTCTCATAGCTTTGGATGAAGAAGCAGATGTGCAAGCTGAATCCCAGTTTCAACCCTTGCACAGCTTTTCTGCTCATACCTTGCCAGTGACAGATATTGTATCTGGCTATGGAGGATGCAGTGCAATTA
TAGTGTCCTCCTCATTGGATTTTACCTGCAAGATCTGGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGTAGCATTTAATGCTACTCTGGTAGATCTTGGTGAGTATGCACTTTATGTTGGATGCACTAATGGCAAGAATATACATTGCTGCTTTGAACGTTGGAACAACATCTGAAAGCATACATGG
AGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGATCTAGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGCAGTAGTTAATGCTGCTCTGGTAGATCCTGGTGAGTATGCACTTTATGTTGGATGCACTGATGGCAAGAATAAACATTGCTGCTTTGAATGTTGGAACAACATATGACAGCATACATG
GAGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGGAGATGAAGAAACATTCGGTTAATTTTAGGATTTATGATGCTTTTTGAAAACATTTTCATTGTATTTGGAAAGTGATAACATTCTTGATATTTGTTGTGGATTAATAGCACTGGATTGCTTTGTTAATTATGATTCAAGGAGTAGAAGTAAATAAGAAG

>TRINITY_DN45345_c0_g1_i4 from sample A6 / Example unspliced isoform:

AAAGCGTTCGTGAAATGGAGTGAGGTCGAGTGAACAACTGTCCCTAAACCAAAATTTTAGACTTCGTATAAGTAGTTACCACCTTTTTTTCGGATTGTCTTTCTTTCCCGGTCTGAGCAACGAACGCCAACCGCGGTACGCTTCAGACTGGTCAAGTTCTTGCACTTCTTCCTCCTTTGTAATCTTCATATAGCTGCTCC
TTACGAGGGCACTCATGTCAACCAAGGGAGTATAGGGATATGGCTGTCCCCAATTGAGCGACGCTACTTCAGGCAGGAATGACTCGTTTGCTTTCAGGGTGATGCAAAAAGTATGAGTAGGAATAACCATTCTACAAGAAGATTGGCATGAAAAAAAATATTGGCATTCTACAAAAAGATTTTAATAACCCCAACCCGGC
AATTTATACGAATGAACCTGGTAAACAACGGGGTAAACACAATTTCGATCTGTGACCATCCCGAATCCAGTGCCCAAAGCAGATTCACGAGCAAAACACCCAGGTCCGGCTTGCGCCTACTCTATTCCGGTAAGAAGTGCCTGTCTCTTGAGATACAAGCAGGCAGAAGAGGATTAAGCTAAGCACAATATAACTCTATG
CTCAGATATATCTTGGAGTCGCCTTCGCCTGCCTGCTGAAGATAGCGTCCTTCGGTCGCAGACCTCTGCCCTTTCGCATGAATGAATGATCTAAGTGTAGCTGTCCCTGCCTGCTGAAGAGTCTGCAAATCGTCGAACTCTGTGTAAGGGTTTGTAAATTAGGTATTTGAAAGCTGGGAAGCTGTGACGGCCTCTGGCCG
TGACTGGATGGGATAAGCTGGCGTCCCCAGGAGAGTTGGTGCTCGTTGCCTCACCTGTCGATGCTGGTATCACCGGTTGGGATTTATCTACCGGCGCAGAGCGCGTGCGCCTTCGGTCTTGTGCATCGCCTCGGCATGGATTAACAACAGTTGGACAACACTTTGTAGTAGCATCACAGATTCAGAAAACTTCTGCTGGC
GGTTGTTTAATTTACTGGGCATGGAATAAGCCACAACCTGAAATTAAGAGTTTTCCTGTAGAGCCTATTGGGCCAGTTGCTTGTAATAGCGATGGCACGTTCATTGTTGGTGGAGGGTCATCAGGAAGAATTTATCTGTGGGAGGTAGCAAGTGGAAGACTCCTTAGGGTGTGGTCTGCCCATTACAAGGCTGTCACACG
CTTGGTCTTCTTTGACGATGAATCTCTTCTAATATCTGGAGCTGAAGATGGATTCATTAAGGCTTGGCCTCTTCTCATAGCTTTGGATGAAGAAGCAGATGTGCAAGCTGAATCCCAGTTTCAACCCTTGCACAGCTTTTCTGCTCATACCTTGCCAGTGACAGATATTGTATCTGGCTATGGAGGATGCAGTGCAATTA
TAGTGTCCTCCTCATTGGATTTTACCTGCAAGATCTGGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGTAGCATTTAATGCTACTCTGGTAGATCTTGGTGAGTATGCACTTTATGTTGGATGCACTAATGGCAAGAATATACATTGCTGCTTTGAACGTTGGAACAACATCTGAAAGCATACATGG
AGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGATCTAGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGCAGTAGTTAATGCTGCTCTGGTAGATCCTGGTGAGTATGCACTTTATGTTGGATGCACTGATGGCAAGAATAAACATTGCTGCTTTGAATGTTGGAACAACATATGACAGCATACATG
GAGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGgtaagaatatcagtaatcattgaaatttgtttctaaaatatcagctctatttgcatgcatacctaaatcttatgtattccaaattgtctatgttgaactgcatcaaactgatgctagtaagttttccaaagaggtcaattcattttgatttcctattcttgttttt
ttcttttcttcaacagacggaagtgttatagagataatcattaacctaataatgcttgcatgcatatcagGAGATGAAGAAACATTCGGTTAATTTTAGGATTTATGATGCTTTTTGAAAACATTTTCATTGTATTTGGAAAGTGATAACATTCTTGATATTTGTTGTGGATTAATAGCACTGGATTGCTTTGTTAATTA
TGATTCAAGGAGTAGAAGTAAATAAGAAG

