sp|P31752|ASNS_ASPOF ----> Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]

Intron 1 GTATATAATC ... TGCTTGTAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	53.65	108	116	134
A2	44.9	154	107	144
A3	49.06	177	162	179
A4	46.67	132	99	132
A5	50.31	80	76	86
A6	57.33	96	115	143
A7	54.84	154	169	205
A8	61.67	23	36	38
A9	51.52	151	142	179
A10	49	178	162	180

>TRINITY_DN104606_c0_g1_i2 from sample A5 / Example spliced isoform

GTTTTGACCGAGGGGTGTTTTATCAGGAGCTCTGCCCACAGTCTTAAGCTCTAAACAACTGTGTTTTTCTTCCTGCTTTTCATTTCATCCACTGTGCTTGTAAGGTATATAATCGGCTAAATTTATCTGTGTAGAGCGGGCAATCATGTGTGGAATACTGGCCGCATTGGGTTGCATTGACGTATCTCAGACTAAACGAG
CTCGAATACTGGAACTGTCCCGACGGTTAAGGCACAGAGGTCCAGATTGGAGTGGGATTAGCCACCATGGAAATTCTTTTCTAGCTCACCAGAGATTGGCCATAGTGGATCCAACATCCGGGAATCAACCGTTGTATAATGAGGATAAAACAATAGTTGTTACAGTGAATGGAGAGATTTACAACCATGAGGAATTGAGG
GAAAAGCTCGGATCTCACAAGTTCAGGACCAGGAGTGACTGTGAAGTTATTGCCCATCTTTATGAAGCATATGGCGAGGACTTCGTCAACATGTTGGATGGAATGTTCTCTTTTGTTCTTCTGGACACCCGTGACAATAGTTTTATTGCTGCTCGAGATGCAATTGGCATCACACCCCTTTACACGGGCTGGGGCCTTGA
TGGATCAATATGGTTTGCATCTGAAATGAAAGCTTTGAATGACGACTGTGAGCGCTTTGAATGTTTTCCTCCTGGACATATATACTCTAGTAAATTAGGAGGCTACAAAAGATGGTACAACCCACCTTGGTTTTCAGAGGATATTCCATCAACTCCATATGATCCCTTGGTTTTACGAGAAGCATTTGAGCAGGCAGTTC
GAAAAAGACTTATGGCAGATGTTCCGTTTGGCGTACTGTTGTCGGGTGGTCTGGATTCTTCATTAGTTGCTGCTGTGGCTTCCCGCTATTTGGCAGGCACCGAGGTTGCGAGACAGTGGGGAGCAAAACTCCATACCTTCTGCATTGGTCTGCAGGGTTCTCCAGACTTGAAGGCTGCAAAAGAGGTAGCTGATTACCTT
GGTACTTTTCATCATGAATTTGAATTCACTGTACAGGAAGGAATAGATGCAATTGAGGAGGTTATCTATCATATTGAAACATATGATGTGACCACAATTAGAGCAAGCACACCTATGTTCCTGATGTCTCGTAAAATTAAGTCTTTGGGAGTAAAGATGGTTCTTTCTGGGGAAGGCTCAGATGAGGTATTTGGGGGTTA
CTTGTATTTCCACAAGGCTCCCAACAAAGAGGAGCTCCATCGTGAAACATGTCGGAAGATAAAGTCTCTTCATCTATATGATTGCCTGAGAGCTAATAAGTCAACAGCAGCATGGGGTGTCGAGGCTCGGGTGCCATTTCTAGATAAGGAGTTTATCAATATTTCCATGGAAATTGATCCAGAGTCGAAGATGGTGCGGC
CTGATCTTGGGCGCATTGAGAAGTGGGTCCTCCGCAAGGCATTTGACGATGTGGAGAATCCTTATCTACCCAAGCATATTTTGTACAGGCAAAAAGAGCAATTCAGTGATGGTGTTGGTTATAGTTGGATTGACGGTTTGAAAGTACATGCTGCAAATCATGTTACCAATACGATGATGGCAAATGCAAAGTATATTTAC
CCTGAGAACACACCTACGACAAAGGAGGCATACTACTACAGGATGATATTTGAAAGATTCTTTCCTCAGAATGCTGCACGCTTGACTGTACCAGGAGGCCCTAGTGTGGCTTGCAGCACTGCCAAAGCTTTAGAATGGGATGCTGCATGGTCTAGAAACCCTGATCCTTCTGGCAGGGCTGCTTTAGGTGTTCATGTGGA
