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Intron 1 GTAAGAAATA ... GTTTATGCAG

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>TRINITY_DN119323_c0_g2_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
AATTTGTAAGGAGATGGAAATTTGTAATCTCTTTACTTCCACGGGAACAAACCATGTCAATGATTCAAACCCTAAACTATCGAATGAATATAGCTTTATAAATCAATCACTAGTAACCATAGGAGCTAGGGTTACATGACTCTTGGATTTAACTCTTAGGTCAATAATCAGGGGCACGCGGAAGAAACCCTTGCTTAACA
TTAATCAAGGGCACGCGGAAGAAATCCTTGCATCCATTTGTTGAATCTGCGGGAGTGCTCACCACTATGGACCCACACCACGGATTAAACTCATGAATTCAACTTTTTATTTTGTGGTTTCAAGTGTCAATCAGCGAAGCTCGCGTGCTGGCGGATTTCCACTTGCGCCAGACTGCTAACGGGTGGAAATGCTTTTATTT
CCATTTTAATCAAAACTTCTCTGCTGCTTTGAAAGTGTTGTGTTCGAATCCTGGGCTTCGGAGCTTTGGCGGGTTTTGTCGGGGCTTTTCTTCTCTCCAGGAGAAGATAAGGTATGCTGTAATCACTGGAAGCTACATGGTAGCTGTTAGCCCTCTTCAGGCATGGATTGTTCTTTGACTGTTTCAACATCGGAACTGTC
ACTGTAAATCCCAAGTTCTTCTGAAGCTTTAAGCATTAGAATTTAAAAAGGCAAAGTTCTTGTGATGGCGTTTGCCGTGGATGAAGGCCATAGCCATCCGGAGTTTCGCAAAATTCCAGTCATAGATTTACGGTTTCTGTCTCAAGATGAGATCAATTGCGCAGCCCAGTGGTCAGACGAGGACACGGAATTACAGCTCA
AGGATATTGTAATCCCTAAAATAGACCGCTCCATTTTTAATGAGAGTGCCGGTAGTCGCAAGCAAACATATTCGAGACTGCGGTTTTCTCAGAGAAAAGAGGAACTTGGAGGTCTTTCAAGACGCAGAGCTGGGCTTCTTAGTGTGTCGAGACACTCTGTTGAAGTTGGGATAACGCCGACTATACGAAGGAAACCTGCA
AATGGATCTGACCTAAAGGATAACAGTCAGATCTTGCAGCTGTTGAAGGGGCTGTTCACGAAAGGAGATCGATCCTTGACATGTAACGAAGCACCCAAAGTACAGTTGTCAAACCCTCCTCTGAACTCAGAAAGTGGCAGCAATCGTTCTTCAAATGTCACCCACAATATACAAAGTTGCAATGGGAAACAAGATTCTGG
TCCCGAGCCAGCGAACAATCTGCAGTTAGTTGTTAGGGATCCCGAAATGGAGACTGAAGGTCTAAGTGCAGTCATTCAGGGAACACACAATGAACAATTTAATGACAATGCAGACCGGGAAATCTCCGATGCTAGGATTTCAGATACACAGATGGAGTCAAAGACAACTCTGGATGCAGACAGGAGTAGGCCTCTAGTGG
ACGGTAGTGTGGATAGACCGAAAAAGAGGATGAGAACAAAAGAGGATGCAAGAAGGAAGGCGTTTGCAAATGCAGAAGAACAAATTGCGATGAGAGCATCAATGTCTATTAAGAATAATACTATTGTGGATGATTGCAGCCATACTGATACAAAGGCAGTAGGAAGTCCAGATGATAAAACTTTCAGCGAATCCAGCCAT
ACTGACACAACAATTATTAGATCTATGCAGGACAATACTGTGAATAACTCTCCCACTGACAAAAAAGTAGAAGATGTGAATGATGTGCCACCACAAAAAGGTGCCAAATTTGGCGGCAAGGGTTGTTCATCGACTGCACAAGAACCTTCTGTGGCTCAATTAAAGAGAAAATTTCCACCTTTAAAAACAGAAGCTCAATT
GCAGGATTTTTTTGACAAAGTAGGTGGCCAATGGGCATCTAAGAGGGAGAGGCGTAAGATTGTGGATGCTAGAGATTTTGGTGATGGATTTCCTGAAGGTTGGAAACTTCTATTGGGTGTTAGAAAAAAGGATGGTCGGTTTTTGATTGAATGCCGCAATTATATAAGCCCAGAGGGCCGCAAATTAAAATCCTGCCGTG