Intron 4 GTAAGAATAT ... ATTGAATCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	69.05	43	62.2	30
A2	70.36	30.6	49.6	10.2
A3	68.31	32.8	47	18
A4	70.17	30.8	47.8	19.2
A5	68.17	14.4	19.8	6
A6	67.77	57.6	77	19.2
A7	68.79	84.4	121.6	29.6
A8	65.31	91	105.8	28.8
A9	67.16	84.4	108	31.2
A10	68.29	66.8	94	18

>TRINITY_DN48970_c0_g2_i5 from sample A7 / Example spliced isoform

TTTCACCATAAAGTTGTTGTTTAACTAAGCGTTCGTGAAATGAGCGCCTCATACTCAGCCACATTGTTTCTACATTTAAATTAAAGCCTTAAAGCATGAGGGAATTCCTTTCCAAAAGGAGATCTCAACCATCATATACCTGCTCCACTGCCTCATGGAAAAGTCGTCAGGTTATCCCTACCATAACCTACCCTCCTATA
CTGGTGATGCGGACAAGGTGGTGCTGCTTCAATAGGGTAATAAACTTAACTTGGTCCTGCAACCTTGCTTCACCTGCTAAGTCAACTGCATAACCAACAGCGGGATCTACTGAATCAACTACTCGATCAACAGCATCAACAGCGAACTTTAATATTATACCCGGCCGGTAGTGCTTTAGAGCCAGATAAGGGTTCCTTAT
TACGAACGGGGCAAGGTCGAAAGAAGAAATAAAGAAGATTTTGGCAAGCGGCGGCACCCTTTTTTCTTCTCCAGTAGGCGGAACCATCTTGTTCTGGTTCTTCTCCATATTCTTTCCGGATAAGCTGGCGTCCCCAGGAGAGTTGGTGCTCGTTGCCTCACCTGTCGATGCTGGTATCACCGGTTGGGATTTATCTACCG
GCGCAGAGCGCGTTCGCCTTCGGTCTTGTGCATCGCCTCGGCATGGATTAACAACAGTTGGACAACACTATGTAGTAGCATCACAGATACAGAAAACTTCTGCTGGCGGTAGTTTAATTTACTGGTCATGGAATAAGCCACAACCTGAAATTAAGAGTTTTCCTGTAGAGCCTATTGGGCCAGTTGCTTGTAATAGTGAT
GGCACGTTCATTGTTGGTGGAGGGTCATCAGGAAGAATTTATCTGTGGGAGGTAGCAAGTGGAAGACTCCTTAGGGTGTGGTCTGCCCATTACAAGGCTGTCACACGCTTGGTCTTCTTTGACGATGAATCTCTTCTAATATCTGGAGCTGAAGATGGATTCATTAAGGCTTGGCCTCTTCTCATAGCTTTGGATGAAGA
AGCAGATGTGCAAGCTGAATCCCAGTTTCAACCCTTACACAGCTTTTCTGCTCATACCTTGCCAGTGACAGATATTGTATCTGGCTATGGAGGATGCAGTGCAATTATAGTGTCCTCCTCATTGGATTTTACCTGCAAGATCTGGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGCAGCAGTTAATG
CTGTTGTGGTAGATCCTGGTGAGTATGCACTTTATGCTGGATGCACTGATGGCAGAATATACATTGCTGCTTTGAACGTTGGAACAACATCTGACAGCATACATGGAGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGATCTAGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGCAGTAGTTAATG
CTGCTCTGGTAGATCCTGGTGAGTATGCA

