sp|Q38732|DAG_ANTMA ----> DAG protein, chloroplastic
Intron 1 GTCAGAAGTG ... GGTGTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 24.63 | 101 | 16 | 50 |
| A2 | 19.23 | 105 | 26 | 24 |
| A3 | 17.97 | 105 | 18 | 28 |
| A4 | 25.27 | 34 | 4 | 19 |
| A5 | 14.29 | 30 | 3 | 7 |
| A6 | 20.4 | 644 | 111 | 219 |
| A7 | 20.51 | 494 | 67 | 188 |
| A8 | 19.63 | 559 | 80 | 193 |
| A9 | 19.59 | 548 | 93 | 174 |
| A10 | 20.62 | 458 | 81 | 157 |
>TRINITY_DN98352_c1_g1_i7 from sample A4 / Example spliced isoformCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCTAACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAG
CAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGCGAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAA
GGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTGTCATGGATCCTCCCAACGAGGGTAAGGCCACCAAACAGGAAATGATCGACTGCTATATTCAAACCCTCGCCAAGGTCTTGGGAAGCGAGGAAGCAGCAAAAAAGTCTATCTACAATGTGTCTTGCGAACGATACTTTGGCTTTGGATGCCAAATAGATGAGGAAACCTCCAA
TAAACTTGTCGGGCTTCCTGGAGTGGTCTTTGTTCTACCAGATTCGTATGTTGATGCAGAATATAAGGATTATGGAGGGGAACTATTAGTTGATGGGAAGATAGTTGAGAGATCTCCAGAAAGACAGCGACGTGTCACTCCTGCTCCTCAGCGGAACAATGATAGACCCAGATACAATGACAGAACAAGATACGTCAGGC
GAAGGGAAAATCAGAATCAAGGTCGTTGATCAGCATTCTCTCCTGAAATTAGAGAAAATAGAGAATTGAGAGTGGCTGTGGACTAGAACAGTTGTAATACCCCGATTGTGATATAATGCTACTTCAAAGTGATCATCATTAGAACATTCTATATCGGTTGCTCATAATGTGGGTGAAGTCTTGTTTTCTTGAAAAACATG
TTATCAGAGTCGTATGTAAAACTAGCATCTAGAATGCTCTGTTACATGGACTGCATTTAATGGATAGCTTATGAATGCCTTAACTTGTAAAGAAGACATATTAACGGAAAGGCTATGTGTTTGGATTCTCTGAGAATAAGTCCGGAGTATTATTGTTTCCATCTAGATTGGCGGACTATTTCACGCTTTTAGTATATTTA
CTCAGGTTGGTCTCTGCTTGGTTTTACAAGGGTGCTATTTTCTTTTGAAATAGAAATTGGAAACTATTTTGGTTTCTAAATTTTTCCCTCG
>TRINITY_DN98352_c1_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:CCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCTAACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAG
CAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGCGAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAA
GGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTGTCATGGATCCTCCCAACGAGGGTAAGGCCACCAAACAGGAAATGATCGACTGCTATATTCAAACCCTCGCCAAGGTCTTGGGAAGCGAGGAAGCAGCAAAAAAGTCTATCTACAATGTGTCTTGCGAACGATACTTTGGCTTTGGATGCCAAATAGATGAGGAAACCTCCAA
TAAACTTGTCGGGCTTCCTGGAGTGGTCTTTGTTCTACCAGATTCGTATGTTGATGCAGAATATAAGGATTATGGAGgtcagaagtggaagttagctcagtggtttgtctctttttttttctcaatttagatttggctgtttaaaaatattttttgaatggtgtttcagGGGAACTATTAGTTGATGGGAAGATAGTTGA
GAGATCTCCAGAAAGACAGCGACGTGTCACTCCTGCTCCTCAGCGGAACAATGATAGACCCAGATACAATGACAGAACAAGATACGTCAGGCGAAGGGAAAATCAGAATCAAGGTCGTTGATCAGCATTCTCTCCTGAAATTAGAGAAAATAGAGAATTGAGAGTGGCTGTGGACTAGAACAGTTGTAATACCCCGATTG
TGATATAATGCTACTTCAAAGTGATCATCATTAGAACATTCTATATCGGTTGCTCATAATGTGGGTGAAGTCTTGTTTTCTTGAAAAACATGTTATCAGAGTCGTATGTAAAACTAGCATCTAGAATGCTCTGTTACATGGACTGCATTTAATGGATAGCTTATGAATGCCTTAACTTGTAAAGAAGACATATTAACGGA
AAGGCTATGTGTTTGGATTCTCTGAGAATAAGTCCGGAGTATTATTGTTTCCATCTAGATTGGCGGACTATTTCACGCTTTTAGTATATTTACTCAGGTTGGTCTCTGCTTGGTTTTACAAGGGTGCTATTTTCTTTTGAAATAGAAATTGGAAACTATTTTGGTTTCTAAATTTTTCCCTCG
Intron 2 GTAAAATTTT ... TATTTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 41.29 | 209 | 150 | 144 |
| A2 | 48.55 | 160 | 164 | 138 |
| A3 | 42.86 | 164 | 117 | 129 |
| A4 | 46.67 | 148 | 128 | 131 |
| A5 | 46.42 | 86 | 74 | 75 |
| A6 | 45.34 | 1170 | 799 | 1142 |
| A7 | 43.98 | 1066 | 714 | 960 |
| A8 | 43.85 | 1219 | 841 | 1063 |
| A9 | 47 | 839 | 643 | 845 |
| A10 | 45.71 | 630 | 456 | 605 |
>TRINITY_DN100752_c0_g3_i1 from sample A5 / Example spliced isoformCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCTAACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGG
CTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGCGAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAG
CACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGTGGGAAGGTAAGGAAGAATCCTGGTTCTTTAAATTTTGCCTTAGGATTCAGGGTTTATAGTTGTTTTCATAAGTCGGTTTTTATTTTAGCTCATGCGATAAGGTTTTAGTGT
CTTACAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCTCAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGGGGATAAGTACATCAATGGGGTAATCATA
CCAGATACTCGAGTATATAATAACAGGCCTAGTGGAAGGTACAATGACAGGCCTCGGAACCGCATGCGTAGAGATTCCATGCCTGTTGAACGAAGAGACACGATGCCCATGGATGGGAGGGGTGGTATGCAGGGAGATAGGAGAGATTTCAGGCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAACGCCAGGCGGTCAACAAGATTA
TAGCAGACCTCCTCAACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAAATGATGGACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAACTGATGGACAAGATTACAACAGGTCGCTTCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTTCAGTGCCAGGTGGCCCTCAAGATTATAACAGACCTCCCC
AAAATTATAACATGTCTTCTCCACAAGGTTACAACAGGCCTCCACAAGATTACAACAGACCTCCTCCACAAGATTATAACAGAGTGCCGCCTCCACCTATTGAAGGAAGGGGTCCAATGCCAGGGTATCAACAAGAGTATCAACAGGATTATAACAGAGCTCCTCCAGCTCCGCCTATGGAAGGAAGGGGCACAATGCCA
GTCTATCAGCAGGGTTATAACAGACCTCCACCTATGGACGGAAGAGGCCCAATGCCAAGTGATTATAACAGGCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAATGCAAGGTGATTACAACAGGCCTCCTCCACCCTCGTCTATGGAAGGAAGAGCCCCAATGGGAGGTGATTACAATAGGTCTCCACCTCCTCCTATGGA
AGGGAGGAACTATCAACAAGATTACTATAGGCCCCCTCCACCTTCCCCTGTGAGGGGAGAGAGGCAAGATTATAGGCCCCCTATGGATGGAAGAGGTCCAATCCCTGGTGATCGACAAGATTATAGGTCGACCATGGATGGAAGAGGCCCTGTGCAGGGAGGACAGGGTGATTATATGCCTCCTAGAGAATCAATGCAGG
GAGGATCATTCCCAACCCAAGGCAGGGGCTCTGTCCAAGGAGAACAAAAAGAAGCTTTCCCATGGCCAATGGAAGGAGCTCAGTGACCGAACGTGTATGGAATTATGAGTCGATGAGAAGGAAATAGGTTGAAGATTGTCAGGTATGCCTGGGTGAATGGAATTTATGATGGATTTCGTTTGACCTTGTAAGATTTGCTC
GTCGTGAGTCTGTCTGGTTTCAAACTCCATCAGTTTTTCCTTTGCAAATTTTGAGAAAGGCGGTCGACTTATGAGGTGTAGCTGGATGGCTTTTGATTTTACTTTGATGCAAAAATCTCCACAGGACTTGTATGGAGAAATTAGTACTTCTACTTTTAGCATAGACGCCGATCCAATTAATAGATAGTGATTATTCAATT
AATAGATAGTAAAGAAGCACATGACTTAATATGATGGATTTACCGCTTTATGGATTTTAACTATTTGTATTTAGCATCAGAAGTGTAGATATTGAATTGAGATATACAATGTAAATGAGGAATGAAGGTTTTTATTAATAATATCACAGCACCTTCAATATTTCCGGATTGACTTTGTGAAAATATTGTTGTAATCCCCA
