sp|Q9FKI0|FIMB5_ARATH ----> Fimbrin-5

Intron 1 GTACGAATTC ... CATGATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	33.33	21	7	14
A2	25.93	10	2	5
A3	27.27	16	6	6
A4	24.32	14	2	7
A5	60	2	5	1
A6	19.61	41	5	15
A7	22.76	56	8	25
A8	16.96	71	17	12
A9	21.57	60	15	18
A10	12.62	45	3	10

>TRINITY_DN39993_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoform

GAGGAATGAAGGGAATGGCCATGCAATTATATGCAAGTGTGCAAGAGTTCGAATTTTTCAGCAGCTGACATAACTGCTTCTCATCCAAGAGATGATTATTTACATTTTTGGGGTGACCGTTTTTTGGCAGATGTATCTTAATTTGCAAACACGAGAAAATACAAAATTAGGTGGTTCCAATAACAAATCTGCATTTCTGA
AGATTGCCACAACTACCTTGCTTCACACAACTGGTGAATCTGAGAAGGTGGCATTTGTTGGTCATATCAACAGCTACCTTAGAGATGATCCAGTGATGAAAAGATACCTTCCAATTGATCCTATGACAAATGATCTCTTTGATATAGTGAAAGATGGCATTCTTCTATGTAAAATTCTCAATGTTGCTACTCCTGGCACC
ATTGATGATTGAGCAATAAATACGAAACCAAAGCTTAATCCATGGGAAATAAATGAAAATCATACACTTTGTCTCAATTCTTCAAAGTCCATTGGATGCACAATAGTAAATATTGGTACACAGGACAAAAGTGAAATGATCTGTATAGTTGTATATATGTTGTTAAAATACATATTGGAACCGAGGACTTAGATGACAGG
ATGGTATGTCAAATAAGCTGTATAGTTGATCCCACCTTTATATATTAACAATGCCATACCATGTTAGCTCAATTGCAACAGTTGAGTGTTCTAAGTTATATGTCCTAATGATGAAAGATTTAGGGCCGCTGTAATTGGCATAAATATATTTATGCTACATGTATAACTCTCTCTGTTTGGATTTGGGCATTACTTGATGG
TGTCATGGTTTAGATCCTTAAATTACATGTTTCATAATTCATAAATTAAGGTAAGTGGATTCTTAATAATACCTTGATAAATTTGAAAAAGTTAAGGGTTTCTCTACCTATATATAATATGTCTATATGGTTGCAAATTCT

>TRINITY_DN39993_c0_g1_i8 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CATAACGTTGCTTGACCATAAATTATGGTTCCACTTCACCCTTTGACTCGTTGTAACGAAGGGGTTGTCCATCACGGAATCCCAAACTAACGTTGATCATTAATGAAGTCAGCTAACTAGCTGCTAAGCTTTCCGCAGATATGCAAAGTGGTAGTTCGTAGGTTTTAATGCTTGTATATATATTTGTACTTTCTCCTCGA
TGGAAAACAAGAAGGGTTTCTTCATGGACAATCCTCTCGAGCCTATTGTCTTTTCGCTTTGAGGGATGAGGGTTTCACTCTGCATCCATAGAGGTTGAGAGAAGAGTTCGAATCTCCATCAGGCTCGCTCTCGCTTAAACGTTGCTTATCTTAACCAGACTTTGTGTAAGTTTATGTTGTGGTCAATGGAGGAAACTATT
GAAGGTATGGCCTTGCTGCGAACATTGTGGGACTCTCCACAGTCCTCTCAAGGTAAAGACTTCCAATGGTGTGGGGAGAACAGAGCCGAGGAGGAATGAAGGGAATGGCCATGATGTATCTTAATTTGCAAACACGAGAAAATACAAAATTAGGTGGTTCCAATAACAAATCTGCATTTCTGAAGATTGCCACAACTACC
TTGCTTCACACAACTGGTGAATCTGAGAAGGTGGCATTTGTTGGTCATATCAACAGCTACCTTAGAGATGATCCAGTGATGAAAAGATACCTTCCAATTGATCCTATGACAAATGATCTCTTTGATATAGTGAAAGATGGCATTCTTCTATGgtacgaattctcaattaactaatagttagaaccttgttgcaattatag