>TRINITY_DN48970_c0_g2_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:

TTTCACCATAAAGTTGTTGTTTAACTAAGCGTTCGTGAAATGAGCGCCTCATACTCAGCCACATTGTTTCTACATTTAAATTAAAGCCTTAAAGCATGAGGGAATTCCTTTCCAAAAGGAGATCTCAACCATCATATACCTGCTCCACTGCCTCATGGAAAAGTCGTCAGGTTATCCCTACCATAACCTACCCTCCTATA
CTGGTGATGCGGACAAGGTGGTGCTGCTTCAATAGGGTAATAAACTTAACTTGGTCCTGCAACCTTGCTTCACCTGCTAAGTCAACTGCATAACCAACAGCGGGATCTACTGAATCAACTACTCGATCAACAGCATCAACAGCGAACTTTAATATTATACCCGGCCGGTAGTGCTTTAGAGCCAGATAAGGGTTCCTTAT
TACGAACGGGGCAAGGTCGAAAGAAGAAATAAAGAAGATTTTGGCAAGCGGCGGCACCCTTTTTTCTTCTCCAGTAGGCGGAACCATCTTGTTCTGGTTCTTCTCCATATTCTTTCCGGATAAGCTGGCGTCCCCAGGAGAGTTGGTGCTCGTTGCCTCACCTGTCGATGCTGGTATCACCGGTTGGGATTTATCTACCG
GCGCAGAGCGCGTTCGCCTTCGGTCTTGTGCATCGCCTCGGCATGGATTAACAACAGTTGGACAACACTATGTAGTAGCATCACAGATACAGAAAACTTCTGCTGGCGGTAGTTTAATTTACTGGTCATGGAATAAGCCACAACCTGAAATTAAGAGTTTTCCTGTAGAGCCTATTGGGCCAGTTGCTTGTAATAGTGAT
GGCACGTTCATTGTTGGTGGAGGGTCATCAGGAAGAATTTATCTGTGGGAGGTAGCAAGTGGAAGACTCCTTAGGGTGTGGTCTGCCCATTACAAGGCTGTCACACGCTTGGTCTTCTTTGACGATGAATCTCTTCTAATATCTGGAGCTGAAGATGGATTCATTAAGGCTTGGCCTCTTCTCATAGCTTTGGATGAAGA
AGCAGATGTGCAAGCTGAATCCCAGTTTCAACCCTTACACAGCTTTTCTGCTCATACCTTGCCAGTGACAGATATTGTATCTGGCTATGGAGGATGCAGTGCAATTATAGTGTCCTCCTCATTGGATTTTACCTGCAAGATCTGGAGTTTGGCTTTGGGGGTTCTTTTAAGAACCATTAAGTTTCCAGCAGCAGTTAATG
CTGTTGTGGTAGATCCTGGTGAGTATGCACTTTATGCTGGATGCACTGATGGCAGAATATACATTGCTGCTTTGAACGTTGGAACAACATCTGACAGCATACATGGAGATGGTATTACTGGGACACTTGTTGACCACAGgtaagaatatcagtaatcattgaaatttgtttctaaaatatcagctctatttgcatgcata
cctaaatcttatgtattccaaattgtctatgttgaactgcatcaaactgatgctagtaagttttccaaagaggtcaattcattttgatttcctattcttgtttttttcttttcttcaacagacggaagtgttatagagataatcattaacctaataatgcttgcatgcatatcaggagatgaagaaacattcggttaatt
ttaggatttatgatgctttttgaaaacattttcattgtatttggaaagtgataacattcttgatatttgttgtggattaatagcactggattgctttgttaattatgattcaaggagtagaagtaaataagaagactttattgaagaaatttggcaatatctttacttccgagaattctagtattcatggatattaagac
ttgtttgctaaaatgtttttggcacaaagcaccttattataatttccagttgttgattttgagaggtattttatgatcatcatattatttctgaagcttattgactattgaatcagATCTAGAGTTTGGCTTTGGG