AAGTTTCTGCTCATATGCTTTCAACCCGTATGCACTGCCCAGCTGTTGGAACTGCCCAACAACCATCTGGCAACTCAACAAACCCAGTGGATAGCAGTGGAGAATGTTCTAAACAACAGACTGCCCATTTGAATGGCGTTGCCTTTCTTAATGCTGAAGAGCAACAAACATCACAAAGTAATGCTTCACCTATGACAGTG
GTTAAGGTTGAAGGAAATTCAATAAAGGATAACTGTGTTATTGCTTCAGATACTTCAGTTAAATGCTCAAAAGGCGACTTAAACTTAAGTAACAGAAGTGATTCAATGGCACATTTGACTGGTCATCACACCCAGAAGGTGAAAAAAACAAGCACTTCTAAGTCAATTGTGGATGGTGTAATCATGATAAATGGTAAATA
TGAATGTCAAATATGCCATAAAGTTTTCAACGAGAGGAATCGTTACACTGGCCATGTTGGTGTTCATGTGAGAAATGCAAAAAGGCTTCTTGATCCCCAGGGCGAAATCTCTAGTGGAGGCAAAGCAGACATTCATCCTCCTGAAACTTTTGGTAACGAGTTTAAGGACTACAGCAATGTTGATTCCACCATGGCAACCA
CAGGTACTAAACCCTGTGATCAGCAAGAGCAAAATGGAAATATGGCTTTGGGAACAATTCTAGATTCGTCATCACCTTCAGGAGAAAATGACTTTACATCTTCGCATGATGTGGGGATCCTCAGTACATTAGACATATCAGCAAAGGATGAGATTGATTTTAATTCTGAAACTCAGAAGCTTGATAGTCTGAAAGGCTTT
GAAGAGTTTCAGATGGAGTATGCTCATTCGCCAAAGTTTGCATTTCAAACGGGCCAGGATACGGACAGTGTGATTGATGCACAATTAGACTTAGGCTTAGATGCGGGTGTTTTGCAGCAGGAAATTGATCCTCCTGGTCAGTTTGAGTGGGAGAGTGTCTTATCCAAGATAGAGAATAGTTCTCAGGTCTTTGTCTGTGT
CTGGTGTAATTCAGAGTTCAGCCATGATGGCCTTGATGAGGAACTCCAAGCAGACTCTGTTGGCTTCATTTGTTCACACTGCAAGAATAAGATTTCAGGGCAAATTGATATTTAAATGGTATCGAGACTATGCCACGAGTCATTTGGGAGGAAATTTGACTCTAAGTAAGCATGCAGTCTTCTTTTCTGCCTTATGGATC
TGCCTTATTGTTGGCAATTGATCTAACGTGCTCTAGGAGAATGTGTTTTCAAATTTTCCCCTGAGCCAATAAGGAAAGATTCAGTTTAAAATATCATGTTGGAGAAGTCCCGACATTGCTTTGCCGAGGTAAAAATGCTGTGTTTATGCAGGCTATGCCATGAGTCATTTGGGAGGAAATGTGACCGTTTAAATAGCCAC
TGCAGTTTCCTTTTTCCGACTTACGGAATTCCCGTATTGTTGGCAAGTGATCTAACATGCTCCTAGAAGAATGTGTTTTGGAATTTTCCCCTAGGCCCACAAGGCAGGGTTCAGGTTAAAATGCCATGTTGGAGAAGTCTGACCATTGCTTTTTCGTTATGTAGATCTGTTGGTATTATATAACTTTTCTATGACCGATA
TTGTTTATGTCGATGAATTTATATACTCCTTATTCAATGTTTCCACAAGGTTTGGTTCTTTCGATTGCATTTTCCTTCTTTGTTTCTGTTTTCAATGAAGGTGAATGCATTCATTGTAATGCAATCTTCAAACTTCTCGTTTTGCAGAAACATGTTATATAATTGAAG


>TRINITY_DN119323_c0_g2_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AATTTGTAAGGAGATGGAAATTTGTAATCTCTTTACTTCCACGGGAACAAACCATGTCAATGATTCAAACCCTAAACTATCGAATGAATATAGCTTTATAAATCAATCACTAGTAACCATAGGAGCTAGGGTTACATGACTCTTGGATTTAACTCTTAGGTCAATAATCAGGGGCACGCGGAAGAAACCCTTGCTTAACA
TTAATCAAGGGCACGCGGAAGAAATCCTTGCATCCATTTGTTGAATCTGCGGGAGTGCTCACCACTATGGACCCACACCACGGATTAAACTCATGAATTCAACTTTTTATTTTGTGGTTTCAAGTGTCAATCAGCGAAGCTCGCGTGCTGGCGGATTTCCACTTGCGCCAGACTGCTAACGGGTGGAAATGCTTTTATTT
CCATTTTAATCAAAACTTCTCTGCTGCTTTGAAAGTGTTGTGTTCGAATCCTGGGCTTCGGAGCTTTGGCGGGTTTTGTCGGGGCTTTTCTTCTCTCCAGGAGAAGATAAGGTATGCTGTAATCACTGGAAGCTACATGGTAGCTGTTAGCCCTCTTCAGGCATGGATTGTTCTTTGACTGTTTCAACATCGGAACTGTC