gatagttgcatttcattaagtattgagtgtacttggattttatggtttgttcatacaactagttgttgtcatacttctgagaattaagacattgactgtttctgtttctgtgggcatgatgcagTAAAATTCTCAATGTTGCTACTCCTGGCACCATTGATGATTGAGCAATAAATACGAAACCAAAGCTTAATCCATGG
GAAATAAATGAAAATCATACACTTTGTCTCAATTCTTCAAAGTCCATTGGATGCACAATAGTAAATATTGGTACACAGGACAAAAGTGAAATGATCTGTATAGTTGTATATATGTTGTTAAAATACATATTGGAACCGAGGACTTAGATGACAGGATGGTATGTCAAATAAGCTGTATAGTTGATCCCACCTTTATATAT
TAACAATGCCATACCATGTTAGCTCAATTGCAACAGTTGAGTGTTCTAAGTTATATGTCCTAATGATGAAAGATTTAGGGCCGCTGTAATTGGCATAAATATATTTATGCTACATGTATAACTCTCTCTGTTTGGATTTGGGCATTACTTGATGGTGTCATGGTTTAGATCCTTAAATTACATGTTTCATAATTCATAAA
TTAAGGTAAGTGGATTCTTAATAATACCTTGATAAATTTGAAAAAGTTAAGGGTTTCTCTACCTATATATAATATGTCTATATGGTTGCAAATTCT

Intron 2 GTTTGGAGAG ... ACACATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	23.15	156	23	71
A2	22.19	142	33	48
A3	19.11	146	22	47
A4	23.61	110	20	48
A5	16.13	52	8	12
A6	22.28	443	89	165
A7	19.57	668	114	211
A8	19.08	526	80	168
A9	19.2	587	106	173
A10	19.9	489	98	145

>TRINITY_DN42702_c1_g3_i12 from sample A8 / Example spliced isoform

CGAAGGGGTTGTCCATCACGGAATCCCAAACTAACGTTGATCATTAATGAAGTCAGCTAACTAGCTGCTAAGCTTTCCGCAGATATGCAAAGTGGTAGTTCGTAGGTTTTAATGCTTGTATATATATTTGTACTTTCTCCTCGATGGAAAACAAGAAGGGTTTCTTCATGGACAATCCTCTCGAGCCTATTGTCTTTTCG
CTTTGAGGGATGAGGGTTTCACTCTGCATCCATAGAGGTTGAGAGAAGAGTTCGAATCTCCATCAGGCTCGCTCTCGCTTAAACGTTGCTTATCTTAACCAGACTTTGTGTAAGTTTATGTTGTGGTCAATGGAGGAAACTATTGAAGGTATGGCCTTGCTGCGAACATTGTGGGACTCTCCACAGTCCTCTCAAGGTAA
AGACTTCCAATGGTGTGGGGAGAACAGAGCCGAGGAGGAATGAAGGGAATGGCCATGGTAAGCCTCCCTTCATTGGTTTATTAACGTATGGATACCAACTATGTTCGAGTTCTTTTTATTGTGTTAAAGCTCAAATCGAGCTTAGGCTCTTCGAGCCTCTATAAATTTGTGAATACGATCAATAAAGTTTGAATTGGGAC
CTCGCATCCCATTTATGGATTTATATGTTATCAATCTTTCATTTCGTGACTTCTCTGTTTTCCCTTTAAGGTTTTGTATTATATATATATATATATATATGCAATAGTGGGTTCGGATGATCAGAGCAACCAATTTGAAGACCATGCTTTCCGCAATTTCATCTTTATCGCCTCCAAGAGCTGCCCATTTGGTCCCTTAC
CACTTCATTTATGCTCGGGCTCGACTCGGTTCCTTGACTCTTCCGAGGAATCTTGCGCTTATTCTGGCATCCAGACGTCCCGGTTACGAAACCCTCTCGTGGAGGCACTCTGACCTGTCCCTGCCAAGGAGCCCAGGGGAATATTCCCCTGGCCACATGCGCTTCGGTATTCAAGCGGGAAATTTTTTCAAAGAGAGTTA