GGTCACATAATCTAAATTTTAATAATATGAACTACAGACTATTTGGGAGTGTATGAAAGAAGAGACCAATTCAGGCAGCATTAAACAAAAGATGTAATGGCAATATCTTTACAATATATCACTTGGGAGTCTTGGCCTCGTAATTTTTGATTGCATGTGTTCAGGCTATTTCTGGTATACAAAATACCGAATTGCATGGT
CTGTTCAGTGTGCAAATTCATGAACAAAAAACTATTCATCTCCAACGTTTAAATTTTAGATATGTAAACGGGGCAGTAAATTTTTGCCACATACCTGCAATTACTTGAGGCTTGCATTTTTTTGTAACGAGTGCTATATATCACCTGCATTTCCCGGGAGTGGCCCACACTGGTATTTTGGCGTTGCTAGTCCTTGAACA
CAAGAACAGTTTAACAAGCTTTATTTGGAATGGAATAACTCCAAAACGTTGAATACCCTTGGGTCTCCCATTTCCATGTACAATTGACAAACATATTCAGCTCCAGTTTTTCTGCTCGATATTACCCAGATTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTATCTGACTTTCCGAGTTCTTTCTTTCTAGAATTGCTTTGCTAGT
ACTTTCTGGATATTACCCAGGTTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTTTCTGGCATTCCGAGTTCTTTCTTTCTAGAACTGCTTTGCTAGTACTTTCCAGGGTCTCCCATTTCCATGTACAAA
>TRINITY_DN100752_c0_g3_i2 from sample A5 / Example unspliced isoform:CTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCTAACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGG
CTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGCGAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAG
CACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGTGGGAAGGTAAGGAAGAATCCTGGTTCTTTAAATTTTGCCTTAGGATTCAGGGTTTATAGTTGTTTTCATAAGTCGGTTTTTATTTTAGCTCATGCGATAAGGTTTTAGTGT
CTTACAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCTCAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGGGGATAAGTACATCAATGGGGTAATCATA
CCAGATACTCGAGTATATAATAACAGGCCTAGTGGAAGGTACAATGACAGGCCTCGGAACCGCATGCGTAGAGATTCCATGCCTGTTGAACGAAGAGACACGATGCCCATGGATGGGAGGGGTGGTATGCAGGGAGATAGGAGAGATTTCAGGCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAACGCCAGGCGGTCAACAAGATTA
TAGCAGACCTCCTCAACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAAATGATGGACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAACTGATGGACAAGATTACAACAGGTCGCTTCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTTCAGTGCCAGGTGGCCCTCAAGATTATAACAGACCTCCCC
AAAATTATAACATGTCTTCTCCACAAGGTTACAACAGGCCTCCACAAGATTACAACAGACCTCCTCCACAAGATTATAACAGAGTGCCGCCTCCACCTATTGAAGGAAGGGGTCCAATGCCAGGGTATCAACAAGAGTATCAACAGGATTATAACAGAGCTCCTCCAGCTCCGCCTATGGAAGGAAGGGGCACAATGCCA
GTCTATCAGCAGGGTTATAACAGACCTCCACCTATGGACGGAAGAGGCCCAATGCCAAGTGATTATAACAGGCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAATGCAAGGTGATTACAACAGGCCTCCTCCACCCTCGTCTATGGAAGGAAGAGCCCCAATGGGAGGTGATTACAATAGGTCTCCACCTCCTCCTATGGA
AGGGAGGAACTATCAACAAGATTACTATAGGCCCCCTCCACCTTCCCCTGTGAGGGGAGAGAGGCAAGATTATAGGCCCCCTATGGATGGAAGAGGTCCAATCCCTGGTGATCGACAAGATTATAGGTCGACCATGGATGGAAGAGGCCCTGTGCAGGGAGGACAGGGTGATTATATGCCTCCTAGAGAATCAATGCAGG
GAGGATCATTCCCAACCCAAGGCAGGGGCTCTGTCCAAGGAGAACAAAAAGAAGCTTTCCCATGGCCAATGGAAGGAGCTCAGTGACCGAACGTGTATGGAATTATGAGTCGATGAGAAGGAAATAGgtaaaattttgagtctaaatagagtgaggggattccttacttgtaacgtgtagctcaagctgacttggtgatt
atttttcaggttgaagattgtcaggtatgcctgggtgtatggaattatgagtcgatgagaaggaaataggtaaaattttgagtctaaatagagtgaggggattccttacttgtaacgtgtagctcaagctgacttggtgattatttttcagGTTGAAGATTGTCAGGTATGCCTGGGTGAATGGAATTTATGATGGATTT
CGTTTGACCTTGTAAGATTTGCTCGTCGTGAGTCTGTCTGGTTTCAAACTCCATCAGTTTTTCCTTTGCAAATTTTGAGAAAGGCGGTCGACTTATGAGGTGTAGCTGGATGGCTTTTGATTTTACTTTGATGCAAAAATCTCCACAGGACTTGTATGGAGAAATTAGTACTTCTACTTTTAGCATAGACGCCGATCCAA
TTAATAGATAGTGATTATTCAATTAATAGATAGTAAAGAAGCACATGACTTAATATGATGGATTTACCGCTTTATGGATTTTAACTATTTGTATTTAGCATCAGAAGTGTAGATATTGAATTGAGATATACAATGTAAATGAGGAATGAAGGTTTTTATTAATAATATCACAGCACCTTCAATATTTCCGGATTGACTTT
GTGAAAATATTGTTGTAATCCCCAGGTCACATAATCTAAATTTTAATAATATGAACTACAGACTATTTGGGAGTGTATGAAAGAAGAGACCAATTCAGGCAGCATTAAACAAAAGATGTAATGGCAATATCTTTACAATATATCACTTGGGAGTCTTGGCCTCGTAATTTTTGATTGCATGTGTTCAGGCTATTTCTGGT
ATACAAAATACCGAATTGCATGGTCTGTTCAGTGTGCAAATTCATGAACAAAAAACTATTCATCTCCAACGTTTAAATTTTAGATATGTAAACGGGGCAGTAAATTTTTGCCACATACCTGCAATTACTTGAGGCTTGCATTTTTTTGTAACGAGTGCTATATATCACCTGCATTTCCCGGGAGTGGCCCACACTGGTAT
TTTGGCGTTGCTAGTCCTTGAACACAAGAACAGTTTAACAAGCTTTATTTGGAATGGAATAACTCCAAAACGTTGAATACCCTTGGGTCTCCCATTTCCATGTACAATTGACAAACATATTCAGCTCCAGTTTTTCTGCTCGATATTACCCAGATTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTATCTGACTTTCCGAGTTCTT
TCTTTCTAGAATTGCTTTGCTAGTACTTTCTGGATATTACCCAGGTTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTTTCTGGCATTCCGAGTTCTTTCTTTCTAGAACTGCTTTGCTAGTACTTTCCAGGGTCTCCCATTTCCATGTACAAA
Intron 3 GTAAGTGTTG ... CTGTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 3.49 | 387 | 14 | 0 |
| A2 | 3.42 | 254 | 9 | 0 |
| A3 | 12.93 | 256 | 38 | 0 |
| A4 | 2.51 | 311 | 8 | 0 |
| A5 | 5.99 | 157 | 10 | 0 |
| A6 | 0.62 | 483 | 3 | 0 |
| A7 | 2.3 | 764 | 18 | 0 |
| A8 | 0.8 | 370 | 3 | 0 |
| A9 | 1.85 | 583 | 11 | 1 |
| A10 | 1.42 | 623 | 9 | 0 |
>TRINITY_DN112893_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformATCAGCCTCGCCTTCCAAAAAAAAACCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCT
AACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGC
GAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGTGGGAAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCT
CAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGGGGATAAGTACATCAATGGGGTAATCATACCAGATACTCGAGTATATAATAACAGGCCTAGTGGAAGGTACAATGACAGGCCTCGGAACCGCATGCGTAG
AGATTCCATGCCTGTTGAACGAAGAGACACGATGCCCATGGATGGGAGGGGTGGTATGCAGGGAGATAGGAGAGATTTCAGGCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAACGCCAGGCGGTCAACAAGATTATAGCAGACCTCCTCAACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAAATGATGGACAAGATT
ACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAACTGATGGACAAGATTACAACAGGTCGCTTCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTTCAGTGCCAGGTGGCCCTCAAGATTATAACAGACCTCCCCAAAATTATAACATGTCTTCTCCACAAGGTTACAACAGGCCTCCACAAGATTACAACAGACCTCCTCCACAA