ACTGTAAATCCCAAGTTCTTCTGAAGCTTTAAGCATTAGAATTTAAAAAGGCAAAGTTCTTGTGATGGCGTTTGCCGTGGATGAAGGCCATAGCCATCCGGAGTTTCGCAAAATTCCAGTCATAGATTTACGGTTTCTGTCTCAAGATGAGATCAATTGCGCAGCCCAGTGGTCAGACGAGGACACGGAATTACAGCTCA
AGGATATTGTAATCCCTAAAATAGACCGCTCCATTTTTAATGAGAGTGCCGGTAGTCGCAAGCAAACATATTCGAGACTGCGGTTTTCTCAGAGAAAAGAGGAACTTGGAGGTCTTTCAAGACGCAGAGCTGGGCTTCTTAGTGTGTCGAGACACTCTGTTGAAGTTGGGATAACGCCGACTATACGAAGGAAACCTGCA
AATGGATCTGACCTAAAGGATAACAGTCAGATCTTGCAGCTGTTGAAGGGGCTGTTCACGAAAGGAGATCGATCCTTGACATGTAACGAAGCACCCAAAGTACAGTTGTCAAACCCTCCTCTGAACTCAGAAAGTGGCAGCAATCGTTCTTCAAATGTCACCCACAATATACAAAGTTGCAATGGGAAACAAGATTCTGG
TCCCGAGCCAGCGAACAATCTGCAGTTAGTTGTTAGGGATCCCGAAATGGAGACTGAAGGTCTAAGTGCAGTCATTCAGGGAACACACAATGAACAATTTAATGACAATGCAGACCGGGAAATCTCCGATGCTAGGATTTCAGATACACAGATGGAGTCAAAGACAACTCTGGATGCAGACAGGAGTAGGCCTCTAGTGG
ACGGTAGTGTGGATAGACCGAAAAAGAGGATGAGAACAAAAGAGGATGCAAGAAGGAAGGCGTTTGCAAATGCAGAAGAACAAATTGCGATGAGAGCATCAATGTCTATTAAGAATAATACTATTGTGGATGATTGCAGCCATACTGATACAAAGGCAGTAGGAAGTCCAGATGATAAAACTTTCAGCGAATCCAGCCAT
ACTGACACAACAATTATTAGATCTATGCAGGACAATACTGTGAATAACTCTCCCACTGACAAAAAAGTAGAAGATGTGAATGATGTGCCACCACAAAAAGGTGCCAAATTTGGCGGCAAGGGTTGTTCATCGACTGCACAAGAACCTTCTGTGGCTCAATTAAAGAGAAAATTTCCACCTTTAAAAACAGAAGCTCAATT
GCAGGATTTTTTTGACAAAGTAGGTGGCCAATGGGCATCTAAGAGGGAGAGGCGTAAGATTGTGGATGCTAGAGATTTTGGTGATGGATTTCCTGAAGGTTGGAAACTTCTATTGGGTGTTAGAAAAAAGGATGGTCGGTTTTTGATTGAATGCCGCAATTATATAAGCCCAGAGGGCCGCAAATTAAAATCCTGCCGTG
AAGTTTCTGCTCATATGCTTTCAACCCGTATGCACTGCCCAGCTGTTGGAACTGCCCAACAACCATCTGGCAACTCAACAAACCCAGTGGATAGCAGTGGAGAATGTTCTAAACAACAGACTGCCCATTTGAATGGCGTTGCCTTTCTTAATGCTGAAGAGCAACAAACATCACAAAGTAATGCTTCACCTATGACAGTG
GTTAAGGTTGAAGGAAATTCAATAAAGGATAACTGTGTTATTGCTTCAGATACTTCAGTTAAATGCTCAAAAGGCGACTTAAACTTAAGTAACAGAAGTGATTCAATGGCACATTTGACTGGTCATCACACCCAGAAGGTGAAAAAAACAAGCACTTCTAAGTCAATTGTGGATGGTGTAATCATGATAAATGGTAAATA
TGAATGTCAAATATGCCATAAAGTTTTCAACGAGAGGAATCGTTACACTGGCCATGTTGGTGTTCATGTGAGAAATGCAAAAAGGCTTCTTGATCCCCAGGGCGAAATCTCTAGTGGAGGCAAAGCAGACATTCATCCTCCTGAAACTTTTGGTAACGAGTTTAAGGACTACAGCAATGTTGATTCCACCATGGCAACCA
CAGGTACTAAACCCTGTGATCAGCAAGAGCAAAATGGAAATATGGCTTTGGGAACAATTCTAGATTCGTCATCACCTTCAGGAGAAAATGACTTTACATCTTCGCATGATGTGGGGATCCTCAGTACATTAGACATATCAGCAAAGGATGAGATTGATTTTAATTCTGAAACTCAGAAGCTTGATAGTCTGAAAGGCTTT
