sp|Q949U4|OFT16_ARATH ----> O-fucosyltransferase 16

Intron 1 GTTGTTGAAC ... TCTATTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	78.76	12	43	46
A2	69.23	12	21	33
A3	87.5	4	30	26
A4	91.89	3	42	26
A5	77.78	2	7	7
A6	90.7	4	50	28
A7	84.98	16	96	85
A8	85.39	13	92	60
A9	84.91	12	70	65
A10	91.3	6	70	56

>TRINITY_DN115429_c0_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

TTCCCGTGCTACTAAAAAGACATAAATGGGCCAAAAGTTAGTTGACAAAATGAAGAAGAGGAGCAGGCGTTTCCTTGCTCTCCACTTAAGGTTTGAGCCTGACATGCTTGCATTTTCTGGATGTTACTATGGTGGGGGAGACAAGGAGAGAAGGGAGTTAGGTGCCATTCGTAAACGGTGGAAAACCTTACATATAAGCA
GTCCAGACAAGGAGCGCAGACATGGGAAATGCCCTCTCACTCCTCAAGAAGTGGGACTGATGCTGAGAGCATTGGGTTTTGGAAGTGATTTGCACCTCTATGTTGCCTCAGGGGAAGTGTATGGAGGAGAAAAGACATTAGCACCTTTGAAAGCTCTGTTCCCAAACTTCTACACTAAAGATACATTGGCAAGTAAGGAG
GAGCTAGAGCCATTCTCATCATACTCCTCGCGTATGGCTGCTCTTGATTATATTGTTTGTGATCAAAGTGATGTATTTGTGACGAATAATAATGGCAACATGGCCAGAATGTTGGCTGGACGAAGGCGGTACTTTGGACACAAGCCTACCATCCGCCCCAATGCCAAAAAGCTGAATTCTTTATTTTTGAATCGACTTAA
CATGACTTGGGACACCTTTGCATTTAAGGTGCGTGCCTGCCAAAAAGGCTTCATGGGAGATCCCAATGAAGTCAGGCCTGGAAGAGGGGAATTTCACGAATATCCCTTTGCTTGTATTTGTGAACATCCTGATGCCAAGGAAAAGATTGAAGCAATCCTCCAACATCAATCCAAGTCCAAGTCAAAAAATGTTGGAGATC
TCCCAATTCAAAATGTGGAATCACACACAGAAGATGAGTCAGTCGTTGATGATACTGACTGGCTTGAAAAGGACGAGTTTGATGACAATTTACAAATCCAACAACGAGCAGGACATGAAGATTACAATCATTTTATTAAGATAGATGAACCTGAATTGGAGGAGATGTTATCAGACTAGCCAAACTGGGGGTTATTTTCT
AAATCAAGAATTTCTTCCTCTGGCATGTCAGTTCACAAAGTGAGATGTTTGCCAATTTAATAATCCCCTCAAAATCTAAGAAGGGTCCTATCAAGGTTGTATTTATGCTATCATTGTGGATAAGCTGCTGCAACAGCCTGGATTTTATTCCCTGTAGGCTCTTGACAGCTTGTGTTGAAAGTCTAAAGAATGCAAGGATA
TTCATTATAGTCAGCATTATTTTCTTTAATGTGGCATTGTATTTTTGACCGAGCATGTCTTGTTAATCCCAATTTTCTTCTCTATCTGGTGTTTTAAGGAGGACAGAACAGATACTTGCATA

>TRINITY_DN115429_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AAGAATATGACAAAATATAAGGAGAAACACCTTGAGATGGCTGAATACATGTGGATATTAATTATAAAGCAAGTGGATATTATTGTACAGCAATATCAAGAAAACCCAACACTTCTGTTCCACTAAGTTTGGAATACCATGTCGTCCAAATCGTATTGGTATTCATCCATTCCAGCATGAACATGTCCCTTGTGATTGAC
GGGTCTTCACATTGGAGCACTATTTTTAGCAGGCCTTATTCAGTGCAACAACCAACGATTAGGGCCTCCCCCTCTTGCCCTTCAAAGGCTCATATCTCTGCCCCACTTTTCATGGATTTCAACCAGGAAGGGGTTGGATCCACATTGCTTTTTCCCAAGACTTTCGGTTTTTTTAGGCGTTTTTGCTGGGGCGTGAGAAA
CCAGGTAGAATGATTTGGCAATCAAGGGCTATCTATCTCACACCCACTATGCTACAATGCAATTTATTAATAGACATTTGACTTGGATCGGGCCATGGACTTGGAAGCATGGGCGATTATCGAATGTTTGAACAAAAATATGAATAATAATGGCGGTGCAAAGACAGAAGAACCAAATGCGGATACTGTTAATCCCGCCA
ACTCCTACTCTCTCTGTCGTTTGCGGATCGATCCTCCTGGCGTTAACATTCGTGTCGATTCTGATAGGACCTCTGATTGATCTCCGACACTTTCCAAACCATTCAGGGCCTCCCCCCGTTCCCATAAACCTGGCAGGGGAGACGAGAAATCCAAATGCTTCGAAATTGAGACTAAGTGAACTGGATGATGTCCCGACTCA
AGGTGACCGTTCAATTGCTGATATTTGGGCTTCAAGGTTCTCTGAGTTTTACTATGGTTGCAGCGAACCTAGCCGTCGTTTCACATCTGCTGTACAGGATAGTCATTCCAAGCGCTACTTAATGATTGCGGCCAGTGGAGGACTAAATCAGCAAAGGACAGGAATAATAGATGCAGTAGTTGTTGCTCGGATGCTGAATG
CTACTTTGGTTGTTCCAAAATTGGATCAGAAATCCTTTTGGAAAGACAAAAGCAACTTTGGTGACATTTTTGATGTTGATTGGTTTATATCCTCACTCTCAAAGGACGTTGTAATTGTCAAAGAGCTGCCTGAGAAGTTTCAAAAGGGGCTGGGGAGGTCACATACCATGCGTGTTCCAAGGAAATGTACTCAACATTGC
TATGAAAACCGAGTACTTCCCGTGCTACTAAAAAGACATgttgttgaactgactaagtttgactataggctggcgaataagttggacactgatttacaaaaattgcgttgtaaagtcaactatcattcattgaaatttaccaattctatttcagAAATGGGCCAAAAGTTAGTTGACAAAATGAAGAAGAGGAGCAGGCG
TTTCCTTGCTCTCCACTTAAGGTTTGAGCCTGACATGCTTGCATTTTCTGGATGTTACTATGGTGGGGGAGACAAGGAGAGAAGGGAGTTAGGTGCCATTCGTAAACGGTGGAAAACCTTACATATAAGCAGTCCAGACAAGGAGCGCAGACATGGGAAATGCCCTCTCACTCCTCAAGAAGTGGGACTGATGCTGAGAG
CATTGGGTTTTGGAAGTGATTTGCACCTCTATGTTGCCTCAGGGGAAGTGTATGGAGGAGAAAAGACATTAGCACCTTTGAAAGCTCTGTTCCCAAACTTCTACACTAAAGATACATTGGCAAGTAAGGAGGAGCTAGAGCCATTCTCATCATACTCCTCGCGTATGGCTGCTCTTGATTATATTGTTTGTGATCAAAGT
GATGTATTTGTGACGAATAATAATGGCAACATGGCCAGAATGTTGGCTGGACGAAGGCGGTACTTTGGACACAAGCCTACCATCCGCCCCAATGCCAAAAAGCTGAATTCTTTATTTTTGAATCGACTTAACATGACTTGGGACACCTTTGCATTTAAGGTGCGTGCCTGCCAAAAAGGCTTCATGGGAGATCCCAATGA
AGTCAGGCCTGGAAGAGGGGAATTTCACGAATATCCCTTTGCTTGTATTTGTGAACATCCTGATGCCAAGGAAAAGATTGAAGCAATCCTCCAACATCAATCCAAGTCCAAGTCAAAAAATGTTGGAGATCTCCCAATTCAAAATGTGGAATCACACACAGAAGATGAGTCAGTCGTTGATGATACTGACTGGCTTGAAA
AGGACGAGTTTGATGACAATTTACAAATCCAACAACGAGCAGGACATGAAGATTACAATCATTTTATTAAGATAGATGAACCTGAATTGGAGGAGATGTTATCAGACTAGCCAAACTGGGGGTTATTTTCTAAATCAAGAATTTCTTCCTCTGGCATGTCAGTTCACAAAGTGAGATGTTTGCCAATTTAATAATCCCCT
CAAAATCTAAGAAGGGTCCTATCAAGGTTGTATTTATGCTATCATTGTGGATAAGCTGCTGCAACAGCCTGGATTTTATTCCCTGTAGGCTCTTGACAGCTTGTGTTGAAAGTCTAAAGAATGCAAGGATATTCATTATAGTCAGCATTATTTTCTTTAATGTGGCATTGTATTTTTGACCGAGCATGTCTTGTTAATCC
CAATTTTCTTCTCTATCTGGTGTTTTAAGGAGGACAGAACAGATACTTGCATA

