sp|A3EWL3|REV1_ARATH ----> DNA repair protein REV1
Intron 1 GTATATAAAC ... CATTATACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 17.18 | 176 | 35 | 38 |
| A2 | 16.67 | 155 | 32 | 30 |
| A3 | 18.72 | 191 | 43 | 45 |
| A4 | 18.21 | 128 | 22 | 35 |
| A5 | 14.29 | 87 | 19 | 10 |
| A6 | 22.45 | 19 | 7 | 4 |
| A7 | 13.29 | 137 | 19 | 23 |
| A8 | 15.53 | 68 | 14 | 11 |
| A9 | 12.76 | 106 | 18 | 13 |
| A10 | 11.2 | 111 | 14 | 14 |
>TRINITY_DN132356_c2_g2_i6 from sample A1 / Example spliced isoformCGCCCCGGAAGCTCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTCAGGTTCCAAAAGAAAAA
GGCCAAATCAAGCACCGTCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCAAAAAATTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGGCGAAG
ACTGATTCAGCCATTGTATCAGGGAGTGCATCTGATTTTAAAAATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTACGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCC
CGACAGCAAGATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTACCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGG
CTATTGGTATGGAAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAAGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAAAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGGTTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAA
ATGTTAACTAGTACATGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGAAGGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAAATATCACAACCAAGCCCCTTTAGAACTAAGCA
TTCATTACATTCAATGATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAATTATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACACCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTATCCACATTGATATGGATT
GCTTCTTTGTATCAGTTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGATGGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTGTTATTCTTCCTTATGAT
TTTGGAGCATATGAAGAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTTTGCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCTGGGATTGCTGGAAATTT
ACTGATGGCCCGAATGGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGTCAATATCATATTCGACCCAATGAGGTAGATCATTTTTTAGCTGATCTTCCAATTAGTGAACTACCGGGAGTGGGCTATGCACTGCAAGAGAAATTGAACTGTCAAAATATTCACAATTGCAACCAGTTGCGGGGGATTTCAAAGGAAGCTCTGCAAA
GAGATTTTGGTTTCAAGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAGCAGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGCGTTTACAAGATGTTTCT
ATGCAAGGTCGCACATTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGAAAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTCTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAG
GGGTATTGGCCTACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCATATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAACCCAGAAGTCCTGTGGCTGAAAAATCATCCAATGGACATGGGCAAGAGAATGTTGAAG
AGAGTCATGGTCTAAGAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGGTTGATGATTACTTATTA
GGGAATCACCCAGTCTTTGACACATACAATATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAGAGTGAAGATGAGGAGCA
ATGTCAAGGTTCTGCTGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCTTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAGCAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGCTAGCCGGCCTCAGTTTC
TTACAACAAATCCAGGAAAGAGTGTTCAAAAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAGCAGAAATGCAGCGTGAC
ATTCTTGATTCTATTCTGGCTCAACAACCATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGGGTTAAAAACTTTATGTT
GAGCAACTGCAACCTGCTTAAGCTAATAGCAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGACAGACTGGAAATTGATA
TTGAAGAAATTTACATTTGTTTTCGTCTTCTTAAAAGGTTGCTTCCCAGTTAGAACTTTTGGATGGCTGTATACAATACAATTTTCCCATTTCTACAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATTCTCTTGCAGGCACTAGC
GGGGAGTGAATTTGTGACGTATGGAAATAGCTGAATCACCATCAAGATATCGAGGTTTGGATCGAGCATGAAGCAATCTAAGGAATAATTGATGAAAACCAGGAGTACGACATCAAATCTGAAACAGAAGATGTGCGCCTGCACTACTTAAAAGAAGACAAGTTACATGTATTTTAACTTTATCATTCAAATATATTTTC
CTCCTTTTAATTTCTGTTAAAAGGGTTATGGAGACAGGATAAATTCTGAGAATAAAATCTCACGAGAGATGGATGTCATGTGATGTAATGCTTAATTCAGTTAAAACCCTAATTAAGAAATGACAAATTGTGGAATAAAGTAATGGCCAAAAAAGGAATGGGAAAGGCGAAGAAAGTTTCTGGTATTTGAACAGTGAAGA
GAGAGAGAGACTTGGAAGAGCAGAAGGCACTGGCCTCTTTGATAAATATAATTATTGAACTGGAACGAGGGGCTTTTTTCATTCACATTGTGACCTCATTTCTTGTATGAATAAAGAAGCCAGTGTTAGCCTGAAGTTCAGTATTAAGAGATAGCATTGTTTCATCTCTTGATTTCTAGGTGTTGGTGTTTGTGGGTTGT
AACCTTGTGTTCATGGGACTATTCTTTTGATGCTTGGTTGCGGTTCACATATTTTTTGTTAATTATTAG
>TRINITY_DN132356_c2_g2_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:CGCCCCGGAAGCTCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTCAGGTTCCAAAAGAAAAA
GGCCAAATCAAGCACCGTCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCAAAAAATTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGGCGAAG
ACTGATTCAGCCATTGTATCAGGGAGTGCATCTGATTTTAAAAATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTACGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCC
CGACAGCAAGATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTACCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGG
CTATTGGTATGGAAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAAGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAAAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGGTTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAA
ATGTTAACTAGTACATGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGAAGGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAAATATCACAACCAAGCCCCTTTAGAACTAAGCA
TTCATTACATTCAATGATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAATTATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACACCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTATCCACATTGATATGGATT
GCTTCTTTGTATCAGTTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGATGGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTGTTATTCTTCCTTATGAT
TTTGGAGCATATGAAGAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTTTGCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCTGGGATTGCTGGAAATTT
ACTGATGGCCCGAATGGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGTCAATATCATATTCGACCCAATGAGGTAGATCATTTTTTAGCTGATCTTCCAATTAGTGAACTACCGGGAGTGGGCTATGCACTGCAAGAGAAATTGAACTGTCAAAATATTCACAATTGCAACCAGTTGCGGGGGATTTCAAAGGAAGCTCTGCAAA
GAGATTTTGGTTTCAAGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAGCAGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGCGTTTACAAGATGTTTCT
ATGCAAGGTCGCACATTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGAAAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTCTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAG
GGGTATTGGCCTACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCATATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAACCCAGAAGTCCTGTGGCTGgtatataaacgattatatatatatttccaatatgtagag
tataagcttttctctggtcccttatttgtgtatttatattcatgtcgaattgcatgttatatccttaagagaaatacttccttgatgaatcatgtcatatcttcaaagtacattaatgtttactctttcttggtctgttctattcattatacagAAAAATCATCCAATGGACATGGGCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCA
TGGTCTAAGAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGGTTGATGATTACTTATTAGGGAATC
ACCCAGTCTTTGACACATACAATATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAGAGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAA
GGTTCTGCTGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCTTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAGCAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGCTAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAAC
AAATCCAGGAAAGAGTGTTCAAAAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAGCAGAAATGCAGCGTGACATTCTTG
ATTCTATTCTGGCTCAACAACCATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGGGTTAAAAACTTTATGTTGAGCAAC
TGCAACCTGCTTAAGCTAATAGCAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGACAGACTGGAAATTGATATTGAAGA
AATTTACATTTGTTTTCGTCTTCTTAAAAGGTTGCTTCCCAGTTAGAACTTTTGGATGGCTGTATACAATACAATTTTCCCATTTCTACAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATTCTCTTGCAGGCACTAGCGGGGAGT