TAAGAGAACCGAAGGAGAAGTAGACCATGAAGAGGAAGAGGCCCAAAAATCGTTCAGTTTAGTGTGTGAGAAGAAGCAGCAGCATCAGCTCAAAGCCATGGAAGACTTGGGCGTCTATGCAAGTGGAGAAATTCATCTCATATTGGGGCCTATGTTCGCGGGCAAGACAACTGCCCTTATTCGCAAAATACGAGCAGAGA
TTCAAATGGGCAGAAGAGTAATGCTTGTGAAATCTGACAAAGATACAAGATACGGGTTGAACTCAGTTGTGTCTCATGATGGTGCAAAAATGCCTTGCTTGGCTGTTGCAGATCTTGCATCTTTCAAAGATAAATTAGGAGAGGAGGCATACAAGCAGTTAGATGTGATCGGCATTGATGAAGCACAGTTCTTCAAAGAC
CTGTATAGTTTTTGTCAGGTAGCAGCTGATAAAGATGGGAAAACTGTCATTGTTGCTGGCCTTGATGGGGATTATTTGAGGAAGAGCTTTGGATCTGCTCTTGAGTTAATACCTATAGCCGATTCTGTAGTTAAATTGAAATCACGTTGTGAGCTATGTGGTAAGCCTGCATCATTTACATTTCGCAAAACAGGAGATAC
AAAAACTGAAGTTGTTGGTGGTGCAGACATTTACATGCCAGTGTGCCGGCGGCATTATGTAAATGGACAAATTGTTATTGATGCAACAAGGGTTGTGCTGGAATCTCAACAGGTGCAATACGATACTTGTCTACAAGCAACCACATTGGGATAATTATGTCACTATTTTCTGTATAAATCTCTTTTTATTATGTGTATGA
TATACTTATTTACTTCGCTAAATGTCAAAGTTTTTCTTGGCATAATCAAGTGCAATAGTTCTTTTAAGGGGTGGCTTAATGGTTGGTATTGCTCAGGCAAGGAAGGGTTTGACTACTTAGGGGATCTTTGAAAAACACTCTGTAAAAGAACTGGCTAATTCTCAATGTATGGCCTCACAATATGAGAGATTTGTCTTTGC
ATATATTTCTGGCCATGCCAGAGATGCTGAGTTGATTTCAGTGTGTATTTTATGCTTTGCTGGTGGTTACAAGAAAAAAAATCTGGCATCCATTGATTTGCCAAGCCATTGTTATGTTGTCTATATTAAAGTTGCATTCTGATCTGTTGAATATACAATTGTTGAAAATACACATTTGCAATATTGAAAAGTTGAGCTAT
GGTGAACATATTACCATGAGTGGGGTTTGCATTCTTAGAAACGGATACCAAATTCAACTGGCAGTGTTCAGAGAATTGTAGCAGACATGCAGGCAACTAAACGGAATTGAATTCTGTGTGGCTTTCACCAACTGTTGTTGTTTTAGTCAATTGTAAAGTGATCTGTAAGAGATGATAATAGAAACTCATAATTTCCCTGA
GATAAAGAGGTTACAGATCTTGTCGACAGGGAGGTAACCAATATGGGAATTTCCTTGCACTGAATTTTCTTAGTATTTTTTTTTATATTACAGGTCTCAACAATTTCTGTTATTAAATGCATCATGTTAATTGTTGAGGATATTCACAATGTAAAAATTGGGCAATACCTATTTTCCGTGTACTCTAATGATATTTTTGG
GTACTCTGTTTTGTGTACTCTGTTGTGATTGATTAAACATCTTCGGCAGATCTACTGTCCTTATTTTTGATAATTA

>TRINITY_DN42702_c1_g3_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CGAAGGGGTTGTCCATCACGGAATCCCAAACTAACGTTGATCATTAATGAAGTCAGCTAACTAGCTGCTAAGCTTTCCGCAGATATGCAAAGTGGTAGTTCGTAGGTTTTAATGCTTGTATATATATTTGTACTTTCTCCTCGATGGAAAACAAGAAGGGTTTCTTCATGGACAATCCTCTCGAGCCTATTGTCTTTTCG
