sp|O82175|SUVH5_ARATH ----> Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH5

Intron 1 GTATGGTCAT ... CTTTGGCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	69.05	13	24	34
A2	51.72	14	16	14
A3	66.67	7	5	23
A4	52.94	12	14	13
A5	57.14	3	0	8
A6	52	18	23	16
A7	50	33	26	40
A8	54.29	48	29	85
A9	51.58	23	19	30
A10	44.19	36	25	32

>TRINITY_DN44027_c1_g1_i5 from sample A7 / Example spliced isoform

AAGAAATTGTCACGTTTCAGATAGGTTTGTGACGGTCCAAGAAGTCTTCTTCCACTGCGGCCGCATCTAGATCTGCGACTACCTTCTTCAATGGAACCCCAGATTGCCAGAGCAATGGCCCAAATGACAATGGATGCCAAGATTCATGCAGACTTTCAAGCATCTAGGAACCATTTCAATTATAGGAAATCCATAGTTGA
TAACATAGATTTGGAGATAGTTCCATTAGTTACGGATTTGGATTTGGAGATTGTTCCATTAGTTACAACAAAGGAGCAAGCTGCTTCAGCCATTTGGGTGCACAGTTGCAGTAAATGAGAAGACTTTTGGAGTGATTGCTTCCAGTGAAAATTCCCCAGATGTCCATCAAGTGTTAGCTCATGCAGTTCCTAGTGTGGAG
GACCATCAGTTCTCTGTATTGGCAGTGATGCAAGGACCTTGCATTTTTCTCCGTTTCAAGTGAATGTCCTCGTTGTTGATTTTTGCTTGTCGGCTTCCGTCAGGGCAAGTAATTTGTCTTTGTATCTTGCTCGCGGGCTCAGGTGAAGGTCCTATGTACGTTGGTTTTTGTTAAACCTTTCTTGGTTCCTTTCTTGTAGA
GGCTCGGGTAATGGTTCTCCGTATTAGTAATCGCACGAAACTTGTCTCTACTCTTTGCTCATAGAATCTCAAGTGAATGTACTTGTTAGTTTTTACTTGCCGGCTTTCGTCAGGGAAAGCAATATGTCTTCGATTCTTGCTCGTAGGCTCAGGTGAAGGTCTTCTATGTTGGTTGCTGTTAGGGTTTATCTTTTTGGGGG
TTGTTTTTCACAAGGGGTCAGGTGAAGCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAACACTAGCCGAATCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAAAACTGGCCCAAGTCTTTGCTCATAGAGTCTCAAGTGAAGGTCCTCGTTGACTTCTCTTAGGGTTTGATTAACTTGTATCGACTTCTTTCTTGCAAAGGCCTGTGCGAAG
GTCCTTCTCTTAGAATATTCTCCTCTATCTCGCATTGTTTTCCTCCCTTCTATCTCTCATTGTTTTCCTTGCATCATTGTTTTTCCTTTGAAAAATCTCACAAACACCAAAAATAGATATTTCGTCTCTAGAGCCTGCTTGCTATGCACCCAAACAGATTGAAATGTGGATTTGAATGCCAACAAACTAGACTGAGAGAG
ATTTTTTGAGAGACGCACTATGCAAATTCCAGATGTCAGAGGCATGCACTCAAGGATGCAAATACAGAGTGTGAGCATCTGATTGCAGATGATGAATTTATTCAGATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTTGTAAAATAGATCGAGCATTAAATTGTATGGGCAATCCACTAATTCCTTTTCACATATTTGTCAA
TTAAACTTGGTGAATTGATATGCTTTTTTATCAGTAGTTTACCAAACAGAATTTTCATTCTTTCTTTATTCCGACACTTTGGCCAGGATGCAAATACAAAATACTCATATATATGACTCCTAATAAAATAGATCGAGCATTAAATTGTATGGGCAATCCACTAATTCCTTTTCACATATTTGTCAAAGGAAACTTTGGTG
AATTGATATGCTTTTTTATCAGTAGTTTACCAAA

>TRINITY_DN44027_c1_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:

AAGAAATTGTCACGTTTCAGATAGGTTTGTGACGGTCCAAGAAGTCTTCTTCCACTGCGGCCGCATCTAGATCTGCGACTACCTTCTTCAATGGAACCCCAGATTGCCAGAGCAATGGCCCAAATGACAATGGATGCCAAGATTCATGCAGACTTTCAAGCATCTAGGAACCATTTCAATTATAGGAAATCCATAGTTGA
TAACATAGATTTGGAGATAGTTCCATTAGTTACGGATTTGGATTTGGAGATTGTTCCATTAGTTACAACAAAGGAGCAAGCTGCTTCAGCCATTTGGGTGCACAGTTGCAGTAAATGAGAAGACTTTTGGAGTGATTGCTTCCAGTGAAAATTCCCCAGATGTCCATCAAGTGTTAGCTCATGCAGTTCCTAGTGTGGAG
GACCATCAGTTCTCTGTATTGGCAGTGATGCAAGGACCTTGCATTTTTCTCCGTTTCAAGTGAATGTCCTCGTTGTTGATTTTTGCTTGTCGGCTTCCGTCAGGGCAAGTAATTTGTCTTTGTATCTTGCTCGCGGGCTCAGGTGAAGGTCCTATGTACGTTGGTTTTTGTTAAACCTTTCTTGGTTCCTTTCTTGTAGA
GGCTCGGGTAATGGTTCTCCGTATTAGTAATCGCACGAAACTTGTCTCTACTCTTTGCTCATAGAATCTCAAGTGAATGTACTTGTTAGTTTTTACTTGCCGGCTTTCGTCAGGGAAAGCAATATGTCTTCGATTCTTGCTCGTAGGCTCAGGTGAAGGTCTTCTATGTTGGTTGCTGTTAGGGTTTATCTTTTTGGGGG
TTGTTTTTCACAAGGGGTCAGGTGAAGCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAACACTAGCCGAATCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAAAACTGGCCCAAGTCTTTGCTCATAGAGTCTCAAGTGAAGGTCCTCGTTGACTTCTCTTAGGGTTTGATTAACTTGTATCGACTTCTTTCTTGCAAAGGCCTGTGCGAAG
GTCCTTCTCTTAGAATATTCTCCTCTATCTCGCATTGTTTTCCTCCCTTCTATCTCTCATTGTTTTCCTTGCATCATTGTTTTTCCTTTGAAAAATCTCACAAACACCAAAAATAGATATTTCGTCTCTAGAGCCTGCTTGCTATGCACCCAAACAGATTGAAATGTGGATTTGAATGCCAACAAACTAGACTGAGAGAG
ATTTTTTGAGAGACGCACTATGCAAATTCCAGATGTCAGAGGCATGCACTCAAGgtatggtcatttgggtttttgatatttttttgaatgatgaattctttgtttcaaaatgagtagagaatcagtagtataatatatatgcatgtgaaacaaatattgtcattcactactcgttgaaacaagtttcatttcaattggtt
taagtttatttgggttacttcttcctgcattaccaactaccatgattggttttctttatgaagtttgtgtggtttcgtggtgtttagtcaatctgagatgggggttcagcttgtagattgcttcgggattgtgtgaagtgtcttatataaattgggtttgtattgatatttgatacaatctttggaattagttaaaaatt
ccttgttttggatctatacttgtattggtgtattataaaaattcggtttctgttgatgttgatacactcttgtgaataaattgaggtttctttattttttatccatattggcaatggaaattttttctaagaaatctctcatttgatgggaacttgtggctctaggttgagtacttgaaggcttttacagaacgtcttcc
ttttagtgtttctttatttcttgaccttgcttatttctctcctcattctgcactacggagtgaatctgactaattgatatcaaagaagaacctttgcctgcattttcttggagcttttatctcactatggttcaacaaacatggtggacccaaaagactcttaaagatcccatagtaacaccacatcttacaccaatggt
taatatgtaggatgtattatatgccaggcccatttagtttgaatttcttgtagaatatgatgtttttaaagttggactaagaatactgcccacaagtaagaaaagagaaatgatccaaaggattgggaagagattaaatatgtttcttcaaacaggatgtaagtggtctgaatgtttcattctttagtctagataaactc
acagaaacatgaaactatggaactaaatgatccaaaaaccaaaaacatattcctcgaggcatcatataggtttaaatcattttggaaaaatatttgcaatagtcatctgggatatgttcttggtgtagaagttggagacatgttccattctcaaagtccattgagtaatgtaggtttgcatagatctctttgagtaggta
tatattatctaaagcctaaagaaacatgccacatggtaccactagctatcagcattgtttcttctagaggttatgaagacgatattgacaataaatatgtgataatatactcgggccaaggtgggaatactcatgaggagagcaggaaacatatttatgattaggagcccactgcaggggatgtagccctcaggaatatt
atctagatgtagaaacaacatgttagattaatccggtcatgtgaggagttgttttctgagtatgggtatgatggattctacaatttataggattcatggttagaaaatggaagaccgggatatctggtgcataaattcaaaccaagcccaaaataagatcagccccctctagtttctctccttattcggtttagtggcag
ttcacatgttaagaaaataattgtaatcaaggaggaaatgaagagggacaacccaaatttggtatatgcattgtgaattatgtagacaacgtccatactcttaatgatttcaaatacctgcttagttcttactatgcaatatctagattgattacctaaaccttgattgcattcagaaggctagaaaatgtctaatgaga
caattagttgtcttcaaacatgtatcgatactgtcacgatatgcaacagctgtgtgaacatccgatactttggccaggatgcaaatacagagtgtgaacatctgattgcaggtgatgaatttattcagattcatgaaatactcatatatatgactccttgtaaaatagatcgagcattaaattgcatgggcagtccacta
attcgttttcacatatttgtcaaaggaaactttggtgttggttgatatgctttttttatcagtagttttttgttaatacacaacaatattattgttgcaatttatgatgttaccagctgtgcatctaagttttcagcataagacattgtattttcatgttgataaagcaagtctttataatcttccaacctggacaacat
taacaagttccatataacttcacttatgctattagtaagacatataattatgaaagtgatgatagaagtgagtgcggcaagggtttcaagcagtgtagcatttattttgatcatctttaggtcaaaagaatctgtcttgtatagaaaagctgattttccttggattagattatttacaacttataagtagatgggctgag
caccttgctgtgacaaagcaaatgtcaagagagcccgtggtctcctgaagaggatgccatactcaaaaattttatagagaagcatggcaccggaggcaactaaatcgctttgtcttggaaagcctgtatggtatatcacacactcaaattcattcagatccacacccacatatttatttttggcattcatgttatgtttt
gtcatgtataatataagcccttctcttctttgttacgatggacatgtggttttacaagtgaataatttagggtttctaactcaggatttttaatttggtgggagttttttattactagtctaggttcaatttttagagtgaggatgttagtatctaaaactgggattcctcatagtgacatgtcctaggagtaataaaat
ataagtcccagactccagccaaaaaaaaaagatgttattataaagaaacttatgattgataaactgagttcaaaaattcttttgtgtttcttcttattcattaccgagataagaagaaataagttaaccaatatggttaaggagagattgataaatgtactgagttttctccttattagacatcaagacataagttaatg
agtaacaaatatgtggtttaatatgtgaagtactttttcactaagggtttataagaaaaagggtacaatattaccctgccaataggttgcagcctttctatatcctttctatgttttctccccttcaacatgtttcaaggggatatcatcatatctcttcatggcaagcttcctccctgccaaaataatgtggctcacac
tctgattgcagaaggttaataaagcttagaagaatacaggatgtctcatggatgctcttagcagaagttaaaaacttaaaaccaacaatataattgcattatggctatattagtatttaatggcagcaacaaaaccgcctaatgagacaaaatggaagcacatggtattcagaacttgctcatgcctccagttggcaagg
tgtacatacaaaaccattgctcagtgagatgcaggtctgatgcaggggaaaaataaaaccattgatagctacttctatgtggtaccactgtaaattactttttggttgtagttttggtaaacttaattgaccgataaatgcagtgaggtccacaatattaacaaagattaactagtcaacaaatctgattcataaccttt
tgcttacaattcacaacactcaaccacccacttacttgatgtaactcatcaaacttgaataacaatattcatatataaaaactcctctccaaataaagagagtccccaatttacttaattaataacactgctctttgcaatttgatagcctgatctccttgatctttggcaaggatattgtttaatgcttacaattcagc
aattacacaggttaagggtttttttaacaggttaagataattgctttggttaatcattgaaaatagattactcagaggggattatttgattcagattgcctggactattaaaaaatttaaacaaatcatgggttataacagttgattttaaagtactaattttaccattttgaatttaagctggagagttcatttgaaaa
atttagttttaaaagaatatttctaccatttgaatttacaatatggagagttcatttggaaagattagatgttaaaatagagaaaacgcattttcattttacaaatccataatttatgtcaatgggtcagaaattcattgtacaagtatctctgagactgattgatgctcaaatctgtaaaatgcaaaagataaaaaggt
aaatcccctgaatgtagtgttatcctcgaggtatttttaaatattttaagcaatcacttttttagaatttttttttggaataattaataaagtactttatttattataactccctttctttaatgtctttttatttcagagaaacttgatcttagagaaaagccaaaaatataaagattactcaagtaactccatgttct
ctttggttacttttaatgggaatgttttacattagtaagtcagagttattatcttaatagatttatcgttttgtttatttgaagcactttttgacatctcatttttttcttattgagacatacttcctacataatttgaggttgtaaaataaaatgttaagatactgtcaaataaaaggctatagttgtcttcaaacatg
tatcgatactgtcacgatatgcaacagttgtgtgtcaagacatgcaaaagtccatatatatagcctatagcattatgtgtttaccaaacaaaattttcattctttctttattccgacactttggccaggatgcaaatacagagtgtgagcatctgattgcagatgatgaatttattcagattcatgaaatactcatatat
atgactccttgtaaaatagatcgagcattaaattgtatgggcaatccactaattccttttcacatatttgtcaattaaactttggtgaattgatatgtttttttatcagtagtttaccaaacagaattttcattctttctttattccgacactttggccagGATGCAAATACAGAGTGTGAGCATCTGATTGCAGATGAT
GAATTTATTCAGATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTTGTAAAATAGATCGAGCATTAAATTGTATGGGCAATCCACTAATTCCTTTTCACATATTTGTCAATTAAACTTGGTGAATTGATATGCTTTTTTATCAGTAGTTTACCAAACAGAATTTTCATTCTTTCTTTATTCCGACACTTTGGCCAGGATGCAA
ATACAGAGTGTGAACATCTGATTGCAGGTGATGAATTTATTCAGATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTAATAAAATAGATCGAGCATTAAATTGTATGGGCAATCCACTAATTCCTTTTCACATATTTGTCAAAGGAAACTTTGGTGAATTGATATGCTTTTTTATCAGTAGTTTACCAAA

