sp|Q9ZQF9|MBR1_ARATH ----> E3 ubiquitin-protein ligase MBR1

Intron 1 GTGCGGGCTA ... TGTGCATCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	16.7	424	89	81
A2	18.18	342	88	64
A3	18.26	394	115	61
A4	19.35	248	53	66
A5	23.21	134	53	28
A6	17.37	1218	316	196
A7	17.26	1632	401	280
A8	17.19	1424	326	265
A9	16.45	1516	352	245
A10	17.03	1311	305	233

>TRINITY_DN33906_c0_g1_i7 from sample A9 / Example spliced isoform

AATAAGTGGCGTATCTTTAAATTTAACAATAATGTATAAAGAGAAGTAGATAAGTGATTTTGTCTTAAACAAAACCGTACATTTAATGCTGAAATTTGGCGCTGCATCTCATGCTAATTTTGGATAACTTGTCAATGTATTTGTTCTCAGCCAAATTCTGAAAGTGGCGCCGGTTTAAATTAAATAACCTCATTCAGGTC
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AAGAAACTACAAAATCCTGCGTGTTTTGACTAACGGCAGCGTCTTGGATCTTAGGTTTGAGCCAAATTCGAGAATGCAATGCGATGAAGTGTGAAGGTTGTGGACCATGAAGTGGAAGCTCGATTATAGCAATGCATTGGCGATTAACGCACGGGCATTCTAGACAAAGCATAAGAGAGCATGGCTTGGAAGGATTCATA
TGCATATGGTAGTCTACCAGCTGATACATCATCAACCCACAAATACAACTGGGCCTCAAGACCTGAATTAACAATGGCTGGAGACCTAAAGCAGTATAATCTTTTGAGTAGATACTTGGCAGAAGAAGTATCCAAGGAGCCATTGTTCGAGGAAACAGATGACACTATATCCAGTGGTGCAGAAGAGGTCCGTTTGACAC
GTTCGGGAAAAATGAAATCGGAAGATTCATGGGCCACTTTAAGAGAAATCACATTAAGAGCCAGGGCCGATTGTCACTCTCAGGAGGATATTGAAGCAGGAAGAAAAGCCCGCACCAGACAAAGCAACGGAGTTACATTCCAGTCAAGAAAGACAGGGAAATGCCGGCTTGTGGGCAAGGATATGCCTGGAGTTAAAACT
AGTTTTTCTGCAGACAGACAAACTGAAACGCTCCCCGATAAGGAAACTAATTTAGCAGGTTGCAAGCCTGGAATTTCCGGCCTGCTATTTTCCTCTGTTTGTTCGTCATTTGCCAAAGCCAATAATGCTGGACAAAAGAGATACAGCTTTGGGAATTTTGGCTGCACATCTGCTCCGGATGTATACTTACCCACATCTGC
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CTCCTATTGTGGATCCTGACATATGGTGCTCCAGAGGTCTATCTTTGACAACAGATGCAACTTCGTTTGATTGCGTTGTACCTACTGGTAATGCGCATGCTTGTGGTCGTCATTATACAGCACCAAATTCAAGTGAAAATGGCAACAGAGCAGCAGGCACTCATTTGGAGAGAAGTTCCAGAGAGAATTCCTGTACCACA
AAGCGTGGAGAAAAGCCAGAAAAAATCTCTGACGTACTATTGGATTTGGGTTCCGAAGGCGGTTGCTCTGTTGCAGAGGTGTCATCCATTGCTAGGAGCCGTCAATTACAGAGATCAAGGCGTTCATCTGGAGGCCTGGGAGAGATACTTTCTGCACTGGAGCGATCTGAAGGACGTGATGAATTGAGTTATGAGCAACT
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TTTGATTTGTTGTTCGTGGTATCTTAGCATCTGAAGAGCATATTGTATAGATTAGCATGAGACGGATTTTATTTTCAGATATTCATTTGCCATCATTTGGTGTTATTCTATCTATATCATGAACAGAGTGATTGGAATGGTAAGAAAGCTATGTGTTTGAGGACAGCTCGTGAGTACGTTTGACCTAATGTAAAAGTTGG
TGGTGGGAAGTTTTCTTTTTCTATCTGCAGCATTTTGCGTATTGATGTATATCTGGTAGAATTGATCTAGACATGTATACTATACTAGTGGCAAGAGCTGTGTTTTATATTGTTAAAAGATGAGTTCAGATGGCCTGTCTTTAAGAATGATGTACTTCTGATCACAGAGGTTTGCTAATATTGGGATATATAACTTTTTG
TGGATGTAGATTGTATCTCTTTTGGGGGTAGCCTCCAAACTTCCTGTATTTGTTATTAAAATAGGATATCGAATAGATGAATGGAGCAGTGCCCTTCTCATCTAGCATGGCAAAATGGGGAACTTCTTTTTAATCTGTCAAATTGAAGTTTGAATGTTCTTTTACAGTTTACCAGCTCAGCCACCAATGCCGGACTAGTC
ACCATGACCTCTTTCAGACCTTTCTAATGTTTCAAGCTGATCATTGATGTTTTGTATTTTGTTTTTTCCCTCGGAATACTCAATTTTGCATCTTGCCACACTTTTTAATGCATCTTTCCTACATTAAGTGTCGGCAGTGTTGTGAATATCAGCTATATCTAACATCTGACTGTGCTCAATGAAGATTGTTTTCGGCTCAG
ATTAAGTTGGGAATAGGATGTATTTCCACCACTAGTTTAATGTAGCACTTTTGTTTTATTTTGTCAATGGAATCAGAACCCTGT

