sp|F4KBM7|AVT6B_ARATH ----> Amino acid transporter AVT6B
Intron 1 GTATGCGTTC ... CCATGGCTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 27.27 | 16 | 4 | 8 |
| A2 | 19.15 | 19 | 4 | 5 |
| A3 | 11.11 | 20 | 1 | 4 |
| A4 | 22.58 | 12 | 7 | 0 |
| A5 | 21.43 | 11 | 2 | 4 |
| A6 | 21.37 | 46 | 12 | 13 |
| A7 | 18.33 | 49 | 14 | 8 |
| A8 | 27.27 | 16 | 4 | 8 |
| A9 | 18.18 | 54 | 16 | 8 |
| A10 | 22.35 | 33 | 16 | 3 |
>TRINITY_DN112412_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoformAAAAATCCTGTTTCGACTTTGTTGATTTTTGGGTTGGAACTGTTTAAGAATACCCAATTTTCGATAAAACTGTTGCAATGATTTCATTTTTGTTTAACTGGGATTCAGAAGGGTTGCTCTGATCAGAAGAACTGTAAATGATAGTTGGACATGAAATGTATGCCTGTCCAAGGGTTTGAAGCTGCTCTGTATCATTGAAT
GAAATATATGTGACTACGAGCTGTGGAAATTTGGTCAGCCAAATGATTTACAAGAACTCTGTAAGAGAATTGTGAAGATTGGATGGGAAACAGCTGTTCCGATCAGAAGAATTTATATGATAGCGTGCTTGCGAAGCGAAAGAAACAGAAGAATATTCAACGGGTTGGTCTGACAATTTTTCCAGGATGACTTTGGGGAA
GCCTACAGGACCGAAAAAGGATTTTGTTATAGTGCCTTTGCTTTCAGGGTCAGAGTCACAACAAGATGTAGGAAACCCTATGCAAAACAATGGATCCTTTACAGGAGCAGTGCTTAATTTGTCGACAACAATTGTTGGGGCAGGTATCATGGCGTTACCTGCCACCATGAAGATTTTGGGACTCATCCCGGGTCTCTCTC
TGCTAGTTTTTGTGGGGCTTTTAACATATGTGTCAATTGAATTTTTGCTGAGGTTTAGTAGGGCCGCTAGGGTTAATTCTTATGGAGGTGTTATGGAGGATGCTTTTGGACAGCCTGGCAGGATTGTTTTGCAAGCTTGCATCATACTAAAGACCTTGGGTATTCTTATCATCTATATGATTATCATCGGTGATGTGATT
TCTGGAACATCATCAAATGGTGTTCATCATACTGGTGTGTTGGAGGAATGGTTTGGGATTTGCTGGTGGACTGGGCGAACTGGTGCCCTCTTTCTCACCACAATTCTTATACTGGTTCCCTTAGTCTCTTTCAAGCATGTGGATTCCTTGAAATTTAGTTCAGCAGTATCAGTATCATTGGCTGTTGTATTTGTGGTGAT
CACTGCGGGCATTACAATTGTTAAATTAGTTCACGGTGATATCTACATGCCAAAACTACTACCTGATGTTGTTGATCAGGCTTCATTTTGGAAGCTTTTTACAACTGTGCCGGTCATGGTCACTTCTTACATTTGCCATTACAATGTTCATCCCATACACAATGAACTTGCGAAATCTTCAGAAATGAAAACAGTTGTTC
AGACTTCACTTGCATTTTGTTCATCCATATACATAACAACAAGCTTTTTCGGCTATCTATTGTTTGGAGATGCAACTATGTCTGATGTTCTAGCCAATTTCGACACGGATTTGGGAATCCCTTACAGTGCTGTTTTGAATGACATTGTTCGTGTTAGCTATGCTATTCATTTGATGCTGGTCTTTCCGGTTATTCATTTT
GCCTTACGTCTCAATTTTGATGGCCTTGCCTTTCCATCTGCACATCCCCTGTCATTAGATTCCAAGAGATTTATTTCAATCACAGCTGGATTGATAGGTTGTGTTTTCCTGGGGGCAACATTTATCCCCAATATCTGGGATGTATTTCAGGTTACAGGGGCTACAGTAGCAGTCTGTGTTGGCTTTATCTTTCCAGGTTC
