sp|Q8L773|THO4A_ARATH ----> THO complex subunit 4A
Intron 1 GTAAACATCT ... TAATCCACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 24.39 | 355 | 167 | 62 |
| A2 | 24.33 | 269 | 134 | 39 |
| A3 | 23.14 | 279 | 129 | 39 |
| A4 | 24.11 | 277 | 119 | 57 |
| A5 | 23.38 | 136 | 60 | 23 |
| A6 | 21.75 | 1076 | 393 | 205 |
| A7 | 22.22 | 1278 | 486 | 244 |
| A8 | 22.03 | 1251 | 423 | 284 |
| A9 | 22.35 | 1216 | 458 | 242 |
| A10 | 23.04 | 989 | 435 | 157 |
>TRINITY_DN112474_c1_g1_i22 from sample A2 / Example spliced isoformCACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTAGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCGATCGGCATCA
ACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGCAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGG
TGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGG
TCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAA
CCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGG
TAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAAT
GAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCAATA
TATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGG
AACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCC
GAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATT
TATGAGCTCGTGTTTGAGCACAGCGTACAGCTCGTTTTTGAGCACAGCGTACAGCTCTGCAGACTAACTTCATATACAATTGATATGGGAATATTTTCTCTTGTAGCTCGCTTGAGCACCATTCAGAGGACATGGAGTACTCTGAACTGGTAAAGGTTTTGACTATGTATCAGAGAAGAATCCTCGTCTTCTCTTTGGTA
TGGCGATTGTAATATTGACACATTTTTTT
>TRINITY_DN112474_c1_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:CACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTAGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCGATCGGCATCA
ACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGA
AGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCG
CTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAACC
CCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAGgtaaacatctatgatcatattttgtttctgtagggatattggtctgttgagttattttcttgctaataggtggaggataattttgatctggttgaggaaat
gagttgtacgtgctttcattgtccatatgtgcttttttggaagcagttctagaaatgatggtacataaatctgtattatttggatacatattttcctatatgcattattggccattgtcaagccttacttttctatattgatcgcttactctattctactgatgcatgtttagggaacaattttgtatttttaatacaaa
aattacataagttatttcttgctaacataattatataatccacagGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGGTAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCG
ATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAATGAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTG
TATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCAATATATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTT
TTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGGAACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCT
TGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCCGAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTG
CTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATTTATGAG
Intron 2 GTAAGTATAA ... TCTCTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 40.58 | 37.4 | 21 | 30 |
| A2 | 42.99 | 15.4 | 16 | 7 |
| A3 | 36.85 | 19.8 | 11.1 | 12 |
| A4 | 40.62 | 19 | 13 | 13 |
| A5 | 52.38 | 4.1 | 4 | 5 |
| A6 | 36.35 | 35.9 | 18 | 23 |
| A7 | 39.98 | 41.1 | 26.7 | 28 |
| A8 | 39.89 | 58.2 | 39.2 | 38 |
| A9 | 35.78 | 37.7 | 18 | 24 |
| A10 | 47.02 | 21.1 | 23.3 | 14 |
>TRINITY_DN126334_c3_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoformGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGGTAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGAT
TACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAATGAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAAT
TTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCAATATATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTA
TTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGGAACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAA
TTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCCGAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTT
CAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATTTATGAGTTTTGTTTGTGGTTCTAGTGTGTATGGTGGTGATCCAGCTCGGGGATGGATTTGGGTTAACGATCGAGTTGCTCTCCCCTATGGCTTGGGAGGAACTGGTTCTCCAAGTTGTCA
TTCGCATTGTTGCAACTCGTGTTTGAGCACAGCGTACAGCTCGTTTTTGAGCACAGCGTACAGCTCTGCAGACTAACTTCATATACAATTGATATGGGAATATTTTCTCTTGTAGCTCGCTTGAGCACCATTCAGAGGACATGGAGTACTCTGAACTGGTAAAGGTTTTGACTATGTATCAGAGAAGAATCCTCGTCTGC
TCTTTGGTATGGCGATTGTAATATTGACACATTTTTTTTCATAAATAAAAGGATGTATTTTTTTGATGAAAAAAAAAATACATAGGTTGGATTCGAAAGTTTAATACCCT
>TRINITY_DN126334_c3_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:CAATCTAAAAGCTCAATAACCAGACAATATCCAAAATCGTAGGGATTGAATGATTATTTGAGATTTGATTGGATGACACAAGACTTGGGAAAAAACTATATATATTGGTGCATTGAGATAGCACGGGACGTCGTGTTGTGCATAGAGAAATTGTGCTGTGGGTGCATGTGTTGAGTGTTTCTCTTTTTCATAAGTCCATC
ACTTAGCTTATTACAGAATCTGAGAGAAAGTGCTGTGTGGAAGTTTTGTTTGTGGTTCTAGTGTGTATGGTGGTGATCCAGCTCGGGGGTGGATTTGGGTTAACGATTGAGTTGCTCTCCACTATGGCTTGGGAGGAACTGGTTCTCCAAGTTGTCATTCGCATTGTTGCAAgtaagtataactttctgacttcttcttc
tttaacgaatgaaattgtttagggtgagtattattgtattttccatttcaagatatgtacacgccatgacaacgtaacttgggttatataagctttgctctagagtaccgtttctgtagactgtaacttcatagatagttgatttggtcgtttttttctcttgtagCTCGTGTTTGAGCACAGCGTACAGCTCGTTTTTG
AGCACAGCGTACAGCTCTGCAGACTAACTTCATATACAATTGATATGGGAATATTTTCTCTTGTAGCTCGCTTGAGCACCATTCAGAGGACATGGAGTACTCTGAACTGGTAAAGGTTTTGACTATGTATCAGAGAAGAATCCTCGTCTGCTCTTTGGTATGGCGATTGTAATATTGACACATTTTTTTTCATAAATAAA
AGGATGTATTTTTTTGATGAAAAAAAAAATACATAGGTTGGATTCGAAAGTTTAATACCCT
Intron 3 GTAAGTATAA ... TCTCTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 39.68 | 38 | 21 | 29 |
| A2 | 41.82 | 16 | 16 | 7 |
| A3 | 36.91 | 19.7 | 12 | 11 |
| A4 | 40.62 | 19 | 13 | 13 |