Intron 2 GCATGGGCAG ... CTTTGGCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	63.08	12	20	21
A2	60	9	15	12
A3	49.15	15	8	21
A4	51.35	9	4	15
A5	30.43	8	3	4
A6	50	2	2	2
A7	51.52	24	22	29
A8	40.28	63	41	44
A9	58.62	12	15	19
A10	34.55	36	24	14

>TRINITY_DN44702_c1_g1_i8 from sample A8 / Example spliced isoform

CCGCATCTAGATCTGCGACTACCTTCTTCAATGGAACCCCAGATTGCCAGAGCAATGGCCCAAATGACAATGGATGCCAAGATTCATGCAGACTTTCAAGCATCTAGGAACCATTTCAATTATAGGAAATCCATAGTTGATAACATAGATTTGGAGATAGTTCCATTAGTTACGGATTTGGATTTGGAGATTGTTCCATT
AGTTACAACAAAGGAGCAAGCTGCTTCAGCCATTTGGGTGCACAGTTGCAGTAAATGAGAAGACTTTTGGAGTGATTGCTTCCAGTGAAAATTCCCCAGATGTCCATCAAGTGTTAGCTCATGCAGTTCCTAGTGTGGAGGACCATTAGTTCTCTGTATTGGCAGTGATGCAAGGACCTTGCATTTTTCTCCGTTTCAAG
TGAATGTCCTCGTTGTTGATTTTTGCTTGTCGGCTTCCGTCAGGGCAAGTAATTTGTCTTTGTATCTTGCTCGCGGGCTCAGGTGAAGGTCCTATGTACGTTGGTTTTTGTTAAACCTTTCTTGGTTCCTTTCTTGTAGAGGCTCGGGTAATGGTTCTCCGTATTAGTAATCGCACGAAACTTGTCTCTACTCTTTGCTC
ATAGAATCTCAAGTGAATGTACTTGTTAGTTTTTACTTGCCGGCTTTCGTCAGGGAAAGCAATATGTCTTCGATTCTTGCTCGTAGGCTCAGGTGAAGGTCTTCTATGTTGGTTGCTGTTAGGGTTTATCTTTTTGGGGGTTGTTTTTCACAAGGGGTCAGGTGAAGCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAACACTAGC
CGAATCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAAAACTGGCCCAAGTCTTTGCTCATAGAGTCTCAAGTGAAGGTCCTCGTTGACTTCTCTTAGGGTTTGATTAACTTGTATCGACTTCTTTCTTGCAAAGGCCTGTGCGAAGGTCCTTCTCTTAGAATATTCTCCTCTATCTCGCATTGTTTTCCTCCCTTCTATCTCTCAT
TGTTTTCCTTGCATCATTGTTTTTCCTTTGAAAAATCTCACAAACACCAAAAATAGATATTTCGTCTCTAGAGCCTGCTTGCTATGCACCCAAACAGATTGAAATGTGGATTTGAATGCCAACAAACTAGACTGAGAGAGATTTTTTGAGAGACGCACTATGCAAATTCCAGATGTCAGAGGCATGCACTCAAGGTCAAT
CTGAGATGGGGGTTCAGCTTGTAGATTGCTTCGGGATTGTGTGAAGTGTCTTATATAAATTGGGTTTGTATTGATATTTGATACAATCTTTGGAATTAGTTAAAAATTCCTTGTTTTGGATCTATACTTGTATTGGTGTATTATAAAAATTCGGTTTCTGTTGATGTTGATACACTCTTGTGAATAAATTGAGGTTTCTT
TATTTTTTATCCATATTGGCAATGGAAATTTTTTCTAAGAAATCTCTCATTTGATGGGAACTTGTGGCTCTAGGTTGAGTACTTGAAGGCTTTTACAGAACGTCTTCCTTTTAGTGTTTCTTTATTTCTTGACCTTGCTTATTTCTCTCCTCATTCTGCACTACGGAGTGAATCTGACTAATTGATATCAAAGAAGAACC
TTTGCCTGCATTTTCTTGGAGCTTTTATCTCACTATGGTTCAACAAACATGGTGGACCCAAAAGACTCTTAAAGATCCCATAGTAACACCACATCTTACACCAATGGTTAATATGTAGGATGTATTATATGCCAGGCCCATTTAGTTTGAATTTCTTGTAGAATATGATGTTTTTAAAGTTGGACTAAGAATACTGCCCA
CAAGTAAGAAAAGAGAAATGATCCAAAGGATTGGGAAGAGATTAAATATGTTTCTCCAAACAGGATGTAGGTGGTCTGAATGTTTCATTCTTTAGTCTAGATAAACTCACAGAAACATGAAACTATGGAACTAAATGATCCAAAAACCAAAAACATATTCCTCGAGGCATCATATAGGTTTAAATCATTTTGGAAAAATA
TTTGCAATAGTCATCTGGGATATGTTCTTGGTGTAGAAGTTGGAGACATGTTCCATTCTCAAAGTCCATTGAGTAATGTAGGTTTGCATAGATCTCTTTGAGTAGGTATATATTATCTAAAGCCTAAAGAAACATGCCACATGGTACCACTAGCTATCAGCATTGTTTCTTCTAGAGGTTATGAAGACGATATTGACAAT
AAATATGTGATAATATACTCGGGCCAAGGTGGGAATACTCATGAGGAGAGCAGGAAACATATTTATGATTAGGAGCCCACTGCAGGGGATGTAGCCCTCAGGAATATTATCTAGATGTAGAAACAACATGTTAGATTAATCCGGTCATGTGAGGAGTTGTTTTCTGAGTATGGGTATGATGGATTCTACAATTTATAGGA
TTCATGGTTAGAAAATGGAAGACCGGGATATCTGGTGCATAAATTCAAACCAAGCCCAAAATAAGATCAGCCCCCTCTAGTTTCTCTCCTTATTCGGTTTAGTGGCAGTTCACATGTTAAGAAAATAATTGTAATCAAGGAGGAAATGAAGAGGGACAACCCAAATTTGGTATATGCATTGTGAATTATGTAGACAACGT
CCATACTCTTAATGATTTCAAATACCTGCTTAGTTCTTACTATGCAATATCTAGATTGATTACCTAAACCTTGATTGCATTCAGAAGGCTAGAAAATGTCTAATGAGACAATTAGTTGTCTTCAAACATGTATCGATACTGTCACGATATGCAACAGCTGTGTGAACATCCGATACTTTGGCCAGGATGCAAATACAGAG
TGTGAACATCTGATTGCAGATGATGAATTTATTCAGATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTTGTAAAATAGATCGAGCATTAAATTGATGCAAATACAGAGTGTGAGCATCTGATTGCAGATGATGAATTTATTCAGATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTTGTAAAATAGATCGAGCATTAAATTGTA
TGGGCAATCCACTAATTCCTTTTCACATAT

