sp|Q8H100|AGD8_ARATH ----> Probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD8

Intron 1 GTGACTAATA ... TTAATTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	75.3	206	628	89
A2	79.42	121	467	88
A3	75.23	159	483	119
A4	73.94	117	332	62
A5	74.69	62	183	48
A6	78.22	689	2475	573
A7	78.33	991	3583	821
A8	78.77	1366	5069	1270
A9	78.91	873	3266	840
A10	78.58	668	2451	574

>TRINITY_DN120122_c3_g1_i2 from sample A3 / Example spliced isoform

TTAAAATGCCACTAGATTTTCACCCAACAAAAATATATAAATCGTTACAATAGAGCTTAACAATATCTGAGGAGGGCATGAATGAAGAGGGCGTTGCTTTTCTCGAACACACAGTCTGATCTCTGTGCTCAGGGCAGTCCGAGAATCGTTTCACCTTTACCATCATCACCCGCCAATGGCTTCCGAGGATTTCAGTGACA
AGAATGCTGTGTTCAGAAAACTCCGGGCAAAATCCGAAAACAAGGTGTGCTTTGACTGTAGCACAAGGAATCCCACATGGGCATCGGTCACTTATGGGATTTTCATCTGCCTGGATTGTTCTGCAGCCCATCGTAGCCTTGGTGTTCACATCAGCTTTGTCAGATCTGTAAACCTGGACTCATGGACTCCTGAACAGTTG
AAGGTCATGAGCTTTGGAGGCAATGGCCGAGGACATACATTCTTTACACAGCATGGTTGGACTGATGGAGGTAAATTAGAAGCGAAGTACACATCAAGAGCAGCTGAGCTATATAGACAGCTTCTTGCAAAGGAAGTTGCAAGAAGCTTGATGAATGGAACAAGTCAGACACCATCCTCATTGCCTGATGCTTCACAAGC
AAACCATGTGACTAATGGAGATTCTAATGGAAAGAGTTCAACATTAGCAACTGATTTTTTCTTCAATGATGAACTTGATGCACCTCAAGCAGTTTCTTCTAAAGCTCAAGTAGGTCCTCCACCTCCAGCTATTGCAAGTACAGTTAAAAAACCACTGGGAGCCAAGAGAATTGTTGGGAGCAAAACTGGTGGGCTTGGTG
TCAAAAAGCTTACAACTAAGCCAAAGGAGAATCTCTATGATCAAAAGCCAGAAGAACCTGCAAGTGCAACTACCAGCATTCCTTCAAGTGCATCTACAGCAGCACATGATGCATCTCGCTCGTCTCGGTTCTCATACATGGAGAATAACTCTAATGGAGACTCAAATGGTGGAGCACATATCTCTGGTCATGTTCCTCCT
CCTGCAGTGACGAACTTTTTTGATGATTTTGGATTAAATGCAGGAAATCAAAAGAAAAAAAACTCAAGCCGCTCTCCACAGATTGAAGAAAGTAATGAGGCAAGGCAGAAATTTGCAAATGCCAAGTCAATATCTTCTTCGCAATTCTTTGGCGAGCACAAGAATGGGGTTGATACAGAAACTCAAGTCTGCTTGCAGAA
GTTTTCTGGCTCATCAGGCATATCAAGCAACGAGCTTTTTGGACATGATGAGTATGATTCTCCACTGGACTTGACAGCAAGTGAGCTTATTACAAGGATTTCGTTGCAGGCATCGCAGGACTTATCAACCCTAAAGAACATAGCTGGTGAAACTGGCAAGAAGCTATCTTCATTTGCTTCAAGCTTTATGGCAGATTTTT
AGGTCGCATTGTATGATCAACATGTTTCGGGATTTCTGGAGTTATTTGTGACTATCTATGTGACAACATACCGTGGCTTTCTCAGGGATAAAGTTTATGCAGTTCCAGAATTGGTTGGCATTCCGTCTCATCTCTAAATAGTACCATAATAATTGCAGAAGATGTATTATTAGGAATGCGAGCTCTATTCTATAGATATT
GAGGATACTTGTTTATGTTTCCTTTGAACTGTAGACATGGGGAGCTTAAATGTCTCATTCATCCAACTGGAAAATGTCTAATAAGTTTCCAGTTAGTATTGGTGGAAAATTTCTTACTTTTCATGAGCTGATTTTAATATACCAATTTTAATATGTTTCTCTAATGTTTATAGGACCAGTTTCAATCGTTTGGCTCTTAT
TTCCACCCTAACACAACAGGTTTTAATAAGATTTTTTAGTTGTGGTTAATAATAA