| A5 | 51.08 | 4.3 | 4 | 5 |
| A6 | 36.84 | 36 | 18 | 24 |
| A7 | 43.16 | 39.7 | 33 | 27 |
| A8 | 39.1 | 57.7 | 40 | 34 |
| A9 | 33.91 | 38 | 18 | 21 |
| A10 | 48.66 | 20.7 | 25 | 14 |
>TRINITY_DN43512_c0_g1_i13 from sample A9 / Example spliced isoformACCTGAGGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTCGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTC
GATCGGCATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGGTACTAAGAAGCAACAGCCCGTGAATTTTGGGTTCGTTCGTTATATATTTTTGGGGTCATTTAGGGTTTACTGTTCAAGTTTTAGAAGAGTTGTTTTACCGTAGCTGCTCCATTATATTTAGCCAAGCTGCGGCCCTTTGTAAATCACCAATCAA
TACAAAGGCCTTAAAGCTTGCCGTTACTTCCGACCTACTTGAGGCGGCAAGATTATCTCGTTTTTGTCTTTTTTCTTTGATCGAGCTGGAAAACTGTTATCTAGTTATTATCCTATGGTAATATGACCTTTCGGCTGCCCTAGTGCGCAGTATTTTAGTATTTATTCCTGTGTACTTTTTTTCCTGGTTTCTTCAAACCC
TAAGACCAGCTTAAAGGCCCTCTTGTATTTTTATTTAAGACTTCCGGCCATTTTGAGTTAAAGACAGTCTTCAACGATTATTCGCGACTGCGTTTAGGGAGTTTCTTGTTTCTGGTTAGTGTAAACCCTAAAGCAGTTTCAATCCAGCTTTCCCCGTCTTTGTCTTGGACTTCAGCCATTTTGAGTCGCAAGCGGCCTTT
TGAATATTATTCCCTACTGTATTCTGGTAGATTTGTGATTTTCAACCCTAAGGTAGTTTTCAGAGATTTTGAAATTTCCGCCCTTGGGAATAGCCGAACTCCTGACATTCATTGTCAATTGTTGATCTGTATTTCGTTGATTAGCAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAG
GGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCC
TGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCC
ATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAACCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGT
CCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGGTAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATAC
CATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAATGAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAG
CTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCAATATATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTT
GAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGGAACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCT
TGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCCGAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGG
TGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATTTATGAGTTTTGTTTGTGGTTCTAGTGTGTATGGTGGTGATCCAGCTCGGGGATGGATTTGGGTTAACGATCGAGTTGCTCTCCCCTATGGCTTGGGAGGAAC
TGGTTCTCCAAGTTGTCATTCGCATTGTTGCAACTCGTGTTTGAGCACAGCGTACAGCTCGTTTTTGAGCACAGCGTACAGCTCTGCAGACTAACTTCATATACAATTGATATGGGAATATTTTCTCTTGTAGCTCGCTTGAGCACCATTCAGAGGACATGGAGTACTCTGAACTGGTAAAGGTTTTGACTATGTATCAG
AGAAGAATCCTCGTCTTCTCTTTGGTATGGCGATTGTAATATTGACACATTTTTTTTCATAAATAAAAGGATGTCTTTTTTTGATGAAAAAAAAAATACATAGGTTGGATTCGAAAGTTTAATACCCTATATATTTAGGCACTCTGTTTCATGTATATATATATATTTATATATGTTGAATTCGAAAGTTTAATACCTAT
ATATTTGGGCACTCTGTTTCATGTATATATATATATACATGTACTGAATTTCTTTACCGGAAAATCTGTATTGTAAATTTTTTTACCTTTTATGAATGAGGTAGAATACATGTGCAGAATTTCTTTATCGGAAAATCTG
>TRINITY_DN43512_c0_g1_i14 from sample A9 / Example unspliced isoform:ACCTGAGGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTCGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTC
GATCGGCATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGGTACTAAGAAGCAACAGCCCGTGAATTTTGGGTTCGTTCGTTATATATTTTTGGGGTCATTTAGGGTTTACTGTTCAAGTTTTAGAAGAGTTGTTTTACCGTAGCTGCTCCATTATATTTAGCCAAGCTGCGGCCCTTTGTAAATCACCAATCAA
TACAAAGGCCTTAAAGCTTGCCGTTACTTCCGACCTACTTGAGGCGGCAAGATTATCTCGTTTTTGTCTTTTTTCTTTGATCGAGCTGGAAAACTGTTATCTAGTTATTATCCTATGGTAATATGACCTTTCGGCTGCCCTAGTGCGCAGTATTTTAGTATTTATTCCTGTGTACTTTTTTTCCTGGTTTCTTCAAACCC
TAAGACCAGCTTAAAGGCCCTCTTGTATTTTTATTTAAGACTTCCGGCCATTTTGAGTTAAAGACAGTCTTCAACGATTATTCGCGACTGCGTTTAGGGAGTTTCTTGTTTCTGGTTAGTGTAAACCCTAAAGCAGTTTCAATCCAGCTTTCCCCGTCTTTGTCTTGGACTTCAGCCATTTTGAGTCGCAAGCGGCCTTT
TGAATATTATTCCCTACTGTATTCTGGTAGATTTGTGATTTTCAACCCTAAGGTAGTTTTCAGAGATTTTGAAATTTCCGCCCTTGGGAATAGCCGAACTCCTGACATTCATTGTCAATTGTTGATCTGTATTTCGTTGATTAGCAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAG
GGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCC
TGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCC
ATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAACCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGT
CCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGGTAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATAC
CATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAATGAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAG
CTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCAATATATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTT
GAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGGAACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCT
TGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCCGAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGG
TGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATTTATGAGTTTTGTTTGTGGTTCTAGTGTGTATGGTGGTGATCCAGCTCGGGGGTGGATTTGGGTTAACGATTGAGTTGCTCTCCACTATGGCTTGGGAGGAAC
TGGTTCTCCAAGTTGTCATTCGCATTGTTGCAAgtaagtataactttctgacttcttcttctttaacgaatgaaattgtttagggtgagtattattgtattttccatttcaagatatgtacacgccatgacaacgtaacttgggttatctcactctgctatctatatatggatttgaatcataaatttatttatatatcc
cctatctcactctgctatctatatatggatttgaatcataaatttatttatatatctctatatcctgttttatataagctttgctctagagtaccgtttctgtagactgtaacttcatagatagttgatttggtcgttttttttctcttgtagCTCGTGTTTGAGCACAGCGTACAGCTCGTTTTTGAGCACAGCGTACA
GCTCTGCAGACTAACTTCATATACAATTGATATGGGAATATTTTCTCTTGTAGCTCGCTTGAGCACCATTCAGAGGACATGGAGTACTCTGAACTGGTAAAGGTTTTGACTATGTATCAGAGAAGAATCCTCGTCTTCTCTTTGGTATGGCGATTGTAATATTGACACATTTTTTTTCATAAATAAAAGGATGTCTTTTT
TTGATGAAAAAAAAAATACATAGGTTGGATTCGAAAGTTTAATACCCTATATATTTAGGCACTCTGTTTCATGTATATATATATATTTATATATGTTGAATTCGAAAGTTTAATACCTATATATTTGGGCACTCTGTTTCATGTATATATATATATACATGTACTGAATTTCTTTACCGGAAAATCTGTATTGTAAATTT
TTTTACCTTTTATGAATGAGGTAGAATACATGTGCAGAATTTCTTTATCGGAAAATCTG
