sp|Q9SJA7|SOX_ARATH ----> Probable sarcosine oxidase
Intron 1 GTGCTTGGCT ... CCTGTTTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 42.86 | 4 | 2 | 4 |
| A2 | 33.33 | 8 | 6 | 2 |
| A3 | 60 | 2 | 4 | 2 |
| A4 | 33.33 | 3 | 2 | 1 |
| A5 | 71.43 | 1 | 3 | 2 |
| A6 | 44.58 | 23 | 21 | 16 |
| A7 | 42.86 | 24 | 24 | 12 |
| A8 | 38 | 31 | 31 | 7 |
| A9 | 33.33 | 27 | 23 | 4 |
| A10 | 40.26 | 23 | 25 | 6 |
>TRINITY_DN44003_c3_g2_i11 from sample A9 / Example spliced isoformAAACATTCTAAATCCAATGTCTACGCTCGGTTGAAAAAAAAAATCCAATGTCTACGGGCCTTGTTTTAGTAAAAGCCCGGGCAAAATATTTAACTTCGAAAAATTGGAAACTTGGGGTTGCAGGCAGGCTGCATGCCAGTCATAAAATCAAAGGAAATTTCAACCCTGCATGCATGTTCTCAGCTAAATAAAATGAAACA
AAAAATTCCAAAACCCAATGGACTAATGTCTTTCTATTTGCAAAACCTCTGATCACCTGCAATCGCAGCCCATTTTTAATTTGCATTTACTAATGAAATGGGATACGAAGATTGGCGTGGAGTTGGTAAACTGCATGGTTTGGAATTGCCAGCAATGTGATTTTTTTGTTGCAAAAATTGAGCAGTACGAGGTTGCCTGA
ACATGAAAACAGAACCATCTGGAATTCTTCTAGGTCAATTCGGAGCTGAACGACAAAGAAAGCAGAGCGAGCTGGAGTTCTTCTGGTCAATTCAGGGCTGAGCAAAACCTCTTGGGCAAGCTCTCATTTTGGCACTTGCTATATATATTGATTTGAAAAGCAGTTGTGTACCCGCAGGGAGAGGAAATTTTAAGTCTTAG
AAGCAATTGCAGCAGCAGCCAAGATGGGTGAAATCTCAGGAGAATACGAAGTGGTAGTGGTAGGAGCAGGCATAATGGGCAGCTGCATTGCCTATCATATTGCAAAGAGAGGCAAATCTGTCCTCCTGGTAGACCAATTTGAATTTCTTCACCACAGAGGATCTTCTCATGGGGAGTCCAGAACCATCAGAGAGGCTTAC
CCAGAAGAATACTACACTGAAATCATGCACGAGGCCTTCGCTCTCTGGGAAGAAGCCCAGCAAGAAATTGGGTACAGAGTTCACATCAAGACCAAGCAGCTTGACATGGGTCCCATCCACAACAAGACCCTGCAATCCATAATAGATGTGTGCACAAAACGAGAGATCCCCGTGGAAGTTCTTGATTCAGAGCAAGTTTT
AGAGAGATTCAAGGTAATCAACCTGCCCAGCGATTGGGTTGGAGTTGTCACAGATAGAGGGGGAATCCTGCGAGCCTCCAAGGCAGTTGCAATGTTCCAGTCTTTGGCGCTGAAGCACGGGGCTATACTCAGGGACAATGCCCAAGTCATAAAAATCAGCAGTGCGTGGAAATTAAAAGATGGGTCACATGGGGTTCTAG
TTTGTACAGGGAGCGGCTCTGTGCTTGGAAGAAAATGTGTGATTGCTGCAGGGGCATGGGCCCATAAACTTGCTAAGGAGATCTCAGGGATTGAATTGCCCATCCAACCTCTTCATACCAGCCTTGCGTATTGGAAAATCCAGGAGGGTTTGCAGAATTTTTTACCTGAGAATGGATTTCCTAGCTTTGCTTGTTACGGT