GATTATAACAGAGTGCCGCCTCCACCTATTGAAGGAAGGGGTCCAATGCCAGGGTATCAACAAGAGTATCAACAGGATTATAACAGAGCTCCTCCAGCTCCGCCTATGGAAGGAAGGGGCACAATGCCAGTCTATCAGCAGGGTTATAACAGACCTCCACCTATGGACGGAAGAGGCCCAATGCCAAGTGATTATAACAG
GCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAATGCAAGGTGATTACAACAGGCCTCCTCCACCCTCGTCTATGGAAGGAAGAGCCCCAATGGGAGGTGATTACAATAGGTCTCCACCTCCTCCTATGGAAGGGAGGAACTATCAACAAGATTACTATAGGCCCCCTCCACCTTCCCCTGTGAGGGGAGAGAGGCAAGATT
ATAGGCCCCCTATGGATGGAAGAGGTCCAATCCCTGGTGATCGACAAGATTATAGGTCGACCATGGATGGAAGAGGCCCTGTGCAGGGAGGACAGGGTGATTATATGCCTCCTAGAGAATCAATGCAGGGAGGATCATTCCCAACCCAAGGCAGGGGCTCTGTCCAAGGAGAACAAAAAGAAGCTTTCCCATGGCCAATG
GAAGGAGCTCAGTGACCGAACGTGTATGGAATTATGAGTCGATGAGAAGGAAATAGGTAAAATTTTGAGTCTAAATAGAGTGAGGGGATTCCTTACTTGTAACGTGTAGCTCAAGCTGACTTGGTGATTATTTTTCAGGTTGAAGATTGTCAGGTATGCCTGGGTGAATGGAATTTATGATGGATTTCGTTTGACCTTGT
AAGATTTGCTCGTCGTGAGTCTGTCTGGTTTCAAACTCCATCAGTTTTTCCTTTGCAAATTTTGAGAAAGGCGGTCGACTTATGAGGTGTAGCTGGATGGCTTTTGATTTTACTTTGATGCAAAAATCTCCACAGGACTTGTATGGAGAAATTAGTACTTCTACTTTTAGCATAGACGCCGATCCAATTAATAGATAGTG
ATTATTCAATTAATAGATAGTAAAGAAGCACATGACTTAATATGATGGATTTACCGCTTTATGGATTTTAACTATTTGTATTTAGCATCAGAAGTGTAGATATTGAATTGAGATATACAATGTAAATGAGGAATGAAGGTTTTTATTAATAATATCACAGCACCTTCAATATTTCCGGATTGACTTTGTGAAAATATTGT
TGTAATCCCCAGGTCACATAATCTAAATTTTAATAATATGAACTACAGACTATTTGGGAGTGTATGAAAGAAGAGACCAATTCAGGCAGCATTAAACAAAAGATGTAATGGCAATATCTTTACAATATATCACTTGGGAGTCTTGGCCTCGTAATTTTTGATTGCATGTGTTCAGGCTATTTCTGGTATACAAAATACCG
AATTGCATGGTCTGTTCAGTGTGCAAATTCATGAACAAAAAAACTATTCATCTCCAACGTTTAAATTTTAGATATGTAAACGGGGCAGTAAATTTTTGCCACATACCTGCAATTACTTGAGGCTTGCATTTTTTTGTAACGAGTGCTATATATCACCTGCATTTCCCGGGAGTGGCCCACACTGGTAATTTGGCGTTGCT
AGTCCTTGAACACAAGAACAGTTTAACAAGCTTTATTTGGAATGGAATAACTCCAAAACGTTGAATACCCTTGGGTCTCCCATTTCCATGTACAATTGACAAACATATTCAGCTCCAGTTTTTCTGCTCGATATTACCCAGATTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTATCTGACTTTCCGAGTTCTTTCTTTCTAGAAT
TGCTTTGCTAGTACTTTCTGGATATTACCCAGGTTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTTTCTGGCATTCCGAGTTCTTTCTTTCTAGAACTGCTTTGCTAGTACTTTCCAGGGTCTCCCATTTCCATGTACAAATGACAAACATATTCAGCTCCAGTTTTTCTGCTCGATATTACCCAGATTTTTAGTGTTGTTTTAGC
ATGG
>TRINITY_DN112893_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATCAGCCTCGCCTTCCAAAAAAAAACCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCT
AACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGC
GAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGTGGGAAGGTAAGGAAGAATCCTGGTTCTTTAAATTTTGCCTTAGGATTCAGGGTTTATAGTTGTTTTCATA
AGTCGGTTTTTATTTTAGCTCATGCGATAAGGTTTTAGTGTCTTACAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCTCAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGTATGCTAAGCCATTTTAATCATTATTTAAGCTTATAATTATTTTGACTGGTTT
AGTCCGTGTTCTGGACCCGTGAACAAAAATGTTGGCAATTTTTGATATTTGTTTTTGCGAACTGTCTGTATTCTTATGCATCATCTGATTGATCGATATTCGAGTGTTTTGTAGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGgtaagtgttgtgatcttttt
ctgatgaatttgtttaggcagggtagacaaaatgggcaaaacattattgatctggaattcttcagtgtgccagatgtgtggaatttaataattgacatatttcacgaccagtgttttagggcattttccgactggatatatatggttaagtttgcctcgatggtctttgagagtgagttaactgcttgatacgtcttcct
tatatttaaaggatgaagatttttctggggcattctgggacaggaatatgcctcaaagttcatttgagagttacctggtctatatgtcctcttcttttatagtcaaaattgaaagtcaatttttataaagtttttaattagagatttaatcaagtatactaagtttctaagatacatattgaggatgtatataaatccta
gaatttgtgcagtgatactcaaatattagtgtttctgtttgcagGGGATAAGTACATCAATGGGG
Intron 4 GTATGCTAAG ... TGTTTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 4.41 | 358 | 24 | 9 |
| A2 | 3.45 | 280 | 17 | 3 |
| A3 | 4.58 | 333 | 12 | 20 |
| A4 | 3.19 | 319 | 18 | 3 |
| A5 | 5.06 | 150 | 11 | 5 |
| A6 | 1.33 | 481 | 11 | 2 |
| A7 | 0.64 | 703 | 4 | 5 |
| A8 | 1 | 298 | 4 | 2 |
| A9 | 1.53 | 611 | 18 | 1 |
| A10 | 1.37 | 611 | 13 | 4 |
>TRINITY_DN112893_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformATCAGCCTCGCCTTCCAAAAAAAAACCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCT
AACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGC
GAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGTGGGAAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCT
CAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGGGGATAAGTACATCAATGGGGTAATCATACCAGATACTCGAGTATATAATAACAGGCCTAGTGGAAGGTACAATGACAGGCCTCGGAACCGCATGCGTAG
AGATTCCATGCCTGTTGAACGAAGAGACACGATGCCCATGGATGGGAGGGGTGGTATGCAGGGAGATAGGAGAGATTTCAGGCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAACGCCAGGCGGTCAACAAGATTATAGCAGACCTCCTCAACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAAATGATGGACAAGATT
ACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAACTGATGGACAAGATTACAACAGGTCGCTTCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTTCAGTGCCAGGTGGCCCTCAAGATTATAACAGACCTCCCCAAAATTATAACATGTCTTCTCCACAAGGTTACAACAGGCCTCCACAAGATTACAACAGACCTCCTCCACAA
GATTATAACAGAGTGCCGCCTCCACCTATTGAAGGAAGGGGTCCAATGCCAGGGTATCAACAAGAGTATCAACAGGATTATAACAGAGCTCCTCCAGCTCCGCCTATGGAAGGAAGGGGCACAATGCCAGTCTATCAGCAGGGTTATAACAGACCTCCACCTATGGACGGAAGAGGCCCAATGCCAAGTGATTATAACAG
GCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAATGCAAGGTGATTACAACAGGCCTCCTCCACCCTCGTCTATGGAAGGAAGAGCCCCAATGGGAGGTGATTACAATAGGTCTCCACCTCCTCCTATGGAAGGGAGGAACTATCAACAAGATTACTATAGGCCCCCTCCACCTTCCCCTGTGAGGGGAGAGAGGCAAGATT
ATAGGCCCCCTATGGATGGAAGAGGTCCAATCCCTGGTGATCGACAAGATTATAGGTCGACCATGGATGGAAGAGGCCCTGTGCAGGGAGGACAGGGTGATTATATGCCTCCTAGAGAATCAATGCAGGGAGGATCATTCCCAACCCAAGGCAGGGGCTCTGTCCAAGGAGAACAAAAAGAAGCTTTCCCATGGCCAATG
GAAGGAGCTCAGTGACCGAACGTGTATGGAATTATGAGTCGATGAGAAGGAAATAGGTAAAATTTTGAGTCTAAATAGAGTGAGGGGATTCCTTACTTGTAACGTGTAGCTCAAGCTGACTTGGTGATTATTTTTCAGGTTGAAGATTGTCAGGTATGCCTGGGTGAATGGAATTTATGATGGATTTCGTTTGACCTTGT
AAGATTTGCTCGTCGTGAGTCTGTCTGGTTTCAAACTCCATCAGTTTTTCCTTTGCAAATTTTGAGAAAGGCGGTCGACTTATGAGGTGTAGCTGGATGGCTTTTGATTTTACTTTGATGCAAAAATCTCCACAGGACTTGTATGGAGAAATTAGTACTTCTACTTTTAGCATAGACGCCGATCCAATTAATAGATAGTG