Intron 4 GTTAGAAAAT ... GTCCCAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.24 | 477 | 111 | 74 |
| A2 | 14.06 | 547 | 104 | 75 |
| A3 | 13.5 | 532 | 108 | 58 |
| A4 | 18.11 | 493 | 143 | 75 |
| A5 | 13.46 | 331 | 66 | 37 |
| A6 | 11.83 | 1263 | 196 | 143 |
| A7 | 12.28 | 1818 | 305 | 204 |
| A8 | 14.55 | 1101.4 | 215 | 160 |
| A9 | 12.81 | 1514.6 | 260 | 185 |
| A10 | 12.77 | 1632.4 | 318 | 160 |
>TRINITY_DN112474_c1_g1_i22 from sample A2 / Example spliced isoformCACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTAGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCGATCGGCATCA
ACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGCAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGG
TGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGG
TCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAA
CCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGG
TAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAAT
GAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCAATA
TATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGG
AACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCC
GAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATT
TATGAGCTCGTGTTTGAGCACAGCGTACAGCTCGTTTTTGAGCACAGCGTACAGCTCTGCAGACTAACTTCATATACAATTGATATGGGAATATTTTCTCTTGTAGCTCGCTTGAGCACCATTCAGAGGACATGGAGTACTCTGAACTGGTAAAGGTTTTGACTATGTATCAGAGAAGAATCCTCGTCTTCTCTTTGGTA
TGGCGATTGTAATATTGACACATTTTTTT
>TRINITY_DN112474_c1_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:CACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTAGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCGATCGGCATCA
ACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGA
AGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGgttagaaaatcaaacccttgatcttttattttaaagataacttgcaggttcagatattggcattgaaaacattaagatacaaatagaattttgtgaggctttgaatttgggggac
atcctgtgcactttttgtgtagatattgcagatttagtatatagattgtcattggattcaccgggatcacgatctgtagagcagggttaatttctgttgatgtttatccaaaaaaaactttttgtcatatcttttcgatattgctggagttcttttgaaccgtttccgagttattgctgtacacaagttctgcaagattg
ctttagagtcgttaattgggatcttgatgtactgggttcttatagatctgattgtagggaattcattttttcacactgcctatctagtatcatttaagaatattattttttattggtgagatcgaataaggcttgttctaatttgaataaagcctttaaactgtgatgcggcctgcttagatgaatattttggttcctag
aatgtttgatttattgcttttattaaattttgaatgttttgcatttgttttctgactatttaatgtttttttctgtcccagcagCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCGC
TGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAACCCC
TCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGGTAGG
GGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAATGAAT
TGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCAATATATA
GGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGGAACT
TGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCCGAGA
CCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATTTATG
AG
Intron 5 GTACTAAGAA ... TGATTAGCAG
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| A3 | 30.95 | 377 | 30.5 | 169 |
| A4 | 30.27 | 311 | 20 | 135 |
| A5 | 34.35 | 172 | 14 | 90 |
| A6 | 31.4 | 673 | 37 | 308 |
| A7 | 29.88 | 900 | 40.5 | 383.5 |
| A8 | 32.13 | 581 | 27.5 | 275 |
| A9 | 29.35 | 1006 | 33.5 | 418 |
| A10 | 29.16 | 933 | 49.5 | 384 |
>TRINITY_DN42029_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoformCCTGAGGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTCGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCG
ATCGGCATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCA
GAGGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGT
ACGAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGA
TGGGAAACCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTG
GACGAGGTAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGT
CTAGAATGAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCA
TCCAATATATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTT
TTCCAGGAACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAA
ATTTCCCGAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAA
AACAATTTATGAGGTAATTAGTTTTATGAAATATTTTTTACAGAATTAGATTCAGGGTATTTTGTGAAATATTTTATACAGAAATATTTATCAGTAAATCACTTACGGAAATATAGATTCATAGTTTCCAGTTGTGTGCAGTTGCCGCCTGCAAGATTTTTCCAAATTCCTTTTAGGCCATTTCTGTCTATTTTTTAATC
ATTGGGAAAATGTATTTGATGTTTCATGTTTCCATTTATTGGTATTTCTTTGGTGATGAGTGCGAGTGATTTTTACATTTGACTGGTAAAGCCTATGGAGGTGTACATATCCTACCCCTTCAAATTTGAACTCGTGACTGGTAAAGCCTATGGAGTAAACGTATGTTTTTTCTGTCTGAGAGATCCTGAATTGATAATAG
AGATACCAAAAATTGTTGGTATTACACCATTTCATCTTGTGGGGTAGCTCATGGCTATTGATTCACTTCTGTTGTACACTTGAGCCATTGATTCATTTTGTTTGACATTTGAGCAACATTGTATATGTTTCAATTGTATTCGAAGAAAAACCAATCAATTGTGGCAGGGCAATGTTTATTTATTTGAACAATCATCTCTT
AACTCTTGGATAAGAAATCAAACTCTCCTCAAGATTGTTAGCTTCTGTTAGCTTCAGTAACCAATCAATTTGTGGAGGTCAAATTTTAGTTTGTTGAACAATCATCTCTCAGCTTTAGGGTTGTCGAAAAT
>TRINITY_DN42029_c0_g1_i11 from sample A6 / Example unspliced isoform:CCTGAGGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTCGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCG
ATCGGCATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGgtactaagaagcaacagcccgtgaattttgggttcgttcgttatatatttttggggtcatttagggtttactgttcaagttttagaagagttgttttaccgtagctgctccattatatttagccaagctgcggccctttgtaaatcaccaatcaat
acaaaggccttaaagcttgccgttacttccgacctacttgaggcggcaagattatctcgtttttgtcgttttctttgatcgagctggaaactgttatctagttattatcctatggtaatatgacctttcggctgccctagtgcgcagtattttagtatttattcctgtgtactttttttcctggtttcttcaaaccctaa
gaccagcttaaaggccctcttgtatttttatttaagacatccggccattttgagttaaagacagtcttcaaagattattcgcgactgcgtttagggagtttcttgtttctggttagtgtaaaccctaaagcagtttcaatccagctttccccgtctttgtcttggacttcagccattttgagtcgcaagcggccttttga
