NA ----> NA
Intron 1 GTATATTATT ... ATTATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A2 | 57.14 | 3 | 3 | 5 |
| A3 | 42.86 | 2 | 2 | 1 |
| A4 | 100 | 0 | 6 | 1 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 33.33 | 3 | 3 | 0 |
| A7 | 80 | 2 | 6 | 10 |
| A8 | 63.64 | 6 | 9 | 12 |
| A9 | 57.14 | 6 | 7 | 9 |
| A10 | 53.85 | 6 | 3 | 11 |
>TRINITY_DN44106_c0_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoformGACACCGGCAAAACATATTTTTGGAGTTGAAGAGCGTCTTCCACACTGAAGCCGGTATTCGTCTTGCGTTGGATGCAGAGATCACTTCGACTACTCCAATTCATTAATTAGACAATATATTATTTACCAGTGGTGCGGTTTCTCTGCAACTTAAATACTTGTTAAACGTTTGGGCAGAGAGCAAGCAGTGGCATAACAAG
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>TRINITY_DN44106_c0_g1_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:GACACCGGCAAAACATATTTTTGGAGTTGAAGAGCGTCTTCCACACTGAAGCCGGTATTCGTCTTGCGTTGGATGCAGAGATCACTTCGACTACTCCAATTCATTAATTAGACAATATATTATTTACCAGTGGTGCGGTTTCTCTGCAACTTAAATACTTGTTAAACGTTTGGGCAGAGAGCAAGCAGTGGCATAACAAG
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TTGGGCTGTAGCTACTTCTGGAGTTCCAGTGCGAGAGCAACTCTTCAATGCCTCTATCTGCAGGCATGGTCCATTTGGTGTATCTCGAGCTTTTGGTCGCACTTTTGATGCTGCTCCTCTAGAGGTAGCAACACCTATCTTGATTCCCAGAAATGATGGACACAAACACCGAAAAGGAAGCCATGGCGATGTAATATTTT
TGACAAGCCGAGGAGAGGTTACTTCTTATTTTCCAGGCATTCATGGCCAGGGTGCAATCCGAAGATGGCAACTACTAACTGGTGCTACATGGTCAAATTTGCCTTCACCTGCGGGCATTGTTGATGAGAAGGTTATCCCCACTTTAGAACCTTTGCCATTGCATGTTCATGGAACCCATGAAGCAATTCTGGTTGCAGGA
GAACAGGAGGCGGTTATTCTTTCGCCAGATGGTAGTCCGCTCACATCAATATTCTTGCCGTCTCCACCTACTCACCCTATATTATATGGTGATTTCTCAAATGATGGCTTGAATGACCTGATTCTTGTAACTTCTGACGGAATTTATGGATTTGTACAAACTCGACAACCTGGTGCCCTCTTCTTCAGCTCCCTGGTTGG
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CTTAGATGGGTTAAAACTTAAAACATGTAGAAGTTTGTAAACAAAACATAGGCAACAGAAATGAGAAAGTCTATTGATATTGTTTGTATGGGACAATGCTTCGGGAAAGCAAATTTTTGTTCAACATAAATGAGCAACACTATCGATATTGTTTGTAAGGGACAATACTTGGGGAAAGCAAATGTTTGCGGAGCATCTAT
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AACTTCTCCATGATCTATGTGTAAATGACATGGATTGTAGGCTACTCTTTCAACACCCTAACTTAGCCTGTATCCACAACAAAACAGCTATTCTAATTATGACTTAACAGTTAACACTAACATGAATATCAATGAACAAAGCAATCATAGCCAAGTGATGCTGGGATCTAAATTGTGTTACTTTCATTTGTCAATTGGAG
TCTGGACCTGTTGGTATGCTGCTACATCTCTTCAAGTACTTAGTTTTTTATGCCCTTTGACTTCTTTGCTCAATATCCATTATTCTTGTTTGTGTCTCATTTTTGTATTATGATCTGGACAGTGAGCAGCTTGTAACTGTTGAATATTAAAAGTAGTACGGAATGGTTGTAATAGACCTTGGTTGAATGCTATGCCCACA
AACTATTTTCAGCTATTTTCCTTCAAGGAACTGTTATCTAGAATCCCCATAATCTATAGCACTTGCTTTTCTGGAGGGA