sp|A9QM73|SMG7_ARATH ----> Nonsense-mediated mRNA decay factor SMG7
Intron 1 GTATAATTCG ... TTGTACTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 34.48 | 19 | 15 | 5 |
| A2 | 34.43 | 20 | 8 | 13 |
| A3 | 24 | 19 | 8 | 4 |
| A4 | 47.37 | 10 | 10 | 8 |
| A5 | 38.46 | 12 | 10 | 5 |
| A6 | 36.36 | 21 | 16 | 8 |
| A7 | 16.98 | 44 | 11 | 7 |
| A8 | 22.58 | 48 | 17 | 11 |
| A9 | 31.53 | 38 | 14 | 21 |
| A10 | 36.36 | 14 | 10 | 6 |
>TRINITY_DN44673_c0_g9_i2 from sample A6 / Example spliced isoformCTAGCAGGCCAGAGGTTGCTGTAGGTAGTGAAGTTGATGAAAAGCAGGCCAATGCAAGGTCCTCCTTTTGGAGGCAATTTGTTTCACTTATGAACACACTGTATGAAAGTAAGGATTTGGATGCCAATATCGATAGCCTTGGGATGCCGATTGAAGGTGGTACTACATTGTGGGAAGATTATGAACTACAGGGATTTGTT
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>TRINITY_DN44673_c0_g9_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:CTAGCAGGCCAGAGGTTGCTGTAGGTAGTGAAGTTGATGAAAAGCAGGCCAATGCAAGGTCCTCCTTTTGGAGGCAATTTGTTTCACTTATGAACACACTGTATGAAAGTAAGGATTTGGATGCCAATATCGATAGCCTTGGGATGCCGATTGAAGGTGGTACTACATTGTGGGAAGATTATGAACTACAGGGATTTGTT
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