ATTATTCAATTAATAGATAGTAAAGAAGCACATGACTTAATATGATGGATTTACCGCTTTATGGATTTTAACTATTTGTATTTAGCATCAGAAGTGTAGATATTGAATTGAGATATACAATGTAAATGAGGAATGAAGGTTTTTATTAATAATATCACAGCACCTTCAATATTTCCGGATTGACTTTGTGAAAATATTGT
TGTAATCCCCAGGTCACATAATCTAAATTTTAATAATATGAACTACAGACTATTTGGGAGTGTATGAAAGAAGAGACCAATTCAGGCAGCATTAAACAAAAGATGTAATGGCAATATCTTTACAATATATCACTTGGGAGTCTTGGCCTCGTAATTTTTGATTGCATGTGTTCAGGCTATTTCTGGTATACAAAATACCG
AATTGCATGGTCTGTTCAGTGTGCAAATTCATGAACAAAAAAACTATTCATCTCCAACGTTTAAATTTTAGATATGTAAACGGGGCAGTAAATTTTTGCCACATACCTGCAATTACTTGAGGCTTGCATTTTTTTGTAACGAGTGCTATATATCACCTGCATTTCCCGGGAGTGGCCCACACTGGTAATTTGGCGTTGCT
AGTCCTTGAACACAAGAACAGTTTAACAAGCTTTATTTGGAATGGAATAACTCCAAAACGTTGAATACCCTTGGGTCTCCCATTTCCATGTACAATTGACAAACATATTCAGCTCCAGTTTTTCTGCTCGATATTACCCAGATTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTATCTGACTTTCCGAGTTCTTTCTTTCTAGAAT
TGCTTTGCTAGTACTTTCTGGATATTACCCAGGTTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTTTCTGGCATTCCGAGTTCTTTCTTTCTAGAACTGCTTTGCTAGTACTTTCCAGGGTCTCCCATTTCCATGTACAAATGACAAACATATTCAGCTCCAGTTTTTCTGCTCGATATTACCCAGATTTTTAGTGTTGTTTTAGC
ATGG
>TRINITY_DN112893_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATCAGCCTCGCCTTCCAAAAAAAAACCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCT
AACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGC
GAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGTGGGAAGGTAAGGAAGAATCCTGGTTCTTTAAATTTTGCCTTAGGATTCAGGGTTTATAGTTGTTTTCATA
AGTCGGTTTTTATTTTAGCTCATGCGATAAGGTTTTAGTGTCTTACAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCTCAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGgtatgctaagccattttaatcattatttaagcttataattattttgactggttt
agtccgtgttctggacccgtgaacaaaaatgttggcaatttttgatatttgtttttgcgaactgtctgtattcttatgcatcatctgattgatcgatattcgagtgttttgtagGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGGTAAGTGTTGTGATCTTTTT
CTGATGAATTTGTTTAGGCAGGGTAGACAAAATGGGCAAAACATTATTGATCTGGAATTCTTCAGTGTGCCAGATGTGTGGAATTTAATAATTGACATATTTCACGACCAGTGTTTTAGGGCATTTTCCGACTGGATATATATGGTTAAGTTTGCCTCGATGGTCTTTGAGAGTGAGTTAACTGCTTGATACGTCTTCCT
TATATTTAAAGGATGAAGATTTTTCTGGGGCATTCTGGGACAGGAATATGCCTCAAAGTTCATTTGAGAGTTACCTGGTCTATATGTCCTCTTCTTTTATAGTCAAAATTGAAAGTCAATTTTTATAAAGTTTTTAATTAGAGATTTAATCAAGTATACTAAGTTTCTAAGATACATATTGAGGATGTATATAAATCCTA
GAATTTGTGCAGTGATACTCAAATATTAGTGTTTCTGTTTGCAGGGGATAAGTACATCAATGGGG
Intron 5 GTGAGTTAAC ... CTGTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 4.4 | 87 | 4 | 1 |
| A2 | 17.81 | 60 | 13 | 0 |
| A3 | 22.22 | 77 | 22 | 3 |
| A4 | 13.43 | 58 | 9 | 2 |
| A5 | 23.44 | 49 | 15 | 0 |
| A6 | 1.5 | 131 | 2 | 0 |
| A7 | 1.63 | 241 | 4 | 4 |
| A8 | 4.88 | 117 | 6 | 1 |
| A9 | 4.73 | 141 | 7 | 1 |
| A10 | 6.76 | 193 | 14 | 2 |
>TRINITY_DN43781_c0_g8_i3 from sample A7 / Example spliced isoformACCAACCAAAAAAAACTCAAATATATAAAATTTAACATTATATATTTTCAACCTTAACTTTAAACCTAACATCAGCCTCGCCTTCCAAAAAAAAACCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAA
ACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCTAACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAA
TGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGCGAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGT
GGGAAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCTCAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGGTAAGTGTTGTGATCTTTTTCTGATGAATT
TGTTTAGGCAGGGTAGACAAAATGGGCAAAACATTATTGATCTGGAATTCTTCAGTGTGCCAGATGTGTGGAATTTAATAATTGACATATTTCACGACCAGTGTTTTAGGGCATTTTCCGACTGGATATATATGGTTAAGTTTGCCTCGATGGTCTTTGAGAGGGATAAGTACATCAATGGGGTAATCATACCAGATACT
CGAGTATATAATAACAGGCCTAGTGGAAGGTACAATGACAGGCCTCGGAACCGCATGCGTAGAGATTCCATGCCTGTTGAACGAAGAGACACGATGCCCATGGATGGGAGGGGTGGTATGCAGGGAGATAGGAGAGATTTCAGGCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAACGCCAGGCGGTCAACAAGATTATAGCAGACC
TCCTCAACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAAATGATGGACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAACTGATGGACAAGATTACAACAGGTCGCTTCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTTCAGTGCCAGGTGGCCCTCAAGATTATAACAGACCTCCCCAAAATTATA
ACATGTCTTCTCCACAAGGTTACAACAGGCCTCCACAAGATTACAACAGACCTCCTCCACAAGATTATAACAGAGTGCCGCCTCCACCTATTGAAGGAAGGGGTCCAATGCCAGGGTATCAACAAGAGTATCAACAGGATTATAACAGAGCTCCTCCAGCTCCGCCTATGGAAGGAAGGGGCACAATGCCAGTCTATCAG
CAGGGTTATAACAGACCTCCACCTATGGACGGAAGAGGCCCAATGCCAAGTGATTATAACAGGCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAATGCAAGGTGATTACAACAGGCCTCCTCCACCCTCGTCTATGGAAGGAAGAGCCCCAATGGGAGGTGATTACAATAGGTCTCCACCTCCTCCTATGGAAGGGAGGAA
CTATCAACAAGATTACTATAGGCCCCCTCCACCTTCCCCTGTGAGGGGAGAGAGGCAAGATTATAGGCCCCCTATGGATGGAAGAGGTCCAATCCCTGGTGATCGACAAGATTATAGGTCGACCATGGATGGAAGAGGCCCTGTGCAGGGAGGACAGGGTGATTATATGCCTCCTAGAGAATCAATGCAGGGAGGATCAT
TCCCAACCCAAGGCAGGGGCTCTGTCCAAGGAGAACAAAAAGAAGCTTTCCCATGGCCAATGGAAGGAGCTCAGTGACCGAACGTGTATGGAATTATGAGTCGATGAGAAGGAAATAGGTTGAAGATTGTCAGGTATGCCTGGGTGAATGGAATTTATGATGGATTTCGTTTGACCTTGTAAGATTTGCTCGTCGTGAGT
CTGTCTGGTTTCAAACTCCATCAGTTTTTCCTTTGCAAATTTTGAGAAAGGCGGTCGACTTATGAGGTGTAGCTGGATGGCTTTTGATTTTACTTTGATGCAAAAATCTCCACAGGACTTGTATGGAGAAATTAGTACTTCTACTTTTAGCATAGACGCCGATCCAATTAATAGATAGTGATTATTCAATTAATAGATAG
TAAAGAAGCACATGACTTAATATGATGGATTTACCGCTTTATGGATTTTAACTATTTGTATTTAGCATCAGAAGTGTAGATATTGAATTGAGATATACAATGTAAATGAGGAATGAAGGTTTTTATTAATAATATCACAGCACCTTCAATATTTCCGGATTGACTTTGTGAAAATATTGTTGTAATCCCCAGGTCACATA
ATCTAAATTTTAATAATATGAACTACAGACTATTTGGGAGTGTATGAAAGAAGAGACCAATTCAGGCAGCATTAAACAAAAGATGTAATGGCAATATCTTTACAATATATCACTTGGGAGTCTTGGCCTCGTAATTTTTGATTGCATGTGTTCAGGCTATTTCTGGTATACAAAATACCGAATTGCATGGTCTGTTCAGT
GTGCAAATTCATGAACAAAAAACTATTCATCTCCAACGTTTAAATTTTAGATATGTAAACGGGGCAGTAAATTTTTGCCACATACCTGCAATTACTTGAGGCTTGCATTTTTTTGTAACGAGT
>TRINITY_DN43781_c0_g8_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:ACCAACCAAAAAAAACTCAAATATATAAAATTTAACATTATATATTTTCAACCTTAACTTTAAACCTAACATCAGCCTCGCCTTCCAAAAAAAAACCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAA
ACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCTAACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAA
TGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGCGAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGT
GGGAAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCTCAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGGTAAGTGTTGTGATCTTTTTCTGATGAATT
TGTTTAGGCAGGGTAGACAAAATGGGCAAAACATTATTGATCTGGAATTCTTCAGTGTGCCAGATGTGTGGAATTTAATAATTGACATATTTCACGACCAGTGTTTTAGGGCATTTTCCGACTGGATATATATGGTTAAGTTTGCCTCGATGGTCTTTGAGAgtgagttaactgcttgatacgtcttccttatatttaaa
ggatgaagatttttctggggcattctgggacaggaatatgcctcaaagttcatttgagagttacctggtctatatgtcctcttcttttatagtcaaaattgaaagtcaatttttataaagtttttaattagagatttaatcaagtatactaagtttctaagatacatattgaggatgtatataaatcctagaatttgtgc
agtgatactcaaatattagtgaggatgtatataaatcctagaatttgtgcagtgatactcaaatattagtgtttctgtttgcagGGGATAAGTACATCAATGGGGCA
Intron 6 GTAAAATTTT ... TATTTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 41.04 | 209 | 149 | 142.1 |
| A2 | 48.14 | 160 | 162 | 135 |
| A3 | 42.05 | 164 | 113 | 125 |
| A4 | 45.59 | 148 | 124 | 124 |
| A5 | 46.58 | 86 | 74 | 76 |
| A6 | 44.9 | 1170 | 780 | 1127 |
| A7 | 43.66 | 1066 | 701 | 951 |
| A8 | 43.47 | 1219 | 825 | 1050 |
| A9 | 46.48 | 839 | 629 | 828 |
| A10 | 45.55 | 630 | 451 | 603 |
>TRINITY_DN112893_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoformATCAGCCTCGCCTTCCAAAAAAAAACCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCT
AACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGC
GAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGTGGGAAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCT
CAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGGGGATAAGTACATCAATGGGGTAATCATACCAGATACTCGAGTATATAATAACAGGCCTAGTGGAAGGTACAATGACAGGCCTCGGAACCGCATGCGTAG
AGATTCCATGCCTGTTGAACGAAGAGACACGATGCCCATGGATGGGAGGGGTGGTATGCAGGGAGATAGGAGAGATTTCAGGCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAACGCCAGGCGGTCAACAAGATTATAGCAGACCTCCTCAACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAAATGATGGACAAGATT
ACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAACTGATGGACAAGATTACAACAGGTCGCTTCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTTCAGTGCCAGGTGGCCCTCAAGATTATAACAGACCTCCCCAAAATTATAACATGTCTTCTCCACAAGGTTACAACAGGCCTCCACAAGATTACAACAGACCTCCTCCACAA
GATTATAACAGAGTGCCGCCTCCACCTATTGAAGGAAGGGGTCCAATGCCAGGGTATCAACAAGAGTATCAACAGGATTATAACAGAGCTCCTCCAGCTCCGCCTATGGAAGGAAGGGGCACAATGCCAGTCTATCAGCAGGGTTATAACAGACCTCCACCTATGGACGGAAGAGGCCCAATGCCAAGTGATTATAACAG
GCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAATGCAAGGTGATTACAACAGGCCTCCTCCACCCTCGTCTATGGAAGGAAGAGCCCCAATGGGAGGTGATTACAATAGGTCTCCACCTCCTCCTATGGAAGGGAGGAACTATCAACAAGATTACTATAGGCCCCCTCCACCTTCCCCTGTGAGGGGAGAGAGGCAAGATT
ATAGGCCCCCTATGGATGGAAGAGGTCCAATCCCTGGTGATCGACAAGATTATAGGTCGACCATGGATGGAAGAGGCCCTGTGCAGGGAGGACAGGGTGATTATATGCCTCCTAGAGAATCAATGCAGGGAGGATCATTCCCAACCCAAGGCAGGGGCTCTGTCCAAGGAGAACAAAAAGAAGCTTTCCCATGGCCAATG
GAAGGAGCTCAGTGACCGAACGTGTATGGAATTATGAGTCGATGAGAAGGAAATAGGTTGAAGATTGTCAGGTATGCCTGGGTGAATGGAATTTATGATGGATTTCGTTTGACCTTGTAAGATTTGCTCGTCGTGAGTCTGTCTGGTTTCAAACTCCATCAGTTTTTCCTTTGCAAATTTTGAGAAAGGCGGTCGACTTA
TGAGGTGTAGCTGGATGGCTTTTGATTTTACTTTGATGCAAAAATCTCCACAGGACTTGTATGGAGAAATTAGTACTTCTACTTTTAGCATAGACGCCGATCCAATTAATAGATAGTGATTATTCAATTAATAGATAGTAAAGAAGCACATGACTTAATATGATGGATTTACCGCTTTATGGATTTTAACTATTTGTATT
TAGCATCAGAAGTGTAGATATTGAATTGAGATATACAATGTAAATGAGGAATGAAGGTTTTTATTAATAATATCACAGCACCTTCAATATTTCCGGATTGACTTTGTGAAAATATTGTTGTAATCCCCAGGTCACATAATCTAAATTTTAATAATATGAACTACAGACTATTTGGGAGTGTATGAAAGAAGAGACCAATT
CAGGCAGCATTAAACAAAAGATGTAATGGCAATATCTTTACAATATATCACTTGGGAGTCTTGGCCTCGTAATTTTTGATTGCATGTGTTCAGGCTATTTCTGGTATACAAAATACCGAATTGCATGGTCTGTTCAGTGTGCAAATTCATGAACAAAAAAACTATTCATCTCCAACGTTTAAATTTTAGATATGTAAACG
GGGCAGTAAATTTTTGCCACATACCTGCAATTACTTGAGGCTTGCATTTTTTTGTAACGAGTGCTATATATCACCTGCATTTCCCGGGAGTGGCCCACACTGGTAATTTGGCGTTGCTAGTCCTTGAACACAAGAACAGTTTAACAAGCTTTATTTGGAATGGAATAACTCCAAAACGTTGAATACCCTTGGGTCTCCCA
TTTCCATGTACAATTGACAAACATATTCAGCTCCAGTTTTTCTGCTCGATATTACCCAGATTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTATCTGACTTTCCGAGTTCTTTCTTTCTAGAATTGCTTTGCTAGTACTTTCTGGATATTACCCAGGTTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTTTCTGGCATTCCGAGTTCTTTCT
TTCTAGAACTGCTTTGCTAGTACTTTCCAGGGTCTCCCATTTCCATGTACAAATGACAAACATATTCAGCTCCAGTTTTTCTGCTCGATATTACCCAGATTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGG
>TRINITY_DN112893_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATCAGCCTCGCCTTCCAAAAAAAAACCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCT
AACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGC
GAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGTGGGAAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCT
CAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGGGGATAAGTACATCAATGGGGTAATCATACCAGATACTCGAGTATATAATAACAGGCCTAGTGGAAGGTACAATGACAGGCCTCGGAACCGCATGCGTAG
AGATTCCATGCCTGTTGAACGAAGAGACACGATGCCCATGGATGGGAGGGGTGGTATGCAGGGAGATAGGAGAGATTTCAGGCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAACGCCAGGCGGTCAACAAGATTATAGCAGACCTCCTCAACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAAATGATGGACAAGATT
ACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAACTGATGGACAAGATTACAACAGGTCGCTTCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTTCAGTGCCAGGTGGCCCTCAAGATTATAACAGACCTCCCCAAAATTATAACATGTCTTCTCCACAAGGTTACAACAGGCCTCCACAAGATTACAACAGACCTCCTCCACAA
GATTATAACAGAGTGCCGCCTCCACCTATTGAAGGAAGGGGTCCAATGCCAGGGTATCAACAAGAGTATCAACAGGATTATAACAGAGCTCCTCCAGCTCCGCCTATGGAAGGAAGGGGCACAATGCCAGTCTATCAGCAGGGTTATAACAGACCTCCACCTATGGACGGAAGAGGCCCAATGCCAAGTGATTATAACAG
GCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAATGCAAGGTGATTACAACAGGCCTCCTCCACCCTCGTCTATGGAAGGAAGAGCCCCAATGGGAGGTGATTACAATAGGTCTCCACCTCCTCCTATGGAAGGGAGGAACTATCAACAAGATTACTATAGGCCCCCTCCACCTTCCCCTGTGAGGGGAGAGAGGCAAGATT
