sp|Q9FLM8|NRPBC_ARATH ----> DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 12

Intron 1 GTATGTCATT ... ATTCTCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	57.53	7	12	7
A2	27.27	8	2	4
A3	52.38	5	11	0
A4	36.94	11	8	5
A5	33.33	7	7	0
A6	28.77	68	39	16
A7	28.61	63	39	11.5
A8	34.41	40	30	12
A9	44.44	30	30	18
A10	44.61	27	20	23.5

>TRINITY_DN40473_c0_g2_i7 from sample A9 / Example spliced isoform

AAAAAATTAGGTAAATTTCACCCCAAACAAAAATCCTCAAACGATGAACGGAATTCTTGAGCGCTTAAAGTTTGAAGAGTCATTAGAGTGGAAGCTTCGAGTGATAAACTATGCTATAAATTGAGAAATTTAGATCACTCTTGCCATTTTGCTAGATTCACGCAGCGAGCTCCCAAATAAGGCTCGAAGTTATCTCCGCA
ACACGCAATTGCCAAACTTTCATCTGCAATACGATCTCCACCCTAAATCAGTTTGATAGACCACTGTGAGAATTCTTCTATTCAATAGACAGTGTTTAAAGTTTATTCTTACCGCTAGCAGGTGCAGAGCAAAAGGCCTTAAGCTACCATGGATGGACCTGCAGCGCCTGAGCCTGTAAGTTACATTTGTGGAGACTGTG
GAGCTGAGAATTCACTAAAGCCTGGTGATGTAATTCAGTGCAGAGAATGTGGTTATCGCATCCTGTACAAGAAACGTACTAGAAGAATTGTTCAATATGAAGCTCGCTGAGATAATTTTGTAATGATCACACTGAACATTGAGAGCATGCTTTGGAACATTTCTAGATTCGGGGATGGATGTGAATGTAAACTTTGATGT
CACACTACGGAAACTTAAAAGACTTTTAGTTGATAGTTCTGTTTTTGTTGCCACTTCATACATATTTGAGTTGGTTTGAAGAACATTATTATATTATGTAACAGGTTGCTTGTTCAATGTTTTAAGGAGAACTTGTACAAAGAATTTCATTTGATAATTTTATCTTTGTTAGT

>TRINITY_DN40473_c0_g2_i3 from sample A9 / Example unspliced isoform:

AAAAAATTAGGTAAATTTCACCCCAAACAAAAATCCTCAAACGATGAACGGAATTCTTGAGCGCTTAAAGTTTGAAGAGTCATTAGAGTGGAAGCTTCGAGTGATAAACTATGCTATAAATTGAGAAATTTAGATCACTCTTGCCATTTTGCTAGATTCACGCAGCGAGCTCCCAAATAAGGCTCGAAGTTATCTCCGCA
ACACGCAATTGCCAAACTTTCATCTGCAATACGATCTCCACCCTAAATCAGgtatgtcatttactactcatatttttgtccgtgatacctacttccaagatattgttcttcataattttcttaaggttaccggatttctgagctcttaagccctgagactaggctgcacttctattctctcagTTTGATAGACCACTGTG
AGAATTCTTCTATTCAATAGACAGTGTTTAAAGTTTATTCTTACCGCTAGCAGGTGCAGAGCAAAAGGTTAGTGGGTTTGAGTTAGGGTTTTTAAGTGGTAGGGTTTGATGCGATCTTCAATTGCTAGTTGGGGCTTGTTTTCCCCCTCTTCTTAAAATACCTTCACTATTCTTTATTGGTCTGAAACAAAGTAGAATTC
TCACTCTTCTTGTTTTTTGGTTCTTCAAAATTTTCCTTTTTTGCATCAGGTGATAACTTGCATTTTGAGGTCACAATTCCATTTAATTATATTCTTTATGGAATTGTAATTGTAGCGTAATGATTTCTGTCATTGTATCCTACAGGCCTTAAGCTACCATGGATG