GAAGAGTTTCAGATGGAGTATGCTCATTCGCCAAAGTTTGCATTTCAAACGGGCCAGGATACGGACAGTGTGATTGATGCACAATTAGACTTAGGCTTAGATGCGGGTGTTTTGCAGCAGGAAATTGATCCTCCTGGTCAGTTTGAGTGGGAGAGTGTCTTATCCAAGATAGAGAATAGTTCTCAGGTCTTTGTCTGTGT
CTGGTGTAATTCAGAGTTCAGCCATGATGGCCTTGATGAGGAACTCCAAGCAGACTCTGTTGGCTTCATTTGTTCACACTGCAAGAATAAGATTTCAGGGCAAATTGATATTTAAATGGTATCGAGgtaagaaatatttcaattggcaaaataaagaagtgatctgttttactggagcgatttggtcactttattccaca
atataggacagttatctagagaaatagaaaaagttacggaaccccgtagtaaaatcgtctttggacaaaattctactttcatgtctgacataattgcgtaactgaggctaaaatgctctgtttatgcag
ACTATGCCACGAGTCATTTGGGAGGAAATTTGACTCTAAGTAAGCATGCAGTCTTCTTTTCTGCCTTATGG
ATCTGCCTTATTGTTGGCAATTGATCTAACGTGCTCTAGGAGAATGTGTTTTCAAATTTTCCCCTGAGCCAATAAGGAAAGATTCAGTTTAAAATATCATGTTGGAGAAGTCCCGACATTGCTTTGCCGAGGTAAAAATGCTGTGTTTATGCAGGCTATGCCATGAGTCATTTGGGAGGAAATGTGACCGTTTAAATAGC
CACTGCAGTTTCCTTTTTCCGACTTACGGAATTCCCGTATTGTTGGCAAGTGATCTAACATGCTCCTAGAAGAATGTGTTTTGGAATTTTCCCCTAGGCCCACAAGGCAGGGTTCAGGTTAAAATGCCATGTTGGAGAAGTCTGACCATTGCTTTTTCGTTATGTAGATCTGTTGGTATTATATAACTTTTCTATGACCG
ATATTGTTTATGTCGATGAATTTATATACTCCTTATTCAATGTTTCCACAAGGTTTGGTTCTTTCGATTGCATTTTCCTTCTTTGTTTCTGTTTTCAATGAAGGTGAATGCATTCATTGTAATGCAATCTTCAAACTTCTCGTTTTGCAGAAACATGTTATATAATTGAAG




Intron 2 GTGAGGGTTT ... AATGATGCAG

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>TRINITY_DN112663_c0_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoform
ATTTGTAATCTCTTTACTTCCACGGGAACAAACCATGTCAATGATTCAAACCCTAAACTATCGAATGAATATAGCTTTATAAATCAATCACTAGTAACCATAGGAGCTAGGGTTACATGACTCTTGGATTTAACTCTTAGGTCAATAATCAGGGGCACGCGGAAGAAACCCTTGCTTAACATTAATCAAGGGCACGCGGA
AGAAATCCTTGCATCCATTTGTTGAATCTGCGGGAGTGCTCACCACTATGGACCCACACCACGGATTAAACTCATGAATTCAACTTTTTATTTTGTGGTTTCAAGTGTCAATCAGCGAAGCTCGCGTGCTGGCGGATTTCCACTTGCGCCAGACTGCTAACGGGTGGAAATGCTTTTATTTCCATTTTAATCAAAACTTC
TCTGCTGCTTTGAAAGTGTTGTGTTCGAATCCTGGGCTTCGGAGCTTTGGCGGGTTTTGTCGGGGCTTTTCTTCTCTCCAGGAGAAGATAAGGTATGCTGTAATCACTGGAAGCTACATGGTAGCTGTTAGCCCTCTTCAGGCATGGATTGTTCTTTGACTGTTTCAACATCGGAACTGTCACTGTAAATCCCAAGTTCT
TCTGAAGCTTTAAGCATTAGAATTTAAAAAGGCAAAGTTCTTGTGATGGCGTTTGCCGTGGATGAAGGCCATAGCCATCCGGAGTTTCGCAAAATTCCAGTCATAGATTTACGGTTTCTGTCTCAAGATGAGATCAATTGCGCAGCCCAGTGGTCAGACGAGGACACGGAATTACAGCTCAAGGATATTGTAATCCCTAA
AATAGACCGCTCCATTTTTAATGAGAGTGCCGGTAGTCGCAAGCAAACATATTCGAGACTGCGGTTTTCTCAGAGAAAAGAGGAACTTGGAGGTCTTTCAAGACGCAGAGCTGGGCTTCTTAGTGTGTCGAGACACTCTGTTGAAGTTGGGATAACGCCGACTATACGAAGGAAACCTGCAAATGGATCTGACCTAAAGG