atattattccctactgtattctggtagatttgtgattttcaaccctaaggtagttttcagagattttgaaatttccgcccttgggaatagccgaactcctgacattcattgtcaattgttgatctgtatttcggtgattagcagTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGC
AACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCTGT
TCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCAT
TATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAACCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCC
TTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGGTAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGA
ATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAATGAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTT
TGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCAATATATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCAC
GAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGGAACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATG
AGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCCGAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGAT
TGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATTTATGAGCTCGTGTTTGAGCACAGCGTACAGCTCGTTTTTGAGCACAGCGTACAGCTCTGCAGACTAACTTCATATACAATTGATATGGGAAT
ATTTTCTCTTGTAGCTCGCTTGAGCACCATTCAGAGGACATGGAGTACTCTGAACTGGTAAAGGTTTTGACTATGTATCAGAGAAGAATCCTCGTCTTCTCTTTGGTATGGCGATTGTAATATTGACACATTTTTTTTCATAAATAAAAGGATGTCTTTTTTTGATGAAAAAAAAAATACATAGGTTGGATTCGAAAGTT
TAATACCCTATATATTTAGGCACTCTGTTTCATGTATATATATATATTTATATATGTTGAATTCGAAAGTTTAATACCTATATATTTGGGC
Intron 6 GTACTAAGAA ... TGATTAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 35.77 | 260 | 16 | 144.8 |
| A2 | 29.78 | 316 | 10 | 134 |
| A3 | 30.95 | 377 | 30.4 | 169 |
| A4 | 30.27 | 311 | 20 | 135 |
| A5 | 34.35 | 172 | 14 | 90 |
| A6 | 31.41 | 673 | 37 | 308.2 |
| A7 | 29.89 | 900 | 40.4 | 383.6 |
| A8 | 32.13 | 581 | 27.4 | 275 |
| A9 | 29.35 | 1006 | 33.4 | 418 |
| A10 | 29.16 | 933 | 49.4 | 384 |
>TRINITY_DN42029_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoformCCTGAGGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTCGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCG
ATCGGCATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCA
GAGGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGT
ACGAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGA
TGGGAAACCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTG
GACGAGGTAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGT
CTAGAATGAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCA
TCCAATATATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTT
TTCCAGGAACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAA
ATTTCCCGAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAA
AACAATTTATGAGGTAATTAGTTTTATGAAATATTTTTTACAGAATTAGATTCAGGGTATTTTGTGAAATATTTTATACAGAAATATTTATCAGTAAATCACTTACGGAAATATAGATTCATAGTTTCCAGTTGTGTGCAGTTGCCGCCTGCAAGATTTTTCCAAATTCCTTTTAGGCCATTTCTGTCTATTTTTTAATC
ATTGGGAAAATGTATTTGATGTTTCATGTTTCCATTTATTGGTATTTCTTTGGTGATGAGTGCGAGTGATTTTTACATTTGACTGGTAAAGCCTATGGAGGTGTACATATCCTACCCCTTCAAATTTGAACTCGTGACTGGTAAAGCCTATGGAGTAAACGTATGTTTTTTCTGTCTGAGAGATCCTGAATTGATAATAG
AGATACCAAAAATTGTTGGTATTACACCATTTCATCTTGTGGGGTAGCTCATGGCTATTGATTCACTTCTGTTGTACACTTGAGCCATTGATTCATTTTGTTTGACATTTGAGCAACATTGTATATGTTTCAATTGTATTCGAAGAAAAACCAATCAATTGTGGCAGGGCAATGTTTATTTATTTGAACAATCATCTCTT
AACTCTTGGATAAGAAATCAAACTCTCCTCAAGATTGTTAGCTTCTGTTAGCTTCAGTAACCAATCAATTTGTGGAGGTCAAATTTTAGTTTGTTGAACAATCATCTCTCAGCTTTAGGGTTGTCGAAAAT
>TRINITY_DN42029_c0_g1_i13 from sample A6 / Example unspliced isoform:CCTGAGGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTCGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCG
ATCGGCATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGgtactaagaagcaacagcccgtgaattttgggttcgttcgttatatatttttggggtcatttagggtttactgttcaagttttagaagagttgttttaccgtagctgctccattatatttagccaagctgcggccctttgtaaatcaccaatcaat
acaaaggccttaaagcttgccgttacttccgacctacttgaggcggcaagattatctcgtttttgtcttttttctttgatcgagctggaaaactgttatctagttattatcctatggtaatatgacctttcggctgccctagtgcgcagtattttagtatttattcctgtgtactttttttcctggtttcttcaaaccct
aagaccagcttaaaggccctcttgtatttttatttaagacatccggccattttgagttaaagacagtcttcaaagattattcgcgactgcgtttagggagtttcttgtttctggttagtgtaaaccctaaagcagtttcaatccagctttccccgtctttgtcttggacttcagccattttgagtcgcaagcggcctttt
gaatattattccctactgtattctggtagatttgtgattttcaaccctaaggtagttttcagagattttgaaatttccgcccttgggaatagccgaactcctgacattcattgtcaattgttgatctgtatttcggtgattagcagTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGG
GCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCT
GTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCA
TTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAACCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTC
CTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGGTAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACG
AATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAATGAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTT
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CGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGGAACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGAT
GAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCCGAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGA
TTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATTTATGAGTTTTGTTTGTGGTTCTAGTGTGTATGGTGGTGATCCAGCTCGGGGATGGATTTGGGTTAACGATCGAGTTGCTCTCCCCTATGGC
TTGGGAGGAACTGGTTCTCCAAGTTGTCATTCGCATTGTTGCAACTCGTGTTTGAGCACAGCGTACAGCTCGTTTTTGAGCACAGCGTACAGCTCTGCAGACTAACTTCATATACAATTGATATGGGAATATTTTCTCTTGTAGCTCGCTTGAGCACCATTCAGAGGACATGGAGTACTCTGAACTGGTAAAGGTTTTGA
CTATGTATCAGAGAAGAATCCTCGTCTTCTCTTTGGTATGGCGATTGTAATATTGACACATTTTTTTTCATAAATAAAAGGATGTCTTTTTTTGATGAAAAAAAAAATACATAGGTTGGATTCGAAAGTTTAATACCCTATATATTTAGGCACTCTGTTTCATGTATATATATATATTTATATATGTTGAATTCGAAAGT
