sp|A7X672|ITPK3_SOYBN ----> Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase 3
Intron 1 GTACGTGTTT ... TTGTGTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.42 | 113 | 0 | 29 |
| A2 | 21.48 | 106 | 0 | 29 |
| A3 | 25.16 | 119 | 4 | 40 |
| A4 | 21.45 | 95.2 | 3 | 26 |
| A5 | 21.74 | 72 | 7 | 20 |
| A6 | 22.49 | 541 | 3 | 157 |
| A7 | 20.72 | 421 | 3 | 110 |
| A8 | 23.59 | 447 | 3 | 138 |
| A9 | 23.71 | 383 | 0 | 119 |
| A10 | 21.58 | 298 | 0 | 82 |
>TRINITY_DN110332_c0_g1_i9 from sample A3 / Example spliced isoformGTGTTCCAAAGCAGCTGGTCATAACTGGGGACCCTGCTTCGATTCCCAGTGCTGTTGCTAAAGCAGGGCTAAAGTTGCCACTGGTTGCCAAGCCATTGGTAGTGGATGGTACAGCGAAGTCACATGCATTATCACTAGCATATGATCAGGTCAGCCTGTCAGAGCTTGACCCCCCTCTGGTGCTCCAAGAGTTTGTAAAT
CATGGTGGAGTACTTTTCAAGGTTTACATTGTTGGGGATACCATTAAAGTAGTGCGCAGGTTCTCTTTACCTGATGTAGATGAAAGTGAATCTTTGGGCTATGGAGTGATTCCATTTCCAAGGGTGTCAAGTGCTTCTGCTTCAGCTGATGATGCAGATTTAGATCCACATGTTGGGGAGTTGCCTCCACCGTTGTTGCT
TGATAAACTTGCAACCGAACTCCGCAGAAGGCTGGGACTCCGACTTTTCAATTTAGACATCATTCGTGAACATGGAACAAGAGATCACTACTATGTAATTGACATCAACTATTTCCCTGGCTATGGAAAAATGCCTGGATATGAGCACATTTTCACGGACTTTCTTTTAAGCCTAGTACAGGGAAAGCATCGAAAGATCA
CAGGGGCTGGTATCTGCTCTGTGGATAGTGATGACTGTTAAAGATAGTGCCCTAGAATAGAAATTCATGACATCTCTCCTCTTGTTTTTTTCAGTTTTAAATACCAGCCGCTTGTAAGATCTGAATGTGTCAAATTTAGGCACTTGACAGATATTTCCAGCTCAATCAGAGAGATCATGGAGATTGAATATTCACCCAAT
TTCCGGATGAGATATTATTTTTACCAAATGTCCTCATTGCACAGACTTCAACATTGTATTTCAGGTGGCCCAGTGGTCATCCAGGGTGCAAAGAACAGTGGAAGTTTCAGCTACCATCCAGCCTTTGCAGTGGGCTCACACCCGCTCCGGAGTCCATCAAGGCAAAACGATGGCTTCTTTTTATACTGTTCTTCTGCATG
GGTCTCTGTAGATAACATGCAAGCAAAGATGGATTTATTGTACACTTTGATTTATTGTACATAATTTTGCATAACAACGACCTAGTAATTGATGCATATCATTCTGTTGTCAATTGTATCTGGATAGCTCCTAAATCCTAATATTTGTTGTTGGAACTTTATTACGTGTAAAATGTGAATCTAATTATCAAAGGAATATC
AAGTTTAATTATGTATGTGGATTTTGTGCAAGACAAAGTAGATACAGTGC
>TRINITY_DN110332_c0_g1_i6 from sample A3 / Example unspliced isoform:GGTTTTCTTTGGAGCATTCCTGGTGGATTGCACTCTTTCTTATTACATCTGACTTCTGTTACATAATTTCTAACGATTGTCATGCTTCTTATGAATCTTGTATTTAATGCTTGCAGAGTTGCCTCCACCGTTGTTGCTTGATAAACTTGCAACCGAACTCCGCAGAAGGCTGGTAAGTAGTATGCATCTTTGCAACAATT
AATTATTAAATGACTTAAAATTTTACTTCTATATTTCATATCCTGGGCGTTATTTAGGTTTAGAGATGCTGGAAGTAATCTCTTGGGATATAGTACATAGTGTATTTTATAGACCCATTGATTGGTTTTAACCCATCCAGTGATACTTCAATGTTGCTTTCGAAAACATATAGGTGGATATGTTTTTCTGACTTGGCTGT
TACTGTAATGTAATCCAGGGACTCCGACTTTTCAATTTAGACATCATTCGTGAACATGGAACAAGAGATCACTACTATGTAATTGACATCAACTATTTCCCTGgtacgtgtttcaaaattttatatgccatggttgtccaaaattgaatgtttgttgcttacacactggatacattttcatcctttgtatttgatttgag
ttactgctagagatcctgttttctttagatcgtccactggcaatcactgatataaattgttatttgtgtacagGCTATGGAAAAATGCCTGGATATGAGCACATTTTCACGGACTTTCTTTTAAGCCTAGTACAGGGAAAGCATCGAAAGATCACAGGGGCTGGTATCTGCTCTGTGGATAGTGATGACTGTTAAAGATA