Intron 2 GTAAAATGCT ... AGATTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	14.71	29	5	5
A2	23.68	29	4	14
A3	25	18	6	6
A4	19.15	19	4	5
A5	17.65	7	2	1
A6	21.31	24	0	13
A7	17.5	66	15	13
A8	17.43	45	8	11
A9	20.3	53	16	11
A10	18.88	58	20	7

>TRINITY_DN33526_c0_g1_i3 from sample A9 / Example spliced isoform

TGTGGATATTAATTATAAAGCAAGTGGATATTATTGTACAGCAATATCAAGAAAACCCAACACTTCTGTTCCACTAAGTTTGGAATACCATGTCGTCCAAATCGTATTGGTATTCATCCATTCCAGCATGAACATGTCCCTTGTGATTGACGGGTCTTCACATTGGAGCACTATTTTTAGCAGGCCTTATTCAGTGCAAC
AACCAACGATTAGGGCCTCCCCCTCTTGCCCTTCAAAGGCTCATATCTCTGCCCCACTTTTCATGGATTTCAACCAGGAAGGGGTTGGATCCACATTGCTTTTTCCCAAGACTTTCGGTTTTTTTAGGCGTTTTTGCTGGGGCGTGAGAAACCAGGTAGAATGATTTGGCAATCAAGGGCTATCTATCTCACACCCACTA
TGCTACAATGCAATTTATTAATAGACATTTGACTTGGATCGGGCCATGGACTTGGAAGCATGGGCGATTATCGAATGTTTGAACAAAAATATGAATAATAATGGCGGTGCAAAGACAGAAGAACCAAATGCGGATACTGTTAATCCCGCCAACTCCTACTCTCTCTGTCGTTTGCGGATCGATCCTCCTGGCGTTAACAT
TCGTGTCGATTCTGATAGGACCTCTGATTGATCTCCGACACTTTCCAAACCATTCAGGGCCTCCCCCCGTTCCCATAAACCTGGCAGGGGAGACGAGAAATCCAAATGCTTCGAAATTGAGACTAAGTGAACTGGATGATGTCCCGACTCAAGGTGACCGTTCAATTGCTGATATTTGGGCTTCAAGGTTCTCTGAGTTT
TACTATGGTTGCAGCGAACCTAGCCGTCGTTTCACATCTGCTGTACAGGATAGTCATTCCAAGCGCTACTTAATGATTGCGGCCAGTGGAGGACTAAATCAGCAAAGGACAGGAATAATAGATGCAGTAGTTGTTGCTCGGATGCTGAATGCTACTTTGGTTGTTCCAAAATTGGATCAGAAATCCTTTTGGAAAGACAA
AAGCAACTTTGGTGACATTTTTGATGTTGATTGGTTTATATCCTCACTCTCAAAGGACGTTGTAATTGTCAAAGAGCTGCCTGAGAAGTTTCAAAAGGGGCTGGGGAGGTCACATACCATGCGTGTTCCAAGGAAATGTACTCAACATTGCTATGAAAACCGAGTACTTCCCGTGCTACTAAAAAGACATGTTGTTGAAC
TGACTAAGTTTGACTATAGGCTGGCGAATAAGTTGGACACTGATTTACAAAAATTGCGTTGTAAAGTCAACTATCATTCATTGAAATTTACCAATTCTATTTCAGAAATGGGCCAAAAGTTAGTTGACAAAATGAAGAAGAGGAGCAGGCGTTTCCTTGCTCTCCACTTAAGGTTTGAGCCTGACATGCTTGCATTTTCT
GGATGTTACTATGGTGGGGGAGACAAGGAGAGAAGGGAGTTAGGTGCCATTCGTAAACGGTGGAAAACCTTACATATAAGCAGTCCAGACAAGGAGCGCAGACATGGGAAATGCCCTCTCACTCCTCAAGAAGTGGGACTGATGCTGAGAGCATTGGGTTTTGGAAGTGATTTGCACCTCTATGTTGCCTCAGGGGAAGT
GTATGGAGGAGAAAAGACATTAGCACCTTTGAAAGCTCTGTTCCCAAACTTCTACACTAAAGATACATTGGCAAGTAAGGAGGAGCTAGAGCCATTCTCATCATACTCCTCGCGTATGGCTGCTCTTGATTATATTGTTTGTGATCAAAGTGATGTATTTGTGACGAATAATAATGGCAACATGGCCAGAATGTTGGCTG
GACGAAGGCGGTACTTTGGACACAAGCCTACCATCCGCCCCAATGCCAAAAAGCTGAATTCTTTATTTTTGAATCGACTTAACATGACTTGGGACACCTTTGCATTTAAGGTGCGTGCCTGCCAAAAAGGCTTCATGGGAGATCCCAATGAAGTCAGGCCTGGAAGAGGGGAATTTCACGAATATCCCTTTGCTTGTATT
TGTGAACATCCTGATGCCAAGGAAAAGATTGAAGCAATCCTCCAACATCAATCCAAGTCCAAGTCAAAAAATGTTGGAGATCTCCCAATTCAAAATGTGGAATCACACACAGAAGATGAGTCAGTCGTTGATGATACTGACTGGCTTGAAAAGGACGAGTTTGATGACAATTTACAAATCCAACAACGAGCAGGACATGA
AGATTACAATCATTTTATTAAGATAGATGAACCTGAATTGGAGGAGATGTTATCAGACTAGCCAAACTGGGGGTTATTTTCTAAATCAAGAATTTCTTCCTCTGGCATGTCAGTTCACAAAGTGAGATGTTTGCCAATTTAATAATCCCCTCAAAATCTAAGAAGGGTCCTATCAAGGTTGTATTTATGCTATCATTGTG
GATAAGCTGCTGCAACAGCCTGGATTTTATTCCCTGTAGGCTCTTGACAGCTTGTGTTGAAAGTCTAAAGAATGCAAGGATATTCATTATAGTCAGCATTATTTTCTTTAATGTGGCATTGTATTTTTGACCGAGCATGTCTTGTTAATCCCAATTTTCTTCTCTATCTGGTGTTTTAAGGAGGACAGAACAGATACTTG
CATAGAAGAATGTGCAGGTAAATTTTATATTGTTCAAAGAGGGATTTTATTTTATGGATAAGTTTCGTGGAATGGAGCTTACCTTGTATTGATTGGTTCCATGTAATACTACAGTACTATTAAAATGTAGTACTATAGTGAATAAATATATGATCAGGTGGTTATCATTCACACTGTCATTGGGGGTACCAATATTTTTA
ATTATACTCCCACACGTGCTCAATTGTACAGTGTTCTTTTGGTGCTTGG

