sp|Q3E6P4|FB95_ARATH ----> F-box protein At2g02240

Intron 1 GTAGGCCAAC ... TTGCCTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	36.44	54.5	38	24.5
A2	31.45	23	8	13
A3	36.2	56	27.5	36
A4	31.42	34	18	13
A5	17.89	19.5	3.5	5
A6	26.17	148	50.5	54
A7	28.48	162	61	68
A8	32.96	150.5	76	72
A9	19.38	172	39	43.5
A10	25.42	150.5	45.5	57

>TRINITY_DN42638_c0_g2_i5 from sample A6 / Example spliced isoform

CAAAAGATGAAGATGAGACAATCTCAAGGATGAATATAATTATGAATATAATTAAAGATTAGAACATGCCTGAATATTCATTAAGTCTTTATGAAGACAAAAGATGAAGATGAGACAATCCCCATGAAAATAACTGAAGACGAGAACATGGCTTAATATTCATTAAGTCTTAGGGAAAGACAAAGTTTGCAATATGTAGA
GATATGATACATATGGTAGAGAATTCGTTTCTCCAGTGTTTGAAATAAATGAACTACTGAAGCTTGTTAGTAAACAGATAGAGTGCTGGTAGCAAGTATCCCAGTATGTTAGAGAGGTAGCAGTGAAAACTATCAGTTTGTTAGATAGGTGTCAATTGACCATTGTAGATGTAACAGATCAAATTCCAGTTGTCTGTAAT
ACTATTTATGCATGTATATTCCTGTTCATTTGAATGGAGAAGTTTCCTTCCATTAGAAGAGTGCACTGCCGTTGTGTTTAGCACTGTTATACACATAAATAACAGCTCCGCATATAAGCTTTGGTGTAGTCAGTTTTTTGTTCTGGTTGGGCCCTAACCACATATCTCTTATCCATTGGCTGGCTTCAGTCTATTGAGAG
TGTGGATTATTGACCTCTGTTTGGACTTAACCATTAAATGGAACCCAGACTTGTGGTTGGAACTAACCATTAGATGGAACCCAGAAATCATTCGTTGACAAAACTGTAATTGTCTTGATTTGTTTAGTCGGTCAACGATGATGTATCTTGGGAAGCTTGCTGTACAATTTATACAATGTTGTCAATGGATCTGCTACGGT
CCTTTATAACAAAAACATTATCTTTAGATATAAACAAACTACCAAAGTATCGTCTGATCAAGTGAACGGTTTCCCTCGAGAGAAGGCTGCAGCTATAGACTTGGGTGAACTGCAACTAGATCTCAATTTTAGATGAAGCTAATCTAGCTACAGAGTTCTAAGTTTTGTGTTAGAAATTCAGTTTGTATTGATTTACGTGC
ATACAACATTACATGGCGCCAACACCATGGTTTGATGTATTTGATTAGGCAAATAGTAGCCTGAATTACCCAGTGTTCATTGCTTACCTTCTTTATTTTGTGGTTGGTTACTTTAGTCCCCATTCAGCGTATCTTAGTTTCCTCTTAACTGAATGTTGATATTTGGCACTAATTACTTGTATGCTTTTTTTACCGTTCCA
GAAGTTCTGGATAGAGCGAGCCACAGGTAAATTGTGCTTTATGTTGTCTGCAAGAGATTTAGATATAACATGGGGAGATGATAATCGGTATTGGCATTGGATTTCTCAGGGTGACTCCAGTTTCGAGGATATAGCTGAACTAGTCGCAGTATGTTGGCTTGAAGTGAAAGGTCAATTTGACTGCAAGTTTTTGTCTCCTG
GTACTGCATATACCGTTTCATTCAGGCTCAAACTCCATGAACCAACCCATGGCATTTATCATATCGTTGATAGAGCTTTTATGCCCGTCTTTTATGAAGCATATGGATGGAATTGCAAGCCAGTCAAATTCTCAGTTACAACTCCTTCTGGTGACCACGAGATATTTGCTCGGTATTTGAGTGACACAGATATACCTGTT
GAAAATGAAGGGTACCAGATGACTCCCTATAGACACGTAGAGGAGGGTTGGATGGAGTTTGATGTAGGAAGATTTGTTGTGGAAGAAGAGGGGGATAATCCAGGAAAAATAGAGTTCTGCATGAGAGAATGGGAAGGTGGGAATTGGAAAGGTGGGCTTCTTTTAGAAGGGGTGAAGATCCAACCCACTTCTTTGGGCAG
TGAAAGAACAGAATGATATAATCTGGTTGTATTTTATCATCAATAATTTTAATAATTTGTTTCCATGGATAAAACCTTATCAGCAATATTTTGGGTAATTTGGAAAATGGAGTATTTCGCTTTGTCACTCAGC

