sp|Q9LT48|PP244_ARATH ----> Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g20730


Intron 1 GTTCATTCTC ... ATGATTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A145.76161611
A246.15739
A348.579314
A450999
A546.67425
A61000212
A754.5510618
A848.15749
A957.69111119
A1068.187624



>TRINITY_DN115995_c7_g2_i4 from sample A1 / Example spliced isoform
CGCCGAGTGTTTGACAAAATGATAAAGCGAAATTCGGTCTCGTGGACCGCAATGATTGCTGGTTATGCACAGAATGATTATGGGGAGGAGGCCCTGCATCTGTTTCAGCAAATGCAAAGGACAAGGGCATGCGATAAGGTTAACCAGTTTACATGCTCGAGCATTCTCGGTGCATGTGCTGGCCTAGCATTGCTAGAGAA
GGGCAGGCAGGGTATGTCCAGAACGAGCAATTTATGGAGGCTCTGTCATTCTTTCGGCGAATGTGTTGTGAAGATATGAAGTTGGACCATTTTACTTTCTGCACCGTTCTTGGTGCATGCGCCGGCCTCAAAGACATCGGACAGGGCAAGCAAATCCATGGCTGTGTTATTAAATCTAGGCTGGATTCAGAAGAATTTGT
GGAGAATGCTCTTGTTGACATGTATGCCAAATGTGGGAGCATGGACAATGCACGTGTTATGTTTGATTTGATGTCCCCGAAAGACGTGATCTCTTGCACTGCGATGATTACTGGTTATGCTCAACAACATGGTCATGATGAAGAAGCTTTAGCAATCTATTATGAAATGTGGCGTGCTGGTATAAAACCTGACCATGTCA
TGTTTTCAAGTGTTCTCAGTGCATGTGCTGGCCTTGCTGCCCTGGAGCAGGGCAGGCAAATCCATGCTCACATTTTTAAAGTTGAAGCCGAGTCGTTTATTGTTTTGGGAAACGCTCTTGTTGACATGTATGCAAAATCGGGGAGGATAGAAGATGCCCGACATCTGTTTGAC


>TRINITY_DN115995_c7_g2_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CGCCGAGTGTTTGACAAAATGATAAAGCGAAATTCGGTCTCGTGGACCGCAATGATTGCTGGTTATGCACAGAATGATTATGGGGAGGAGGCCCTGCATCTGTTTCAGCAAATGCAAAGGACAAGGGCATGCGATAAGGTTAACCAGTTTACATGCTCGAGCATTCTCGGTGCATGTGCTGGCCTAGCATTGCTAGAGAA
GGGCAGGCAGgttcattctctcaccattaagactggttttagtttagatttatttgtggggagtagcctcgttgacatgtattctaaatgtgagagatcagaagatgcatggaaagtgtttgataagatgcctgaaaaagaccaggtctcatggagtgcaatgattgcagGGTATGTCCAGAACGAGCAATTTATGGAGG
CTCTGTCATTCTTTCGGCGAATGTGTTGTGAAGATATGAAGTTGGACCATTTTACTTTCTGCACCGTTCTTGGTGCATGCGCCGGCCTCAAAGACATCGGACAGGGCAAGCAAATCCATGGCTGTGTTATTAAATCTAGGCTGGATTCAGAAGAATTTGTGGAGAATGCTCTTGTTGACATGTATGCCAAATGTGGGAGC
ATGGACAATGCACGTGTTATGTTTGATTTGATGTCCCCGAAAGACGTGATCTCTTGCACTGCGATGATTACTGGTTATGCTCAACAACATGGTCATGATGAAGAAGCTTTAGCAATCTATTATGAAATGTGGCGTGCTGGTATAAAACCTGACCATGTCATGTTTTCAAGTGTTCTCAGTGCATGTGCTGGCCTTGCTGC
CCTGGAGCAGGGCAGGCAAATCCATGCTCACATTTTTAAAGTTGAAGCCGAGTCGTTTATTGTTTTGGGAAACGCTCTTGTTGACATGTATGCAAAATCGGGGAGGATAGAAGATGCCCGACATCTGTTTGAC