TTAATACCTATATATTTGGGC
Intron 7 GTTAGTGTAA ... TGATTAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 53.87 | 125 | 61 | 146 |
| A2 | 53.6 | 116 | 42 | 134 |
| A3 | 57.88 | 123 | 33 | 169 |
| A4 | 53.36 | 118 | 46 | 135 |
| A5 | 54.88 | 74 | 38 | 90 |
| A6 | 55.22 | 249 | 85 | 307 |
| A7 | 55.11 | 312 | 83 | 383 |
| A8 | 53.19 | 242 | 41 | 275 |
| A9 | 53.87 | 358 | 48 | 418 |
| A10 | 53.04 | 340 | 55 | 384 |
>TRINITY_DN46630_c0_g2_i1 from sample A7 / Example spliced isoformTCTTCATGTACCTGAGGACCTGAGGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTAGCCGCCGTCCTCAA
ACTCGTCTGTAGGCGTCGATCGGCATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGGTACTAAGAAGCAACAGCCCGTGAATTTTGGGTTCGTTCGTTATATATTTTTGGGGTCATTTAGGGTTTACTGTTCAAGTTTTAGAAGAGTTGTTTTACCGTAGCTGCTCCATTATATTTAGCCAAGCTGCGGCCCTT
TGTAAATCACCAATCAATACAAAGGCCTTAAAGCTTGCCGTTACTTCCGACCTACTTGAGGCGGCAAGATTATCTCGTTTTTGTCTTTTTTCTTTGATCGAGCTGGAAAACTGTTATCTAGTTATTATCCTATGGTAATATGACCTTTCGGCTGCCCTAGTGCGCAGTATTTTAGTATTTATTCCTGTGTACTTTTTTTC
CTGGTTTCTTCAAACCCTAAGACCAGCTTAAAGGCCCTCTTGTATTTTTATTTAAGACATCCGGCCATTTTGAGTTAAAGACAGTCTTCAACGATTATTCGCGACTGCGTTTAGGGAGTTTCTTGTTTCTGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTT
CCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAGCTCCC
GAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGG
>TRINITY_DN46630_c0_g2_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:TCTTCATGTACCTGAGGACCTGAGGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTAGCCGCCGTCCTCAA
ACTCGTCTGTAGGCGTCGATCGGCATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGGTACTAAGAAGCAACAGCCCGTGAATTTTGGGTTCGTTCGTTATATATTTTTGGGGTCATTTAGGGTTTACTGTTCAAGTTTTAGAAGAGTTGTTTTACCGTAGCTGCTCCATTATATTTAGCCAAGCTGCGGCCCTT
TGTAAATCACCAATCAATACAAAGGCCTTAAAGCTTGCCGTTACTTCCGACCTACTTGAGGCGGCAAGATTATCTCGTTTTTGTCTTTTTTCTTTGATCGAGCTGGAAAACTGTTATCTAGTTATTATCCTATGGTAATATGACCTTTCGGCTGCCCTAGTGCGCAGTATTTTAGTATTTATTCCTGTGTACTTTTTTTC
CTGGTTTCTTCAAACCCTAAGACCAGCTTAAAGGCCCTCTTGTATTTTTATTTAAGACATCCGGCCATTTTGAGTTAAAGACAGTCTTCAACGATTATTCGCGACTGCGTTTAGGGAGTTTCTTGTTTCTGgttagtgtaaaccctaaagcagtttcaatccagctttccccgtctttgtcttggacttcagccattttg
agtcgcaagcggccttttgaatattattccctactgtattctggtagatttgtgattttcaaccctaaggtagttttcagagattttgaaatttccgcccttgggaatagccgaactcctgacattcattgtcaattgttgatctgtatttcggtgattagcagTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACG
AGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCG
TATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCT
AAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAACCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAG
TTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGGTAGGGGTCGTCAAT
Intron 8 GTAGGTCCAA ... ATCATGTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 23.74 | 334.1 | 38.3 | 104 |
| A2 | 24.19 | 329.1 | 23.7 | 105 |
| A3 | 25.01 | 278.9 | 25 | 93 |
| A4 | 25.33 | 274.1 | 31.6 | 93 |
| A5 | 23.84 | 182.1 | 22.1 | 57 |
| A6 | 23.13 | 1010.4 | 71.4 | 304 |
| A7 | 22.17 | 1257 | 89.6 | 358 |
| A8 | 22.06 | 1010.7 | 70.9 | 286 |
| A9 | 21.98 | 1125.1 | 83.1 | 317 |
| A10 | 26.34 | 1194 | 77.7 | 427 |
>TRINITY_DN101936_c0_g1_i5 from sample A4 / Example spliced isoformGGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTAGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCGATCGG
CATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGCAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGA
GGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTAC
GAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATG
GGAAACCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGA
CGAGGTAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCT
AGAATGAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATC
CAATATATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTT
CCAGGAACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAAT
TTCCCGAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAA
CAATTTATGAGGTAATTAGTTTTATGAAATATTTTTTACAGAATTAGATTCAGGGTATTTTGTGAAATATTTTATACAGAAATATTTATCAGTAAATCACTTACGGAAATATAGATTCATAGTTTCCAGTTGTGTGCAGTTGCCGCCTGCAAGATTTTTCCAAATTCCTTTTAGGCCATTTCTGTCTATTTTTTAATCAT
TGGGAAAATGTATTTGATGTTTCATGTTTCCATTTATTGGTATTTCTTTGGTGATGAGTGCGAGTGATTTTTACATTTGACTGGTAAAGCCTATGGAGGTGTACATATCCTACCCCTTCAAATTTGAACTCGTGACTGGTAAAGCCTATGGAGTAAACGTATGTTTTTTCTGTCTGAGAGATCCTGAATTGATAATAGAG
ATACCAAAAATTGTTGGTATTACACCATTTCATCTTGTGGGGTAGCTCATGGCTATTGATTCACTTCTGTTGTACACTTGAGCCATTGATTCATTTTGTTTGACATTTGAGCAACATTGTATATGTTTCAATTGTATTCGAAGAAAAACCAATCAATTGTGGCAGGGCAATGTTTATTTATTTGAACAATCATCTCTTAA
CTCTTGGATAAGAAATCAAACTCTCCTCAAGATTGTTAGCTTCTGTTAGCTTCAGTAACCAATCAATTTGTGGAGGTCAAATTTTAGTTTGTTGAACAATCATCTCTCAGCTTTAGGGTTGTCGAAAATATGATACACATATGAGACTTGATGGGTAAATGATGTATTGTGCCAAATGATTTATGAATTTGATTGGTACC
AACATTTTTAGTAAAGTTTGGTTGATTTTGTAATTAGTGTGTCTCGTGAAAGATCATTGTATGGTGAAAGAGAAATAACAGAACAAATTGGTTGCATGCAATATCAAAGTTGATGCGGGAGCGGTAGAGAACGATAGCATGCTGTTATTGACACCTGTTGAGATTTGTGGGAGATCCAGGTGGGAAGAAGAACAGCAGAG
AAAGGCAAAGAATAAGGGCATTCGAGAAAGAAGAAAAAGGAAAAAGGAGAAAGATTGATAGTTGGGTGGAGCAAAGAGTAAGGTGGGAGTAATGGGCTTTGGAATTTAGAATTGATGAAGCTTATTTTGATAAATGCCCAATGTAGAGGAGAGCACATTCCAGTTGAACAAGGACCTTCAGATTTTTGAAGTGTCGAATA
TATGTAGGAGAAGTTGATATCGGTTGAGAGATTTTCGGGAGCTGCTCTGAATGAAGTAAATGACATCTTGCCGTAAACGGCGTTGAAGATCAGTAAATCCAATTTAGAATGTGACGGGGTTTCCAATACCCTAAAATTTGTTGTTCATGTTCTCATTTCAACTAGCAGAATATTTAGGGCTTTTAATGCATACATATCTC
TTGAGGAATTTAAGATTGCAACTTATTGTGATCTCTGCATATAAACAGTCTGGCTCGTTTATATTTTGCTTGGTTGCAGGGGGGGTGTGGCTCTGAGAAATCCTTGGAAGAGAGCTGTCATGCTCTCTAGGAATCTTTGTGTGCTTTGTATGGGTACAATAGAGCTGTTAGGCTATGTATAAAGAGGTAATGCAATGTAG