ATAACAGTCAGATCTTGCAGCTGTTGAAGGGGCTGTTCACGAAAGGAGATCGATCCTTGACATGTAACGAAGTACCCAAAGTACAGTTGTCAAACCCTCCTCTGAACTCAGAAAGTGGCAGCAATCGTTCTTCAAATGTCACCCACAATATACAAAGTTGCAATGGGAAACAAGATTCTGGTCCCGAGCCAGCGAACAAT
CTGCAGTTAGTTGTTAGGGATCCCGAAATGGAGACTGAAGGTCTAAGTGCAGTCATTCAGGGAACACACAATGAACAATTTAATGACAATGCAGACCGGGAAATCTCCGATGCTAGGATTTCAGATACACAGATGGAGTCAAAGACAACTCTGGATGCAGACAGGAGTAGGCCTCTAGTGGACGGTAGTGTGGATAGACC
GAAAAAGAGGATGAGAACAAAAGAGGATGCAAGAAGGAAGGCGTTTGCAAATGCAGAAGAACAAATTGCGATGAGAGCATCAATGTCTATTAAGAATAATACTATTGTGGATGATTGCAGCCATACTGATACAAAGGCAGTAGGAAGTCCAGATGATAAAACTTTCAGCGAATCCAGCCATACTGACACAACAATTATTA
GATCTATGCAGGACAATACTGTGAATAACTCTCCCACTGACAAAAAAGTAGAAGATGTGAATGATGTGCCACCACAAAAAGGTGCCAAATTTGGCGGCAAGGGTTGTTCATCGACTGCACAAGAACCTTCTGTGGCTCAATTAAAGAGAAAATTTCCACCTTTAAAAACAGAAGCTCAATTGCAGGATTTTTTTGACAAA
GTAGGTGGCCAATGGGCATCTAAGAGGGAGAGGCGTAAGATTGTGGATGCTAGAGATTTTGGTGATGGATTTCCTGAAGGTTGGAAACTTCTATTGGGTGTTAGAAAAAAGGATGGTCGGTTTTTGATTGAATGCCGCAATTATATAAGCCCAGAGGGCCGCAAATTAAAATCCTGCCGTGAAGTTTCTGCTCATATGCT
TTCAACCCGTATGCACTGCCCAGCTGTTGGAACTGCCCAACAACCATCTGGCAACTCAACAAACCCAGTGGATAGCAGTGGAGAATGTTCTAAACAACAGACTGCCCATTTGAATGGCGTTGCCTTTCTTAATGCTGAAGAGCAACAAACATCACAAAGTAATGCTTCACCTATGACAGTGGTTAAGGTTGAAGGAAATT
CAATAAAGGATAACTGTGTTATTGCTTCAGATACTTCAGTTAAATGCTCAAAAGGCGACTTAAACTTAAGTAACAGAAGTGATTCAATGGCACATTTGACTGGTCATCACACCCAGAAGGTGAAAAAAACAAGCACTTCTAAGTCAATTGTGGATGGTGTAATCATGATAAATGGTAAATATGAATGTCAAATATGCCAT
AAAGTTTTCAACGAGAGGAATCGTTACACTGGCCATGTTGGTGTTCATGTGAGAAATGCAAAAAGGCTTCTTGATCCCCAGGGCGAAATCTCTAGTGGAGGCAAAGCAGACATTCATCCTCCTGAAACTTTTGGTAACGAGTTTAAGGACTACAGCAATGTTGATTCCACCATGGCAACCACAGGTACTAAACCCTGTGA
TCAGCAAGAGCAAAATGGAAATATGGCTTTGGGAACAATTCTAGATTCGTCATCACCTTCAGGAGAAAATGACTTTACATCTTCGCATGATGTGGGGATCCTCAGTACATTAGACATATCAGCAAAGGATGAGATTGATTTTAATTCTGAAACTCAGAAGCTTGATAGTCTGAAAGGCTTTGAAGAGTTTCAGATGGAGT
ATGCTCATTCGCCAAAGTTTGCATTTCAAACGGGCCAGGATACGGACAGTGTGATTGATGCACAATTAGACTTAGGCTTAGATGCGGGTGTTTTGCAGCAGGAAATTGATCCTCCTGGTCAGTTTGAGTGGGAGAGTGTCTTATCCAAGATAGAGAATAGTTCTCAGGTCTTTGTCTGTGTCTGGTGTAATTCAGAGTTC
AGCCATGATGGCCTTGATGAGGAACTCCAAGCAGACTCTGTTGGCTTCATTTGTTCACACTGCAAGAATAAGATTTCAGGGCAAATTGATATTTAAATGGTATTGAGACTATGCCACGAGTCATTTGGGAGGAAATTTGACTCTAAGTAAGCATGCAGTCTTCTTTTCTGCCTTATGGATCTGCCTTATTGTTGGCAATT
