sp|Q9SLN8|DBR_TOBAC ----> 2-alkenal reductase (NADP(+)-dependent)


Intron 1 GTGAGATTTT ... GTTTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A132.0553325
A2202827
A327.7865425
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A619.2342010
A72239011
A822.7334010
A921.1541011
A1015.383306



>TRINITY_DN117008_c2_g3_i30 from sample A3 / Example spliced isoform
TGGCCGGAAAAGGAATGATCGCGGAGGATGTAGACAGAAGAGTCATAGAGCGAAATTTCAAGATATTGATACAGCTTTCGGCATTAAACAGACAACACTTCGACACGGGAGAACGTTGATTCATTGACAATGTTAGCACCGGAAACGTTTCATATATAAAGAGACCATTCTCCAAACAAAACCTAAAGAACCACATTATC
CTTGGACGGCTAAATCTGCACAGATGCTGAATTAACCCCGCTTCTACTTGATCACATCGTTTGAAGTTTTAATTATTTAACATGGAGCTCAAGGGCAAGGTTGCACTAGTCACTGGAGGAGGAGCCGGAATTGGACGAGCTCTTTGTCTTGCTTTGGCAAAAAAAGGTGTTCGTATGACAATTCTTGATTATTCAGAAAC
ATCTGGAAAAGAAGTTGTTGGTGTTCTGGAAGAAGAGTATGCCAAATTCTATAGCGATCTGGAAAAGCCTACAGCATTATTTATTAGATGCGATGTTGCTAATCCAGGGGACCTTGCATCTGCTTTTGTGAAGCATTTGGACACATTTCGAAGACTGGACATTTGCATTAACAATGCTGGTATAGGCGAGCAAATGCCTT
TTGTTAAGGACAAGAGTAATGATAGAAGTGGTCAATGGAGGCGCATTATTGACATAAATCTAGTGGCTGTCATTGACAGTACTCGTTTGGCAATTCAAGCTATGGAAGCAGGAGGCTACAATGGAACAATTTTGAATATCGGATCTGCATCAGGGCTTTATCCATCATACTTTATGCCTATATATGGTGCTTCGAAAGGT
GGTGTGGTTATGTTTTCAAGATCACTTGGCGCTTACAAACGCAAGGGCATTCGTGTGAATGTACTTTGTCCTGAGTTTGTGGACACTGACTTGACCAAGAAAGTGCAGCCTAGATTTATTGATCTAATCGGAGGGTTCTTACCTATGGATATGATTATTAAAGGTGCTTTTGAGCTTATAGAAGATGAGACAAAGGCTGG
TCAATGTCTGTGGATAACAAAACGAAGAGGGTTGGAGTATTGGCCAACTCCTGAAGAGAAGAAAAAATACCTGGCAAAATTTCCACGTTCAGATAATAGTGTCTCATATAAACCTCAAGCAAATGTTGAGATTGTGCCAACTATTCCCAGCAGTTTTGAGAAAGTAGTGGTTCACAGACTGGATAACAATTTTCGACAAG
CTACCAAAATGGAGAGAACATACTTGAAGCTGCCCATTAAACCTGGTCATGTTCTTGTGAAAAATATATATGCAGGAGTAAATGCTAGTGATATAAATTACAGTTCCGGGCGTTATTTTGGGAATGCGAAGGAAGCTGGTTCTCGTCTACCGTTTGATGCAGGATTTGAGGCTGTGGGTTTAGTTGTAGCAGTTGGTGAT
TTTGTTGAGGGTTTAACTATAGGTGGGCCTGTGGCAGCTATGTCATTTGGTGCATATGCTGAATTCACTGTGGTTCCGGCAAAACATGTTATACCAGTGCCTAGACTAATACCTGAAGCGGTGGCAATGCTTACATCTGGTCTCACAGCATCAATTGGATTGGAGGAGGCAGGAAGGATGGAATCAGGTCAGACAGTTCT
AGTTACAGCGGCTGCTGGGGGGACTGGACAGTTTGCTGTTCAGCTGGCAAAAATAGCAGGAAATAAGGTGGTTGCAACATGTGGAGGAACACAAAAGGCGGCCCTTCTCAAGGACTTTGGTGTTGATAGGGTGATCGACTACAAAAAAGAAGATATTAAATTGGTATTGAAAAAGGAGTTTCCAAAAGGTGTCAATATTG
TATATGAATCTGTTGGAGGAGAAATGTTCAATACATGCTTAAATGCCCTTGCAATTCATGGTCATCTTGTTGTTATCGGGATGATGTCTCAGGTGAATGTCCTAACTTGTAATAGTCTTGAAACCTGCTATGTTTATGTTAGTTATCTTATTAAGGTATATTGTTTGAGATTATATGACTCTTAATTGAGAATGCTGCTA
ACTACTGATTGCTATGCAATTAGAGTAGAGCTTCTCTCCAATGAAAACTTCTGCTGATATTGTTCCCAATACTGTTGCAAAAATAAGCAGTCCCATAGAATGGTGTTTTGAGTGATTTGGATTTGGTTCATTTAAGGCATTTATCATTTGTTAAACCACTTTTCGCCAGTCTAGCTTTGGTTGGCAGACCCTGGAAAATA
ACCAGCTACGCAAACACTG


