sp|F4I8H8|GDPD4_ARATH ----> Glycerophosphodiester phosphodiesterase GDPD4


Intron 1 GTAAGTGCAT ... CCTTTTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A136.36735
A222.8122103
A337.1411103
A438.46441
A533.33523
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A72536186
A88.72140
A99.092022
A1017.241250



>TRINITY_DN127297_c3_g1_i11 from sample A1 / Example spliced isoform
TTAGGAGTTTCGTGCAACATAGCCAACTCACATTTCCCCAATGGCCTCTTTGAATGAAAATCCATTTTATAGAAGTTTACAAATACCTGCTTAATCTCTTCCGTCTCTTGCTGCCTAGTTATTTGATCGAGTACATTTGGAGTGCTGAGATTTTCTCGTTGGTATATTCTCCATTATTTAATAATTTATCCAATGAAACT
GGGCTATTAGTTGAGTCCGCCTAGTTCATTTTATGTCCTTGGCCTTCAAAATGTGACGAATTTTGGTAGCTCATGTTTGCTTGTCTTCATTGTAAGGACTAACCAAGAGCATTTGAGAAACATACTCCAACTTATCTTTCACCACTTTATGTCGTTTTTGATGCGTAACTACAATTTGGAGATCGTAGGCTATAGCCACA
AAGGAAGGCTATTGCCCAAGTTGTAGCATCCTCCCACCATGCAATCCACCACTCTTCTTTTATTGGATGTGGCATGGGGTTTCAATTTCTTTTTATAAACTTCTCTGCAACCATTTTCATTATACTAGATACCGACTTTGGTTTATTATAGTAGATAGTAATTGTACTTTGCCTGTTTATATAATGTTTATAACTTGGTT
TCACTGCATGAGTTATGCCATAATTTATCTAAAGAACTTGATTCTAGCTTGAGTGCAGATTAAAGGATTGGATGCAGGCTTTGGATTTGCAAAAGAATTTCAAAATCAGGAAGTGCCTACACTTGATGATGCCTTGAAGTTTGTTTCAGAATCAGTCAAGCATGTTATTGTTGATGTGAAAATTGGCCCCCCTCGTTTTC
AACAAGGACTTGCAGCAGACTTGCTTTCAGTTATCAATAAAACTGAATGCAGAAATTGTATCATATGGGCCAAAGTAGACAATTTGGTGAGAGAATTGAAGCAGCTATCTCATGACATAATGGTAGGATATATTGTTATGAAAGATCCTATAAATGAAATTCAAAGTGATTTGCTACGCATGGAAGGGGCAGAGGTTATT
GGGGTCTACCATGGTCTTGTGAATGAGAAGCTTGTTAAATCAGCACATAGGGCAGGAAAGAAGGTTTATGCTTGGACTGTGGATGATATTGAATCCATGCAAAAGATGCTCCTTGTAGGAGTGGATAGCATCATCACAAGTCAGCCTAACTCGCTTCAGAAGATGATGGAATATATTAGAAACCAATGTATGGGTGTTGG
GTTCTAATTGAAAGTGGAAAGTTGAGTCTTGGCCATGCAGCTATTATAGATAGGACATATGAAGCATAAATAGAACATGGCATTTGCGTTCAGTATCTTCTTGTGGAAATCAATGTGAATTACAACTAGTGTGGTTCTAAAATTCTACCTGTCTAGAAGCAAGTTAAGAATGTTTCCAGAGGAGAAAGTGTTTATAACCT
TCAATGTATTTTCTCAGAAAGAACTACTTATTATCATGAAGTTGCTTGTAGCCATTTCCCTTAGAAATTTCTGGAGGAGGAAGTGTCAATTTCCTTCAATATATTGTCTCATAAAGATCTAAATATTGTCGGGAAGATGCTTGGAGTTGTTTATCTCAAGTTTCAACACCTGATTGAAGGTCAAGGCTGTAATGCCCAAG
AAATCCTGTTTTATAGCTAGTTTTGATGCAGGTATGAAAAAG