TGCTTATAAAGAAAATGCAGATGCCAGCAATGGCGACGAGGAAGTAGCAGCAGATATTTCAGTTAAAAGGCCAAAATTTCAGGATGATGGTGTGAAAGTTGCAGTTGAAGGTTGAGCCATAAGACATCTACGCTTCTCAAACGTAGCTTTGACCTGTATATGCTTGTGGCACTCTTGGATGACTCAGGCTTTCGTATTTT
TGCTTGCTGTCTAGGTTGTAAAGTGTAGGAAGTATTGAGATGCTTAGAAATTCGAGGATGAATTTAGATGAATACGAGAGTTTCCTGTTGATGTTATACTAAATTTAGTCATTGGATCTCAATGTTGATGTCCAGTGATGAAATACGTATTGATGTTGGGCATCTTCAGAGCATCATTCTAGTGCATTCATAGTTTTTCC
GATATTCATTGAATCTTGTCCAGTTAATTATTTCCAGAAGGATGAGTTATGGTATGTAAAAGCTTTAGTTGCCGGTTAAAAGGCATTACCTTTTTTGTGCTAATATTTTGATACATATTTGTTTTATTTGCATTATGAAAGTATGTGCTGGCAATCATAATTTCATGCGTAAGAGCCAGGCAGCATGAACCTGTTTCTGG
CATAACGTTTGGGGTGGAGTCTCATCATCTAGTGTTCAGATATGCTCCAGCTTTATGTTTGCCTAGCTGAT

>TRINITY_DN104606_c0_g1_i3 from sample A5 / Example unspliced isoform:

GTTTTGACCGAGGGGTGTTTTATCAGGAGCTCTGCCCACAGTCTTAAGCTCTAAACAACTGTGTTTTTCTTCCTGCTTTTCATTTCATCCACTGTGCTTGTAAGgtatataatcggcgaaaactgtgcttgtaagGTATATAATCGGCTAAATTTATCTGTGTAGAGCGGGCAATCATGTGTGGAATACTGGCCGCATTG
GGTTGCATTGACGTATCTCAGACTAAACGAGCTCGAATACTGGAACTGTCCCGACGGTTAAGGCACAGAGGTCCAGATTGGAGTGGGATTAGCCACCATGGAAATTCTTTTCTAGCTCACCAGAGATTGGCCATAGTGGATCCAACATCCGGGAATCAACCGTTGTATAATGAGGATAAAACAATAGTTGTTACAGTGAA
TGGAGAGATTTACAACCATGAGGAATTGAGGGAAAAGCTCGGATCTCACAAGTTCAGGACCAGGAGTGACTGTGAAGTTATTGCCCATCTTTATGAAGCATATGGCGAGGACTTCGTCAACATGTTGGATGGAATGTTCTCTTTTGTTCTTCTGGACACCCGTGACAATAGTTTTATTGCTGCTCGAGATGCAATTGGCA
TCACACCCCTTTACACGGGCTGGGGCCTTGATGGATCAATATGGTTTGCATCTGAAATGAAAGCTTTGAATGACGACTGTGAGCGCTTTGAATGTTTTCCTCCTGGACATATATACTCTAGTAAATTAGGAGGCTACAAAAGATGGTACAACCCACCTTGGTTTTCAGAGGATATTCCATCAACTCCATATGATCCCTTG
GTTTTACGAGAAGCATTTGAGCAGGCAGTTCGAAAAAGACTTATGGCAGATGTTCCGTTTGGCGTACTGTTGTCGGGTGGTCTGGATTCTTCATTAGTTGCTGCTGTGGCTTCCCGCTATTTGGCAGGCACCGAGGTTGCGAGACAGTGGGGAGCAAAACTCCATACCTTCTGCATTGGTCTGCAGGGTTCTCCAGACTT
GAAGGCTGCAAAAGAGGTAGCTGATTACCTTGGTACTTTTCATCATGAATTTGAATTCACTGTACAGGAAGGAATAGATGCAATTGAGGAGGTTATCTATCATATTGAAACATATGATGTGACCACAATTAGAGCAAGCACACCTATGTTCCTGATGTCTCGTAAAATTAAGTCTTTGGGAGTAAAGATGGTTCTTTCTG
GGGAAGGCTCAGATGAGGTATTTGGGGGTTACTTGTATTTCCACAAGGCTCCCAACAAAGAGGAGCTCCATCGTGAAACATGTCGGAAGATAAAGTCTCTTCATCTATATGATTGCCTGAGAGCTAATAAGTCAACAGCAGCATGGGGTGTCGAGGCTCGGGTGCCATTTCTAGATAAGGAGTTTATCAATATTTCCATG
GAAATTGATCCAGAGTCGAAGATGGTGCGGCCTGATCTTGGGCGCATTGAGAAGTGGGTCCTCCGCAAGGCATTTGACGATGTGGAGAATCCTTATCTACCCAAGCATATTTTGTACAGGCAAAAAGAGCAATTCAGTGATGGTGTTGGTTATAGTTGGATTGACGGTTTGAAAGTACATGCTGCAAATCATGTTACCAA