>TRINITY_DN117008_c2_g3_i22 from sample A3 / Example unspliced isoform:
ATGCAGGAGTAAATGCTAGTGATgtgagattttagatcctttatatttacttgcatgtgaggtccttttgagataaattgttgtatttgttcttgaagtttcttttctgaatgcatatggataaaaaaaaacgatgtttggggtttttcatttgtagaatcatatggataaaaaaaacaatgtttggagttattcatttg
tagaatatgacacaaatctcatattctgaagttgatttgtttttgcag
ATAAATTACAGTTCCGGGCGTTATTTTGGGAATGCGAAGGAAGCTGGTTCTCGTCTACCGTTTGATGCAGGATTTGAGGCTGTGGGTTTAGTTGTAGCAGTTGGTGATTTTGTTGAGGGTTTAACTATAGGTGGGCCTGTGGCAGCTATGTC
ATTTGGTGCATATGCTGAATTCACTGTGGTTCCGGCAAAACATGTTATACCAGTGCCTAGACTAATACCTGAAGCGGTGGCAATGCTTACATCTGGTCTCACAGCATCAATTGGATTGGAGGAGGCAGGAAGGATGGAATCAGGTCAGACAGTTCTAGTTACAGCGGCTGCTGGGGGGACTGGACAGTTTGCTGTTCAGC
TGGCAAAAATAGCAGGAAATAAGGTGGTTGCAACATGTGGAGGAACACAAAAGGCGGCCCTTCTCAAGGACTTTGGTGTTGATAGGGTGATCGACTACAAAAAAGAAGATATTAAATTGGTATTGAAAAAGGAGTTTCCAAAAGGTGTCAATATTGTATATGAATCTGTTGGAGGAGAAATGTTCAATACATGCTTAAAT
GCCCTTGCAATTCATGGTCATCTTGTTGTTATCGGGATGATGTCTCAGTATCAAGGAGAGAGCGGATGGAAACCATCAAACTATACTGGACTTTGTGAGAAGATTCTCTCTAAGAGTCAGTCAGTGGCTGGCTTTTTTTTAATGAATTATGCACATTTATGGCGCTTACATATGGAAAGACTTCACAACCTTTATACTAC
TGGAAAGCTTAAGATTGCATTAGACCCAAAGCAGTTTTTGGGTGTAAAGTCAGTTGCAGATGCTGTTGAATATCTCCACTCTGGTCAAAGCATTGGCAAGGTTGTTGTCTGCATAGATCCAAGCTTCAGTCAAGTAACTGCACGGTTGTAGGTGTGGGAATTTGAATTTTTCATCTCTTCATCAAAACATGCATGCGAAA
TGCCTGCAGTTGAGCACTAGTGTATTTATTTCTTTAAAGCTTATTCTGACATTGATCATTATTATTGGATAATACTTGTAGATTATTAGTGTCTCCATTGTGGTATAATTATTGTTGTAACTCATTTAAAATGGTAATACTGTCACAAAACAGTGAACTAGTGGAAGGAGCAAGAAATGTGGTAAGCTTGTTCCTCGGCA
AATTGGCATTGGATAATGGATTTTAAAGAGGTCAATGCCAATGAAAAAAATTTGCATGATTTTGGCTTGACCTTTTAAAACTCCAGTCACTAATAAACAGCATAGCATTACATCTAAAATGCAATGTTATATGCTGTCGACAGCAGCATAAACACAAACCCCATGAGGCCATGCACCATGTACAAGTCATTGATCGATTG
GCTATTCAATGACTCCCACTTGAGATTCACAATTCCTTTTAAACGGACCATTTTTTTTCTTGTAAAATATGAATACACTTGAATGTTTGGTTGGCTACCCAAAGAGTCTCTCTTGATATTCACAAATTTTGAAAAACATAACATTTGTTTTTCTTGTATTGAAAGCGTGCACATATGAGAGGAGATAATAACCACAAGTG
ACCTC




Intron 2 GTAAATATTG ... AATGCTGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A50300
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A921.511351037
A1022.7368020