>TRINITY_DN127297_c3_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TTAGGAGTTTCGTGCAACATAGCCAACTCACATTTCCCCAATGGCCTCTTTGAATGAAAATCCATTTTATAGAAGTTTACAAATACCTGCTTAATCTCTTCCGTCTCTTGCTGCCTAGTTATTTGATCGAGTACATTTGGAGTGCTGAGATTTTCTCGTTGGTATATTCTCCATTATTTAATAATTTATCCAATGAAACT
GGGCTATTAGTTGAGTCCGCCTAGTTCATTTTATGTCCTTGGCCTTCAAAATGTGACGAATTTTGGTAGCTCATGTTTGCTTGTCTTCATTGTAAGGACTAACCAAGAGCATTTGAGAAACATACTCCAACTTATCTTTCACCACTTTATGTCGTTTTTGATGCGTAACTACAATTTGGAGATCGTAGGCTATAGCCACA
AAGGAAGGCTATTGCCCAAGTTGTAGCATCCTCCCACCATGCAATCCACCACTCTTCTTTTATTGGATGTGGCATGGGGTTTCAATTTCTTTTTATAAACTTCTCTGCAACCATTTTCATTATACTAGATACCGACTTTGGTTTATTATAGTAGATAGTAATTGTACTTTGCCTGTTTATATAATGTTTATAACTTGGTT
TCACTGCATGAGTTATGCCATAATTTATCTAAAGAACTTGATTCTAGCTTGAGTGCAGATTAAAGGATTGGATGCAGGCTTTGGATTTGCAAAAGAATTTCAAAATCAGGAAGTGCCTACACTTGATGATGCCTTGAAGTTTGTTTCAGAATCAGTCAAGCATGTTATTGTTGATGTGAAAATTGGCCCCCCTCGTTTTC
AACAAGGACTTGCAGCAGACTTGCTTTCAGTTgtaagtgcatttagtcttatctgtaaattgtggtcttcatttcaattatttattttctattacattgtaacttgtttgcacttttttctgcaatttcttcctgacactgcatgatgctgtttatttgttggaaatttcctttttcagATCAATAAAACTGAATGCAGA
AATTGTATCATATGGGCCAAAGTAGACAATTTGGTGAGAGAATTGAAGCAGCTATCTCATGACATAATGGTAGGATATATTGTTATGAAAGATCCTATAAATGAAATTCAAAGTGATTTGCTACGCATGGAAGGGGCAGAGGTTATTGGGGTCTACCATGGTCTTGTGAATGAGAAGCTTGTTAAATCAGCACATAGGGC
AGGAAAGAAGGTTTATGCTTGGACTGTGGATGATATTGAATCCATGCAAAAGATGCTCCTTGTAGGAGTGGATAGCATCATCACAAGTCAGCCTAACTCGCTTCAGAAGATGATGGAATATATTAGAAACCAATGTATGGGTGTTGGGTTCTAATTGAAAGTGGAAAGTTGAGTCTTGGCCATGCAGCTATTATAGATAG
GACATATGAAGCATAAATAGAACATGGCATTTGCGTTCAGTATCTTCTTGTGGAAATCAATGTGAATTACAACTAGTGTGGTTCTAAAATTCTACCTGTCTAGAAGCAAGTTAAGAATGTTTCCAGAGGAGAAAGTGTTTATAACCTTCAATGTATTTTCTCAGAAAGAACTACTTATTATCATGAAGTTGCTTGTAGCC
ATTTCCCTTAGAAATTTCTGGAGGAGGAAGTGTCAATTTCCTTCAATATATTGTCTCATAAAGATCTAAATATTGTCGGGAAGATGCTTGGAGTTGTTTATCTCAAGTTTCAACACCTGATTGAAGGTCAAGGCTGTAATGCCCAAGAAATCCTGTTTTATAGCTAGTTTTGATGCAGGTATGAAAAAG




Intron 2 GTACCAAATT ... ATTTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A126.671124
A233.331025
A338.46815
A430793
A533.33603
A633.195647
A7251021534
A828.0477730
A931.931131253
A1021.43991127



>TRINITY_DN43375_c0_g1_i6 from sample A9 / Example spliced isoform
GCACTTTGTTCTTTATCCCTTCCGTTATAGGCTTCCTCAGAGGCTTCTTCTTCCTCTTCTTGTCTTTTAAGTCCAGTCTTCATCTTCATCAATCCTTCAAGAGCTTTGGGACAATTTGATGGAGCATTCGGGTAGTTGGCAGTGGAGCAACTGACATTGCAGATTTACCAGGCAATATTCAGATGACGCCGTTGGTTTTG
TTGATGGCCATGCAGAATCCCTCCATGCTCACAAGTCCTCCCCTGCTTATATGTTTTTCCACAAAAATGTTGCCAAAATCTACATAAAAATCATTCTAGAGTATTGCAACGCCATAGAATGCAGGCTGCAAGAAGCTAGACATATTCCTTACTTTATACCAGCGATCGTGGATTGTCCTTGGCTTCCTGGCCAAGTTCAA
CTTTCTTTCAGAATGAAAATGCAAGAAAAAAACCAGTTCACCTGCTAGGCCTCCCATTAATATACATCAATGACGGGCAAAGGTAGTCACTACGGCATACACCACTCGCTATTTCTGGTGTCTGCCATCTGTTGGGAAGATAAATGATTCGACGGCTGGCTCTTTTAAAGACAAAGCATACTATGTGTCGCTGTATGGTG
GAGCATGCAATTGCCATTTTTTTATCCATTCAATATATGTCCTAGCGTTAGATCCATTCTCGCCATCTGTTTACGTTCTATTTACATTATTGATTGATTGCTCATCTGGTTACGAGTTGTTCTGTTTGCCAGTTGTTTATTATATAGATTATCACATAAAAAATATCGAGTTGTTCTGTTTGTCAGTTGTTTAGTATATA
GATTATCGCATAAAAAATATTATTCATTGCTCTTCTAGCTGCAAAGCAAATAAAAAGAAAGCGATCCAACACGTAATCTCC