CTTTGAGGGATGAGGGTTTCACTCTGCATCCATAGAGGTTGAGAGAAGAGTTCGAATCTCCATCAGGCTCGCTCTCGCTTAAACGTTGCTTATCTTAACCAGACTTTGTGTAAGTTTATGTTGTGGTCAATGGAGGAAACTATTGAAGGTATGGCCTTGCTGCGAACATTGTGGGACTCTCCACAGTCCTCTCAAGGTAA
AGACTTCCAATGGTGTGGGGAGAACAGAGCCGAGGAGGAATGAAGGGAATGGCCATGGTAAGCCTCCCTTCATTGGTTTATTAACGTATGGATACCAACTATGTTCGAGTTCTTTTTATTGTGTTAAAGCTCAAATCGAGCTTAGGCTCTTCGAGCCTCTATAAATTTGTGAATACGATCAATAAAGTTTGAATTGGGAC
CTCGCATCCCATTTATGGATTTATATGTTATCAATCTTTCATTTCGTGACTTCTCTGTTTTCCCTTTAAGGTTTTGTATTATATATATATATATATATATGCAATAGTGGGTTCGGATGATCAGAGCAACCAATTTGAAGACCATGCTTTCCGCAATTTCATCTTTATCGCCTCCAAGAGCTGCCCATTTGGTCCCTTAC
CACTTCATTTATGCTCGGGCTCGACTCGGTTCCTTGACTCTTCCGAGGAATCTTGCGCTTATTCTGGCATCCAGACGTCCCGGTTACGAAACCCTCTCGTGGAGGCACTCTGACCTGTCCCTGCCAAGGAGCCCAGGGGAATATTCCCCTGGCCACATGCGCTTCGGTATTCAAGCGGGAAATTTTTTCAAAGAGAGTTA
TAAGAGAACCGAAGGAGAAGTAGACCATGAAGAGGAAGAGGCCCAAAAATCGTTCAGTTTAGTGTGTGAGAAGAAGCAGCAGCATCAGCTCAAAGCCATGGAAGACTTGGGCGTCTATGCAAGTGGAGAAATTCATCTCATATTGGGGCCTATGTTCGCGGGCAAGACAACTGCCCTTATTCGCAAAATACGAGCAGAGA
TTCAAATGGGCAGgtttggagagtctgtaggcttctgttttggtttctgggtggtgttttgggttacgatcgtagattaatcttgctccaggcacactatgtagatctgcttagacttgaaactagatgttggatttcatattctttgatctttcgcctttgtgttgtattgttgaccgattctctagtggttttaagaa
aattgcttagacttacattagatgttgtatctgatgttctttgtccattcttagagggattggacgtgttaagatgaacggggagaatgcatggtgtatatgaacgcttatggagaatcatttcacctgattcacccaacgtcctttaccatgatcgtggagtgctgatgttataagtgcagccctatgaagttatagac
atgggttacctaatgtcccaaaattgttttttatttcaattttcgagctggtgaagcatagagctcaagcctaactccatgcttacatggtaacagcattatcactgtgtggcttgggaggtccaaactgtctgcttacgatttttcaatcgtctaccacattggctgtctacagtacagctgtgttctcaaatatctgt
gtctctacgcttattatgaatcccctttttaggaacatagctttatttcctatgcagatatgtctactcctcgttcaaggtgattatccaatatatctgatagtaattcgtgctcaagccagatagtttactcctcattcaaggtgattatccaatatatctgatagtcattggttctcaagcctcccctcacttgtgtg
cattgactgtataatgctcatatctatgtctaaaatactcaaagatctgacagaatcagcaatgtgtgcctccttgtttgcacatgttttcatccgagggccctcattctttaattccctccaatatcctgtaaaaagatgaaacttgagttttatggcattgatattccccagcattgttcctgccctctcactgtatc
gaatgatttcaggcatggcatgtttaaaaggacaatattgtagttctaagcgttgactgtacaattctccaggcaaaagattcagtgataagtgctttgattcatttgtgtttaaatgtaaatgtattgctgctatagtatatagagatctgattatggataaatcttttttgtttttgacacatgcagAAGAGTAATGC