>TRINITY_DN120122_c3_g1_i4 from sample A3 / Example unspliced isoform:

TTAAAATGCCACTAGATTTTCACCCAACAAAAATATATAAATCGTTACAATAGAGCTTAACAATATCTGAGGAGGGCATGAATGAAGAGGGCGTTGCTTTTCTCGAACACACAGTCTGATCTCTGTGCTCAGGGCAGTCCGAGAATCGTTTCACCTTTACCATCATCACCCGCCAATGGCTTCCGAGGATTTCAGTGACA
AGAATGCTGTGTTCAGAAAACTCCGGGCAAAATCCGAAAACAAGGTGTGCTTTGACTGTAGCACAAGGAATCCCACATGGGCATCGGTCACTTATGGGATTTTCATCTGCCTGGATTGTTCTGCAGCCCATCGTAGCCTTGGTGTTCACATCAGCTTTGTCAGATCTGTAAACCTGGACTCATGGACTCCTGAACAGTTG
AAGGTCATGAGCTTTGGAGGCAATGGCCGAGGACATACATTCTTTACACAGCATGGTTGGACTGATGGAGGTAAATTAGAAGCGAAGTACACATCAAGAGCAGCTGAGCTATATAGACAGCTTCTTGCAAAGGAAGTTGCAAGAAGCTTGATGAATGGAACAAGTCAGACACCATCCTCATTGCCTGATGCTTCACAAGC
AAACCATGTGACTAATGGAGATTCTAATGGAAAGAGTTCAACATTAGCAACTGATTTTTTCTTCAATGATGAACTTGATGCACCTCAAGCAGTTTCTTCTAAAGCTCAAGTAGGTCCTCCACCTCCAGCTATTGCAAGTACAGTTAAAAAACCACTGGGAGCCAAGAGAATTGTTGGGAGCAAAACTGGTGGGCTTGGTG
TCAAAAAGCTTACAACTAAGCCAAAGGAGAATCTCTATGATCAAAAGCCAGAAGAACCTGCAAGTGCAACTACCAGCATTCCTTCAAGTGCATCTACAGCAGCACATGATGCATCTCGCTCGTCTCGGTTCTCATACATGGAGAATAACTCTAATGGAGACTCAAATGGTGGAGCACATATCTCTGGTCATGTTCCTCCT
CCTGCAGTGACGAACTTTTTTGATGATTTTGGATTAAATGCAGGAAATCAAAAGAAAAAAAACTCAAGCCGCTCTCCACAGATTGAAGAAAGTAATGAGGCAAGGCAGAAATTTGCAAATGCCAAGTCAATATCTTCTTCGCAATTCTTTGGCGAGCACAAGAATGGGGTTGATACAGAAACTCAAGTCTGCTTGCAGAA
GTTTTCTGGCTCATCAGGCATATCAAGCAACGAGCTTTTTGGACATGATGAGTATGATTCTCCACTGGACTTGACAGCAAGTGAGCTTATTACAAGGATTTCGTTGCAGGCATCGCAGGACTTATCAACCCTAAAGAACATAGCTGGTGAAACTGGCAAGAAGCTATCTTCATTTGCTTCAAGCTTTATGGCAGATTTTT
AGGTCGCATTGTATGATCAACATGTTTCGGGATTTCTGGAGgtgactaataatgcaagcttgtgataataattagtcagttttgggctatggtatttccattctttgtttgatttgttgtactggttggctgggagattcttaaggtggcatctagaaattttcaaaatgttggtgtatttattcattctttgacagaaa
ataatttctgcactttcaacttgttgctttgggtagtgtcaacggtgctccaaggcctcgttctatgtagaatttgttacagtatcgtgcaatatatgtttcactgtttaattgcagTTATTTGTGACTATCTATGTGACAACATACCGTGGCTTTCTCAGGGATAAAGTTTATGCAGTTCCAGAATTGGTTGGCATTCC
GTCTCATCTCTAAATAGTACCATAATAATTGCAGAAGATGTATTATTAGGAATGCGAGCTCTATTCTATAGATATTGAGGATACTTGTTTATGTTTCCTTTGAACTGTAGACATGGGGAGCTTAAATGTCTCATTCATCCAACTGGAAAATGTCTAATAAGTTTCCAGTTAGTATTGGTGGAAAATTTCTTACTTTTCAT
GAGCTGATTTTAATATACCAATTTTAATATGTTTCTCTAATGTTTATAGGACCAGTTTCAATCGTTTGGCTCTTATTTCCACCCTAACACAACAGGTTTTAATAAGATTTTTTAGTTGTGGTTAATAATAA