GTGCCCTAGAATAGAAATTCATGACATCTCTCCTCTTGTTTTTTTCAGTTTTAAATACCAGCCGCTTGTAAGATCTGAATGTGTCAAATTTAGGCACTTGACAGATATTTCCAGCTCAATCAGAGAGATCATGGAGATTGAATATTCACCCAATTTCCGGATGAGATATTATTTTTACCAAATGTCCTCATTGCACAGAC
TTCAACATTGTATTTCAGGTATCTTGTTTGGAAAGGGCAAGTTCCTTTGTATATTCTGTGCAATGCTGTTTTCTCCCACAGGTCAATTCTGTCTCTGCTTAAATCGGAATTTAGGTTTGGTTGGTGGAGGCAGGTGGCCCAGTGGTCATCCAGGGTGCAAAGAACAGTGGAAGTTTCAGCTACCATCCAGGTTATTATTT
GTCAGCATGATATTGTTACTTTCCAAGTTTATTTTTCAGCAGGACTACTTAATCTCGTCTTGCTGTTGTACATGAACTACAATTGATTAACTGGTCACAAATCTCATTTCATGGCATTTGTATTTAATGATTCATCAGCTTTGAAGTGTACATTTCTTGTTGTGCAGTTTTAACTATTGCACGACTTAATTGATATGAAA
CTATTCTGCTTACTTTGTTGGGCTCTGAGGTTCTGATATAATTGAATGTTTATTATTTATCCATCTAGAATACTCGTTATTTTAGTTGAAATTGTGAAACGTAGGAAAAACCTCTGAATAATATTTTTTTTTGCAGCCTTTGCAGTGGGCTCACACCCGCTCCGGAGTCCATCAAGGCAAAACGATGGCTTCTTTTTATA
CTGTTCTTCTGCATGGGTCTCTGTAGATAACATGCAAGCAAAGATGGATTTATTGTACACTTTGATTTATTGTACATAATTTTGCATAACAACGACCTAGTAATTGATGCATATCATTCTGTTGTCAATTGTATCTGGATAGCTCCTAAATCCTAATATTTGTTGTTGGAACTTTATTACGTGTAAAATGTGAATCTAAT
TATCAAAGGAATATCAAGTTTAATTATGTATGTGGATTTTGTGCAAGACAAAGTAGATACAGTGC
Intron 2 GTAAGTTTTA ... TTCTTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.39 | 148.5 | 4 | 38 |
| A2 | 18.19 | 103.5 | 1 | 23 |
| A3 | 13.97 | 117.5 | 6.5 | 19 |
| A4 | 19.72 | 90 | 0.5 | 22 |
| A5 | 23.82 | 38.5 | 7 | 12 |
| A6 | 15.38 | 331 | 1 | 60 |
| A7 | 19.77 | 285 | 3 | 70 |
| A8 | 24.52 | 225 | 8 | 73 |
| A9 | 16.96 | 285 | 3.5 | 58 |
| A10 | 13.91 | 268 | 3 | 43 |
>TRINITY_DN110332_c0_g1_i9 from sample A3 / Example spliced isoformGTGTTCCAAAGCAGCTGGTCATAACTGGGGACCCTGCTTCGATTCCCAGTGCTGTTGCTAAAGCAGGGCTAAAGTTGCCACTGGTTGCCAAGCCATTGGTAGTGGATGGTACAGCGAAGTCACATGCATTATCACTAGCATATGATCAGGTCAGCCTGTCAGAGCTTGACCCCCCTCTGGTGCTCCAAGAGTTTGTAAAT
CATGGTGGAGTACTTTTCAAGGTTTACATTGTTGGGGATACCATTAAAGTAGTGCGCAGGTTCTCTTTACCTGATGTAGATGAAAGTGAATCTTTGGGCTATGGAGTGATTCCATTTCCAAGGGTGTCAAGTGCTTCTGCTTCAGCTGATGATGCAGATTTAGATCCACATGTTGGGGAGTTGCCTCCACCGTTGTTGCT
TGATAAACTTGCAACCGAACTCCGCAGAAGGCTGGGACTCCGACTTTTCAATTTAGACATCATTCGTGAACATGGAACAAGAGATCACTACTATGTAATTGACATCAACTATTTCCCTGGCTATGGAAAAATGCCTGGATATGAGCACATTTTCACGGACTTTCTTTTAAGCCTAGTACAGGGAAAGCATCGAAAGATCA
CAGGGGCTGGTATCTGCTCTGTGGATAGTGATGACTGTTAAAGATAGTGCCCTAGAATAGAAATTCATGACATCTCTCCTCTTGTTTTTTTCAGTTTTAAATACCAGCCGCTTGTAAGATCTGAATGTGTCAAATTTAGGCACTTGACAGATATTTCCAGCTCAATCAGAGAGATCATGGAGATTGAATATTCACCCAAT
TTCCGGATGAGATATTATTTTTACCAAATGTCCTCATTGCACAGACTTCAACATTGTATTTCAGGTGGCCCAGTGGTCATCCAGGGTGCAAAGAACAGTGGAAGTTTCAGCTACCATCCAGCCTTTGCAGTGGGCTCACACCCGCTCCGGAGTCCATCAAGGCAAAACGATGGCTTCTTTTTATACTGTTCTTCTGCATG
GGTCTCTGTAGATAACATGCAAGCAAAGATGGATTTATTGTACACTTTGATTTATTGTACATAATTTTGCATAACAACGACCTAGTAATTGATGCATATCATTCTGTTGTCAATTGTATCTGGATAGCTCCTAAATCCTAATATTTGTTGTTGGAACTTTATTACGTGTAAAATGTGAATCTAATTATCAAAGGAATATC
AAGTTTAATTATGTATGTGGATTTTGTGCAAGACAAAGTAGATACAGTGC
