sp|Q9ZW33|TIM10_ARATH ----> Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10


Intron 1 GTGAATTGAA ... GCTATTGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A191.95216.729
A278.84278
A387.23212.315
A473.6149.313
A510007.57
A673.643272.8106
A772.783978.5130
A878.33296135.5
A974.453891130.7
A1071.852146.361



>TRINITY_DN38345_c0_g1_i6 from sample A6 / Example spliced isoform
CACATAAATTAAAATACAATGTTTGAAAAACAGTTAACCAACCATCTCTACAAATTTTTGTCCTAAAAGAGAAAATGGGAGTGCATTGTTAAAATCCCAATACAGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACC
GACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAAC
TACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAGTATTGACAGATTTTATCAATGTATAAAGTTTTAATGTCAAAACAGTCTTAAGATGATGTCAATATTACTGTGCTGTTTTATTTGGAGTTGTTTTTTCTGCAATTACAACACCAAATCCACATGCAGAGGCAA
TTCCTAAGTGAATTGTTCACATTTTTGAGCATTCTCTTGAAGGTGCTCAGACAATTTTGTAGTGGTTCTATTCATCTGGATCTTGAATAACTATGATCTTAATTTTTAAGTTTACATATATTGGGTCAGACATTAAATCACAGGACTGCTTTTGTTGTTTGATGCAGGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCC
AAGTAGATATAAAGAAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATA
ATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGT
TGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTG
TATTATC


>TRINITY_DN38345_c0_g1_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CACATAAATTAAAATACAATGTTTGAAAAACAGTTAACCAACCATCTCTACAAATTTTTGTCCTAAAAGAGAAAATGGGAGTGCATTGTTAAAATCCCAATACAGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACC
GACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAA
ATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGgtgaattgaacataggagaatccacttgtgttgatcgctgtgttgccaaatactcacaggttactgctattgtagGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTG
ATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGC
ATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTA
AATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATC




Intron 2 GTGTCTAGTC ... TTTGATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A151.6311.31213.6
A266.0513.4263.9
A373.15.414.65.7
A466.7712.725.54.6
A568.3510.84.8
A652.9154.961.643.4
A753.3847.25445.9
A854.1863.374.964.9
A947.4672.265.452.9
A1056.033139.527.6



>TRINITY_DN38345_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoform
CTTCGATACTCTCGAGTATGCTGTTTATCTACGGTGTTTAGTTTGAAGGTTTTAAGGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCA
TTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCAC
GAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTT
GTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAA
AACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATC


>TRINITY_DN38345_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CTTCGATACTCTCGAGTATGCTGTTTATCTACGGTGTTTAGTTTGAAGGTTTTAAGGTTAAATTTTAGGACTAGGGGCTTTTAAGTTTTTCCTTTTTACTAATGGATGTGCAACTAACATGTTTTGTACATGCTGTTTTTTTTGTTTTTGTTTTCCAGGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTT
CTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAgtgtctagtctccctttttttaactacttgatttgactatatgttgacagttggcctgcttttcaccacctttgatctctcatcaggctaagtattgacagattttatcaatgtataaagttttaat
gtcaaaacagtcttaagatgatgtcaatattactgtgctgttttatttggagttgttttttctgcaattacaacaccaaatccacatgcagaggcaattcctaagtgaattgttcacatttttgagcattctcttgaaggtgctcagacaattttgtagtggttctattcatctggatcttgaataactatgatcttaat
ttttaagtttacatatattgggtcagacattaaatcacaggactgcttttgttgtttgatgcag
GGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTT
GGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTG
CTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCAC
TTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATC




Intron 3 GTATTGACAG ... TTTGATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A168.1871513.5
A262.56103.8
A363.527.713.55.6
A476.923104.5
A550114.7
A648.24444142.6
A743.59443445.3
A854.31536363.7
A949.33383752.1
A1055.74273427.2



>TRINITY_DN38345_c0_g1_i8 from sample A6 / Example spliced isoform
CACATAAATTAAAATACAATGTTTGAAAAACAGTTAACCAACCATCTCTACAAATTTTTGTCCTAAAAGAGAAAATGGGAGTGCATTGTTAAAATCCCAATACAGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACC
GACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAAC
TACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTT
CTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTA
TTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCC
CACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATC


>TRINITY_DN38345_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CTTCGATACTCTCGAGTATGCTGTTTATCTACGGTGTTTAGTTTGAAGGTTTTAAGGTTAAATTTTAGGACTAGGGGCTTTTAAGTTTTTCCTTTTTACTAATGGATGTGCAACTAACATGTTTTGTACATGCTGTTTTTTTTGTTTTTGTTTTCCAGGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTT
CTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAACTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAgtattgacagattttatcaatgtataaagttttaat
gtcaaaacagtcttaagatgatgtcaatattactgtgctgttttatttggagttgttttttctgcaattacaacaccaaatccacatgcagaggcaattcctaagtgaattgttcacatttttgagcattctcttgaaggtgctcagacaattttgtagtggttctattcatctggatcttgaataactatgatcttaat
ttttaagtttacatatattgggtcagacattaaatcacaggactgcttttgttgtttgatgcag
GGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTT
GGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTG
CTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCAC
TTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATC




Intron 4 GTGTCTAGTC ... CTCTCATCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A144.1912127
A255.9313276
A365.525127
A455.5612264
A5605114
A647.47575845
A750495048
A854.29647973
A941.5746540
A1054.07313934



>TRINITY_DN44396_c0_g2_i4 from sample A10 / Example spliced isoform
GCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTC
TGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGC
AACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTT
TATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGG
AGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATCG


>TRINITY_DN44396_c0_g2_i1 from sample A10 / Example unspliced isoform:
GCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTC
TGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAgtgtctagtctccctttttttaactacttgatttgactatatgttgacagttggcctgcttttcaccacctttgatctctcatcagGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATA
TAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATG
TGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTA
GCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAA
AAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATCG




Intron 5 GCTAAGTATT ... TTTGATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A167.4471514
A256.23611.54
A358.2713.56
A466.674115
A546.67425
A649.34541.546
A746.96483748
A848.04736669
A953.76403756
A1048.09343429



>TRINITY_DN44396_c0_g2_i1 from sample A10 / Example spliced isoform
GCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTC
TGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAACTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATA
TAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATG
TGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTA
GCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAA
AAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATCG


>TRINITY_DN44396_c0_g2_i7 from sample A10 / Example unspliced isoform:
TGTTTACTTCGATACTCTCGAGTATGCTGTTTATCTACGGTGTTTAGTTTGAAGGTTTTAAGGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAA
CTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGgctaagtattgacagattttatcaatgtataaagttttaatgtcaaaacagtcttaagatgatgtcaatattactgtgctgttttatttggagttgttttttctgcaattacaacaccaaatccacatgcagaggca
attcctaagtgaattgttcacatttttgagcattctcttgaaggtgctcagacaattttgtagtggttctattcatctggatcttgaataactatgatcttaatttttaagtttacatatattgggtcagacattaaatcacaggactgcttttgttgtttgatgcag
GGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTC
CAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAG
TGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTC
ATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAAC
TTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATCG




Intron 6 GTATGCTGTT ... TGTTTTCCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A133.65151.97.6
A228.729.46.112
A326.6525.37.19.2
A430.1528.65.112.6
A515.5218.63.23.5
A623.297615.323.4
A723.7460.517.819.1
A830.8262.710.828.4
A916.688.510.818.1
A1017.546.3149.9



>TRINITY_DN105159_c0_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoform
GTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTT
TATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGC
CACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATT


>TRINITY_DN105159_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:
GTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAgtatgctgtttatctacggtgtttagtttgaaggttttaaggttaaattttaggactaggggct
tttaagtttttcctttttactaatggatgtgcaactaacatgttttgtacatgctgttttttttgtttttgttttccag
GTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTATGT
CATTATTCTTTACATTTTCTCTTAAATGCCCGTAAAAGAATAGGTTTAAATTGGAATTTGCTGTGATTCTCGATTTAATTTGTTTTCTATTGTATGTTTGGGTTTGTTGGTATATCTGCCTCCCTGCAAGACTTTGAAATATCTTTATTGCCTGGCGTTTCTGCCAAAGCCGCATATTATTACTTTAGAATTTATTCAAT
GAATAGACAAGTCTCGTTAATTGAAGTATATGGAACCCCAGCCTTTTCATATTATGGTAGCCATGGAATGCTCTGTCATCTGTTATGTGGATTTTGTATTGATGCCAATCATTAAAGTGACTGTAATTCTAGTTTTTTGAATTCATATCTTAGATTGCAGTTACCTCTTTGCTTGTAAAACAATTCATAAGCAGAGAATT
GCAAGCACTCAC




Intron 7 GTATAAAGTT ... TTTGATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A168.1871511
A270373
A3754124
A478.573112.5
A5-1003.5
A651.81404327.5
A747.62444033
A853.57526040
A950.63394034.5
A1049.21323119



>TRINITY_DN41776_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoform
GTTAAAATCCCAATACAGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACT
GACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAACTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAGTATTGACAGATTTTATCAA
T
GGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATT
TGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGA
ACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTAC
GCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCA


>TRINITY_DN41776_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:
GTTAAAATCCCAATACAGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACT
GACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAACTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAGTATTGACAGATTTTATCAA
T
gtataaagttttaatgtcaaaacagtcttaagatgatgtcaatattactgtgctgttttatttggagttgttttttctgcaattacaacaccaaatccacatgcagaggcaattcctaagtgaattgttcacatttttgagcattctcttgaaggtgctcagacaattttgtagtggttctattcatctggatcttgaa
taactatgatcttaatttttaagtttacatatattgggtcagacattaaatcacaggactgcttttgttgtttgatgcag
GGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTAT
TGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATA
TGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTG
CCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCA




Intron 8 GTATGCTGTT ... AGGTTTTAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A127.57154.85.7
A225.04292.19.7
A318.9325.42.95.9
A421.7128.52.17.9
A516.6718.51.33.7
A626.2976.99.427.5
A724.1960.59.519.4
A832.462.910.530.2
A926.889.511.932.8
A1016.9946.55.99.5



>TRINITY_DN123835_c3_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform
AAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATT
GGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTATGTCATTATTCTTTACATTTTCTCTTAAATGCCCGTAAAAGAATAGGTTTAAATTGGAATTTGCTGTGATTCTCGATTTAATTTGTTTTCTATTGTATGTTTGGGTTTGTTGGTATATCTGCCTCCCTGCAAGACTTTGAAATATCTTTA
TTGCCTG


>TRINITY_DN123835_c3_g1_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:
AAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAgtatgctgtttatctacggtgtttagtttgaaggttttaagGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTG
ACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTG
CTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATG
CATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCA
CTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGG




Intron 9 GTTAAATTTT ... TGTTTTCCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A158.15.207.2
A254.9595.611.2
A360.865.84.69
A458.717.8011.8
A550.763.203.2
A643.7126.4221.4
A749.3217.82.217.6
A845.6629.4125.6
A931.0632015.8
A1044.4510.21.28.6



>TRINITY_DN123835_c3_g1_i3 from sample A3 / Example spliced isoform
AAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTATGCTGTTTATCTACGGTGTTTAGTTTGAAGGTTTTAAGGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTG
ACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTG
CTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATG
CATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCA
CTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGG


>TRINITY_DN123835_c3_g1_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:
AAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTATGCTGTTTATCTACGGTGTTTAGTTTGAAGGTTTTAAGgttaaattttaggactaggggctttta
agtttttcctttttactaatggatgtgcaactaacatgttttgtacatgctgttttttttgtttttgttttccag
GTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTC
TCCCTTTTTTTAACTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAGTATTGACAGATTTTATCAATGTATAAAGTTTTAATGTCAAAACAGTCTTAAGATGATGTCAATATTACTGTGCTGTTTTATTTGGAGTTGTTTTTTCTGCAATTACAACACCAAATCC
ACATGCAGAGGCAATTCCTAAGTGAATTGTTCACATTTTTGAGCATTCTCTTGAAGGTGCTCAGACAATTTTGTAGTGGTTCTATTCATCTGGATCTTGAATAACTATGATCTTAATTTTTAAGTTTACATATATTGGGTCAGACATTAAATCACAGGACTGCTTTTGTTGTTTGATGCAGGGTCACTCAAGTTTGCTAT
GCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGAAGAGAGGGGCGCATTAGTG




Intron 10 GTGTGTAGTT ... TTTGGGACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A190.482199
A287.884295
A383.333154
A488.892161
A573.334119
A683.614020457
A785.674627564
A884.594323687
A979.925321157
A1086.982214736



>TRINITY_DN41776_c0_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoform
CTTTTCTTGTTTGTACAAACTATGAGTTGTTGCCCTCCATTTGTTTGTGAGCCTCAATTCTGCCAATATCTTCCACAGGTTCTCTCTCGACACTGCATCAAATATATTTTTGACGTCTATGAAGCAGCACCATAGCCCCTCAACTTTGTTGTCCCACGTTTTCTCTATTGTGTGCCTCAGTATGAGGCATTGTTCTATGG
TGGAATTTTCTGGCCAGAAATTGGTTTGGCCCATAGCTCTTTTTCCCTCTGCTTCTCCACATTTGCTGATTTTTCATTCCACTATCCCTCCAAATAGATTAGCGAATACAAGGGTAAACATGATGATCTGTAGTTTCCTGTATCATTCTACTGCCCACTTTCATATAGTTTTAGGACTTTCTGAAAATTTAGATATTTAT
ACATTATGTTGTTAAATCTCACTGTGTTCAAACTTCATATGGATTGCTTACTTGTATAGTAGAATTTAGGGCTTAATAATGATAATATATGAAGGTATTTTTATTCAGTATTTTACATGGTTTCTTAATGTTTCAAAATTCAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGC
CAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAG
CTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCA


>TRINITY_DN41776_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:
GTTAAAATCCCAATACAGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACT
GACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAACTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAGTATTGACAGATTTTATCAA
TGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATT
TGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATgtgtgtagtttgattcttcatttctgacggactaaaaatatctgccttgtaccgtttttgaaccataatggaatgcatatgcggttttattattgctttccaaaaggttacttgaagttcttctcatcaacatatttttactctattttgggacagGA
ACTT
GTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTAC
GCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCA