sp|Q9ZW33|TIM10_ARATH ----> Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10
Intron 1 GTGAATTGAA ... GCTATTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 91.95 | 2 | 16.7 | 29 |
| A2 | 78.84 | 2 | 7 | 8 |
| A3 | 87.23 | 2 | 12.3 | 15 |
| A4 | 73.61 | 4 | 9.3 | 13 |
| A5 | 100 | 0 | 7.5 | 7 |
| A6 | 73.64 | 32 | 72.8 | 106 |
| A7 | 72.78 | 39 | 78.5 | 130 |
| A8 | 78.3 | 32 | 96 | 135.5 |
| A9 | 74.45 | 38 | 91 | 130.7 |
| A10 | 71.85 | 21 | 46.3 | 61 |
>TRINITY_DN38345_c0_g1_i6 from sample A6 / Example spliced isoformCACATAAATTAAAATACAATGTTTGAAAAACAGTTAACCAACCATCTCTACAAATTTTTGTCCTAAAAGAGAAAATGGGAGTGCATTGTTAAAATCCCAATACAGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACC
GACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAAC
TACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAGTATTGACAGATTTTATCAATGTATAAAGTTTTAATGTCAAAACAGTCTTAAGATGATGTCAATATTACTGTGCTGTTTTATTTGGAGTTGTTTTTTCTGCAATTACAACACCAAATCCACATGCAGAGGCAA
TTCCTAAGTGAATTGTTCACATTTTTGAGCATTCTCTTGAAGGTGCTCAGACAATTTTGTAGTGGTTCTATTCATCTGGATCTTGAATAACTATGATCTTAATTTTTAAGTTTACATATATTGGGTCAGACATTAAATCACAGGACTGCTTTTGTTGTTTGATGCAGGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCC
AAGTAGATATAAAGAAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATA
ATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGT
TGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTG
TATTATC
>TRINITY_DN38345_c0_g1_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:CACATAAATTAAAATACAATGTTTGAAAAACAGTTAACCAACCATCTCTACAAATTTTTGTCCTAAAAGAGAAAATGGGAGTGCATTGTTAAAATCCCAATACAGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACC
GACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAA
ATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGgtgaattgaacataggagaatccacttgtgttgatcgctgtgttgccaaatactcacaggttactgctattgtagGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTG
ATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGC
ATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTA
AATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATC
Intron 2 GTGTCTAGTC ... TTTGATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 51.63 | 11.3 | 12 | 13.6 |
| A2 | 66.05 | 13.4 | 26 | 3.9 |
| A3 | 73.1 | 5.4 | 14.6 | 5.7 |
| A4 | 66.77 | 12.7 | 25.5 | 4.6 |
| A5 | 68.3 | 5 | 10.8 | 4.8 |
| A6 | 52.91 | 54.9 | 61.6 | 43.4 |
| A7 | 53.38 | 47.2 | 54 | 45.9 |
| A8 | 54.18 | 63.3 | 74.9 | 64.9 |
| A9 | 47.46 | 72.2 | 65.4 | 52.9 |
| A10 | 56.03 | 31 | 39.5 | 27.6 |
>TRINITY_DN38345_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoformCTTCGATACTCTCGAGTATGCTGTTTATCTACGGTGTTTAGTTTGAAGGTTTTAAGGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCA
TTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCAC
GAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTT
GTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAA
AACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATC
>TRINITY_DN38345_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:CTTCGATACTCTCGAGTATGCTGTTTATCTACGGTGTTTAGTTTGAAGGTTTTAAGGTTAAATTTTAGGACTAGGGGCTTTTAAGTTTTTCCTTTTTACTAATGGATGTGCAACTAACATGTTTTGTACATGCTGTTTTTTTTGTTTTTGTTTTCCAGGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTT
CTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAgtgtctagtctccctttttttaactacttgatttgactatatgttgacagttggcctgcttttcaccacctttgatctctcatcaggctaagtattgacagattttatcaatgtataaagttttaat
gtcaaaacagtcttaagatgatgtcaatattactgtgctgttttatttggagttgttttttctgcaattacaacaccaaatccacatgcagaggcaattcctaagtgaattgttcacatttttgagcattctcttgaaggtgctcagacaattttgtagtggttctattcatctggatcttgaataactatgatcttaat