TACGATGATGGCAAATGCAAAGTATATTTACCCTGAGAACACACCTACGACAAAGGAGGCATACTACTACAGGATGATATTTGAAAGATTCTTTCCTCAGAATGCTGCACGCTTGACTGTACCAGGAGGCCCTAGTGTGGCTTGCAGCACTGCCAAAGCTTTAGAATGGGATGCTGCATGGTCTAGAAACCCTGATCCTT
CTGGCAGGGCTGCTTTAGGTGTTCATGTGGATGCTTATAAAGAAAATGCAGATGCCAGCAATGGCGACGAGGAAGTAGCAGCAGATATTTCAGTTAAAAGGCCAAAATTTCAGGATGATGGTGTGAAAGTTGCAGTTGAAGGTTGAGCCATAAGACATCTACGCTTCTCAAACGTAGCTTTGACCTGTATATGCTTGTGG
CACTCTTGGATGACTCAGGCTTTCGTATTTTTGCTTGCTGTCTAGGTTGTAAAGTGTAGGAAGTATTGAGATGCTTAGAAATTCGAGGATGAATTTAGATGAATACGAGAGTTTCCTGTTGATGTTATACTAAATTTAGTCATTGGATCTCAATGTTGATGTCCAGTGATGAAATACGTATTGATGTTGGGCATCTTCAG
AGCATCATTCTAGTGCATTCATAGTTTTTCCGATATTCATTGAATCTTGTCCAGTTAATTATTTCCAGAAGGATGAGTTATGGTATGTAAAAGCTTTAGTTGCCGGTTAAAAGGCATTACCTTTTTTGTGCTAATATTTTGATACATATTTGTTTTATTTGCATTATGAAAGTATGTGCTGGCAATCATAATTTCATGCG
TAAGAGCCAGGCAGCATGAACCTGTTTCTGGCATAACGTTTGGGGTGGAGTCTCATCATCTAGTGTTCAGATATGCTCCAGCTTTATGTTTGCCTAGCTGAT

Intron 2 GTTTTGACCG ... ATCTGTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	67.33	56	10.1	115.5
A2	66.57	71	25	141.4
A3	63.12	104	22	178
A4	61.88	75	16.9	121.8
A5	66.3	38	7	74.8
A6	55.17	104	15.2	128
A7	60.11	129	20	194.4
A8	56.34	31	8	40
A9	65.19	85	14.8	159.2
A10	56.86	125	27	164.8

>TRINITY_DN121894_c2_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

AATACACACTTTTTCAAGTCAAAACCAAAAGTGGGATCTATGAGACCACGAACTTCTAGAACCATGCAAGTTGCGTTTCATAAATATGCATCTGCGTATTTCGTCGGTTCATAGGAATCTGGATCTTAACTATCTTCCACAATACCTACCATTGGACTTACTACGTGTATCGATATAGTTGATTTTTCACAAGTGGTTGG
AATCCGGCGAGAAAGTGGCATTTGGGGAATAAGGAATAGCCGCCAGGGTTACGGCTTTTTCAGAGCGGGCAATCATGTGTGGAATACTGGCCGCATTGGGTTGCATTGACGTATCTCAGACTAAACGAGCTCGAATACTGGAACTGTCCCGACGGTTAAGGCACAGAGGTCCAGATTGGAGTGGGATTAGCCACCATGGA
AATTCTTTTCTAGCTCACCAGAGATTGGCCATAGTGGATCCAACATCCGGGAATCAACCGTTGTATAATGAGGATAAAACAATAGTTGTTACAGTGAATGGAGAGATTTACAACCATGAGGAATTGAGGGAAAAGCTCGGATCTCACAAGTTCAGGACCAGGAGTGACTGTGAAGTTATTGCCCATCTTTATGAAGCATA
TGGGGAGGACTTCGTCAACATGTTGGATGGAATGTTCTCTTTTGTTCTTCTGGACACCCGTGACAATAGTTTTATTGCTGCTCGAGATGCAATTGGCATCACACCCCTTTACACGGGCTGGGGCCTTGATGGATCAATATGGTTTGCATCTGAAATGAAAGCTTTGAATGACGACTGTGAGCGCTTTGAATGTTTTCCTC