>TRINITY_DN110332_c0_g1_i8 from sample A3 / Example unspliced isoform:GTGTTCCAAAGCAGCTGGTCATAACTGGGGACCCTGCTTCGATTCCCAGTGCTGTTGCTAAAGCAGGGCTAAAGTTGCCACTGGgtaagttttagttatattgtgcaataattgatgattatacactaatattttcttagcacttgaggctgaggcaaatataggattagtgacagctacagcattttcatgttgctata
ttctttgtagTTGCCAAGCCATTGGTAGTGGATGGTACAGCGAAGTCACATGCATTATCACTAGCATATGATCAGGTCAGCCTGTCAGAGCTTGACCCCCCTCTGGTGCTCCAAGAGTTTGTAAATCATGGTGGAGTACTTTTCAAGGTTTACATTGTTGGGGATACCATTAAAGTAGTGCGCAGGTTCTCTTTACCTGA
TGTAGATGAAAGTGAATCTTTGGGCTATGGAGTGATTCCATTTCCAAGGGTGTCAAGTGCTTCTGCTTCAGCTGATGATGCAGATTTAGATCCACATGTTGGGGAGTTGCCTCCACCGTTGTTGCTTGATAAACTTGCAACCGAACTCCGCAGAAGGCTGGGACTCCGACTTTTCAATTTAGACATCATTCGTGAACATG
GAACAAGAGATCACTACTATGTAATTGACATCAACTATTTCCCTGGCTATGGAAAAATGCCTGGATATGAGCACATTTTCACGGACTTTCTTTTAAGCCTAGTACAGGGAAAGCATCGAAAGATCACAGGGGCTGGTATCTGCTCTGTGGATAGTGATGACTGTTAAAGATAGTGCCCTAGAATAGAAATTCATGACATC
TCTCCTCTTGTTTTTTTCAGTTTTAAATACCAGCCGCTTGTAAGATCTGAATGTGTCAAATTTAGGCACTTGACAGATATTTCCAGCTCAATCAGAGAGATCATGGAGATTGAATATTCACCCAATTTCCGGATGAGATATTATTTTTACCAAATGTCCTCATTGCACAGACTTCAACATTGTATTTCAGGTATCTTGTT
TGGAAAGGGCAAGTTCCTTTGTATATTCTGTGCAATGCTGTTTTCTCCCACAGGTCAATTCTGTCTCTGCTTAAATCGGAATTTAGGTTTGGTTGGTGGAGGCAGGTGGCCCAGTGGTCATCCAGGGTGCAAAGAACAGTGGAAGTTTCAGCTACCATCCAGGTTATTATTTGTCAGCATGATATTGTTACTTTCCAAGT
TTATTTTTCAGCAGGACTACTTAATCTCGTCTTGCTGTTGTACATGAACTACAATTGATTAACTGGTCACAAATCTCATTTCATGGCATTTGTATTTAATGATTCATCAGCTTTGAAGTGTACATTTCTTGTTGTGCAGTTTTAACTATTGCACGACTTAATTGATATGAAACTATTCTGCTTACTTTGTTGGGCTCTGA
GGTTCTGATATAATTGAATGTTTATTATTTATCCATCTAGAATACTCGTTATTTTAGTTGAAATTGTGAAACGTAGGAAAAACCTCTGAATAATATTTTTTTTTGCAGCCTTTGCAGTGGGCTCACACCCGCTCCGGAGTCCATCAAGGCAAAACGATGGCTTCTTTTTATACTGTTCTTCTGCATGGGTCTCTGTAGAT
AACATGCAAGCAAAGATGGATTTATTGTACACTTTGATTTATTGTACATAATTTTGCATAACAACGACCTAGTAATTGATGCATATCATTCTGTTGTCAATTGTATCTGGATAGCTCCTAAATCCTAATATTTGTTGTTGGAACTTTATTACGTGTAAAATGTGAATCTAATTATCAAAGGAATATCAAGTTTAATTATG
TATGTGGATTTTGTGCAAGACAAAGTAGATACAGTGC
Intron 3 GTTATTATTT ... TTTTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 76.62 | 51.9 | 167.3 | 13 |
| A2 | 80.5 | 43.1 | 175 | 16 |
| A3 | 75.61 | 49 | 151 | 8 |
| A4 | 71.66 | 54.7 | 135 | 5 |
| A5 | 82.97 | 12 | 58 | 6 |
| A6 | 77.78 | 465.6 | 1608.3 | 77 |
| A7 | 81.48 | 240.4 | 1043.3 | 42 |
| A8 | 80.75 | 412.7 | 1709 | 65 |
| A9 | 80.67 | 275.9 | 1134 | 30 |
| A10 | 80.59 | 173 | 702.3 | 27 |
>TRINITY_DN110332_c0_g1_i4 from sample A3 / Example spliced isoformGGTTTTCTTTGGAGCATTCCTGGTGGATTGCACTCTTTCTTATTACATCTGACTTCTGTTACATAATTTCTAACGATTGTCATGCTTCTTATGAATCTTGTATTTAATGCTTGCAGAGTTGCCTCCACCGTTGTTGCTTGATAAACTTGCAACCGAACTCCGCAGAAGGCTGGGACTCCGACTTTTCAATTTAGACATCA
TTCGTGAACATGGAACAAGAGATCACTACTATGTAATTGACATCAACTATTTCCCTGGCTATGGAAAAATGCCTGGATATGAGCACATTTTCACGGACTTTCTTTTAAGCCTAGTACAGGGAAAGCATCGAAAGATCACAGGGGCTGGTATCTGCTCTGTGGATAGTGATGACTGTTAAAGATAGTGCCCTAGAATAGAA