>TRINITY_DN44306_c2_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoform
AGCGGAGGATGTAGACAGAAGAGTCATAGAGCGAAATTTCAAGATATTGATACAGCTTTCGGCATTAAACAGACAACACTTCGACACGGGAGAACGTTGATTCATTGACAATGTTAGCACCGGAAACGTTTCATATATAAAGAGACCATTCTCCAAACAAAACCTAAAGAACCACATTATCCTTGGACGGCTAAATCTGC
ACAGATGCTGAATTAACCCCGCTTCTACTTGATCACATCGTTTGAAGTTTTAATTATTTAACATGGAGCTCAAGGGCAAGGTTGCACTAGTCACTGGAGGAGGAGCCGGAATTGGACGAGCTCTTTGTCTTGCTTTGGCAAAAAAAGGTGTTCGTATGACAATTCTTGATTATTCAGAAACATCTGGAAAAGAAGTTGTT
GGTGTTCTGGAAGAAGAGTATGCCAAATTCTATAGCGATCTGGAAAAGCCTACAGCATTATTTATTAGATGCGATGTTGCTAATCCAGGGGACCTTGCATCTGCTTTTGTGAAGCATTTGGACACATTTCGAAGACTGGACATTTGCATTAACAATGCTGGTATAGGCGAGCAAATGCCTTTTGTTAAGGACAAGAGTAA
TGATAGAAGTGGTCAATGGAGGCGCATTATTGACATAAATCTAGTGGCTGTCATTGACAGTACTCGTTTGGCAATTCAAGCTATGGAAGCAGGAGGCTACAATGGAACAATTTTGAATATCGGATCTGCATCAGGGCTTTATCCATCATACTTTATGCCTATATATGGTGCTTCGAAAGGTGGTGTGGTTATGTTTTCAA
GATCACTTGGCGCTTACAAACGCAAGGGCATTCGTGTGAATGTACTTTGTCCTGAGTTTGTGGACACTGACTTGACCAAGAAAGTGCAGCCTAGATTTATTGATCTAATCGGAGGGTTCTTACCTATGGATATGATTATTAAAGGTGCTTTTGAGCTTATAGAAGATGAGACAAAGGCTGGTCAATGTCTGTGGATAACA
AAACGAAGAGGGTTGGAGTATTGGCCAACTCCTGAAGAGAAGAAAAAATACCTGGCAAAATTTCCACGTTCAGATAATAGTGTCTCATATAAACCTCAAGCAAATGTTGAGATTGTGCCAACTATTCCCAGCAGTTTTGAGAAAGTAGTGGTTCACAGACTGGATAACAATTTTCGACAAGCTACCAAAATGGAGAGAAC
ATACTTGAAGCTGCCCATTAAACCTGGTCATGTTCTTGTGAAAAATATATATGCAGGAGTAAATGCTAGTGATATAAATTACAGTTCCGGGCGTTATTTTGGGAATGCGAAGGAAGCTGGTTCTCGTCTACCGTTTGATGCAGGATTTGAGGCTGTGGGTTTAGTTGTAGCAGTTGGTGATTTTGTTGAGGGTTTAACTA
TAGGTGGGCCTGTGGCAGCTATGTCATTTGGTGCATATGCTGAATTCACTGTGGTTCCGGCAAAACATGTTATACCAGTGCCTAGACTAATACCTGAAGCGGTGGCAATGCTTACATCTGGTCTCACAGCATCAATTGGATTGGAGGAGGCAGGAAGGATGGAATCAGGTCAGACAGTTCTAGTTACAGCGGCTGCTGGG
GGGACTGGACAGTTTGCTGTTCAGCTGGCAAAAATAGCAGGAAATAAGGTGGTTGCAACATGTGGAGGAACACAAAAGGCGGCCCTTCTCAAGGACTTTGGTGTTGATAGGGTGATCGACTACAAAAAAGAAGATATTAAATTGGTATTGAAAAAGGAGTTTCCAAAAGGTGTCAATATTGTATATGAATCTGTTGGAGG
AGAAATGTTCAATACATGCTTAAATGCCCTTGCAATTCATGGTCATCTTGTTGTTATCGGGATGATGTCTCAGTATCAAGGAGAGAGCGGATGGAAACCATCAAACTATACTGGACTTTGTGAGAAGATTCTCTCTAAGAGTCAGTCAGTGGCTGGCTTTTTTTTAATGAATTATGCACATTTATGGCGCTTACATATGG
AAAGACTTCACAACCTTTATACTACTGGAAAGCTTAAGATTGCATTAGACCCAAAGCAGTTTTTGGGTGTAAAGTCAGTTGCAGATGCTGTTGAATATCTCCACTCTGGTCAAAGCATTGGCAAGGTTGTTGTCTGCATAGATCCAAGCTTCAGTCAAGTAACTGCACGGTTGTAGGTGTGGGAATTTGAATTTTTCATC
TCTTCATCAAAACATGCATGCGAAATGCCTGCAGTTGAGCACTAGTGTATTTATTTCTTTAAAGCTTATTCTGACATTGATCATTATTATTGGATAATACTTGTAGATTATTAGTGTCTCCATTGTGGTATAATTATTGTTGTAACTCATTTAAAATGGTAATACTGTCACAAAACAGTGAACTAGTGGAAGGAGCAAGA
AATGTGGTAAGCTTGTTCCTCGGCAAATTGGCATTGGATAATGGATTTTAAAGAGGTCAATGCCAATGAAAAAAATTTGCATGATTTTGGCTTGACCTTTTAAAACTCCAGTCACTAATAAACAGCATAGCATTACATCTAAAATGCAATGTTATATGCTGTCGACAGCAGCATAAACACAAACCCCATGAGGCCATGCA
CCATGTACAAGTCATTGATCGATTGGCTATTCAATGACTCCCACTTGAGATTCACAATTCCTTTTAAACGGACCATTTTTTTTCTTGTAAAATATGAATACACTTGAATGGTTGGTTGGCTACCCAAAGAGTCTCTCTTGATATTCACAAATTTTGAAAAACATAACATTTGTTTTTCTTGTATTGAAAGCGTGCACATA
TGAGAGGAGATAATAACCACAAGTGACCTATTTTGACATCATTAAGATATTCACAAATTTTGAAAAAC