GATCTAACGTGCTCTAGGAGAATGTGTTTTCAAATTTTCCCCTGAGCCAATAAGGAAAGATTCAGTTTAAAATATCATGTTGGAGAAGTCCCGACATTGCTTTGCCGAGGTAAAAATGCTGTGTTTATGCAGGCTATGCCATGAGTCATTTGGGAGGAAATGTGACCGTTTAAATAGCCACTGCAGTTTCCTTTTTCCGA
CTTACGGAATTCCCGTATTGTTGGCAAGTGATCTAACATGCTCCTAGAAGAATGTGTTTTGGAATTTTCCCCTAGGCCCACAAGGCAGGGTTCAGGTTAAAATGCCATGTTGGAGAAGTCTGACCATTGCTTTTTCGTTATGTAGATCTGTTGGTATTATATAACTTTTCTATGACCGATATTGTTTATGTCGATGAATT
TATATACTCCTTATTCAATGTTTCCACAAGGTTTGGTTCTTTCGATTGCATTTTCCTTCTTTGTTTCTGTTTTCAATGAAGGTGAATGCATTCATTGTAATGCAATCTTCAAACTTCTCGTTTTGCAGAAACATGTTATATAATTGAAGAG


>TRINITY_DN112663_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:
TCGGGGCTTTTCTTCTCTCCAGgtgagggtttattctctgatttagctcgacatgacaattcatggcttcgattttattttattattatttttaaacagtgaaataaaactataatgatgcagGAGAAGATAAGGTATGCTGTAATCACTGGAAGCTACATGGTAGCTGTTAGCCCTCTTCAGGCATGGATTGTTCTTTG
ACTGTTTCAACATCGGAACTGTCACTGTAAATCCCAAGTTCTTCTGAAGCTTTAAGCATTAGAATTTAAAAAGGCAAAGTTCTTGTGATGGCGTTTGCCGTGGATGAAGGCCATAGCCATCCGGAGTTTCGCAAAATTCCAGTCATAGATTTACGGTTTCTGTCTCAAGATGAGATCAATTGCGCAGCCCAGTGGTCAGA
CGAGGACACGGAATTACAGCTCAAGGATATTGTAATCCCTAAAATAGACCGCTCCATTTTTAATGAGAGTGCCGGTAGTCGCAAGCAAACATATTCGAGACTGCGGTTTTCTCAGAGAAAAGAGGAACTTGGAGGTCTTTCAAGACGCAGAGCTGGGCTTCTTAGTGTGTCGAGACACTCTGTTGAAGTTGGGATAACGC
CGACTATACGAAGGAAACCTGCAAATGGATCTGACCTAAAGGATAACAGTCAGATCTTGCAGCTGTTGAAGGGGCTGTTCACGAAAGGAGATCGATCCTTGACATGTAACGAAGTACCCAAAGTACAGTTGTCAAACCCTCCTCTGAACTCAGAAAGTGGCAGCAATCGTTCTTCAAATGTCACCCACAATATACAAAGT
TGCAATGGGAAACAAGATTCTGGTCCCGAGCCAGCGAACAATCTGCAGTTAGTTGTTAGGGATCCCGAAATGGAGACTGAAGGTCTAAGTGCAGTCATTCAGGGAACACACAATGAACAATTTAATGACAATGCAGACCGGGAAATCTCCGATGCTAGGATTTCAGATACACAGATGGAGTCAAAGACAACTCTGGATGC
AGACAGGAGTAGGCCTCTAGTGGACGGTAGTGTGGATAGACCGAAAAAGAGGATGAGAACAAAAGAGGATGCAAGAAGGAAGGCGTTTGCAAATGCAGAAGAACAAATTGCGATGAGAGCATCAATGTCTATTAAGAATAATACTATTGTGGATGATTGCAGCCATACTGATACAAAGGCAGTAGGAAGTCCAGATGATA
AAACTTTCAGCGAATCCAGCCATACTGACACAACAATTATTAGATCTATGCAGGACAATACTGTGAATAACTCTCCCACTGACAAAAAAGTAGAAGATGTGAATGATGTGCCACCACAAAAAGGTGCCAAATTTGGCGGCAAGGGTTGTTCATCGACTGCACAAGAACCTTCTGTGGCTCAATTAAAGAGAAAATTTCCA
CCTTTAAAAACAGAAGCTCAATTGCAGGATTTTTTTGACAAAGTAGGTGGCCAATGGGCATCTAAGAGGGAGAGGCGTAAGATTGTGGATGCTAGAGATTTTGGTGATGGATTTCCTGAAGGTTGGAAACTTCTATTGGGTGTTAGAAAAAAGGATGGTCGGTTTTTGATTGAATGCCGCAATTATATAAGCCCAGAGGG