ATTCATGACATATATGCTCTTTGTTTTTCAGTTTTAAATACCAGCCGCTTGTAAGATCTGAATGTGTCAAATTTAGGCACTTGACAGATATTTCCAGCTCAATCAGAGAGATCATGGAGATTGAATATTCACCCAATTTCCGGATGAGATATTATTTTTACCAAATGTCCTCATTGCACAGACTTCAACATTGTATTTCA
GGTATCTTGTTTGGAAAGGGCAAGTTCCTTTGTATATTCTGTGCAATGCTGTTTTCTCCCACAGGTCAATTCTGTCTCTGCTTAAATCGGAATTTAGGTTTGGTTGGTGGAGGCAGGTGGCCCAGTGGTCATCCAGGGTGCAAAGAACAGTGGAAGTTTCAGCTACCATCCAGCCTTTGCAGTGGGCTCACACCCGCTCC
GGAGTCCATCAAGGCAAAACGATGGCTTCTTTTTATACTGTTCTTCTGCATGGGTCTCTGTAGATAACATGCAAGCAAAGATGGATTTATTGTACACTTTGATTTATTGTACATAATTTTGCATAACAACGACCTAGTAATTGATGCATATCATTCTGTTGTCAATTGTATCTGGATAGCTCCTAAATCCTAATATTTGT
TGTTGGAACTTTATTACGTGTAAAATGTGAATCTAATTATCAAAGGAATATCAAGTTTAATTATGTATGTGGATTTTGTGCAAGACAAAGTAGATACAGTGC
>TRINITY_DN110332_c0_g1_i6 from sample A3 / Example unspliced isoform:GGTTTTCTTTGGAGCATTCCTGGTGGATTGCACTCTTTCTTATTACATCTGACTTCTGTTACATAATTTCTAACGATTGTCATGCTTCTTATGAATCTTGTATTTAATGCTTGCAGAGTTGCCTCCACCGTTGTTGCTTGATAAACTTGCAACCGAACTCCGCAGAAGGCTGGTAAGTAGTATGCATCTTTGCAACAATT
AATTATTAAATGACTTAAAATTTTACTTCTATATTTCATATCCTGGGCGTTATTTAGGTTTAGAGATGCTGGAAGTAATCTCTTGGGATATAGTACATAGTGTATTTTATAGACCCATTGATTGGTTTTAACCCATCCAGTGATACTTCAATGTTGCTTTCGAAAACATATAGGTGGATATGTTTTTCTGACTTGGCTGT
TACTGTAATGTAATCCAGGGACTCCGACTTTTCAATTTAGACATCATTCGTGAACATGGAACAAGAGATCACTACTATGTAATTGACATCAACTATTTCCCTGGTACGTGTTTCAAAATTTTATATGCCATGGTTGTCCAAAATTGAATGTTTGTTGCTTACACACTGGATACATTTTCATCCTTTGTATTTGATTTGAG
TTACTGCTAGAGATCCTGTTTTCTTTAGATCGTCCACTGGCAATCACTGATATAAATTGTTATTTGTGTACAGGCTATGGAAAAATGCCTGGATATGAGCACATTTTCACGGACTTTCTTTTAAGCCTAGTACAGGGAAAGCATCGAAAGATCACAGGGGCTGGTATCTGCTCTGTGGATAGTGATGACTGTTAAAGATA
GTGCCCTAGAATAGAAATTCATGACATCTCTCCTCTTGTTTTTTTCAGTTTTAAATACCAGCCGCTTGTAAGATCTGAATGTGTCAAATTTAGGCACTTGACAGATATTTCCAGCTCAATCAGAGAGATCATGGAGATTGAATATTCACCCAATTTCCGGATGAGATATTATTTTTACCAAATGTCCTCATTGCACAGAC
TTCAACATTGTATTTCAGGTATCTTGTTTGGAAAGGGCAAGTTCCTTTGTATATTCTGTGCAATGCTGTTTTCTCCCACAGGTCAATTCTGTCTCTGCTTAAATCGGAATTTAGGTTTGGTTGGTGGAGGCAGGTGGCCCAGTGGTCATCCAGGGTGCAAAGAACAGTGGAAGTTTCAGCTACCATCCAGgttattattt
gtcagcatgatattgttactttccaagtttatttttcagcaggactacttaatctcgtcttgctgttgtacatgaactacaattgattaactggtcacaaatctcatttcatggcatttgtatttaatgattcatcagctttgaagtgtacatttcttgttgtgcagttttaactattgcacgacttaattgatatgaaa
ctattctgcttactttgttgggctctgaggttctgatataattgaatgtttattatttatccatctagaatactcgttattttagttgaaattgtgaaacgtaggaaaaacctctgaataatatttttttttgcagCCTTTGCAGTGGGCTCACACCCGCTCCGGAGTCCATCAAGGCAAAACGATGGCTTCTTTTTATA
CTGTTCTTCTGCATGGGTCTCTGTAGATAACATGCAAGCAAAGATGGATTTATTGTACACTTTGATTTATTGTACATAATTTTGCATAACAACGACCTAGTAATTGATGCATATCATTCTGTTGTCAATTGTATCTGGATAGCTCCTAAATCCTAATATTTGTTGTTGGAACTTTATTACGTGTAAAATGTGAATCTAAT