>TRINITY_DN44306_c2_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:
CTCTGATACTGAGAACCTTCCCTCCACTTGAATCTGCACTTGAACAAGACAACGCAACGACAAACAAACAACCAAGCAATCATTCAATATTCCCCACTTAATACAGACACTGGCTTTCAACCCTTGTTTTGGGTTTTTTTGGCTAACTATTGTTTACATCATTTCTTTCGGAAAGGACATCCATTAAACATTCTAATTGC
ATTGCTCATCTCAAAGAGTAATTTAGGCAATCTATGATTGAAGGTTATTTCATGAGCAAAATGCATTCTTAAATGTTTGTGTTGAGTGTAAATCTTCATTGATCGTAGTACCTTTTACAGAAGATGCTCATGGTTTTAAACTTTATGGACATTAGGTTGTTATTTCAAGATGCACCTCAAAAGGTCCTCTTTCTCAAGAA
GAGAAAACCATTATCAATTACAGTGCATTGTGCAGCAGTCCAGGGATTCCTCTAAATTTCTCAAGAACCAATAAAACTCACATTTTTGTTTTGCTTCAATCAGATTGCATTAGACCCAAAGCAGTTTTTGGGTGTAAAGTCAGTTGCAGATGCTGTTGAATATCTCCACTCTGGTCAAAGCATTGGCAAGgtaaatattg
atactctacaaatattctctattcacttcaatctgattgaaggccaattcttgtttaccagttacatgaaattcgtgctgactaagtcaaagtttcaaaccaagaaatttatttttttgtgcaccagactaggaagacttattcgtcttgctatggaaatgctgtag
GTTGTTGTCTGCATAGATCCAAGCTTCAGTCAA
GTAACTGCACGGTTGTAGGTGTGGGAATTTGAATTTTTCATCTCTTCATCAAAACATGCATGCGAAATGCCTGCAGTTGAGCACTAGTGTATTTATTTCTTTAAAGCTTATTCTGACATTGATCATTATTATTGGATAATACTTGTAGATTATTAGTGTCTCCATTGTGGTATAATTATTGTTGTAACTCATTTAAAATG
GTAATACTGTCACAAAACAGTGAACTAGTGGAAGGAGCAAGAAATGTGGTAAGCTTGTTCCTCGGCAAATTGGCATTGGATAATGGATTTTAAAGAGGTCAATGCCAATGAAAAAAATTTGCATGATTTTGGCTTGACCTTTTAAAACTCCAGTCACTAATAAACAGCATAGCATTACATCTAAAATGCAATGTTATATG
CTGTCGACAGCAGCATAAACACAAACCCCATGAGGCCATGCACCATGTACAAGTCATTGATCGATTGGCTATTCAATGACTCCCACTTGAGATTCACAATTCCTTTTAAACGGACCATTTTTTTTCTTGTAAAATATGAATACACTTGAATGGTTGGTTGGCTACCCAAAGAGTCTCTCTTGATATTCACAAATTTTGAA
AAACATAACATTTGTTTTTCTTGTATTGAAAGCGTGCACATATGAGAGGAGATAATAACCACAAGTGACCTATTTTGACATCATTAAGATATTCACAAATTTTGAAAAAC




Intron 3 GTTGTTATTT ... CTTCAATCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A134.6916710
A226.321473
A321.74941
A423.332368
A520210
A623.5352824
A725.76852831
A828.48591532
A925.481172753
A1021.55711821