TTGTGAAATCTGACAAAGATACAAGATACGGGTTGAACTCAGTTGTGTCTCATGATGGTGCAAAAATGCCTTGCTTGGCTGTTGCAGATCTTGCATCTTTCAAAGATAAATTAGGAGAGGAGGCATACAAGCAGTTAGATGTGATCGGCATTGATGAAGCACAGTTCTTCAAAGACCTGTATAGTTTTTGTCAGGTAGCA
GCTGATAAAGATGGGAAAACTGTCATTGTTGCTGGCCTTGATGGGGATTATTTGAGGAAGAGCTTTGGATCTGCTCTTGAGTTAATACCTATAGCCGATTCTGTAGTTAAATTGAAATCACGTTGTGAGCTATGTGGTAAGCCTGCATCATTTACATTTCGCAAAACAGGAGATACAAAAACTGAAGTTGTTGGTGGTGC
AGACATTTACATGCCAGTGTGCCGGCGGCATTATGTAAATGGACAAATTGTTATTGATGCAACAAGGGTTGTGCTGGAATCTCAACAGGTGCAATACGATACTTGTCTACAAGCAACCACATTGGGATAATTATGTCACTATTTTCTGTATAAATCTCTTTTTATTATGTGTATGATATACTTATTTACTTCGCTAAATG
TCAAAGTTTTTCTTGGCATAATCAAGTGCAATAGTTCTTTTAAGGGGTGGCTTAATGGTTGGTATTGCTCAGGCAAGGAAGGGTTTGACTACTTAGGGGATCTTTGAAAAACACTCTGTAAAAGAACTGGCTAATTCTCAATGTATGGCCTCACAATATGAGAGATTTGTCTTTGCATATATTTCTGGCCATGCCAGAGA
TGCTGAGTTGATTTCAGTGTGTATTTTATGCTTTGCTGGTGGTTACAAGAAAAAAAATCTGGCATCCATTGATTTGCCAAGCCATTGTTATGTTGTCTATATTAAAGTTGCATTCTGATCTGTTGAATATACAATTGTTGAAAATACACATTTGCAATATTGAAAAGTTGAGCTATGGTGAACATATTACCATGAGTGGG
GTTTGCATTCTTAGAAACGGATACCAAATTCAACTGGCAGTGTTCAGAGAATTGTAGCAGACATGCAGGCAACTAAACGGAATTGAATTCTGTGTGGCTTTCACCAACTGTTGTTGTTTTAGTCAATTGTAAAGTGATCTGTAAGAGATGATAATAGAAACTCATAATTTCCCTGAGATAAAGAGGTTACAGATCTTGTC
GACAGGGAGGTAACCAATATGGGAATTTCCTTGCACTGAATTTTCTTAGTATTTTTTTTTATATTACAGGTCTCAACAATTTCTGTTATTAAATGCATCATGTTAATTGTTGAGGATATTCACAATGTAAAAATTGGGCAATACCTATTTTCCGTGTACTCTAATGATATTTTTGGGTACTCTGTTTTGTGTACTCTGTT
GTGATTGATTAAACATCTTCGGCAGATCTACTGTCCTTATTTTTGATAATTA

Intron 3 GTAGAGTTGG ... CCCTTGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	27.51	191	51	94
A2	26.24	149	36	70
A3	25.69	162	27	85
A4	24.42	130	24	60
A5	30.14	51	11	33
A6	25.98	761	152	382
A7	26.36	1004.3	194	525
A8	25.32	979	200	464
A9	26	943.5	216	447
A10	27.75	705.5	106	436

>TRINITY_DN42702_c1_g3_i4 from sample A8 / Example spliced isoform

CGAAGGGGTTGTCCATCACGGAATCCCAAACTAACGTTGATCATTAATGAAGTCAGCTAACTAGCTGCTAAGCTTTCCGCAGATATGCAAAGTGGTAGTTCGTAGGTTTTAATGCTTGTATATATATTTGTACTTTCTCCTCGATGGAAAACAAGAAGGGTTTCTTCATGGACAATCCTCTCGAGCCTATTGTCTTTTCG
CTTTGAGGGATGAGGGTTTCACTCTGCATCCATAGAGGTTGAGAGAAGAGTTCGAATCTCCATCAGGCTCGCTCTCGCTTAAACGTTGCTTATCTTAACCAGACTTTGTGTAAGTTTATGTTGTGGTCAATGGAGGAAACTATTGAAGGTATGGCCTTGCTGCGAACATTGTGGGACTCTCCACAGTCCTCTCAAGGTAA
AGACTTCCAATGGTGTGGGGAGAACAGAGCCGAGGAGGAATGAAGGGAATGGCCATGGTAAGCCTCCCTTCATTGGTTTATTAACGTATGGATACCAACTATGTTCGAGTTCTTTTTATTGTGTTAAAGCTCAAATCGAGCTTAGGCTCTTCGAGCCTCTATAAATTTGTGAATACGATCAATAAAGTTTGAATTGGGAC
CTCGCATCCCATTTATGGATTTATATGTTATCAATCTTTCATTTCGTGACTTCTCTGTTTTCCCTTTAAGGTTTTGTATTATATATATATATATATATATGCAATAGTGGGTTCGGATGATCAGAGCAACCAATTTGAAGACCATGCTTTCCGCAATTTCATCTTTATCGCCTCCAAGAGCTGCCCATTTGGTCCCTTAC
CACTTCATTTATGCTCGGGCTCGACTCGGTTCCTTGACTCTTCCGAGGAATCTTGCGCTTATTCTGGCATCCAGACGTCCCGGTTACGAAACCCTCTCGTGGAGGCACTCTGACCTGTCCCTGCCAAGGAGCCCAGGGGAATATTCCCCTGGCCACATGCGCTTCGGTATTCAAGCGGGAAATTTTTTCAAAGAGAGTTA
TAAGAGAACCGAAGGAGAAGTAGACCATGAAGAGGAAGAGGCCCAAAAATCGTTCAGTTTAGTGTGTGAGAAGAAGCAGCAGCATCAGCTCAAAGCCATGGAAGACTTGGGCGTCTATGCAAGTGGAGAAATTCATCTCATATTGGGGCCTATGTTCGCGGGCAAGACAACTGCCCTTATTCGCAAAATACGAGCAGAGA
TTCAAATGGGCAGGTTTGGAGAGTCTGTAGGCTTCTGTTTTGGTTTCTGGGTGGTGTTTTGGGTTACGATCGTAGATTAATCTTGCTCCAGGCACACTATGTAGATCTGCTTAGACTTGAAACTAGATGTTGGATTTCATATTCTTTGATCTTTCGCCTTTGTGTTGTATTGTTGACCGATTCTCTAGTGGTTTTAAGAA
AATTGCTTAGACTTACATTAGATGTTGTATCTGATGTTCTTTGTCCATTCTTAGAGGGATTGGACGTGTTAAGATGAACGGGGAGAATGCATGGTGTATATGAACGCTTATGGAGAATCATTTCACCTGATTCACCCAACGTCCTTTACCATGATCGTGGAGTGCTGATGTTATAAGTGCAGCCCTATGAAGTTATAGAC
ATGGGTTACCTAATGTCCCAAAATTGTTTTTTATTTCAATTTTCGAGCTGGTGAAGCATAGAGCTCAAGCCTAACTCCATGCTTACATGGTAACAGCATTATCACTGTGTGGCTTGGGAGGTCCAAACTGTCTGCTTACGATTTTTCAATCGTCTACCACATTGGCTGTCTACAGTACAGCTGTGTTCTCAAATATCTGT
GTCTCTACGCTTATTATGAATCCCCTTTTTAGGAACATAGCTTTATTTCCTATGCAGATATGTCTACTCCTCGTTCAAGGTGATTATCCAATATATCTGATAGTAATTCGTGCTCAAGCCAGATAGTTTACTCCTCATTCAAGGTGATTATCCAATATATCTGATAGTCATTGGTTCTCAAGCCTCCCCTCACTTGTGTG
CATTGACTGTATAATGCTCATATCTATGTCTAAAATACTCAAAGATCTGACAGAATCAGCAATGTGTGCCTCCTTGTTTGCACATGTTTTCATCCGAGGGCCCTCATTCTTTAATTCCCTCCAATATCCTGTAAAAAGATGAAACTTGAGTTTTATGGCATTGATATTCCCCAGCATTGTTCCTGCCCTCTCACTGTATC
GAATGATTTCAGGCATGGCATGTTTAAAAGGACAATATTGTAGTTCTAAGCGTTGACTGTACAATTCTCCAGGCAAAAGATTCAGTGATAAGTGCTTTGATTCATTTGTGTTTAAATGTAAATGTATTGCTGCTATAGTATATAGAGATCTGATTATGGATAAATCTTTTTTGTTTTTGACACATGCAGAAGAGTAATGC
