NA ----> NA

Intron 1 GTATTATAAT ... TTGTTCACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	17.92	160.3	31	39
A2	16.41	242	51	44
A3	13.82	246.3	29	50
A4	15.06	141	19	31
A5	13.59	124	15	24
A6	13.93	1214.3	172	221
A7	14.14	774	115	140
A8	16.68	587	127	108
A9	17.23	831	182	164
A10	15.31	608.3	92	128

>TRINITY_DN116219_c0_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoform

AGATGAACTGCAGAGCAAATGATATTGTGAGATCACTTCAGCTTTCGAAGAAGAAGTCAGTAAATTTGCTTGATTTTATTTGATTTATAGTCTGGTTTCGGGGTACCTATACAGAAATGGGTTCGTTAGTGGCAGGCTGGGATTCTCCCACTTCGAGTTTTGGGAAAGGTAGATTAGAGAGAAACAAATCTCTAACTAAT
GAAGAGATCGAGACGTTCTGGAAGACAAAGCGCAAGGCTCAAGAAGAACATCTAAAGGCGGTTGCTGAGGCTCAGGGTCATGCCACCTCAGATATTCAAAGTCCAACAGATAACAATATTGAGGAAACCGAGGCAGCGTTGATAGGAGGAGCTATACACCGAAAGCTGTCTGCCAAACGCCCGGTTGGCCTGGACAGTAG
CATGAGTTTCCCAGGTTGCAACACTGCTACTGTTGCCTCAGGCAGCCAATTTGCCAACGAGGATGATTTAGATACTTTGAGGAAGGCCAAGGCCTGGTAAGTGTTCCTATTTACTCTCTCAAAGTGCCTTCAAATGATTCTATTGATATAAATTCAGAGTAATTTATGAATATCTGCCTTGAAATAATTCTGTTGATATA
AATTCAGAGTAATTTATGAATATCTGCCTTGAAATAATTCTGTTGATATAAATTCAGAGTAATTTATGAATATCTGCCTTGACTTAGTTTGGAATACCTTGTAGGTGGACAAGGAGCAACTGGGCATTTTTGAATGAGCCACCATTGATGGCAACGGAAGGTTCAACACAGAAGTATGGTACACAGTATCATGTTTCTGC
ACTGGGCTGCAAAGAGAGGCACTAAAGTTCTTGGTGACCATAAAGTCTGCAATGGGCTGCAAAGAGAGGCACTAAAGTTCTTGGTGACCATAAAGTCTGCAATGGGCTGCAAAGAGAGGCACTAAACAATGTATAGACTGGTGTTTTACATATGTTTGTTATTGAGCAAAAGTATTGATCTTAATTGTATATATTGGAGA
GTTGCTCTGCATAAAAGCTTAGGTTTTATTTTCATTGGGTCTTTTTAAGGTGCAGAGAATGGTGTTTTACATATGTTTGTTATTGAGCAAAAGTATTGATCTTAATTGTATAAATTGGAGAGTTACTCTGCATAAAAGCTTAGGTTTTATTTTCATTGGGTCTTTTTAAGGTGCAGAGAATGGTGTTTTACATATGTTTG
TTATTTTTTAAGGTGCAGACATATCATGTACAGAAAAGGCAAAAGTACTTTGGATGGTGTGAACACATACGAGGGTTAATGACGATCTGAATAAAACTTTAATGCTTTTAAGTCAATTTCAACTTTTATACAAGTGGAAA

>TRINITY_DN116219_c0_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AGATGAACTGCAGAGCAAATGATATTGTGAGATCACTTCAGCTTTCGAAGAAGAAGTCAGTAAATTTGCTTGATTTTATTTGATTTATAGTCTGGTTTCGGGGTACCTATACAGAAATGGGTTCGTTAGTGGCAGGCTGGGATTCTCCCACTTCGAGTTTTGGGAAAGgtattataatttcagaaaattattcaatctta
ttacgaagaaatctaatactgaatacttactgttctgtacatatctgttttattattttggggtgatttttttttttaattgttcacagGTAGATTAGAGAGAAACAAATCTCTAACTAATGAAGAGATCGAGACGTTCTGGAAGACAAAGCGCAAGGCTCAAGAAGAACATCTAAAGGCGGTTGCTGAGGCTCAGGGTC
ATGCCACCTCAGATATTCAAAGTCCAACAGATAACAATATTGAGGTAAGCTGCTAGCTGCTACTGCTCCTGTCATCATCAACCCCCAAAAACCAACACAAATAAAAAGATCAGCCATCTCTTAATTATTGATCTAACAATCTCATGAATCAAAGTCCCTGGTGGAACTGAACTGGTGGGACTTCACTTAAAATTATGGCT
CTTTTGCATCCATATCGCAGATTTAAATGCATTCTATTATATTCGAAAATGTAGGTTTGGCTGGGCCAGAGATGATTCTTAGAGTTGTGAAATTTGTTTTGATTGTATATTATGTTATAAAATATTGTGCTTATTTAGACCCCTTAGACGTTTATGAATGTATGATTGATTGAGG