NA ----> NA
Intron 1 ATCCTGAGAT ... GCATGCGCAC
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 80.65 | 3 | 9 | 16 |
| A2 | 40 | 9 | 5 | 7 |
| A3 | 48.15 | 7 | 6 | 7 |
| A4 | 37.5 | 5 | 2 | 4 |
| A5 | 41.67 | 7 | 4 | 6 |
| A6 | 42.86 | 4 | 2 | 4 |
| A7 | 58.82 | 7 | 6 | 14 |
| A8 | 57.14 | 6 | 8 | 8 |
| A9 | 70 | 9 | 13 | 29 |
| A10 | 56.92 | 14 | 15 | 22 |
>TRINITY_DN47870_c1_g1_i2 from sample A10 / Example spliced isoformTGAGATAACGTCTATATTGCCGCTATTGTTTACAAAAAAATAAATCTCTTAGGTAACAAAGATCAGGGTAGTTGAGATACGTATAAACGATTTACCTTGTTAGAATCTTGTTTATGCGGTTATTGCTGCCTGGGATGGCATGAATGTTGAAGATATCATATAGCTCGATTCCTGGTGTTAACTCTGTTTGTGGGATCTTT
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>TRINITY_DN47870_c1_g1_i8 from sample A10 / Example unspliced isoform:TGAGATAACGTCTATATTGCCGCTATTGTTTACAAAAAAATAAATCTCTTAGGTAACAAAGATCAGGGTAGTTGAGATACGTATAAACGATTTACCTTGTTAGAATCTTGTTTATGCGGTTATTGCTGCCTGGGATGGCATGAATGTTGAAGATATCATATAGCTCGATTCCTGGTGTTAACTCTGTTTGTGGGATCTTT
TCCTGTGCGTTTAAGCCACTACTTCGTGGTTCCACTAACTGCTATAGAAGTCGTGGGTTTTGGTGTGGTTGTGTCATGGTGCCATTACAGTTTGTTATTCTATGGCCCGCGTGATTACTTAAATGGTTACTCTCTTTATTTTCCTGCGCACATGCTGAGATAGCATGGTTACTCTTCTTGTTGCATGCGTACATGCTGAG
ATGGTTACTCTTCTTGTTGCATGCGCACatcctgagatagcatggttactctctttatattttcttgtgcacatgttgagatatcatggttactcttcttcttgcatgcgcacATGCTGAGATAGCATGATTACTCTCTTTATTTGCCTGCGCACATGCTGAGATATCATGGTTACTCTTCTTGTTGCATGCGCACATGC
TGAGATAGCATGATTACTCTTTTGTTGCCTGCGCACATGTTGGAGATAACATCTCTGTTTTCTTTGTGTGTTTATTTCCTGTGAAAACGTGTTACGCTACCACCGATAAATATATACATGCTCTGTATAAATGTTATGCTGCTTGTTGTATGCATGGAATACCACCGATAGATATACATGCTCTATATAAACGTTACGTT
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TTATATTCTGTATAATGTTGTATGCATTGGGTGCATATTAATTATGTGGTAGGCATGGAGCATGTTGATTGTTGTTTAAAAGTATTCATTCTCATATTAAAATGTTACATGCCGAGTGTTGGAGCATGTTGTTTGTTATTTAAAAGTATTCATTCTCATATTAAAATGTTGCATGCCGAGTGTTGGAGCATGTT