GACCCTTGTCTCTATGGGACACCTTCCATAGAGTACCCTGGATTGCTCAAGGTCTCACTTCATGGAGGCCACCCATGTGACCCTGACAAGAGGACCTTGGTCCCTGATGTAGATGCATTGAGGGAGAATCTTAGCCCTTGGATAGCTGAAAGTTTTAGAGGATGTGTTATGTCACAGAGCCCTGTTGTTGCTGAGGCTTG
CATGTATTCAATGTCCCCTGATCAGGATTTCATCCTTGATTTCTTGCCATTGACGAAGAATGAGATGCCAACATCAGGCAAGTCTCCTTTTTTAATTGCCGCTGGATTCTCTGGACATGGATTCAAGATGGGCCCTTTGGTAGGACGGATAATGGCGGATCTTGCCCTCACAGGAGAAGCCCATGGTGTACCGTTGCACT
ATTTTTCTATTGAACGTTTTCTTCAGAATCCACGGGGTAATCTCAAGGATTACGAGGACCAGTTGAACAAAAGCTTGAAGATAATGTCGAGGGCACATCATGTCAGAGTACCAAAGGTATATAATTGACAGGCTTAATTGAACAGCCAATGAATTGTAGTACTCCTGGTCTGCTTATGACACAAGTCAAGAAGTGCAATG
GTAATGGTTCTTTCTTGAAAGGAAATGGTTTAGTTACTTAGGGAGGATGGTTTAACTGTTCTTCCTTGAAAGGCACCGGTTTAATTACTTAGGGAAGATGGAAAACTTGTATGGAGATGAGACATATTACACCGATGCATGATTAAGTTTGTTTCCTTCTCGGTATTGTATGTTGAATTAGTTTTGTCTGGTTTTGAATA
ATAGGGCAGGAGAATCAGAAGTTTTCATGAATTGTAGACTCCAGGTTATCTCAGATTCTCAAGTATAAGAAATTGCTGATTGAGAAGCTGCTAAATTATGTTTGATTGATTTACAGCACCATTGACACATTACTACTCGATAGATTGAGAAACCTCTA
>TRINITY_DN44003_c3_g2_i10 from sample A9 / Example unspliced isoform:AAACATTCTAAATCCAATGTCTACGCTCGGTTGAAAAAAAAAATCCAATGTCTACGGGCCTTGTTTTAGTAAAAGCCCGGGCAAAATATTTAACTTCGAAAAATTGGAAACTTGGGGTTGCAGGCAGGCTGCATGCCAGTCATAAAATCAAAGGAAATTTCAACCCTGCATGCATGTTCTCAGCTAAATAAAATGAAACA
AAAAATTCCAAAACCCAATGGACTAATGTCTTTCTATTTGCAAAACCTCTGATCACCTGCAATCGCAGCCCATTTTTAATTTGCATTTACTAATGAAATGGGATACGAAGATTGGCGTGGAGTTGGTAAACTGCATGGTTTGGAATTGCCAGCAATGTGATTTTTTTGTTGCAAAAATTGAGCAGTACGAGGTTGCCTGA
ACATGAAAACAGAACCATCTGGAATTCTTCTAGGTCAATTCGGAGCTGAACGACAAAGAAAGCAGAGCGAGCTGGAGTTCTTCTGGTCAATTCAGGGCTGAGCAAAACCTCTTGGGCAAGCTCTCATTTTGGCACTTGCTATATATATTGATTTGAAAAGCAGTTGTGTACCCGCAGGGAGAGGAAATTTTAAGTCTTAG