>TRINITY_DN33906_c0_g1_i6 from sample A9 / Example unspliced isoform:

ATTAATCCTGCCAGCGCGACACGCTGACGAGCTGAACCTAGAGTGAATTGGATGGAGTGGAAGGCCTTTTCGTTAACCCCGAAAGAGGAGAGGGATCCCAATTAAACATTATCGTTTCCAGCCACGTGGTGGATGGGCAGACAGGTATTGATGAGAGGTCTTAAAAGAAGGGCAGGTCCGTAGCGTCAGGAAAAGGAAGA
GTACCTGCAGCCTAATGTTGTTGTTGGGTCGTATAATCAATACGAGTCCGGTCCCACAGGCTGTGCGACTTACCTGGAATTGCAGAATTAAAAAAAATCAAAATATTGGAAGAATCTTGCAGAAAGCAAAATAGGAGGAGAACAATGTATGTTAAAATACAATGGGAGGTTAACCTGTGCATCTCGTGAATTTGACAGAC
GACGAGACAGACGCAACAAACAAGAAACCCATTTGCATTTGTTGTTCTTCCTGCTCTGCCCTCTCGTGTTCGTGTTCTTGTAAGGAGCCCGCTGGACGAATGCATAGTGAAGAAAACGAAGCTGGAAATGGCAATGGGGGACGAAAGCTAAACTATGAATCGGCCGTTGCCTCGGTTTCTAAGGTTGTGGACCATGAAGT
GGAAGCTCGATTATAGCAATGCATTGGCGATTAACGCACGGGCATTCTAGACAAAGCATAAGAGAGCATGGCTTGGAAGGATTCATATGCATATGGTAGTCTACCAGCTGATACATCATCAACCCACAAATACAACTGGGCCTCAAGACCTGAATTAACAATGGCTGGAGACCTAAAGCAGTATAATCTTTTGAGTAGAT
ACTTGGCAGAAGAAGTATCCAAGGAGCCATTGTTCGAGGAAACAGATGACACTATATCCAGTGGTGCAGAAGAGGTCCGTTTGACACGTTCGGGAAAAATGAAATCGGAAGATTCATGGGCCACTTTAAGAGAAATCACATTAAGAGCCAGGGCCGATTGTCACTCTCAGGAGGATATTGAAGCAGGAAGAAAAGCCCGC
ACCAGACAAAGCAACGGAGTTACATTCCAGTCAAGAAAGACAGGGAAATGCCGGCTTGTGGGCAAGGATATGCCTGGAGTTAAAACTAGTTTTTCTGCAGACAGACAAACTGAAACGCTCCCCGATAAGGAAACTAATTTAGCAGGTTGCAAGCCTGGAATTTCCGGCCTGCTATTTTCCTCTGTTTGTTCGTCATTTGC
CAAAGCCAATAATGCTGGACAAAAGAGATACAGCTTTGGGAATTTTGGCTGCACATCTGCTCCGGATGTATACTTACCCACATCTGCGACTAAGGTTGTCCGTGCGTCTGCTGATTGGGATGCAAAGCGAGTAAGACATAAATCCTCTAAAGTCAGAAGAGCTACTGGTGGTAGTGTTGGAGCGACATTTGCAAATCACT
CAGGGAAAAGCTTTGAAAGAAGAGCTCAGGTGACTTCACATCCAATCTATAATCAGTGCTCTAACCCCCCATCAAGAAAGCAGACGACTCCTATTGTGGATCCTGACATATGGTGCTCCAGAGGTCTATCTTTGACAACAGATGCAACTTCGTTTGATTGCGTTGTACCTACTGGTAATGCGCATGCTTGTGGTCGTCAT
TATACAGCACCAAATTCAAGTGAAAATGGCAACAGAGCAGCAGGCACTCATTTGGAGAGAAGTTCCAGAGAGAATTCCTGTACCACAAAGCGTGGAGAAAAGCCAGAAAAAATCTCTGACGTACTATTGGATTTGGGTTCCGAAGGCGGTTGCTCTGTTGCAGAGGTGTCATCCATTGCTAGGAGCCGTCAATTACAGAG