ATAGGCCCCCTATGGATGGAAGAGGTCCAATCCCTGGTGATCGACAAGATTATAGGTCGACCATGGATGGAAGAGGCCCTGTGCAGGGAGGACAGGGTGATTATATGCCTCCTAGAGAATCAATGCAGGGAGGATCATTCCCAACCCAAGGCAGGGGCTCTGTCCAAGGAGAACAAAAAGAAGCTTTCCCATGGCCAATG
GAAGGAGCTCAGTGACCGAACGTGTATGGAATTATGAGTCGATGAGAAGGAAATAGgtaaaattttgagtctaaatagagtgaggggattccttacttgtaacgtgtagctcaagctgacttggtgattatttttcagGTTGAAGATTGTCAGGTATGCCTGGGTGAATGGAATTTATGATGGATTTCGTTTGACCTTGT
AAGATTTGCTCGTCGTGAGTCTGTCTGGTTTCAAACTCCATCAGTTTTTCCTTTGCAAATTTTGAGAAAGGCGGTCGACTTATGAGGTGTAGCTGGATGGCTTTTGATTTTACTTTGATGCAAAAATCTCCACAGGACTTGTATGGAGAAATTAGTACTTCTACTTTTAGCATAGACGCCGATCCAATTAATAGATAGTG
ATTATTCAATTAATAGATAGTAAAGAAGCACATGACTTAATATGATGGATTTACCGCTTTATGGATTTTAACTATTTGTATTTAGCATCAGAAGTGTAGATATTGAATTGAGATATACAATGTAAATGAGGAATGAAGGTTTTTATTAATAATATCACAGCACCTTCAATATTTCCGGATTGACTTTGTGAAAATATTGT
TGTAATCCCCAGGTCACATAATCTAAATTTTAATAATATGAACTACAGACTATTTGGGAGTGTATGAAAGAAGAGACCAATTCAGGCAGCATTAAACAAAAGATGTAATGGCAATATCTTTACAATATATCACTTGGGAGTCTTGGCCTCGTAATTTTTGATTGCATGTGTTCAGGCTATTTCTGGTATACAAAATACCG
AATTGCATGGTCTGTTCAGTGTGCAAATTCATGAACAAAAAAACTATTCATCTCCAACGTTTAAATTTTAGATATGTAAACGGGGCAGTAAATTTTTGCCACATACCTGCAATTACTTGAGGCTTGCATTTTTTTGTAACGAGTGCTATATATCACCTGCATTTCCCGGGAGTGGCCCACACTGGTAATTTGGCGTTGCT
AGTCCTTGAACACAAGAACAGTTTAACAAGCTTTATTTGGAATGGAATAACTCCAAAACGTTGAATACCCTTGGGTCTCCCATTTCCATGTACAATTGACAAACATATTCAGCTCCAGTTTTTCTGCTCGATATTACCCAGATTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTATCTGACTTTCCGAGTTCTTTCTTTCTAGAAT
TGCTTTGCTAGTACTTTCTGGATATTACCCAGGTTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTTTCTGGCATTCCGAGTTCTTTCTTTCTAGAACTGCTTTGCTAGTACTTTCCAGGGTCTCCCATTTCCATGTACAAATGACAAACATATTCAGCTCCAGTTTTTCTGCTCGATATTACCCAGATTTTTAGTGTTGTTTTAGC
ATGG
Intron 7 GTAAGGAAGA ... TGTCTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.2 | 301.7 | 76 | 41.9 |
| A2 | 12.9 | 210.4 | 31 | 28.1 |
| A3 | 15.27 | 317.7 | 57 | 24.3 |
| A4 | 21.09 | 253.7 | 67.6 | 29.3 |
| A5 | 21.93 | 148.8 | 41.8 | 23.7 |
| A6 | 14.53 | 390.4 | 66 | 35.6 |
| A7 | 17.35 | 569.9 | 119 | 45.5 |
| A8 | 18.73 | 218.2 | 50 | 16.9 |
| A9 | 14.54 | 426.8 | 72 | 45.2 |
| A10 | 14.24 | 515.7 | 85 | 49 |
>TRINITY_DN112893_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformATCAGCCTCGCCTTCCAAAAAAAAACCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCT
AACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGC
GAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGTGGGAAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCT
CAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGGGGATAAGTACATCAATGGGGTAATCATACCAGATACTCGAGTATATAATAACAGGCCTAGTGGAAGGTACAATGACAGGCCTCGGAACCGCATGCGTAG
AGATTCCATGCCTGTTGAACGAAGAGACACGATGCCCATGGATGGGAGGGGTGGTATGCAGGGAGATAGGAGAGATTTCAGGCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAACGCCAGGCGGTCAACAAGATTATAGCAGACCTCCTCAACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAAATGATGGACAAGATT
ACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAACTGATGGACAAGATTACAACAGGTCGCTTCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTTCAGTGCCAGGTGGCCCTCAAGATTATAACAGACCTCCCCAAAATTATAACATGTCTTCTCCACAAGGTTACAACAGGCCTCCACAAGATTACAACAGACCTCCTCCACAA
GATTATAACAGAGTGCCGCCTCCACCTATTGAAGGAAGGGGTCCAATGCCAGGGTATCAACAAGAGTATCAACAGGATTATAACAGAGCTCCTCCAGCTCCGCCTATGGAAGGAAGGGGCACAATGCCAGTCTATCAGCAGGGTTATAACAGACCTCCACCTATGGACGGAAGAGGCCCAATGCCAAGTGATTATAACAG
GCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAATGCAAGGTGATTACAACAGGCCTCCTCCACCCTCGTCTATGGAAGGAAGAGCCCCAATGGGAGGTGATTACAATAGGTCTCCACCTCCTCCTATGGAAGGGAGGAACTATCAACAAGATTACTATAGGCCCCCTCCACCTTCCCCTGTGAGGGGAGAGAGGCAAGATT
ATAGGCCCCCTATGGATGGAAGAGGTCCAATCCCTGGTGATCGACAAGATTATAGGTCGACCATGGATGGAAGAGGCCCTGTGCAGGGAGGACAGGGTGATTATATGCCTCCTAGAGAATCAATGCAGGGAGGATCATTCCCAACCCAAGGCAGGGGCTCTGTCCAAGGAGAACAAAAAGAAGCTTTCCCATGGCCAATG
GAAGGAGCTCAGTGACCGAACGTGTATGGAATTATGAGTCGATGAGAAGGAAATAGGTAAAATTTTGAGTCTAAATAGAGTGAGGGGATTCCTTACTTGTAACGTGTAGCTCAAGCTGACTTGGTGATTATTTTTCAGGTTGAAGATTGTCAGGTATGCCTGGGTGAATGGAATTTATGATGGATTTCGTTTGACCTTGT
AAGATTTGCTCGTCGTGAGTCTGTCTGGTTTCAAACTCCATCAGTTTTTCCTTTGCAAATTTTGAGAAAGGCGGTCGACTTATGAGGTGTAGCTGGATGGCTTTTGATTTTACTTTGATGCAAAAATCTCCACAGGACTTGTATGGAGAAATTAGTACTTCTACTTTTAGCATAGACGCCGATCCAATTAATAGATAGTG
ATTATTCAATTAATAGATAGTAAAGAAGCACATGACTTAATATGATGGATTTACCGCTTTATGGATTTTAACTATTTGTATTTAGCATCAGAAGTGTAGATATTGAATTGAGATATACAATGTAAATGAGGAATGAAGGTTTTTATTAATAATATCACAGCACCTTCAATATTTCCGGATTGACTTTGTGAAAATATTGT
TGTAATCCCCAGGTCACATAATCTAAATTTTAATAATATGAACTACAGACTATTTGGGAGTGTATGAAAGAAGAGACCAATTCAGGCAGCATTAAACAAAAGATGTAATGGCAATATCTTTACAATATATCACTTGGGAGTCTTGGCCTCGTAATTTTTGATTGCATGTGTTCAGGCTATTTCTGGTATACAAAATACCG
AATTGCATGGTCTGTTCAGTGTGCAAATTCATGAACAAAAAAACTATTCATCTCCAACGTTTAAATTTTAGATATGTAAACGGGGCAGTAAATTTTTGCCACATACCTGCAATTACTTGAGGCTTGCATTTTTTTGTAACGAGTGCTATATATCACCTGCATTTCCCGGGAGTGGCCCACACTGGTAATTTGGCGTTGCT
AGTCCTTGAACACAAGAACAGTTTAACAAGCTTTATTTGGAATGGAATAACTCCAAAACGTTGAATACCCTTGGGTCTCCCATTTCCATGTACAATTGACAAACATATTCAGCTCCAGTTTTTCTGCTCGATATTACCCAGATTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTATCTGACTTTCCGAGTTCTTTCTTTCTAGAAT
TGCTTTGCTAGTACTTTCTGGATATTACCCAGGTTTTTAGTGTTGTTTTAGCATGGCTTTTCTGGCATTCCGAGTTCTTTCTTTCTAGAACTGCTTTGCTAGTACTTTCCAGGGTCTCCCATTTCCATGTACAAATGACAAACATATTCAGCTCCAGTTTTTCTGCTCGATATTACCCAGATTTTTAGTGTTGTTTTAGC
ATGG
>TRINITY_DN112893_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATCAGCCTCGCCTTCCAAAAAAAAACCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCT
AACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGC
GAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGTGGGAAGgtaaggaagaatcctggttctttaaattttgccttaggattcagggtttatagttgttttcata