ttttaagtttacatatattgggtcagacattaaatcacaggactgcttttgttgtttgatgcagGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTT
GGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTG
CTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCAC
TTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATC
Intron 3 GTATTGACAG ... TTTGATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 68.18 | 7 | 15 | 13.5 |
| A2 | 62.5 | 6 | 10 | 3.8 |
| A3 | 63.52 | 7.7 | 13.5 | 5.6 |
| A4 | 76.92 | 3 | 10 | 4.5 |
| A5 | 50 | 1 | 1 | 4.7 |
| A6 | 48.24 | 44 | 41 | 42.6 |
| A7 | 43.59 | 44 | 34 | 45.3 |
| A8 | 54.31 | 53 | 63 | 63.7 |
| A9 | 49.33 | 38 | 37 | 52.1 |
| A10 | 55.74 | 27 | 34 | 27.2 |
>TRINITY_DN38345_c0_g1_i8 from sample A6 / Example spliced isoformCACATAAATTAAAATACAATGTTTGAAAAACAGTTAACCAACCATCTCTACAAATTTTTGTCCTAAAAGAGAAAATGGGAGTGCATTGTTAAAATCCCAATACAGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACC
GACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAAC
TACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTT
CTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTA
TTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCC
CACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATC
>TRINITY_DN38345_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:CTTCGATACTCTCGAGTATGCTGTTTATCTACGGTGTTTAGTTTGAAGGTTTTAAGGTTAAATTTTAGGACTAGGGGCTTTTAAGTTTTTCCTTTTTACTAATGGATGTGCAACTAACATGTTTTGTACATGCTGTTTTTTTTGTTTTTGTTTTCCAGGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTT
CTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAACTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAgtattgacagattttatcaatgtataaagttttaat
gtcaaaacagtcttaagatgatgtcaatattactgtgctgttttatttggagttgttttttctgcaattacaacaccaaatccacatgcagaggcaattcctaagtgaattgttcacatttttgagcattctcttgaaggtgctcagacaattttgtagtggttctattcatctggatcttgaataactatgatcttaat
ttttaagtttacatatattgggtcagacattaaatcacaggactgcttttgttgtttgatgcagGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTT
GGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTG
CTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCAC
TTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATC
Intron 4 GTGTCTAGTC ... CTCTCATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 44.19 | 12 | 12 | 7 |
| A2 | 55.93 | 13 | 27 | 6 |
| A3 | 65.52 | 5 | 12 | 7 |
| A4 | 55.56 | 12 | 26 | 4 |
| A5 | 60 | 5 | 11 | 4 |
| A6 | 47.47 | 57 | 58 | 45 |
| A7 | 50 | 49 | 50 | 48 |
| A8 | 54.29 | 64 | 79 | 73 |
| A9 | 41.5 | 74 | 65 | 40 |
| A10 | 54.07 | 31 | 39 | 34 |
>TRINITY_DN44396_c0_g2_i4 from sample A10 / Example spliced isoformGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTC
TGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGC
AACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTT
TATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGG
AGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATCG
>TRINITY_DN44396_c0_g2_i1 from sample A10 / Example unspliced isoform:GCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTC
TGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAgtgtctagtctccctttttttaactacttgatttgactatatgttgacagttggcctgcttttcaccacctttgatctctcatcagGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATA
TAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATG
TGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTA
GCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAA
AAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATCG
Intron 5 GCTAAGTATT ... TTTGATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 67.44 | 7 | 15 | 14 |
| A2 | 56.23 | 6 | 11.5 | 4 |
| A3 | 58.2 | 7 | 13.5 | 6 |
| A4 | 66.67 | 4 | 11 | 5 |
| A5 | 46.67 | 4 | 2 | 5 |
| A6 | 49.3 | 45 | 41.5 | 46 |
| A7 | 46.96 | 48 | 37 | 48 |
| A8 | 48.04 | 73 | 66 | 69 |
| A9 | 53.76 | 40 | 37 | 56 |
| A10 | 48.09 | 34 | 34 | 29 |
>TRINITY_DN44396_c0_g2_i1 from sample A10 / Example spliced isoformGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTC
TGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAACTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATA
TAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATG
TGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTA
GCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAA
AAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATCG
>TRINITY_DN44396_c0_g2_i7 from sample A10 / Example unspliced isoform:TGTTTACTTCGATACTCTCGAGTATGCTGTTTATCTACGGTGTTTAGTTTGAAGGTTTTAAGGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAA
CTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGgctaagtattgacagattttatcaatgtataaagttttaatgtcaaaacagtcttaagatgatgtcaatattactgtgctgttttatttggagttgttttttctgcaattacaacaccaaatccacatgcagaggca
attcctaagtgaattgttcacatttttgagcattctcttgaaggtgctcagacaattttgtagtggttctattcatctggatcttgaataactatgatcttaatttttaagtttacatatattgggtcagacattaaatcacaggactgcttttgttgtttgatgcagGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTC
CAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAG
TGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTC
ATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAAC
TTGAAAGGAAAAAACTCTATCATTCTCTATCAATGCAAATTCTTAGTGGTGTTGGTTACAGAATAAAATTGTATTGTATTATCG
Intron 6 GTATGCTGTT ... TGTTTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 33.65 | 15 | 1.9 | 7.6 |
| A2 | 28.7 | 29.4 | 6.1 | 12 |
| A3 | 26.65 | 25.3 | 7.1 | 9.2 |
| A4 | 30.15 | 28.6 | 5.1 | 12.6 |
| A5 | 15.52 | 18.6 | 3.2 | 3.5 |
| A6 | 23.29 | 76 | 15.3 | 23.4 |
| A7 | 23.74 | 60.5 | 17.8 | 19.1 |
| A8 | 30.82 | 62.7 | 10.8 | 28.4 |
| A9 | 16.6 | 88.5 | 10.8 | 18.1 |
| A10 | 17.5 | 46.3 | 14 | 9.9 |
>TRINITY_DN105159_c0_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoformGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTT
TATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGC
CACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATT
>TRINITY_DN105159_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:GTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAgtatgctgtttatctacggtgtttagtttgaaggttttaaggttaaattttaggactaggggct
tttaagtttttcctttttactaatggatgtgcaactaacatgttttgtacatgctgttttttttgtttttgttttccagGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTATGT
CATTATTCTTTACATTTTCTCTTAAATGCCCGTAAAAGAATAGGTTTAAATTGGAATTTGCTGTGATTCTCGATTTAATTTGTTTTCTATTGTATGTTTGGGTTTGTTGGTATATCTGCCTCCCTGCAAGACTTTGAAATATCTTTATTGCCTGGCGTTTCTGCCAAAGCCGCATATTATTACTTTAGAATTTATTCAAT
GAATAGACAAGTCTCGTTAATTGAAGTATATGGAACCCCAGCCTTTTCATATTATGGTAGCCATGGAATGCTCTGTCATCTGTTATGTGGATTTTGTATTGATGCCAATCATTAAAGTGACTGTAATTCTAGTTTTTTGAATTCATATCTTAGATTGCAGTTACCTCTTTGCTTGTAAAACAATTCATAAGCAGAGAATT
GCAAGCACTCAC
Intron 7 GTATAAAGTT ... TTTGATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 68.18 | 7 | 15 | 11 |
| A2 | 70 | 3 | 7 | 3 |
| A3 | 75 | 4 | 12 | 4 |
| A4 | 78.57 | 3 | 11 | 2.5 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 3.5 |
| A6 | 51.81 | 40 | 43 | 27.5 |
| A7 | 47.62 | 44 | 40 | 33 |
| A8 | 53.57 | 52 | 60 | 40 |