>TRINITY_DN44331_c0_g4_i3 from sample A10 / Example spliced isoform
AGCGGAGGATGTAGACAGAAGAGTCATAGAGCGAAATTTCAAGATATTGATACAGCTTTCGGCATTAAACAGACAACACTTCGACACGGGAGAACGTTGATTCATTGACAATGTTAGCACCGGAAACGTTTCATATATAAAGAGACCATTCTCCAAACAAAACCTAAAGAACCACATTATCCTTGGACGGCTAAATCTGC
ACAGATGCTGAATTAACCCCGCTTCTACTTGATCACATCGTTTGAAGTTTTAATTATTTAACATGGAGCTCAAGGGCAAGGTTGCACTAGTCACTGGAGGAGGAGCCGGAATTGGACGAGCTCTTTGTCTTGCTTTGGCAAAAAAAGGTGTTCGTATGACAATTCTTGATTATTCAGAAACATCTGGAAAAGAAGTTGTT
GGTGTTCTGGAAGAAGAGTATGCCAAATTCTATAGCGATCTGGAAAAGCCTACAGCATTATTTATTAGATGCGATGTTGCTAATCCAGGGGACCTTGCATCTGCTTTTGTGAAGCATTTGGACACATTTCGAAGACTGGACATTTGCATTAACAATGCTGGTATAGGCGAGCAAATGCCTTTTGTTAAGGACAAGAGTAA
TGATAGAAGTGGTCAATGGAGGCGCATTATTGACATAAATCTAGTGGCTGTCATTGACAGTACTCGTTTGGCAATTCAAGCTATGGAAGCAGGAGGCTACAATGGAACAATTTTGAATATCGGATCTGCATCAGGGCTTTATCCATCATACTTTATGCCTATATATGGTGCTTCGAAAGGTGGTGTGGTTATGTTTTCAA
GATCACTTGGCGCTTACAAACGCAAGGGCATTCGTGTGAATGTACTTTGTCCTGAGTTTGTGGACACTGACTTGACCAAGAAAGTGCAGCCTAGATTTATTGATCTAATCGGAGGGTTCTTACCTATGGATATGATTATTAAAGGTGCTTTTGAGCTTATAGAAGATGAGACAAAGGCTGGTCAATGTCTGTGGATAACA
AAACGAAGAGGGTTGGAGTATTGGCCAACTCCTGAAGAGAAGAAAAAATACCTGGCAAAATTTCCACGTTCAGATAATAGTGTCTCATATAAACCTCAAGCAAATGTTGAGATTGTGCCAACTATTCCCAGCAGTTTTGAGAAAGTAGTGGTTCACAGACTGGATAACAATTTTCGACAAGCTACCAAAATGGAGAGAAC
ATACTTGAAGCTGCCCATTAAACCTGGTCATGTTCTTGTGAAAAATATATATGCAGGAGTAAATGCTAGTGATATAAATTACAGTTCCGGGCGTTATTTTGGGAATGCGAAGGAAGCTGGTTCTCGTCTACCGTTTGATGCAGGATTTGAGGCTGTGGGTTTAGTTGTAGCATTTGGTGATTTTGTTGAGGGTTTAACTA
TAGGTGGGCCTGTGGCAGCTATGTCATTTGGTGCATATGCTGAATTCACTGTGGTTCCGGCAAAACATGTTATACCAGTGCCTAGACTAATACCTGAAGCGGTGGCAATGCTTACATCTGGTCTCACAGCATCAATTGGATTGGAGGAGGCAGGAAGGATGGAATCAGGTCAGACAGTTCTAGTTACAGCGGCTGCTGGG
GGGACTGGACAGTTTGCTGTTCAGCTGGCAAAAATAGCAGGAAATAAGGTGGTTGCAACATGTGGAGGAACACAAAAGGCGGCCCTTCTCAAGGACTTTGGTGTTGATAGGGTGATCGACTACAAAAAAGAAGATATTAAATTGGTATTGAAAAAGGAGTTTCCAAAAGGTGTCAATATTGTATATGAATCTGTTGGAGG
AGAAATGTTCAATACATGCTTAAATGCCCTTGCAATTCATGGTCATCTTGTTGTTATCGGGATGATGTCTCAGTATCAAGGAGAGAGCGGATGGAAACCATCAAACTATACTGGACTTTGTGAGAAGATTCTCTCTAAGAGTCAGTCAGTGGCTGGCTTTTTTTTAATGAATTATGCACATTTATGGCGCTTACATATGG
AAAGACTTCACAACCTTTATACTACTGGAAAGCTTAAGATTGCATTAGACCCAAAGCAGTTTTTGGGTGTAAAGTCAGTTGCAGATGCTGTTGAATATCTCCACTCTGGTCAAAGCATTGGCAAGGTTGTTGTCTGCATAGATCCAAGCTTCAGTCAAGTAACTGCACGGTTGTAGGTGTGGGAATTTGAATTTTTCATC
TCTTCATCAAAACATGCATGCGAAATGCCTGCAGTTGAGCACTAGTGTATTTATTTCTTTAAAGCTTATTCTGACATTGATCATTATTATTGGATAATACTTGTAGATTATTAGTGTCTCCATTGTGGTATAATTATTGTTGTAACTCATTTAAAATGGTAATACTGTCACAAAACAGTGAACTAGTGGAAGGAGCAAGA
AATGTGGTAAGCTTGTTCCTCGGCAAATTGGCATTGGATAATGGATTTTAAAGAGGTCAATGCCAATGAAAAAAATTTGCATGATTTTGGCTTGACCTTTTAAAACTCCAGTCACTAATAAACAGCATAGCATTACATCTAAAATGCAATGTTATATGCTGTCGACAGCAGCATAAACACAAACCCCATGAGGCCATGCA
CCATGTACAAGTCATTGATCGATTGGCTATTCAATGACTCCCACTTGAGATTCACAATTCCTTTTAAACGGACCATTTTTTTTCTTGTAAAATATGAATACACTTGAATGGTTGGTTGGCTACCCAAAGAGTCTCTCTTGATATTCACAAATTTTGAAAAACATAACATTTGTTTTTCTTGTATTGAAAGCGTGCACATA
TGAGAGGAGATAATAACCACAAGTGACCTATTTTGACATCATTAAGATATTCACAAATTTTGAAAAACATAACATTTGTTTTGCTTGTATTAAAACTGTGCACATATGAGAGAGGAGATAATCACAAGTTACCTATTTTGACATCATTAAGATCATTGCATTTCATGGCTTCTGTTAGTATTATAATGTACTTAATAAAA
TCAGGA