CTGGACATATATACTCTAGTAAATTAGGAGGCTACAAAAGATGGTACAACCCACCTTGGTTTTCAGAGGATATTCCATCAACTCCATATGATCCCTTGGTTTTACGAGAAGCATTTGAGCAGGCAGTTCGAAAAAGACTTATGGCAGATGTTCCGTTTGGCGTACTGTTGTCGGGTGGTCTGGATTCTTCATTAGTTGCT
GCTGTGGCTTCCCGTTATTTGGCAGGCACTGAGGTTGCGAGACAGTGGGGAGCAAAACTCCATACCTTCTGCATTGGTCTGCAGGGTTCTCCAGACTTGAAGGCTGCAAAAGAGGTAGCTGATTACCTTGGTACTTTTCATCATGAATTTGAATTCACTGTACAGGAAGGAATAGATGCAATTGAGGAGGTTATCTATCA
TATTGAAACATATGACGTGACCACAATTAGAGCAAGCACACCTATGTTCTTGATGTCTCGTAAAATTAAGTCTTTGGGAGTAAAGATGGTTCTTTCTGGGGAAGGCTCAGATGAGGTATTTGGGGGTTACTTGTATTTCCACAAGGCTCCCAACAAAGAGGAGCTCCATCGTGAAACATGTCGGAAGATAAAGTCTCTTC
ATCTATATGATTGCCTGAGAGCTAATAAGTCAACAGCAGCATGGGGTGTCGAGGCTCGGGTGCCATTTCTAGATAAGGAGTTTATCAATATTTCCATGGAAATTGATCCAGAGTCGAAGATGGTGCGGCCTGATCTTGGGCGCATTGAGAAGTGGGTCCTCCGCAAGGCATTTGACGATGTGGAGAATCCTTATCTACCC
AAGCATATTTTGTACAGGCAAAAAGAGCAATTCAGTGATGGTGTTGGTTATAGTTGGATTGACGGTTTGAAAGTACATGCTGCAAATCATGTTACCAATACGATGATGGCAAATGCAAAGTATATTTACCCTGAGAACACACCTACGACAAAGGAGGCATACTACTACAGGATGATATTTGAAAGATTCTTTCCTCAGAA
TGCTGCACGCTTGACTGTACCAGGAGGCCCTAGTGTGGCTTGCAGCACTGCCAAAGCTTTAGAATGGGATGCTGCATGGTCTAGAAACCCTGATCCTTCTGGCAGGGCTGCTTTAGGTGTTCATGTGGATGCTTATAAAGAAAATGCAGATGCCAGCAATGGCGACGAGGAAGTAGCAGCAGATATTTCAGTTAAAAGGC
CAAAATTTCAGGATGATGGTGTGAAAGTTGCAGTTGAAGGTTGAGCCATAAGACATCTACGCTTCTCAAACGTAGCTTTGACCTGTATATGCTTGTGGCACTCTTGGATGACTCAGGCTTTCGTATTTTTGCTTGCTGTCTAGGTTGTAAAGTGTAGGAAGTATTGAGATGCTTAGAAATTCGAGGATGAATTTAGATGA
ATACGAGAGTTTCCTGTTGATGTTATACTAAATTTAGTCATTGGATCTCAATGTTGATGTCCAGTGATGAAATACGTATTGATGTTGGGCATCTTCAGAGCATCATTCTAGTGCATTCATAGTTTTTCCGATATTCATTGAATCTTGTCCAGTTAATTATTTCCAGAAGGATGAGTTATGGTATGTAAAAGCTTTAGTTG
CCGGTTAAAAGGCATTACCTTTTTTGTGCTAATATTTTGATACATATTTGTTTTATTTGCATTATGAAAGTATGTGCTGGCAATCATAATTTCATGCGTAAGAGCCAGGCAGCATGAACCTGTTTCTGGCATAACGTTTGGGGTGGAGTCTCATCATCTAGTGTTCAGATATGCTCCAGCTTTATGTTTGCCTAACTGAT
TTGACACAGTACTTTTCTTACATTTAGCATATAAAATCTGTATGCTCCAGCTAGATTTGTTTATGCGTCCATGGTATGGTCGTTTGTTCGAAGGCAGTATGTAGATCAGACGGAGTTAAATTGCATTGAAGTCACAGCATTATTGACAATTTCCTTTCAGTGGTGTGCTTGGATACCATCTGTTCTTGTTGGCAACCTCG
TCTGCTTATAATGAATTACCTACCGAGGTAGCCAACAATTCTAGTTAGAGTGTCAGCATTCTATTAACTAGAAA

>TRINITY_DN121894_c2_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AATACACACTTTTTCAAGTCAAAACCAAAAGTGGGATCTATGAGACCACGAACTTCTAGAACCATGCAAGTTGCGTTTCATAAATATGCATCTGCGTATTTCGTCGGTTCATAGGAATCTGGATCTTAACCATCTTCCACAATACCTACCATTTGATTTACTACGTGTATCGATATAGTTGATTTTTCACAAGTGGTTGG