>TRINITY_DN43375_c0_g1_i7 from sample A9 / Example unspliced isoform:
GCACTTTGTTCTTTATCCCTTCCGTTATAGGCTTCCTCAGAGGCTTCTTCTTCCTCTTCTTGTCTTTTAAGTCCAGTCTTCATCTTCATCAATCCTTCAAGAGCTTTGGGACAATTTGATGGAGCATTCGGGTAGTTGGCAGTGGAGCAACTGACATTGCAGATTTACCAGGCAATATTCAGgtaccaaattcggtttct
actttgtacttgcatatttcgttgcaattgcatttacaataatgatctgcatatatagctcagatataattgatctgtatagaaccgatcgattctatcgatacccggccaacaagaaagacctagggacgttaagaactgaaatcccacagttaatcgaaagcccacagttaccaacagtgagaaattcacctcaagat
ctcccaacagcttagcttcagctttcctggtgttgaataccataatcaaagcaagtatcaaagccagtatagtttctgtttttttgtttctatggattgaacataacataaatgataagactacgcgtagaataaggtccccgacgatgccgtcaaactacaggctccgcttcccttttgtggtcctctcgccttcgtgt
tcccttttaaaggtggtttaccctcttctccttcgtccttgccactaaaagaaacagtctaggtagtgcccatttccttttaataataatatatgccccatgtaataataagattgcatatccatattaaaaatgacaatttaaattaaaccgtagagatgcatgcgagtctcaggagaagccctaaactgagaaacaat
ttaactgaataataagccattgttctgtgttaacctaaccatgcagtaattcttttcaactttcaaagaaatcgaatttaccaacttcttagccattcttttctagtttcttatttgcagcttgcaatgtcttctcacttccgttaaatgaacatctgccctactatatttgttttttttcagagcattaggtcgaataa
tgattagcgtcacaatggaatctgcttatttcaaagtcaaataatgattagcgtcacaatctgtttatttcaaaatcaaacttgatatgtcatgatagaatctacttatttcaaaatcaaaattgatatgtgttcccatatgaacacactgtgctcgcctgcagtttttctcccataaaaatctattagtcaaacaattc
taatattgcatggccatacagtgaatatgaaagtcttttgtgaaatgtaaatatgaaaaccccaacacctgcagtataaagaggaatacaataaatatgaaagtttttgtgcattgtaaatatgaaagccccaacacctgtagtatagagaggaagcaacatgtcaatatgacagattgaagacatatgcaagcattctg
cccatacgtttttgcaaaaaaaaatccagaaactgagtcactgattgcttcttcttccatagcttctctatgtaggtctgtatgcacctgcattccccaaaccaacgcagttaaatatatcacaactaatttcccacagaatttcgatagaacccaacccttctgattttttcagccagggtttgggctttagcaggagt
tctattccaaattataggctcgccccttatcaaataaggggcaagctgactagaacccaccatggaaagaacatggacatttggccttgcaaggtaggacgtagctaaggtcgatagacattaatttatccagtgggttatctctgtttcatctatgaattccaaagggactctattaaatgactctgaaaggacatacg
agacatttatggcaggcaaacccatgtgggtattgcaaggaaatgcagtgacaagcttgactcctgtgtagggttttgcgggggattgagaccatgaaggcatcacaagtaattggctaggctttgcatctctattggtgttggatgttgttgttgatgcagatattttggccttgaggacaatggattgtatcctttga
gagaaatgtttgaagatgatatattagaattgattcaatgagcaatgttcttacttgttgaaaatatatgataatacatttttgcag
ATGACGCCGTTGGTTTTGTTGATGGCCATGCAGAATCCCTCCATGCTCACAAGTCCTCCCCTGCTTATATGTTTTTCCACAAAAATGTTGCCAAAATCTACATAAAAATCATT
CTAGAGTATTGCAACGCCATAGAATGCAGGCTGCAAGAAGCTAGACATATTCCTTACTTTATACCAGCGATCGTGGATTGTCCTTGGCTTCCTGGCCAAGTTCAACTTTCTTTCAGAATGAAAATGCAAGAAAAAAACCAGTTCACCTGCTAGGCCTCCCATTAATATACATCAATGACGGGCAAAGGTAGTCACTACGG
CATACACCACTCGCTATTTCTGGTGTCTGCCATCTGTTGGGAAGATAAATGATTCGACGGCTGGCTCTTTTAAAGACAAAGCATACTATGTGTCGCTGTATGGTGGAGCATGCAATTGCCATTTTTTTATCCATTCAATATATGTCCTAGCGTTAGATCCATTCTCGCCATCTGTTTACGTTCTATTTACATTATTGATT
GATTGCTCATCTGGTTACGAGTTGTTCTGTTTGCCAGTTGTTTATTATATAGATTATCACATAAAAAATATCGAGTTGTTCTGTTTGTCAGTTGTTTAGTATATAGATTATCGCATAAAAAATATTATTCATTGCTCTTCTAGCTGCAAAGCAAATAAAAAGAAAGCGATCCAACACGTAATCTCC




Intron 3 GTATTCTATT ... ATTGCTGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A15.3124.46.11.5
A226.222108.5
A314.912394.3
A427.5416.82.96.4
A532.557.633.8
A611.9250.31.37.6
A715.1344.66.19
A813.5234.33.15.6
A97.1433.80.93
A107.952612.6