GAATTTGTGACGTATGGAAATAGCTGAATCACCATCAAGATATCGAGGTTTGGATCGAGCATGAAGCAATCTAAGGAATAATTGATGAAAACCAGGAGTACGACATCAAATCTGAAACAGAAGATGTGCGCCTGCACTACTTAAAAGAAGACAAGTTACATGTATTTTAACTTTATCATTCAAATATATTTTCCTCCTTT
TAATTTCTGTTAAAAGGGTTATGGAGACAGGATAAATTCTGAGAATAAAATCTCACGAGAGATGGATGTCATGTGATGTAATGCTTAATTCAGTTAAAACCCTAATTAAGAAATGACAAATTGTGGAATAAAGTAATGGCCAAAAAAGGAATGGGAAAGGCGAAGAAAGTTTCTGGTATTTGAACAGTGAAGAGAGAGAG
AGACTTGGAAGAGCAGAAGGCACTGGCCTCTTTGATAAATATAATTATTGAACTGGAACGAGGGGCTTTTTTCATTCACATTGTGACCTCATTTCTTGTATGAATAAAGAAGCCAGTGTTAGCCTGAAGTTCAGTATTAAGAGATAGCATTGTTTCATCTCTTGATTTCTAGGTGTTGGTGTTTGTGGGTTGTAACCTTG
TGTTCATGGGACTATTCTTTTGATGCTTGGTTGCGGTTCACATATTTTTTGTTAATTATTAG
Intron 2 GTATGCCATT ... TTGTTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.72 | 88 | 24 | 22 |
| A2 | 16.98 | 88 | 13 | 23 |
| A3 | 18.37 | 60 | 13 | 14 |
| A4 | 15.09 | 45 | 11 | 5 |
| A5 | 20 | 20 | 5 | 5 |
| A6 | 19.02 | 66 | 9 | 22 |
| A7 | 19.09 | 195 | 39 | 53 |
| A8 | 20.97 | 292 | 61 | 94 |
| A9 | 16.83 | 168 | 27 | 41 |
| A10 | 19.16 | 116 | 23 | 32 |
>TRINITY_DN47578_c0_g1_i12 from sample A7 / Example spliced isoformTCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTCAGGTTCCAAAAGAAAAAGGCCAAATCAAG
CACCGTCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCAAAAAATTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGGCGAAGACTGATTCAGCC
ATTGTATCAGGGAGTGCATCTGATTTTAAAAATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTACGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCCCGACAGCAAGAT
AAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTACCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGGCTATTGGTATGG
AAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAAGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAAAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGATTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAAATGTTAACTAGT
ACATGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGAAGGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAAATATCACAACCAAGCCCCTTTAGAACTAAGCATTCATTACATTC
AATGATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAATTATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACACCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTATCCACATTGATATGGATTGCTTCTTTGTAT
CAGTTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGATGGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTGTTATTCTTCCTTATGATTTTGGAGCATAC
GAAGAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTTTGCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCTGGGATTGCTGGAAATTTACTGATGGCCCG
AATGGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGTCAATATCATATTCGACCCAATGAGGTAGATCATTTTTTAGCTGATCTTCCAATTAGTGAACTACCGGGAGTGGGCTATGCACTGCAAGAGAAATTGAACTGTCAAAATATTCACAATTGCAACCAGTTGCGGGGGATTTCAAAGGAAGCTCTGCAAAGAGATTTTGGTT
TCAAGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAGCAGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGCGTTTACAAGATGTTTCTATGCAAGGTCGC
ACATTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGAAAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTCTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAGGGGTATTGGCCT
ACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCATATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAACCCAGAAGTCCTGTGGCTGAAAAATCATCCAATGGACATGGGCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCATGGTC
TAAGAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGGTTGATGATTACTTATTAGGGAATCACCCA
GTCTTTGACACATACAATATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAGAGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAAGGTTC
TGCTGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCTTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAGCAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGCTAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAACAAATC
CAGGAAAGAGTGTTCAAAAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAGCAGAAATGCAGCGTGACATTCTTGATTCT
ATTCTGGCTCAACAACCATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGGGTTAAAAACTTTATGTTGAGCAACTGCAA
CCTGCTTAAGCTAATAGCAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGACAGACTGGAAATTGATATTGAAGAAATTT
ACATTTGTTTTCGTCTTCTTAAAAGGTTGCTTCCCAGTTCGAACTTTTGGATGGCTGTATACAATACAATTTTCCCATTTCTACAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATTCTCTTGCAGGCACTAGCGGGGAGTGAATT
TGTGACGTATGGAAATAGCTGAATCACCATCAAGATATCGAGGTTTGGATCGAGCATGAAGCAATCTAAGGAATAATTGATGAAAACCAGGAGTACGACATCAAATCTGAAACAGAAGATGTGCGCCTGCACTACTTAAAAGAAGACAAGTTACATGTATTTTAACTTTATCATTCAAATATATTGTCCTCCTTTTAATT
ACTGTTAAAAGGGTTATGGAGACAGGATAAATTCTGAGAATAAAATCTCACGAGAGATGGATGTCATGTGATGTAATGCTTAATTCAGTTAAAACCCTAATTAAGAAATGACAAATTGTGGAATAAAGTAATGGCCAAAAAAGGAATGGGAAAGGCGAAGAAAGTTTCTGGTATTTGAACAGTGAAGAGAGAGAGAGACT
TGGAAGAGCAGAAGGCACTGGCCTCTTTGATAAATATAATTATTGAACTGGAACGAGGGGCTTTTTTCATTCACATTGTGACCTCATTTCTTGTATGAATAAAGAAGCCAGTGTTAGCCTGAAGTTCAGTATTAAGAGATAGCATTGTTTCATCTCTTGATTTCTAGGTGTTGGTGTTTGTGGGTTGTAACCTTGTGTTC
ATGGGACTATTCTTTTGATGCTTGGTTGCGGTTCACATATTTTTTGTTAATTATTAGCTGTAACCCTTTGGAATTTGTAAAGGTATCTTCGCTTTCTTTGCTAGTTTATGTCTAGCTTATCTATCATGAAACAGGTTCTTCCACTGGTAATTGAAGCTGTTTTTGTGCTTGCAAAGAAAAATGGGTTGGTTTTCCTTCAG
TGATTGTGGACTATTCTCGATTGTTAGTGAGGTTGCTACTTGAGGTTTTGGCA
>TRINITY_DN47578_c0_g1_i14 from sample A7 / Example unspliced isoform:TCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTCAGGTTCCAAAAGAAAAAGGCCAAATCAAG
CACCGTCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCGAAAAACTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGTGCATCTGATTTTAAAAA
TCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTACGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCCCGACAGCAAGATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTAC
CAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGGCTATTGGTATGGAAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAA
GGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAAAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGATTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAAATGTTAACTAGTACATGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGAA
GGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAAATATCACAACCAAGCCCCTTTAGAACTAAGCATTCATTACATTCAATGATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAATT
ATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACACCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTATCCACATTGATATGGATTGCTTCTTTGTATCAGTTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGAT
GGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTGTTATTCTTCCTTATGATTTTGGAGCATACGAAGAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTTT
GCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCTGGGATTGCTGGAAATTTACTGATGGCCCGAATGGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGTC
AATATCATATTCGACCCAATGAGGTAGATCATTTTTTAGCTGATCTTCCAATTAGTGAACTACCGGGAGTGGGCTATGCACTGCAAGAGAAATTGAACTGTCAAAATATTCACAATTGCAACCAGTTGCGGGGGATTTCAAAGGAAGCTCTGCAAAGAGATTTTGGTTTCAAGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAGC
AGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGCGTTTACAAGATGTTTCTATGCAAGGTCGCACATTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGAA
AGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTCTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAGGGGTATTGGCCTACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCAT
ATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAACCCAGAAGTCCTGTGGCTGAAAAATCATCCAATGGACATGGGCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCATGGTCTAAGAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTAT
GATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGGTTGATGATTACTTATTAGGGAATCACCCAGTCTTTGACACATACAATATTGTAAATACCCA
TGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAGAGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAAGGTTCTGCTGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGC
CGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCTTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAGCAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGCTAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAACAAATCCAGGAAAGGCTTATGTCACAGAGTGTTCAAAA
AATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAGCAGAAATGCAGCGTGACATTCTTGATTCTATTCTGGCTCAACAACCAT
CAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGGGTTAAAAACTTTATGTTGAGCAACTGCAACCTGCTTAAGCTAATAGCA
GAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGACAGACTGGAAATTGATATTGAAGAAATTTACATTTGTTTTCGTCTTCT
TAAAAGGTTGCTTCCCAGTTCGAACTTTTGGATGGCTGTATACAATACAATTTTCCCATTTCTACAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATTCTCTTGCAGgtatgccattctttcttttctgtcataagttgaatattt
gtttaggttttatattgctacatattggaaacaatgtatgaattgcagaatatgggagcaatcctagctgatgtaaattttgtttctattcggaagtaggaatagaggatggtatgtgctgctttgatcatttcatgttagatgggaggcatactttgctgtttcttcaaaagttgcaaaagaacttcaaaagggtgcat
tggcaaaaatgaacgcagaaaccaagcgtggatattgataactattttatggacaagttaagactaacaaggatcaaccagaatctcttgtttccagGCACTAGCGGGGAGTGAATTTGTGACGTATGGAAATAGCTGAATCACCATCAAGATATCGAGGTTTGGATCGAGCATGAAGCAATCTAAGGAATAATTGATGA
AAACCAGGAGTACGACATCAAATCTGAAACAGAAGATGTGCGCCTGCACTACTTAAAAGAAGACAAGTTACATGTATTTTAACTTTATCATTCAAATATATT
Intron 3 GTAAACCTGC ... TTCTATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 41.67 | 35 | 10 | 25 |
| A2 | 47.83 | 24 | 7 | 22 |
| A3 | 45.95 | 20 | 3 | 17 |
| A4 | 38.89 | 11 | 1 | 7 |
| A5 | 66.67 | 5 | 0 | 10 |
| A6 | 44.19 | 24 | 7 | 19 |
| A7 | 47.22 | 57 | 8 | 51 |
| A8 | 48.8 | 107 | 9 | 102 |
| A9 | 50.57 | 43 | 1 | 44 |
| A10 | 35.53 | 49 | 5 | 27 |
>TRINITY_DN46134_c2_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoformCCCAAACAGGGAAGGATTCTAAACGAAGCTCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTC
AGGTTCCAAAAGAAAAAGGCCAAATCAAGCACCGCCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCGAAAAACTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCT
TACTCAAGGAGGCGAAGACTGATTCAGCCATTGTATCAGGGAGTGCATCTGATTTTAAAAATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTATGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATT
ATCTGTAGCAATCTTCCCGACAGCAAGATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTACCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAA
TCCTCTCCCCAATAGGGCTATTGGTATGGAAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAAGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAGAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGGTTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCA
TTGAAAAAAGCTTACAAATGTTAACTAGTACATGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGAAGGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAAATATCACAACCAAGC
CCCTTTAGAACTAAGCATTCATTACATTCAATGATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAATTATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACCCCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTAT
CCACATTGATATGGATTGCTTCTTTGTATCAGTTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGATGGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTG
TTATTCTTCCTTATGATTTTGGAGCATATGAAGAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTTTGCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCT
GGGATTGCTGGAAATTTACTGATGGCCCGAATGGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGTCAATATCATATTCGACCCAATGAGGTAGATCATTTTTTAGCTGATCTTCCAATTAGTGAACTACCGGGAGTGGGCTATGCACTGCAAGAGAAATTGAACTGTCAAAATATTCACAATTGCAACCAGTTGCGGGGGATTTC
AAAGGAAGCTCTGCAAAGAGATTTTGGTTTCAAGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAGCAGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGC
GTTTACAAGATGTTTCTATGCAAGGTCGCACATTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGAAAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTCTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTG
GATGTTCGAGAGGTAAGGGGTATTGGCCTACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCATATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAACCCAGAAGTCCTGTGGCTGAAAAATCATCCAATGGACATGG
GCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCATGGTCTAAGAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGG
TTGATGATTACTTATTAGGGAATCACCCAGTCTTTGACACATACAATATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAG
AGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAAGATTCTGCTGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCCTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAGCAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGC
TAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAACAAATCCAGGAAAGAGTGTTCAAAAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAG
CAGAAATGCAGCGTGACATTCTTGATTCTATTCTGGCTCAACAACCATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGG
GTTAAAAACTTTATGTTGAGCAACTGCAACCTGCTTAAGCTAATAGCAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGA
CAGACTGGAAATTGATATTGAAGAAATTTACATTTGTTTTCGTCTTCTTAAAAGGTTGCTTCCCAGTTCGAACTTTTGGATGGCTGTATACAACACAATTTTCCCATTTCTACAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATT
CTCTTGCAGATTCTCAAATTCTAAAATTCTCAGAGAATGGAAAGCGTGGGCAGCCTCCTGACCCTTTGGCACTAGCGGGGAGTGAATTTGTGACGTATGGAAATAGCTGAATCACCATCAAGATATCGAGGTTTGGATCGAGCATGAAGCAATCTAAGGAATAATTGATGAAAACCAGGAGTACGACATCAAATCTGAAA
CAGAAGATGTGCGCCTGCACTACTTAAAAGAAGACAAGTTACATGTATTTTAACTTTATCATTCAAATATATTTTCCTCCTTTTAATTTCTGTTAAAAGGGTTATGGAGACAGGATAAATTCTGAGAATAAAATCTCACGAGAGATGGATGTCATGTGATGTAATGCTTAATTCAGTTAAAACCCTAATTAAGAAATGAC
AAATTGTGGAATAAAGTAATGGCCAAAAAAGGAATGGGAAAGGCGAAGAAAGTTTCTGGTATTTGAACAGTGAAGAGAGAGAGAGACTTGGAAGAGCAGAAGGCACTGGCCTCTTTGATAAATATAATTATTGAACTGGAACGAGGGGCTTTTTTCATTCACATTGTGACCTCATTTCTTGTATGAATAAAGAAGCCAGT
GTTAGCCTGAAGTTCAGTATTAAGAGATAGCATTGTTTCATCTCTTGATTTCTAGGTGTTGGTGTTTGTGGGTTGTAACCTTGTGTTCATGGGACTATTCTTTTGATGCTTGGTTGCGGTTCACATATTTTTTGTTAATTATTAGCTGTAACCCTTTGGAATTTGTAAAGGTATCTTCGCTTGCTTTGCTAGTTTATGTC
TAGCTTATCTATCATGAAACAGGTTCTTCCACTGGTAATTGAAGCTGTTTTTGTGCTTGCAAAGAAAAATGGGTTGGTTTTCCTTCAGTGATTGTGGACTATTCTCGATTGTTAGTGAGGTTGCTACTTGAGGTTTTGGCACTAATTGTGATTGGCGAATTTTTC
>TRINITY_DN46134_c2_g1_i14 from sample A8 / Example unspliced isoform:CCCAAACAGGGAAGGATTCTAAACGAAGCTCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTC
AGGTTCCAAAAGAAAAAGGCCAAATCAAGCACCGCCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCGAAAAACTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCT
TACTCAAGGAGGCGAAGACTGATTCAGCCATTGTATCAGGGAGTGCATCTGATTTTAAAAATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTATGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATT
ATCTGTAGCAATCTTCCCGACAGCAAGATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTACCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAA
TCCTCTCCCCAATAGGGCTATTGGTATGGAAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAAGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAGAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGGTTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCA
TTGAAAAAAGCTTACAAATGTTAACTAGTACATGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGAAGGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAAATATCACAACCAAGC
CCCTTTAGAACTAAGCATTCATTACATTCAATGATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAATTATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACCCCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTAT
CCACATTGATATGGATTGCTTCTTTGTATCAGTTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGATGGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTG
TTATTCTTCCTTATGATTTTGGAGCATATGAAGAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTTTGCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCT
GGGATTGCTGGAAATTTACTGATGGCCCGAATGGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGTCAATATCATATTCGACCCAATGAGGTAGATCATTTTTTAGCTGATCTTCCAATTAGTGAACTACCGGGAGTGGGCTATGCACTGCAAGAGAAATTGAACTGTCAAAATATTCACAATTGCAACCAGTTGCGGGGGATTTC
AAAGGAAGCTCTGCAAAGAGATTTTGGTTTCAAGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAGCAGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGC
GTTTACAAGATGTTTCTATGCAAGGTCGCACATTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGAAAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTCTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTG
GATGTTCGAGAGGTAAGGGGTATTGGCCTACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCATATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAACCCAGAAGTCCTGTGGCTGAAAAATCATCCAATGGACATGG
GCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCATGGTCTAAGAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGG
TTGATGATTACTTATTAGGGAATCACCCAGTCTTTGACACATACAATATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAG
AGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAAGATTCTGCTGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCCTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAGCAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGC
TAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAACAAATCCAGGAAAGAGTGTTCAAAAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAG
CAGAAATGCAGCGTGACATTCTTGATTCTATTCTGGCTCAACAACCATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGG
GTTAAAAACTTTATGTTGAGCAACTGCAACCTGCTTAAGCTAATAGCAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGA
CAGACTGGAAATTGATATTGAAGAAATTTACATTTGTTTTCGTCTTCTTAAAAGGTTGCTTCCCAGTTCGAACTTTTGGATGGCTGTATACAACACAATTTTCCCATTTCTACAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATT
CTCTTGCAGATTCTCAAATTCTAAAATTCTCAGAGAATGGAAAGCGTGGGCAGCCTCCTGACCCTTTGgtaaacctgctgtctctgtaatatttgtcttaaatgtcaatagacctattattccctttgcctagatgggtgagaattttaaggtctatttaaaagctttcattggtttttgattttttatgtgtatacaag
tgctttcagaccggactaaaactttaatagtacagttacagtgcgttttgaattttgtccattttttaatcagcctgagtaatttgaattttgtccattttttaatcagcccaagtaatgttgataagatgtgcacattctagattgagaaggccatggaaatctatggtttccgtggtttgaattttttattgtgtgca
tttcatcgccagtattttcattgtgggattttgggaaacatttgtctttgaaggagcttataaatagtttaaaaaaattaagattttctattgatttcaatataatgttattctttgaatggagtctttttttgataaatattaaggtattcagtttaacgggttttatgtaattttgatatgtataagctatattaaga
gaaatccccctaatgttgcaatttgtatatactggttagaatgcactaaatccctattactatagtgctttttgttgtttgttgtcttactattttccttatctaattttggtttagaatcaattttttttaattatcggtaaatataaatactagacagtaaatataaatattagtcatatgaagggcactttcagaaa
gaaaaccgtcataaaagtttttattgatgggcaagggttcccatcaaatttaacccctgggaatgagtatcttctatgcagGCACTAGCGGGGAGTGAATTTGTGACGTATGGAAATAGCTGAATCACCATCAAGATATCGAGGTTTGGATCGAGCATGAAGCAATCTAAGGAATAATTGATGAAAACCAGGAGTACGAC
ATCAAATCTGAAACAGAAGATGTGCGCCTGCACTACTTAAAAGAAGACAAGTTACATGTATTTTAACTTTATCATTCAAATATATTTTCCTCCTTTTAATTTCTGTTAAAAGGGTTATGGAGACAGGATAAATTCTGAGAATAAAATCTCACGAGAGATGGATGTCATGTGATGTAATGCTTAATTCAGTTAAAACCCTA
ATTAAGAAATGACAAATTGTGGAATAAAGTAATGGCCAAAAAAGGAATGGGAAAGGCGAAGAAAGTTTCTGGTATTTGAACAGTGAAGAGAGAGAGAGACTTGGAAGAGCAGAAGGCACTGGCCTCTTTGATAAATATAATTATTGAACTGGAACGAGGGGCTTTTTTCATTCACATTGTGACCTCATTTCTTGTATGAA
TAAAGAAGCCAGTGTTAGCCTGAAGTTCAGTATTAAGAGATAGCATTGTTTCATCTCTTGATTTCTAGGTGTTGGTGTTTGTGGGTTGTAACCTTGTGTTCATGGGACTATTCTTTTGATGCTTGGTTGCGGTTCACATATTTTTTGTTAATTATTAGCTGTAACCCTTTGGAATTTGTAAAGGTATCTTCGCTTGCTTT
GCTAGTTTATGTCTAGCTTATCTATCATGAAACAGGTTCTTCCACTGGTAATTGAAGCTGTTTTTGTGCTTGCAAAGAAAAATGGGTTGGTTTTCCTTCAGTGATTGTGGACTATTCTCGATTGTTAGTGAGGTTGCTACTTGAGGTTTTGGCACTAATTGTGATTGGCGAATTTTTC
Intron 4 GTAATGCCAT ... TTGATTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 19.51 | 198 | 4 | 48 |
| A2 | 13.62 | 184 | 3 | 29 |
| A3 | 19.63 | 217 | 4 | 53 |
| A4 | 16.38 | 148 | 1 | 29 |
| A5 | 21.05 | 60 | 0 | 16 |
| A6 | 18.42 | 31 | 0 | 7 |
| A7 | 16.79 | 109 | 0 | 22 |
| A8 | 19.51 | 66 | 0 | 16 |
| A9 | 22.22 | 91 | 0 | 26 |
| A10 | 18.02 | 91 | 0 | 20 |
>TRINITY_DN121015_c3_g1_i10 from sample A2 / Example spliced isoformCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTCAGGTTCCAAAAGAAAAAGGCCAAATCAAGC
ACCGCCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCGAAAAACTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGTGCATCTGATTTTAAAAAT
CCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTATGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCCCGACAGCAAGATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTACC
AGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGGCTATTGGTATGGAAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAAG
GGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAAAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGATTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAAATGTTAACTAGTACATGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGAAG
GAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAGATATCACAACCAAGCCCCTTTAGAACTAAGCATTCATTACATTCAATGATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAATTA
TTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACACCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTATCCACATTGATATGGATTGCTTCTTTGTATCAGTTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGATG
GGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTGTTATTCTTCCTTATGATTTTGGAGCATACGAAGAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTTTG
CACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCTGGGATTGCTGGAAATTTACTGATGGCCCGAATGGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGTCA
ATATCATATTCGACCCAATGAGGTAGATCATTTTTTAGCTGATCTTCCAATTAGTGAACTACCGGGAGTGGGCTATGCACTGCAAGAGAAATTGAACTGTCAAAATATTCACAATTGCAACCAGTTGCGGGGGATTTCAAAGGAAGCTCTGCAAAGAGATTTTGGTTTCAAGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAGCA
GAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGCGTTTACAAGATGTTTCTATGCAAGGTCGCACATTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGAAA
GGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTCTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAGGGGTATTGGCCTACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCATA
TAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAACCCAGAAGTCCTGTGGCTGGTATATAAACGATTATATATATATTTCCAATATAAAAATCATCCAATGGACATGGGCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCATGGTC
TAAGAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGGTTGATGATTACTTATTAGGGAATCACCCA
GTCTTTGACACATACAATATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAGAGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAAGGTTC
TGCTGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCTTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAGCAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGCTAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAACAAATC
CAGGAAAGAGTGTTCAAAAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAGCAGAAATGCAGCGTGACATTCTTGATTCT
ATTCTGGCTCAACAACCATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGGGTTAAAAACTTTATGTTGAGCAACTGCAA
CCTGCTTAAGCTAATAGCAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGACAGACTGGAAATTGATATTGAAGAAATTT
ACATTTGTTTTCGTCTTCTTAAAAGGTTGCTTCCCAGTTCGAACTTTTGGATGGCTGTATACAACACAATTTTCCCATTTCTACAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATTCTCTTGCAGAGAATGGAAAGCGTGGGCAG
CCTCCTGACCCTTTGGCACTAGCGGGGAGTGAATTTGTGACGTATGGAAATAGCTGAATCACCATCAAGATATCGAGGTTTGGATCGAGCATGAAGCAATCTAAGGAATAATTGATGAAAACCAGGAGTACGACATCAAATCTGAAACAGAAGATGTGCGCCTGCACTACTTAAAAGAAGACAAGTTACATGTATTTTAA
CTTTATCATTCAAATATATTTTCCTCCTTTTAATTTCTGTTAAAAGGGTTATGGAGACAGGATAAATTCTGAGAATAAAATCTCACGAGAGATGGATGTCATGTGATGTAATGCTTAATTCAGTTAAAACCCTAATTAAGAAATGACAAATTGTGGAATAAAGTAATGGCCAAAAAAGGAATGGGAAAGGCGAAGAAAGT
TTCTGGTATTTGAACAGTGAAGAGAGAGAGAGACTTGGAAGAGCAGAAGGCACTGGCCTCTTTGATAAATATAATTATTGAACTGGAACGAGGGGCTTTTTTCATTCACATTGTGACCTCATTTCTTGTATGAATAAAGAAGCCAGTGTTAGCCTGAAGTTCAGTATTAAGAGATAGCATTGTTTCATCTCTTGATTTCT