>TRINITY_DN44331_c0_g4_i1 from sample A10 / Example unspliced isoform:
AGCGGAGGATGTAGACAGAAGAGTCATAGAGCGAAATTTCAAGATATTGATACAGCTTTCGGCATTAAACAGACAACACTTCGACACGGGAGAACGTTGATTCATTGACAATGTTAGCACCGGAAACGTTTCATATATAAAGAGACCATTCTCCAAACAAAACCTAAAGAACCACATTATCCTTGGACGGCTAAATCTGC
ACAGATGCTGAATTAACCCCGCTTCTACTTGATCACATCGTTTGAAGTTTTAATTATTTAACATGGAGCTCAAGGGCAAGGTTGCACTAGTCACTGGAGGAGGAGCCGGAATTGGACGAGCTCTTTGTCTTGCTTTGGCAAAAAAAGGTGTTCGTATGACAATTCTTGATTATTCAGAAACATCTGGAAAAGAAGTTGTT
GGTGTTCTGGAAGAAGAGTATGCCAAATTCTATAGCGATCTGGAAAAGCCTACAGCATTATTTATTAGATGCGATGTTGCTAATCCAGGGGACCTTGCATCTGCTTTTGTGAAGCATTTGGACACATTTCGAAGACTGGACATTTGCATTAACAATGCTGGTATAGGCGAGCAAATGCCTTTTGTTAAGGACAAGAGTAA
TGATAGAAGTGGTCAATGGAGGCGCATTATTGACATAAATCTAGTGGCTGTCATTGACAGTACTCGTTTGGCAATTCAAGCTATGGAAGCAGGAGGCTACAATGGAACAATTTTGAATATCGGATCTGCATCAGGGCTTTATCCATCATACTTTATGCCTATATATGGTGCTTCGAAAGGTGGTGTGGTTATGTTTTCAA
GATCACTTGGCGCTTACAAACGCAAGGGCATTCGTGTGAATGTACTTTGTCCTGAGTTTGTGGACACTGACTTGACCAAGAAAGTGCAGCCTAGATTTATTGATCTAATCGGAGGGTTCTTACCTATGGATATGATTATTAAAGGTGCTTTTGAGCTTATAGAAGATGAGACAAAGGCTGGTCAATGTCTGTGGATAACA
AAACGAAGAGGGTTGGAGTATTGGCCAACTCCTGAAGAGAAGAAAAAATACCTGGCAAAATTTCCACGTTCAGATAATAGTGTCTCATATAAACCTCAAGCAAATGTTGAGATTGTGCCAACTATTCCCAGCAGTTTTGAGAAAGTAGTGGTTCACAGACTGGATAACAATTTTCGACAAGCTACCAAAATGGAGAGAAC
ATACTTGAAGCTGCCCATTAAACCTGGTCATGTTCTTGTGAAAAATATATATGCAGGAGTAAATGCTAGTGATATAAATTACAGTTCCGGGCGTTATTTTGGGAATGCGAAGGAAGCTGGTTCTCGTCTACCGTTTGATGCAGGATTTGAGGCTGTGGGTTTAGTTGTAGCATTTGGTGATTTTGTTGAGGGTTTAACTA
TAGGTGGGCCTGTGGCAGCTATGTCATTTGGTGCATATGCTGAATTCACTGTGGTTCCGGCAAAACATGTTATACCAGTGCCTAGACTAATACCTGAAGCGGTGGCAATGCTTACATCTGGTCTCACAGCATCAATTGGATTGGAGGAGGCAGGAAGGATGGAATCAGGTCAGACAGTTCTAGTTACAGCGGCTGCTGGG
GGGACTGGACAGTTTGCTGTTCAGCTGGCAAAAATAGCAGGAAATAAGGTGGTTGCAACATGTGGAGGAACACAAAAGGCGGCCCTTCTCAAGGACTTTGGTGTTGATAGGGTGATCGACTACAAAAAAGAAGATATTAAATTGGTATTGAAAAAGGAGTTTCCAAAAGGTGTCAATATTGTATATGAATCTGTTGGAGG
AGAAATGTTCAATACATGCTTAAATGCCCTTGCAATTCATGGTCATCTTGTTGTTATCGGGATGATGTCTCAGTATCAAGGAGAGAGCGGATGGAAACCATCAAACTATACTGGACTTTGTGAGAAGATTCTCTCTAAGAGTCAGTCAGTGGCTGGCTTTTTTTTAATGAATTATGCACATTTATGGCGCTTACATATGG
AAAGACTTCACAACCTTTATACTACTGGAAAGCTTAAGgttgttatttcaagatgcacctcaaaaggtcctctttctcaagaagagaaaaccattatcaattacagtgcattgtgcagcagtccagggattcctctaaatttctcaagaaccaataaaactcacatttttgttttgcttcaatcagATTGCATTAGACCC
AAAGCAGTTTTTGGGTGTAAAGTCAGTTGCAGATGCTGTTGAATATCTCCACTCTGGTCAAAGCATTGGCAAGGTTGTTGTCTGCATAGATCCAAGCTTCAGTCAAGTAACTGCACGGTTGTAGGTGTGGGAATTTGAATTTTTCATCTCTTCATCAAAACATGCATGCGAAATGCCTGCAGTTGAGCACTAGTGTATTT
ATTTCTTTAAAGCTTATTCTGACATTGATCATTATTATTGGATAATACTTGTAGATTATTAGTGTCTCCATTGTGGTATAATTATTGTTGTAACTCATTTAAAATGGTAATACTGTCACAAAACAGTGAACTAGTGGAAGGAGCAAGAAATGTGGTAAGCTTGTTCCTCGGCAAATTGGCATTGGATAATGGATTTTAAA
GAGGTCAATGCCAATGAAAAAAATTTGCATGATTTTGGCTTGACCTTTTAAAACTCCAGTCACTAATAAACAGCATAGCATTACATCTAAAATGCAATGTTATATGCTGTCGACAGCAGCATAAACACAAACCCCATGAGGCCATGCACCATGTACAAGTCATTGATCGATTGGCTATTCAATGACTCCCACTTGAGATT
CACAATTCCTTTTAAACGGACCATTTTTTTTCTTGTAAAATATGAATACACTTGAATGGTTGGTTGGCTACCCAAAGAGTCTCTCTTGATATTCACAAATTTTGAAAAACATAACATTTGTTTTTCTTGTATTGAAAGCGTGCACATATGAGAGGAGATAATAACCACAAGTGACCTATTTTGACATCATTAAGATATTC
ACAAATTTTGAAAAACATAACATTTGTTTTGCTTGTATTAAAACTGTGCACATATGAGAGAGGAGATAATCACAAGTTACCTATTTTGACATCATTAAGATCATTGCATTTCATGGCTTCTGTTAGTATTATAATGTACTTAATAAAATCAGGA