TATCAAAGGAATATCAAGTTTAATTATGTATGTGGATTTTGTGCAAGACAAAGTAGATACAGTGC
Intron 4 GTATGGAAGT ... TTGGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 15.2 | 145 | 33 | 19 |
| A2 | 13.78 | 97 | 19 | 12 |
| A3 | 12.64 | 114 | 22 | 11 |
| A4 | 15.09 | 90 | 22 | 10 |
| A5 | 19.33 | 48 | 13 | 10 |
| A6 | 13.28 | 418 | 66 | 62 |
| A7 | 12.42 | 395 | 71 | 41 |
| A8 | 13.54 | 297 | 68 | 25 |
| A9 | 15.03 | 359 | 69 | 58 |
| A10 | 11.64 | 296 | 47 | 31 |
>TRINITY_DN110332_c0_g1_i9 from sample A3 / Example spliced isoformGTGTTCCAAAGCAGCTGGTCATAACTGGGGACCCTGCTTCGATTCCCAGTGCTGTTGCTAAAGCAGGGCTAAAGTTGCCACTGGTTGCCAAGCCATTGGTAGTGGATGGTACAGCGAAGTCACATGCATTATCACTAGCATATGATCAGGTCAGCCTGTCAGAGCTTGACCCCCCTCTGGTGCTCCAAGAGTTTGTAAAT
CATGGTGGAGTACTTTTCAAGGTTTACATTGTTGGGGATACCATTAAAGTAGTGCGCAGGTTCTCTTTACCTGATGTAGATGAAAGTGAATCTTTGGGCTATGGAGTGATTCCATTTCCAAGGGTGTCAAGTGCTTCTGCTTCAGCTGATGATGCAGATTTAGATCCACATGTTGGGGAGTTGCCTCCACCGTTGTTGCT
TGATAAACTTGCAACCGAACTCCGCAGAAGGCTGGGACTCCGACTTTTCAATTTAGACATCATTCGTGAACATGGAACAAGAGATCACTACTATGTAATTGACATCAACTATTTCCCTGGCTATGGAAAAATGCCTGGATATGAGCACATTTTCACGGACTTTCTTTTAAGCCTAGTACAGGGAAAGCATCGAAAGATCA
CAGGGGCTGGTATCTGCTCTGTGGATAGTGATGACTGTTAAAGATAGTGCCCTAGAATAGAAATTCATGACATCTCTCCTCTTGTTTTTTTCAGTTTTAAATACCAGCCGCTTGTAAGATCTGAATGTGTCAAATTTAGGCACTTGACAGATATTTCCAGCTCAATCAGAGAGATCATGGAGATTGAATATTCACCCAAT
TTCCGGATGAGATATTATTTTTACCAAATGTCCTCATTGCACAGACTTCAACATTGTATTTCAGGTGGCCCAGTGGTCATCCAGGGTGCAAAGAACAGTGGAAGTTTCAGCTACCATCCAGCCTTTGCAGTGGGCTCACACCCGCTCCGGAGTCCATCAAGGCAAAACGATGGCTTCTTTTTATACTGTTCTTCTGCATG
GGTCTCTGTAGATAACATGCAAGCAAAGATGGATTTATTGTACACTTTGATTTATTGTACATAATTTTGCATAACAACGACCTAGTAATTGATGCATATCATTCTGTTGTCAATTGTATCTGGATAGCTCCTAAATCCTAATATTTGTTGTTGGAACTTTATTACGTGTAAAATGTGAATCTAATTATCAAAGGAATATC
AAGTTTAATTATGTATGTGGATTTTGTGCAAGACAAAGTAGATACAGTGC
>TRINITY_DN110332_c0_g1_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:GTGTTCCAAAGCAGCTGGTCATAACTGGGGACCCTGCTTCGATTCCCAGTGCTGTTGCTAAAGCAGGGCTAAAGTTGCCACTGGTTGCCAAGCCATTGGTAGTGGATGGTACAGCGAAGTCACATGCATTATCACTAGCATATGATCAGGTCAGCCTGTCAGAGCTTGACCCCCCTCTGGTGCTCCAAGAGTTTGTAAAT
CATGgtatggaagtaaacatcctcaacttctgttgttcaagcttttagttgcgtaatgctttcagcagtactctttcaacttatttggtaagtagttaatcaatcaagcaatctaccttggttgcagGTGGAGTACTTTTCAAGGTTTACATTGTTGGGGATACCATTAAAGTAGTGCGCAGGTTCTCTTTACCTGATGT
AGATGAAAGTGAATCTTTGGGCTATGGAGTGATTCCATTTCCAAGGGTGTCAAGTGCTTCTGCTTCAGCTGATGATGCAGATTTAGATCCACATGTTGGGGAGTTGCCTCCACCGTTGTTGCTTGATAAACTTGCAACCGAACTCCGCAGAAGGCTGGGACTCCGACTTTTCAATTTAGACATCATTCGTGAACATGGAA
CAAGAGATCACTACTATGTAATTGACATCAACTATTTCCCTGGCTATGGAAAAATGCCTGGATATGAGCACATTTTCACGGACTTTCTTTTAAGCCTAGTACAGGGAAAGCATCGAAAGATCACAGGGGCTGGTATCTGCTCTGTGGATAGTGATGACTGTTAAAGATAGTGCCCTAGAATAGAAATTCATGACATCTCT