TATTGTTCTAAGAGATGCCCGTGGTATATCGACAAGGAAAGATAAGTGTCTTGCACTGATAATGATTACGTTGGCAGTCATTTGCAGTTTGATTGCTGTAACCAGTGACATATATGATTTATTCCGGAAAATTGATGCTGTTTCAAGTCCACCATGATCTCGAGTGTTGGATTTATTTCCAGCACTTAGCTTGTGTATTA
TTAGTTGATGTCTATTGTTCTGGAACAGGAGTTAATCAACCTGTGTCAAGCAGTAAACATGTGCCAACCACACCATTTGTAGTAATTCTCAAAAAAGCTGAAGTTAATATGGGCTATTGCATACGTCATTATAATATCTCCACAAAGCATAACGATTCTCTGGCATTGGTGTGTTTCTTGGGCATACTGTATTTCTAGTA
TTTGAATAATGCTTTCCTTATATTAACGAGGTTCAAAATTTATGGATTCTGTAAGATGATCTGGTGTAGCTTACATTTGGGCTGGCATTTACTTTTGCAGCTCTTTTTCATGGGCTATCTTGTAAAGGAATTGCTTCTGGTTGACCGTC
>TRINITY_DN112412_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:AAAAATCCTGTTTCGACTTTGTTGATTTTTGGGTTGGAACTGTTTAAGAATACCCAATTTTCGATAAAACTGTTGCAATGATTTCATTTTTGTTTAACTGGGATTCAGAAGGGTTGCTCTGATCAGAAGAACTGTAAATGATAGTTGGACATGAAATGTATGCCTGTCCAAGGGTTTGAAGCTGCTCTGTATCATTGAAT
GAAATATATGTGACTACGAGCTGTGGAAATTTGGTCAGCCAAATGATTTACAAGAACTCTGTAAGAGAATTGTGAAGATTGGATGGGAAACAGCTGTTCCGATCAGAAGAATTTATATGATAGCGTGCTTGCGAAGCGAAAGAAACAGAAGAATATTCAACGGGTTGGTCTGACAATTTTTCCAGGATGACTTTGGGGAA
GCCTACAGGACCGAAAAAGGATTTTGTTATAGTGCCTTTGCTTTCAGGGTCAGAGTCACAACAAGATGTAGGAAACCCTATGCAAAACAATGGATCCTTTACAGGAGCAGTGCTTAATTTGTCGACAACAATTGTTGGGGCAGGTATCATGGCGTTACCTGCCACCATGAAGATTTTGGGACTCATCCCGGGTCTCTCTC
TGCTAGTTTTTGTGGGGCTTTTAACATATGTGTCAATTGAATTTTTGCTGAGGTTTAGTAGGGCCGCTAGGGTTAATTCTTATGGAGGTGTTATGGAGGATGCTTTTGGACAGCCTGGCAGGATTGTTTTGCAAGCTTGCATCATACTAAAGACCTTGGGTATTCTTATCATCTATATGATTATCATCGgtatgcgttca
atatataataggctcactctgtgtcttaacttttgttttattgcttagttcctgaaatccttttatttgatatcgacacttcaattgcgtactgaagttttttccccatggctagGTGATGTGATTTCTGGAACATCATCAAATGGTGTTCATCATACTGGTGTGTTGGAGGAATGGTTTGGGATTTGCTGGTGGACTGG
GCGAACTGGTGCCCTCTTTCTCACCACAATTCTTATACTGGTTCCCTTAGTCTCTTTCAAGCATGTGGATTCCTTGAAATTTAGTTCAGCAGTATCAGTATCATTGGCTGTTGTATTTGTGGTGATCACTGCGGGCATTACAATTGTTAAATTAGTTCACGGTGATATCTACATGCCAAAACTACTACCTGATGTTGTTG
ATCAGGCTTCATTTTGGAAGCTTTTTACAACTGTGCCGGTCATGGTCACTTCTTACATTTGCCATTACAATGTTCATCCCATACACAATGAACTTGCGAAATCTTCAGAAATGAAAACAGTTGTTCAGACTTCACTTGCATTTTGTTCATCCATATACATAACAACAAGCTTTTTCGGCTATCTATTGTTTGGAGATGCA
ACTATGTCTGATGTTCTAGCCAATTTCGACACGGATTTGGGAATCCCTTACAGTGCTGTTTTGAATGACATTGTTCGTGTTAGCTATGCTATTCATTTGATGCTGGTCTTTCCGGTTATTCATTTTGCCTTACGTCTCAATTTTGATGGCCTTGCCTTTCCATCTGCACATCCCCTGTCATTAGATTCCAAGAGATTTAT