>TRINITY_DN120084_c2_g1_i6 from sample A3 / Example spliced isoform
CCATAAACTAGGGTTTTTTAGATTTCCTTTGGGTCCCAATCTGTTCATGGGCCCTTGGAGGTTTCCGAGAAGCTTCTGAGTTTATGCAAGTTTCTGGTACCGGTACGTGAGCACTTTAGGAGTTTCGTGCAACATAGCCAACTCACATTTCCCCAATGGCCTCTTTGAATGAAAATCCATTTTATAGAAGTTTACAAATA
CCTGCTTAATCTCTTCCGTCTCTTGCTGCCTAGTTATTTGATCGAGTACATTTGGAGTGCTGAGATTTTCTCGTTGGTATATTCTCCATTATTTAATAATTTATCCAATGAAACTGGGCTATTAGTTGAGTCCGCCTAGTTCATTTTATGTCCTTGGCCTTCAAAATGTGACGAATTTTGGTAGCTCGTGTTTGCTTGTC
TTCATTGTAAGGACTAACCAAGAGCATTTGAGAAACATACTCCAACTTATCTTTCACCGCTTTATGTCGTTTTTGATGCGTAACTACAATTTGGAGATCGTAGGCTATAGCCACAAAGGAAGGCTATTGCCCAAGTTGTAGCATCCTCCCACCATGCAATCCACCACTCTTCTTTTATTGGATGTGGCATGGGGTTTCAA
TTTCTTTTCATAAACTTCTCTGCAACCATTTTCATTATACTAGATACCGACTTTGGTTTATTATAGTAGATAGTAATTGTACTTTGCCTGTTTATATAATGTTTATAACTTGGTTTCACTGCATGAGTTATGCCATAATTTATCTAAAGAACTTGATTCTAGCTTGAGTGCAGATTAAAGGATTGGATGCAGGCTTTGGA
TTTGCAAAAGAATTTCAAAATCAGGAAGTGCCTACACTTGATGATGCCTTGAAGTTTGTTTCAGAATCAGTCAAGCATGTTATTGTTGATGTGAAAATTGGCCCCCCTCGTTTTCAACAAGGACTTGCAGCAGACTTGCTTTCAGTTATCAATAAAACTGAATGCAGAAATTGTATCATATGGGCTAAAGTAGACAATTT
GGTGAGAGAATTGAAGCAGCTATCTCATGACATAATGGTAGGATATATTGTTATGAAAGATCCTATAAATGAAATTCAAAGTGATTTGCTACGCATGGAAGGGGCAGAGGTTATTGGGGTCTACCATGGTCTTGTGAATGAGAAGCTTGTTAAGTCAGCACATAGGGCAGGAAAGAAGGTTTATGCTTGGACTGTGGATG
ATATTGAATCCATGCAAAAGATGCTCCTTGTAGGAGTGGATAGCATCATCACAAGTCAGCCTAACTCGCTTCAGAAGATGATGGAATATATTAGAAACCAATGTATGGGTGTTGGGTTCTAATTGAAAGTGGAAAGTTGAGTCTTGGCCATGCAGCTATTATAGATAGGACATATGAAGCATAAATAGAACATGGCATTT
GCGTTCAGTATCTTCTTGTGGAAATCAATGTGAATTACAACTAGTGTGGTTCTAAAATTCTACCTGTCTAGAAGCAAGTTGAGAATGTTTCCAGAGGAGAAAGTGTTTATAACCTTCAATGTATTTTCTCAGAAAGAACTACTTATTATCATGAAGTTGCTTGTAGCCATTTCCCTTAGAAATTTCTGGAGGAGGAAGTG
TCAATTTGCTTCAATATATTGTCTCATAAAGATCTAAATATTGTTGGGAAGATGCTTGGAGTTGTTTATCTCAAGTTTCAACACCTGATTGAAGGTCAAGGCTGTAATGCCCAAGAAATCCTGTTTTATAGCTAGTTTTGATGCAGCTATGAAAAAGGAACCATTTATTTAATACCAG


>TRINITY_DN120084_c2_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CCATAAACTAGGGTTTTTTAGATTTCCTTTGGGTCCCAATCTGTTCATGGGCCCTTGGAGGTTTCCGAGAAGCTTCTGAGTTTATGCAAGTTTCTGGTACCGGTACGTGAGCACTTTAGGAGTTTCGTGCAACATAGCCAACTCACATTTCCCCAATGGCCTCTTTGAATGAAAATCCATTTTATAGAAGTTTACAAATA
CCTGCTTAATCTCTTCCGTCTCTTGCTGCCTAGTTATTTGATCGAGTACATTTGGAGTGCTGAGATTTTCTCGTTGGTATATTCTCCATTATTTAATAATTTATCCAATGAAACTGGGCTATTAGTTGAGTCCGCCTAGTTCATTTTATGTCCTTGGCCTTCAAAATGTGACGAATTTTGGTAGCTCGTGTTTGCTTGTC
TTCATTGTAAGGACTAACCAAGAGCATTTGAGAAACATACTCCAACTTATCTTTCACCGCTTTATGTCGTTTTTGATGCGTAACTACAATTTGGAGATCGTAGGCTATAGCCACAAAGGAAGGCTATTGCCCAAGTTGTAGCATCCTCCCACCATGCAATCCACCACTCTTCTTTTATTGGATGTGGCATGGGGTTTCAA
TTTCTTTTCATAAACTTCTCTGCAACCATTTTCATTATACTAGATACCGACTTTGGTTTATTATAGTAGATAGTAATTGTACTTTGCCTGTTTATATAATGTTTATAACTTGGTTTCACTGCATGAGTTATGCCATAATTTATCTAAAGAACTTGATTCTAGCTTGAGTGCAGATTAAAGGATTGGATGCAGGCTTTGGA
TTTGCAAAAGAATTTCAAAATCAGGAAGTGCCTACACTTGATGATGCCTTGAAGgtattctattacctttatttctatgctgttgagattacgatatcaggattttaattccagaatcatttcattgctgtagTTTGTTTCAGAATCAGTCAAGCATGTTATTGTTGATGTGAAAATTGGCCCCCCTCGTTTTCAACAAG
GACTTGCAGCAGACTTGCTTTCAGTTGTAAGTGCATTTAGTCTTATCTGTAAATTGTGGTCTTCATTTCAATTATTTATTTTCTATTACATTGTAACTTCTTTGCACTTTTTTCTACAATTTCTTCCTGAC




Intron 4 GTATTTTGAT ... CATTTTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A127.9918.368
A27.6312.302
A313.82544
A49.9718.704
A55.1918.720
A6021.700
A7012.300
A802200
A9010.300
A10014.300