CCTCTTGTTTTTTTCAGTTTTAAATACCAGCCGCTTGTAAGATCTGAATGTGTCAAATTTAGGCACTTGACAGATATTTCCAGCTCAATCAGAGAGATCATGGAGATTGAATATTCACCCAATTTCCGGATGAGATATTATTTTTACCAAATGTCCTCATTGCACAGACTTCAACATTGTATTTCAGGTATCTTGTTTGG
AAAGGGCAAGTTCCTTTGTATATTCTGTGCAATGCTGTTTTCTCCCACAGGTCAATTCTGTCTCTGCTTAAATCGGAATTTAGGTTTGGTTGGTGGAGGCAGGTGGCCCAGTGGTCATCCAGGGTGCAAAGAACAGTGGAAGTTTCAGCTACCATCCAGGTTATTATTTGTCAGCATGATATTGTTACTTTCCAAGTTTA
TTTTTCAGCAGGACTACTTAATCTCGTCTTGCTGTTGTACATGAACTACAATTGATTAACTGGTCACAAATCTCATTTCATGGCATTTGTATTTAATGATTCATCAGCTTTGAAGTGTACATTTCTTGTTGTGCAGTTTTAACTATTGCACGACTTAATTGATATGAAACTATTCTGCTTACTTTGTTGGGCTCTGAGGT
TCTGATATAATTGAATGTTTATTATTTATCCATCTAGAATACTCGTTATTTTAGTTGAAATTGTGAAACGTAGGAAAAACCTCTGAATAATATTTTTTTTTGCAGCCTTTGCAGTGGGCTCACACCCGCTCCGGAGTCCATCAAGGCAAAACGATGGCTTCTTTTTATACTGTTCTTCTGCATGGGTCTCTGTAGATAAC
ATGCAAGCAAAGATGGATTTATTGTACACTTTGATTTATTGTACATAATTTTGCATAACAACGACCTAGTAATTGATGCATATCATTCTGTTGTCAATTGTATCTGGATAGCTCCTAAATCCTAATATTTGTTGTTGGAACTTTATTACGTGTAAAATGTGAATCTAATTATCAAAGGAATATCAAGTTTAATTATGTAT
GTGGATTTTGTGCAAGACAAAGTAGATACAGTGC
Intron 5 GTAAGTAGTA ... TGTAATCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 11.75 | 140.2 | 3.6 | 18.8 |
| A2 | 9.98 | 149.1 | 0.8 | 16.6 |
| A3 | 11.36 | 148 | 2.6 | 18.6 |
| A4 | 12.76 | 128.8 | 0 | 19.4 |
| A5 | 15.88 | 62.6 | 0.8 | 12.2 |
| A6 | 9.86 | 599.7 | 0 | 66.2 |
| A7 | 10.68 | 456 | 0.4 | 54.4 |
| A8 | 13.4 | 455.2 | 0.4 | 71.6 |
| A9 | 10.56 | 431.7 | 0.8 | 51.2 |
| A10 | 9.16 | 397.9 | 0 | 39.8 |
>TRINITY_DN110332_c0_g1_i4 from sample A3 / Example spliced isoformGGTTTTCTTTGGAGCATTCCTGGTGGATTGCACTCTTTCTTATTACATCTGACTTCTGTTACATAATTTCTAACGATTGTCATGCTTCTTATGAATCTTGTATTTAATGCTTGCAGAGTTGCCTCCACCGTTGTTGCTTGATAAACTTGCAACCGAACTCCGCAGAAGGCTGGGACTCCGACTTTTCAATTTAGACATCA
TTCGTGAACATGGAACAAGAGATCACTACTATGTAATTGACATCAACTATTTCCCTGGCTATGGAAAAATGCCTGGATATGAGCACATTTTCACGGACTTTCTTTTAAGCCTAGTACAGGGAAAGCATCGAAAGATCACAGGGGCTGGTATCTGCTCTGTGGATAGTGATGACTGTTAAAGATAGTGCCCTAGAATAGAA
ATTCATGACATATATGCTCTTTGTTTTTCAGTTTTAAATACCAGCCGCTTGTAAGATCTGAATGTGTCAAATTTAGGCACTTGACAGATATTTCCAGCTCAATCAGAGAGATCATGGAGATTGAATATTCACCCAATTTCCGGATGAGATATTATTTTTACCAAATGTCCTCATTGCACAGACTTCAACATTGTATTTCA
GGTATCTTGTTTGGAAAGGGCAAGTTCCTTTGTATATTCTGTGCAATGCTGTTTTCTCCCACAGGTCAATTCTGTCTCTGCTTAAATCGGAATTTAGGTTTGGTTGGTGGAGGCAGGTGGCCCAGTGGTCATCCAGGGTGCAAAGAACAGTGGAAGTTTCAGCTACCATCCAGCCTTTGCAGTGGGCTCACACCCGCTCC
GGAGTCCATCAAGGCAAAACGATGGCTTCTTTTTATACTGTTCTTCTGCATGGGTCTCTGTAGATAACATGCAAGCAAAGATGGATTTATTGTACACTTTGATTTATTGTACATAATTTTGCATAACAACGACCTAGTAATTGATGCATATCATTCTGTTGTCAATTGTATCTGGATAGCTCCTAAATCCTAATATTTGT
TGTTGGAACTTTATTACGTGTAAAATGTGAATCTAATTATCAAAGGAATATCAAGTTTAATTATGTATGTGGATTTTGTGCAAGACAAAGTAGATACAGTGC
>TRINITY_DN110332_c0_g1_i6 from sample A3 / Example unspliced isoform:GGTTTTCTTTGGAGCATTCCTGGTGGATTGCACTCTTTCTTATTACATCTGACTTCTGTTACATAATTTCTAACGATTGTCATGCTTCTTATGAATCTTGTATTTAATGCTTGCAGAGTTGCCTCCACCGTTGTTGCTTGATAAACTTGCAACCGAACTCCGCAGAAGGCTGgtaagtagtatgcatctttgcaacaatt