>TRINITY_DN33526_c0_g1_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:

TGTGGATATTAATTATAAAGCAAGTGGATATTATTGTACAGCAATATCAAGAAAACCCAACACTTCTGTTCCACTAAGTTTGGAATACCATGTCGTCCAAATCGTATTGGTATTCATCCATTCCAGCATGAACATGTCCCTTGTGATTGACGGGTCTTCACATTGGAGCACTATTTTTAGCAGGCCTTATTCAGTGCAAC
AACCAACGATTAGGGCCTCCCCCTCTTGCCCTTCAAAGGCTCATATCTCTGCCCCACTTTTCATGGATTTCAACCAGGAAGGGGTTGGATCCACATTGCTTTTTCCCAAGACTTTCGGTTTTTTTAGGCGTTTTTGCTGGGGCGTGAGAAACCAGGTAGAATGATTTGGCAATCAAGGGCTATCTATCTCACACCCACTA
TGCTACAATGCAATTTATTAATAGACATTTGACTTGGATCGGGCCATGGACTTGGAAGCATGGGCGATTATCGAATGTTTGAACAAAAATATGAATAATAATGGCGGTGCAAAGACAGAAGAACCAAATGCGGATACTGTTAATCCCGCCAACTCCTACTCTCTCTGTCGTTTGCGGATCGATCCTCCTGGCGTTAACAT
TCGTGTCGATTCTGATAGGACCTCTGATTGATCTCCGACACTTTCCAAACCATTCAGGGCCTCCCCCCGTTCCCATAAACCTGGCAGGGGAGACGAGAAATCCAAATGCTTCGAAATTGAGACTAAGTGAACTGGATGATGTCCCGACTCAAGGTGACCGTTCAATTGCTGATATTTGGGCTTCAAGGTTCTCTGAGTTT
TACTATGGTTGCAGCGAACCTAGCCGTCGTTTCACATCTGCTGTACAGGATAGTCATTCCAAGCGCTACTTAATGATTGCGGCCAGTGGAGGACTAAATCAGCAAAGGACAGGAATAATAGATGCAGTAGTTGTTGCTCGGATGCTGAATGCTACTTTGGTTGTTCCAAAATTGGATCAGAAATCCTTTTGGAAAGACAA
AAGCAACTTTGGTGACATTTTTGATGTTGATTGGTTTATATCCTCACTCTCAAAGGACGTTGTAATTGTCAAAGAGCTGCCTGAGAAGTTTCAAAAGGGGCTGGGGAGGTCACATACCATGCGTGTTCCAAGGAAATGTACTCAACATTGCTATGAAAACCGAGTACTTCCCGTGCTACTAAAAAGACATGTTGTTGAAC
TGACTAAGTTTGACTATAGGCTGGCGAATAAGTTGGACACTGATTTACAAAAATTGCGTTGTAAAGTCAACTATCATTCATTGAAATTTACCAATTCTATTTCAGAAATGGGCCAAAAGTTAGTTGACAAAATGAAGAAGAGGAGCAGGCGTTTCCTTGCTCTCCACTTAAGgtaaaatgcttttgagttacaaggtaaa
agaattgttttactgtagtcaagaatgtttggtctagctttatatgctctttgttttgagtttcagttgctgcattaccttgattggtgattgatttatccagcataggttatttgctgtgaaaaattgatatttctgcaattctggaagaggagtacaaatatatgcatggtgctaagaaatgaaagatttgcagGTTT
GAGCCTGACATGCTTGCATTTTCTGGATGTTACTATGGTGGGGGAGACAAGGAGAGAAGGGAGTTAGGTGCCATTCGTAAACGGTGGAAAACCTTACATATAAGCAGTCCAGACAAGGAGCGCAGACATGGGAAATGCCCTCTCACTCCTCAAGAAGTGGGACTGATGCTGAGAGCATTGGGTTTTGGAAGTGATTTGCA
CCTCTATGTTGCCTCAGGGGAAGTGTATGGAGGAGAAAAGACATTAGCACCTTTGAAAGCTCTGTTCCCAAACTTCTACACTAAAGATACATTGGCAAGTAAGGAGGAGCTAGAGCCATTCTCATCATACTCCTCGCGTATGGCTGCTCTTGATTATATTGTTTGTGATCAAAGTGATGTATTTGTGACGAATAATAATG
GCAACATGGCCAGAATGTTGGCTGGACGAAGGCGGTACTTTGGACACAAGCCTACCATCCGCCCCAATGCCAAAAAGCTGAATTCTTTATTTTTGAATCGACTTAACATGACTTGGGACACCTTTGCATTTAAGGTGCGTGCCTGCCAAAAAGGCTTCATGGGAGATCCCAATGAAGTCAGGCCTGGAAGAGGGGAATTT
CACGAATATCCCTTTGCTTGTATTTGTGAACATCCTGATGCCAAGGAAAAGATTGAAGCAATCCTCCAACATCAATCCAAGTCCAAGTCAAAAAATGTTGGAGATCTCCCAATTCAAAATGTGGAATCACACACAGAAGATGAGTCAGTCGTTGATGATACTGACTGGCTTGAAAAGGACGAGTTTGATGACAATTTACA
AATCCAACAACGAGCAGGACATGAAGATTACAATCATTTTATTAAGATAGATGAACCTGAATTGGAGGAGATGTTATCAGACTAGCCAAACTGGGGGTTATTTTCTAAATCAAGAATTTCTTCCTCTGGCATGTCAGTTCACAAAGTGAGATGTTTGCCAATTTAATAATCCCCTCAAAATCTAAGAAGGGTCCTATCAA
GGTTGTATTTATGCTATCATTGTGGATAAGCTGCTGCAACAGCCTGGATTTTATTCCCTGTAGGCTCTTGACAGCTTGTGTTGAAAGTCTAAAGAATGCAAGGATATTCATTATAGTCAGCATTATTTTCTTTAATGTGGCATTGTATTTTTGACCGAGCATGTCTTGTTAATCCCAATTTTCTTCTCTATCTGGTGTTT
TAAGGAGGACAGAACAGATACTTGCATAGAAGAATGTGCAGGTAAATTTTATATTGTTCAAAGAGGGATTTTATTTTATGGATAAGTTTCGTGGAATGGAGCTTACCTTGTATTGATTGGTTCCATGTAATACTACAGTACTATTAAAATGTAGTACTATAGTGAATAAATATATGATCAGGTGGTTATCATTCACACTG
TCATTGGGGGTACCAATATTTTTAATTATACTCCCACACGTGCTCAATTGTACAGTGTTCTTTTGGTGCTTGG