>TRINITY_DN127297_c3_g1_i10 from sample A1 / Example spliced isoform
CTTGCATTGTTATATTGATAGCCTCACCGTCATCCTTCTTTCAAAGTCTTGGTCAAGGGTTTTGACATTTTGCTTACAAAGTCGACAATACTAACAAAATTCACTTGGGACGGAGGTGGGTTACAAATTACTTACAATCTTCGATATGCCGATTTAGAGAATGAATGAAATAGCGATTTTTGTCCACAAATTTAGAACAA
TCTCTCCAAAACTGCACTTCAGGAGAAATGAAATCTTGACTTTTGTGTTGGGGTCAATTGAGTTGGGGGTAATTGTAAATTGAGTTGGGGTAATTGTATTGCTGCAATAAAAACCAAAGTTCGTGACGGGATTGGATGGAGGAAAAGGGTTTAATGGCTAAACCCAAGGCCGTCTCTACACGCTGGTTCGGGAGAAGGAG
GCGCAGGTTCTCGTCCAGGGCATTTGTGCGATTCTTTGCTTTTATAGCTATCATGGCAGTCTTGCCACCGATCTTCTTTCATCTCAGATTGAAGCGACATGAACAGGCACAATCTAGAAAATGTGGTTGGCTACAAAATCCTCCTCTTGTATGTGCCCATGGAGGTGATTCAAGTAGGTCTCCTCCAAATACGATGACAG
CATATCGTCTAGCAATTGGTTCTCAAGTAGATTGTGTAGAAATAGATGCATCTCGTTCTCGTGATGGCGTTCTATTGGCCCTACATGATAGGGCAGGGACTTGCAGAACATAACAGGTGACAACACTTTAAGGGTTGGGGATTTAAGTATGAGTGAGGTACAACTTTATAAGTGGTATGCATGTCCTTATGTGCATGGTT
ATCCTTTCGAAGATGCACCCCTTCGACATGATCATAACACCTTTTGTACTTTATGGCTTGAAGATGTGGAGGACCATTTTAGGGCTTGTTGAATGGGTATGTGTGGAAAGAATTCAAACTATAATGCTCCAATTATGATCCTTGTAAACTAATGATCCCCCAAAATAATGTCCAACCTGAATTTGATACCCATCCTCTTT
ATCTTGAGAGCATATTTTGGTTTATTTCATACCTTTAGTGGCTACAAACCCTTGATGACTTTGCCTTGGGTTAGGAGAGATTCCATATTTGGCTCTTTTCTCTTCTAAGGAGTTTACCTCTTG


>TRINITY_DN127297_c3_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CTTGCATTGTTATATTGATAGCCTCACCGTCATCCTTCTTTCAAAGTCTTGGTCAAGGGTTTTGACATTTTGCTTACAAAGTCGACAATACTAACAAAATTCACTTGGGACGGAGGTGGGTTACAAATTACTTACAATCTTCGATATGCCGATTTAGAGAATGAATGAAATAGCGATTTTTGTCCACAAATTTAGAACAA
TCTCTCCAAAACTGCACTTCAGGAGAAATGAAATCTTGACTTTTGTGTTGGGGTCAATTGAGTTGGGGGTAATTGTAAATTGAGTTGGGGTAATTGTATTGCTGCAATAAAAACCAAAGTTCGTGACGGGATTGGATGGAGGAAAAGGGTTTAATGGCTAAACCCAAGGCCGTCTCTACACGCTGGTTCGGGAGAAGGAG
GCGCAGGTTCTCGTCCAGGGCATTTGTGCGATTCTTTGCTTTTATAGCTATCATGGCAGTCTTGCCACCGATCTTCTTTCATCTCAGATTGAAGCGACATGAACAGATGACAGCATATCGTCTAGCAATTGGTTCTCAAGTAGATTGTGTAGAAATAGATGCATCTCGTTCTCGTGATGGCGTTCTATTGGCCCTACATG
ATAG
gtattttgatttttccctatggcaatgttagtgcactttcacgtgtaaggataagactttgtagcttgatgctcaccatttgcttgccattctttttgcactgtgctgccttgtgttattgttacatttactaaatactttctggagtgacttgattctcacattttacagGGCAGGGACTTGCAGAACATAACAG
GTGACAACACTTTAAGGGTTGGGGATTTAAGTATGAGTGAGGTCAGAATTTCTTGTCTTGGACATTTTGAAAGATACAAGTTTATCTAGGTTTATTTCGTATGGGTTCTAAATAGGTTATAAGCTCTTGATGCTTGTGAACAGGAAGCTATCTTTGACTAATGTCCTTTATTTCACTCAATCTTATTTGAATCTTATAAA
TGTTATATAGGGAAATAAGATGTGGTTTACTAGAACTTGAAAATTTATGTATCACAATAACCTGTTGTGATTAGGAATAATTGCGACTCAGTTTAGATTGTATGTGGAAAGAAATAAATGAAAAAAGTCAGTAATATGTTTTACAATTTAACTATCTGTAGAAAGATTATCATTTCTTGTTGTTTACTGCTTGTGCACAA
TCATTCTTAAACTGCAATGAAGGTTGAATCCCAGTGATGCCTAGAGGTAAACATATATAAGAAAAAATCAATATTTTCATTCTTTATATAATATAATAATACTTTCTGCTCATTGCCCAAGAGCTAACTGTATGAAATGGTCTCTGTGAGGGCAAACAGTTTTAGTCATTGTGAAACTCAAAAATGGATGGTCAGCATAT
CAAGCCATTGATTAAGCAAGTGATATAGGTTTGGTTATGTAATAAACATTTTGTGAAAGAAAGATAGAGTTCATTATTCTATGGGACAAATTTGAGTGTAATAACATTGACATATATGTTGATCCCTAATGGCAAAGTGTTCAATTTCTACTTGAAGCTGGTGAGAAAAAAGTGAAAACACTTGAAAGTTGATGTTCCAT
GAGCACTGAAGTAATACATTGCTCACATTCATATTAGGGGGTAAAACTAAATAGTATTAGCTGTTATGCAAATTTAAATGTTGTGGTAGGAGCATAATTTCCTAGTTTGAGATGGCAGCTTGCAAGGGAATGTCTATGAGATATGCATGTAAGATATGTTGATATTGTCCTTACTAGCCTTAACTATCTAGATGGCTAGA
TTAGGATATAGTTGCTATTCTTTGGATGGCACCATACATTGGACACTAGGATGGAGTTGCACGACAAGTCATTGTTGAAAAAATCGACATCTAGAAAAAATTGGTGGGGGGTTTGGAATACAACTTCTCGGTAACATTGACAAAAAAATCGGCAAGCTGCGGGAAGCATTAAAAATTACAAAATAAATTCATTTTTTTCA
AATTTTTAAACATATAAACCAACAACAACATCAAATAAACACATTGGCACATAAATATAGGAAAACACAAGTATATATGATGTAGTAGATGCCAAATAAAAAATGATACATCAAAGTCAATACAAAATCCTGAACCCTAATAGCTGTCCAACCTAGCATTCAAAAATGGACAACCAATACAAAATGAC