Intron 2 GTGACTAATA ... GCTTTCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	71.69	248	628	85
A2	71.19	189	467	56
A3	74.19	168	483	79
A4	69.17	148	332	43
A5	70.66	76	183	42
A6	72.79	925.1	2475.1	431
A7	74.32	1238.2	3583.1	550
A8	74.16	1766.4	5069.1	979
A9	72.99	1208.4	3266.1	661
A10	73.03	905.2	2451	456

>TRINITY_DN133304_c2_g3_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

AACAACCACCCAAGTATGATATTCATAAAGTTATACGTTCAATATGAAGAATAATTTAAAATGCCACTAGATTTTCACCCAACAAAAATATATAAATCGTTACAATAGAGCTTAACAATATCTGAGGAGGGCATGAATGAAGAGGGCGTTGCTTTTCTCGAACACACAGTCTGATCTCTGTGCTCAGGGCAGTCCGAGAA
TCGTTTCACCTTTACCATCATCACACGCCAATGGCTTCCGAGGATTTCAGTGACAAGAATGCTGTGTTCAGAAAACTCCGGGCAAAATCCGAAAACAAGGTGTGCTTTGACTGTAGCACAAGGAATCCCACATGGGCATCGGTCACTTATGGGATTTTCATCTGCCTGGATTGTTCTGCAGCCCATCGTAGCCTTGGTGT
TCACATCAGCTTTGTCAGATCTGTAAACCTGGACTCATGGACTCCTGAACAGTTGAAGGTCATGAGCTTTGGAGGCAATGGCCGAGGACATACATTCTTTACACAGCATGGTTGGACTGATGGAGGTAAATTAGAAGCGAAGTACACATCAAGAGCAGCTGAGCTATATAGACAGCTTCTTGCAAAGGAAGTTGCAAGAA
GCTTGATGAATGGAACAAGTCAGACACCATCCTCATTGCCTGATGCTTCACAAGCAAACCATGTGACTAATGGAGATTCTAATGGAAAGAGTTCAACATTAGCAACTGATTTTTTCTTCAATGATGAACTTGATGCACCTCAAGCAGTTTCTTCTAAAGCTCAAGTAGGTCCTCCACCTCCAGCTATTGCAAGTACAGTT
AAAAAACCACTGGGAGCCAAGAGAATTGTTGGGAGCAAAACTGGTGGGCTTGGTGTCAAAAAGCTTACAACTAAGCCAAAGGAGAATCTCTATGATCAAAAGCCAGAAGAACCTGCAAGTGCAACTACCAGCATTCCTTCAAGTGCATCTACAGCAGCACATGATGCATCTCGCTCGTCTCGGTTCTCATACATGGAGAA
TAACTCTAATGGAGACTCAAATGGTGGAGCACATATCTCTGGTCATGTTCCTCCTCCTGCAGTGACGAACTTTTTTGATGATTTTGGATTAAATGCAGGAAATCAAAAGAAAAAAAACTCAAGCCGCTCTCCACAGATTGAAGAAAGTAATGAGGCAAGGCAGAAATTTGCAAATGCCAAGTCAATATCTTCTTCGCAAT
TCTTTGGCGAGCACAAGAATGGGGTTGATACAGAAACTCAAGTCTGCTTGCAGAAGTTTTCTGGCTCATCAGGCATATCAAGCAACGAGCTTTTTGGACATGATGAGTATGATTCTCCACTGGACTTGACAGCAAGTGAGCTTATTACAAGGATTTCGTTGCAGGCATCGCAGGACTTATCAACCCTAAAGAACATAGCT
GGTGAAACTGGCAAGAAGCTATCTTCATTTGCTTCAAGCTTTATGGCAGATTTTTAGGTCGCATTGTATGATCAACATGTTTCGGGATTTCTGGAGGGATAAAGTTTATGCAGTTCCAGAATTGGTTGGCATTCCGTCTCATCTCTAAATAGTACCATAATAATTGCAGAAGATGTATTATTAGGAATGCGAGCTCTATT
CTATAGATATTGAGGATACTTGTTTATGTTTCCTTTGAACTGTAGACATGGGGAGCTTAAATGTCTCATTCATCCAACTGGAAAATGTCTAATAAGTTTCCAGTTAGTATTGGTGGAAAATTTCTTACTTTTCATGAGCTGATTTTAATATACCAATTTTAATATGTTTCTCTAATGTTTATAGGACCAGTTTCAATCGT
TTGGCTCTTATTTCCACCCTAACACAACAGGTTTTAATAAGATTTTTTAGTTGTGGTTAATAATAAAAATTGAATATTTTCACTACAATATTTGATTTTTCATAGTGAAACTTGTCTCTATAACAATGATTTCGTCTATGTTGGAAAGCACAGCATCGGAGTCTCCTAAGCTGATGTTTGTCTACCTTTCACTGCATCTA
CACTATTATATTTTCTGCTGTAAGTAGCTGATTAATGACATTAGGCTTGTCAAATTGTCAGTAAAACAATAA

