sp|Q8L586|Y4958_ARATH ----> Uncharacterized membrane protein At4g09580
Intron 1 GTAATCATCT ... GTTTGTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 42.86 | 6 | 4 | 5 |
| A2 | 7.57 | 14 | 1.3 | 1 |
| A3 | 25 | 3 | 0 | 2 |
| A4 | 45.48 | 6 | 4.1 | 6 |
| A5 | 14.39 | 8 | 1.7 | 1 |
| A6 | 12.48 | 53 | 7.7 | 8 |
| A7 | 15.35 | 45 | 4.8 | 12 |
| A8 | 16.2 | 48.7 | 5 | 14 |
| A9 | 18.52 | 33 | 7.3 | 8 |
| A10 | 6.55 | 30 | 2.4 | 2 |
>TRINITY_DN111186_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformGCCTTTCAACCTAAACAAGAATACTCTTAATCCGACACGATAAAATTGCTTGAATGCTTCCGAGATCGAGAAACAGTGTGTGCACTCTCAGAAACACCAAATTAAGAGAAGAATTCGTATTTTTTCCTTGTATAATTCGTGAAGATTGCTAGGAAAATGGCGGTTTCCTGGGGCACTGTGTTTCGGGGATCGCTGTTAGT
TGTACTTGTAGCTGCCATTGCTACAGCTTGCTTTACCCTTCCGGTGGAGAAGATATTAAAAGACTTCCTTTTTTGGATTGATAAGAATTTAGGTCCTTGGGGACCTCTTGTTTTAGCTGTAGCTTATATTCCATTGACAGTGCTAGTAGTTCCAGCATCCATTCTCACAATTGGAGGTGGATACCTATTTGGCCTGCCAA
TTGGTTTCATTGCTGATTCTATTGGATCTACAATTGGTTGCACAGCTGCATTCCTTGTTGGAAAAACAATTGGAAGATCTTATGTGGCGTCCAAGTTGAATGATTTTCCACAATTCCAAGCTGTTTCTATAGCAACTCGAAGATCGGGGTTTAAGATTGTTTTTCTTCTACGGCTTGTACCACTACTTCCATTCAATATG
CTAAATTATCTTCTTTCTGTGACTCCTGTCGGCTTGGGTCAGTATATGCTGGCTTCCTGGATTGGTATGATGCCAATCACGTTTGGATTTGTGTATATTGGAACTACTATCAAGGATCTTTCTGATGTTACTCATAATTGGAGTGAAATCTCGACAGCTCATTGGATATTGCTGACTACAGGTTTAGTGGCATCTGTGGT
TCTTATCTTTCTCGTGACTCAAATAGCAAAGAGATCTCTAGCTAAGGCCCTCGAAGAGGATGGCAAGTTGGATGGCATCTCAGTACCAACCGATTCTGCAATTGCAATTGAAGCATGCTCAGATATTCACCAACCTCTTCTAGTCAAAATAGAGGGAAGTGTTGATAGCCGTGACAACTAATGATTGATGATTCGTACAC
TACCAATGATATGATTGTACAGAAGATCCCTACATATTTTCCATATATTTATAAAGTGAAAGTTGTAATTAATTGGTTACTTCACAAGTAATCTCCATGGGGAGGAGTTTGTAAGAAAGCTACAAATACATTACTATAAGCTTTGTATTTCTCATATTAATGTAATTTGATTACTTATTAAATGAATTTTGTTATTTTAT
TATTGCCATGTAATGATTC
>TRINITY_DN111186_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATTTTTTCATAAAAAGCTGGATTAAGAATGATAAAATCAATCATTACAATTTACATTCTATTTTTTCAATTATATTAGAGTTCATTGTGATCCTCACATTCTCTCTTGTGATTTGGATGCAGATATTGCTGACTACAGGTTTAGTGGCATCTGgtaatcatcttgctaatgtctcagatgactagtttagtagaacagat
tagttgtggttgatgttgctatagggaaagattatctttatattatcatcattggtttacatagtatgaactcagcaaggacagttgcttttattttcatgtctgatagtcatttacgtattttagtttgatctcgtttgtgtagTGGTTCTTATCTTTCTCGTGACTCAAATAGCAAAGAGATCTCTAGCTAAGGCCCT
CGAAGAGGATGGCAAGTTGGATGGCATCTCAGTACCAACCGATTCTGCAATTGCAATTGAAGCATGCTCAGATATTCACCAACCTCTTCTAGTCAAAATAGAGGGAAGTGTTGATAGCCGTGACAACTAATGATTGATGATTCGTACACTACCAATGATATGATTGTACAGAAGATCCCTACATATTTTCCATATATTTA
TAAAGTGAAAGTTGTAATTAATTGGTTACTTCACAAGTAATCTCCATGGGGAGGAGTTTGTAAGAAAGCTACAAATACATTACTATAAGCTTTGTATTTCTCATATTAATGTAATTTGATTACTTATTAAATGAATTTTGTTATTTTATTATTGCCATGTAATGATTC