GGGATCTCCTTGTGTCATGAATGCAATCTCGTTTTTGTAATAAAGAGAAATACGTTTAGAGCAATGCTTGCCAGAGGGCATACATAAGAGGAGTGATGCCTCTATTTTGGCTTTCGTGCCATTGAACAATCTTACCGTAACCGGGCCTTAGTTGTTAGGATGGAACTAGTTTTTGTGCAGTAGCAATTTTATTGTGATTG
GATAATTTAATGCGAGGTTTTGAAAATTTAGTTGTTTGGATCGAACTGTGAGGTGCAGTTAGATTAGTACAGATACAATGCAATGCTATTTTGTAGAAGAGGTGGGCCAGTTAGGAAAAGGTGTTCTTAATTAGCTTATGTGGTGTTTACTTGTGTTAACCTCATAAAGTGATCAATTAGAACTTCCTCCCTCAAGGTGA
GTTCTGGTTTGTGGCGTTGATGTTTGTAATTTGGTTTTTATGACTTCATTTGAATTGCAATGATTATTATGAAATGTAGGGCTGTAATCTGGAATGCAAGTAAATCCTATTTAAAAAGAACAAATAATATAAGTCGACAATTACCATTGATAACAAGAACAGTAGTTTGTTATCAGAAATGAATTTGAATTAGAGCCTAC
TCACTCTCGAAGTGAAATGATCTAAAATACTTCAAGGCCAGCAAATTGTGATGAAACCAAGTTAGTTGCATATCAGTGATGGAAATAGTTCACAACCACTGCATAGAGACGTTGTGAAATAATTAGAGACCTTGAACAAGTGTAGTCTATAGCACGTTGTGGATCTCACTGCCACAAACCTGCACATCATTGAAATGGAG
CAACATTAGAGCTATAGTGATAGGGAGATTGGTCCACCAAAGAGTACATGCAAAATCAAAGATTTTGAGCAATCGATAATAGACTAGTGATAAGAATATCCCTGTTGCATCTTGAGTGTTTGTGATATTGTGGGAATAAATTCATAACAAAAGAAGAGCTCCATAGGTTAGAATGTTAT
>TRINITY_DN101936_c0_g1_i15 from sample A4 / Example unspliced isoform:GGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTAGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCGATCGG
CATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGCAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGA
GGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTAC
GAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGgtaggtccaaggaaggtcacatattgtggaaatatcaatgtattgaatatttttaaatttaccctccctttgacattgt
tatgcttgattgtttttaaatttttaccctacctttgacattgttatgcttgattgttttaaaatcatgtcagGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAACCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTG
CTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGG
Intron 9 GTAAGTATAA ... TCTCTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 40.16 | 38 | 21 | 30 |
| A2 | 41.82 | 16 | 16 | 7 |
| A3 | 36.51 | 20 | 11 | 12 |
| A4 | 40.62 | 19 | 13 | 13 |
| A5 | 52.94 | 4 | 4 | 5 |
| A6 | 36.28 | 36 | 18 | 23 |
| A7 | 39.13 | 42 | 26 | 28 |
| A8 | 39.49 | 59 | 39 | 38 |
| A9 | 35.59 | 38 | 18 | 24 |
| A10 | 45.68 | 22 | 23 | 14 |
>TRINITY_DN42029_c0_g1_i13 from sample A6 / Example spliced isoformCCTGAGGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTCGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCG
ATCGGCATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGGTACTAAGAAGCAACAGCCCGTGAATTTTGGGTTCGTTCGTTATATATTTTTGGGGTCATTTAGGGTTTACTGTTCAAGTTTTAGAAGAGTTGTTTTACCGTAGCTGCTCCATTATATTTAGCCAAGCTGCGGCCCTTTGTAAATCACCAATCAAT
ACAAAGGCCTTAAAGCTTGCCGTTACTTCCGACCTACTTGAGGCGGCAAGATTATCTCGTTTTTGTCTTTTTTCTTTGATCGAGCTGGAAAACTGTTATCTAGTTATTATCCTATGGTAATATGACCTTTCGGCTGCCCTAGTGCGCAGTATTTTAGTATTTATTCCTGTGTACTTTTTTTCCTGGTTTCTTCAAACCCT
AAGACCAGCTTAAAGGCCCTCTTGTATTTTTATTTAAGACATCCGGCCATTTTGAGTTAAAGACAGTCTTCAAAGATTATTCGCGACTGCGTTTAGGGAGTTTCTTGTTTCTGGTTAGTGTAAACCCTAAAGCAGTTTCAATCCAGCTTTCCCCGTCTTTGTCTTGGACTTCAGCCATTTTGAGTCGCAAGCGGCCTTTT
GAATATTATTCCCTACTGTATTCTGGTAGATTTGTGATTTTCAACCCTAAGGTAGTTTTCAGAGATTTTGAAATTTCCGCCCTTGGGAATAGCCGAACTCCTGACATTCATTGTCAATTGTTGATCTGTATTTCGGTGATTAGCAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGG
GCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCT
GTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCA
TTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAACCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTC
CTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGGTAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACG
AATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAATGAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTT
TTGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCAATATATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCA
CGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGGAACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGAT
GAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCCGAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGA
TTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATTTATGAGTTTTGTTTGTGGTTCTAGTGTGTATGGTGGTGATCCAGCTCGGGGATGGATTTGGGTTAACGATCGAGTTGCTCTCCCCTATGGC
TTGGGAGGAACTGGTTCTCCAAGTTGTCATTCGCATTGTTGCAACTCGTGTTTGAGCACAGCGTACAGCTCGTTTTTGAGCACAGCGTACAGCTCTGCAGACTAACTTCATATACAATTGATATGGGAATATTTTCTCTTGTAGCTCGCTTGAGCACCATTCAGAGGACATGGAGTACTCTGAACTGGTAAAGGTTTTGA
CTATGTATCAGAGAAGAATCCTCGTCTTCTCTTTGGTATGGCGATTGTAATATTGACACATTTTTTTTCATAAATAAAAGGATGTCTTTTTTTGATGAAAAAAAAAATACATAGGTTGGATTCGAAAGTTTAATACCCTATATATTTAGGCACTCTGTTTCATGTATATATATATATTTATATATGTTGAATTCGAAAGT
TTAATACCTATATATTTGGGC
>TRINITY_DN42029_c0_g1_i8 from sample A6 / Example unspliced isoform:TTGAGATAGCACGGGACGTCGTGTTGTGCATAGAGAAATTGTGCTGCGGGTGCATGTGTTGAGTGTTTCTCTTTTTCATAAGTCCATCACTTAGCTTGTTACAGAATCTGAGAGAAAGTGCTGTGTGGAAGTTTTGTTTGTGGTTCTAGTGTGTATGGTGGTGATCCAGCTCGGGGATGGATTTGGGTTAACGATCGAGT
TGCTCTCCCCTATGGCTTGGGAGGAACTGGTTCTCCAAGTTGTCATTCGCATTGTTGCAAgtaagtataactttctgacttcttcttctttaacgaatgaaattgtttagggtgagtattattgtattttccatttcaagatatgtacacgccatgacaacgtaacttgggttatataagctttgctctagagtaccgtt
tctgtagactgtaacttcatagatagttgatttggtcgttttttttctcttgtagCTCGTGTTTGAGCACAGCGTACAGCTCGTTTTTGAGCACAGCGTACAGCTCTGCAGACTAACTTCATATACAATTGATATGGGAATATTTTCTCTTGTAGCTCGCTTGAGCACCATTCAGAGGACATGGAGTACTCTGAACTGGT
AAAGGTTTTGACTATGTATCAGAGAAGAATCCTCGTCTTCTCTTTGGTATGGCGATTGTAATATTGACACATTTTTTTTCATAAATAAAAGGATGTCTTTTTTTGATGAAAAAAAAAATACATAGGTTGGATTCGAAAGTTTAATACCCTATATATTTAGGCACTCTGTTTCATGTATATATATATATTTATATATGTTG
AATTCGAAAGTTTAATACCTATATATTTGGGC
Intron 10 GTACTAAGAA ... CGGTGATTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 32.89 | 235 | 16 | 115.1 |
| A2 | 27.67 | 298 | 10 | 114 |
| A3 | 29.71 | 362 | 31 | 153 |
| A4 | 27.55 | 284 | 20 | 108 |
| A5 | 33.2 | 165 | 14 | 82 |