Intron 2 GTTAGTGGGT ... TATCCTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	9.6	24	2	0
A2	10.74	20.7	2	0
A3	0	23.7	0	0
A4	27.39	24.3	7	0
A5	0	10.7	0	0
A6	1.81	249.7	4	1
A7	3.06	186.3	5	0
A8	3.99	167.3	6	0
A9	5.74	212.7	11	0
A10	6.67	139	9	0

>TRINITY_DN40473_c0_g2_i2 from sample A9 / Example spliced isoform

AAAAAATTAGGTAAATTTCACCCCAAACAAAAATCCTCAAACGATGAACGGAATTCTTGAGCGCTTAAAGTTTGAAGAGTCATTAGAGTGGAAGCTTCGAGTGATAAACTATGCTATAAATTGAGAAATTTAGATCACTCTTGCCATTTTGCTAGATTCACGCAGCGAGCTCCCAAATAAGGCTCGAAGTTATCTCCGCA
ACACGCAATTGCCAAACTTTCATCTGCAATACGATCTCCACCCTAAATCAGGTATGTCATTTACTACTCATATTTTTGTCCGTGATACCTACTTCCAAGATATTGTTCTTCATAATTTTCTTAAGGTTACCGGATTTCTGAGCTCTTAAGCCCTGAGACTAGGCTGCACTTCTATTCTCTCAGTTTGATAGACCACTGTG
AGAATTCTTCTATTCAATAGACAGTGTTTAAAGTTTATTCTTACCGCTAGCAGGTGCAGAGCAAAAGGCCTTAAGCTACCATGGATGGACCTGCAGCGCCTGAGCCTGTAAGTTACATTTGTGGAGACTGTGGAGCTGAGAATTCACTAAAGCCTGGTGATGTAATTCAGTGCAGAGAATGTGGTTATCGCATCCTGTAC
AAGAAACGTACTAGAAGAATTGTTCAATATGAAGCTCGCTGAGATAATTTTGTAATGATCACACTGAACATTGAGAGCATGCTTTGGAACATTTCTAGATTCGGGGATGGATGTGAATGTAAACTTTGATGTCACACTACGGAAACTTAAAAGACTTTTAGTTGATAGTTCTGTTTTTGTTGCCACTTCATACATATTTG
AGTTGGTTTGAAGAACATTATTATATTATGTAACAGGTTGCTTGTTCAATGTTTTAAGGAGAACTTGTACAAAGAATTTCATTTGATAATTTTATCTTTGTTAGT

>TRINITY_DN40473_c0_g2_i3 from sample A9 / Example unspliced isoform:

AAAAAATTAGGTAAATTTCACCCCAAACAAAAATCCTCAAACGATGAACGGAATTCTTGAGCGCTTAAAGTTTGAAGAGTCATTAGAGTGGAAGCTTCGAGTGATAAACTATGCTATAAATTGAGAAATTTAGATCACTCTTGCCATTTTGCTAGATTCACGCAGCGAGCTCCCAAATAAGGCTCGAAGTTATCTCCGCA
ACACGCAATTGCCAAACTTTCATCTGCAATACGATCTCCACCCTAAATCAGGTATGTCATTTACTACTCATATTTTTGTCCGTGATACCTACTTCCAAGATATTGTTCTTCATAATTTTCTTAAGGTTACCGGATTTCTGAGCTCTTAAGCCCTGAGACTAGGCTGCACTTCTATTCTCTCAGTTTGATAGACCACTGTG
AGAATTCTTCTATTCAATAGACAGTGTTTAAAGTTTATTCTTACCGCTAGCAGGTGCAGAGCAAAAGgttagtgggtttgagttagggtttttaagtggtagggtttgatgcgatcttcaattgctagttggggcttgttttccccctcttcttaaaataccttcactattctttattggtctgaaacaaagtagaattc
tcactcttcttgttttttggttcttcaaaattttccttttttgcatcaggtgataacttgcattttgaggtcacaattccatttaattatattctttatggaattgtaattgtagcgtaatgatttctgtcattgtatcctacagGCCTTAAGCTACCATGGATG

Intron 3 GTATCTTTAC ... GATATTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	18.66	109	0	25
A2	18.85	99	0	23
A3	26.24	149	0	53
A4	13.83	81	0	13
A5	14.67	64	1	11
A6	20.65	1395	0	363
A7	21.9	977	2	274
A8	20.41	998	1	256
A9	20.51	1089	0	281
A10	21.14	675	0	181