>TRINITY_DN42638_c0_g2_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CAAAAGATGAAGATGAGACAATCTCAAGGATGAATATAATTATGAATATAATTAAAGATTAGAACATGCCTGAATATTCATTAAGTCTTTATGAAGACAAAAGATGAAGATGAGACAATCCCCATGAAAATAACTGAAGACGAGAACATGGCTTAATATTCATTAAGTCTTAGGGAAAGACAAAGTTTGCAATATGTAGA
GATATGATACATATGGTAGAGAATTCGTTTCTCCAGTGTTTGAAATAAATGAACTACTGAAGCTTGTTAGTAAACAGATAGAGTGCTGGTAGCAAGTATCCCAGTATGTTAGAGAGGTAGCAGTGAAAACTATCAGTTTGTTAGATAGGTGTCAATTGACCATTGTAGATGTAACAGATCAAATTCCAGTTGTCTGTAAT
ACTATTTATGCATGTATATTCCTGTTCATTTGAATGGAGAAGTTTCCTTCCATTAGAAGAGTGCACTGCCGTTGTGTTTAGCACTGTTATACACATAAATAACAGCTCCGCATATAAGCTTTGGTGTAGTCAGTTTTTTGTTCTGGTTGGGCCCTAACCACATATCTCTTATCCATTGGCTGGCTTCAGTCTATTGAGAG
TGTGGATTATTGACCTCTGTTTGGACTTAACCATTAAATGGAACCCAGACTTGTGGTTGGAACTAACCATTAGATGGAACCCAGAAATCATTCGTTGACAAAACTGTAATTGTCTTGATTTGTTTAGTCGGTCAACGATGATGTATCTTGGGAAGCTTGCTGTACAATTTATACAATGTTGTCAATGGATCTGCTACGGT
CCTTTATAACAAAAACATTATCTTTAGATATAAACAAACTACCAAAGTATCGTCTGATCAAGTGAACGGTTTCCCTCGAGAGAAGGCTGCAGCTATAGACTTGGGTGAACTGCAACTAGATCTCAATTTTAGATGAAGCTAATCTAGCTACAGAGTTCTAAGTTTTGTGTTAGAAATTCAGTTTGTATTGATTTACGTGC
ATACAACATTACATGGCGCCAACACCATGGTTTGATGTATTTGATTAGGCAAATAGTAGCCTGAATTACCCAGTGTTCATTGCTTACCTTCTTTATTTTGTGGTTGGTTACTTTAGTCCCCATTCAGCGTATCTTAGTTTCCTCTTAACTGAATGTTGATATTTGGCACTAATTACTTGTATGCTTTTTTTACCGTTCCA
GAAGTTCTGGATAGAGCGAGCCACAGGTAAATTGTGCTTTATGTTGTCTGCAAGAGATTTAGATATAACATGGGGAGATGATAATCGGTATTGGCATTGGATTTCTCAGGGTGACTCCAGgtaggccaacactctattctttcattttttttctttttgatgtaagtaaagaaaaactaacagcacagttttgacttttg
cctacagTTTCGAGGATATAGCTGAACTAGTCGCAGTATGTTGGCTTGAAGTGAAAGGTCAATTTGACTGCAAGTTTTTGTCTCCTGGTACTGCATATACCGTTTCATTCAGGCTCAAACTCCATGAACCAACCCATGGCATTTATCATATCGTTGATAGAGCTTTTATGCCCGTCTTTTATGAAGCATATGGATGGAAT
TGCAAGCCAGTCAAATTCTCAGTTACAACTCCTTCTGGTGACCACGAGATATTTGCTCGGTATTTGAGTGACACAGATATACCTGTTGAAAATGAAGGGTACCAGATGACTCCCTATAGACACGTAGAGGAGGGTTGGATGGAGTTTGATGTAGGAAGATTTGTTGTGGAAGAAGAGGGGGATAATCCAGGAAAAATAGA
GTTCTGCATGAGAGAATGGGAAGGTGGGAATTGGAAAGGTGGGCTTCTTTTAGAAGGGGTGAAGATCCAACCCACTTCTTTGGGCAGTGAAAGAACAGAATGATATAATCTGGTTGTATTTTATCATCAATAATTTTAATAATTTGTTTCCATGGATAAAACCTTATCAGCAATATTTTGGGTAATTTGGAAAATGGAGT
ATTTCGCTTTGTCACTCAGC

