sp|F4HWL3|RLP4_ARATH ----> Receptor-like protein 4


Intron 1 GTAATCACAA ... TATTTAGAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A211.9148020
A314.98176031
A419.7163240
A512.3571010
A618.15257057
A721.484970136
A818.4173039
A921.014850129
A1022.656180181



>TRINITY_DN101036_c0_g1_i1 from sample A4 / Example spliced isoform
TTAGAGTTGTAGGGCCTCACATTTTGCGTTTATTTATTTATTTAATAATTAATTTTCTGGCCCAAGTCGTCCATACATGTAAAGATGTAAAGCTCGATCACTTCCTCTCTCATAAATGCTTGGGTGTTGACTACATAACACGTTGGGATTTGATCTCGTGATCAGCGTGGCAGCGCAGAACCACGGGAAACAACAAACGA
CGCCGCTGCATCACTGTAAAGGCAGGCAAACGCCATCATTGAAATCATCTTGCAATTCTTGGATTACTGTAAAGGGCATGAAAAAAACACAATAATGCGTGTCTGTGGAGATCATTGACATCATATTGCAGTTCCCATTGACGTTATGTCTCCATTTCTGTTGAATTTTATGCTCTCAGTTAAGGAACCATATACTAATC
ATGTGTAAGCGATTTCGAGTTCCGTCACTGAAAAATGGCGAAGATAACAGTGAATGCTGGGTTTAGATTGGCGGCAGTTGCATACATTTGTATGTGGATGAGCATTTACATGGCATTTTCAGAGAATGCAGAGCCGTTGGCCATCCGGATCAGCTGCGGTTCATGGCAGAATACGCACACGCCCACCACGAACATGCTCT
GGGTTAAAGACTATGGTTACACAGGCGGGTCGTCCGCAAATGCCACCGGCACGAGCTACATTGCCCCTCAACTTAACAAACTCCGATTCTTTAAGCTCTCGGACGGTCCCGAGAACTGCTACAACATCACTCATCTCCCGGACGGCCATTATTCTGTCAGAATCTTTTTCGGCCTCAACGAGGACATTCTGGCCGACCGC
GAGCCGCTCTTTGACGTCTCCATTGAAGGAACGCAACTCTATTCTTTAAAGCCCGGCTGGAGCGTGAACGACGACCAGTCGTATGTGGAGGCTTCGGTCTTTATCTCAGACACTGCTGCCACCGCTTGCTTCCACAGCACAGGCCACGGCGATCCCTCGGTAATGAGTATCGAGATTCTTCAGCTTCATCGAGATGCTTA
TTATTTTGGGGTTCAGTGGGGGGATACTGTCATTTTTAGGACTGCTAAGCGGGTCGACTGTGGAGCAGACCAGGGCGTGTACGGGGAGTCCTACAATGCCGATCCCTGGGGCGGCGACCGCTTTTGGTTTACGGATAATGAGCAGGATGTTGTGGACAAGAGCTCGATTCGCACGCTTACGAGTTCGAATCCCATCAAAA
AGACCTCGGTGCCCCCCAATTTTTATCCGGAAGCAATTTACCAGTCTGCTTCAATAGGCAATGCGGCTGGGGAAGTCTTAAATTATAATTTTAAGGTTGAGCCCAACGCGAATTATTCTGTTTGGCTGCATTTTGCAGAGATTGAGGATGGTGTGAGCAGTCCAGGGCAGAGGGTGTTTGATGTGCTCATAAATGGCCAG
CTTCTTGTCTCCAATGTTGACATTGTGGGGATGGCTGGGGGACCTTTTACTGCTGTTGTGTTGAACAGGACAGTGCCTATTGATGGGAGAACTCTAACTCTTAGCTTTCGCCCCCAGCAGCAGAGCATTGCAATGGTGAATGCTATTGAGATCTTCCAGGTTGTTGAAATGGAAAAGAAAACCTTAAATACAGAAGTTTG
GTCCTTGCGGGCACTGAAGGATACCCTAGGACTCCCTCTTCGATTTGGATGGAATGGTGATCCTTGTGTTCCTCAGCAGCACCCCTGGAGTGGAATCGACTGCCAATTTGATAAAAAAAAAGGCACATGGTTCATTGATGGATTAGGCCTTGACAACCAAGGATTGAAGGGATTCATAAGCGATGACATAGCATATCTGC