AATCCGGCGAGAAAGTGGCATTTGGGGAATAAGGAATAGCCGCCAGGGTTACGGCTTTTTCAGgttttgaccgaggggtgttttatcaggagctctgcccacagtcttaagctctaaacaactgtgtttttcttcctgcttttcatttcatccactgtgcttgtaaggtatataatcggcgaaaactgtgcttgtaaggt
atataatcggcgaaatttatctgtgtagAGCGGGCAATCATGTGTGGAATACTGGCCGCATTGGGTTGCATTGACGTATCTCAGACTAAACGAGCTCGAATACTGGAACTGTCCCGACGGTTAAGGCACAGAGGTCCAGATTGGAGTGGGATTAGCCACCATGGAAATTCTTTTCTAGCTCACCAGAGATTGGCCATAGT
GGATCCAACATCCGGGAATCAACCGTTGTATAATGAGGATAAAACAATAGTTGTTACAGTGAATGGAGAGATTTACAACCATGAGGAATTGAGGGAAAAGCTCGGATCTCACAAGTTCAGGACCAGGAGTGACTGTGAAGTTATTGCCCATCTTTATGAAGCATATGGGGAGGACTTCGTCAACATGTTGGATGGAATGT
TCTCTTTTGTTCTTCTGGACACCCGTGACAATAGTTTTATTGCTGCTCGAGATGCAATTGGCATCACACCCCTTTACACGGGCTGGGGCCTTGATGGATCAATATGGTTTGCATCTGAAATGAAAGCTTTGAATGACGACTGTGAGCGCTTTGAATGTTTTCCTCCTGGACATATATACTCTAGTAAATTAGGAGGCTAC
AAAAGATGGTACAACCCACCTTGGTTTTCAGAGGATATTCCATCAACTCCATATGATCCCTTGGTTTTACGAGAAGCATTTGAGCAGGCAGTTCGAAAAAGACTTATGGCAGATGTTCCGTTTGGCGTACTGTTGTCGGGTGGTCTGGATTCTTCATTAGTTGCTGCTGTGGCTTCCCGTTATTTGGCAGGCACTGAGGT
TGCGAGACAGTGGGGAGCAAAACTCCATACCTTCTGCATTGGTCTGCAGGGTTCTCCAGACTTGAAGGCTGCAAAAGAGGTAGCTGATTACCTTGGTACTTTTCATCATGAATTTGAATTCACTGTACAGGAAGGAATAGATGCAATTGAGGAGGTTATCTATCATATTGAAACATATGACGTGACCACAATTAGAGCAA
GCACACCTATGTTCTTGATGTCTCGTAAAATTAAGTCTTTGGGAGTAAAGATGGTTCTTTCTGGGGAAGGCTCAGATGAGGTATTTGGGGGTTACTTGTATTTCCACAAGGCTCCCAACAAAGAGGAGCTCCATCGTGAAACATGTCGGAAGATAAAGTCTCTTCATCTATATGATTGCCTGAGAGCTAATAAGTCAACA
GCAGCATGGGGTGTCGAGGCTCGGGTGCCATTTCTAGATAAGGAGTTTATCAATATTTCCATGGAAATTGATCCAGAGTCGAAGATGGTGCGGCCTGATCTTGGGCGCATTGAGAAGTGGGTCCTCCGCAAGGCATTTGACGATGTGGAGAATCCTTATCTACCCAAGCATATTTTGTACAGGCAAAAAGAGCAATTCAG
TGATGGTGTTGGTTATAGTTGGATTGACGGTTTGAAAGTACATGCTGCAAATCATGTTACCAATACGATGATGGCAAATGCAAAGTATATTTACCCTGAGAACACACCTACGACAAAGGAGGCATACTACTACAGGATGATATTTGAAAGATTCTTTCCTCAGAATGCTGCACGCTTGACTGTACCAGGAGGCCCTAGTG
TGGCTTGCAGCACTGCCAAAGCTTTAGAATGGGATGCTGCATGGTCTAGAAACCCTGATCCTTCTGGCAGGGCTGCTTTAGGTGTTCATGTGGATGCTTATAAAGAAAATGCAGATGCCAGCAATGGCGACGAGGAAGTAGCAGCAGATATTTCAGTTAAAAGGCCAAAATTTCAGGATGATGGTGTGAAAGTTGCAGTT
GAAGGTTGAGCCATAAGACATCTACGCTTCTCAAACGTAGCTTTGACCTGTATATGCTTGTGGCACTCTTGGATGACTCAGGCTTTCGTATTTTTGCTTGCTGTCTAGGTTGTAAAGTGTAGGAAGTATTGAGATGCTTAGAAATTCGAGGATGAATTTAGATGAATACGAGAGTTTCCTGTTGATGTTATACTAAATTT