Intron 2 GTAACCCAAC ... TTGACTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	25.29	97	32.8	25.8
A2	20.65	78	20.3	20.8
A3	23.36	117	35.7	35.8
A4	28.22	75	29.5	31.3
A5	19.04	51	12	17.8
A6	15.86	704.2	132.8	313.7
A7	18.85	424	98.5	171.3
A8	18.27	308	68.8	112.8
A9	13.58	373	58.7	173.3
A10	14.51	371	63	151.2

>TRINITY_DN116505_c1_g3_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

CAAATTTAAATTATGTACTGACTGTATAGATTCAAAATTTCCAGGGTGTTAGGTTGAACCTTGGATCTGATTTTCACATCCTCCTGAAGAATTCTCCTAAAAGAAGAGGTATTTCTCGCTCAACCGGCGAGACTGAAAACGAGGCAAAACCCATTTAGGTTGAATTCATTCAGTCAACTGGAAAACCCTCTCAACCGCCT
CTGTTTCCGGCGGTGGAACTAGAAAAGGAAGACCCTTGGAGGAGTAGGCAGTGAATCAGAGTCGGGAACAGATCAGGTAAGGAAAGAACCGATTACAACGAGAGTAATGCTATAAATCGGATTTTGGTGAGTGGGTTGGTTTAATACCGTCCATTGGTAAGAAACTACCCTTGTTTCCTGTTCTTGATCTTGGCAATATC
TTGGGAGATGGAGAAGAATCAGAAAGAGATGTTGAGGGATTTGCCAGAGAGCTGCATATCGCATATACTGAGCTTCACCACACCCAGAGATGTTTGCAGGCTCAGCACCGTCAGCCAGACATTCAGATTGGCCGGGAATTCGGACTCGGTCTGGGAGAAGATGCTTCCAGATCAGTATCGCCATCTTCTTGAAAGGCTCG
ATTCTCCTTTGCAATTCTCTTCCAAGAGGGAATTATATTTCAGTCTCTGTCATCCCAAATTCATTGACGGCAGAACCAAGATGTTTTGGATAGAGCGAGCCACAGGCAAACTGTGCTTTATCTTGTCCCCAAGAGATTTACATATAACATGGGGAGATGATAATCGTTATTGGCACTGGATTTCTCGGGATGACTCCAGT
TTCAAGGAGATAGCCGAACTAGTTACAGTATGTTGGCTTGAAGTGCAAGGTCAATTTGACTGCAAGCTTTTGTCTCCTGGTGCGGCATATACCATCTCATTCAGGCTCAAACTCAATGAATCACGCCGTGGTATTACTCGGAACTTTGGACATAGAGCTATGGTTCCCCCCTGGCCTCGACCATATGGATGGAATCATAA
GCCAGTCAAATTCTCAGTTACAACTCCTGGTGGTGATCACCAGATATGTGCTCGGTATTTGAGTGACACAGATAAACCTGTTGAAAATGATGAGTACCAGATGACTCCCTTTAGACATGTAGAAGAGGGTTGGATGGAGTTTGAAGCAGGCAGATTTGTTGTGGAAGAAGAGGGGGATAATCCAGGAAAGATAGAGTTCT
GCATGAGAGAATGGGAAGGTGGGAATTGGAAAGGCGGACTTCTTTTAGATGGGATTAAGATTCAACCTACTTCACTGTTCAAGGAATGAACAAAATGATATAAATTTGGTTGTACTTCATCATTAAGAACTTTCGTAATTAGTAATTTGTATAGCAGTCTTGTTATATGCATAGGGAAATTCCTATCATCAGCATTTTGG
GTAATTTAGAAACGAACAGTTTCAATGTAATATTTAGATTTCTCATTTCACTATGTTCAACTTTATGCATCTTTACTCGATTAGAGGAGTAAATTCAGTGTACAGAAATTACTATAATTTTTTGTGTCATTTCACTATGTTAAACTCCATGTATTTTTCTCTAGTACATTCAATGTACAAAAGGCTAAGACAAAATTTCT
CCCG