aattattaaatgacttaaaattttacttctatatttcatatcctgggcgttatttaggtttagagatgctggaagtaatctcttgggatatagtacatagtgtattttatagacccattgattggttttaacccatccagtgatacttcaatgttgctttcgaaaacatataggtggatatgtttttctgacttggctgt
tactgtaatgtaatccagGGACTCCGACTTTTCAATTTAGACATCATTCGTGAACATGGAACAAGAGATCACTACTATGTAATTGACATCAACTATTTCCCTGGTACGTGTTTCAAAATTTTATATGCCATGGTTGTCCAAAATTGAATGTTTGTTGCTTACACACTGGATACATTTTCATCCTTTGTATTTGATTTGAG
TTACTGCTAGAGATCCTGTTTTCTTTAGATCGTCCACTGGCAATCACTGATATAAATTGTTATTTGTGTACAGGCTATGGAAAAATGCCTGGATATGAGCACATTTTCACGGACTTTCTTTTAAGCCTAGTACAGGGAAAGCATCGAAAGATCACAGGGGCTGGTATCTGCTCTGTGGATAGTGATGACTGTTAAAGATA
GTGCCCTAGAATAGAAATTCATGACATCTCTCCTCTTGTTTTTTTCAGTTTTAAATACCAGCCGCTTGTAAGATCTGAATGTGTCAAATTTAGGCACTTGACAGATATTTCCAGCTCAATCAGAGAGATCATGGAGATTGAATATTCACCCAATTTCCGGATGAGATATTATTTTTACCAAATGTCCTCATTGCACAGAC
TTCAACATTGTATTTCAGGTATCTTGTTTGGAAAGGGCAAGTTCCTTTGTATATTCTGTGCAATGCTGTTTTCTCCCACAGGTCAATTCTGTCTCTGCTTAAATCGGAATTTAGGTTTGGTTGGTGGAGGCAGGTGGCCCAGTGGTCATCCAGGGTGCAAAGAACAGTGGAAGTTTCAGCTACCATCCAGGTTATTATTT
GTCAGCATGATATTGTTACTTTCCAAGTTTATTTTTCAGCAGGACTACTTAATCTCGTCTTGCTGTTGTACATGAACTACAATTGATTAACTGGTCACAAATCTCATTTCATGGCATTTGTATTTAATGATTCATCAGCTTTGAAGTGTACATTTCTTGTTGTGCAGTTTTAACTATTGCACGACTTAATTGATATGAAA
CTATTCTGCTTACTTTGTTGGGCTCTGAGGTTCTGATATAATTGAATGTTTATTATTTATCCATCTAGAATACTCGTTATTTTAGTTGAAATTGTGAAACGTAGGAAAAACCTCTGAATAATATTTTTTTTTGCAGCCTTTGCAGTGGGCTCACACCCGCTCCGGAGTCCATCAAGGCAAAACGATGGCTTCTTTTTATA
CTGTTCTTCTGCATGGGTCTCTGTAGATAACATGCAAGCAAAGATGGATTTATTGTACACTTTGATTTATTGTACATAATTTTGCATAACAACGACCTAGTAATTGATGCATATCATTCTGTTGTCAATTGTATCTGGATAGCTCCTAAATCCTAATATTTGTTGTTGGAACTTTATTACGTGTAAAATGTGAATCTAAT
TATCAAAGGAATATCAAGTTTAATTATGTATGTGGATTTTGTGCAAGACAAAGTAGATACAGTGC
Intron 6 GTATCTTGTT ... GTGGAGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 82.95 | 25 | 125 | 119 |
| A2 | 78.38 | 25 | 92 | 90 |
| A3 | 70.51 | 43 | 111 | 95 |
| A4 | 79.72 | 26 | 99 | 105.7 |
| A5 | 85.11 | 8 | 45 | 46.7 |
| A6 | 81.12 | 170 | 577 | 897.3 |
| A7 | 80.05 | 125 | 430 | 581 |
| A8 | 81.53 | 167 | 591.3 | 894.7 |
| A9 | 81.81 | 118 | 449 | 620.2 |
| A10 | 81.2 | 72 | 270 | 358.3 |
>TRINITY_DN110332_c0_g1_i9 from sample A3 / Example spliced isoformGTGTTCCAAAGCAGCTGGTCATAACTGGGGACCCTGCTTCGATTCCCAGTGCTGTTGCTAAAGCAGGGCTAAAGTTGCCACTGGTTGCCAAGCCATTGGTAGTGGATGGTACAGCGAAGTCACATGCATTATCACTAGCATATGATCAGGTCAGCCTGTCAGAGCTTGACCCCCCTCTGGTGCTCCAAGAGTTTGTAAAT
CATGGTGGAGTACTTTTCAAGGTTTACATTGTTGGGGATACCATTAAAGTAGTGCGCAGGTTCTCTTTACCTGATGTAGATGAAAGTGAATCTTTGGGCTATGGAGTGATTCCATTTCCAAGGGTGTCAAGTGCTTCTGCTTCAGCTGATGATGCAGATTTAGATCCACATGTTGGGGAGTTGCCTCCACCGTTGTTGCT