| A9 | 50.63 | 39 | 40 | 34.5 |
| A10 | 49.21 | 32 | 31 | 19 |
>TRINITY_DN41776_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoformGTTAAAATCCCAATACAGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACT
GACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAACTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAGTATTGACAGATTTTATCAA
TGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATT
TGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGA
ACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTAC
GCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCA
>TRINITY_DN41776_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:GTTAAAATCCCAATACAGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACT
GACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAACTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAGTATTGACAGATTTTATCAA
Tgtataaagttttaatgtcaaaacagtcttaagatgatgtcaatattactgtgctgttttatttggagttgttttttctgcaattacaacaccaaatccacatgcagaggcaattcctaagtgaattgttcacatttttgagcattctcttgaaggtgctcagacaattttgtagtggttctattcatctggatcttgaa
taactatgatcttaatttttaagtttacatatattgggtcagacattaaatcacaggactgcttttgttgtttgatgcagGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTAT
TGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATGCATA
TGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTG
CCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCA
Intron 8 GTATGCTGTT ... AGGTTTTAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 27.57 | 15 | 4.8 | 5.7 |
| A2 | 25.04 | 29 | 2.1 | 9.7 |
| A3 | 18.93 | 25.4 | 2.9 | 5.9 |
| A4 | 21.71 | 28.5 | 2.1 | 7.9 |
| A5 | 16.67 | 18.5 | 1.3 | 3.7 |
| A6 | 26.29 | 76.9 | 9.4 | 27.5 |
| A7 | 24.19 | 60.5 | 9.5 | 19.4 |
| A8 | 32.4 | 62.9 | 10.5 | 30.2 |
| A9 | 26.8 | 89.5 | 11.9 | 32.8 |
| A10 | 16.99 | 46.5 | 5.9 | 9.5 |
>TRINITY_DN123835_c3_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoformAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATT
GGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTATGTCATTATTCTTTACATTTTCTCTTAAATGCCCGTAAAAGAATAGGTTTAAATTGGAATTTGCTGTGATTCTCGATTTAATTTGTTTTCTATTGTATGTTTGGGTTTGTTGGTATATCTGCCTCCCTGCAAGACTTTGAAATATCTTTA
TTGCCTG
>TRINITY_DN123835_c3_g1_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:AAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAgtatgctgtttatctacggtgtttagtttgaaggttttaagGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTG
ACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTG
CTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATG
CATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCA
CTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGG
Intron 9 GTTAAATTTT ... TGTTTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 58.1 | 5.2 | 0 | 7.2 |
| A2 | 54.95 | 9 | 5.6 | 11.2 |
| A3 | 60.86 | 5.8 | 4.6 | 9 |
| A4 | 58.71 | 7.8 | 0 | 11.8 |
| A5 | 50.76 | 3.2 | 0 | 3.2 |
| A6 | 43.71 | 26.4 | 2 | 21.4 |
| A7 | 49.32 | 17.8 | 2.2 | 17.6 |
| A8 | 45.66 | 29.4 | 1 | 25.6 |
| A9 | 31.06 | 32 | 0 | 15.8 |
| A10 | 44.45 | 10.2 | 1.2 | 8.6 |
>TRINITY_DN123835_c3_g1_i3 from sample A3 / Example spliced isoformAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTATGCTGTTTATCTACGGTGTTTAGTTTGAAGGTTTTAAGGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTG
ACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTG
CTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGTGTGTAGTTTGATTCTTCATTTCTGACGGACTAAAAATATCTGCCTTGTACCGTTTTTGAACCATAATGGAATG