| A6 | 29.9 | 635 | 37 | 270.9 |
| A7 | 28.76 | 872 | 42 | 351.9 |
| A8 | 29.19 | 524 | 28 | 216 |
| A9 | 27.11 | 941 | 34 | 350 |
| A10 | 27.66 | 892 | 49.5 | 341 |
>TRINITY_DN112474_c1_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoformCACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTAGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCGATCGGCATCA
ACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGCAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGG
TGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGG
TCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAA
CCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGG
TAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAAT
GAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCAATA
TATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGG
AACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCC
GAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATT
TATGAGGTAATTAGTTTTATGAAATATTTTTTACAGAATTAGATTCAGGGTATTTTGTGAAATATTTTATACAGAAATATTTATCAGTAAATCACTTACGGAAATATAGATTCATAGTTTCCAGTTGTGTGCAGTTGCCGCCTGCAAGATTTTTCCAAATTCCTTTTAGGCCATTTCTGTCTATTTTTTAATCATTGGGA
AAATGTATTTGATGTTTCATGTTTCCATTTATTGGTATTTCTTTGGTGATGAGTGCGAGTGATTTTTACATTTGACTGGTAAAGCCTATGGAGGTGTACATATCCTACCCCTTCAAATTTGAACTCGTGACTGGTAAAGCCTATGGAGTAAACGTATGTTTTTTCTGTCTGAGAGATCCTGAATTGATAATAGAGATACC
AAAAATTGTTGGTATTACACCATTTCATCTTGTGGGGTAGCTCATGGCTATTGATTCACTTCTGTTGTACACTTGAGCCATTGATTCATTTTGTTTGACATTTGAGCAACATTGTATATGTTTCAATTGTATTCGAAGAAAAACCAATCAATTGTGGCAGGGCAATGTTTATTTATTTGAACAATCATCTCTTAACTCTT
GGATAAGAAATCAAACTCTCCTCAAGATTGTTAGCTTCTGTTAGCTTCAGTAACCAATCAATTTGTGGAGGTCAAATTTTAGTTTGTTGAACAATCATCTCTCAGCTTTAGGGTTGTCGAAAATATGATACACATATGAGACTTGATGGGTAAATGATGTATTGTGCCAAATGATTTATGAATTTGATTGGTACCAACAT
TTTTTGTAAAGTTTGGTTGATTTTGTAATTAGTGTGTCTCGTGAAAGATCATTGTATGGTGAAAGAGAAATAACAGAACAAATTGGTTGCATGCAATATCAAAGTTGATGCGGGAGCGGTAGAGAACGATAGCATGCTGTTATTGACACCTGTTGAGATTTGTGGGAGATCCAGGTGGGAAGAAGAACAGCAGAGAAAGG
CAAAGAATAAGGGCATTCGAGAAAGAAGAAAAAGGAAAAAGGAGAAAGATTGATAGTTGGGTGGAGCAAAGAGTAAGGTGGGAGTAATGGGCTTTGGAATTTAGAATTGATGAAGCTTATTTTGATAAATGCCCAATGTAGAGGAGAGCACATTCCAGTTGAACAAGGACCAAGGACCTTCAAATTTTTGAAGTGTCGAA
TATATGTAGGAGAAGTTGATATCGGTTGAGAGATTTTCGGGAGCTGCTCTGAATGAAGTAAATGACATCTTGCCGTAAACGGCATTGAAGATCAGTAAATCCAATTTAGAATGTGACGGGGTTTCCAATACCCTAAAATTTGTTGTTCATGTTCTCATTTCAACTAGCAGAATATTTAGGGCTTTTAATGCATACATATC
TCTTGAGGAATTTAAGATTGCAACTTATTGTGATCTCTGCATATAAACAGTCTGGCTCGTTTATATTTTGCTTGGTTGCAGGGGGGGTGTGGCTCTGAGAAATCCTTGGAAGAGAGCTGTCATGCTCTCTAGGAATCTTTGTGTGCTTTGTATGGGTACAATAGAGCTGTTAGGCTATGTATAAAGAGGTAATGCAATGT
AGGGGATCTCCTTGTGTCATGAATGCAATCTCGTTTTTGTAATAAGGAGAAATACGTTTAGAGCAATGCTTGCCAGAGGGCATACATAAGAGGAGTGATGCCTCTATTTTGGCTTTCGTGCCATTGAACAATCTTACCGTAACCGGGCCTTAGTTGTTAGGATGGAACTAGTTTTTGTGCAGTAGCAATTTTATTGTGAT
TGGATAATTTAATGCGAGGTTTTGAAAATTTAGTTGTTTGGATCGAACTGTGAGGTGCAGTTAGATTAGTACAGATACAATGCAATGCTATTTTGTAGAAGAGGTGGGCCAGTTAGGAAAAGGTGTTCTTAATTAGCTTATGTGGTGTTTACTTGTGTTAACCTCATAAAGTGATCAATTAGAACTTCCTCCCTCAAGGT
GAGTTCTGGTTTGTGGCGTTGATGTTTGTAATTTGGTTTTTATGACTTCATTTGAATTGCAATGATTATTATGAAATGTAGGGCTGTAATCTGGAATGCAAGTAAATCCTATTTAAAAAGAACAAATAATATAAGTCGACAATTACCATTGATAACAAGAACAGTAGTTTGTTATCAGAAATGAATTTGAATTAGAGCCT
ACTCACTCTCGAAGTGAAATGATCTAAAATACTTCAAGGCCAGCAAATTGTGATGA
>TRINITY_DN112474_c1_g1_i21 from sample A2 / Example unspliced isoform:CACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTAGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCGATCGGCATCA
ACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGgtactaagaagcaacagcccgtgaattttgggttcgttcgttatttatttttggggtcatttagggtttactgttcaagttttagaagagttgttttaccggagctgctccattatatttagccaagctgcggccctttgtaaatcaccaatcaatacaaaggcct
taaagcttgccgttacttccgacctacttgaggcggcaagattatctcgtttttgtcttttttctttgatcgagctggaaaactgttatctagttattatcctatggtaatatgacctttcggctgccctagtgcgcagtattttagtatttattcctgtgtactttttttcctggtttcttcaaaccctaagaccagct
taaaggccctcttgtatttttatttaagacatccggccattttgagttaaagacagtcttcaacgattattcgcgactgcgtttagggagtttcttgtttctggttagtgtaaaccctaaagcagtttcaatccagctttccccgtctttgtcttggacttcagccattttgagtcgcaagcggccttttgaatattatt
ccctactgtattctggtagatttgtgattttcaaccctaaggtagttttcagagattttgaaatttccgcccttgggaatagccgaactcctgacattcattgtcaattgttgatctgtatttcgttgattagCAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGAC
GAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAG
CTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGG
AGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAACCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAG
GGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGGTAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATA
CCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAATGAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCA
GCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCAATATATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTT
TGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGGAACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTC
TTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCCGAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAG
GTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATTTATGAGTTTTGTTTGTGGTTCTAGTGTGTATGGTGGTGATCCAGCTCGGGGGTGGATTTGGGTTAACGATTGAGTTGCTCTCCACTATGGCTTGGGAGGAA
CTGGTT
Intron 11 GTACTAAGAA ... TGATTAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 35.96 | 260 | 16 | 146 |
| A2 | 29.78 | 316 | 10 | 134 |
| A3 | 30.95 | 377 | 30 | 169 |
| A4 | 30.27 | 311 | 20 | 135 |
| A5 | 34.35 | 172 | 14 | 90 |
| A6 | 31.33 | 673 | 37 | 307 |
| A7 | 29.85 | 900 | 40 | 383 |
| A8 | 32.13 | 581 | 27 | 275 |
| A9 | 29.35 | 1006 | 33 | 418 |