Intron 3 GTAAGGTGCA ... GTTTAAGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	20.63	34.8	3	9
A2	28.78	24.8	7	10
A3	28.84	39.5	3	16
A4	18.32	31.3	8.3	7
A5	25.89	5.8	3.5	2
A6	21.52	73	6.8	20
A7	22.96	110.8	13.8	33
A8	19.73	89.5	5.5	22
A9	25.2	121.8	8.3	41
A10	18.32	111.5	5.6	25

>TRINITY_DN107669_c2_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoform

AGCAATCTCAAGAAAACCCAACACTTCTGTTCCACTAAGTTTGGAATACCATGTCGTCCAAATCGTATTGGTATTCATCCATTCCAGCATGAACATGTCCCTTGTGATTGACGGGTCTTCACATTGGAGCACTATTTTTAGCAGGCCTTATTCAGTGCAACAACCAACGATTAGGGCCTCCCCCTCTTGCCCTTCAAAGG
CTCATATCTCTGCCCCACTTTTCATGGATTTCAACCAGGAAGGGGTTGGATCCACATTGCTTTTTCCCAAGACTTTCGGTTTTTTTAGGCGTTTTTGCTGGGGCGTGAGAAACCAGGTAGAATGATTTGGCAATCAAGGGCTATCTATCTCACACCCACTATGCTACAATGCAATTTATTAATAGACATTTGACTTGGAT
CGGGCCATGGACTTGGAAGCATGGGCGATTATCGAATGTTTGAACAAAAATATGAATAATAATGGCGGTGCAAAGACAGAAGAACCAAATGCGGATACTGTTAATCCCGCCAACTCCTACTCTCTCTGTCGTTTGCGGATCGATCCTCCTGGCGTTAACATTCGTGTCGATTCTGATAGGACCTCTGATTGATCTCCGAC
ACTTTCCAAACCATTCAGGGCCTCCCCCCGTTCCCATAAACCTGGCAGGGGAGACGAGAAATCCAAATGCTTCGAAATTGAGACTAAGTGAACTGGATGATGTCCCGACTCAAGGTGACCGTTCAATTGCTGATATTTGGGCTTCAAGGTTCTCTGAGTTTTACTATGGTTGCAGCGAACCTAGCCGTCGTTTCACATCT
GCTGTACAGGATAGTCATTCCAAGCGCTACTTAATGATTGCGGCCAGTGGAGGACTAAATCAGCAAAGGACAGGAATAATAGATGCAGTAGTTGTTGCTCGGATGCTGAATGCTACTTTGGTTGTTCCAAAATTGGATCAGAAATCCTTTTGGAAAGACAAAAGCAACTTTGGTGACATTTTTGATGTTGATTGGTTTAT
ATCCTCACTCTCAAAGGACGTTGTAATTGTCAAAGAGCTGCCTGAGAAGTTTCAAAAGGGGCTGGGGAGGTCACATACCATGCGTGTTCCAAGGAAATGTACTCAACATTGCTATGAAAACCGAGTACTTCCCGTGCTACTAAAAAGACATGTTGTTGAACTGACTAAGTTTGACTATAGGCTGGCGAATAAGTTGGACA
CTGATTTACAAAAATTGCGTTGTAAAGTCAACTATCATTCATTGAAATTTACCAATTCTATTTCAGAAATGGGCCAAAAGTTAGTTGACAAAATGAAGAAGAGGAGCAGGCGTTTCCTTGCTCTCCACTTAAGGTTTGAGCCTGACATGCTTGCATTTTCTGGATGTTACTATGGTGGGGGAGACAAGGAGAGAAGGGAG
TTAGGTGCCATTCGTAAACGGTGGAAAACCTTACATATAAGCAGTCCAGACAAGGAGCGCAGACATGGGAAATGCCCTCTCACTCCTCAAGAAGTGGGACTGATGCTGAGAGCATTGGGTTTTGGAAGTGATTTGCACCTCTATGTTGCCTCAGGGGAAGTGTATGGAGGAGAAAAGACATTAGCACCTTTGAAAGCTCT
GTTCCCAAACTTCTACACTAAAGATACATTGGCAAGTAAGGAGGAGCTAGAGCCATTCTCATCATACTCCTCGCGTATGGCTGCTCTTGATTATATTGTTTGTGATCAAAGTGATGTATTTGTGACGAATAATAATGGCAACATGGCCAGAATGTTGGCTGGACGAAGGCGGTACTTTGGACACAAGCCTACCATCCGCC
CCAATGCCAAAAAGCTGAATTCTTTATTTTTGAATCGACTTAACATGACTTGGGACACCTTTGCATTTAAGGTGCGTGCCTGCCAAAAAGGCTTCATGGGAGATCCCAATGAAGTCAGGCCTGGAAGAGGGGAATTTCACGAATATCCCTTTGCTTGTATTTGTGAACATCCTGATGCCAAGGAAAAGATTGAAGCAATC
CTCCAACATCAATCCAAGTCCAAGTCAAAAAATGTTGGAGATCTCCCAATTCAAAATGTGGAATCACACACAGAAGATGAGTCAGTCGTTGATGATACTGACTGGCTTGAAAAGGACGAGTTTGATGACAATTTACAAATCCAACAACGAGCAGGACATGAAGATTACAATCATTTTATTAAGATAGATGAACCTGAATT
GGAGGAGATGTTATCAGACTAGCCAAACTGGGGGTTATTTTCTAAATCAAGAATTTCTTCCTCTGGCATGTCAGTTCACAAAGTGAGATGTTTGCCAATTTAATAATCCCCTCAAAATCTAAGAAGGGTCCTATCAAGGTTGTATTTATGCTATCATTGTGGATAAGCTGCTGCAACAGCCTGGATTTTATTCCCTGTAG
GCTCTTGACAGCTTGTGTTGAAAGTCTAAAGAATGCAAGGATATTCATTATAGTCAGCATTATTTTCTTTAATGTGGCATTGTATTTTTGACCGAGCATGTCTTGTTAATCCCAATTTTCTTCTCTATCTGGTGTTTTAAGGAGGACAGAACAGATACTTGCATAGAAGAATGTGCAGGTAAATTTT