>TRINITY_DN44702_c1_g1_i11 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CCGCATCTAGATCTGCGACTACCTTCTTCAATGGAACCCCAGATTGCCAGAGCAATGGCCCAAATGACAATGGATGCCAAGATTCATGCAGACTTTCAAGCATCTAGGAACCATTTCAATTATAGGAAATCCATAGTTGATAACATAGATTTGGAGATAGTTCCATTAGTTACGGATTTGGATTTGGAGATTGTTCCATT
AGTTACAACAAAGGAGCAAGCTGCTTCAGCCATTTGGGTGCACAGTTGCAGTAAATGAGAAGACTTTTGGAGTGATTGCTTCCAGTGAAAATTCCCCAGATGTCCATCAAGTGTTAGCTCATGCAGTTCCTAGTGTGGAGGACCATTAGTTCTCTGTATTGGCAGTGATGCAAGGACCTTGCATTTTTCTCCGTTTCAAG
TGAATGTCCTCGTTGTTGATTTTTGCTTGTCGGCTTCCGTCAGGGCAAGTAATTTGTCTTTGTATCTTGCTCGCGGGCTCAGGTGAAGGTCCTATGTACGTTGGTTTTTGTTAAACCTTTCTTGGTTCCTTTCTTGTAGAGGCTCGGGTAATGGTTCTCCGTATTAGTAATCGCACGAAACTTGTCTCTACTCTTTGCTC
ATAGAATCTCAAGTGAATGTACTTGTTAGTTTTTACTTGCCGGCTTTCGTCAGGGAAAGCAATATGTCTTCGATTCTTGCTCGTAGGCTCAGGTGAAGGTCTTCTATGTTGGTTGCTGTTAGGGTTTATCTTTTTGGGGGTTGTTTTTCACAAGGGGTCAGGTGAAGCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAACACTAGC
CGAATCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAAAACTGGCCCAAGTCTTTGCTCATAGAGTCTCAAGTGAAGGTCCTCGTTGACTTCTCTTAGGGTTTGATTAACTTGTATCGACTTCTTTCTTGCAAAGGCCTGTGCGAAGGTCCTTCTCTTAGAATATTCTCCTCTATCTCGCATTGTTTTCCTCCCTTCTATCTCTCAT
TGTTTTCCTTGCATCATTGTTTTTCCTTTGAAAAATCTCACAAACACCAAAAATAGATATTTCGTCTCTAGAGCCTGCTTGCTATGCACCCAAACAGATTGAAATGTGGATTTGAATGCCAACAAACTAGACTGAGAGAGATTTTTTGAGAGACGCACTATGCAAATTCCAGATGTCAGAGGCATGCACTCAAGGTATGG
TCATTTGGGTTTTTGATATTTTTTTGAATGATGAATTCTTTGTTTCAAAATGAGTAGAGAATCAGTAGTATAATATATATGCATGTGAAACAAATATTGTCATTCACTACTCGTTGAAACAAGTTTCATTTCAATTGGTTTAAGTTTATTTGGGTTACTTCTTCCTGCATTACCAACTACCATGATTGGTTTTCTTTATG
AAGTTTGTGTGGTTTCGTGGTGTTTAGTCAATCTGAGATGGGGGTTCAGCTTGTAGATTGCTTCGGGATTGTGTGAAGTGTCTTATATAAATTGGGTTTGTATTGATATTTGATACAATCTTTGGAATTAGTTAAAAATTCCTTGTTTTGGATCTATACTTGTATTGGTGTATTATAAAAATTCGGTTTCTGTTGATGTT
GATACACTCTTGTGAATAAATTGAGGTTTCTTTATTTTTTATCCATATTGGCAATGGAAATTTTTTCTAAGAAATCTCTCATTTGATGGGAACTTGTGGCTCTAGGTTGAGTACTTGAAGGCTTTTACAGAACGTCTTCCTTTTAGTGTTTCTTTATTTCTTGACCTTGCTTATTTCTCTCCTCATTCTGCACTACGGAG
TGAATCTGACTAATTGATATCAAAGAAGAACCTTTGCCTGCATTTTCTTGGAGCTTTTATCTCACTATGGTTCAACAAACATGGTGGACCCAAAAGACTCTTAAAGATCCCATAGTAACACCACATCTTACACCAATGGTTAATATGTAGGATGTATTATATGCCAGGCCCATTTAGTTTGAATTTCTTGTAGAATATGA
TGTTTTTAAAGTTGGACTAAGAATACTGCCCACAAGTAAGAAAAGAGAAATGATCCAAAGGATTGGGAAGAGATTAAATATGTTTCTCCAAACAGGATGTAGGTGGTCTGAATGTTTCATTCTTTAGTCTAGATAAACTCACAGAAACATGAAACTATGGAACTAAATGATCCAAAAACCAAAAACATATTCCTCGAGGC
ATCATATAGGTTTAAATCATTTTGGAAAAATATTTGCAATAGTCATCTGGGATATGTTCTTGGTGTAGAAGTTGGAGACATGTTCCATTCTCAAAGTCCATTGAGTAATGTAGGTTTGCATAGATCTCTTTGAGTAGGTATATATTATCTAAAGCCTAAAGAAACATGCCACATGGTACCACTAGCTATCAGCATTGTTT
CTTCTAGAGGTTATGAAGACGATATTGACAATAAATATGTGATAATATACTCGGGCCAAGGTGGGAATACTCATGAGGAGAGCAGGAAACATATTTATGATTAGGAGCCCACTGCAGGGGATGTAGCCCTCAGGAATATTATCTAGATGTAGAAACAACATGTTAGATTAATCCGGTCATGTGAGGAGTTGTTTTCTGAG
TATGGGTATGATGGATTCTACAATTTATAGGATTCATGGTTAGAAAATGGAAGACCGGGATATCTGGTGCATAAATTCAAACCAAGCCCAAAATAAGATCAGCCCCCTCTAGTTTCTCTCCTTATTCGGTTTAGTGGCAGTTCACATGTTAAGAAAATAATTGTAATCAAGGAGGAAATGAAGAGGGACAACCCAAATTT
GGTATATGCATTGTGAATTATGTAGACAACGTCCATACTCTTAATGATTTCAAATACCTGCTTAGTTCTTACTATGCAATATCTAGATTGATTACCTAAACCTTGATTGCATTCAGAAGGCTAGAAAATGTCTAATGAGACAATTAGTTGTCTTCAAACATGTATCGATACTGTCACGATATGCAACAGCTGTGTGAACA
TCCGATACTTTGGCCAGGATGCAAATACAGAGTGTGAACATCTGATTGCAGATGATGAATTTATTCAGATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTTGTAAAATAGATCGAGCATTAAATTgcatgggcagtccactaattcgttttcacatatttgtcaaaggaaactttggtgttggttgatatgctttttttatc
agtagttttttgttaatacacaacaatattattgttgcaatttatgatgttaccagctgtgcatctaagttttcagcataagacattgtattttcatgttgataaagcaagtctttataatcttccaacctggacaacattaacaagttccatataacttcacttatgctattagtaagacatataattatgaaagtgat
gatagaagtgagtgcggcaagggtttcaagcagtgtagcatttattttgatcatctttaggtcaaaagaatctgtcttgtatagaaaagctgattttccttggattagattatttacaacttataagtagatgggctgagcaccttgctgtgacaaagcaaatgtcaagagagcccgtggtctcctgaagaggatgccat
actcaaaaattttatagagaagcatggcaccggaggcaactaaatcgctttgtcttggaaagcctgtatggtatatcacacactcaaattcattcagatccacacccacatatttatttttggcattcatgttatgttttgtcatgtataatataagcccttctcttctttgttacgatggacatgtggttttacaagtg
aataatttagggtttctaactcaggatttttaatttggtgggagttttttattactagtctaggttcaatttttagagtgaggatgttagtatctaaaactgggattcctcatagtgacatgtcctaggagtaataaaatataagtcccagactccagccaaaaaaaaagatgttattataaagaaacttatgattgata
aactgagttcaaaaattcttttgtgtttcttcttattcattaccgagataagaagaaataagttaaccaatatggttaaggagagattgataaatgtactgagttttctccttattagacatcaagacataagttaatgagtaacaaatatgtggtttaatatgtgaagtactttttcactaagggtttataagaaaaag
ggtacaatattaccctgccaataggttgcagcctttctatatcctttctatgttttctccccttcaacatgtttcaaggggatatcatcatatctcttcatggcaagcttcctccctgccaaaataatgtggctcacactctgattgcagaaggttaataaagcttagaagaatacaggatgtctcatggatgctcttag
cagaagttaaaaacttaaaaccaacaatataattgcattatggctatattagtatttaatggcagcaacaaaaccgcctaatgagacaaaatggaagcacatggtattcagaacttgctcatgcctccagttggcaaggtgtacatacaaaaccattgctcagtgagatgcaggtctgatgcaggggaaaaataaaacca
ttgatagctacttctatgtggtaccactgtaaattactttttggttgtagttttggtaaacttaattgaccgataaatgcagtgaggtccacaatattaacaaagattaactagtcaacaaatctgattcataaccttttgcttacaattcacaacactcaaccacccacttacttgacgtaactcatcaaacttgaata
acaatattcatatataaaaactcctctccaaataaagagagtccccaatttacttaattaataacactgctctttgcaatttgatagcctgatctccttgatctttggcaaggatattgtttaatgcttacaattcagcaattacacaggttaagggtttttttaacaggttaagataattgctttggttaatcattgaa
aatagattactcagaggggattatttgattcagattgcctggactattaaaaaatttaaacaaatcatgggttataacagttgattttaaagtactaattttaccattttgaatttaagctggagagttcatttgaaaaattagttttaaaagaatatttttaccatttgaatttacaatatggagagttcatttggaaa
gattagatgttaaaatagagaaaacgcattttcattttacaaatccataatttatgtcaatgggtcagaaattcattgtacaagtatctctgagactgattgatgctcaaatctgtaaaatgcaaaagataaaaaggtaaatcccctgaatgtagtgttatcctcgaggtatttttaaatattttaagcaatcacttttt
tagaatttttttttggaataattaataaagtactttatttattataactccctttctttaatgtctttttatttcagagaaacttgatcttagagaaaagccaaaaatataaagattactcaagtaactccatgttctctttggttacttttaatgggaatgttttacattagtaagtcagagttattatcttaatagat
ttatcgttttgtttatttgaagcactttttgacatctcatttttttcttattgagacatacttcctacataatttgaggttgtaaaataaaatgttaagatactgtcaaataaaaggctatagttgtcttcaaacatgtatcgatactgtcacgatatgcaacagttgtgtgtcaagacatgcaaaagtccatatatata
gcctatagcattatgtgtttaccaaacaaaattttcattctttctttattccgacactttggccagGATGCAAATACAGAGTGTGAGCATCTGATTGCAGATGATGAATTTATTCAGATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTTGTAAAATAGATCGAGCATTAAATTGTATGGGCAATCCACTAATTCCTTTTCA
CATAT