TTCAATCACAGCTGGATTGATAGGTTGTGTTTTCCTGGGGGCAACATTTATCCCCAATATCTGGGATGTATTTCAGGTTACAGGGGCTACAGTAGCAGTCTGTGTTGGCTTTATCTTTCCAGGTTCTATTGTTCTAAGAGATGCCCGTGGTATATCGACAAGGAAAGATAAGTGTCTTGCACTGATAATGATTACGTTGG
CAGTCATTTGCAGTTTGATTGCTGTAACCAGTGACATATATGATTTATTCCGGAAAATTGATGCTGTTTCAAGTCCACCATGATCTCGAGTGTTGGATTTATTTCCAGCACTTAGCTTGTGTATTATTAGTTGATGTCTATTGTTCTGGAACAGGAGTTAATCAACCTGTGTCAAGCAGTAAACATGTGCCAACCACACC
ATTTGTAGTAATTCTCAAAAAAGCTGAAGTTAATATGGGCTATTGCATACGTCATTATAATATCTCCACAAAGCATAACGATTCTCTGGCATTGGTGTGTTTCTTGGGCATACTGTATTTCTAGTATTTGAATAATGCTTTCCTTATATTAACGAGGTTCAAAATTTATGGATTCTGTAAGATGATCTGGTGTAGCTTAC
ATTTGGGCTGGCATTTACTTTTGCAGCTCTTTTTCATGGGCTATCTTGTAAAGGAATTGCTTCTGGTTGACCGTC
Intron 2 GTGTGTTTCT ... ACTTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 64.71 | 3 | 7 | 4 |
| A2 | 66.67 | 1 | 1 | 3 |
| A3 | 80 | 1 | 5 | 3 |
| A4 | 100 | 0 | 2 | 0 |
| A5 | 42.86 | 2 | 3 | 0 |
| A6 | 64.96 | 24 | 60 | 29 |
| A7 | 66 | 17 | 42 | 24 |
| A8 | 79.83 | 12 | 51 | 44 |
| A9 | 78.79 | 7 | 31 | 21 |
| A10 | 66.04 | 9 | 21 | 14 |
>TRINITY_DN37555_c0_g1_i5 from sample A6 / Example spliced isoformAGATGCCACGCTCCACCACGTCACTTTTTAAAAAATATAATAGCTGACTAAGAACCCAGGTTGCTAAGCTACACATTTCCTTACATACCATGATCATATGGGTAACTTGCCACGCTATTCGTGTTGATTTAAAGGTAATACGATGGTGCAGCTGAGTAACAACCTTGGCTGCTATCCTATAGAGTTGAGCTATATTCCCA
CCCCCGGTGCTGGTGTTGTCGCCTGGTTGTTGTCTCTGAGAATGATTGAATTGTGTTAGTTGGTACAATGATTTTGGATCACTTTCTTTGGGTTTGGAGGTGAAATAATGCGATGCACGGGTTTGTAATGTTTTGGATTATACTTCCCATATATTGTACTATAAAATTCCAATCTAAAAGAGTGAAATGATCTATTCGAA
AATTGGGTATTCCCTCTACATGTCTGATCTGATCGACAAAAATCCTGTTTCGACTTTGTTGATTTTTGGGTTGGAACTGTTTAAGAATACCCAATTTTCGATAAAACTGTTGCAATGATTTCATTTTTGTTTAACTGGGATTCAGAAGGGTTGCTCTGATCAGAAGAACTGTAAATGATAGTTGGACATGAAATGTATGC
CTGTCCAAGGGTTTGAAGCTGCTCTGTATCATTGAATGAAATATATGTGACTACGAGCTGTGGAAATTTGGTCAGCCAAATGATTTACAAGAACTCTGTAAGAGAATTGTGAAGATTGGATGGGAAACAGCTGTTCCGATCAGAAGAATTTATATGATAGCGTGCTTGCGAAGCGAAAGAAACAGAAGAATATTCAACGG
GTTGGTCTGACAATTTTTCCAGGATGACTTTGGGGAAGCCTACAGGACCGAAAAAGGATTTTGTTATAGTGCCTTTGCTTTCAGGGTCAGAGTCACAACAAGATGTAGGAAACCCTATGCAAAACAATGGATCCTTTACAGGAGCAGTGCTTAATTTGTCGACAACAATTGTTGGGGCAGGTATCATGGCGTTACCTGCC