>TRINITY_DN107669_c2_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GGTGATTGATTTATCCAGCATAGGTTATTTGCTGTGAAAAATTGATATTTCTGCAATTCTGGAAGAGGAGTACAAATATATGCATGGTGCTAAGAAATGAAAGATTTGCAGGTTTGAGCCTGACATGCTTGCATTTTCTGGATGTTACTATGGTGGGGGAGACAAGGAGAGAAGGGAGTTAGGTGCCATTCGTAAACGGT
GGAAAACCTTACATgtaaggtgcagagttctatttttacctggtcgagagtaaagaacttgttatcatggaccattctctttattctacctgatttgctttaatctaaactttaaagcacagaccttttactactagttaaattatttgtttgtttaagcagATAAGCAGTCCAGACAAGGAGCGCAGACATGGGAAATG
CCCTCTCACTCCTCAAGAAGTGGGACTGATGCTGAGAGCATTGGGTTTTGGAAGTGATTTGCACCTCTATGTTGCCTCAGGGGAAGTGTATGGAGGAGAAAAGACATTAGCACCTTTGAAAGCTCTGTTCCCAAACTTCTACACTAAAGATACATTGGCAAGTAAGGAGGAGCTAGAGCCATTCTCATCATACTCCTCGC
GTATGGCTGCTCTTGATTATATTGTTTGTGATCAAAGTGATGTATTTGTGACGAATAATAATGGCAACATGGCCAGAATGTTGGCTGGACGAAGGCGGTACTTTGGACACAAGCCTACCATCCGCCCCAATGCCAAAAAGCTGAATTCTTTATTTTTGAATCGACTTAACATGACTTGGGACACCTTTGCATTTAAGGTG
CGTGCCTGCCAAAAAGGCTTCATGGGAGATCCCAATGAAGTCAGGCCTGGAAGAGGGGAATTTCACGAATATCCCTTTGCTTGTATTTGTGAACATCCTGATGCCAAGGAAAAGATTGAAGCAATCCTCCAACATCAATCCAAGTCCAAGTCAAAAAATGTTGGAGATCTCCCAATTCAAAATGTGGAATCACACACAGA
AGATGAGTCAGTCGTTGATGATACTGACTGGCTTGAAAAGGACGAGTTTGATGACAATTTACAAATCCAACAACGAGCAGGACATGAAGATTACAATCATTTTATTAAGATAGATGAACCTGAATTGGAGGAGATGTTATCAGACTAGCCAAACTGGGGGTTATTTTCTAAATCAAGAATTTCTTCCTCTGGCATGTCAG
TTCACAAAGTGAGATGTTTGCCAATTTAATAATCCCCTCAAAATCTAAGAAGGGTCCTATCAAGGTTGTATTTATGCTATCATTGTGGATAAGCTGCTGCAACAGCCTGGATTTTATTCCCTGTAGGCTCTTGACAGCTTGTGTTGAAAGTCTAAAGAATGCAAGGATATTCATTATAGTCAGCATTATTTTCTTTAATG
TGGCATTGTATTTTTGACCGAGCATGTCTTGTTAATCCCAATTTTCTTCTCTATCTGGTGTTTTAAGGAGGACAGAACAGATACTTGCATAGAAGAATGTGCAGGTAAATTTT

Intron 4 GTATAAATTT ... GTGATTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	36.78	32.7	19	9
A2	26.7	33	12	5.3
A3	23.85	38.3	12	5.3
A4	34.88	28	15	3.7
A5	31.82	15	7	6.3
A6	34.29	69	36	6.7
A7	26.8	128.3	47	15.7
A8	27.75	99	38	18
A9	27.34	101	38	13.3
A10	29.62	92.7	39	8

>TRINITY_DN115429_c0_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

TTCCCGTGCTACTAAAAAGACATAAATGGGCCAAAAGTTAGTTGACAAAATGAAGAAGAGGAGCAGGCGTTTCCTTGCTCTCCACTTAAGGTTTGAGCCTGACATGCTTGCATTTTCTGGATGTTACTATGGTGGGGGAGACAAGGAGAGAAGGGAGTTAGGTGCCATTCGTAAACGGTGGAAAACCTTACATATAAGCA
GTCCAGACAAGGAGCGCAGACATGGGAAATGCCCTCTCACTCCTCAAGAAGTGGGACTGATGCTGAGAGCATTGGGTTTTGGAAGTGATTTGCACCTCTATGTTGCCTCAGGGGAAGTGTATGGAGGAGAAAAGACATTAGCACCTTTGAAAGCTCTGTTCCCAAACTTCTACACTAAAGATACATTGGCAAGTAAGGAG
GAGCTAGAGCCATTCTCATCATACTCCTCGCGTATGGCTGCTCTTGATTATATTGTTTGTGATCAAAGTGATGTATTTGTGACGAATAATAATGGCAACATGGCCAGAATGTTGGCTGGACGAAGGCGGTACTTTGGACACAAGCCTACCATCCGCCCCAATGCCAAAAAGCTGAATTCTTTATTTTTGAATCGACTTAA
CATGACTTGGGACACCTTTGCATTTAAGGTGCGTGCCTGCCAAAAAGGCTTCATGGGAGATCCCAATGAAGTCAGGCCTGGAAGAGGGGAATTTCACGAATATCCCTTTGCTTGTATTTGTGAACATCCTGATGCCAAGGAAAAGATTGAAGCAATCCTCCAACATCAATCCAAGTCCAAGTCAAAAAATGTTGGAGATC
TCCCAATTCAAAATGTGGAATCACACACAGAAGATGAGTCAGTCGTTGATGATACTGACTGGCTTGAAAAGGACGAGTTTGATGACAATTTACAAATCCAACAACGAGCAGGACATGAAGATTACAATCATTTTATTAAGATAGATGAACCTGAATTGGAGGAGATGTTATCAGACTAGCCAAACTGGGGGTTATTTTCT
AAATCAAGAATTTCTTCCTCTGGCATGTCAGTTCACAAAGTGAGATGTTTGCCAATTTAATAATCCCCTCAAAATCTAAGAAGGGTCCTATCAAGGTTGTATTTATGCTATCATTGTGGATAAGCTGCTGCAACAGCCTGGATTTTATTCCCTGTAGGCTCTTGACAGCTTGTGTTGAAAGTCTAAAGAATGCAAGGATA
TTCATTATAGTCAGCATTATTTTCTTTAATGTGGCATTGTATTTTTGACCGAGCATGTCTTGTTAATCCCAATTTTCTTCTCTATCTGGTGTTTTAAGGAGGACAGAACAGATACTTGCATA