Intron 3 GTATGGTCAT ... CTTTGGCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	63.38	13	24	21
A2	50	14	16	12
A3	65	7	5	21
A4	54.72	12	14	15
A5	40	3	0	4
A6	40.98	18	23	2
A7	45.45	33	26	29
A8	43.53	48	29	45
A9	45.24	23	19	19
A10	35.14	36	25	14

>TRINITY_DN42514_c0_g1_i2 from sample A9 / Example spliced isoform

CCACTGCAACGCATCTAGATCTGCGACTACCTTCTTCAATGGAACCCCAGATTGCCAGAGCAATGGCCCAAATGACAATGGATGCCAAGATTCATGCAGACTTTCAAGCATCTAGGAACCATTTCAATTATAGGAAATCCATAGTTGATAACATAGATTTGGAGATAGTTCCATTAGTTACGGATTTGGATTTGGAGATT
GTTCCATTAGTTACAACAAAGGAGCAAGCTGCTTCAGCCATTTGGGTGCACAGTTGCAGTAAATGAGAAGACTTTTGGAGTGATTGCTTCCAGTGAAAATTCCCCAGATGTCCATCAAGTGTTAGCTCATGCAGTTCCTAGTGTGGAGGACCATCAGTTCTCTGTATTGGCAGTGATGCAAGGACCTTGCATTTTTCTCC
GTTTCAAGTGAATGTCCTCGTTGTTGATTTTTGCTTGTCGGCTTCCGTCAGGGCAAGTAATTTGTCTTTGTATCTTGCTCGCGGGCTCAGGTGAAGGTCCTATGTACGTTGGTTTTTGTTAAACCTTTCTTGGTTCCTTTCTTGTAGAGGCTCGGGTAATGGTTCTCCGTATTAGTAATCGCACGAAACTTGTCTCTACT
CTTTGCTCATAGAATCTCAAGTGAATGTACTTGTTAGTTTTTACTTGCCGGCTTTCGTCAGGGAAAGCAATATGTCTTCGATTCTTGCTCGTAGGCTCAGGTGAAGGTCTTCTATGTTGGTTGCTGTTAGGGTTTATCTTTTTGGGGGTTGTTTTTCACAAGGGGTCAGGTGAAGCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGA
ACACTAGCCGAATCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAAAACTGGCCCAAGTCTTTGCTCATAGAGTCTCAAGTGAAGGTCCTCGTTGACTTCTCTTAGGGTTTGATTAACTTGTATCGACTTCTTTCTTGCAAAGGCCTGTGCGAAGGTCCTTCTCTTAGAATATTCTCCTCTATCTCGCATTGTTTTCCTCCCTTCTA
TCTCTCATTGTTTTCCTTGCATCATTGTTTTTCCTTTGAAAAATCTCACAAACACCAAAAATAGATATTTCGTCTCTAGAGCCTGCTTGCTATGCACCCAAACAGATTGAAATGTGGATTTGAATGCCAACAAACTAGACTGAGAGAGATTTTTTGAGAGACGCACTATGCAAATTCCAGATGTCAGAGGCATGCACTCA
AGGATGCAAATACAGAGTGTGAGCATCTGATTGCAGATGATGAATTTATTCAGATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTTGTAAAATAGATCGAGCATTAAATTGTATGGGCAATCCACTAATTCCTTTTCACATATTTGTCAATTAAACTT

>TRINITY_DN42514_c0_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:

CCACTGCAACGCATCTAGATCTGCGACTACCTTCTTCAATGGAACCCCAGATTGCCAGAGCAATGGCCCAAATGACAATGGATGCCAAGATTCATGCAGACTTTCAAGCATCTAGGAACCATTTCAATTATAGGAAATCCATAGTTGATAACATAGATTTGGAGATAGTTCCATTAGTTACGGATTTGGATTTGGAGATT
GTTCCATTAGTTACAACAAAGGAGCAAGCTGCTTCAGCCATTTGGGTGCACAGTTGCAGTAAATGAGAAGACTTTTGGAGTGATTGCTTCCAGTGAAAATTCCCCAGATGTCCATCAAGTGTTAGCTCATGCAGTTCCTAGTGTGGAGGACCATCAGTTCTCTGTATTGGCAGTGATGCAAGGACCTTGCATTTTTCTCC
GTTTCAAGTGAATGTCCTCGTTGTTGATTTTTGCTTGTCGGCTTCCGTCAGGGCAAGTAATTTGTCTTTGTATCTTGCTCGCGGGCTCAGGTGAAGGTCCTATGTACGTTGGTTTTTGTTAAACCTTTCTTGGTTCCTTTCTTGTAGAGGCTCGGGTAATGGTTCTCCGTATTAGTAATCGCACGAAACTTGTCTCTACT
CTTTGCTCATAGAATCTCAAGTGAATGTACTTGTTAGTTTTTACTTGCCGGCTTTCGTCAGGGAAAGCAATATGTCTTCGATTCTTGCTCGTAGGCTCAGGTGAAGGTCTTCTATGTTGGTTGCTGTTAGGGTTTATCTTTTTGGGGGTTGTTTTTCACAAGGGGTCAGGTGAAGCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGA
ACACTAGCCGAATCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAAAACTGGCCCAAGTCTTTGCTCATAGAGTCTCAAGTGAAGGTCCTCGTTGACTTCTCTTAGGGTTTGATTAACTTGTATCGACTTCTTTCTTGCAAAGGCCTGTGCGAAGGTCCTTCTCTTAGAATATTCTCCTCTATCTCGCATTGTTTTCCTCCCTTCTA
TCTCTCATTGTTTTCCTTGCATCATTGTTTTTCCTTTGAAAAATCTCACAAACACCAAAAATAGATATTTCGTCTCTAGAGCCTGCTTGCTATGCACCCAAACAGATTGAAATGTGGATTTGAATGCCAACAAACTAGACTGAGAGAGATTTTTTGAGAGACGCACTATGCAAATTCCAGATGTCAGAGGCATGCACTCA
AGgtatggtcatttgggtttttgatatttttttgaatgatgaattctttgtttcaaaatgagtagagaatcagtagtataatatatatgcatgtgaaacaaatattgtcattcactactcgttgaaacaagtttcatttcaattggtttaagtttatttgggttacttcttcctgcattaccaactaccatgattggttt
tctttatgaagtttgtgtggtttcgtggtgtttagtcaatctgagatgggggttcagcttgtagattgcttcgggattgtgtgaagtgtcttatataaattgggtttgtattgatatttgatacaatctttggaattagttaaaaattccttgttttggatctatacttgtattggtgtattataaaaattcggtttctg
ttgatgttgatacactcttgtgaataaattgaggtttctttattttttatccatattggcaatggaaattttttctaagaaatctctcatttgatgggaacttgtggctctaggttgagtacttgaaggcttttacagaacgtcttccttttagtgtttctttatttcttgaccttgcttatttctctcctcattctgca
ctacggagtgaatctgactaattgatatcaaagaagaacctttgcctgcattttcttggagcttttatctcactatggttcaacaaacatggtggacccaaaagactcttaaagatcccatagtaacaccacatcttacaccaatggttaatatgtaggatgtattatatgccaggcccatttagtttgaatttcttgta
gaatatgatgtttttaaagttggactaagaatactgcccacaagtaagaaaagagaaatgatccaaaggattgggaagagattaaatatgtttcttcaaacaggatgtaagtggtctgaatgtttcattctttagtctagataaactcacagaaacatgaaactatggaactaaatgatccaaaaaccaaaaacatattc
ctcgaggcatcatataggtttaaatcattttggaaaaatatttgcaatagtcatctgggatatgttctgggtgtagaagttggagacatgttccattctcaaagtccattgagtaatgtaggtttgcatagatctctttgagtaggtatatattatctaaagcctaaagaaacatgccacatggtaccactagctatcag
cattgtttcttctagaggttatgaagacgatattgacaataaatatgtgataatatactcgggccaaggtgggaatactcatgaggagagcaggaaacatatttatgattaggagcccactgcaggggatgtagccctcaggaatattatctagatgtagaaacaacatgttagattaatccggtcatgtgaggagttgt
tttctgagtatgggtatgatggattctacaatttataggattcatggttagaaaatggaagaccgggatatctggtgcataaattcaaaccaagcccaaaataagatcagccccctctagtttctctccttattcggtttagtggcagttcacatgttaagaaaataattgtaatcaaggaggaaatgaagagggacaac
ccaaatttggtatatgcattgtgaattatgtagacaacgtccatactcttaatgatttcaaatacctgcttagttcttactatgcaatatctagattgattacctaaaccttgattgcattcagaaggctagaaaatgtctaatgagacaattagttgtcttcaaacatgtatcgatactgtcacgatatgcaacagctg
tgtgaacatccgatactttggccaggatgcaaatacagagtgtgaacatctgattgcagatgatgaatttatccagattcatgaaatactcatatatatgactccttgtaaaatagatcgagcattaaattgcatgggcagtccactaattcgttttcacatatttgtcaaaggaaactttggtgttggttgatatgctt
tttttatcagtagttttttgttaatacacaacaatattattgttgcaatttatgatgttaccagctgtgcatctaagttttcagcataagacattgtattttcatgttgataaagcaagtctttataatcttccaacctggacaacattaacaagttccatataacttcacttatgctattagtaagacatataattatg
aaagtgatgatagaagtgagtgcggcaagggtttcaagcagtgtagcatttattttgatcatctttaggtcaaaagaatctgtcttgtatagaaaagctgattttccttggattagattatttacaacttataagtagatgggctgagcaccttgctgtgacaaagcaaatgtcaagagagcccgtggtctcctgaagag
gatgccatactcaaaaattttatagagaagcatggcaccggaggcaactaaatcgctttgtcttggaaagcctgtatggtatatcacacactcaaattcattcagatccacacccacatatttatttttggcattcatgttatgttttgtcatgtataatataagcccttctcttctttgttacgatggacatgtggttt
tacaagtgaataatttagggtttctaactcaggatttttaatttggtgggagttttttattactagtctaggttcaatttttagagtgaggatgttagtatctaaaactgggattcctcatagtgacatgtcctaggagtaataaaatataagtcccagactccagccaaaaaaaaaagatgttattataaagaaactta
tgattgataaactgagttcaaaaattcttttgtgtttcttcttattcattaccgagataagaagaaataagttaaccaatatggttaaggagagattgataaatgtactgagttttctccttattagacatcaagacataagttaatgagtaacaaatatgtggtttgatatgtgaagtactttttcactaagggtttat
aagaaaaagggtacaatattaccctgccaataggttgcagcctttctatatcctttctatgttttctccccttcaacatgtttcaaggggatatcatcatatctcttcatggcaagcttcctccctgccaaaataatgtggctcacactctgattgcagaaggttaataaagcttagaagaatacaggatgtctcatgga
tgctcttagcagaagttaaaaacttaaaaccaacaatataattgcattatggctatattagtatttaatggcagcaacaaaaccgcctaatgagacaaaatggaagcacatggtattcagaacttgctcatgcctccagttggcaaggtgtacatacaaaaccattgctcagtgagatgcaggtctgatgcaggggaaaa
ataaaaccattgatagctacttctatgtggtaccactgtaaattactttttggttgtagttttggtaaacttaattgaccgataaatgcagtgaggtccacaatattaacaaagattaactagtcaacaaatctgattcataaccttttgcttacaattcacaacactcaaccacccacttacttgacgtaactcatcaa
acttgaataacaatattcatatataaaaactcctctccaaataaagagagtccccaatttacttaattaataacactgctctttgcaatttgatagcctgatctccttgatctttggcaaggatattgtttaatgcttacaattcagcaattacacaggttaagggtttttttaacaggttaagataattgctttggtta
atcattgaaaatagattactcagaggggattatttgattcagattgcctggactattaaaaaatttaaacaaatcatgggttataacagttgattttaaagtactaattttaccattttgaatttaagctggagagttcatttgaaaaattagttttaaaagaatatttttaccatttgaatttacaatatggagagttc
atttggaaagattagatgttaaaatagagaaaacgcattttcattttacaaatccataatttatgtcaatgggtcagaaattcattgtacaagtatctctgagactgattgatgctcaaatctgtaaaatgcaaaagataaaaaggtaaatcccctgaatgtagtgttatcctcgaggtatttttaaatattttaagcaa
tcacttttttagaatttttttttggaataattaataaagtactttatttattataactccctttctttaatgtctttttatttcagagaaacttgatcttagagaaaagccaaaaatataaagattactcaagtaactccatgttctctttggttacttttaatgggaatgttttacattagtaagtcagagttattatc
ttaatagatttatcgttttgtttatttgaagcactttttgacatctcatttttttcttattgagacatacttcctacataatttgaggttgtaaaataaaatgttaagatactgtcaaataaaaggctatagttgtcttcaaacatgtatcgatactgtcacgatatgcaacagttgtgtgtcaagacatgcaaaagtcc
atatatatagcctatagcattatgtgtttaccaaacaaaattttcattctttctttattccgacactttggccagGATGCAAATACAGAGTGTGAGCATCTGATTGCAGATGATGAATTTATTCAGATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTTGTAAAATAGATCGAGCATTAAATTGTATGGGCAATCCACTAAT
TCCTTTTCACATATTTGTCAATTAAACTT

Intron 4 GTATGGTCAT ... CTTTGGCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	58.73	13	24	13
A2	49.09	14	16	11
A3	66.67	5	5	15
A4	48.94	12	14	9
A5	57.14	3	0	8
A6	40.98	18	23	2
A7	38.32	33	26	15
A8	40.26	46	29	33
A9	42.86	22	19	14
A10	35.71	36	25	15