>TRINITY_DN133304_c2_g3_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGAGGACCTTCGTGGCAGATCTGCTCCTACAGTCAATTAGGCGACAGATCTGCCTTGGTGTTCACATCAGCTTTGTCAGATCTGTAAACCTGGACTCATGGACTCCTGAACAGTTGAAGGTCATGAGCTTTGGAGGCAATGGCCGAGGACATACATTCTTTACACAGCATGGTTGGACTGATGGAGGTAAATTAGAAGCG
AAGTACACATCAAGAGCAGCTGAGCTATATAGACAGCTTCTTGCAAAGGAAGTTGCAAGAAGCTTGATGAATGGAACAAGTCAGACACCATCCTCATTGCCTGATGCTTCACAAGCAAACCATGTGACTAATGGAGATTCTAATGGAAAGAGTTCAACATTAGCAACTGATTTTTTCTTCAATGATGAACTTGATGCACC
TCAAGCAGTTTCTTCTAAAGCTCAAGTAGGTCCTCCACCTCCAGCTATTGCAAGTACAGTTAAAAAACCACTGGGAGCCAAGAGAATTGTTGGGAGCAAAACTGGTGGGCTTGGTGTCAAAAAGCTTACAACTAAGCCAAAGGAGAATCTCTATGATCAAAAGCCAGAAGAACCTGCAAGTGCAACTACCAGCATTCCTT
CAAGTGCATCTACAGCAGCACATGATGCATCTCGCTCGTCTCGGTTCTCATACATGGAGAATAACTCTAATGGAGACTCAAATGGTGGAGCACATATCTCTGGTCATGTTCCTCCTCCTGCAGTGACGAACTTTTTTGATGATTTTGGATTAAATGCAGGAAATCAAAAGAAAAAAAACTCAAGCCGCTCTCCACAGATT
GAAGAAAGTAATGAGGCAAGGCAGAAATTTGCAAATGCCAAGTCAATATCTTCTTCGCAATTCTTTGGCGAGCACAAGAATGGGGTTGATACAGAAACTCAAGTCTGCTTGCAGAAGTTTTCTGGCTCATCAGGCATATCAAGCAACGAGCTTTTTGGACATGATGAGTATGATTCTCCACTGGACTTGACAGCAAGTGA
GCTTATTACAAGGATTTCGTTGCAGGCATCGCAGGACTTATCAACCCTAAAGAACATAGCTGGTGAAACTGGCAAGAAGCTATCTTCATTTGCTTCAAGCTTTATGGCAGATTTTTAGGTCGCATTGTATGATCAACATGTTTCGGGATTTCTGGAGgtgactaataatgcaagcttgtgataataattagtcagttttg
ggctatggtatttccattctttgtttgatttgttgtactggttggctgggagattcttaaggtggcatctagaaattttcaaaatgttggtgtatttattcattctttgacagaaaataatttctgcactttcaacttgttgctttgggtagtgtcaacggtgctccaaggcctcgttctatgtagaatttgttacagta
tcgtgcaatatatgtttcactgtttaattgcagttatttgtgactatctatgtgacaacataccgtggctttctcagGGATAAAGTTTATGCAGTTCCAGAATTGGTTGGCATTCCGTCTCATCTCTAAATAGTACCATAATAATTGCAGAAGATGTATTATTAGGAATGCGAGCTCTATTCTATAGATATTGAGGATAC
TTGTTTATGTTTCCTTTGAACTGTAGACATGGGGAGCTTAAATGTCTCATTCATCCAACTGGAAAATGTCTAATAAGTTTCCAGTTAGTATTGGTGGAAAATTTCTTACTTTTCATGAGCTGATTTTAATATACCAATTTTAATATGTTTCTCTAATGTTTATAGGACCAGTTTCAATCGTTTGGCTCTTATTTCCACCC
TAACACAACAGGTTTTAATAAGATTTTTTAGTTGTGGTTAATAATAAAAATTGAATATTTTCACTACAATATTTGATTTTTCATAGTGAAACTTGTCTCTATAACAATGATTTCGTCTATGTTGGAAAGCACAGCATCGGAGTCTCCTAAGCTGATGTTTGTCTACCTTTCACTGCATCTACACTATTATATTTTCTGCT
GTAAGTAGCTGATTAATGACATTAGGCTTGTCAAATTGTCAGTAAAACAATAA