TTGTGAAATCTGACAAAGATACAAGATACGGGTTGAACTCAGTTGTGTCTCATGATGGTGCAAAAATGCCTTGCTTGGCTGTTGCAGATCTTGCATCTTTCAAAGATAAATTAGGAGAGGAGGCATACAAGCAGTTAGATGTGATCGGCATTGATGAAGCACAGTTCTTCAAAGACCTGTATAGTTTTTGTCAGGTAGCA
GCTGATAAAGATGGGAAAACTGTCATTGTTGCTGGCCTTGATGGGGATTATTTGAGGAAGAGCTTTGGATCTGCTCTTGAGTTAATACCTATAGCCGATTCTGTAGTTAAATTGAAATCACGTTGTGAGCTATGTGGTAAGCCTGCATCATTTACATTTCGCAAAACAGGAGATACAAAAACTGAAGTTGTTGGTGGTGC
AGACATTTACATGCCAGTGTGCCGGCGGCATTATGTAAATGGACAAATTGTTATTGATGCAACAAGGGTTGTGCTGGAATCTCAACAGGTGCAATACGATACTTGTCTACAAGCAACCACATTGGGATAATTATGTCACTATTTTCTGTATAAATCTCTTTTTATTATGTGTATGATATACTTATTTACTTCGCTAAATG
TCAAAGTTTTTCTTGGCATAATCAAGTGCAATAGTTCTTTTAAGGGGTGGCTTAATGGTTGGTATTGCTCAGGCAAGGAAGGGTTTGACTACTTAGGGGATCTTTGAAAAACACTCTGTAAAAGAACTGGCTAATTCTCAATGTATGGCCTCACAATATGAGAGATTTGTCTTTGCATATATTTCTGGCCATGCCAGAGA
TGCTGAGTTGATTTCAGTGTGTATTTTATGCTTTGCTGGTGGTTACAAGAAAAAAAATCTGGCATCCATTGATTTGCCAAGCCATTGTTATGTTGTCTATATTAAAGTTGCATTCTGATCTGTTGAATATACAATTGTTGAAAATACACATTTGCAATATTGAAAAGTTGAGCTATGGTGAACATATTACCATGAGTGGG
GTTTGCATTCTTAGAAACGGATACCAAATTCAACTGGCAGTGTTCAGAGAATTGTAGCAGACATGCAGGCAACTAAACGGAATTGAATTCTGTGTGGCTTTCACCAACTGTTGTTGTTTTAGTCAATTGTAAAGTGATCTGTAAGAGATGATAATAGAAACTCATAATTTCCCTGAGATAAAGAGGTTACAGATCTTGTC
GACAGGGAGGTAACCAATATGGGAATTTCCTTGCACTGAATTTTCTTAGTATTTTTTTTTATATTACAGGTCTCAACAATTTCTGTTATTAAATGCATCATGTTAATTGTTGAGGATATTCACAATGTAAAAATTGGGCAATACCTATTTTCCGTGTACTCTAATGATATTTTTGGGTACTCTGTTTTGTGTACTCTGTT
GTGATTGATTAAACATCTTCGGCAGATCTACTGTCCTTATTTTTGATAATTA

>TRINITY_DN42702_c1_g3_i11 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CTTGGTTTGGGCCCAGGGCTGGGCTGGAGAGTCGATGATTGTCGTGAGAACGTGAGGGTTTTAGGAGGGTTTTGGTCCTTTCCTTGCCGAGCACATGCTCTTTCCCTGACCGATTACCCTCGTTTTACTGAGAATCCCCGACTCAGCTTCAACTGGGCAATGTCCAAACTCAAACCAGTGTTGACGGCAACCTCGGTTTT
CTTCATGGGTACTCTGAACACCTAAATTTTAACTCCATTCCATTTTTTTCCCTGTATTCCTATTGTATATATTGTATTATACCCATTTACGTATTGCCATTGTGGAGGAAGGGGAAGCCGAAGGGGTTTGGGTTTGTGAAATCACATACACATTGTATTATATATATATATATATATATGCAATAGTGGGTTCGGATGAT
CAGAGCAACCAATTTGAAGACCATGCTTTCCGCAATTTCATCTTTATCGCCTCCAAGAGCTGCCCATTTGGTCCCTTACCACTTCATTTATGCTCGGGCTCGACTCGGTTCCTTGACTCTTCCGAGGAATCTTGCGCTTATTCTGGCATCCAGACGTCCCGGTTACGAAACCCTCTCGTGGAGGCACTCTGACCTGTCCC
