NA ----> NA
Intron 1 GTAGGCAGTT ... TGTGGACCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 43.72 | 56 | 55 | 32 |
| A2 | 34.65 | 66 | 48 | 22 |
| A3 | 33.02 | 72 | 46 | 25 |
| A4 | 43.02 | 51 | 49 | 28 |
| A5 | 39.58 | 29 | 26 | 12 |
| A6 | 29.3 | 462 | 241 | 142 |
| A7 | 26.61 | 520 | 251 | 126 |
| A8 | 29.46 | 553 | 302 | 160 |
| A9 | 29.24 | 473 | 264 | 127 |
| A10 | 27.68 | 384 | 200 | 94 |
>TRINITY_DN117544_c5_g1_i4 from sample A3 / Example spliced isoformGTCTTTTTTAACACCGTTAACTCTGCTTTTTTAATTCCACTCTGTGTCGTTTGTTGTTGCAGCAAAATGAAAGGTGGGGCAGCGTTTCGGCTTTTTGTATGTAGCCGTTGGATGGGGAGGATGGATATTTGCTGTGCCTCTCTCCCCTCGCGCTTTTATTTAAATACTTTACATCATAGAAATTGATCTCCGCAAGTGTT
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>TRINITY_DN117544_c5_g1_i6 from sample A3 / Example unspliced isoform:GTCTTTTTTAACACCGTTAACTCTGCTTTTTTAATTCCACTCTGTGTCGTTTGTTGTTGCAGCAAAATGAAAGGTGGGGCAGCGTTTCGGCTTTTTGTATGTAGCCGTTGGATGGGGAGGATGGATATTTGCTGTGCCTCTCTCCCCTCGCGCTTTTATTTAAATACTTTACATCATAGAAATTGATCTCCGCAAGTGTT
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TGAGGGTTGGTCCCATGTTAATCAAGGAGATGTTTGGAGAAATTTATCAAACTTGTCCAAAATGAATTTTAAGAAAACCATGTTTGACTCTATTGAGGGTTGGTCCCATGTTGGCCCAATTATTACTTCCTATATTATAATCAAATAATTAAATATATATGTCTTTTGGTGAAACTTTGTTGGCTTATATAATAGATAGA
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