Intron 5 GTTAGAAGCT ... TTATATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A145.7119216
A244.1219415
A3252157
A433.331437
A5351377
A637.3552731
A734.5536819
A843.6431424
A925.4938313
A1027.592108



>TRINITY_DN46105_c1_g1_i5 from sample A7 / Example spliced isoform
ATTGATAGCCTCACCGTCATCCTTCTTTGAAAGTCTTGGTCAAGGGTTTTGACATTTTGCTTACAAAGTCGACAATACTAACAAAATTCACTTGGGACGGAGGTGGGTTACAAATTACTTACAATCTTCGATATGCCGATTTAGAGAATCAATGAAATAGCGATTTTTGTCCACAAATTTAGAACAATCTCTCCAAAACT
GCACTTCAGGAGAAATGAAATCTTGACTTTTGTGTTGGGGTCAATTGAGTTGGGGGTAATTGTAAATTGAGTTGGGGTAATTGTATTGCTGCAATAAAAACCAAAGTTCGTGACGGGATTGGATGGAGGAAAAGGGTTTAATGGCTAAACCCAAGGCCGTCTCTACACGCTGGTTCGGGAGAAGGAGGCGCAGGTTCTCG
TCCAGGGCATTTGTGCGATTCTTTGCTTTTATAGCTATCATGGCAGTCTTGCCACCGATCTTCTTTCATCTCAGATTGAAGCGACATGAACAGGCACAATCTAGAAAATGTGGTTGGCTACAAAATCCTCCTCTTGTATGTGCCCATGGAGGTGATTCAAGTAGGTCTCCTCCAAATACGATTAAACGATTGGATGCAGG
CTTTGGATTTGCAAAAGAATTTCAAAATCAGGAAGTGCCTACACTTGATGATGCCTTGAAGTTTGTTTCAGAATCAGTCAAGCATGTTATTGTTGATGTGAAAATTGGCCCCCCTCGTTTTCAACAAGGACTTGCAGCAGACTTGCTTTCAGTTATCAATAAAACTGAATGCAGAAATTGTATCATATGGGCTAAAGTAG
ACAATTTGGTGAGAGAATTGAAGCAGCTATCTCATGACATAATGGTAGGATATATTGTTATGAAAGATCCTATAAATGAAATTCAAAGTGATTTGCTACGCATGGAAGGGGCAGAGGTTATTGGGGTCTACCATGGTCTTGTGAATGAGAAGCTTGTTAAGTCAGCACATAGGGCAGGAAAGAAGGTTTATGCTTGGACT
GTGGATGATATTGAATCCATGCAAAAGATGCTCCTTGTAGGAGTGGATAGCATCATCACAAGTCAGCCTAACTCGCTTCAGAAGATGATGGAATATATTAGAAACCAATGTATGGGTGTTGGGTTCTAATTGAAAGTGGAAAGTTGAGTCTTGGCCATGCAGCTATTATAGATAGGACATATGAAGCATAAATAGAACAT
GGCATTTGCGTTCAGTATCTTCTTGTGGAAATCAATGTGAATTACAACTAGTGTGGTTCTAAAATTCTACCTGTCTAGAAGCAAGTTAAGAATGTTTCCAGAGGAGAAAGTGTTTATAACCTTCAATGTATTTTCTCAGAAAGAACTACTTATTATCATGAAGTTGCTTGTAGCCATTTCCCTTAGAAATTTCTGGAGGA
GGAAGTGTCAATTTCCTTCAATATATTGTCTCATAAAGATCTAAATATTGTCGGGAAGATGCTTGGAGTTGTTTATCTCAAGTTTCAACACCTGATTGAAGGTCAAGGCTGTAATGCCCAAGAAATCCTGTTTTATAGCTAGTTTTGATGCAGCTATGAAAAAGGAACCATTTATTTACAACCAGTTACTATTTTTCAAT
TTTGAGTACCCCTTTTAGATGTATGTTTTATTGGAATTACATGTAATGTTTGGATGCTTCCCCT