Intron 4 GTTTGTATAG ... TGTGTCACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A124.263.8200
A218.4531.5710
A329.6445.3192
A413.6326.341
A525.517.862
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A711.3639.550
A86.9227.320
A98.6532.830
A1020.2147.5120



>TRINITY_DN115985_c2_g1_i7 from sample A2 / Example spliced isoform
ACCCAACACATATGGCCGGAAAAGGAATGATCGCGGAGGATGTAGACAGAAGAGTCATAGAGCGAAATTTCAAGATATTGATACAGCTTTCGGCATTAAACAGACAACACTTCGACACGGGAGAACGTTGATTCATTGACAATGTTAGCACCGGAAACGTTTCATATATAAAGAGACCATTCTCCAAACAAAACCTAAAG
AACCACATTATCCTTGGACGGCTAAATCTGCACAGATGCTGAATTAACCCCGCTTCTACTTGATCACATCGTTTGAAGTTTTAATTATTTAACATGGAGCTCAAGGGCAAGGTTGCACTAGTCACTGGAGGAGGAGCCGGAATTGGACGAGCTCTTTGTCTTGCTTTGGCAAAAAAAGGTGTTCGTATGACAATTCTTGA
TTATTCAGAAACATCTGGAAAAGAAGTTGTTGGTGTTCTGGAAGAAGAGTATGCCAAATTCTATAGCGATCTGGAAAAGCCTACAGCATTATTTATTAGATGCGATGTTGCTAATCCAGGGGACCTTGCATCTGCTTTTGTGAAGCATTTGGACACATTTCGAAGACTGGACATTTGCATTAACAATGCTGGTATAGGCG
AGCAAATGCCTTTTGTTAAGGACAAGAGTAATGATAGAAGTGGTCAATGGAGGCGCATTATTGACATAAATCTAGTGGCTGTCATTGACAGTACTCGTTTGGCAATTCAAGCTATGGAAGCAGGAGGCTACAATGGAACAATTTTGAATATCGGATCTGCATCAGGGCTTTATCCATCATACTTTATGCCTATATATGGT
GCTTCGAAAGGTGGTGTGGTTATGTTTTCAAGATCACTTGGCGCTTACAAACGCAAGGGCATTCGTGTGAATGTACTTTGTCCTGAGTTTGTGGACACTGACTTGACCAAGAAAGTGCAGCCTAGATTTATTGATCTAATCGGAGGGTTCTTACCTATGGATATGATTATTAAAGGTGCTTTTGAGCTTATAGAAGATGA
GACAAAGGCTGGTCAATGTCTGTGGATAACAAAACGAAGAGGGTTGGAGTATTGGCCAACTCCTGAAGAGAAGAAAAAATACCTGGCAAAATTTCCACGTTCAGATAATAGTGTCTCATATAAACCTCAAGCAAATGTTGAGATTGTGCCAACTATTCCCAGCAGTTTTGAGAAAGTAGTGGTTCACAGACTGGATAACA
ATTTTCGACAAGCTACCAAAATGGAGAGAACATACTTGAAGCTGCCCATTAAACCTGGTCATGTTCTTGTGAAAAATATATATGCAGGAGTAAATGCTAGTGATATAAATTACAGTTCCGGGCGTTATTTTGGGAATGCGAAGGAAGCTGGTTCTCGTCTACCGTTTGATGCAGGATTTGAGGCTGTGGGTTTAGTTGTA
GCAGTTGGTGATTTTGTTGAGGGTTTAACTATAGGTGGGCCTGTGGCAGCTATGTCATTTGGTGCATATGCTGAATTCACTGTGGTTCCGGCAAAACATGTTATACCAGTGCCTAGACTAATACCTGAAGCGGTGGCAATGCTTACATCTGGTCTCACAGCATCAATTGGATTGGAGGAGGTTCTCCACTGTCAATCTTT
TCCTTTTATGCTTTTTTTATTAACTTTCTGTAAACATACAAACATTATGATACACCATTTTTACAATATAAATTTGATTGGCACAAAGGGGCAGGACTGATTCCTATTGGGTAGGATACACCTGATTTGATGAATTAAATACACAATTGCAACCATCATGACAAATTGGCGTCATAATAACTCCCAGCCTCAAATGTCTA
AATTTCAATCATGATGGGGGAGAAAATGACAAAGTGGCACCATAATTTGTTAGTTTTTGTACCTAGGGAAGTGTTCCCCAAGTGACATTTGCCTAATGTCACTTAGAAGGGGGAAAAAGGTGACC