AGTCATTGGATCTCAATGTTGATGTCCAGTGATGAAATACGTATTGATGTTGGGCATCTTCAGAGCATCATTCTAGTGCATTCATAGTTTTTCCGATATTCATTGAATCTTGTCCAGTTAATTATTTCCAGAAGGATGAGTTATGGTATGTAAAAGCTTTAGTTGCCGGTTAAAAGGCATTACCTTTTTTGTGCTAATAT
TTTGATACATATTTGTTTTATTTGCATTATGAAAGTATGTGCTGGCAATCATAATTTCATGCGTAAGAGCCAGGCAGCATGAACCTGTTTCTGGCATAACGTTTGGGGTGGAGTCTCATCATCTAGTGTTCAGATATGCTCCAGCTTTATGTTTGCCTAACTGATTTGACACAGTACTTTTCTTACATTTAGCATATAAA
ATCTGTATGCTCCAGCTAGATTTGTTTATGCGTCCATGGTATGGTCGTTTGTTCGAAGGCAGTATGTAGATCAGACGGAGTTAAATTGCATTGAAGTCACAGCATTATTGACAATTTCCTTTCAGTGGTGTGCTTGGATACCATCTGTTCTTGTTGGCAACCTCGTCTGCTTATAATGAATTACCTACCGAGGTAGCCAA
CAATTCTAGTTAGAGTGTCAGCATTCTATTAACTAGAAA

Intron 3 GTTTTGACCG ... ATCTGTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	68.36	56	10.5	121
A2	73.11	71	25	193
A3	66.56	104	23	207
A4	68.49	75	16.5	163
A5	71.85	38	7	97
A6	58.57	104	16	147
A7	62.39	129	20	214
A8	56.34	31	8	40
A9	69.86	85	14	197
A10	64.39	125	27	226

>TRINITY_DN39248_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform

CCAAAACCCCTCACCACTAAATCAAAACCCCAATATTCAAATTTCTTATACTTTACTCAGGAATAAGGATAAAGAAGGCATTACCTTCATACACAGCAAACGAGAAATACACACTTTTTCAAGTCAAAACCAAAAGTGGGATCTATGAGACCACGAACTTCTAGAACCATGCAAGTTGCGTTTCATAAATATGCATCTGC
GTATTTCGTCGGTTCATAGGAATCTGGATCTTAACTATCTTCCACAATACCTACCATTGGACTTACTACGTGTATCGATATAGTTGATTTTTCACAAGTGGTTGGAATCCGGCGAGAAAGTGGCATTTGGGGAATAAGGAATAGCCGCCAGGGTTACGGCTTTTTCAGAGCGGGCAATCATGTGTGGAATACTGGCCGCA
TTGGGTTGCATTGACGTATCTCAGACTAAACGAGCTCGAATACTGGAACTGTCCCGACGGTTAAGGCACAGAGGTCCAGATTGGAGTGGGATTAGCCACCATGGAAATTCTTTTCTAGCTCACCAGAGATTGGCCATAGTGGATCCAACATCCGGGAATCAACCGTTGTATAATGAGGATAAAACAATAGTTGTTACAGT
GAATGGAGAGATTTACAACCATGAGGAATTGAGGGAAAAGCTCGGATCTCACAAGTTCAGGACCAGGAGTGACTGTGAAGTTATTGCCCATCTTTATGAAGCATATGGCGAGGACTTCGTCAACATGTTGGATGGAATGTTCTCTTTTGTTCTTCTGGACACCCGTGACAATAGTTTTATTGCTGCTCGAGATGCAATTG
GCATCACACCCCTTTACACGGGCTGGGGCCTTGATGGATCAATATGGTTTGCATCTGAAATGAAAGCTTTGAATGACGACTGTGAGCGCTTTGAATGTTTTCCTCCTGGACATATATACTCTAGTAAATTAGGAGGCTACAAAAGATGGTACAACCCACCTTGGTTTTCAGAGGATATTCCATCAACTCCATATGATCCC
TTGGTTTTACGAGAAGCATTTGAGCAGGCAGTTCGAAAAAGACTTATGGCAGATGTTCCGTTTGGCGTACTGTTGTCGGGTGGTCTGGATTCTTCATTAGTTGCTGCTGTGGCTTCCCGCTATTTGGCAGGCACCGAGGTTGCGAGACAGTGGGGAGCAAAACTCCATACCTTCTGCATTGGTCTGCAGGGTTCTCCAGA