CATATGCGGTTTTATTATTGCTTTCCAAAAGGTTACTTGAAGTTCTTCTCATCAACATATTTTTACTCTATTTTGGGACAGGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCA
CTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGG
>TRINITY_DN123835_c3_g1_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:AAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTATGCTGTTTATCTACGGTGTTTAGTTTGAAGGTTTTAAGgttaaattttaggactaggggctttta
agtttttcctttttactaatggatgtgcaactaacatgttttgtacatgctgttttttttgtttttgttttccagGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACTGACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTC
TCCCTTTTTTTAACTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAGTATTGACAGATTTTATCAATGTATAAAGTTTTAATGTCAAAACAGTCTTAAGATGATGTCAATATTACTGTGCTGTTTTATTTGGAGTTGTTTTTTCTGCAATTACAACACCAAATCC
ACATGCAGAGGCAATTCCTAAGTGAATTGTTCACATTTTTGAGCATTCTCTTGAAGGTGCTCAGACAATTTTGTAGTGGTTCTATTCATCTGGATCTTGAATAACTATGATCTTAATTTTTAAGTTTACATATATTGGGTCAGACATTAAATCACAGGACTGCTTTTGTTGTTTGATGCAGGGTCACTCAAGTTTGCTAT
GCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGAAGAGAGGGGCGCATTAGTG
Intron 10 GTGTGTAGTT ... TTTGGGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 90.48 | 2 | 19 | 9 |
| A2 | 87.88 | 4 | 29 | 5 |
| A3 | 83.33 | 3 | 15 | 4 |
| A4 | 88.89 | 2 | 16 | 1 |
| A5 | 73.33 | 4 | 11 | 9 |
| A6 | 83.61 | 40 | 204 | 57 |
| A7 | 85.67 | 46 | 275 | 64 |
| A8 | 84.59 | 43 | 236 | 87 |
| A9 | 79.92 | 53 | 211 | 57 |
| A10 | 86.98 | 22 | 147 | 36 |
>TRINITY_DN41776_c0_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoformCTTTTCTTGTTTGTACAAACTATGAGTTGTTGCCCTCCATTTGTTTGTGAGCCTCAATTCTGCCAATATCTTCCACAGGTTCTCTCTCGACACTGCATCAAATATATTTTTGACGTCTATGAAGCAGCACCATAGCCCCTCAACTTTGTTGTCCCACGTTTTCTCTATTGTGTGCCTCAGTATGAGGCATTGTTCTATGG
TGGAATTTTCTGGCCAGAAATTGGTTTGGCCCATAGCTCTTTTTCCCTCTGCTTCTCCACATTTGCTGATTTTTCATTCCACTATCCCTCCAAATAGATTAGCGAATACAAGGGTAAACATGATGATCTGTAGTTTCCTGTATCATTCTACTGCCCACTTTCATATAGTTTTAGGACTTTCTGAAAATTTAGATATTTAT
ACATTATGTTGTTAAATCTCACTGTGTTCAAACTTCATATGGATTGCTTACTTGTATAGTAGAATTTAGGGCTTAATAATGATAATATATGAAGGTATTTTTATTCAGTATTTTACATGGTTTCTTAATGTTTCAAAATTCAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGC
CAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATTTGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATGAACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAG
CTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTACGCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCA
>TRINITY_DN41776_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:GTTAAAATCCCAATACAGCGATTTCGTGCGTCTTGGATGTAGAAGGAACGTGTCGCTGCCCGAAAGCGACAATCTATAAGGCGAATACTAGTAAAACCTAAGCAGAATAAACCGACGTTGAAGTGCTATTGCTTGTAGTTGAGCGGCACTCACTGTTTACTTCGATACTCTCGAGTTCAGGCTATTTAAAAATGGCAACT
GACCCCAAAGCCTCTTCTGTACTCGACAAAGATAAGTTTATTGGTACGGTAGAGCAGGAACTGGAGCACAAAGTTGAGCTTTTCAATAAGTGTCTAGTCTCCCTTTTTTTAACTACTTGATTTGACTATATGTTGACAGTTGGCCTGCTTTTCACCACCTTTGATCTCTCATCAGGCTAAGTATTGACAGATTTTATCAA
TGGTCACTCAAGTTTGCTATGCGAAATGCATTCCAAGTAGATATAAAGAAGGTGAATTGAACATAGGAGAATCCACTTGTGTTGATCGCTGTGTTGCCAAATACTCACAGGTTACTGCTATTGTAGGGCAACTTCTTGGTTCGGGCAGGCCACATATCTAAATTCAACTTGCAGTCAAATGTCTTGGGCAATTGATAATT
TGGGAGATGGAAACTTTCAATTTTGATCACGAGTGATATTATgtgtgtagtttgattcttcatttctgacggactaaaaatatctgccttgtaccgtttttgaaccataatggaatgcatatgcggttttattattgctttccaaaaggttacttgaagttcttctcatcaacatatttttactctattttgggacagGA
ACTTGTGACAGATACCTTGAGATGCATCTTGTCATGTATGTTAGCTAACTTAGCTTATATTTTAAATTTCAATAAGCTTTGTCCAATGCATGTTGATTAAATGGTAAGTTGGGGGCACTTGCCGCGAGGAGGCCCACTTTCCAATCTTTTGGATATTTTTTGTCCACCAATCTGAACATGTTATTGTGTTTTATTTGTAC
GCAGTGGTGCCAAGCTAGTATGGTAAATAAAACTTGAAAGGAAAAAACTCA