AACATTTACAGAGCATAGATCTGTCATTCAATATGCTAAATGGCACAATTCCTGAGAGCTTTGGGAATCTGACTCATCTGAAGAAGCTGTACCTTAACGGAAACCATTTGTCTGGAAGAGTTCCAGCTGCACTTGATGGTGGACCTATCCATGGGGCAAGCTTCAACTTTTCAGAAAATGCAGGCCTTTGTGGTGTTCCT
GGCCTACCATCGTGTGATCCCCATCTTACAGCAGGAGCTAAAGTTGGGGTTGCACTTGGAGTTATAATTTTTGGCCTCCTGTTCCTTCTTTGTGGGACGTGCATGTGGAAAAGAAGGCAAAACATTCTTCGGGCACAGCGACTTGCTTTGCGGGAAGCTCCATATGCAAAAGCTAGGACTCACTTTGCGAGGGATGTGCA
AATGTCAAGACCAAATATTCATGAACATTTTCGGGCTTATACAGATCCTGGGCCACAATTACTCACATAATCATCATTTTTTAATGTACAGATTAATCATTATGTTTGCTGTAATCATGATTCTTGCAATTTCAAATTGTTAGAACTCACCTTCCAAGCAAATGTTGTTGTACCTAGGAGGCAGCTTATTGGCAAAGTTG
CCATTATTGATTTGCAGTGAAATGCTAAGGATAATTCATAAATAAGTCAATTCATTCTTGAAAGAGCCAAAGTGATATCGGTGATTATTAATCTCTATCACCTTTGTCCATCTGTGCATAGTGCTTTCTTTTACAGTCATTTTTAATCAAATGGGTCAACATGCTTAGCAACA


>TRINITY_DN101036_c0_g1_i5 from sample A4 / Example unspliced isoform:
CATGGCATTTTCAGAGAATGCAGgtaatcacaaagccagatgatctcagtctactaaaatttttagaaggttttcaaatttcgacttcggatccaaatatttagaagAGCCGTTGGCCATCCGGATCAGCTGCGGTTCATGGCAGAATACGCACACGCCCACCACGAACATGCTCTGGGTTAAAGACTATGGTTACACAG
GCGGGTCGTCCGCAAATGCCACCGGCACGAGCTACATTGCCCCTCAACTTAACAAACTCCGATTCTTTAAGCTCTCGGACGGTCCCGAGAACTGCTACAACATCACTCATCTCCCGGACGGCCATTATTCTGTCAGAATCTTTTTCGGCCTCAACGAGGACATTCTGGCCGACCGCGAGCCGCTCTTTGACGTCTCCATT
GAAGGAACGCAACTCTATTCTTTAAAGCCCGGCTGGAGCGTGAACGACGACCAGTCGTATGTGGAGGCTTCGGTCTTTATCTCAGACACTGCTGCCACCGCTTGCTTCCACAGCACAGGCCACGGCGATCCCTCGGTAATGAGTATCGAGATTCTTCAGCTTCATCGAGATGCTTATTATTTTGGGGTTCAGTGGGGGGA
TACTGTCATTTTTAGGACTGCTAAGCGGGTCGACTGTGGAGCAGACCAGGGCGTGTACGGGGAGTCCTACAATGCCGATCCCTGGGGCGGCGACCGCTTTTGGTTTACGGATAATGAGCAGGATGTTGTGGACAAGAGCTCGATTCGCACGCTTACGAGTTCGAATCCCATCAAAAAGACCTCGGTGCCCCCCAATTTTT
ATCCGGAAGCAATTTACCAGTCTGCTTCAATAGGCAATGCGGCTGGGGAAGTCTTAAATTATAATTTTAAGGTTGAGCCCAACGCGAATTATTCTGTTTGGCTGCATTTTGCAGAGATTGAGGATGGTGTGAGCAGTCCAGGGCAGAGGGTGTTTGATGTGCTCATAAATGGCCAGCTTCTTGTCTCCAATGTTGACATT
GTGGGGATGGCTGGGGGACCTTTTACTGCTGTTGTGTTGAACAGGACAGTGCCTATTGATGGGAGAACTCTAACTCTTAGCTTTCGCCCCCAGCAGCAGAGCATTGCAATGGTGAATGCTATTGAGATCTTCCAGGTTGTTGAAATGGAAAAGAAAACCTTAAATACAGAAGTTTGGTCCTTGCGGGCACTGAAGGATAC