AAGCAATTGCAGCAGCAGCCAAGATGGGTGAAATCTCAGGAGAATACGAAGTGGTAGTGGTAGGAGCAGGCATAATGGGCAGCTGCATTGCCTATCATATTGCAAAGAGAGGCAAATCTGTCCTCCTGGTAGACCAATTTGAATTTCTTCACCACAGAGGATCTTCTCATGGGGAGTCCAGAACCATCAGAGAGGCTTAC
CCAGAAGAATACTACACTGAAATCATGCACGAGGCCTTCGCTCTCTGGGAAGAAGCCCAGCAAGAAATTGGGTACAGAGTTCACATCAAGACCAAGCAGCTTGACATGGGTCCCATCCACAACAAGACCCTGCAATCCATAATAGATGTGTGCACAAAACGAGAGATCCCCGTGGAAGTTCTTGATTCAGAGCAAGTTTT
AGAGAGATTCAAGGTAATCAACCTGCCCAGCGATTGGGTTGGAGTTGTCACAGATAGAGGGGGAATCCTGCGAGCCTCCAAGGCAGTTGCAATGTTCCAGTCTTTGGCGCTGAAGCACGGGGCTATACTCAGGGACAATGCCCAAGTCATAAAAATCAGCAGTGCGTGGAAATTAAAAGATGGGTCACATGGGGTTCTAG
TTTGTACAGGGAGCGGCTCTGTGCTTGGAAGAAAATGTGTGATTGCTGCAGGGGCATGGGCCCATAAACTTGCTAAGGAGATCTCAGGGATTGAATTGCCCATCCAACCTCTTCATACCAGCCTTGCGTATTGGAAAATCCAGGAGGGTTTGCAGAATTTTTTACCTGAGAATGGATTTCCTAGCTTTGCTTGTTACGGT
GACCCTTGTCTCTATGGGACACCTTCCATAGAGTACCCTGGATTGCTCAAGGTCTCACTTCATGGAGGCCACCCATGTGACCCTGACAAGAGGACCTTGGTCCCTGATGTAGATGCATTGAGGGAGAATCTTAGCCCTTGGATAGCTGAAAGTTTTAGAGGATGTGTTATGTCACAGAGCCCTGTTGTTGCTGAGGCTTG
CATGTATTCAATGTCCCCTGATCAGGATTTCATCCTTGATTTCTTGCCATTGACGAAGAATGAGATGCCAACATCAGGCAAGTCTCCTTTTTTAATTGCCGCTGGATTCTCTGGACATGGATTCAAGATGGGCCCTTTGGTAGGACGGATAATGGCGGATCTTGCCCTCACAGGAGAAGCCCATGGTGTACCGTTGCACT
ATTTTTCTATTGAACGTTTTCTTCAGAATCCACGGGGTAATCTCAAGGATTACGAGGACCAGgtgcttggctgggggccgtggactgttttcctctttgaaggttttaagcacataaaacatcagtgtgtctatctgtgatctatttgtgtgagcagttgcttaaggtgttcgacttgtgtggaaataccctgttttagT
TGAACAAAAGCTTGAAGATAATGTCGAGGGCACATCATGTCAGAGTACCAAAGGTATATAATTGACAGGCTTAATTGAACAGCCAATGAATTGTAGTACTCCTGGTCTGCTTATGACACAAGTCAAGAAGTGCAATGGTAATGGTTCTTTCTTGAAAGGAAATGGTTTAGTTACTTAGGGAGGATGGTTTAACTGTTCTT
CCTTGAAAGGCACCGGTTTAATTACTTAGGGAAGATGGAAAACTTGTATGGAGATGAGACATATTACACCGATGCATGATTAAGTTTGTTTCCTTCTCGGTATTGTATGTTGAATTAGTTTTGTCTGGTTTTGAATAATAGGGCAGGAGAATCAGAAGTTTTCATGAATTGTAGACTCCAGGTTATCTCAGATTCTCAAG
TATAAGAAATTGCTGATTGAGAAGCTGCTAAATTATGTTTGATTGATTTACAGCACCATTGACACATTACTACTCGATAGATTGAGAAACCTCTA