CTTGAAGGCTGCAAAAGAGGTAGCTGATTACCTTGGTACTTTTCATCATGAATTTGAATTCACTGTACAGGAAGGAATAGATGCAATTGAGGAGGTTATCTATCATATTGAAACATATGATGTGACCACAATTAGAGCAAGCACACCTATGTTCCTGATGTCTCGTAAAATTAAGTCTTTGGGAGTAAAGATGGTTCTTT
CTGGGGAAGGCTCAGATGAGGTATTTGGGGGTTACTTGTATTTCCACAAGGCTCCCAACAAAGAGGAGCTCCATCGTGAAACATGTCGGAAGATAAAGTCTCTTCATCTATATGATTGCCTGAGAGCTAATAAGTCAACAGCAGCATGGGGTGTCGAGGCTCGGGTGCCATTTCTAGATAAGGAGTTTATCAATATTTCC
ATGGAAATTGATCCAGAGTCGAAGATGGTGCGGCCTGATCTTGGGCGCATTGAGAAGTGGGTCCTTCGCAAGGCATTTGACGATGTGGAGAATCCTTATCTACCCAAGCATATTTTGTACAGGCAAAAAGAGCAATTCAGTGATGGTGTTGGTTATAGTTGGATTGACGGTTTGAAAGTACATGCTGCAAATCATGTTAC
CAATACGATGATGGCAAATGCAAAGTATATTTACCCTGAGAACACACCTACGACAAAGGAGGCATACTACTACAGGATGATATTTGAAAGATTCTTTCCTCAGAATGCTGCACGCTTGACTGTACCAGGAGGCCCTAGTGTGGCTTGCAGCACTGCCAAAGCTTTAGAATGGGATGCTGCATGGTCTAGAAACCCTGATC
CTTCTGGCAGGGCTGCTTTAGGTGTTCATGTGGATGCTTATAAAGAAAATGCAGATGCCAGCAATGGCGACGAGGAAGTAGCAGCAGATATTTCAGTTAAAAGGCCAAAATTTCAGGATGATGGTGTGAAAGTTGCAGTTGAAGGTTGAGCCATAAGACATCTACGCTTCTCAAACGTAGCTTTGACCTGTATATGCTTG
TGGCACTCTTGGATGACTCAGGCTTTCGTATTTTTGCTTGCTGTCTAGGTTGTAAAGTGTAGGAAGTATTGAGATGCTTAGAAATTCGAGGATGAATTTAGATGAATACGAGAGTTTCCTGTTGATGTTATACTAAATTTAGTCATTGGATCTCAATGTTGATGTCCAGTGATGAAATACGTATTGATGTTGGGCATCTT
CAGAGCATCATTCTAGTGCATTCATAGTTTTTCCGATATTCATTGAATCTTGTCCAGTTAATTATTTCCAGAAGGATGAGTTATGGTATGTAAAAGCTTTAGTTGCCGGTTAAAAGGCATTACCTTTTTTGTGCTAATATTTTGATACATATTTGTTTTATTTGCATTATGAAAGTATGTGCTGGCAATCATAATTTCAT
GCGTAAGAGCCAGGCAGCATGAACCTGTTTCTGGCATAACGTTTGGGGTGGAGTCTCATCATCTAGTGTTCAGATATGCTCCAGCTTTATGTTTGCCTAACTGATTTGACACAGTACTTTTCTTACATTTAGCATATAAAATCTGTATGCTCCAGCTAGATTTGTTTATGCGTCCATGGAATGGTCGTTTGTTCGAAGGC
AGTATGTAGATCAGACGGAGTTAAATTGCATTGAAGTCACAGCATTATTGACAATTTCCTTTCAGTGGTGTGCTTGGATACCATCTGTTCTTGTTGGCAACCTCGTCTGCTTATAATGAATTACCTACCGAGGTAGCCAACAATTCTAGTTAGAGTGTCAGCATTCTATTAACTAGAAAGTTTAGTCGGTAATAAATAAC
TGTAAGAGTTCACGAGCCTCACTATTTCTGAAATTTGAATATTAAACTAAAGTTTTTT

>TRINITY_DN39248_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CCAAAACCCCTCACCACTAAATCAAAACCCCAATATTCAAATTTCTTATACTTTACTCAGGAATAAGGATAAAGAAGGCATTACCTTCATACACAGCAAACGAGAAATACACACTTTTTCAAGTCAAAACCAAAAGTGGGATCTATGAGACCACGAACTTCTAGAACCATGCAAGTTGCGTTTCATAAATATGCATCTGC
GTATTTCGTCGGTTCATAGGAATCTGGATCTTAACTATCTTCCACAATACCTACCATTGGACTTACTACGTGTATCGATATAGTTGATTTTTCACAAGTGGTTGGAATCCGGCGAGAAAGTGGCATTTGGGGAATAAGGAATAGCCGCCAGGGTTACGGCTTTTTCAGgttttgaccgaggggtgttttatcaggagctc