>TRINITY_DN46105_c1_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:
ATTGATAGCCTCACCGTCATCCTTCTTTGAAAGTCTTGGTCAAGGGTTTTGACATTTTGCTTACAAAGTCGACAATACTAACAAAATTCACTTGGGACGGAGGTGGGTTACAAATTACTTACAATCTTCGATATGCCGATTTAGAGAATCAATGAAATAGCGATTTTTGTCCACAAATTTAGAACAATCTCTCCAAAACT
GCACTTCAGGAGAAATGAAATCTTGACTTTTGTGTTGGGGTCAATTGAGTTGGGGGTAATTGTAAATTGAGTTGGGGTAATTGTATTGCTGCAATAAAAACCAAAGTTCGTGACGGGATTGGATGGAGGAAAAGGGTTTAATGGCTAAACCCAAGGCCGTCTCTACACGCTGGTTCGGGAGAAGGAGGCGCAGGTTCTCG
TCCAGGGCATTTGTGCGATTCTTTGCTTTTATAGCTATCATGGCAGTCTTGCCACCGATCTTCTTTCATCTCAGATTGAAGCGACATGAACAGGCACAATCTAGAAAATGTGGTTGGCTACAAAATCCTCCTCTTGTATGTGCCCATGGAGGTGATTCAAGTAGGTCTCCTCCAAATACGATGACAGCATATCGTCTAGC
AATTGGTTCTCAAGTAGATTGTGTAGAAATAGATGCATCTCGTTCTCGTGATGGCGTTCTATTGGCCCTACATGATAGGGCAGGGACTTGCAGAACATAACAGGTGACAACACTTTAAGGGTTGGGGATTTAAGTATGAGTGAGCTTGAGTGCAGATTAAACGATTGGATGCAGGCTTTGGATTTGCAAAAGAATTTCAA
AATCAGGAAGTGCCTACACTTGATGATGCCTTGAAGTTTGTTTCAGAATCAGTCAAGCATGTTATTGTTGATGTGAAAATTGGCCCCCCTCGTTTTCAACAAGGACTTGCAGCAGACTTGCTTTCAGTTATCAATAAAACTGAATGCAGAAATTGTATCATATGGGCTAAAGTAGACAATTTGGTGAGAGAATTGAAGCA
GCTATCTCATGACATAATGgttagaagctgaatattttttaaaatgtctgcttttctgctcaaaattctcttttttctaggagtattgtatttcttccttatgtcagcagttcacatgttaaaatgtaaccccacaaatctcaatgtgggtacataaaggcccttgaatggaaagttatttaatgacacattcagatgaa
tgaaaatttcattgacacgtgatagttatcaacctgctaatttaccctagttactacttgactattagctacaactgttattctcatagaacattctaaagagcaagcaggtatatgttatcttgcaattcaaatctaccgccattcatatcttgcaggcctcaaggattcgattggtttccctcggtgggaggtccatg
ggaggcctgatgtgtcataattccatgatttgaaatatgctgaagataattggttactagttgactcgatctgacagagcaacatgaaattattaggtgatcctcttggtggtcacatggtaaggtggggcatgcaagaactgagatctatggttgagtatctccctgatgaagagggctaggcatctctgattaggata
tgggaataaactggagagtctgctccttgagtccctatagaggcagtagtagtatcctctgatctcatagtaagaggggcatctgaaaatgaggtatatttctgtgcttggctcttgtaagtggcacatttgatagatcctgtctggctgtgggatatggtggtcgtttccacttggagctgacctagagggatgctgat
tgagtgcattcagtgtctctgtgtgtatggggtatggatgatgacgccaccccgcaactccaagaagtgctctagatagaaagacatcttggagcccagactcttcagtgatgaggtccaggtaacatggatgtacaatctgtaggtgtcatctctaatgacttgattcagttcttgtctagttggcaagagatggcttg
gcaaatctagaatgtacttaaggagggaagatgctctgcagaaatggttataaactggagaagctgagaggcctctaaatatcaaccttgtgcatgtcctgtgtgggatctgaggggagggtgtcagaggaagaagagtgttagttaggggtacctttctctctttgaggcagagtccccaaggtctggactctatgtag
gaaagggaccaaatgaaacaaaacaaaatgaacgataaccccctggattcctgtaagatgatatgagaaatgactttcctttgaaatttgtattatcgtaaaaaaatgttggttattttataagtaatgtatacaaattgacaaataacttgttaaaatccatgtttatacgatttaagcaattttcaaatttggtcaac
aaatgtcaaactcaatttacccaaaaggctgattttgttaagaaaattttactaggccactggcttcaaattgagctcgaatagtttttggatcaggactcttgttatgaaattggatttgttagtctgtacaaggtatttcagttatcatatgttttaaggaaattggattatttatcatccataattcttatcaactc
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GTAGGATATATTGTTATGAAAGATCCTA
TAAATGAAATTCAAAGTGATTTGCTACGCATGGAAGGGGCAGAGGTTATTGGGGTCTACCATGGTCTTGTGAATGAGAAGCTTGTTAAGTCAGCACATAGGGCAGGAAAGAAGGTTTATGCTTGGACTGTGGATGATATTGAATCCATGCAAAAGATGCTCCTTGTAGGAGTGGATAGCATCATCACAAGTCAGCCTAAC
TCGCTTCAGAAGATGATGGAATATATTAGAAACCAATGTATGGGTGTTGGGTTCTAATTGAAAGTGGAAAGTTGAGTCTTGGCCATGCAGCTATTATAGATAGGACATATGAAGCATAAATAGAACATGGCATTTGCGTTCAGTATCTTCTTGTGGAAATCAATGTGAATTACAACTAGTGTGGTTCTAAAATTCTACCT
GTCTAGAAGCAAGTTAAGAATGTTTCCAGAGGAGAAAGTGTTTATAACCTTCAATGTATTTTCTCAGAAAGAACTACTTATTATCATGAAGTTGCTTGTAGCCATTTCCCTTAGAAATTTCTGGAGGAGGAAGTGTCAATTTCCTTCAATATATTGTCTCATAAAGATCTAAATATTGTCGGGAAGATGCTTGGAGTTGT
TTATCTCAAGTTTCAACACCTGATTGAAGGTCAAGGCTGTAATGCCCAAGAAATCCTGTTTTATAGCTAGTTTTGATGCAGCTATGAAAAAGGAACCATTTATTTACAACCAGTTACTATTTTTCAATTTTGAGTACCCCTTTTAGATGTATGTTTTATTGGAATTACATGTAATGTTTGGATGCTTCCCCT