>TRINITY_DN108881_c0_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform

TGGTTGGGCATCACAAATCTATAGGAATGAAGTGTGAGTCCTTCCACCTGTATGGACTAAACTTAGAGGTCGTAACGCCCTTGGTTTGTCTGCATTCTATATATTGTGTGATAAGGTTTTACCGCTTGTGTGTCCAAGAAGTCTTCCCCCACTGCAACGCATCTAGATCTGCGACTACCTTCTTCAATGGAAACCCAGAT
TGCCAGAGCAATGGCCCAAATGACAATGGATGCCAAGATTCATGCAGACTTTCAAGCATCTAGGAACCATTTCAATTATAGGAAATCCATAGTTGATAACATAGATTTGGAGATAGTTCCATTAGTTACGGATTTGGATTTGGAGATTGTTCCATTAGTTACAACAAAGGAGCAAGCTGCTTCAGCCATTTGGGTGCACA
GTTGCAGTAAATGAGAAGACTTTTGGAGTGATTGCTTCCAGTGAAAATTCCCCAGATGTCCATCAAGTGTTAGCTCATGCAGTTCCTAGTGTGGAGGACCATTAGTTCTCTGTATTGGCAGTGATGCAAGGACCTTGCATTTTTCTCCGTTTCAAGTGAATGTCCTCGTTGTTGATTTTTGCTTGTCGGCTTCCGTCAGG
GCAAGTAATTTGTCTTTGTATCTTGCTCGCGGGCTCAGGTGAAGGTCCTATGTACGTTGGTTTTTGTTAAACCTTTCTTGGTTCCTTTCTTGTAGAGGCTCGGGTAATGGTTCTCCGTATTAGTAATCGCACGAAACTTGTCTCTACTCTTTGCTCATAGAATCTCAAGTGAATGTACTTGTTAGTTTTTACTTGCCGGC
TTTCGTCAGGGAAAGCAATATGTCTTCGATTCTTGCTCGTAGGCTCAGGTGAAGGTCTTCTATGTTGGTTGCTGTTAGGGTTTATCTTTTTGGGGGTTGTTTTTCACAAGGGGTCAGGTGAAGCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAACACTAGCCGAATCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAAAACTGGCCCAAGT
CTTTGCTCATAGAGTCTCAAGTGAAGGTCCTCGTTGACTTCTCTTAGGGTTTGATTAACTTGTATCGACTTCTTTCTTGCAAAGGCCTGTGCGAAGGTCCTTCTCTTAGAATATTCTCCTCTATCTCGCATTGTTTTCCTCCCTTCTATCTCTCATTGTTTTCCTTGCATCATTGTTTTTCCTTTGAAAAATCTCACAAA
CACCAAAAATAGATATTTCGTCTCTAGAGCCTGCTTGCTATGCACCCAAACAGATTGAAATGTGGATTTGAATGCCAACAAACTAGACTGAGAGAGATTTTTTGAGAGACGCACTATGCAAATTCCAGATGTCAGAGGCATGCACTCAAGGATGCAAATACAGAGTGTGAGCATCTGATTGCAGATGATGAATTTATCCA
GATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTTGTAAAATAGATCGAGCATTAAATTGCATGGGCAGTCCACTAATTCGTTTTCACATATTTGTCAAAGGAAACTTTGGTGTTGGTTGATATGCTTTTTTTATCAGTAGTTTTTTGTTAATACACAACAATATTATTGTTGCAATTTATGATGTTACCAGCTGTGCATCTA
AGTTTTCAGCATAAGACATTGTATTTTCATGTTGATAAAGCAAGTCTTTATAATCTTCCAACCTGGACAACATTAACAAGTTCCATATAACTTCACTTATGCTATTAGTAAGACATATAATTATGAAAGTGATGATAGAAGTGAGTGCGGCAAGGGTTTCAAGCAGTGTAGCATTTATTTTGATCATCTTTAGGTCAAAA
GAATCTGTCTTGTATAGAAAAGCTGATTTTCCTTGGATTAGATTATTTACAACTTATAAGTAGATGGGCTGAGCACCTTGCTGTGACAAAGCAAATGTCAAGAGAGCCCGTGGTCTCCTGAAGAGGATGCCATACTCAAAAATTTTATAGAGAAGCATGGCACCGGAGGCAACTAAATCGCTTTGTCTTGGAAAGCCTGT
ATGGTATATCACACACTCAAATTCATTCAGATCCACACCCACATATTTATTTTTGGCATTCATGTTATGTTTTGTCATGTATAATATAAGCCCTTCTCTTCTTTGTTACGATGGACATGTGGTTTTACAAGTGAATAATTTAGGGTTTCTAACTCAGGATTTTTAATTTGGTGGGAGTTTTTTATTACTAGTCTAGGTTC
AATTTTTAGAGTGAGGATGTTAGTATCTAAAACTGGGATTCCTCATAGTGACATGTCCTAGGAGTAATAAAATATAAGTCCCAGACTCCAGCCAAAAAAAAAAGATGTTATTATAAAGAAACTTATGATTGATAAACTGAGTTCAAAAATTCTTTTGTGTTTCTTCTTATTCATTACCGAGATAAGAAGAAATAAGTTAA
CCAATATGGTTAAGGAGAGATTGATAAATGTACTGAGTTTTCTCCTTATTAGACATCAAGACATAAGTTAATGAGTAACAAATATGTGGTTTAATATGTGAAGTACTTTTTCACTAAGGGTTTATAAGAAAAAGGGTACAATATTACCCTGCCAATAGGTTGCAGCCTTTCTATATCCTTTCTATGTTTTCTCCCCTTCA
ACATGTTTCAAGGGGATATCATCATATCTCTTCATGGCAAGCTTCCTCCCTGCCAAAATAATGTGGCTCACACTCTGATTGCAGAAGGTTAATAAAGCTTAGAAGAATACAGGATGTCTCATGGATGCTCTTAGCAGAAGTTAAAAACTTAAAACCAACAATATAATTGCATTATGGCTATATTAGTATTTAATGGCAGC
AACAAAACCGCCTAATGAGACAAAATGGAAGCACATGGTATTCAGAACTTGCTCATGCCTCCAGTTGGCAAGGTGTACATACAAAACCATTGCTCAGTGAGATGCAGGTCTGATGCAGGGGAAAAATAAAACCATTGATAGCTACTTCTATGTGGTACCACTGTAAATTACTTTTTGGTTGTAGTTTTGGTAAACTTAAT
TGACCGATAAATGCAGTGAGGTCCACAATATTAACAAAGATTAACTAGTCAACAAATCTGATTCATAACCTTTTGCTTACAATTCACAACACTCAACCACCCACTTACTTGACGTAACTCATCAAACTTGAATAACAATATTCATATATAAAAACTCCTCTCCAAATAAAGAGAGTCCCCAATTTACTTAATTAATAACA
CTGCTCTTTGCAATTTGATAGCCTGATCTCCTTGATCTTTGGCAAGGATATTGTTTAATGCTTACAATTCAGCAATTACACAGGTTAAGGGTTTTTTTAACAGGTTAAGATAATTGCTTTGGTTAATCATTGAAAATAGATTACTCAGAGGGGATTATTTGATTCAGATTGCCTGGACTATTAAAAAATTTAAACAAATC
ATGGGTTATAACAGTTGATTTTAAAGTACTAATTTTACCATTTTGAATTTAAGCTGGAGAGTTCATTTGAAAAATTTAGTTTTAAAAGAATATTTCTACCATTTGAATTTACAATATGGAGAGTTCATTTGGAAAGATTAGATGTTAAAATAGAGAAAACGCATTTTCATTTTACAAATCCATAATTTATGTCAATGGGT
CAGAAATTCATTGTACAAGTATCTCTGAGACTGATTGATGCTCAAATCTGTAAAATGCAAAAGATAAAAAGGTAAATCCCCTGAATGTAGTGTTATCCTCGAGGTATTTTTAAATATTTTAAGCAATCACTTTTTTAGAATTTTTTTTTGGAATAATTAATAAAGTACTTTATTTATTATAACTCCCTTTCTTTAATGTC
TTTTTATTTCAGAGAAACTTGATCTTAGAGAAAAGCCAAAAATATAAAGATTACTCAAGTAACTCCATGTTCTCTTTGGTTACTTTTAATGGGAATGTTTTACATTAGTAAGTCAGAGTTATTATCTTAATAGATTTATCGTTTTGTTTATTTGAAGCACTTTTTGACATCTCATTTTTTTCTTATTGAGACATACTTCC
TACATAATTTGAGGTTGTAAAATAAAATGTTAAGATACTGTCAAATAAAAGGCTATAGTTGTCTTCAAACATGTATCGATACTGTCACGATATGCAACAGTTGTGTGTCAAGACATGCAAAAGTCCATATATATAGCCTATAGCATTATGTGTTTACCAAACAGAATTTTCATTCTTTCTTTATTCCGACACTTTGGCCA
GGATGCAAATACAGAGTGTGAGCATCTGATTGCAGATGATGAATTTATTCAGATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTTGTAAAATAGATCGAGCATTAAATTGTATGGGCAATCCACTAATTCCTTTTCACATATTTGTCAAAGGAAACTTTGGTGAATTGATATGCTTTTTTATCAGTAGTTTTTTGTTAATAC
ACAACAATATTATTGTTGCAATTTATGATGTTACCAGCTGTGCATCTAAGTTTTCAGCATAAGACATTGTATTTTCATGTTGATAAAGCAAGTCTTTATAATCTTCCAACCTGGACAACATTAACAAGTTCCATATAACTTCACTTATGCTATTAGTAAGACATATAATTATGAAAGTGATGATAGAAGTGAGTGCGGCA
AGGGTTTCAAGCAGTGTAGCATTTATTTTGATCATCTTTAGGTCAAAAGAATCTGTCTTGTATAGAAAAGCTGATTTTCCTTGGATTAGATTATTTACAACTTATAAGTAGATGGGCTGAGCACCC

>TRINITY_DN108881_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:

TGGTTGGGCATCACAAATCTATAGGAATGAAGTGTGAGTCCTTCCACCTGTATGGACTAAACTTAGAGGTCGTAACGCCCTTGGTTTGTCTGCATTCTATATATTGTGTGATAAGGTTTTACCGCTTGTGTGTCCAAGAAGTCTTCCCCCACTGCAACGCATCTAGATCTGCGACTACCTTCTTCAATGGAAACCCAGAT
TGCCAGAGCAATGGCCCAAATGACAATGGATGCCAAGATTCATGCAGACTTTCAAGCATCTAGGAACCATTTCAATTATAGGAAATCCATAGTTGATAACATAGATTTGGAGATAGTTCCATTAGTTACGGATTTGGATTTGGAGATTGTTCCATTAGTTACAACAAAGGAGCAAGCTGCTTCAGCCATTTGGGTGCACA
GTTGCAGTAAATGAGAAGACTTTTGGAGTGATTGCTTCCAGTGAAAATTCCCCAGATGTCCATCAAGTGTTAGCTCATGCAGTTCCTAGTGTGGAGGACCATTAGTTCTCTGTATTGGCAGTGATGCAAGGACCTTGCATTTTTCTCCGTTTCAAGTGAATGTCCTCGTTGTTGATTTTTGCTTGTCGGCTTCCGTCAGG
GCAAGTAATTTGTCTTTGTATCTTGCTCGCGGGCTCAGGTGAAGGTCCTATGTACGTTGGTTTTTGTTAAACCTTTCTTGGTTCCTTTCTTGTAGAGGCTCGGGTAATGGTTCTCCGTATTAGTAATCGCACGAAACTTGTCTCTACTCTTTGCTCATAGAATCTCAAGTGAATGTACTTGTTAGTTTTTACTTGCCGGC
TTTCGTCAGGGAAAGCAATATGTCTTCGATTCTTGCTCGTAGGCTCAGGTGAAGGTCTTCTATGTTGGTTGCTGTTAGGGTTTATCTTTTTGGGGGTTGTTTTTCACAAGGGGTCAGGTGAAGCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAACACTAGCCGAATCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAAAACTGGCCCAAGT
CTTTGCTCATAGAGTCTCAAGTGAAGGTCCTCGTTGACTTCTCTTAGGGTTTGATTAACTTGTATCGACTTCTTTCTTGCAAAGGCCTGTGCGAAGGTCCTTCTCTTAGAATATTCTCCTCTATCTCGCATTGTTTTCCTCCCTTCTATCTCTCATTGTTTTCCTTGCATCATTGTTTTTCCTTTGAAAAATCTCACAAA
CACCAAAAATAGATATTTCGTCTCTAGAGCCTGCTTGCTATGCACCCAAACAGATTGAAATGTGGATTTGAATGCCAACAAACTAGACTGAGAGAGATTTTTTGAGAGACGCACTATGCAAATTCCAGATGTCAGAGGCATGCACTCAAGgtatggtcatttgggtttttgatatttttttgaatgatgaattctttgtt
tcaaaatgagtagagaatcagtagtataatatatatgcatgtgaaacaaatattgtcattcactactcgttgaaacaagtttcatttcaattggtttaagtttatttgggttacttcttcctgcattaccaactaccatgattggttttctttatgaagtttgtgtggtttcgtggtgtttagtcaatctgagatggggg
ttcagcttgtagattgcttcgggattgtgtgaagtgtcttatataaattgggtttgtattgatatttgatacaatctttggaattagttaaaaattccttgttttggatctatacttgtattggtgtattataaaaattcggtttctgttgatgttgatacactcttgtgaataaattgaggtttctttattttttatcc
atattggcaatggaaattttttctaagaaatctctcatttgatgggaacttgtggctctaggttgagtacttgaaggcttttacagaacgtcttccttttagtgtttctttatttcttgaccttgcttatttctctcctcattctgcactacggagtgaatctgactaattgatatcaaagaagaacctttgcctgcatt
ttcttggagcttttatctcactatggttcaacaaacatggtggacccaaaagactcttaaagatcccatagtaacaccacatcttacaccaatggttaatatgtaggatgtattatatgccaggcccatttagtttgaatttcttgtagaatatgatgtttttaaagttggactaagaatactgcccacaagtaagaaaa
gagaaatgatccaaaggattgggaagagattaaatatgtttcttcaaacaggatgtaagtggtctgaatgtttcattctttagtctagataaactcacagaaacatgaaactatggaactaaatgatccaaaaaccaaaaacatattcctcgaggcatcatataggtttaaatcattttggaaaaatatttgcaatagtc
atctgggatatgttcttggtgtagaagttggagacatgttccattctcaaagtccattgagtaatgtaggtttgcatagatctctttgagtaggtatatattatctaaagcctaaagaaacatgccacatggtaccactagctatcagcattgtttcttctagaggttatgaagacgatattgacaataaatatgtgata
atatactcgggccaaggtgggaatactcatgaggagagcaggaaacatatttatgattaggagcccactgcaggggatgtagccctcaggaatattatctagatgtagaaacaacatgttagattaatccggtcatgtgaggagttgttttctgagtatgggtatgatggattctacaatttataggattcatggttaga
aaatggaagaccgggatatctggtgcataaattcaaaccaagcccaaaataagatcagccccctctagtttctctccttattcggtttagtggcagttcacatgttaagaaaataattgtaatcaaggaggaaatgaagagggacaacccaaatttggtatatgcattgtgaattatgtagacaacgtccatactcttaa
tgatttcaaatacctgcttagttcttactatgcaatatctagattgattacctaaaccttgattgcattcagaaggctagaaaatgtctaatgagacaattagttgtcttcaaacatgtatcgatactgtcacgatatgcaacagctgtgtgaacatccgatactttggccagGATGCAAATACAGAGTGTGAGCATCTG
ATTGCAGATGATGAATTTATCCAGATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTTGTAAAATAGATCGAGCATTAAATTGCATGGGCAGTCCACTAATTCGTTTTCACATATTTGTCAAAGGAAACTTTGGTGTTGGTTGATATGCTTTTTTTATCAGTAGTTTTTTGTTAATACACAACAATATTATTGTTGCAATTTA
TGATGTTACCAGCTGTGCATCTAAGTTTTCAGCATAAGACATTGTATTTTCATGTTGATAAAGCAAGTCTTTATAATCTTCCAACCTGGACAACATTAACAAGTTCCATATAACTTCACTTATGCTATTAGTAAGACATATAATTATGAAAGTGATGATAGAAGTGAGTGCGGCAAGGGTTTCAAGCAGTGTAGCATTTA
TTTTGATCATCTTTAGGTCAAAAGAATCTGTCTTGTATAGAAAAGCTGATTTTCCTTGGATTAGATTATTTACAACTTATAAGTAGATGGGCTGAGCACCTTGCTGTGACAAAGCAAATGTCAAGAGAGCCCGTGGTCTCCTGAAGAGGATGCCATACTCAAAAATTTTATAGAGAAGCATGGCACCGGAGGCAACTAAA
TCGCTTTGTCTTGGAAAGCCTGTATGGTATATCACACACTCAAATTCATTCAGATCCACACCCACATATTTATTTTTGGCATTCATGTTATGTTTTGTCATGTATAATATAAGCCCTTCTCTTCTTTGTTACGATGGACATGTGGTTTTACAAGTGAATAATTTAGGGTTTCTAACTCAGGATTTTTAATTTGGTGGGAG
TTTTTTATTACTAGTCTAGGTTCAATTTTTAGAGTGAGGATGTTAGTATCTAAAACTGGGATTCCTCATAGTGACATGTCCTAGGAGTAATAAAATATAAGTCCCAGACTCCAGCCAAAAAAAAAAGATGTTATTATAAAGAAACTTATGATTGATAAACTGAGTTCAAAAATTCTTTTGTGTTTCTTCTTATTCATTAC
CGAGATAAGAAGAAATAAGTTAACCAATATGGTTAAGGAGAGATTGATAAATGTACTGAGTTTTCTCCTTATTAGACATCAAGACATAAGTTAATGAGTAACAAATATGTGGTTTAATATGTGAAGTACTTTTTCACTAAGGGTTTATAAGAAAAAGGGTACAATATTACCCTGCCAATAGGTTGCAGCCTTTCTATATC
CTTTCTATGTTTTCTCCCCTTCAACATGTTTCAAGGGGATATCATCATATCTCTTCATGGCAAGCTTCCTCCCTGCCAAAATAATGTGGCTCACACTCTGATTGCAGAAGGTTAATAAAGCTTAGAAGAATACAGGATGTCTCATGGATGCTCTTAGCAGAAGTTAAAAACTTAAAACCAACAATATAATTGCATTATGG
CTATATTAGTATTTAATGGCAGCAACAAAACCGCCTAATGAGACAAAATGGAAGCACATGGTATTCAGAACTTGCTCATGCCTCCAGTTGGCAAGGTGTACATACAAAACCATTGCTCAGTGAGATGCAGGTCTGATGCAGGGGAAAAATAAAACCATTGATAGCTACTTCTATGTGGTACCACTGTAAATTACTTTTTG
GTTGTAGTTTTGGTAAACTTAATTGACCGATAAATGCAGTGAGGTCCACAATATTAACAAAGATTAACTAGTCAACAAATCTGATTCATAACCTTTTGCTTACAATTCACAACACTCAACCACCCACTTACTTGACGTAACTCATCAAACTTGAATAACAATATTCATATATAAAAACTCCTCTCCAAATAAAGAGAGTC
CCCAATTTACTTAATTAATAACACTGCTCTTTGCAATTTGATAGCCTGATCTCCTTGATCTTTGGCAAGGATATTGTTTAATGCTTACAATTCAGCAATTACACAGGTTAAGGGTTTTTTTAACAGGTTAAGATAATTGCTTTGGTTAATCATTGAAAATAGATTACTCAGAGGGGATTATTTGATTCAGATTGCCTGGA
CTATTAAAAAATTTAAACAAATCATGGGTTATAACAGTTGATTTTAAAGTACTAATTTTACCATTTTGAATTTAAGCTGGAGAGTTCATTTGAAAAATTTAGTTTTAAAAGAATATTTCTACCATTTGAATTTACAATATGGAGAGTTCATTTGGAAAGATTAGATGTTAAAATAGAGAAAACGCATTTTCATTTTACAA
ATCCATAATTTATGTCAATGGGTCAGAAATTCATTGTACAAGTATCTCTGAGACTGATTGATGCTCAAATCTGTAAAATGCAAAAGATAAAAAGGTAAATCCCCTGAATGTAGTGTTATCCTCGAGGTATTTTTAAATATTTTAAGCAATCACTTTTTTAGAATTTTTTTTTGGAATAATTAATAAAGTACTTTATTTAT
TATAACTCCCTTTCTTTAATGTCTTTTTATTTCAGAGAAACTTGATCTTAGAGAAAAGCCAAAAATATAAAGATTACTCAAGTAACTCCATGTTCTCTTTGGTTACTTTTAATGGGAATGTTTTACATTAGTAAGTCAGAGTTATTATCTTAATAGATTTATCGTTTTGTTTATTTGAAGCACTTTTTGACATCTCATTT
TTTTCTTATTGAGACATACTTCCTACATAATTTGAGGTTGTAAAATAAAATGTTAAGATACTGTCAAATAAAAGGCTATAGTTGTCTTCAAACATGTATCGATACTGTCACGATATGCAACAGTTGTGTGTCAAGACATGCAAAAGTCCATATATATAGCCTATAGCATTATGTGTTTACCAAACAGAATTTTCATTCTT
TCTTTATTCCGACACTTTGGCCAGGATGCAAATACAGAGTGTGAGCATCTGATTGCAGAACATCTGATTGCAGGTGATGAATTTATTCAGATTCATGAAATACTCATATATATGACTCCTTGTAAAATAGATCGAGCATTAAATTGTATGGGCAATCCACTAATTCCTTTTCACATATTTGTCAAAGGAAACTTTGGTGA
ATTGATATGCTTTTTTATCAGTAGTTTTTTGTTAATACACAACAATATTATTGTTGCAATTTATGATGTTACCAGCTGTGCATCTAAGTTTTCAGCATAAGACATTGTATTTTCATGTTGATAAAGCAAGTCTTTATAATCTTCCAACCTGGACAACATTAACAAGTTCCATATAACTTCACTTATGCTATTAGTAAGAC
ATATAATTATGAAAGTGATGATAGAAGTGAGTGCGGCAAGGGTTTCAAGCAGTGTAGCATTTATTTTGATCATCTTTAGGTCAAAAGAATCTGTCTTGTATAGAAAAGCTGATTTTCCTTGGATTAGATTATTTACAACTTATAAGTAGATGGGCTGAGCACCC