agtcggtttttattttagctcatgcgataaggttttagtgtcttacagTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCTCAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGTATGCTAAGCCATTTTAATCATTATTTAAGCTTATAATTATTTTGACTGGTTT
AGTCCGTGTTCTGGACCCGTGAACAAAAATGTTGGCAATTTTTGATATTTGTTTTTGCGAACTGTCTGTATTCTTATGCATCATCTGATTGATCGATATTCGAGTGTTTTGTAGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGGTAAGTGTTGTGATCTTTTT
CTGATGAATTTGTTTAGGCAGGGTAGACAAAATGGGCAAAACATTATTGATCTGGAATTCTTCAGTGTGCCAGATGTGTGGAATTTAATAATTGACATATTTCACGACCAGTGTTTTAGGGCATTTTCCGACTGGATATATATGGTTAAGTTTGCCTCGATGGTCTTTGAGAGTGAGTTAACTGCTTGATACGTCTTCCT
TATATTTAAAGGATGAAGATTTTTCTGGGGCATTCTGGGACAGGAATATGCCTCAAAGTTCATTTGAGAGTTACCTGGTCTATATGTCCTCTTCTTTTATAGTCAAAATTGAAAGTCAATTTTTATAAAGTTTTTAATTAGAGATTTAATCAAGTATACTAAGTTTCTAAGATACATATTGAGGATGTATATAAATCCTA
GAATTTGTGCAGTGATACTCAAATATTAGTGTTTCTGTTTGCAGGGGATAAGTACATCAATGGGG
Intron 8 GTAAGTGTTG ... CTGTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 17.83 | 387 | 73 | 95 |
| A2 | 18.98 | 254 | 55 | 64 |
| A3 | 25.04 | 256 | 93 | 78 |
| A4 | 19.12 | 311 | 82 | 65 |
| A5 | 22.85 | 157 | 48 | 45 |
| A6 | 20.56 | 483 | 111 | 139 |
| A7 | 21.12 | 764 | 143 | 266 |
| A8 | 20.94 | 370 | 72 | 124 |
| A9 | 21.43 | 583 | 152 | 166 |
| A10 | 20.64 | 623 | 125 | 199 |
>TRINITY_DN108505_c0_g2_i4 from sample A2 / Example spliced isoformATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCTAACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCT
TCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGCGAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTAT
TACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGTGGGAAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCTCAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTT
GGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGGGGATAAGTACATCAATGGGGTAATCATACCAGATACTCGAGTATATAATAACAGGCCTAGTGGAAGGTACAATGACAGGCCTCGGAACCGCATGCGTAGAGATTCCATGCCTGTTGAACGAAGAGACACGATGCCCATGGATGGGAGGGGT
GGTATGCAGGGAGATAGGAGAGATTTCAGGCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAACGCCAGGCGGTCAACAAGATTATAGCAGACCTCCTCAACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAAATGATGGACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAACTGATGGACAAGATTACAA
CAGGTCGCTTCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTTCAGTGCCAGGTGGCCCTCAAGATTATAACAGACCTCCCCAAAATTATAACATGTCTTCTCCACAAGGTTACAACAGGCCTCCACAAGATTACAACAGACCTCCTCCACAAGATTATAACAGAGTGCCGCCTCCACCTATTGAAGGAAGGGGTCCAATGCCAG
GGTATCAACAAGAGTATCAACAGGATTATAACAGAGCTCCTCCAGCTCCGCCTATGGAAGGAAGGGGCACAATGCCAGTCTATCAGCAGGGTTATAACAGACCTCCACCTATGGACGGAAGAGGCCCAATGCAAAGTGATTATAACAGGCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAATGCAAGGTGATTACAACAGG
CCTCCTCCACCCTCGTCTATGGAAGGAAGAGCCCCAATGGGAGGTGATTACAATAGGTCTCCACCTCCTCCTATGGAAGGGAGGAACTATCAACAAGATTACTATAGGCCCCCTCCACCTTCCCCTGTGAGGGGAGAGAGGCAAGATTATAGGCCCCCTATGGATGGAAGAGGTCCAATCCCTGGTGATCGACAAGATTA
TAGGTCGACCATGGATGGAAGAGGCCCTGTGCAGGGAGGACAGGGTGATTATATGCCTCCTAGAGAATCAATGCAGGGAGGATCATTCCCAACCCAAGGCAGGGGCTCTGTCCAAGGAGAACAAAAAGAAGCTTTCCCATGGCCAATGGAAGGAGCTCAGTGACCGAACGTGTATGGAATTATGAGTCGATGAGAAGGAA
ATAGGTAAAATTTTGAGTCTAAATAGAGTGAGGGGATTCCTTACTTGTAACGTGTAGCTCAAGCTGACTTGGTGATTATTTTTCAGGTTGAAGATTGTCAGGTATGCCTGGGTGAATGGAATTTATGATGGATTTCGTTTGACCTTGTAAGATTTGCTCGTCGTGAGTCTGTCTGGTTTCAAACTCCATCAGTTTTTCCT
TTGCAAATTTTGAGAAAGGCGGTCGACTTATGAGGTGTAGCTGGATGGCTTTTGATTTTACTTTGATGCAAAAATCTCCACAGGACTTGTATGGAGAAATTAGTACTTCTACTTTTAGCATAGACGCCGATCCAATTAATAGATAGTGATTATTCAATTAATAGATAGTAAAGAAGCACATGACTTAATATGATGGATTT
ACCGCTTTATGGATTTTAACTATTTGTATTTAGCATCAGAAGTGTAGATATTGAATTGAGATATACAATGTAAATGAGGAATGAAGGTTTTTATTAATAATATCACAGCACCTTCAATATTTCCGGATTGACTTTGTGAAAATATTGTTGTAATCCCCAGGTCACATAATCTAAATTTTAATAATATGAACTACAGACTA
TTTGGGAGTGTATGAAAGAAGAGACCAATTCAGGCAGCATTAAACAAAAGATGTAATGGCAATATCTTTACAATATATCACTTGGGAGTCTTGGCCTCGTAATTTTTGATTGCATGTGTTCAGGCTATTTCTGGTATACAAAATACCGAATTGCATGGTCTGTTCAGTGTGCAAATTCATGAACAAAAAACTATTCATCT
CCAACGTTTAAATTTTAGATATGTAAACGGGGCAGTAAATTTTTGCCACATACCTGCAATTACTTGAGGCTTGCATTTTTTTGTAACGAGTGCTATATATCACCTGCATTTCCCGGGAGTGGCCCA
>TRINITY_DN108505_c0_g2_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:ATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAAACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCTAACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCT
TCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAATGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGCGAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTAT
TACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGTGGGAAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCTCAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTT
GGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGgtaagtgttgtgatctttttctgatgaatttgtttaggcagggtagacaaaatgggcaaaacattattgatctggaattcttcagtgtgccagatgtgtggaatttaataattgacatatttcacgaccagtgttttagggcattttccgac
tggatatatatggttaagtttgcctcgatggtctttgagagtgagttaactgcttgatacgtcttccttatatttaaaggatgaagatttttctggggcattctgggacaggaatatgcctcaaagttcatttgagagttacctggtctatatgtcctcttcttttatagtcaaaattgaaagtcaatttttataaagtt
tttaattagagatttaatcaagtatactaagtttctaagatacatattgaggatgtatataaatcctagaatttgtgcagtgatactcaaatattagtgaggatgtatataaatcctagaatttgtgcagtgatactcaaatattagtgtttctgtttgcagGGGATAAGTACATCAATGGGGTAATCATACCAGATACT
CGAGTATATAATAACAGGCCTAGTGGAAGGTACAATGACAGGCCTCGGAACCGCATGCGTAGAGATTCCATGCCTGTTGAACGAAGAGACACGATGCCCATGGATGGGAGGGGTGGTATGCAGGGAGATAGGAGAGATTTCAGGCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAACGCCAGGCGGTCAACAAGATTATAGCAGACC
TCCTCAACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAAATGATGGACAAGATTACAACAGACCTCCCCCTCAAGGTCCGTTCCCAACTGATGGACAAGATTACAACAGGTCGCTTCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTTCAGTGCCAGGTGGCCCTCAAGATTATAACAGACCTCCCCAAAATTATA