ATCAAGGCGTTCATCTGGAGGCCTGGGAGAGATACTTTCTGCACTGGAGCGATCTGAAGGACGTGATGAATTGAGTTATGAGCAACTTTTGATGCTCGAAGCCACTTTACTATTGGGTGGAATAGACGTTTACGACCAACACAGGGATTGGCGGCTTGACGTAGACAGCATGTCCTATGAGgtgcgggctattatccacc
aaattatttgtcagatagtttatttttacatggatgagatataatatttattgtttgtcctgttatttgttgtccataaacaaattgagtttggtctagtcatgggtggcagtttccaactatagttcatttaacatgcgcacacatcctgtaggttgatggaaaaacatggtaacctggcaatgggaacctagctcctt
gtcttgtgcagcttaactgtacaatggttctgtatttactttctatgttttattgattaggatgctgatttgcttgtgcatcagGATTTACTTGAACTTGGAGATCGAATTGGTTACGTTAATGCAGGGTTAAGTGAAGACACTATTTTTCAGTGTCTACAGAAGATGAAGCATTGTATCTTGGAGGCTAGATCTACCCG
TGTAACAGAAAATGAGCGCAAGTGTAGTATTTGTCAGGAGGAATATGAACCTAATGATGATTTGGGGAAACTTCAATGCGGTCATAGCTATCACGTGTGTTGCATAAAGCAATGGCTTCTACAGAAAAATGCATGTCCTGTTTGTAAGGCATCTGCGTTGTCCTAGCAAGGCCATATTGATAAATTCGCTTTTGATTTGT
TGTTCGTGGTATCTTAGCATCTGAAGAGCATATTGTATAGATTAGCATGAGACGGATTTTATTTTCAGATATTCATTTGCCATCATTTGGTGTTATTCTATCTATATCATGAACAGAGTGATTGGAATGGTAAGAAAGCTATGTGTTTGAGGACAGCTCGTGAGTACGTTTGACCTAATGTAAAAGTTGGTGGTGGGAAG
TTTTCTTTTTCTATCTGCAGCATTTTGCGTATTGATGTATATCTGGTAGAATTGATCTAGACATGTATACTATACTAGTGGCAAGAGCTGTGTTTTATATTGTTAAAAGATGAGTTCAGATGGCCTGTCTTTAAGAATGATGTACTTCTGATCACAGAGGTTTGCTAATATTGGGATATATAACTTTTTGTGGATGTAGA
TTGTATCTCTTTTGGGGGTAGCCTCCAAACTTCCTGTATTTGTTATTAAAATAGGATATCGAATAGATGAATGGAGCAGTGCCCTTCTCATCTAGCATGGCAAAATGGGGAACTTCTTTTTAATCTGTCAAATTGAAGTTTGAATGTTCTTTTACAGTTTACCAGCTCAGCCACCAATGCCGGACTAGTCACCATGACCT
CTTTCAGACCTTTCTAATGTTTCAAGCTGATCATTGATGTTTTGTATTTTGTTTTTTCCCTCGGAATACTCAATTTTGCATCTTGCCACACTTTTTAATGCATCTTTCCTACATTAAGTGTCGGCAGTGTTGTGAATATCAGCTATATCTAACATCTGACTGTGCTCAATGAAGATTGTTTTCGGCTCAGATTAAGTTGG
GAATAGGATGTATTTCCACCACTAGTTTAATGTAGCACTTTTGTTTTATTTTGTCAATGGAATCAGAACCCTGT