CCGCAAATTAAAATCCTGCCGTGAAGTTTCTGCTCATATGCTTTCAACCCGTATGCACTGCCCAGCTGTTGGAACTGCCCAACAACCATCTGGCAACTCAACAAACCCAGTGGATAGCAGTGGAGAATGTTCTAAACAACAGACTGCCCATTTGAATGGCGTTGCCTTTCTTAATGCTGAAGAGCAACAAACATCACAAA
GTAATGCTTCACCTATGACAGTGGTTAAGGTTGAAGGAAATTCAATAAAGGATAACTGTGTTATTGCTTCAGATACTTCAGTTAAATGCTCAAAAGGCGACTTAAACTTAAGTAACAGAAGTGATTCAATGGCACATTTGACTGGTCATCACACCCAGAAGGTGAAAAAAACAAGCACTTCTAAGTCAATTGTGGATGGT
GTAATCATGATAAATGGTAAATATGAATGTCAAATATGCCATAAAGTTTTCAACGAGAGGAATCGTTACACTGGCCATGTTGGTGTTCATGTGAGAAATGCAAAAAGGCTTCTTGATCCCCAGGGCGAAATCTCTAGTGGAGGCAAAGCAGACATTCATCCTCCTGAAACTTTTGGTAACGAGTTTAAGGACTACAGCAA
TGTTGATTCCACCATGGCAACCACAGGTACTAAACCCTGTGATCAGCAAGAGCAAAATGGAAATATGGCTTTGGGAACAATTCTAGATTCGTCATCACCTTCAGGAGAAAATGACTTTACATCTTCGCATGATGTGGGGATCCTCAGTACATTAGACATATCAGCAAAGGATGAGATTGATTTTAATTCTGAAACTCAGA
AGCTTGATAGTCTGAAAGGCTTTGAAGAGTTTCAGATGGAGTATGCTCATTCGCCAAAGTTTGCATTTCAAACGGGCCAGGATACGGACAGTGTGATTGATGCACAATTAGACTTAGGCTTAGATGCGGGTGTTTTGCAGCAGGAAATTGATCCTCCTGGTCAGTTTGAGTGGGAGAGTGTCTTATCCAAGATAGAGAAT
AGTTCTCAGGTCTTTGTCTGTGTCTGGTGTAATTCAGAGTTCAGCCATGATGGCCTTGATGAGGAACTCCAAGCAGACTCTGTTGGCTTCATTTGTTCACACTGCAAGAATAAGATTTCAGGGCAAATTGATATTTAAATGGTATCGAGGTAAGAAATATTTCAATTGGCAAAATAAAGAAGTGATCTGTTTTACTGGAG
CGATTTGGTCACTTTATTCCACAATATAGGACAGTTATCTAGAGAAATAGAAAAAGTTACGGAACCCCGTAGTAAAATCGTCTTTGGACAAAATTCTACTTTCATGTCTGACATAATTGCGTAACTGAGGCTAAAATGCTCTGTTTATGCAGACTATGCCACGAGTCATTTGGGAGGAAATTTGACTCTAAGTAAGCATG
CAGTCTTCTTTTCTGCCTTATGGATCTGCCTTATTGTTGGCAATTGATCTAACGTGCTCTAGGAGAATGTGTTTTCAAATTTTCCCCTGAGCCAATAAGGAAAGATTCAGTTTAAAATATCATGTTGGAGAAGTCCCGACATTGCTTTGCCGAGGTAAAAATGCTGTGTTTATGCAGGCTATGCCATGAGTCATTTGGGA
GGAAATGTGACCGTTTAAATAGCCACTGCAGTTTCCTTTTTCCGACTTACGGAATTCCCGTATTGTTGGCAAGTGATCTAACATGCTCCTAGAAGAATGTGTTTTGGAATTTTCCCCTAGGCCCACAAGGCAGGGTTCAGGTTAAAATGCCATGTTGGAGAAGTCTGACCATTGCTTTTTCGTTATGTAGATCTGTTGGT
ATTATATAACTTTTCTATGACCGATATTGTTTATGTCGATGAATTTATATACTCCTTATTCAATGTTTCCACAAGGTTTGGTTCTTTCGATTGCATTTTCCTTCTTTGTTTCTGTTTTCAATGAAGGTGAATGCATTCATTGTAATGCAATCTTCAAACTTCTCGTTTTGCAGAAACATGTTATATAATTGAAGAG




Intron 3 GTGAGGGTTT ... TTTTAAACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A11.5912402
A29.578529
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A801400
A944802
A1005700



>TRINITY_DN112663_c0_g1_i4 from sample A2 / Example spliced isoform