>TRINITY_DN115429_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AAGAATATGACAAAATATAAGGAGAAACACCTTGAGATGGCTGAATACATGTGGATATTAATTATAAAGCAAGTGGATATTATTGTACAGCAATATCAAGAAAACCCAACACTTCTGTTCCACTAAGTTTGGAATACCATGTCGTCCAAATCGTATTGGTATTCATCCATTCCAGCATGAACATGTCCCTTGTGATTGAC
GGGTCTTCACATTGGAGCACTATTTTTAGCAGGCCTTATTCAGTGCAACAACCAACGATTAGGGCCTCCCCCTCTTGCCCTTCAAAGGCTCATATCTCTGCCCCACTTTTCATGGATTTCAACCAGGAAGGGGTTGGATCCACATTGCTTTTTCCCAAGACTTTCGGTTTTTTTAGGCGTTTTTGCTGGGGCGTGAGAAA
CCAGGTAGAATGATTTGGCAATCAAGGGCTATCTATCTCACACCCACTATGCTACAATGCAATTTATTAATAGACATTTGACTTGGATCGGGCCATGGACTTGGAAGCATGGGCGATTATCGAATGTTTGAACAAAAATATGAATAATAATGGCGGTGCAAAGACAGAAGAACCAAATGCGGATACTGTTAATCCCGCCA
ACTCCTACTCTCTCTGTCGTTTGCGGATCGATCCTCCTGGCGTTAACATTCGTGTCGATTCTGATAGGACCTCTGATTGATCTCCGACACTTTCCAAACCATTCAGGGCCTCCCCCCGTTCCCATAAACCTGGCAGGGGAGACGAGAAATCCAAATGCTTCGAAATTGAGACTAAGTGAACTGGATGATGTCCCGACTCA
AGGTGACCGTTCAATTGCTGATATTTGGGCTTCAAGGTTCTCTGAGTTTTACTATGGTTGCAGCGAACCTAGCCGTCGTTTCACATCTGCTGTACAGGATAGTCATTCCAAGCGCTACTTAATGATTGCGGCCAGTGGAGGACTAAATCAGCAAAGGACAGGAATAATAGATGCAGTAGTTGTTGCTCGGATGCTGAATG
CTACTTTGGTTGTTCCAAAATTGGATCAGAAATCCTTTTGGAAAGACAAAAGCAACTTTGGTGACATTTTTGATGTTGATTGGTTTATATCCTCACTCTCAAAGGACGTTGTAATTGTCAAAGAGCTGCCTGAGAAGTTTCAAAAGGGGCTGGGGAGGTCACATACCATGCGTGTTCCAAGGAAATGTACTCAACATTGC
TATGAAAACCGAGTACTTCCCGTGCTACTAAAAAGACATGTTGTTGAACTGACTAAGTTTGACTATAGGCTGGCGAATAAGTTGGACACTGATTTACAAAAATTGCGTTGTAAAGTCAACTATCATTCATTGAAATTTACCAATTCTATTTCAGAAATGGGCCAAAAGTTAGTTGACAAAATGAAGAAGAGGAGCAGGCG
TTTCCTTGCTCTCCACTTAAGGTTTGAGCCTGACATGCTTGCATTTTCTGGATGTTACTATGGTGGGGGAGACAAGGAGAGAAGGGAGTTAGGTGCCATTCGTAAACGGTGGAAAACCTTACATATAAGCAGTCCAGACAAGGAGCGCAGACATGGGAAATGCCCTCTCACTCCTCAAGAAGTGGGACTGATGCTGAGAG
CATTGGGTTTTGGAAGTGATTTGCACCTCTATGTTGCCTCAGGGGAAGTGTATGGAGGAGAAAAGACATTAGCACCTTTGAAAGCTCTGTTCCCAAACTTCTACACTAAAGATACATTGGCAAGTAAGGAGGAGCTAGAGCCATTCTCATCATACTCCTCGCGTATGGCTGCTCTTGATTATATTGTTTGTGATCAAAGT
GATGTATTTGTGACGAATAATAATGGCAACATGGCCAGAATGTTGGCTGGACGAAGgtataaattttgcttttggcagaaaataaaccacgtcttacccttaaaatttgaatttatatatgtaaaactgaaaagctcactgtgtgattgcagGCGGTACTTTGGACACAAGCCTACCATCCGCCCCAATGCCAAAAAGCT
GAATTCTTTATTTTTGAATCGACTTAACATGACTTGGGACACCTTTGCATTTAAGGTGCGTGCCTGCCAAAAAGGCTTCATGGGAGATCCCAATGAAGTCAGGCCTGGAAGAGGGGAATTTCACGAATATCCCTTTGCTTGTATTTGTGAACATCCTGATGCCAAGGAAAAGATTGAAGCAATCCTCCAACATCAATCCA
AGTCCAAGTCAAAAAATGTTGGAGATCTCCCAATTCAAAATGTGGAATCACACACAGAAGATGAGTCAGTCGTTGATGATACTGACTGGCTTGAAAAGGACGAGTTTGATGACAATTTACAAATCCAACAACGAGCAGGACATGAAGATTACAATCATTTTATTAAGATAGATGAACCTGAATTGGAGGAGATGTTATCA
GACTAGCCAAACTGGGGGTTATTTTCTAAATCAAGAATTTCTTCCTCTGGCATGTCAGTTCACAAAGTGAGATGTTTGCCAATTTAATAATCCCCTCAAAATCTAAGAAGGGTCCTATCAAGGTTGTATTTATGCTATCATTGTGGATAAGCTGCTGCAACAGCCTGGATTTTATTCCCTGTAGGCTCTTGACAGCTTGT
GTTGAAAGTCTAAAGAATGCAAGGATATTCATTATAGTCAGCATTATTTTCTTTAATGTGGCATTGTATTTTTGACCGAGCATGTCTTGTTAATCCCAATTTTCTTCTCTATCTGGTGTTTTAAGGAGGACAGAACAGATACTTGCATA

Intron 5 GTGGGCATTT ... TGATCCACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
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A9	15	68	0	12
A10	18.48	75	1	17

>TRINITY_DN105755_c0_g2_i1 from sample A3 / Example spliced isoform

CTAAATTTAAAATGTTGAATGAATCTAAAGACAGACTAAAGAAGTTGTAGGAATTGAATGGGATAATGTCAATGACCACAGATCCTATGCACATGCCAGAATTTCGTTATGTGACATAATAAATTGAATTATGACCAATTTATTGCATCACAGACTCAAGGTGACCGTTCAATTGCTGATATTTGGGCTTCAAGGTTCTC
TGAGTTTTACTATGGTTGCAGCGAACCTAGCCGTCGTTTCACATCTGCTGTACAGGATAGTCATTCCAAGCGCTACTTAATGATTGCGGCCAGTGGAGGACTAAATCAGCAAAGGACAGGAATAATAGATGCAGTAGTTGTTGCTCGGATGCTGAATGCTACTTTGGTTGTTCCAAAATTGGATCAGAAATCCTTTTGGA
AAGACAAAAGCAACTTTGGTGACATTTTTGATGTTGATTGGTTTATATCCTCACTCTCAAAGGACGTTGTAATTGTCAAAGAGCTGCCTGAGAAGTTTCAAAAGGGGCTGGGGAGGTCACATACCATGCGTGTTCCAAGGAAATGTACTCAACATTGCTATGAAAACCGAGTACTTCCCGTGCTACTAAAAAGACATGTT
GTTGAACTGACTAAGTTTGACTATAGGCTGGCGAATAAGTTGGACACTGATTTACAAAAATTGCGTTGTAAAGTCAACTATCATTCATTGAAATTTACCAATTCTATTTCAGAAATGGGCCAAAAGTTAGTTGACAAAATGAAGAAGAGGAGCAGGCGTTTCCTTGCTCTCCACTTAAGGTTTGAGCCTGACATGCTTGC
ATTTTCTGGATGTTACTATGGTGGGGGAGACAAGGAGAGAAGGGAGTTAGGTGCCATTCGTAAACGGTGGAAAACCTTACATATAAGCAGTCCAGACAAGGAGCGCAGACATGGGAAATGCCCTCTCACTCCTCAAGAAGTGGGACTGATGCTGAGAGCATTGGGTTTTGGAAGTGATTTGCACCTCTATGTTGCCTCAG
GGGAAGTGTATGGAGGAGAAAAGACATTAGCACCTTTGAAAGCTCTGTTCCCAAACTTCTACACTAAAGATACATTGGCAAGTAAGGAGGAGCTAGAGCCATTCTCATCATACTCCTCGCGTATGGCTGCTCTTGATTATATTGTTTGTGATCAAAGTGATGTATTTGTGACGAATAATAATGGCAACATGGCCAGAATG
TTGGCTGGACGAAGGCGGTACTTTGGACACAAGCCTACCATCCGCCCCAATGCCAAAAAGCTGAATTCTTTATTTTTGAATCGACTTAACATGACTTGGGACACCTTTGCATTTAAGGTGCGTGCCTGCCAAAAAGGCTTCATGGGAGATCCCAATGAAGTCAGGCCTGGAAGAGGGGAATTTCACGAATATCCCTTTGC
TTGTATTTGTGAACATCCTGATGCCAAGGAAAAGATTGAAGCAATCCTCCAACATCAATCCAAGTCCAAGTCAAAAAATGTTGGAGATCTCCCAATTCAAAATGTGGAATCACACACAGAAGATGAGTCAGTCGTTGATGATACTGACTGGCTTGAAAAGGACGAGTTTGATGACAATTTACAAATCCAACAACGAGCAG
GACATGAAGATTACAATCATTTTATTAAGATAGATGAACCTGAATTGGAGGAGATGTTATCAGACTAGCCAAACTGGGGGTTATTTTCTAAATCAAGAATTTCTTCCTCTGGCATGTCAGTTCACAAAGTGAGATGTTTGCCAATTTAATAATCCCCTCAAAATCTAAGAAGGGTCCTATCAAGGTTGTATTTATGCTAT
CATTGTGGATAAGCTGCTGCAACAGCCTGGATTTTATTCCCTGTAGGCTCTTGACAGCTTGTGTTGAAAGTCTAAAGAATGCAAGGATATTCATTATAGTCAGCATTATTTTCTTTAATGTGGCATTGTATTTTTGACCGAGCATGTCTTGTTAATCCCAATTTTCTTCTCTATCTGGTGTTTTAAGGAGGACAGAACAG
ATACTTGCATAGAAGAATGTGCAGGTAAATTTTATATTGTTCAAAGAGGGATTTTATTTTATGGATAAGTTTCGTGGAATGGAGCTTACCTTGTATTGATTGGTTCCATGTAATACTACAGTACTATTAAAATGTAGTACTATAGTGAATAAATATATGATCAGGTGGTTATCATTCACACTGTCATTGGGGGTACCAAT
ATTTTTAATTATACTCCCACACGTGCTCAATTGTAC