| A10 | 29.16 | 933 | 49 | 384 |
>TRINITY_DN40348_c1_g1_i15 from sample A8 / Example spliced isoformCTTCATGTACCTGAGGACCTGAGGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTCGCCGCCGTCCTCAAA
CTCGTCTGTAGGCGTCGATCGGCATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGG
AGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTC
TGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAA
>TRINITY_DN40348_c1_g1_i11 from sample A8 / Example unspliced isoform:CTTCATGTACCTGAGGACCTGAGGTAACACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTCGCCGCCGTCCTCAAA
CTCGTCTGTAGGCGTCGATCGGCATCAACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGgtactaagaagcaaaagcccgtgaattttgggttcgttcgttatttatttttggggtcatttagggtttactgttcaagttttagaagagttgttttaccgtagctgctccattatatttagccaagctgcggcccttt
gtaaatcaccaatcaatacaaaggccttaaagcttgccgttacttccgacctacttgaggcggcaagattatctcgtttttgtcttttttctttgatcgagctggaaaactgttatctagttattatcctatggtaatatgacctttcggctgccctagtgcgcagtattttagtatttattcctgtgtacttttttttc
ctggtttcttcaaaccctaaaaccagcttaaaggccctcttgtatttttatttaagacttccggccattttgagttaaagacagtcttcaacgattattcgcgactgcgtttagggagtttcttgtttctggttagtgtaaaccctaaagcagtttcaatccagatttcctcgtctttgtcttggacttcggccattttg
agtcgcaagcggccttttgaatattattccctactgtattctggtagatttgtgattttcaaccctaaggtagttttcagagattttgaaatttccgcccttgggaatagccgaactcctgacattcattgtcaattgttgatctgtatttcggtgattagcagTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACG
AGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCG
TATGCTCTTTCTAAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCT
AAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAA
Intron 12 GTTAGAAAAT ... TCTGTCCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.21 | 473 | 111 | 72 |
| A2 | 13.88 | 543 | 104 | 71 |
| A3 | 13.45 | 534 | 108 | 58 |
| A4 | 18.07 | 492 | 143 | 74 |
| A5 | 13.5 | 330 | 66 | 37 |
| A6 | 11.8 | 1259 | 196 | 141 |
| A7 | 12.16 | 1810 | 305 | 196 |
| A8 | 14.44 | 1096 | 215 | 155 |
| A9 | 12.77 | 1510 | 260 | 182 |
| A10 | 12.72 | 1626 | 318 | 156 |
>TRINITY_DN112474_c1_g1_i19 from sample A2 / Example spliced isoformCACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTAGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCGATCGGCATCA
ACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGCAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGG
TGAAGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGCAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGA
AGGTCGCTGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGG
AAACCCCTCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACG
AGGTAGGGGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAG
AATGAATTGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCA
ATATATAGGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCC
AGGAACTTGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTT
CCCGAGACCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACA
ATTTATGAG
>TRINITY_DN112474_c1_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:CACTAAAGCACTCCGAACCTTCCGCGTCCCGGGTCGACGGGCCGACACAATAACAAAACTAAATATACGCACATACATATACGAACAGAACTAAATACGTTATATACGAATCACTTCGGCTATTTAATAAGGATTTCCACAGTAGAGAGATCCATTTAGCCGCCGTCCTCAAACTCGTCTGTAGGCGTCGATCGGCATCA
ACGAAGGATTATTGCTCAGTCTCAGGCGCCCGAGTAAAATCTGAATTGAAGCATCGATTCTGAGAAGACGAGCAACAAAGAAGGTAGGGCAACATGACGAGTTCCTTGGACATGTCCCTCGAGGACTTGATTAAAATCAACAAACAAACCGGGCGAGGACGAGGGAGGGGTGGAGGTGGAGGTAGAGGCAGAGGCGGTGA
AGCGAATGGAAAGACGGCAGGGCCAGTGCGCAGCAGAGGACTGTCGCGGATAGCGAACCGTGCTGCGCCGTATGCTCTTTCTAAGgttagaaaatcaaacccttgatcttttattttaaagataacttgcaggttcagatattggcattgaaaacattaagatacaaatagaattttgtgaggctttgaatttgggggac
atcctgtgcactttttgtgtagatattgcagatttagtatatagattgtcattggattcaccgggatcacgatctgtagagcagggttaatttctgttgatgtttatccaaaaaaaactttttgtcatatcttttcgatattgctggagttcttttgaaccgtttccgagttattgctgtacacaagttctgcaagattg
ctttagagtcgttaattgggatcttgatgtactgggttcttatagatctgattgtagggaattcattttttcacactgcctatctagtatcatttaagaatattattttttattggtgagatcgaataaggcttgttctaatttgaataaagcctttaaactgtgatgcggcctgcttagatgaatattttggttcctag
aatgtttgatttattgcttttattaaattttgaatgttttgcatttgttttctgactatttaatgtttttttctgtcccagCAGCCTGTTCAGAAAGCTCCCGAGTCGGTGTGGCATCATGATATGTTTGATAATCAGATGAGTACTGATGCAGTAACTTCTAATAGACTTCTGAAAATTGAGACTGGTACGAAGGTCGC
TGTCTCGAACTTAGATTATGGAGTTTCAAATGATGATATAAAGGAGCTTTTTTCAGAGGTTGGTGATCTAAAACGACACACTGTCCATTATGACAGGAGTGGGAGGTCAAAGGGTACTGGAGAAGTTGTATTTGCAAGAAAGGCAGATGCTGAAACTGCAGTTAAGCGGTATAACAATGTGCAACTTGATGGGAAACCCC
TCAAGCTAGAAATAGTTGGAACAAACCTAACAGTTCCTGCTCCAAATATTCAGCCTAGGAATTGGGCAGTTGGAAATGCAATCCGTCCTTCATTGAGGGGACGTGGCAGGGGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGAGCTGGTGCTTTTAGAGGCTCTCGTGGCCGTGGACGAGGTAGG
GGTCGTCAATCCCAGCGTGGTGAGGATAAAAGTGTAGAAGATCTTGATGCCGATTTGGAATCTTACCATGCAGAAGCTATGCAGACGAATTGAAATACCATATTTTGTATTTTGATTACCTGCCTCGGTATTCAGAGGACTTGATCCTGTTGATAGACACTGCAAAAGTTTTGAAAATATATCTGGGGTCTAGAATGAAT
TGGTTTGAGCACCTGTGCAATGACCTATCCAGTGCTGATCATATTTGAATTGTATTCTTGAAGAGATTCTCGTAATACCAACAGGTTTTGTGTGGCAGCTCAGACAGTCATTTAATTTTATACACATTATTTTCATTATGGACAAAGCTGCACACCTTATTTGCTTGCAGCCTCTGATCTGATGCAGCATCCAATATATA
GGTTGTTCTAAAAATTGTGATCTAAGAGTTGTAACAATTCAGCAAGCTACTTTTATATAGCTTAAATGCACTTTATCAGCTGAATCACGAAGTTTTTTGAACAATTTAGTTTGTTATTGTCAAAAGGTGCACTGAGTCAAAGCTGCAGTTTAATGCTGGCAGTCTTGAGAAGAGAAGTCCACTATAGTTTTCCAGGAACT
TGAATCTTGCGATTGTGCATTATGCATATGTTTAAGGACATATTGGCTGGCTTGGAGATCAAATAAGATGAACCTGATTGATAAGATGAGCCTGTTCTTGAAAACATATAATGAAATTTACATAAAGAACTTTATCAATCTCATCAGGTAAATCAAGAGGGCTTGGTTAGATGCTAAAACATGGATCAAATTTCCCGAGA
CCCCATTGACAAGTTTCACCTCTTGGGCGATTTCTCTTTGTGCAAGCGGGTGCTGTCGTGCTTGTGTAAGTAGGCTATCTGAAGTGATTGGGCCCAGGTGCAGGTCTGAGTGACTTCAGTGGGATAGATACCATCCTATATTGGAGAAGGGGAATGCTTGTCGTGCAGGAATAGGAAGCATCACGTCAAAACAATTTATG
AG