>TRINITY_DN104829_c0_g2_i2 from sample A3 / Example spliced isoform

GTCATTAGAGTGGAAGCTTCGAGTGATAAACTATGCTATAAATTGAGAAATTTAGATCACTCTTGCCATTTTGCTAGATTCACGCAGCGAGCTCCCAATTAAGGCTCGAAGTTATCTCCGCAACACGCAATTGCCAAACTTTCATCTGCAATACGATCTCCACCCTAAATCAGGCCTTAAGCTACCATGGATGGACCTGC
AGCGCCTGAGCCTGTAAGTTACATTTGTGGAGACTGTGGAGCTGAGAATTCACTAAAGCCTGGTGATGTAATTCAGTGCAGAGAATGTGGTTATCGCATCCTGTACAAGAAACGTACTAGAAGAATTGTTCAATATGAAGCTCGCTGAGATAATTTTGTAATGATCACACTGAACATTGAGAGCATGCTTTGGAACATTT
CTAGATTCGGGGATGGATGTGAATGTAAACTTTGATGTCACACTACGGAAACTTAAAAGACTTTTAGTTGATAGTTCTGTTTTTGTTGCCACTTCATACATATTTGAGTTGGTTTGAAGAACATTATTATATTATGTAAATCAGGTTGCTTGTTCAATGTTTTTAGAAGAACTTGTACAAAGAATTTCAGTTGATAATTT
CAG

>TRINITY_DN104829_c0_g2_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GCCTGTAAGTTACATTTGTGGAGgtatctttacttccctggctaagattgctaaagcctctagtagtttttattcctgaacatgtaaacattatatgtattaggataagagatttcccttattgcgttttgttgtttctaagttgggcattcttcttacacttgtatgatattgcagACTGTGGAGCTGAGAATTCACTA
AAGCCTGGTGATGTAATTCAGTGCAGAGAATGTGGTTATCGCATCCTGTACAAGAAACGTACTAGAAGAATTGTTCAATATGAAGCTCGCTGAGATAATTTTGTAATGATCACACTGAACATTGAGAGCATGCTTTGGAACATTTCTAGATTCGGGGATGGATGTGAATGTAAACTTTGATGTCACACTACGGAAACTTA
AAAGACTTTTAGTTGATAGTTCTGTTTTTGTTGCCACTTCATACATATTTGAGTTGGTTTGAAGAACATTATTATATTATGTAAATCAGGTTGCTTGTTCAATGTTTTTAGAAGAACTTGTACAAAGAATTTCAGTTGATAATTTCAG

Intron 4 GTATGTCATT ... TATCCTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	28.57	80	12	32
A2	22.22	77	2	22
A3	25.78	95	8	33
A4	33.33	58	8	29
A5	15	68	7	12
A6	22.35	1053	40	303
A7	21.39	801	47	218
A8	20.69	805	25	210
A9	23.77	850	28	265
A10	22.7	572	19	168

>TRINITY_DN40393_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform

CGAAGTTGAAAGAAAAGGGTAAATTTCATCTTGTTTGAAAAAAATTAGGTAAATTTCACCCCAAACAAAAATCCTCAAACGATGAACGGAATTCTTGAGCGCTTAAGTTTGACGAGTCATTAGAGTGGAAGCTTCGAGTGATAAACTATGCTATAAATTGAGAAATTTAGATCACTCTTGCCATTTTGCTAGATTCACGC
AGCGAGCTCCCAATTAAGGCTCGAAGTTATCTCCGCAACACGCAATTGCCAAACTTTCATCTGCAATACGATCTCCACCCTAAATCAGGCCTTAAGCTACCATGGATGGACCTGCAGCGCCTGAGCCTGTAAGTTACATTTGTGGAGACTGTGGAGCTGAGAATTCACTAAAGCCTGGTGATGTAATTCAGTGCAGAGAA
TGTGGTTATCGCATCCTGTACAAGAAACGTACTAGAAGAATTGTTCAATATGAAGCTCGCTGAGATAATTTTGTAATGATCACACTGAACATTGAGAGCATGCTTTGGAACATTTCTAGATTCGGGGATGGATGTGAATGTAAACTTTGATGTCACACTACGGAAACTTAAAAGACTTTTAGTTGATAGTTCTGTTTTTG
TTGCCACTTCATACATATTTGAGTTGGTTTGAAGAACATTATTATATTATGTAAATCAGGTTGCTTGTTCAATGTTTTTAGAAGAACTTGTACAAAGAATTTCAGTTGATAATTTCAGTTGATAATTTTATCTTTGTTAGTTTTTGTACTGACTTTGTTTATTTCTAAGAATTAGTACTAAATCATTTGAAGTAGCGAAC
AGGGTAAATCTCTTCATGTAAGATATATCAATGAATGGCTTATCTTTAGGAATTCACGAGGAAATTTCCAAAATGATTTAATACAATGTGCATCAACGAAATTTTTGTTACGTATAGTTGGCTTTTATTATTCAAGAACTGAATCTTGTCTCTGTTTAAGTCTGAGGTGAATGGAAAATTGA

>TRINITY_DN40393_c0_g1_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CGAAGTTGAAAGAAAAGGGTAAATTTCATCTTGTTTGAAAAAAATTAGGTAAATTTCACCCCAAACAAAAATCCTCAAACGATGAACGGAATTCTTGAGCGCTTAAGTTTGACGAGTCATTAGAGTGGAAGCTTCGAGTGATAAACTATGCTATAAATTGAGAAATTTAGATCACTCTTGCCATTTTGCTAGATTCACGC
AGCGAGCTCCCAATTAAGGCTCGAAGTTATCTCCGCAACACGCAATTGCCAAACTTTCATCTGCAATACGATCTCCACCCTAAATCAGgtatgtcatttactactcatatttttgtccgtgatacctacttccaagatattgttcttcataattttcttaaggttaccggatttctgagctcttaagccctgagactagg
ctgcacttctattctctcagtttgatagaccactgtgagaattcttctattcaatagacagtgtttaaagtttattcttaccgctagcaggtgcagagcaaaaggttagtaggtttgagttagggtttttaagtggtagggtttgatgcgatcttcaattgctagttggggtttgttttccccctcttcttaaaatacct
tcactattctttattggtctgaaacaaagtagaattctcactcttcttgttttttggttcttcaaaattttcctgtttttgcttcaggtgataacttgcattttgaggtcacaattccatttaattatattctttatggaattgtaattgtagcgtaatgatttctgtcatttgtaattgtagcgtaatgatttctgtca
ttgtatcctacagGCCTTAAGCTACCATGGATGGACCTGCAGCGCCTGAGCCTGTAAGTTACATTTGTGGAGACTGTGGAGCTGAGAATTCACTAAAGCCTGGTGATGTAATTCAGTGCAGAGAATGTGGTTATCGCATCCTGTACAAGAAACGTACTAGAAGAATTGTTCAATATGAAGCTCGCTGAGATAATTTTGTA
ATGATCACACTGAACATTGAGAGCATGCTTTGGAACATTTCTAGATTCGGGGATGGATGTGAATGTAAACTTTGATGTCACACTACGGAAACTTAAAAGACTTTTAGTTGATAGTTCTGTTTTTGTTGCCACTTCATACATATTTGAGTTGGTTTGAAGAACATTATTATATTATGTAAATCAGGTTGCTTGTTCAATGT
TTTTAGAAGAACTTGTACAAAGAATTTCAGTTGATAATTTCAGTTGATAATTTTATCTTTGTTAGTTTTTGTACTGACTTTGTTTATTTCTAAGAATTAGTACTAAATCATTTGAAGTAGCGAACAGGGTAAATCTCTTCATGTAAGATATATCAATGAATGGCTTATCTTTAGGAATTCACGAGGAAATTTCCAAAATG
ATTTAATACAATGTGCATCAACGAAATTTTTGTTACGTATAGTTGGCTTTTATTATTCAAGAACTGAATCTTGTCTCTGTTTAAGTCTGAGGTGAATGGAAAATTGA

