sp|Q9M1V9|LFG2_ARATH ----> Protein LIFEGUARD 2

Intron 1 GTATTTATTG ... TGAATTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	16.76	149	38	22
A2	21.45	130	40	31
A3	19.58	230	82	30
A4	29.78	79	41	26
A5	18.98	111	40	12
A6	19.76	1896	594	340
A7	20.3	1170.5	381	215
A8	20	1274	347	290
A9	19.81	1113	312	238
A10	19.04	897	286	136

>TRINITY_DN92999_c0_g1_i3 from sample A4 / Example spliced isoform

CTTCAGGAGCTTTCGAACCCTTGATAAATTGTGTGCAGGCGTAGGTGCTTCGAGGTTATTCTGCTCCTCCCCTGTTCTTGAATAATCCACATAGTACTTCAGGAGCTTTCGAACCCTTGATAAATTGTGTGCAGGCGTAGGTGCTTCGAGGTTATTCTGCTCCTCCCCTGTTCTTCTTGAATAATCCACAGAGTACTTCA
GGAGCTTTCGAACCCTTGGTAAATTGTGTGCAGGCGTAGGTCTTTCTGTTTTGATTTGGCTTTCTACGAGGACAATCTCTCTGTATTCTGACATAGGGCAACAATGGCGAAAACCCTGCATGGACCATATGCAGACCTGGAGACAGGGAACGCGGCTCTCTACCCAGCTCAACCCTCCGATGAGATTCAGCTCCGGTGGG
CTTTCATAAGGAAAATATACTCGATTCTCACACTGCAATTGCTACTCACCATTGCCGTTGCTAGTGTTGTGGTCTTCGTTCGACCTGTCTCCCATTTCTTCGTCTCTACTCCGGCCGGGCTCGCTCTGTACATATTCTCTATCTTTTTCCCCTTAATCTTGATATGGCCTATGTATTACTACTCTCAAAAGCATCCTGTC
AATTACATCCTTCTCGCAACATTTACGGTTTTCATGGGATTATCTGTTGGATTAACTTGTGCTTTCACAGCGGGTAAGCCTGTTATTTTAAATTCTTTGTCAGTTACTCTGGAATTCTGGTATCTCTGTTTCCGGCTTTGTTTCTTATTTTGGCTATGAATCTGTTAATTTGTTATATTAATGTGACGGAAATATGAAAC
AGGGAAGGTGATTTTGGAATCGGCCATTTTAACGGCTGTGGTTGTGGTGAGTCTTACGCTTTATACATTCTGGGCAGCGAGAAGGGGTCATGATTTCAGTTTTCTGGCTCCCATTCTCTTCGCTGGATTCATGGTTCTACTCGTCTTTATTCTGATTCAGCTAATTGTTCCGCTGGGGAGGCTGTCTGTGATGATATATG
GGGCGCTGGCTTCCATCATATTCAGCGGGTTCATAATTTACGACACAGATAATCTGATAAAGCGGTATTCATATGATGAATATATATGGGCCGCAGTTGCCTTGTATTTGGACATCATTAATCTTTTCCTCTCTCTGCTCACGCTCCTGCGCGCCTCCAACAGTTAATACTATCGCCCATATGTACAGAGAAGATTTAAT
TCTTTATATGTGTATTATTAGCTTATGCGAATTATAGTATGGAATACGCTCTTTTTGTTTTGGACAAATCATTATGAATGATCCGTGTAAAGTAGTAGAGACTTCAAATTACGAGACTCTCTTTTTTGAAAAATAGTTACCTCGATTTAAGAAGGTAGAGAAGTCAGATTTGCTAAATTGGAATTAATTGTTTACTTTTA
ATTTATTTGTTTCAGCTTATTTATTAAATTTTAAGCAATATATTTGCCCATTTTCTCATTGAGTGTAAAAAAGTGGAAAAACACAGTAGGC

>TRINITY_DN92999_c0_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:

CTTCAGGAGCTTTCGAACCCTTGATAAATTGTGTGCAGGCGTAGGTGCTTCGAGGTTATTCTGCTCCTCCCCTGTTCTTGAATAATCCACATAGTACTTCAGGAGCTTTCGAACCCTTGATAAATTGTGTGCAGGCGTAGGTGCTTCGAGGTTATTCTGCTCCTCCCCTGTTCTTCTTGAATAATCCACAGAGTACTTCA
GGAGCTTTCGAACCCTTGGTAAATTGTGTGCAGGCGTAGGTCTTTCTGTTTTGATTTGGCTTTCTACGAGGACAATCTCTCTGTATTCTGACATAGGGCAACAATGGCGAAAACCCTGCATGGACCATATGCAGACCTGGAGACAGGGAACGCGGCTCTCTACCCAGCTCAACCCTCCGATGAGATTCAGCTCCGGTGGG
CTTTCATAAGGAAAATATACTCGATTCTCACACTGCAATTGCTACTCACCATTGCCGTTGCTAGTGTTGTGGTCTTCGTTCGACCTGTCTCCCATTTCTTCGTCTCTACTCCGGCCGGGCTCGCTCTGTACATATTCTCTATCTTTTTCCCCTTAATCTTGATATGGCCTATGTATTACTACTCTCAAAAGCATCCTGTC
AATTACATCCTTCTCGCAACATTTACGGTTTTCATGGGATTATCTGTTGGATTAACTTGTGCTTTCACAGCGGGGAAGGTGATTTTGGAATCGGCCATTTTAACGGCTGTGGTTGTGGTGAGTCTTACGCTTTATACATTCTGGGCAGCGAGAAGGGGTCATGATTTCAGTTTTCTGGCTCCCATTCTCTTCGCTGGATT
CATGGTTCTACTCGTCTTTATTCTGATTCAGgtatttattgattccgagtagtaactctgattcgggtattagtttagatgttttgggcagtgaatttatgttcttgcttggaatgaatttcagCTAATTGTTCCGCTGGGGAGGCTGTCTGTGATGATATATGGGGCGCTGGCTTCCATCATATTCAGCGGGTTCATAA
TTTACGACACAGATAATCTGATAAAGCGGTATTCATATGATGAATATATATGGGCCGCAGTTGCCTTGTATTTGGACATCATTAATCTTTTCCTCTCTCTGCTCACGCTCCTGCGCGCCTCCAACAGTTAATACTATCGCCCATATGTACAGAGAAGATTTAATTCTTTATATGTGTATTATTAGCTTATGCGAATTATA
GTATGGAATACGCTCTTTTTGTTTTGGACAAATCATTATGAATGATCCGTGTAAAGTAGTAGAGACTTCAAATTACGAGACTCTCTTTTTTGAAAAATAGTTACCTCGATTTAAGAAGGTAGAGAAGTCAGATTTGCTAAATTGGAATTAATTGTTTACTTTTAATTTATTTGTTTCAGCTTATTTATTAAATTTTAAGC
AATATATTTGCCCATTTTCTCATTGAGTGTAAAAAAGTGGAAAAACACAGTAGGC

Intron 2 GTAAATTGTG ... CCATATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	74.84	39	132	100
A2	79.34	28	127	88
A3	78.12	43	191	116
A4	82.14	20	100	84
A5	80.95	22	114	73
A6	81.97	211	1220	698
A7	81.19	153	826	495
A8	78.14	129	527	395
A9	77.61	212	884	586
A10	80.18	142	736	413

>TRINITY_DN103091_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform

GCTCTGTAGCTTACCAGTGAATCTTGATTCATCATTTCTCCATCCGTTTAAATTCTGTTGTTTTGTTAAAATCATTTTGTTTTATTCTTCGGCGTGTACGCGTGTATTACACTCGGAACGGTTTAGTTGTTTCTAGAAAGCAAACGAAGCCAGCGAAGCAATCCCAGTAGAGCTTCGAGGTTATTCTGCTCCTCCCCTGT
TCTTGAATAATCCACATAGTACTTCAGGAGCTTTCGAACCCTTGATAAATTGTGTGCAGGCGTAGGTGCTTCGAGGTTATTCTGCTCCTCCCCTGTTCTTCTTGAATAATCCACAGAGTACTTCAGGAGCTTTCGAACCCTTGACCTGGAGACAGGGAACGCGGCTCTCTACCCAGCTCAACCCTCCGATGAGATTCAGC
TCCGGTGGGCTTTCATAAGGAAAATATACTCGATTCTCACACTGCAATTGCTACTCACCATTGCCGTTGCTAGTGTTGTGGTCTTCGTTCGACCTGTCTCCCATTTCTTCGTCTCTACTCCGGCCGGGCTCGCTCTGTACATATTCTCTATCTTTTTCCCCTTAATCTTGATATGGCCTATGTATTACTACTCTCAAAAG
CATCCTGTCAATTACATCCTTCTCGCAACATTTACGGTTTTCATGGGATTATCTGTTGGATTAACTTGTGCTTTCACAGCGGGGAAGGTGATTTTGGAATCGGCCATTTTAACGGCTGTGGTTGTGGTGAGTCTTACGCTTTATACATTCTGGGCAGCGAGAAGGGGTCATGATTTCAGTTTTCTGGCTCCCATTCTCTT
CGCTGGATTCATGGTTCTACTCGTCTTTATTCTGATTCAGCTAATTGTTCCGCTGGGGAGGCTGTCTGTGATGATATATGGGGCGCTGGCTTCCATCATATTCAGCGGGTTCATAATTTACGACACAGATAATCTGATAAAGCGGTATTCATATGATGAATATATATGGGCCGCAGTTGCCTTGTATTTGGACATCATTA
ATCTTTTCCTCTCTCTGCTCACGCTCCTGCGCGCCTCCAACAGTTAATACTATCGCCCATATGTACAGAGAAGATTTAATTCTTTATATGTGTATTATTAGCTTATGCGAATTATAGTATGGAATACGCTCTTTTTGTTTTGGACAAATCATTATGAATGATCCGTGTAAAGTAGTAGAGACTTCAAATTACGAGACTCT
CTTTTTTGAAAAATAGTTACCTCGATTTAAGAAGGTAGAGAAGTCAGATTTGCTAAATTGGAATTAATTGTTTACTTTTAAAAAAAAAATAGTTACC