CCTAGGACTCCCTCTTCGATTTGGATGGAATGGTGATCCTTGTGTTCCTCAGCAGCACCCCTGGAGTGGAATCGACTGCCAATTTGATAAAAAAAAAGGCACATGGTTCATTGATGGATTAGGCCTTGACAACCAAGGATTGAAGGGATTCATAAGCGATGACATAGCATATCTGCAACATTTACAGAGCATAAATTTGA
GTGGCAACAGTATACAAGGACCTATTCCGCCTTTGCTTGGGACAATTCAAACCCTAAAGTATTTAGATCTGTCATTCAATATGCTAAATGGCACAATTCCTGAGAGCTTTGGGAATCTGACTCATCTGAAGAAGCTGTACCTTAACGGAAACCATTTGTCTGGAAGAGTTCCAGCTGCACTTGATGGTGGACCTATCCAT
GGGGCAAGCTTCAACTTTTCAGAAAATGCAGGCCTTTGTGGTGTTCCTGGCCTACCATCGTGTGATCCCCATCTTACAGCAGGAGCTAAAGTTGGGGTTGCACTTGGAGTTATAATTTTTGGCCTCCTGTTCCTTCTTTGTGGGACGTGCATGTGGAAAAGAAGGCAAAACATTCTTCGGGCACAGCGACTTGCTTTGCG
GGAAGCTCCATATGCAAAAGCTAGGACTCACTTTGCGAGGGATGTGCAAATGTCAAGACCAAATATTCATGAACATTTTCGGGCTTATACAGATCCTGGGCCACAATTACTCACATAATCATCATTTTTTAATGTACAGATTAATCATTATGTTTGCTGTAATCATGATTCTTGCAATTTCAAATTGTTAGAACTCACCT
TCCAAGCAAATGTTGTTGTACCTAGGAGGCAGCTTATTGGCAAAGTTGCCATTATTGATTTGCAGTGAAATGCTAAGGATAATTCATAAATAAGTCAATTCATTCTTGAAAGAGCCAAAGTGATATCGGTGATTATTAATCTCTATCACCTTTGTCCATCTGTGCATAGTGCTTTCTTTTACAGTCATTTTTAATCAAAT
GGGTCAACATGCTTAGCAACA



Intron 2 GTGATGATGA ... TGCAATTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A181.82154
A2100004
A3100010
A4-1000
A550231
A637.5515
A746.67425
A835.481029
A9100010
A1017.65712



>TRINITY_DN43172_c0_g1_i6 from sample A7 / Example spliced isoform
TGCGATTCGAACCCGCGACGGCTTGGAAACGCAGAACGACGGGAAAGAACAAACGACGCCGTTGGGTACTATAAATACTCATGAAATCGCCATACCAGTGCCTGCCTGTGGAGGGCATCGACTTCATCTGACAGTTCGCATTAACGTCATGGCTCCATTTATGACGAATTTTATATTCTCTCTGAAGGAACCGTATCGTA
GTCATATCTAAGAGGTTTCAAGTTCAAGCTCCATTACTGAAAAATGGCGAGGCAAAGAGCGAATGCCGGCTTTAGATTGGCGGCAGCGGCGTTTATTTGCCTGTGGACGAGCGCTTACACGGCATTTGCACAGAATTCAGATCCGTTGGCCATCCGAATCAGCTGTGGTTCATGGCAGAACACGTACCGCCCGGTCACGA
ACAAGCTCTGGGGTAAAGACCACGGTTACACAGGCGGCTCGTACGCAAACGCCACCGGCACGAGCTATATTGCACCCCAGCTTAAAAAACTCCGATTCTTTAAGCCCTCGGATGGCCCCGAGAACTGCTACAACATCACTAATCTCCCGGACGGCCATTATTCCGTCAGAATGTTCTTCGGCCTCAACAAGGACGTTTTA
GCCGACCGCGAGCCGCTCTTTGACGTCTCAATTGAAGGAACGCAGGTCTATTCTTTAAAATCCGGCTGGAGCGTGAACGATGACCAGTCGTATCTGGAAGCTTCGGTCTTTGTCTCAGACACTGCTGCCACCGCCTGCTTTCACAGCACCGGCCACGGCGATCCTTCGGTAATGAGTATCGAGATTCTTCAGCTTCATCC