Intron 6 GTACCAAATT ... TCCTGTGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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>TRINITY_DN43375_c0_g1_i4 from sample A9 / Example spliced isoform
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GACCATGAAGGCATCACAAGTAATTGGCTAGGCTTTGCATCTCTATTGGTGTTGGATGTTGTTGTTGATGCAGATATTTTGGCCTTGAGGACAATGGATTGTATCCTTTGAGAGAAATGTTTGAAGATGATATATTAGAATTGATTCAATGAGCAATGTTCTTACTTGTTGAAAATATATGATAATACATTTTTGCAGAT
GACGCCGTTGGTTTTGTTGATGGCCATGCAGAATCCCTCCATGCTCACAAGTCCTCCCCTGCTTATATGTTTTTCCACAAAAATGTTGCCAAAATCTACATAAAAATCATTCTAGAGTATTGCAACGCCATAGAATGCAGGCTGCAAGAAGCTAGACATATTCCTTACTTTATACCAGCGATCGTGGATTGTCCTTGGCT
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AGTTGTTTAGTATATAGATTATCGCATAAAAAATATTATTCATTGCTCTTCTAGCTGCAAAGCAAATAAAAAGAAAGCGATCCAACACGTAATCTCC


>TRINITY_DN43375_c0_g1_i7 from sample A9 / Example unspliced isoform:
GCACTTTGTTCTTTATCCCTTCCGTTATAGGCTTCCTCAGAGGCTTCTTCTTCCTCTTCTTGTCTTTTAAGTCCAGTCTTCATCTTCATCAATCCTTCAAGAGCTTTGGGACAATTTGATGGAGCATTCGGGTAGTTGGCAGTGGAGCAACTGACATTGCAGATTTACCAGGCAATATTCAGgtaccaaattcggtttct
actttgtacttgcatatttcgttgcaattgcatttacaataatgatctgcatatatagctcagatataattgatctgtatagaaccgatcgattctatcgatacccggccaacaagaaagacctagggacgttaagaactgaaatcccacagttaatcgaaagcccacagttaccaacagtgagaaattcacctcaagat
ctcccaacagcttagcttcagctttcctggtgttgaataccataatcaaagcaagtatcaaagccagtatagtttctgtttttttgtttctatggattgaacataacataaatgataagactacgcgtagaataaggtccccgacgatgccgtcaaactacaggctccgcttcccttttgtggtcctctcgccttcgtgt
tcccttttaaaggtggtttaccctcttctccttcgtccttgccactaaaagaaacagtctaggtagtgcccatttccttttaataataatatatgccccatgtaataataagattgcatatccatattaaaaatgacaatttaaattaaaccgtagagatgcatgcgagtctcaggagaagccctaaactgagaaacaat
ttaactgaataataagccattgttctgtgttaacctaaccatgcagtaattcttttcaactttcaaagaaatcgaatttaccaacttcttagccattcttttctagtttcttatttgcagcttgcaatgtcttctcacttccgttaaatgaacatctgccctactatatttgttttttttcagagcattaggtcgaataa
tgattagcgtcacaatggaatctgcttatttcaaagtcaaataatgattagcgtcacaatctgtttatttcaaaatcaaacttgatatgtcatgatagaatctacttatttcaaaatcaaaattgatatgtgttcccatatgaacacactgtgctcgcctgcagtttttctcccataaaaatctattagtcaaacaattc
taatattgcatggccatacagtgaatatgaaagtcttttgtgaaatgtaaatatgaaaaccccaacacctgcagtataaagaggaatacaataaatatgaaagtttttgtgcattgtaaatatgaaagccccaacacctgtagtatagagaggaagcaacatgtcaatatgacagattgaagacatatgcaagcattctg
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tctattccaaattataggctcgccccttatcaaataaggggcaagctgactagaacccaccatggaaagaacatggacatttggccttgcaaggtaggacgtagctaaggtcgatagacattaatttatccagtgggttatctctgtttcatctatgaattccaaagggactctattaaatgactctgaaaggacatacg
agacatttatggcaggcaaacccatgtgggtattgcaaggaaatgcagtgacaagcttgactcctgtgtag
GGTTTTGCGGGGGATTGAGACCATGAAGGCATCACAAGTAATTGGCTAGGCTTTGCATCTCTATTGGTGTTGGATGTTGTTGTTGATGCAGATATTTTGGCCTTGAGGACAATGGATTGTATCCTTTGA
GAGAAATGTTTGAAGATGATATATTAGAATTGATTCAATGAGCAATGTTCTTACTTGTTGAAAATATATGATAATACATTTTTGCAGATGACGCCGTTGGTTTTGTTGATGGCCATGCAGAATCCCTCCATGCTCACAAGTCCTCCCCTGCTTATATGTTTTTCCACAAAAATGTTGCCAAAATCTACATAAAAATCATT
CTAGAGTATTGCAACGCCATAGAATGCAGGCTGCAAGAAGCTAGACATATTCCTTACTTTATACCAGCGATCGTGGATTGTCCTTGGCTTCCTGGCCAAGTTCAACTTTCTTTCAGAATGAAAATGCAAGAAAAAAACCAGTTCACCTGCTAGGCCTCCCATTAATATACATCAATGACGGGCAAAGGTAGTCACTACGG
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