ATTTGTAATCTCTTTACTTCCACGGGAACAAACCATGTCAATGATTCAAACCCTAAACTATCGAATGAATATAGCTTTATAAATCAATCACTAGTAACCATAGGAGCTAGGGTTACATGACTCTTGGATTTAACTCTTAGGTCAATAATCAGGGGCACGCGGAAGAAACCCTTGCTTAACATTAATCAAGGGCACGCGGA
AGAAATCCTTGCATCCATTTGTTGAATCTGCGGGAGTGCTCACCACTATGGACCCACACCACGGATTAAACTCATGAATTCAACTTTTTATTTTGTGGTTTCAAGTGTCAATCAGCGAAGCTCGCGTGCTGGCGGATTTCCACTTGCGCCAGACTGCTAACGGGTGGAAATGCTTTTATTTCCATTTTAATCAAAACTTC
TCTGCTGCTTTGAAAGTGTTGTGTTCGAATCCTGGGCTTCGGAGCTTTGGCGGGTTTTGTCGGGGCTTTTCTTCTCTCCAGTGAAATAAAACTATAATGATGCAGGAGAAGATAAGGTATGCTGTAATCACTGGAAGCTACATGGTAGCTGTTAGCCCTCTTCAGGCATGGATTGTTCTTTGACTGTTTCAACATCGGAA
CTGTCACTGTAAATCCCAAGTTCTTCTGAAGCTTTAAGCATTAGAATTTAAAAAGGCAAAGTTCTTGTGATGGCGTTTGCCGTGGATGAAGGCCATAGCCATCCGGAGTTTCGCAAAATTCCAGTCATAGATTTACGGTTTCTGTCTCAAGATGAGATCAATTGCGCAGCCCAGTGGTCAGACGAGGACACGGAATTACA
GCTCAAGGATATTGTAATCCCTAAAATAGACCGCTCCATTTTTAATGAGAGTGCCGGTAGTCGCAAGCAAACATATTCGAGACTGCGGTTTTCTCAGAGAAAAGAGGAACTTGGAGGTCTTTCAAGACGCAGAGCTGGGCTTCTTAGTGTGTCGAGACACTCTGTTGAAGTTGGGATAACGCCGACTATACGAAGGAAAC
CTGCAAATGGATCTGACCTAAAGGATAACAGTCAGATCTTGCAGCTGTTGAAGGGGCTGTTCACGAAAGGAGATCGATCCTTGACATGTAACGAAGTACCCAAAGTACAGTTGTCAAACCCTCCTCTGAACTCAGAAAGTGGCAGCAATCGTTCTTCAAATGTCACCCACAATATACAAAGTTGCAATGGGAAACAAGAT
TCTGGTCCCGAGCCAGCGAACAATCTGCAGTTAGTTGTTAGGGATCCCGAAATGGAGACTGAAGGTCTAAGTGCAGTCATTCAGGGAACACACAATGAACAATTTAATGACAATGCAGACCGGGAAATCTCCGATGCTAGGATTTCAGATACACAGATGGAGTCAAAGACAACTCTGGATGCAGACAGGAGTAGGCCTCT
AGTGGACGGTAGTGTGGATAGACCGAAAAAGAGGATGAGAACAAAAGAGGATGCAAGAAGGAAGGCGTTTGCAAATGCAGAAGAACAAATTGCGATGAGAGCATCAATGTCTATTAAGAATAATACTATTGTGGATGATTGCAGCCATACTGATACAAAGGCAGTAGGAAGTCCAGATGATAAAACTTTCAGCGAATCCA
GCCATACTGACACAACAATTATTAGATCTATGCAGGACAATACTGTGAATAACTCTCCCACTGACAAAAAAGTAGAAGATGTGAATGATGTGCCACCACAAAAAGGTGCCAAATTTGGCGGCAAGGGTTGTTCATCGACTGCACAAGAACCTTCTGTGGCTCAATTAAAGAGAAAATTTCCACCTTTAAAAACAGAAGCT
CAATTGCAGGATTTTTTTGACAAAGTAGGTGGCCAATGGGCATCTAAGAGGGAGAGGCGTAAGATTGTGGATGCTAGAGATTTTGGTGATGGATTTCCTGAAGGTTGGAAACTTCTATTGGGTGTTAGAAAAAAGGATGGTCGGTTTTTGATTGAATGCCGCAATTATATAAGCCCAGAGGGCCGCAAATTAAAATCCTG
CCGTGAAGTTTCTGCTCATATGCTTTCAACCCGTATGCACTGCCCAGCTGTTGGAACTGCCCAACAACCATCTGGCAACTCAACAAACCCAGTGGATAGCAGTGGAGAATGTTCTAAACAACAGACTGCCCATTTGAATGGCGTTGCCTTTCTTAATGCTGAAGAGCAACAAACATCACAAAGTAATGCTTCACCTATGA
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>TRINITY_DN112663_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:
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