>TRINITY_DN105755_c0_g2_i5 from sample A3 / Example unspliced isoform:

ATTTGAATTATGGACCTTTGGCTACTAAGTTTGGTCAATATACTATCATTTACTTAAGTGTTGATTTATGCTGACACACTGCCACAGATAATAGATGCAGTAGTTGTTGCTCGGATGCTGAATGCTACTTTGGTTGTTCCAAAATTGGATCAGAAATCCTTTTGGAAAGACAAAAGgtgggcattttgcatgttatatat
ttccaagctgtagattaatgagcatatttttctgatttttctgaactttattatccttgcttggtttcataatttgctaataataattgttgtcttgatccacagCAACTTTGGTGACATTTTTGATGTTGATTGGTTTATATCCTCACTCTCAAAGGACGTTGTAATTGTCAAAGAGCTGCCTGAGAAGTTTCAAAAGG
GGCTGGGGAGGTCACATACCATGCGTGTTCCAAGGAAATGTACTCAACATTGCTATGAAAACCGAGTACTTCCCGTGCTACTAAAAAGACATGTATGTATGTGGGATAAACTATATGAAGTTCTACAAGGGCCCTTTAAGTAGATTGATTGACACTGCCTACTTTTGTATGACAGTGGGCTCTTTTTCTTGTGTACGTCT
TACAGTCACTCACTTCCTAATGTCCAATTAAAAACTAAACCCTTCAAACAGGGAATGTGGATAAAATGACAAAAGGACAAAATGAGGTGCTGTGTTTTATTTTGATTGGGCCACATGTACCAGTATGGTGTATGTGCTGTTCCCCACTAGATTATTGGTATCATAATTTAGAGTGTAAGCTTTCTGAGTCTGTCAGAAAT
ATTTTAGGATTGAAATTTCTATTGTAATGTATGCTGCCCTGAAACGAAGTTTAATGCTTTGTTTTTTATGATTGCTTATTATGTATTAAATGGCAATGTGTATTATACTATTATGTATTATTGAGTAT

Intron 6 GTATGTATGT ... GTGGCTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	36.76	43	0	25
A2	36.36	21	0	12
A3	23.08	30	0	9
A4	23.64	42	0	13
A5	30	7	0	3
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A10	19.54	70	0	17

>TRINITY_DN33081_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform

CTAAGTTTGGAATACCATGTCGTCCAAATCGTATTGGTATTCATCCATTCCAGCATGAACATGTCCCTTGTGATTGACGGGTCTTCACATTGGAGCACTATTTTTAGCAGGCCTTATTCAGTGCAACAACCAACGATTAGGGCCTCCCCCTCTTGCCCTTCAAAGGCTCATATCTCTGCCCCACTTTTCATGGATTTCAA
CCAGGAAGGGGTTGGATCCACATTGCTTTTTCCCAAGACTTTCGGTTTTTTTAGGCGTTTTTGCTGGGGCGTGAGAAACCAGGTAGAATGATTTGGCAATCAAGGGCTATCTATCTCACACCCACTATGCTACAATGCAATTTATTAATAGACATTTGACTTGGATCGGGCCATGGACTTGGAAGCATGGGCGATTATCG
AATGTTTGAACAAAAATATGAATAATAATGGCGGTGCAAAGACAGAAGAACCAAATGCGGATACTGTTAATCCCGCCAACTCCTACTCTCTCTGTCGTTTGCGGATCGATCCTCCTGGCGTTAACATTCGTGTCGATTCTGATAGGACCTCTGATTGATCTCCGACACTTTCCAAACCATTCAGGGCCTCCCCCCGTTCC
CATAAACCTGGCAGGGGAGACGAGAAATCCAAATGCTTCGAAATTGAGACTAAGTGAACTGGATGATGTCCCGACTCAAGGTGACCGTTCAATTGCTGATATTTGGGCTTCAAGGTTCTCTGAGTTTTACTATGGTTGCAGCGAACCTAGCCGTCGTTTCACATCTGCTGTACAGGATAGTCATTCCAAGCGCTACTTAA
TGATTGCGGCCAGTGGAGGACTAAATCAGCAAAGGACAGGAATAATAGATGCAGTAGTTGTTGCTCGGATGCTGAATGCTACTTTGGTTGTTCCAAAATTGGATCAGAAATCCTTTTGGAAAGACAAAAGCAACTTTGGTGACATTTTTGATGTTGATTGGTTTATATCCTCACTCTCAAAGGACGTTGTAATTGTCAAA
GAGCTGCCTGAGAAGTTTCAAAAGGGGCTGGGGAGGTCACATACCATGCGTGTTCCAAGGAAATGTACTCAACATTGCTATGAAAACCGAGTACTTCCCGTGCTACTAAAAAGACATGTTGTTGAACTGACTAAGTTTGACTATAGGCTGGCGAATAAGTTGGACACTGATTTACAAAAATTGCGTTGTAAAGTCAACTA
TCATTCATTGAAATTTACCAATTCTATTTCAGAAATGGGCCAAAAGTTAGTTGACAAAATGAAGAAGAGGAGCAGGCGTTTCCTTGCTCTCCACTTAAGGTTTGAGCCTGACATGCTTGCATTTTCTGGATGTTACTATGGTGGGGGAGACAAGGAGAGAAGGGAGTTAGGTGCCATTCGTAAACGGTGGAAAACCTTAC
ATATAAGCAGTCCAGACAAGGAGCGCAGACATGGGAAATGCCCTCTCACTCCTCAAGAAGTGGGACTGATGCTGAGAGCATTGGGTTTTGGAAGTGATTTGCACCTCTATGTTGCCTCAGGGGAAGTGTATGGAGGAGAAAAGACATTAGCACCTTTGAAAGCTCTGTTCCCAAACTTCTACACTAAAGATACATTGGCA
AGTAAGGAGGAGCTAGAGCCATTCTCATCATACTCCTCGCGTATGGCTGCTCTTGATTATATTGTTTGTGATCAAAGTGATGTATTTGTGACGAATAATAATGGCAACATGGCCAGAATGTTGGCTGGACGAAGGCGGTACTTTGGACACAAGCCTACCATCCGCCCCAATGCCAAAAAGCTGAATTCTTTATTTTTGAA
TCGACTTAACATGACTTGGGACACCTTTGCATTTAAGGTGCGTGCCTGCCAAAAAGGCTTCATGGGAGATCCCAATGAAGTCAGGCCTGGAAGAGGGGAATTTCACGAATATCCCTTTGCTTGTATTTGTGAACATCCTGATGCCAAGGAAAAGATTGAAGCAATCCTCCAACATCAATCCAAGTCCAAGTCAAAAAATG
TTGGAGATCTCCCAATTCAAAATGTGGAATCACACACAGAAGATGAGTCAGTCGTTGATGATACTGACTGGCTTGAAAAGGACGAGTTTGATGACAATTTACAAATCCAACAACGAGCAGGACATGAAGATTACAATCATTTTATTAAGATAGATGAACCTGAATTGGAGGAGATGTTATCAGACTAGCCAAACTGGGGG
TTATTTTCTAAATCAAGAATTTCTTCCTCTGGCATGTCAGTTCACAAAGTGAGATGTTTGCCAATTTAATAATCCCCTCAAAATCTAAGAAGGGTCCTATCAAGGTTGTATTTATGCTATCATTGTGGATAAGCTGCTGCAACAGCCTGGATTTTATTCCCTGTAGGCTCTTGACAGCTTGTGTTGAAAGTCTAAAGAAT
GCAAGGATATTCATTATAGTCAGCATTATTTTCTTTAATGTGGCATTGTATTTTTGACCGAGCATGTCTTGTTAATCCCAATTTTCTTCTCTATCTGGTGTTTTAAGGAGGACAGAACAGATACTTGCATAGAAGAATGTGCAGGTAAATTTTATATTGTTCAAAGAGGGATTTTATTTTATGGATAAGTTTCGTGGAAT
GGAGCTTACCTTGTATTGATTGGTTCCATGTAATACTACAGTACTATTAAAATGTAGTACTATAGTGAATAAATATATGATCAGGTGGTTATCATTCACACTGTCATTGGGGGTACCAATATTTTTAATTATACTCCCACACGTGCTCAATTGTACAGTGTTCTTTTGGTG