AGAAGCTTATTATTTTGGGGCTCACTGGCGAAATACTGTTATCTTTAGGACTGCTAAGCGGGTCGACTGTGGAGCAGGCAGCCGGGGCGTATACGGGGAGTCTTACAATGCCAATCCCTGGGGCGGCGATCGCTTTTGGTTTTCGGATACTGAACCAGATGTTCTGGACAGGACTTTGACTCGTCGGCTCAGGACTTCGA
ATTCCATCCGATATACCTCTGTGGCCCCCAATTTTTATCCCGGAGCAATCTACCAGTCTGCTTCAAGAGGCAGTGATGTTGGACAAGTCATGAATTATAGGTTTAAGGTTGAGCCCAACGCGAATTATTCTGTTTGGCTGCATTTTGCAGAGATTGAGGATGGTGTGAGAAGTGCAGGGCAGAGGGTGTTTGATGTGCTC
ATAAATGGCCAGCTCATTTTCTCTAATGTCGACATTGTGAGGATGGCTGGGGGACCTTTTGCTGCTGTTGTGCTGAACAGGACAGTGGCCGTTCATGGAAGAACTTTAACCCTTAGCTTTAACCCCCAGCGGCATAGCACTGCGATCGTGAATGCTATTGAGATCTTCCAGGTTATTGAAATGGAAAAGAGAACCTCAGA
TACAGAAGATCTGCATGTGCCAGTTGTGATTTCATTTGAAGTACTTGGAGATGTATATGTTTCAGTAAGATCCATTGGAATGCTGCCTGGCTAGGGTCAAAGCACTTCCATATAGAGAAGATGCATGTGGATGTTCAATTCAGGGTCAAAAGCACTTCCAAAAGCACTTCCTACCTTTTGGCATTCAGGTAGGCGTGGTC
ATTTGTACATTATTATAATTGGCATTCAGGTAGGCGTCCCCGTTTGTATATTATTGTATTTTATTCTCGATGCACATCACAGGTGAAACTTACATTTCTATGATGCAAGGAATAATATCTAGCTCGTTGATCTCCTTTCGGTTTATCTTATTGTTTCTTAAAAATGGTCTTAATTTTGGATCTATTAAGTACTCTGATCC
CAAAAATTAAGATGCAAAATTTTTGACGCTTAATATTTAAGATGGATCTATGTTGTTGTGCAGATATATAAATTAATGCTTTCTATCACCTAAC


>TRINITY_DN43172_c0_g1_i8 from sample A7 / Example unspliced isoform:
CTTTCTTTTTATTCATCTTTTGTTCAAAAATCTCGATACTGTCCTCTATATATCTTCATCTGATATCAAGATTTCCATACTTATCACTTACAAAAATTCTTTGGCAGTGTTTCGTACAGTATCGTCCTTTACATTCTTTCTAGCTTCTAGTATACCGGGCTTATCTTTAAAGAGCAGTTATCACGGATGGGGTTCAGTTG
ATGCTTGCTTTGTGGCACAGTTTGAGACCATCCAACATTTATTTTGGTGTTGCAGATCTGCATGTGCCAGTTGTGATTTCATTTGAAGTACTTGGAGATGTATATGTTTCAGTAAGATCCATTGGAATGCTGCCTGGCTAGgtgatgatgattcctttataccttgtttactttagaggggtttggtagaaactttgttg
tgaagctggtcttagtgtagtgttttctgttttggttcctttaacgaggttgatttacgagttaaaagttgcaattcagGGTCAAAGCACTTCCATATAGAGAAGATGCATGTGGATGTTCAATTCAGGGTCAAAAGCACTTCCAAAAGCACTTCCTACCTTTTGGCATTCAGGTAGGCGTGGTCATTTGTACATTATTA
TAATTGGCATTCAGGTAGGCGTCCCCGTTTGTATATTATTGTATTTTATTCTCGATGCACATCACAGGTGAAACTTACATTTCTATGATGCAAGGAATAATATCTAGCTCGTTGATCTCCTTTCGGTTTATCTTATTGTTTCTTAAAAATGGTCTTAATTTTGGATCTATTAAGTACTCTGATCCCAAAAATTAAGATGC
AAAATTTTTGACGCTTAATATTTAAGATGGATCTATGTTGTTGTGCAGATATATAAATTAATGCTTTCTATCACCTAAC