Intron 5 GTATGGTCAT ... TGGTGTTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	70	8.7	24	12
A2	62.04	9.7	16	14
A3	69.23	4	5	13
A4	65.64	7	14	11
A5	100	0	0	3
A6	58.41	16.3	23	17
A7	70.4	11.3	26	24
A8	58.98	19.7	29	25
A9	65.47	9.7	19	16
A10	53.92	20	25	17

>TRINITY_DN41402_c0_g1_i7 from sample A6 / Example spliced isoform

CCGGGGGCGGCCGCATCTAGATCTGCGACTACCTTCTTCAATGGAACCCCAGATTGCCAGAGCAATGGCCCAAATGACAATGGATGCCAAGATTCATGCAGACTTTCAAGCATCTAGGAACCATTTCAATTATAGGAAATCCATAGTTGATAACATAGATTTGGAGATAGTTCCATTAGTTACGGATTTGGATTTGGAGA
TTGTTCCATTAGTTACAACAAAGGAGCAAGCTGCTTCAGCCATTTGGGTGCACAGTTGCAGTAAATGAGAAGACTTTTGGAGTGATTGCTTCCAGTGAAAATTCCCCAGATGTCCATCAAGTGTTAGCTCATGCAGTTCCTAGTGTGGAGGACCATCAGTTCTCTGTATTGGCAGTGATGCAAGGACCTTGCATTTTTCT
CCGTTTCAAGTGAATGTCCTCGTTGTTGATTTTTGCTTGTCGGCTTCCGTCAGGGCAAGTAATTTGTCTTTGTATCTTGCTCGCGGGCTCAGGTGAAGGTCCTATGTACGTTGGTTTTTGTTAAACCTTTCTTGGTTCCTTTCTTGTAGAGGCTCGGGTAATGGTTCTCCGTATTAGTAATCGCACGAAACTTGTCTCTA
CTCTTTGCTCATAGAATCTCAAGTGAATGTACTTGTTAGTTTTTACTTGCCGGCTTTCGTCAGGGAAAGCAATATGTCTTCGATTCTTGCTCGTAGGCTCAGGTGAAGGTCTTCTATGTTGGTTGCTGTTAGGGTTTATCTTTTTGGGGGTTGTTTTTCACAAGGGGTCAGGTGAAGCTCCTCTATGTTGGTTACCACAT
GAACACTAGCCGAATCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAACACTAGCCGAATCTCCTCTATGTTGGTTACCACATAACTGGCCCAAGTCTTTGCTCATAGAGTCTCAAGTGAAGGTCCTCGTTGACTTCTCTTAGGGTTTGATTAACTTGTATCGACTTCTTTCTTGCAAAGGCCTGTGCGAAGGTCCTTCTCTTAGAA
TATTCTCCTCTATCTCGCATTGTTTTCCTCCCTTCTATCTCTCATTGTTTTCCTTGCATCATTGTTTTTCCTTTGAAAAATCTCACAAACACCAAAAATAGATATTTCGTCTCTAGAGCCTGCTTGCTATGCACCCAAACAGATTGAAATGTGGATTTGAATGCCAACAAACTAGACTGAGAGAGATTTTTTGAGAGACG
CACTATGCAAATTCCAGATGTCAGAGGCATGCACTCAAGTCAATCTGAGATGGGGGTTCAGCTTGTAGATTGCTTCGGGATTGTGTGAAGTGTCTTATATAAATTGGGTTTGTATTGATATTTGATACAATCTTTGGAATTAGTTAAAAATTCCTTGTTTTGGATCTATACTTGTATTGGTGTATTATAAAAATTCGGTT
TCTGTTGATGTTGATACACTCTTGTGAAT

>TRINITY_DN41402_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CCGGGGGCGGCCGCATCTAGATCTGCGACTACCTTCTTCAATGGAACCCCAGATTGCCAGAGCAATGGCCCAAATGACAATGGATGCCAAGATTCATGCAGACTTTCAAGCATCTAGGAACCATTTCAATTATAGGAAATCCATAGTTGATAACATAGATTTGGAGATAGTTCCATTAGTTACGGATTTGGATTTGGAGA
TTGTTCCATTAGTTACAACAAAGGAGCAAGCTGCTTCAGCCATTTGGGTGCACAGTTGCAGTAAATGAGAAGACTTTTGGAGTGATTGCTTCCAGTGAAAATTCCCCAGATGTCCATCAAGTGTTAGCTCATGCAGTTCCTAGTGTGGAGGACCATCAGTTCTCTGTATTGGCAGTGATGCAAGGACCTTGCATTTTTCT
CCGTTTCAAGTGAATGTCCTCGTTGTTGATTTTTGCTTGTCGGCTTCCGTCAGGGCAAGTAATTTGTCTTTGTATCTTGCTCGCGGGCTCAGGTGAAGGTCCTATGTACGTTGGTTTTTGTTAAACCTTTCTTGGTTCCTTTCTTGTAGAGGCTCGGGTAATGGTTCTCCGTATTAGTAATCGCACGAAACTTGTCTCTA
CTCTTTGCTCATAGAATCTCAAGTGAATGTACTTGTTAGTTTTTACTTGCCGGCTTTCGTCAGGGAAAGCAATATGTCTTCGATTCTTGCTCGTAGGCTCAGGTGAAGGTCTTCTATGTTGGTTGCTGTTAGGGTTTATCTTTTTGGGGGTTGTTTTTCACAAGGGGTCAGGTGAAGCTCCTCTATGTTGGTTACCACAT
GAACACTAGCCGAATCTCCTCTATGTTGGTTACCACATGAACACTAGCCGAATCTCCTCTATGTTGGTTACCACATAACTGGCCCAAGTCTTTGCTCATAGAGTCTCAAGTGAAGGTCCTCGTTGACTTCTCTTAGGGTTTGATTAACTTGTATCGACTTCTTTCTTGCAAAGGCCTGTGCGAAGGTCCTTCTCTTAGAA
TATTCTCCTCTATCTCGCATTGTTTTCCTCCCTTCTATCTCTCATTGTTTTCCTTGCATCATTGTTTTTCCTTTGAAAAATCTCACAAACACCAAAAATAGATATTTCGTCTCTAGAGCCTGCTTGCTATGCACCCAAACAGATTGAAATGTGGATTTGAATGCCAACAAACTAGACTGAGAGAGATTTTTTGAGAGACG
CACTATGCAAATTCCAGATGTCAGAGGCATGCACTCAAGgtatggtcatttgggtttttgatatttttttgaatgatgaattctttgtttcaaaatgagtagagaatcagtagtataatatatatgcatgtgaaacaaatattgtcattcactactcgttgaaacaagtttcatttcaattggtttaagtttatttgggt
tacttcttcctgcattaccaactaccatgattggttttctttatgaagtttgtgtggtttcgtggtgtttagTCAATCTGAGATGGGGGTTCAGCTTGTAGATTGCTTCGGGATTGTGTGAAGTGTCTTATATAAATTGGGTTTGTATTGATATTTGATACAATCTTTGGAATTAGTTAAAAATTCCTTGTTTTGGATCT
ATACTTGTATTGGTGTATTATAAAAATTCGGTTTCTGTTGATGTTGATACACTCTTGTGAAT