>TRINITY_DN33081_c0_g1_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CCCGTGCTACTAAAAAGACATgtatgtatgtgggataaactatatgaagttctacaagggccctttaagtagattgattgacactgcctacttttgtatgacagtgggctctttttcttgtgtacgtcttacagtcactcacttcctaatgtccaattaaaaactaaacccttcaaacagggaatgtggataaaatgaca
aaaggacaaaatgaggtgctgtgttttattttgattgggccacatgtaccagtatggtgtatgtgctgttccccactagattattggtatcataatttagagtgtaagctttctgagtctgtcagaaatattttaggattgaaatttctattgtaatgtatgctgccctgaaacgaagtttaatgctttgttttttatga
ttgcttattatgtattaaatggcaatgtgtattatactattatgtattattgagtattgcattcatttcagctctacctgtaaacaaaccaaacttactaattttattgtggctgcagGTTGTTGAACTGACTAAGTTTGACTATAGGCTGGCGAATAAGTTGGACACTGATTTACAAAAATTGCGTTGTAAAGTCAACT
ATCATTCATTGAAATTTACCAATTCTATTTCAGAAATGGGCCAAAAGTTAGTTGACAAAATGAAGAAGAGGAGCAGGCGTTTCCTTGCTCTCCACTTAAGGTTTGAGCCTGACATGCTTGCATTTTCTGGATGTTACTATGGTGGGGGAGACAAGGAGAGAAGGGAGTTAGGTGCCATTCGTAAACGGTGGAAAACCTTA
CATATAAGCAGTCCAGACAAGGAGCGCAGACATGGGAAATGCCCTCTCACTCCTCAAGAAGTGGGACTGATGCTGAGAGCATTGGGTTTTGGAAGTGATTTGCACCTCTATGTTGCCTCAGGGGAAGTGTATGGAGGAGAAAAGACATTAGCACCTTTGAAAGCTCTGTTCCCAAACTTCTACACTAAAGATACATTGGC
AAGTAAGGAGGAGCTAGAGCCATTCTCATCATACTCCTCGCGTATGGCTGCTCTTGATTATATTGTTTGTGATCAAAGTGATGTATTTGTGACGAATAATAATGGCAACATGGCCAGAATGTTGGCTGGACGAAGGCGGTACTTTGGACACAAGCCTACCATCCGCCCCAATGCCAAAAAGCTGAATTCTTTATTTTTGA
ATCGACTTAACATGACTTGGGACACCTTTGCATTTAAGGTGCGTGCCTGCCAAAAAGGCTTCATGGGAGATCCCAATGAAGTCAGGCCTGGAAGAGGGGAATTTCACGAATATCCCTTTGCTTGTATTTGTGAACATCCTGATGCCAAGGAAAAGATTGAAGCAATCCTCCAACATCAATCCAAGTCCAAGTCAAAAAAT
GTTGGAGATCTCCCAATTCAAAATGTGGAATCACACACAGAAGATGAGTCAGTCGTTGATGATACTGACTGGCTTGAAAAGGACGAGTTTGATGACAATTTACAAATCCAACAACGAGCAGGACATGAAGATTACAATCATTTTATTAAGATAGATGAACCTGAATTGGAGGAGATGTTATCAGACTAGCCAAACTGGGG
GTTATTTTCTAAATCAAGAATTTCTTCCTCTGGCATGTCAGTTCACAAAGTGAGATGTTTGCCAATTTAATAATCCCCTCAAAATCTAAGAAGGGTCCTATCAAGGTTGTATTTATGCTATCATTGTGGATAAGCTGCTGCAACAGCCTGGATTTTATTCCCTGTAGGCTCTTGACAGCTTGTGTTGAAAGTCTAAAGAA
TGCAAGGATATTCATTATAGTCAGCATTATTTTCTTTAATGTGGCATTGTATTTTTGACCGAGCATGTCTTGTTAATCCCAATTTTCTTCTCTATCTGGTGTTTTAAGGAGGACAGAACAGATACTTGCATAGAAGAATGTGCAGGTAAATTTTATATTGTTCAAAGAGGGATTTTATTTTATGGATAAGTTTCGTGGAA
TGGAGCTTACCTTGTATTGATTGGTTCCATGTAATACTACAGTACTATTAAAATGTAGTACTATAGTGAATAAATATATGATCAGGTGGTTATCATTCACACTGTCATTGGGGGTACCAATATTTTTAATTATACTCCCACACGTGCTCAATTGTACAGTGTTCTTTTGGTG