ACCATGAAGATTTTGGGACTCATCCCGGGTCTCTCTCTGCTAGTTTTTGTGGGGCTTTTAACATATGTGTCAATTGAATTTTTGCTGAGGTTTAGTAGGGCCGCTAGGGTTAATTCTTATGGAGGTGTTATGGAGGATGCTTTTGGACAGCCTGGCAGGATTGTTTTGCAAGCTTGCATCATACTAAAGACCTTGGGTAT
TCTTATCATCTATATGATTATCATCGGTGATGTGATTTCTGGAACATCATCAAATGGTGTTCATCATACTGGTGTGTTGGAGGAATGGTTTGGGATTTGCTGGTGGACTGGGCGAACTGGTGCCCTCTTTCTCACCACAATTCTTATACTGGTTCCCTTAGTCTCTTTCAAGCATGTGGATTCCTTGAAATTTAGTTCAG
CAGTATCAGTATCATTGGCTGTTGTATTTGTGGTGATCACTGCGGGCATTACAATTGTTAAATTAGTTCACGGTGATATCTACATGCCAAAACTACTACCTGATGTTGTTGATCAGGCTTCATTTTGGAAGCTTTTTACAACTGTGCCGGTCATGGTCACTTCTTACATTTGCCATTACAATGTTCATCCCATACACAAT
GAACTTGCGAAATCTTCAGAAATGAAAACAGTTGTTCAGACTTCACTTGCATTTTGTTCATCCATATACATAACAACAAGCTTTTTCGGCTATCTATTGTTTGGAGATGCAACTATGTCTGATGTTCTAGCCAATTTCGACACGGATTTGGGAATCCCTTACAGTGCTGTTTTGAATGACATTGTTCGTGTTAGCTATGC
TATTCATTTGATGCTGGTCTTTCCGGTTATTCATTTTGCCTTACGTCTCAATTTTGATGGCCTTGCCTTTCCATCTGCACATCCCCTGTCATTAGATTCCAAGAGATTTATTTCAATCACAGCTGGATTGATAGGTTGTGTTTTCCTGGGGGCAACATTTATCCCCAATATCTGGGATGTATTTCAGGTTACAGGGGCTA
CAGTAGCAGTCTGTGTTGGCTTTATCTTTCCAGGTTCTATTGTTCTAAGAGATGCCCGTGGTATATCGACAAGGAAAGATAAGTGTCTTGCACTGATAATGATTACGTTGGCAGTCATTTGCAGTTTGATTGCTGTAACCAGTGACATATATGATTTATTCCGGAAAATTGATGCTGTTTCAAGTCCACCATGATCTCGA
GTGTTGGATTTATTTCCAGCACTTAGCTTGTGTATTATTAGTTGATGTCTATTGTTCTGGAACAGGAGTTAATCAACCTGTGTCAAGCAGTAAACATGTGCCAACCACACCATTTGTAGTAATTCTCAAAAAAGCTGAAGTTAATATGGGCTATTGCATACGTCATTATAATATCTCCACAAAGCATAACGATTCTCTGG
CATTGCTCTTTTTCATGGGCTATCTTGTAAAGGAATTGCTTCTGGTTGACCGTCTATGCTTGTACTATGGTTTGATGGTTTGAATGCTTGCAATAGTGAAATTGGCATGTTGGAATTCAAATTGTGCTCAGAGA
>TRINITY_DN37555_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:AGATGCCACGCTCCACCACGTCACTTTTTAAAAAATATAATAGCTGACTAAGAACCCAGGTTGCTAAGCTACACATTTCCTTACATACCATGATCATATGGGTAACTTGCCACGCTATTCGTGTTGATTTAAAGGTAATACGATGGTGCAGCTGAGTAACAACCTTGGCTGCTATCCTATAGAGTTGAGCTATATTCCCA
CCCCCGGTGCTGGTGTTGTCGCCTGGTTGTTGTCTCTGAGAATGATTGAATTGTGTTAGTTGGTACAATGATTTTGGATCACTTTCTTTGGGTTTGGAGGTGAAATAATGCGATGCACGGGTTTGTAATGTTTTGGATTATACTTCCCATATATTGTACTATAAAATTCCAATCTAAAAGAGTGAAATGATCTATTCGAA
AATTGGGTATTCCCTCTACATGTCTGATCTGATCGACAAAAATCCTGTTTCGACTTTGTTGATTTTTGGGTTGGAACTGTTTAAGAATACCCAATTTTCGATAAAACTGTTGCAATGATTTCATTTTTGTTTAACTGGGATTCAGAAGGGTTGCTCTGATCAGAAGAACTGTAAATGATAGTTGGACATGAAATGTATGC