TGATAAACTTGCAACCGAACTCCGCAGAAGGCTGGGACTCCGACTTTTCAATTTAGACATCATTCGTGAACATGGAACAAGAGATCACTACTATGTAATTGACATCAACTATTTCCCTGGCTATGGAAAAATGCCTGGATATGAGCACATTTTCACGGACTTTCTTTTAAGCCTAGTACAGGGAAAGCATCGAAAGATCA
CAGGGGCTGGTATCTGCTCTGTGGATAGTGATGACTGTTAAAGATAGTGCCCTAGAATAGAAATTCATGACATCTCTCCTCTTGTTTTTTTCAGTTTTAAATACCAGCCGCTTGTAAGATCTGAATGTGTCAAATTTAGGCACTTGACAGATATTTCCAGCTCAATCAGAGAGATCATGGAGATTGAATATTCACCCAAT
TTCCGGATGAGATATTATTTTTACCAAATGTCCTCATTGCACAGACTTCAACATTGTATTTCAGGTGGCCCAGTGGTCATCCAGGGTGCAAAGAACAGTGGAAGTTTCAGCTACCATCCAGCCTTTGCAGTGGGCTCACACCCGCTCCGGAGTCCATCAAGGCAAAACGATGGCTTCTTTTTATACTGTTCTTCTGCATG
GGTCTCTGTAGATAACATGCAAGCAAAGATGGATTTATTGTACACTTTGATTTATTGTACATAATTTTGCATAACAACGACCTAGTAATTGATGCATATCATTCTGTTGTCAATTGTATCTGGATAGCTCCTAAATCCTAATATTTGTTGTTGGAACTTTATTACGTGTAAAATGTGAATCTAATTATCAAAGGAATATC
AAGTTTAATTATGTATGTGGATTTTGTGCAAGACAAAGTAGATACAGTGC
>TRINITY_DN110332_c0_g1_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:GTGTTCCAAAGCAGCTGGTCATAACTGGGGACCCTGCTTCGATTCCCAGTGCTGTTGCTAAAGCAGGGCTAAAGTTGCCACTGGTTGCCAAGCCATTGGTAGTGGATGGTACAGCGAAGTCACATGCATTATCACTAGCATATGATCAGGTCAGCCTGTCAGAGCTTGACCCCCCTCTGGTGCTCCAAGAGTTTGTAAAT
CATGGTATGGAAGTAAACATCCTCAACTTCTGTTGTTCAAGCTTTTAGTTGCGTAATGCTTTCAGCAGTACTCTTTCAACTTATTTGGTAAGTAGTTAATCAATCAAGCAATCTACCTTGGTTGCAGGTGGAGTACTTTTCAAGGTTTACATTGTTGGGGATACCATTAAAGTAGTGCGCAGGTTCTCTTTACCTGATGT
AGATGAAAGTGAATCTTTGGGCTATGGAGTGATTCCATTTCCAAGGGTGTCAAGTGCTTCTGCTTCAGCTGATGATGCAGATTTAGATCCACATGTTGGGGAGTTGCCTCCACCGTTGTTGCTTGATAAACTTGCAACCGAACTCCGCAGAAGGCTGGGACTCCGACTTTTCAATTTAGACATCATTCGTGAACATGGAA
CAAGAGATCACTACTATGTAATTGACATCAACTATTTCCCTGGCTATGGAAAAATGCCTGGATATGAGCACATTTTCACGGACTTTCTTTTAAGCCTAGTACAGGGAAAGCATCGAAAGATCACAGGGGCTGGTATCTGCTCTGTGGATAGTGATGACTGTTAAAGATAGTGCCCTAGAATAGAAATTCATGACATCTCT
CCTCTTGTTTTTTTCAGTTTTAAATACCAGCCGCTTGTAAGATCTGAATGTGTCAAATTTAGGCACTTGACAGATATTTCCAGCTCAATCAGAGAGATCATGGAGATTGAATATTCACCCAATTTCCGGATGAGATATTATTTTTACCAAATGTCCTCATTGCACAGACTTCAACATTGTATTTCAGgtatcttgtttgg
aaagggcaagttcctttgtatattctgtgcaatgctgttttctcccacaggtcaattctgtctctgcttaaatcggaatttaggtttggttggtggaggcagGTGGCCCAGTGGTCATCCAGGGTGCAAAGAACAGTGGAAGTTTCAGCTACCATCCAGGTTATTATTTGTCAGCATGATATTGTTACTTTCCAAGTTTA
TTTTTCAGCAGGACTACTTAATCTCGTCTTGCTGTTGTACATGAACTACAATTGATTAACTGGTCACAAATCTCATTTCATGGCATTTGTATTTAATGATTCATCAGCTTTGAAGTGTACATTTCTTGTTGTGCAGTTTTAACTATTGCACGACTTAATTGATATGAAACTATTCTGCTTACTTTGTTGGGCTCTGAGGT
TCTGATATAATTGAATGTTTATTATTTATCCATCTAGAATACTCGTTATTTTAGTTGAAATTGTGAAACGTAGGAAAAACCTCTGAATAATATTTTTTTTTGCAGCCTTTGCAGTGGGCTCACACCCGCTCCGGAGTCCATCAAGGCAAAACGATGGCTTCTTTTTATACTGTTCTTCTGCATGGGTCTCTGTAGATAAC
ATGCAAGCAAAGATGGATTTATTGTACACTTTGATTTATTGTACATAATTTTGCATAACAACGACCTAGTAATTGATGCATATCATTCTGTTGTCAATTGTATCTGGATAGCTCCTAAATCCTAATATTTGTTGTTGGAACTTTATTACGTGTAAAATGTGAATCTAATTATCAAAGGAATATCAAGTTTAATTATGTAT
GTGGATTTTGTGCAAGACAAAGTAGATACAGTGC