>TRINITY_DN103091_c0_g1_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GCTCTGTAGCTTACCAGTGAATCTTGATTCATCATTTCTCCATCCGTTTAAATTCTGTTGTTTTGTTAAAATCATTTTGTTTTATTCTTCGGCGTGTACGCGTGTATTACACTCGGAACGGTTTAGTTGTTTCTAGAAAGCAAACGAAGCCAGCGAAGCAATCCCAGTAGAGCTTCGAGGTTATTCTGCTCCTCCCCTGT
TCTTGAATAATCCACATAGTACTTCAGGAGCTTTCGAACCCTTGATAAATTGTGTGCAGGCGTAGGTGCTTCGAGGTTATTCTGCTCCTCCCCTGTTCTTCTTGAATAATCCACAGAGTACTTCAGGAGCTTTCGAACCCTTGgtaaattgtgtgcaggcgtaggtctttctgttttgatttggctttctacgaggacaa
tctctctgtattctgacatagggcaacaatggcgaaaaccctgcatggaccatatgcagACCTGGAGACAGGGAACGCGGCTCTCTACCCAGCTCAACCCTCCGATGAGATTCAGCTCCGGTGGGCTTTCATAAGGAAAATATACTCGATTCTCACACTGCAATTGCTACTCACCATTGCCGTTGCTAGTGTTGTGGTCT
TCGTTCGACCTGTCTCCCATTTCTTCGTCTCTACTCCGGCCGGGCTCGCTCTGTACATATTCTCTATCTTTTTCCCCTTAATCTTGATATGGCCTATGTATTACTACTCTCAAAAGCATCCTGTCAATTACATCCTTCTCGCAACATTTACGGTTTTCATGGGATTATCTGTTGGATTAACTTGTGCTTTCACAGCGGGG
AAGGTGATTTTGGAATCGGCCATTTTAACGGCTGTGGTTGTGGTGAGTCTTACGCTTTATACATTCTGGGCAGCGAGAAGGGGTCATGATTTCAGTTTTCTGGCTCCCATTCTCTTCGCTGGATTCATGGTTCTACTCGTCTTTATTCTGATTCAGCTAATTGTTCCGCTGGGGAGGCTGTCTGTGATGATATATGGGGC
GCTGGCTTCCATCATATTCAGCGGGTTCATAATTTACGACACAGATAATCTGATAAAGCGGTATTCATATGATGAATATATATGGGCCGCAGTTGCCTTGTATTTGGACATCATTAATCTTTTCCTCTCTCTGCTCACGCTCCTGCGCGCCTCCAACAGTTAATACTATCGCCCATATGTACAGAGAAGATTTAATTCTT
TATATGTGTATTATTAGCTTATGCGAATTATAGTATGGAATACGCTCTTTTTGTTTTGGACAAATCATTATGAATGATCCGTGTAAAGTAGTAGAGACTTCAAATTACGAGACTCTCTTTTTTGAAAAATAGTTACCTCGATTTAAGAAGGTAGAGAAGTCAGATTTGCTAAATTGGAATTAATTGTTTACTTTTAAAAA
AAAAATAGTTACC

Intron 3 GTAAGCCTGT ... TATGAAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	19.61	123	8.3	30
A2	13.6	108	10.3	17
A3	18.71	113	13.7	26
A4	19.69	102	11.3	25
A5	21.95	64	3.3	18
A6	25.18	1034	87.7	348
A7	25.1	719	57	241
A8	25.5	628	45	215
A9	23.26	666.3	56	202
A10	26.81	576	49.7	211