AGGTGTTGGTGTTTGTGGGTTGTAACCTTGTGTTCATGGGACTATTCTTTTGATGCTTGGTTGCGGTTCACATATTTTTTGTTAATTATTAGCTGTAACCCTTTGGAATTTGTAAAGGTATCTTCGCTTTCTTTGCTAGTTTATGTCTAGCTTATCTATCATGAAACAGGTTCTTCCACTGGTAATTGAAGCTGTTTTTG
TGCTTGCAAAGAAAAATGGGTTGGTTTTCCTTCAGTGATTGTGGACTATTCTCGATTGTTAGTAA
>TRINITY_DN121015_c3_g1_i7 from sample A2 / Example unspliced isoform:CTTGCTTCCACTATGCTGTTTGCAGCCTCAAACATTGATTTATAACTTTACATTTACTTGTTAAGACTTTCTACCTGTTTGGAAGCAACTTATTTGATATTTGTACTCAGGTGAAGAAAAGAAAGAAAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGgtaatg
ccatgagctcaacgttctaagaaattttctggcacctcttcttattctaactagacgttatgtctggagatcactaagtttcatagtaattgattgtagGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTCTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAGGGGTATTGGCCT
ACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCATATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAA
Intron 5 GTTGCTTCCC ... ATTTCTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 71.74 | 40.4 | 111 | 92.1 |
| A2 | 67.72 | 29 | 70 | 50.6 |
| A3 | 72.21 | 24.8 | 73 | 54.8 |
| A4 | 67.02 | 27.9 | 67 | 44.8 |
| A5 | 62.06 | 10.1 | 16 | 17 |
| A6 | 61.49 | 24 | 46 | 29.7 |
| A7 | 61.45 | 63.7 | 100 | 97.3 |
| A8 | 68.35 | 76 | 158 | 156.8 |
| A9 | 62.76 | 56.9 | 100 | 87.3 |
| A10 | 65.57 | 44.6 | 96 | 73.4 |
>TRINITY_DN110786_c0_g2_i11 from sample A5 / Example spliced isoformCTTAAATTTAACTTTAATTTCAAACCCGCGTGGTTTATACCTGAGAAATTCAAGTAATCTTTGTCATTGCCATGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGGCGAAGACTGATTCAGCCATTGTATCAGGGAGTGCATCTGATTTTAAAA
ATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTACGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCCCGACAGCAAGATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTA
CCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGGCTATTGGTATGGAAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCA
AGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAGAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGGTTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAAATGTTAACTAGTACATGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGA
AGGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAGATATCACAACCAAGCCCCTTTAGAACTAAGCATTCATTACATTCAATGATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAAT
TATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACACCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTATCCACATTGATATGGATTGCTTCTTTGTATCAGTTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGA
TGGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTGTTATTCTTCCTTATGATTTTGGAGCATATGAAGAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTT
TGCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCTGGGATTGCTGGAAATTTACTGATGGCCCGAATGGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGT
CAATATCATATTCGACCCAATGAGGTAGATCATTTTTTAGCTGATCTTCCAATTAGTGAACTACCGGGAGTGGGCTATGCACTGCAAGAGAAATTGAACTGTCAAAATATTCACAATTGCAACCAGTTGCGGGGGATTTCAAAGGAAGCTCTGCAAAGAGATTTTGGTTTCAAGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAG
CAGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGCGTTTACAAGATGTTTCTATGCAAGGTCGCACATTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGA
AAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTCTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAGGGGTATTGGCCTACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCA
TATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAATCCAGAAGTACTGTGGCTGGTATATAAACGATTATATATATATTTCCAATATAAAAATCATCCAATGGACATGGGCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCATGG
TCTAAGAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGGTTGATGATTACTTATTAGGGAATCACC
CAGTCTTTGACACATACAATATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAGAGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAAGGT
TCTGCTGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCCTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAACAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGCTAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAACAAA
TCCAGGAAAGAGTGTTCAAAAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAGCAGAAATGCAGCGTGACATTCTTGATT
CTATTCTGGCTCAACAACCATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGGGTTAAAAACTTTATGTTGAGCAACTGC
AACCTGCTTAAGCTAATAGCAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGACAGACTGGAAATTGATATTGAAGAAAT
TTACATTTGTTTTCGTCTTCTTAAAAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATTCTCTTGCAGGCACTAGCGGGGAGTGAATTTGTGACGTATGGAAATAGCTGAATCACCATCAAGATATCGAGGTTTGGATCGAGCATGA
AGCAATCTAAGGAATAATTGATGAAAACCAGGAGTACGACATCAAATCTGAAACAGAAGATGTGCGCCTGCACTACTTAAAAGAAGACAAGTTACATGTATTTTAACTTTATCATTCAAATATATTGTCCTCCTTTTAATTACTGTTAAAAGGGTTATGGAGACAGGATAAATTCTGAGAATAAAATCTCACGAGAGATG
GATGTCATGTGATGTAATGCTTAATTCAGTTAAAACCCTAATTAAGAAATGACAAATTGTGGAATAAAGTAATGGCCAAAAAAGGAATGGGAAAGGCGAAGAAAGTTTCTGGTATTTGAACAGTGAAGAGAGAGAGAGACTTGGAAGAGCAGAAGGCACTGGCCTCTTTGATAAATATAATTATTGAACTGGAACGAGGG
GCTTTTTTCATTCACATTGTGACCTCATTTCTTGTATGAATAAAGAAGCCAGTGTTAGCCTGAAGTTCAGTATTAAGAGATAGCATTGTTTCATCTCTTGATTTCTAGGTGTTGGTGTTTGTGGGTTGTAACCTTGTGTTCATGGGACTATTCTTTTGATGCTTGGTTGCGGTTCACATATTTTTTGTTAATTATTAGCT
GTAACCCTTTGGAATTTGTAAAGGTATCTTCGCTTGCTTTGCTAGTTTATGTCTAGCTTATCTATCATGAAACAGGTTCTTCCACTGGTAATTGAAGCTGTTTTTGTGCTTG
>TRINITY_DN110786_c0_g2_i4 from sample A5 / Example unspliced isoform:CAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTCAGGTTCCAAAAGAAAAAGGCCAAATCAAGCAC
CGTCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCAAAAAATTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGGCGAAGACTGATTCAGCCATT
GTATCAGGGAGTGCATCTGATTTTAAAAATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTACGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCCCGACAGCAAGATAAA
AAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTACCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGGCTATTGGTATGGAAA
ACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAAGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAGAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGGTTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAAATGTTAACTAGTACA
TGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGAAGGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAGATATCACAACCAAGCCCCTTTAGAACTAAGCATTCATTACATTCAAT
GATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAATTATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACACCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTATCCACATTGATATGGATTGCTTCTTTGTATCAG
TTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGATGGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTGTTATTCTTCCTTATGATTTTGGAGCATATGAA
GAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTTTGCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCTGGGATTGCTGGAAATTTACTGATGGCCCGAAT
GGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGTCAATATCATATTCGACCCAATGAGGTAGATCATTTTTTAGCTGATCTTCCAATTAGTGAACTACCGGGAGTGGGCTATGCACTGCAAGAGAAATTGAACTGTCAAAATATTCACAATTGCAACCAGTTGCGGGGGATTTCAAAGGAAGCTCTGCAAAGAGATTTTGGTTTCA
AGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAGCAGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGCGTTTACAAGATGTTTCTATGCAAGGTCGCACA
TTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGAAAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTCTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAGGGGTATTGGCCTACA
GGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCATATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAACCCAGAAGTCCTGTGGCTGAAAAATCATCCAATGGACATGGGCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCATGGTCTAA
GAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGGTTGATGATTACTTATTAGGGAATCACCCAGTC
TTTGACACATACAATATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAGAGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAAGGTTCTGC
TGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCCTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAACAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGCTAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAACAAATCCAG
GAAAGAGTGTTCAAAAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAGCAGAAATGCAGCGTGACATTCTTGATTCTATT
CTGGCTCAACAACCATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGGGTTAAAAACTTTATGTTGAGCAACTGCAACCT
GCTTAAGCTAATAGCAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGACAGACTGGAAATTGATATTGAAGAAATTTACA
TTTGTTTTCGTCTTCTTAAAAGgttgcttcccagttcgaacttttggatggctgtatacaatacaattttcccatttctacagGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATTCTCTTGCAGGCACTAGCGGGGAGTGAATTTGT
GACGTATGGAAATAGCTGAATCACCATCAAGATATCGAGGTTTGGATCGAGCATGAAGCAATCTAAGGAATAATTGATGAAAACCAGGAGTACGACATCAAATCTGAAACAGAAGATGTGCGCCTGCACTACTTAAAAGAAGACAAGTTACATGTATTTTAACTTTATCATTCAAATATATTGTCCTCCTTTTAATTACT
GTTAAAAGGGTTATGGAGACAGGATAAATTCTGAGAATAAAATCTCACGAGAGATGGATGTCATGTGATGTAATGCTTAATTCAGTTAAAACCCTAATTAAGAAATGACAAATTGTGGAATAAAGTAATGGCCAAAAAAGGAATGGGAAAGGCGAAGAAAGTTTCTGGTATTTGAACAGTGAAGAGAGAGAGAGACTTGG
AAGAGCAGAAGGCACTGGCCTCTTTGATAAATATAATTATTGAACTGGAACGAGGGGCTTTTTTCATTCACATTGTGACCTCATTTCTTGTATGAATAAAGAAGCCAGTGTTAGCCTGAAGTTCAGTATTAAGAGATAGCATTGTTTCATCTCTTGATTTCTAGGTGTTGGTGTTTGTGGGTTGTAACCTTGTGTTCATG
GGACTATTCTTTTGATGCTTGGTTGCGGTTCACATATTTTTTGTTAATTATTAGCTGTAACCCTTTGGAATTTGTAAAGGTATCTTCGCTTGCTTTGCTAGTTTATGTCTAGCTTATCTATCATGAAACAGGTTCTTCCACTGGTAATTGAAGCTGTTTTTGTGCTTG
Intron 6 GTAACCCTGC ... TTCTATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 46.35 | 29.5 | 10 | 25 |
| A2 | 52.86 | 20 | 3 | 22 |
| A3 | 50.4 | 17 | 3 | 17 |
| A4 | 42.78 | 9.5 | 0 | 7 |
| A5 | 66.67 | 5 | 0 | 10 |
| A6 | 47.77 | 21 | 3 | 19 |
| A7 | 50.17 | 51 | 6 | 51 |
| A8 | 50.97 | 98.5 | 6 | 102 |
| A9 | 51.48 | 41.5 | 1 | 44 |
| A10 | 41.87 | 39 | 5 | 27 |
>TRINITY_DN43862_c0_g3_i13 from sample A9 / Example spliced isoformGCTCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTTAGGTTCCAAAAGAAAAAGGCCAAATCA
AGCACCGTCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCAAAAAATTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGGCGAAGACTGATTCAG
CCATTGTATCAGGGAGTGCATCTGATTTTAAAAATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTACGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCCCGACAGCAAG
ATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTACCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGGCTATTGGTAT
GGAAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAAGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAGAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGATTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAAATGTTAACTA
GTACATGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGAAGGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAAATATCACAACCAAGCCCCTTTAGAACTAAGCATTCATTACAT
TCAATGATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAATTATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACCCCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTATCCACATTGATATGGATTGCTTCTTTGT
ATCAGTTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGATGGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTGTTATTCTTCCTTATGATTTTGGAGCAT
ATGAAGAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTTTGCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCTGGGATTGCTGGAAATTTACTGATGGCC
CGAATGGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGTCAATATCATATTCGACCCAATGAGGTAGATCATTTTTTAGCTGATCTTCCAATTAGTGAACTACCGGGAGTGGGCTATGCACTGCAAGAGAAATTGAACTGTCAAAATATTCACAATTGCAACCAGTTGCGGGGGATTTCAAAGGAAGCTCTGCAAAGAGATTTTGG
TTTCAAGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAGCAGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGCGTTTACAAGATGTTTCTATGCAAGGTC
GCACATTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGAAAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTTTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAGGGGTATTGGC
CTACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCATATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAATCCAGAAGTACTGTGGCTGAAAAATCATCCAATGGACATGGGCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCATGG
TCTAAGAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGGTTGATGATTACTTATTAGGGAATCACC
CAGTCTTTGACACATACAATATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAGAGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAAGGT
TCTGCTGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCCTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAGCAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGCTAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAACAAA
TCCAGGAAAGAGTGTTCAAAAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAGCAGAAATGCAGCGTGACATTCTTGATT
CTATTCTGGCTCAACAACCATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGGGTTAAAAACTTTATGTTGAGCAACTGC
AACCTGCTTAAGCTAATAGCAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGACAGACTGGAAATTGATATTGAAGAAAT
TTACATTTGTTTTCGTCTTCTTAAAAGGTTGCTTCCCAGTTCGAACTTTTGGATGGCTGTATACAACACAATTTTCCCATTTCTACAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATTCTCTTGCAGATTCTCAAATTCTAAAAT
TCTCAGAGAATGGAAAGCGTGGGCAGCCTCCTGACCCTTTGGCACTAGCGGGGAGTGAATTTGTGACGTATGGAAATAGCTGAATCACCATCAAGATATCGAGGTTTGGATCGAGCATGAAGCAATCTAAGGAATAATTGATGAAAACCAGGAGTACGACATCAAATCTGAAACAGAAGATGTGCGCCTGCACTACTTAA
AAGAAGACAAGTTACATGTATTTTAACTTTATCATTCAAATATATT
>TRINITY_DN43862_c0_g3_i19 from sample A9 / Example unspliced isoform:GCTCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTTAGGTTCCAAAAGAAAAAGGCCAAATCA
AGCACCGTCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCAAAAAATTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGGCGAAGACTGATTCAG
CCATTGTATCAGGGAGTGCATCTGATTTTAAAAATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTACGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCCCGACAGCAAG
ATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTACCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGGCTATTGGTAT
GGAAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAAGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAGAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGATTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAAATGTTAACTA
GTACATGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGAAGGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAAATATCACAACCAAGCCCCTTTAGAACTAAGCATTCATTACAT
TCAATGATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAATTATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACCCCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTATCCACATTGATATGGATTGCTTCTTTGT
ATCAGTTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGATGGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTGTTATTCTTCCTTATGATTTTGGAGCAT
ATGAAGAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTTTGCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCTGGGATTGCTGGAAATTTACTGATGGCC
CGAATGGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGTCAATATCATATTCGACCCAATGAGGTAGATCATTTTTTAGCTGATCTTCCAATTAGTGAACTACCGGGAGTGGGCTATGCACTGCAAGAGAAATTGAACTGTCAAAATATTCACAATTGCAACCAGTTGCGGGGGATTTCAAAGGAAGCTCTGCAAAGAGATTTTGG
TTTCAAGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAGCAGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGCGTTTACAAGATGTTTCTATGCAAGGTC
GCACATTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGAAAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTTTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAGGGGTATTGGC
CTACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCATATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAATCCAGAAGTACTGTGGCTGAAAAATCATCCAATGGACATGGGCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCATGG
TCTAAGAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGGTTGATGATTACTTATTAGGGAATCACC
CAGTCTTTGACACATACAATATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAGAGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAAGGT
TCTGCTGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCCTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAGCAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGCTAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAACAAA
TCCAGGAAAGAGTGTTCAAAAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAGCAGAAATGCAGCGTGACATTCTTGATT
CTATTCTGGCTCAACAACCATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGGGTTAAAAACTTTATGTTGAGCAACTGC
AACCTGCTTAAGCTAATAGCAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGACAGACTGGAAATTGATATTGAAGAAAT
TTACATTTGTTTTCGTCTTCTTAAAAGGTTGCTTCCCAGTTCGAACTTTTGGATGGCTGTATACAACACAATTTTCCCATTTCTACAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATTCTCTTGCAGTTATTTCAGATTCTCAAA
TTCTAAAATTCTCAGAGAATGGAAAGCGTGGGCAGCCTCCTGACCCTTTGgtaaccctgctgtctctgtaatatttgtcttaaatgtcaatagacctattattccctttgcctagatgggtgagaattttaaggtctatttaaaagctttcattaaattgattggtttttgattttttatgtgtatacaagtgctttcag
accggactaaaactttaatagtacagttacagtgcgttttgaattttgtccattttttaatcagcccaagtaatgttgataagatgtgcacattctagattgagaaggccatggaaatctatggtttccgtggtttgaattttttattgtgtgcatttcatcgccagtattttcattgtgggattttgggaaacatttgt
ctttgaaggagcttataaatagtttaaaaaaattaagattttctattgatttcaatataatgttattctttgaatggagtctttttttgataaatattaaggtattcagtttaacgggttttatgtaattttgatatgtataagctatattaagagaaatccccctaatgttgcaatttgtatatactggttagaatgca
ctaaatccctattactatagtgctttttgttgtttgttgtcttactattttccttatctaattttggtttagaatcaattttttttaattatcggtaaatataaatactagacagtaaatataaatattagtcatatgaagggcactttcagaaagaaaaccgtcataaaagtttttattgatgggcaagggttcccatc
aaatttaacccctgggaatgagtatcttctatgcagGCACTAGCGGGGAGTGAATTTGTGACGTATGGAAATAGCTGAATCACCATCAAGATATCGAGGTTTGGATCGAGCATGAAGCAATCTAAGGAATAATTGATGAAAACCAGGAGTACGACATCAAATCTGAAACAGAAGATGTGCGCCTGCACTACTTAAAAGAA
GACAAGTTACATGTATTTTAACTTTATCATTCAAATATATT
Intron 7 GTAGATCATT ... TCAAAGGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 59.25 | 109 | 124 | 193 |
| A2 | 71.51 | 49 | 106 | 140 |
| A3 | 68.54 | 70 | 136 | 169 |
| A4 | 63.98 | 67 | 111 | 127 |
| A5 | 76 | 15 | 39 | 56 |
| A6 | 80 | 3 | 10 | 14 |
| A7 | 68 | 32 | 54 | 82 |
| A8 | 58.27 | 29 | 33 | 48 |
| A9 | 78.69 | 13 | 54 | 42 |
| A10 | 63.13 | 40 | 76 | 61 |
>TRINITY_DN48208_c0_g1_i4 from sample A10 / Example spliced isoformGGCGGGGAAGCTCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTCAGGTTCCAAAAGAAAAAG
GCCAAATCAAGCACCGTCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCAAAAAATTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGGCGAAGA
CTGATTCAGCCATTGTATCAGGGAGTGCATCTGATTTTAAAAATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTACGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCCC
GACAGCAAGATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTACCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGGC
TATTGGTATGGAAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAAGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAAAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGGTTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAAA
TGTTAACTAGTACATGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGAAGGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAGATATCACAACCAAGCCCCTTTAGAACTAAGCAT
TCATTACATTCAATGATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAATTATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACCCCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTATCCACATTGATATGGATTG
CTTCTTTGTATCAGTTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGATGGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTGTTATTCTTCCTTATGATT
TTGGAGCATACGAAGAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTTTGCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCTGGGATTGCTGGAAATTTA
CTGATGGCCCGAATGGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGTCAATATCATATTCGACCCAATGAGGAAGCTCTGCAAAGAGATTTTGGTTTCAAGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAGCAGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACG
GTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGCGTTTACAAGATGTTTCTATGCAAGGTCGCACATTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGAAAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTG
CTACACATAATATGGATATACTTTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAGGGGTATTGGCCTACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCATATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTT
CCGATGTCAAATGAAGTAAAATCCAGAAGTACTGTGGCTGAAAAATCATCCAATGGACATGGGCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCATGGTCTAAGAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGA
AGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGGTTGATGATTACTTATTAGGGAATCACCCAGTCTTTGACACATACAATATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCA
GTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAGAGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAAGGTTCTGCTGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCTTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATAT
AGAAGCAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGCTAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAACAAATCCAGGAAAGAGTGTTCAAAAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAG
AGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAGCAGAAATGCAGCGTGACATTCTTGATTCTATTCTGGCTCAACAACCATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTT
CTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGGGTTAAAAACTTTATGTTGAGCAACTGCAACCTGCTTAAGCTAATAGCAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGG
TCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGACAGACTGGAAATTGATATTGAAGAAATTTACATTTGTTTTCGTCTTCTTAAAAGGTTGCTTCCCAGTTCGAACTTTTGGATGGCTGTATACAATACAATTTTCCCATTTCTACAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGG
AGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATTCTCTTGCAGTTATTACCATATGCCCTTCAACGTGGCATTGGAGGACAGGTTGGGCGATTGATTGGTTCCTTTCACTACAGTTTTGGTTACTTAGGCAAGACAATCAAGG
>TRINITY_DN48208_c0_g1_i1 from sample A10 / Example unspliced isoform:GGCGGGGAAGCTCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTCAGGTTCCAAAAGAAAAAG
GCCAAATCAAGCACCGTCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCGAAAAACTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGTGCATCT
GATTTTAAAAATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTACGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCCCGACAGCAAGATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAG
CAGGGGACTACCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGGCTATTGGTATGGAAAACAAGTCTGCTTCCATGT
CCTGTGATCAAGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAAAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGGTTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAAATGTTAACTAGTACATGCCAAATGCCTTGTTCA
TTGAATTTGAAGGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAGATATCACAACCAAGCCCCTTTAGAACTAAGCATTCATTACATTCAATGATGGGAGATGCCAATTT
TGTGGAAAATTATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACCCCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTATCCACATTGATATGGATTGCTTCTTTGTATCAGTTGTGATCAGGAATCGTT
CTGGATTAGATGGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTGTTATTCTTCCTTATGATTTTGGAGCATACGAAGAGGTTGCTGATCAATTC
TATGACATTTTGCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCTGGGATTGCTGGAAATTTACTGATGGCCCGAATGGCTACGAAGAGAGCTAA
GCCCAATGGTCAATATCATATTCGACCCAATGAGgtagatcattttttagctgatcttccaattagtgaactaccgggagtgggctatgcactgcaagagaaattgaactgtcaaaatattcacaattgcaaccagttgcgggggatttcaaaggtagGAAGCTCTGCAAAGAGATTTTGGTTTCAAGACTGGCGATATG
TTATGGCATTACAGCAGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGCGTTTACAAGATGTTTCTATGCAAGGTCGCACATTCACACTTAAGGT
GAAGAAAAGAAAGAAAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTTTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAGGGGTATTGGCCTACAGGTCTCAAAACTAC
AAGCTGCAGAATCATATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAATCCAGAAGTACTGTGGCTGAAAAATCATCCAATGGACATGGGCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCATGGTCTAAGAAAGGAATTTGGA
AGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGATGTCTACAATATCAAGGTTGATGATTACTTATTAGGGAATCACCCAGTCTTTGACACATACAA
TATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCGTCACAAGATTTTAAAGAGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAAGGTTCTGCTGCTAACACATTCT
GGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCTTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAGCAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCAGTAGAGAAGAGAGTGCTAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAACAAATCCAGGAAAGAGTGTTCAA
AAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTCTTGCAGGAGTTACCAGCAGAAATGCAGCGTGACATTCTTGATTCTATTCTGGCTCAACAACC
ATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGGAAATCCCCCAGTGTGGGTTAAAAACTTTATGTTGAGCAACTGCAACCTGCTTAAGCTAATAG
CAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCAAACAGTATATTGAAGACAGACTGGAAATTGATATTGAAGAAATTTACATTTGTTTTCGTCTT
CTTAAAAGGTTGCTTCCCAGTTCGAACTTTTGGATGGCTGTATACAATACAATTTTCCCATTTCTACAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGATATTACATGAACACATTCTCTTGCAGTTATTACCATATGCCCTTCAACGTGGCATTGGAGGAC
AGGTTGGGCGATTGATTGGTTCCTTTCACTACAGTTTTGGTTACTTAGGCAAGACAATCAAGG
Intron 8 GTAGAGTATA ... CATTATACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 45.24 | 46 | 8 | 38 |
| A2 | 45.45 | 36 | 5 | 30 |
| A3 | 43.27 | 59 | 12 | 45 |
| A4 | 50 | 35 | 4 | 35 |
| A5 | 33.33 | 20 | 3 | 10 |
| A6 | 40 | 6 | 2 | 4 |
| A7 | 45.1 | 28 | 1 | 23 |
| A8 | 45.83 | 13 | 0 | 11 |
| A9 | 39.39 | 20 | 3 | 13 |
| A10 | 50 | 14 | 0 | 14 |
>TRINITY_DN132356_c2_g2_i5 from sample A1 / Example spliced isoformCGCCCCGGAAGCTCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTCAGGTTCCAAAAGAAAAA
GGCCAAATCAAGCACCGTCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCAAAAAATTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGGCGAAG
ACTGATTCAGCCATTGTATCAGGGAGTGCATCTGATTTTAAAAATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTACGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCC
CGACAGCAAGATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTACCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGG
CTATTGGTATGGAAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAAGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAAAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGGTTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAA
ATGTTAACTAGTACATGCCAAATGCCTTGTTCATTGAATTTGAAGGAAGAGTGCCGTCTAACTGATCACAGGGATGCATGCAGTGAAAATGAGATAACAAGTTGCAATGTTTTGAAGCTGGCAAACACTGAGACTATCAATAATTCAGTAAACAAAGGCTGCAAGGAAATATCACAACCAAGCCCCTTTAGAACTAAGCA
TTCATTACATTCAATGATGGGAGATGCCAATTTTGTGGAAAATTATTTCAAGAATTCAAGGTTGCACTTCATAGGGACCTGGAAGAATCGGTATCGTAAACGATTTGCAGGAAAATCATTTGAGGACATACACCAATATTCAGGGGATGATACCACATTTGTTCCTGGTAGTCGAGTTATTATCCACATTGATATGGATT
GCTTCTTTGTATCAGTTGTGATCAGGAATCGTTCTGGATTAGATGGGAAACCTGTAGCCGTATGCCATTCTGATAATCCTGAAGGAACTGCTGAAATCTCTTCTGCAAACTATCCTGCCCGGGACTATGGCATCAGGGCAGGAATGTTCGTGCGGGATGCAAAGGCTTTGTGCCCACATCTTGTTATTCTTCCTTATGAT
TTTGGAGCATATGAAGAGGTTGCTGATCAATTCTATGACATTTTGCACAAGCACTGTAACAAAATACAAGTGTTAAGCTGTGACGAGGCATATTTAGATATGACTGGTTCAGGTGATCCTGATCACATTGTATCAGCTATCAGAGATGAGATATTTGGTGCGACAAATTGCACTGCAAGTGCTGGGATTGCTGGAAATTT
ACTGATGGCCCGAATGGCTACGAAGAGAGCTAAGCCCAATGGTCAATATCATATTCGACCCAATGAGGTAGATCATTTTTTAGCTGATCTTCCAATTAGTGAACTACCGGGAGTGGGCTATGCACTGCAAGAGAAATTGAACTGTCAAAATATTCACAATTGCAACCAGTTGCGGGGGATTTCAAAGGAAGCTCTGCAAA
GAGATTTTGGTTTCAAGACTGGCGATATGTTATGGCATTACAGCAGAGGGATTGATGATCGCCAGGTTCAAACTGCTCAGGAGCTTAAATCTATAGGCGCTGAAGTGAACTGGGGTGTACGGTTCAACAATCTTGCAGATGTTCATCACTTTCTTATGAATCTGAGCAGGGAAGTTTCATCGCGTTTACAAGATGTTTCT
ATGCAAGGTCGCACATTCACACTTAAGGTGAAGAAAAGAAAGAAAGGTGCAGGTGAGCCTGCCAAATTTATGGGCTGTGGAAGTTGTGACAATCTCAGCCACTCTGTGACGGTGCCTTCTGCTACACATAATATGGATATACTCTTGAGGATTAGTCGGCAGCTTTTTTCATCATTTAACCTGGATGTTCGAGAGGTAAG
GGGTATTGGCCTACAGGTCTCAAAACTACAAGCTGCAGAATCATATAATCAAGGTGTTGGGAAAAATGCACTGAAGTCGTGGCTTGCTTCGACATCGAAGATGGCATCACAGCAATCAGTTCCGATGTCAAATGAAGTAAAATCCAGAAGTACTGTGGCTGGTATATAAACGATTATATATATATTTCCAATATAAAAAT
CATCCAATGGACATGGGCAAGAGAATGTTGAAGAGAGTCATGGTCTAAGAAAGGAATTTGGAAGTTCTGAAAGTTATGATGATAAAGTTAAAGGGAAACGGAAAATCCATGAAGGTGATCCTTTTGTGCCACATATATCTCGACTGGACCCAGAAGTTCTTGCAAATCTTCCCTCCGAAATACTTTCGGAAATCAGTGAT
GTCTACAATATCAAGGTTGATGATTACTTATTAGGGAATCACCCAGTCTTTGACACATACAATATTGTAAATACCCATGCAATGGATAGGTTTAGTACAGGCACAGGCAGTAAAATACAGGAATTAAGGTTTCCTGTATTGGAAGGGTGTAGCAGTAAAGTTGTTAGAAGTGATTCCAGAAATATTGAATGTGACAATCG
TCACAAGATTTTAAAGAGTGAAGATGAGGAGCAATGTCAAGGTTCTGCTGCTAACACATTCTGGTCAGTTGATTTGCCGGCATCATCGGAGTTGGATCCTTCTGTACTTTCGGCCCTTCCATTGTCTTTACGTCTTGAAATTGAGCAGCAATATAGAAGCAACAATTCTTTAGAAGCAAAGAATGCTCCAGCTATTGTCA
GTAGAGAAGAGAGTGCTAGCCGGCCTCAGTTTCTTACAACAAATCCAGGAAAGAGTGTTCAAAAAATGTTTGTTGGGAATTCAAGGACATTGACTTCATGCACTTCTGATTCGAGGAATATGACCATTGGTAAAGCTGGAAGGCAGGCAAGTAGAGATGATTCAGTTTCTATGTCTATGAGCCAATTAGATATCACTGTC
TTGCAGGAGTTACCAGCAGAAATGCAGCGTGACATTCTTGATTCTATTCTGGCTCAACAACCATCAGAAGCATCTCATGAAGAATCTTTGCTATGTAAGAGGGAAAATTCTTCTCATACCATCAGTGCATATGTTGAGGTGGAACAGAAAGTTTCTGGTGTAGAAGATGAAGCACTCTTTGAGAAACGCCTTTGGAAGGG
AAATCCCCCAGTGTGGGTTAAAAACTTTATGTTGAGCAACTGCAACCTGCTTAAGCTAATAGCAGAAAGCTACATTAAGGCAGGCTCAACTGAATGTCTATCCTCTGTGTTGCTGTATCTTGTTTCCTCACTCCCGCAAGAATTTGTTTCCTGGTCAGATTTACAGGAAAAATCTGTCAGAATCTGTTCAGATCTTTTCA
AACAGTATATTGAAGACAGACTGGAAATTGATATTGAAGAAATTTACATTTGTTTTCGTCTTCTTAAAAGGTTGCTTCCCAGTTAGAACTTTTGGATGGCTGTATACAATACAATTTTCCCATTTCTACAGGTTAATGTTGGAGAGATATATGGAGGAGCTTTAAAGTTTGAGTAAAAGAAAGTATATTATGATAGAGAT
ATTACATGAACACATTCTCTTGCAGGCACTAGCGGGGAGTGAATTTGTGACGTATGGAAATAGCTGAATCACCATCAAGATATCGAGGTTTGGATCGAGCATGAAGCAATCTAAGGAATAATTGATGAAAACCAGGAGTACGACATCAAATCTGAAACAGAAGATGTGCGCCTGCACTACTTAAAAGAAGACAAGTTACA
TGTATTTTAACTTTATCATTCAAATATATTTTCCTCCTTTTAATTTCTGTTAAAAGGGTTATGGAGACAGGATAAATTCTGAGAATAAAATCTCACGAGAGATGGATGTCATGTGATGTAATGCTTAATTCAGTTAAAACCCTAATTAAGAAATGACAAATTGTGGAATAAAGTAATGGCCAAAAAAGGAATGGGAAAGG
CGAAGAAAGTTTCTGGTATTTGAACAGTGAAGAGAGAGAGAGACTTGGAAGAGCAGAAGGCACTGGCCTCTTTGATAAATATAATTATTGAACTGGAACGAGGGGCTTTTTTCATTCACATTGTGACCTCATTTCTTGTATGAATAAAGAAGCCAGTGTTAGCCTGAAGTTCAGTATTAAGAGATAGCATTGTTTCATCT
CTTGATTTCTAGGTGTTGGTGTTTGTGGGTTGTAACCTTGTGTTCATGGGACTATTCTTTTGATGCTTGGTTGCGGTTCACATATTTTTTGTTAATTATTAG
>TRINITY_DN132356_c2_g2_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:CGCCCCGGAAGCTCTCAACATTTTTGAAAGCTTTCTATTTGTTTGCGTTTCCCGCGGGTCTTTTCTGCCTGCCTCCTTCAAACCCCGGGGCCTTTTTGCACCGACATGCTGTTCAATTGCCGAACGACGCCCTCCATTTCATCTGCACAAAATGAGCTTTGCCACTCTAAACTCGTCTCGTTCAGGTTCCAAAAGAAAAA
GGCCAAATCAAGCACCGTCGGGGAATCGAACCCTCGTCGGTATGGCCTGGGGTGCCAATTCTGCCTCCTCAAAAAATTCCACAAAAAATAAAAGTTCCGCTGCTTTCACCGACTTTGGCAGTTATATGAGTGAGAAGGAGCGGAAGCTCCGGCTTCAATTTCAATCTGATGCAGAAAACAGCTTACTCAAGGAGGCGAAG
ACTGATTCAGCCATTGTATCAGGGAGTGCATCTGATTTTAAAAATCCCAAGGGCTTGTTCAGTGGCATTTCTATATTTGTTGATGGCTTCACCATACCTTCGAATCAGGAGCTACGTAATTATATGATAGAATATGGAGGAGGATTTCAGAATTACTTCTCCAGAGATCGGGTTACACACATTATCTGTAGCAATCTTCC
CGACAGCAAGATAAAAAATTTAAGGTCTTTCAGCAGGGGACTACCAGTTGTGAGACCACAGTGGATAGTTGATAGTATTGCTGCCAACAAAATTTTACCTGTGGTAACCTATCAGCTTGAACGTCTTGCAAATGAATGTCCACAACAGCAAAGGCTATCTGCTTTTTTTACTGTCAAGTCTAATCCTCTCCCCAATAGGG
CTATTGGTATGGAAAACAAGTCTGCTTCCATGTCCTGTGATCAAGGGTCGTCTTTGAATGGGCATGGGGGAGTAGTTGAAAGAAAAAAGAATCATGACTGCAAGCCACAAGCAGAGGTTTTTGGAGAAAACTCAAGTGTATTATGTGGTGCACAAGAGATGCATGGTGATGAAGAAAATTGCATTGAAAAAAGCTTACAA
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