CTGTCCAAGGGTTTGAAGCTGCTCTGTATCATTGAATGAAATATATGTGACTACGAGCTGTGGAAATTTGGTCAGCCAAATGATTTACAAGAACTCTGTAAGAGAATTGTGAAGATTGGATGGGAAACAGCTGTTCCGATCAGAAGAATTTATATGATAGCGTGCTTGCGAAGAACCGGTGCTTTAATCACTGAAACATA
ATTTTTTGTGTGTGGCGAAAATTGGATGCAAACGCCTCGCTTTCCAGCGAAAGAAACAGAAGAATATTCAACGGGTTGGTCTGACAATTTTTCCAGGATGACTTTGGGGAAGCCTACAGGACCGAAAAAGGATTTTGTTATAGTGCCTTTGCTTTCAGGGTCAGAGTCACAACAAGATGTAGGAAACCCTATGCAAAACA
ATGGATCCTTTACAGGAGCAGTGCTTAATTTGTCGACAACAATTGTTGGGGCAGGTATCATGGCGTTACCTGCCACCATGAAGATTTTGGGACTCATCCCGGGTCTCTCTCTGCTAGTTTTTGTGGGGCTTTTAACATATGTGTCAATTGAATTTTTGCTGAGGTTTAGTAGGGCCGCTAGGGTTAATTCTTATGGAGGT
GTTATGGAGGATGCTTTTGGACAGCCTGGCAGGATTGTTTTGCAAGCTTGCATCATACTAAAGACCTTGGGTATTCTTATCATCTATATGATTATCATCGGTGATGTGATTTCTGGAACATCATCAAATGGTGTTCATCATACTGGTGTGTTGGAGGAATGGTTTGGGATTTGCTGGTGGACTGGGCGAACTGGTGCCCT
CTTTCTCACCACAATTCTTATACTGGTTCCCTTAGTCTCTTTCAAGCATGTGGATTCCTTGAAATTTAGTTCAGCAGTATCAGTATCATTGGCTGTTGTATTTGTGGTGATCACTGCGGGCATTACAATTGTTAAATTAGTTCACGGTGATATCTACATGCCAAAACTACTACCTGATGTTGTTGATCAGGCTTCATTTT
GGAAGCTTTTTACAACTGTGCCGGTCATGGTCACTTCTTACATTTGCCATTACAATGTTCATCCCATACACAATGAACTTGCGAAATCTTCAGAAATGAAAACAGTTGTTCAGACTTCACTTGCATTTTGTTCATCCATATACATAACAACAAGCTTTTTCGGCTATCTATTGTTTGGAGATGCAACTATGTCTGATGTT
CTAGCCAATTTCGACACGGATTTGGGAATCCCTTACAGTGCTGTTTTGAATGACATTGTTCGTGTTAGCTATGCTATTCATTTGATGCTGGTCTTTCCGGTTATTCATTTTGCCTTACGTCTCAATTTTGATGGCCTTGCCTTTCCATCTGCACATCCCCTGTCATTAGATTCCAAGAGATTTATTTCAATCACAGCTGG
ATTGATAGGTTGTGTTTTCCTGGGGGCAACATTTATCCCCAATATCTGGGATGTATTTCAGGTTACAGGGGCTACAGTAGCAGTCTGTGTTGGCTTTATCTTTCCAGGTTCTATTGTTCTAAGAGATGCCCGTGGTATATCGACAAGGAAAGATAAGTGTCTTGCACTGATAATGATTACGTTGGCAGTCATTTGCAGTT
TGATTGCTGTAACCAGTGACATATATGATTTATTCCGGAAAATTGATGCTGTTTCAAGTCCACCATGATCTCGAGTGTTGGATTTATTTCCAGCACTTAGCTTGTGTATTATTAGTTGATGTCTATTGTTCTGGAACAGGAGTTAATCAACCTGTGTCAAGCAGTAAACATGTGCCAACCACACCATTTGTAGTAATTCT
CAAAAAAGCTGAAGTTAATATGGGCTATTGCATACGTCATTATAATATCTCCACAAAGCATAACGATTCTCTGGCATTGgtgtgtttcttgggcatactgtatttctagtatttgaataatgctttccttatattaacgaggttcaaaatttatggattctgtaagatgatctggtgtagcttacatttgggctggcatt
tacttttgcagCTCTTTTTCATGGGCTATCTTGTAAAGGAATTGCTTCTGGTTGACCGTCTATGCTTGTACTATGGTTTGATGGTTTGAATGCTTGCAATAGTGAAATTGGCATGTTGGAATTCAAATTGTGCTCAGAGA