>TRINITY_DN103091_c0_g1_i3 from sample A3 / Example spliced isoform

GCTCTGTAGCTTACCAGTGAATCTTGATTCATCATTTCTCCATCCGTTTAAATTCTGTTGTTTTGTTAAAATCATTTTGTTTTATTCTTCGGCGTGTACGCGTGTATTACACTCGGAACGGTTTAGTTGTTTCTAGAAAGCAAACGAAGCCAGCGAAGCAATCCCAGTAGAGCTTCGAGGTTATTCTGCTCCTCCCCTGT
TCTTGAATAATCCACATAGTACTTCAGGAGCTTTCGAACCCTTGATAAATTGTGTGCAGGCGTAGGTGCTTCGAGGTTATTCTGCTCCTCCCCTGTTCTTCTTGAATAATCCACAGAGTACTTCAGGAGCTTTCGAACCCTTGGTAAATTGTGTGCAGGCGTAGGTCTTTCTGTTTTGATTTGGCTTTCTACGAGGACAA
TCTCTCTGTATTCTGACATAGGGCAACAATGGCGAAAACCCTGCATGGACCATATGCAGACCTGGAGACAGGGAACGCGGCTCTCTACCCAGCTCAACCCTCCGATGAGATTCAGCTCCGGTGGGCTTTCATAAGGAAAATATACTCGATTCTCACACTGCAATTGCTACTCACCATTGCCGTTGCTAGTGTTGTGGTCT
TCGTTCGACCTGTCTCCCATTTCTTCGTCTCTACTCCGGCCGGGCTCGCTCTGTACATATTCTCTATCTTTTTCCCCTTAATCTTGATATGGCCTATGTATTACTACTCTCAAAAGCATCCTGTCAATTACATCCTTCTCGCAACATTTACGGTTTTCATGGGATTATCTGTTGGATTAACTTGTGCTTTCACAGCGGGG
AAGGTGATTTTGGAATCGGCCATTTTAACGGCTGTGGTTGTGGTGAGTCTTACGCTTTATACATTCTGGGCAGCGAGAAGGGGTCATGATTTCAGTTTTCTGGCTCCCATTCTCTTCGCTGGATTCATGGTTCTACTCGTCTTTATTCTGATTCAGCTAATTGTTCCGCTGGGGAGGCTGTCTGTGATGATATATGGGGC
GCTGGCTTCCATCATATTCAGCGGGTTCATAATTTACGACACAGATAATCTGATAAAGCGGTATTCATATGATGAATATATATGGGCCGCAGTTGCCTTGTATTTGGACATCATTAATCTTTTCCTCTCTCTGCTCACGCTCCTGCGCGCCTCCAACAGTTAATACTATCGCCCATATGTACAGAGAAGATTTAATTCTT
TATATGTGTATTATTAGCTTATGCGAATTATAGTATGGAATACGCTCTTTTTGTTTTGGACAAATCATTATGAATGATCCGTGTAAAGTAGTAGAGACTTCAAATTACGAGACTCTCTTTTTTGAAAAATAGTTACCTCGATTTAAGAAGGTAGAGAAGTCAGATTTGCTAAATTGGAATTAATTGTTTACTTTTAAAAA
AAAAATAGTTACC

>TRINITY_DN103091_c0_g1_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:

TTAACTTGTGCTTTCACAGCGGgtaagcctgttattttaaattctttgtcagttactctggaattctggtatctctgtttccggctttgtttcttattttggctatgaatctgttaatttgttatattaatgtgacggaaatatgaaacagGGAAGGTGATTTTGGAATCGGCCATTTTAACGGCTGTGGTTGTGGTGAG
TCTTACGCTTTATACATTCTGGGCAGCGAGAAGGGGTCATGATTTCAGTTTTCTGGCTCCCATTCTCTTCGCTGGATTCATGGTTCTACTCGTCTTTATTCTGATTCAGCTAATTGTTCCGCTGGGGAGGCTGTCTGTGATGATATATGGGGCGCTGGCTTCCATCATATTCAGCGGGTTCATAATTTACGACACAGATA
ATCTGATAAAGCGGTATTCATATGATGAATATATATGGGCCGCAGTTGCCTTGTATTTGGACATCATTAATCTTTTCCTCTCTCTGCTCACGCTCCTGCGCGCCTCCAACAGTTAATACTATCGCCCATATGTACAGAGAAGATTTAATTCTTTATATGTGTATTATTAGCTTATGCGAATTATAGTATGGAATACGCTC
TTTTTGTTTTGGACAAATCATTATGAATGATCCGTGTAAAGTAGTAGAGACTTCAAATTACGAGACTCTCTTTTTTGAAAAATAGTTACCTCGATTTAAGAAGGTAGAGAAGTCAGATTTGCTAAATTGGAATTAATTGTTTACTTTTAAAAAAAAAATAGTTACC