TGCCAAGGAGCCCAGGGGAATATTCCCCTGGCCACATGCGCTTCGGTATTCAAGCGGGAAATTTTTTCAAAGAGAGTTATAAGAGAACCGAAGGAGAAGTAGACCATGAAGAGGAAGAGGCCCAAAAATCGTTCAGTTTAGTGTGTGAGAAGAAGCAGCAGCATCAGCTCAAAGCCATGGAAGACTTGGGCGTCTATGCA
AGTGGAGAAATTCATCTCATATTGGGGCCTATGTTCGCGGGCAAGACAACTGCCCTTATTCGCAAAATACGAGCAGAGATTCAAATGGGCAGAAGAGTAATGCTTGTGAAATCTGACAAAGATACAAGATACGGGTTGAACTCAGTTGTGTCTCATGATGGTGCAAAAATGCCTTGCTTGGCTGTTGCAGATCTTGCATC
TTTCAAAGATAAATTAGGAGAGGAGGCATACAAGCAGTTAGATGTGATCGGCATTGATGAAGCACAGTTCTTCAAAGACCTGTATAGTTTTTGTCAGGTAGCAGCTGATAAAGATGGGAAAACTGTCATTGTTGCTGGCCTTGATGGGGATTATTTGAGgtagagttggttgaggtggaggttttgattttagtcgagat
taggtgctattttataagctggaaagatgaatgtgaacctaaatttttaaagattgtattgaattttggtgttcagagtataaggagagcagtgcaattttttatttgttttctttgggaaatatgcactatattgtttttgttttcaatgtttttaatagcgctggaggaatatcgtttctgaaatatttttctgctta
ttgatgttcccttggcagGAAGAGCTTTGGATCTGCTCTTGAGTTAATACCTATAGCCGATTCTGTAGTTAAATTGAAATCACGTTGTGAGCTATGTGGTAAGCCTGCATCATTTACATTTCGCAAAACAGGAGATACAAAAACTGAAGTTGTTGGTGGTGCAGACATTTACATGCCAGTGTGCCGGCGGCATTATGTAA
ATGGACAAATTGTTATTGATGCAACAAGGGTTGTGCTGGAATCTCAACAGGTGCAATACGATACTTGTCTACAAGCAACCACATTGGGATAATTATGTCACTATTTTCTGTATAAATCTCTTTTTATTATGTGTATGATATACTTATTTACTTCGCTAAATGTCAAAGTTTTTCTTGGCATAATCAAGTGCAATAGTTCT
TTTAAGGGGTGGCTTAATGGTTGGTATTGCTCAGGCAAGGAAGGGTTTGACTACTTAGGGGATCTTTGAAAAACACTCTGTAAAAGAACTGGCTAATTCTCAATGTATGGCCTCACAATATGAGAGATTTGTCTTTGCATATATTTCTGGCCATGCCAGAGATGCTGAGTTGATTTCAGTGTGTATTTTATGCTTTGCTG
GTGGTTACAAGAAAAAAAATCTGGCATCCATTGATTTGCCAAGCCATTGTTATGTTGTCTATATTAAAGTTGCATTCTGATCTGTTGAATATACAATTGTTGAAAATACACATTTGCAATATTGAAAAGTTGAGCTATGGTGAACATATTACCATGAGTGGGGTTTGCATTCTTAGAAACGGATACCAAATTCAACTGGC
AGTGTTCAGAGAATTGTAGCAGACATGCAGGCAACTAAACGGAATTGAATTCTGTGTGGCTTTCACCAACTGTTGTTGTTTTAGTCAATTGTAAAGTGATCTGTAAGAGATGATAATAGAAACTCATAATTTCCCTGAGATAAAGAGGTTACAGATCTTGTCGACAGGGAGGTAACCAATATGGGAATTTCCTTGCACTG
AATTTTCTTAGTATTTTTTTTTATATTACAGGTCTCAACAATTTCTGTTATTAAATGCATCATGTTAATTGTTGAGGATATTCACAATGTAAAAATTGGGCAATACCTATTTTCCGTGTACTCTAATGATATTTTTGGGTACTCTGTTTTGTGTACTCTGTTGTGATTGATTAAACATCTTCGGCAGATCTACTGTCCTT
ATTTTTGATAATTA