ACATGTCTTCTCCACAAGGTTACAACAGGCCTCCACAAGATTACAACAGACCTCCTCCACAAGATTATAACAGAGTGCCGCCTCCACCTATTGAAGGAAGGGGTCCAATGCCAGGGTATCAACAAGAGTATCAACAGGATTATAACAGAGCTCCTCCAGCTCCGCCTATGGAAGGAAGGGGCACAATGCCAGTCTATCAG
CAGGGTTATAACAGACCTCCACCTATGGACGGAAGAGGCCCAATGCAAAGTGATTATAACAGGCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAATGCAAGGTGATTACAACAGGCCTCCTCCACCCTCGTCTATGGAAGGAAGAGCCCCAATGGGAGGTGATTACAATAGGTCTCCACCTCCTCCTATGGAAGGGAGGAA
CTATCAACAAGATTACTATAGGCCCCCTCCACCTTCCCCTGTGAGGGGAGAGAGGCAAGATTATAGGCCCCCTATGGATGGAAGAGGTCCAATCCCTGGTGATCGACAAGATTATAGGTCGACCATGGATGGAAGAGGCCCTGTGCAGGGAGGACAGGGTGATTATATGCCTCCTAGAGAATCAATGCAGGGAGGATCAT
TCCCAACCCAAGGCAGGGGCTCTGTCCAAGGAGAACAAAAAGAAGCTTTCCCATGGCCAATGGAAGGAGCTCAGTGACCGAACGTGTATGGAATTATGAGTCGATGAGAAGGAAATAGGTAAAATTTTGAGTCTAAATAGAGTGAGGGGATTCCTTACTTGTAACGTGTAGCTCAAGCTGACTTGGTGATTATTTTTCAG
GTTGAAGATTGTCAGGTATGCCTGGGTGAATGGAATTTATGATGGATTTCGTTTGACCTTGTAAGATTTGCTCGTCGTGAGTCTGTCTGGTTTCAAACTCCATCAGTTTTTCCTTTGCAAATTTTGAGAAAGGCGGTCGACTTATGAGGTGTAGCTGGATGGCTTTTGATTTTACTTTGATGCAAAAATCTCCACAGGAC
TTGTATGGAGAAATTAGTACTTCTACTTTTAGCATAGACGCCGATCCAATTAATAGATAGTGATTATTCAATTAATAGATAGTAAAGAAGCACATGACTTAATATGATGGATTTACCGCTTTATGGATTTTAACTATTTGTATTTAGCATCAGAAGTGTAGATATTGAATTGAGATATACAATGTAAATGAGGAATGAAG
GTTTTTATTAATAATATCACAGCACCTTCAATATTTCCGGATTGACTTTGTGAAAATATTGTTGTAATCCCCAGGTCACATAATCTAAATTTTAATAATATGAACTACAGACTATTTGGGAGTGTATGAAAGAAGAGACCAATTCAGGCAGCATTAAACAAAAGATGTAATGGCAATATCTTTACAATATATCACTTGGG
AGTCTTGGCCTCGTAATTTTTGATTGCATGTGTTCAGGCTATTTCTGGTATACAAAATACCGAATTGCATGGTCTGTTCAGTGTGCAAATTCATGAACAAAAAACTATTCATCTCCAACGTTTAAATTTTAGATATGTAAACGGGGCAGTAAATTTTTGCCACATACCTGCAATTACTTGAGGCTTGCATTTTTTTGTAA
CGAGTGCTATATATCACCTGCATTTCCCGGGAGTGGCCCA
Intron 9 GTAAGTGTTG ... AGTGTGCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 56.59 | 56 | 73 | 19 |
| A2 | 57.89 | 40 | 55 | 20.7 |
| A3 | 62.42 | 56 | 93 | 36.3 |
| A4 | 55.78 | 65 | 82 | 14 |
| A5 | 60.76 | 31 | 48 | 16.7 |
| A6 | 53.11 | 98 | 111 | 8 |
| A7 | 55.21 | 116 | 143 | 21 |
| A8 | 52.94 | 64 | 72 | 11 |
| A9 | 53.15 | 134 | 152 | 13.3 |
| A10 | 54.35 | 105 | 125 | 10.3 |
>TRINITY_DN43781_c0_g8_i1 from sample A7 / Example spliced isoformACCAACCAAAAAAAACTCAAATATATAAAATTTAACATTATATATTTTCAACCTTAACTTTAAACCTAACATCAGCCTCGCCTTCCAAAAAAAAACCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAA
ACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCTAACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAA
TGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGCGAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGT
GGGAAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCTCAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGATGTGTGGAATTTAATAATTGACATATTTC
ACGACCAGTGTTTTAGGGCATTTTCCGACTGGATATATATGGTTAAGTTTGCCTCGATGGTCTTTGAGAG
>TRINITY_DN43781_c0_g8_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:ACCAACCAAAAAAAACTCAAATATATAAAATTTAACATTATATATTTTCAACCTTAACTTTAAACCTAACATCAGCCTCGCCTTCCAAAAAAAAACCCTAGTTCTAGAAGTCTCGAATAAGCATTATATATCGCAACAGGGCAAAATCCCTCTTACGTGTATATAGTCTCTCAAGGCCTTCTTAAACCTTTGTTGCTTAA
ACCCTAGCTCTGAATTTGTGGATCAAGTCTCAGCAATGGCGACCCTGGCAGTTCGTCTTCGTCGCGGGCTAACCCTGGCGAGGGCTTTTTCAACAGCAACGCTATACAGGGCTCAGCCTTCTTCTTCCGGCTTGATACCAACAGCGTGCTCCGTCCAAGGTCACGTAAGTGGTTTCACCTTGCCGTCCCCAGTGTTGCAA
TGTCTGACAGGACATCGCGGGGTTTCAAACTGGGGACCAGTCTGCTCTCCGATGGACTCGGACAACAAGCGAGGGGACACTACCATTCTTTTCGAAGGCTGCGACTACGAGCACTGGCTTATTACCATGGAGTTTCCTGATCCCCAACCCACCCGCGAGGAAAAGATCGATACGTTTATAAAAACCCTAGCGAAGGTGGT
GGGAAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAAAGATATATGCTCTGTCTACGACGACCTATACTGGGTTTCAAGCTCAGATATCAGAGGAGCTTTCAGAAAAAATGAAGGGCCTGCCCGGCGTTGTTTGGGTGTTGCCCGATTCGTATATTGACCCTGTAAATAAGGAGTATGGAGgtaagtgttgtgatctttttctgatgaatt
tgtttaggcagggtagacaaaatgggcaaaacattattgatctggaattcttcagtgtgccagATGTGTGGAATTTAATAATTGACATATTTCACGACCAGTGTTTTAGGGCATTTTCCGACTGGATATATATGGTTAAGTTTGCCTCGATGGTCTTTGAGAGGGATAAGTACATCAATGGGGTAATCATACCAGATACT
CGAGTATATAATAACAGGCCTAGTGGAAGGTACAATGACAGGCCTCGGAACCGCATGCGTAGAGATTCCATGCCTGTTGAACGAAGAGACACGATGCCCATGGATGGGAGGGGTGGTATGCAGGGAGATAGGAGAGATTTCAGGCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAACGCCAGGCGGTCAACAAGATTATAGCAGACC
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ACATGTCTTCTCCACAAGGTTACAACAGGCCTCCACAAGATTACAACAGACCTCCTCCACAAGATTATAACAGAGTGCCGCCTCCACCTATTGAAGGAAGGGGTCCAATGCCAGGGTATCAACAAGAGTATCAACAGGATTATAACAGAGCTCCTCCAGCTCCGCCTATGGAAGGAAGGGGCACAATGCCAGTCTATCAG
CAGGGTTATAACAGACCTCCACCTATGGACGGAAGAGGCCCAATGCCAAGTGATTATAACAGGCCACCTCCACCTATGGAAGGAAGAGGTCCAATGCAAGGTGATTACAACAGGCCTCCTCCACCCTCGTCTATGGAAGGAAGAGCCCCAATGGGAGGTGATTACAATAGGTCTCCACCTCCTCCTATGGAAGGGAGGAA
CTATCAACAAGATTACTATAGGCCCCCTCCACCTTCCCCTGTGAGGGGAGAGAGGCAAGATTATAGGCCCCCTATGGATGGAAGAGGTCCAATCCCTGGTGATCGACAAGATTATAGGTCGACCATGGATGGAAGAGGCCCTGTGCAGGGAGGACAGGGTGATTATATGCCTCCTAGAGAATCAATGCAGGGAGGATCAT
TCCCAACCCAAGGCAGGGGCTCTGTCCAAGGAGAACAAAAAGAAGCTTTCCCATGGCCAATGGAAGGAGCTCAGTGACCGAACGTGTATGGAATTATGAGTCGATGAGAAGGAAATAGGTTGAAGATTGTCAGGTATGCCTGGGTGAATGGAATTTATGATGGATTTCGTTTGACCTTGTAAGATTTGCTCGTCGTGAGT
CTGTCTGGTTTCAAACTCCATCAGTTTTTCCTTTGCAAATTTTGAGAAAGGCGGTCGACTTATGAGGTGTAGCTGGATGGCTTTTGATTTTACTTTGATGCAAAAATCTCCACAGGACTTGTATGGAGAAATTAGTACTTCTACTTTTAGCATAGACGCCGATCCAATTAATAGATAGTGATTATTCAATTAATAGATAG
TAAAGAAGCACATGACTTAATATGATGGATTTACCGCTTTATGGATTTTAACTATTTGTATTTAGCATCAGAAGTGTAGATATTGAATTGAGATATACAATGTAAATGAGGAATGAAGGTTTTTATTAATAATATCACAGCACCTTCAATATTTCCGGATTGACTTTGTGAAAATATTGTTGTAATCCCCAGGTCACATA
ATCTAAATTTTAATAATATGAACTACAGACTATTTGGGAGTGTATGAAAGAAGAGACCAATTCAGGCAGCATTAAACAAAAGATGTAATGGCAATATCTTTACAATATATCACTTGGGAGTCTTGGCCTCGTAATTTTTGATTGCATGTGTTCAGGCTATTTCTGGTATACAAAATACCGAATTGCATGGTCTGTTCAGT
GTGCAAATTCATGAACAAAAAACTATTCATCTCCAACGTTTAAATTTTAGATATGTAAACGGGGCAGTAAATTTTTGCCACATACCTGCAATTACTTGAGGCTTGCATTTTTTTGTAACGAGT