tgcccacagtcttaagctctaaacaactgtgtttttcttcctgcttttcatttcatccactgtgcttgtaaggtatataatcggctaaatttatctgtgtagAGCGGGCAATCATGTGTGGAATACTGGCCGCATTGGGTTGCATTGACGTATCTCAGACTAAACGAGCTCGAATACTGGAACTGTCCCGACGGTTAAGG
CACAGAGGTCCAGATTGGAGTGGGATTAGCCACCATGGAAATTCTTTTCTAGCTCACCAGAGATTGGCCATAGTGGATCCAACATCCGGGAATCAACCGTTGTATAATGAGGATAAAACAATAGTTGTTACAGTGAATGGAGAGATTTACAACCATGAGGAATTGAGGGAAAAGCTCGGATCTCACAAGTTCAGGACCAG
GAGTGACTGTGAAGTTATTGCCCATCTTTATGAAGCATATGGCGAGGACTTCGTCAACATGTTGGATGGAATGTTCTCTTTTGTTCTTCTGGACACCCGTGACAATAGTTTTATTGCTGCTCGAGATGCAATTGGCATCACACCCCTTTACACGGGCTGGGGCCTTGATGGATCAATATGGTTTGCATCTGAAATGAAAG
CTTTGAATGACGACTGTGAGCGCTTTGAATGTTTTCCTCCTGGACATATATACTCTAGTAAATTAGGAGGCTACAAAAGATGGTACAACCCACCTTGGTTTTCAGAGGATATTCCATCAACTCCATATGATCCCTTGGTTTTACGAGAAGCATTTGAGCAGGCAGTTCGAAAAAGACTTATGGCAGATGTTCCGTTTGGC
GTACTGTTGTCGGGTGGTCTGGATTCTTCATTAGTTGCTGCTGTGGCTTCCCGCTATTTGGCAGGCACCGAGGTTGCGAGACAGTGGGGAGCAAAACTCCATACCTTCTGCATTGGTCTGCAGGGTTCTCCAGACTTGAAGGCTGCAAAAGAGGTAGCTGATTACCTTGGTACTTTTCATCATGAATTTGAATTCACTGT
ACAGGAAGGAATAGATGCAATTGAGGAGGTTATCTATCATATTGAAACATATGATGTGACCACAATTAGAGCAAGCACACCTATGTTCCTGATGTCTCGTAAAATTAAGTCTTTGGGAGTAAAGATGGTTCTTTCTGGGGAAGGCTCAGATGAGGTATTTGGGGGTTACTTGTATTTCCACAAGGCTCCCAACAAAGAGG
AGCTCCATCGTGAAACATGTCGGAAGATAAAGTCTCTTCATCTATATGATTGCCTGAGAGCTAATAAGTCAACAGCAGCATGGGGTGTCGAGGCTCGGGTGCCATTTCTAGATAAGGAGTTTATCAATATTTCCATGGAAATTGATCCAGAGTCGAAGATGGTGCGGCCTGATCTTGGGCGCATTGAGAAGTGGGTCCTT
CGCAAGGCATTTGACGATGTGGAGAATCCTTATCTACCCAAGCATATTTTGTACAGGCAAAAAGAGCAATTCAGTGATGGTGTTGGTTATAGTTGGATTGACGGTTTGAAAGTACATGCTGCAAATCATGTTACCAATACGATGATGGCAAATGCAAAGTATATTTACCCTGAGAACACACCTACGACAAAGGAGGCATA
CTACTACAGGATGATATTTGAAAGATTCTTTCCTCAGAATGCTGCACGCTTGACTGTACCAGGAGGCCCTAGTGTGGCTTGCAGCACTGCCAAAGCTTTAGAATGGGATGCTGCATGGTCTAGAAACCCTGATCCTTCTGGCAGGGCTGCTTTAGGTGTTCATGTGGATGCTTATAAAGAAAATGCAGATGCCAGCAATG
GCGACGAGGAAGTAGCAGCAGATATTTCAGTTAAAAGGCCAAAATTTCAGGATGATGGTGTGAAAGTTGCAGTTGAAGGTTGAGCCATAAGACATCTACGCTTCTCAAACGTAGCTTTGACCTGTATATGCTTGTGGCACTCTTGGATGACTCAGGCTTTCGTATTTTTGCTTGCTGTCTAGGTTGTAAAGTGTAGGAAG
TATTGAGATGCTTAGAAATTCGAGGATGAATTTAGATGAATACGAGAGTTTCCTGTTGATGTTATACTAAATTTAGTCATTGGATCTCAATGTTGATGTCCAGTGATGAAATACGTATTGATGTTGGGCATCTTCAGAGCATCATTCTAGTGCATTCATAGTTTTTCCGATATTCATTGAATCTTGTCCAGTTAATTATT
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