>TRINITY_DN115985_c2_g1_i5 from sample A2 / Example unspliced isoform:
ACCCAACACATATGGCCGGAAAAGGAATGATCGCGGAGGATGTAGACAGAAGAGTCATAGAGCGAAATTTCAAGATATTGATACAGCTTTCGGCATTAAACAGACAACACTTCGACACGGGAGAACGTTGATTCATTGACAATGTTAGCACCGGAAACGTTTCATATATAAAGAGACCATTCTCCAAACAAAACCTAAAG
AACCACATTATCCTTGGACGGCTAAATCTGCACAGATGCTGAATTAACCCCGCTTCTACTTGATCACATCGTTTGAAGTTTTAATTATTTAACATGGAGCTCAAGGGCAAGGTTGCACTAGTCACTGGAGGAGGAGCCGGAATTGGACGAGCTCTTTGTCTTGCTTTGGCAAAAAAAGGTGTTCGTATGACAATTCTTGA
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aattttcagtggatactgctgctaatatgtatgcccatcctgatattaagtacttgtccactttatatatcatctcgagtactttatactttaactcacgactttataggtgtcttaaactgatatcataaatgccaatgtgtcacag
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GCTCGTCCTTCAGGGTAGAACCCCATTTTATCAAGTATTTGTTAAATTTCATATGTGGGTGCATACAAATTACAATAGCACATAGTATGGATAAAA




Intron 5 GTATGCACTC ... TTGACTGTAG

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>TRINITY_DN129121_c5_g1_i6 from sample A1 / Example spliced isoform
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ACCTTACATATAATCATAATGAAACATTTCTAATTTTAAAAGTTACTTTTACTGGATTTAGCTATCTACCATTGATTCG


>TRINITY_DN129121_c5_g1_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CAACACATATGGCCGGAAAAGGAATGATCGCGGAGGATGTAGACAGAAGAGTCATAGAGCGAAATTTCAAGATATTGATACAGCTTTCGGCATTAAACAGACAACACTTCGACACGGGAGAACGTTGATTCATTGACAATGTTAGCACCGGAAACGTTTCATATATAAAGAGACCATTCTCCAAACAAAACCTAAAGAAC
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TTCAGAAACATCTGGAAAAGAAGTTGTTGGTGTTCTGGAAGAAGAGTATGCCAAATTCTATAGCGATCTGGAAAAGCCTACAGCATTATTTATTAGATGCGATGTTGCTAATCCAGGGGACCTTGCATCTGCTTTTGTGAAGCATTTGGACACATTTCGAAGACTGGACATTTGCATTAACAATGCTGGTATAGGCGAGC
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TCGAAAGGTGGTGTGGTTATGTTTTCAAGATCACTTGGCGCTTACAAACGCAAGGGCATTCGTGTGAATGTACTTTGTCCTGAGTTTGTGGACACTGACTTGACCAAGAAAGTGCAGCCTAGATTTATTGATCTAATCGGAGGGTTCTTACCTATGGATATGATTATTAAAGGTGCTTTTGAGCTTATAGAAGATGAGAC
AAAGGCTGGTCAATGTCTGTGGATAACAAAACGAAGAGGGTTGGAGTATTGGCCAACTCCTGAAGAGAAGAAAAAATACCTGGCAAAATTTCCACGTTCAGATAATAGTGTCTCATATAAACCTCAAGCAAATGTTGAGATTGTGCCAACTATTCCCAGCAGTTTTGAGAAAGTAGTGGTTCACAGACTGGATAACAATT
TTCGACAAGCTACCAAAATGGAGAGAACATACTTGAAGCTGCCCATTAAACCTGGTCATGTTCTTGTGAAAAATATATATGCAGGAGTAAATGCTAGTGATATAAATTACAGTTCCGGGCGTTATTTTGGGAATGCGAAGGAAGCTGGTTCTCGTCTACCGTTTGATGCAGGATTTGAGGCTGTGGGTTTAGTTGTAGCA
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GCTTTTTTTATTAACTTTCTGTAAACATACAAACATTATGATACACCATTTTTACAATATAAATTTGATTGGCACAAAGGGGCAGGACTGATTCCTATTGGGTAGGATACACCTGATTTGATGAATTAAATACACAATTGCAACCATCATGACAAATTGGCGTCATAATAACTCCCAGCCTCAAATGTCTAAATTTCAAT
CATGATGGGGGAGAAAATGACAAAGTGGCACCATAATTTGTTAGTTTTTGTACCTAGGGAAGTGTTCCCCAAGTGACATTTGCCTAATGTCACTTAGAAGGGGGAAAAAGGTGACCCTCACATTAATTGCACTTAATGAG