>TRINITY_DN116505_c1_g3_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GTTTATGCCATCTAACTTCCAACCTCTATTTTATGTTGTATTGAATATTCTAATTTCTTGTGTGTTTGAATATCATTGATGTAGTGACTAGTTGTGTCAATCTTTTGTTAATGTGCCACTTTCTAAAAATATTGGATTGTTAATGTGCCACTTTCTAAAAATATTGGATTTTTTTCTCTATATTTTGTTTATATATATAT
ATCCCCGTGTTCTGTTATAAGGGTCTACATGTATCCTTGTGTCTTGCGTGTCCCTTGTCCTAGTGTCATGTGAGTCAGCAGATCAATGTCATTTGAAAGTGAAATGGTTTACCTGAAGATAAGGCTACAACTATAAACTTGGATGAGGTCCTCTCCTAGATCTCAACTTCCAATGAAGTTGGTTCGGGCTCAGAGTTCTA
AGTTTGGTCAGCGATTCAGTTTATAATGATTTACGCAAATACGGCATTACAGAGGGCCCATCATTGTGGTTTGATGTATTTGATTTAACAAATATTACCCTCAATCATGCAGCGTTCATTGCTTACCGTGCTCCTCCATTTTGTGGTTCACTAGTTTAGTTGCCATTCAGAATATCTTAGTTTCCTCATCATAGCTGAAT
GTTTATGTTTGGCACTATTGACCTGAATGTTTCTTGACAATTTTAGATGTTTTGGATAGAGCGAGCCACAGGCAAACTGTGCTTTATCTTGTCCCCAAGAGATTTACATATAACATGGGGAGATGATAATCGTTATTGGCACTGGATTTCTCGGGATGACTCCAGgtaacccaactcttttctttcaagtttctgttaat
actaacaggaagacaagctaattgactgttgactgcagTTTCAAGGAGATAGCCGAACTAGTTACAGTATGTTGGCTTGAAGTGCAAGGTCAATTTGACTGCAAGCTTTTGTCTCCTGGTGCGGCATATACCATCTCATTCAGGCTCAAACTCAATGAATCACGCCGTGGTATTACTCGGAACTTTGGACATAGAGCTAT
GGTTCCCCCCTGGCCTCGACCATATGGATGGAATCATAAGCCAGTCAAATTCTCAGTTACAACTCCTGGTGGTGATCACCAGATATGTGCTCGGTATTTGAGTGACACAGATAAACCTGTTGAAAATGATGAGTACCAGATGACTCCCTTTAGACATGTAGAAGAGGGTTGGATGGAGTTTGAAGCAGGCAGATTTGTTG
TGGAAGAAGAGGGGGATAATCCAGGAAAGATAGAGTTCTGCATGAGAGAATGGGAAGGTGGGAATTGGAAAGGCGGACTTCTTTTAGATGGGATTAAGATTCAACCTACTTCACTGTTCAAGGAATGAACAAAATGATATAAATTTGGTTGTACTTCATCATTAAGAACTTTCGTAATTAGTAATTTGTATAGCAGTCTT
GTTATATGCATAGGGAAATTCCTATCATCAGCATTTTGGGTAATTTAGAAACGAACAGTTTCAATGTAATATTTAGATTTCTCATTTCACTATGTTCAACTTTATGCATCTTTACTCGATTAGAGGAGTAAATTCAGTGTACAGAAATTACTATAATTTTTTGTGTCATTTCACTATGTTAAACTCCATGTATTTTTCTC
TAGTACATTCAATGTACAAAAGGCTAAGACAAAATTTCTCCCG