Intron 5 GTTAGTGGGT ... TATCCTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	50	31	2	31
A2	45.36	26.5	2	22
A3	50	31	0	31
A4	47.18	32.5	7	29
A5	52	12	0	13
A6	48.4	306	4	287
A7	47.33	231.5	5	208
A8	49.2	206.5	6	200
A9	48.7	265.5	11	252
A10	48.47	167	9	157

>TRINITY_DN40271_c1_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform

TAAGGCTCGAAGTTATCTCCGCAACACGCAATTGCCAAACTTTCATCTGCAATACGATCTCCACTCTAAATCAGTTTGATAGACCACTGTGAGAATTCTTCTATTCAATAGACAGTGTTTAAAGTTTATTCTTACCGCTAGCAGGTGCAGAGCAAAAGGCCTTAAGCTACCATGGATGGACCTGCAGCGCCTGAGCCTGT
AAGTTACATTTGTGGAGACTGTGGAGCTGAGAATTCACTAAAGCCTGGTGATGTAATTCAGTGCAGAGAATGTGGTTATCGCATCCTGTACAAGAAACGTACTAGAAGAATTGTTCAATATGAAGCTCGCTGAGATAATTTTGTAATGATCACACTGAACATTGAGAGCATGCTTTGGAACATTTCTAGATTCGGGGATG
GATGTGAATGTAAACTTTGATGTCACACTACGGAAACTTAAAAGACTTCTAGTTGATAGTTCTGTTTTTGTTGCCACTTCATACATATTTGAGTTGGTTTGAAGAACATTATTATATTATGTAA

>TRINITY_DN40271_c1_g1_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CCAAGATATTGTTCTTCATAATTTTCTTAAGGTTACCGGATTTCTGAGCTCTTAAGGCCTGAGACTAGGCTGCACTTCTATTCTCTCAGTTTGATAGACCACTGTGAGAATTCTTCTATTCAATAGACAGTGTTTAAAGTTTATTCTTACCGCTAGCAGGTGCAGAGCAAAAGgttagtgggtttgagttagggttttta
agtggtagggtttgatgcgatcttcaattgctagttggggtttgttttccccctcttcttaaaataccttcactattctttattggtctgaaacaaagtagaattctcactcttcttgttttttggttcttcaaaattttcctgtttttgcttcaggtgataacttgcattttgaggtcacaattccatttaattacatt
ctttatggaattgtaattgtagcgtaatgatttatgtcattgtatcctacagGCCTTAAGCTACCATGGATGGACCTGCAGCGCCTGAGCCTGTAAGTTACATTTGTGGAGACTGTGGAGCTGAGAATTCACTAAAGCCTGGTGATGTAATTCAGTGCAGAGAATGTGGTTATCGCATCCTGTACAAGAAACGTACTAGA
AGAATTGTTCAATATGAAGCTCGCTGAGATAATTTTGTAATGATCACACTGAACATTGAGAGCATGCTTTGGAACATTTCTAGATTCGGGGATGGATGTGAATGTAAACTTTGATGTCACACTACGGAAACTTAAAAGACTTCTAGTTGATAGTTCTGTTTTTGTTGCCACTTCATACATATTTGAGTTGGTTTGAAGAA
CATTATTATATTATGTAA

Intron 6 GTATGTCATT ... AGAGCAAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	32.78	67.3	10.3	31
A2	28.86	66.7	2	26
A3	28.85	80.7	9	31
A4	42.36	46.3	6.3	31
A5	18.7	56.7	5.7	12
A6	26.05	907	28.7	305.3
A7	25.68	694.3	32	230.3
A8	23.56	701.3	19.7	208
A9	27.99	728	23.3	269.7
A10	26.29	495.7	16.3	169.7

>TRINITY_DN40393_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform

CGAAGTTGAAAGAAAAGGGTAAATTTCATCTTGTTTGAAAAAAATTAGGTAAATTTCACCCCAAACAAAAATCCTCAAACGATGAACGGAATTCTTGAGCGCTTAAGTTTGACGAGTCATTAGAGTGGAAGCTTCGAGTGATAAACTATGCTATAAATTGAGAAATTTAGATCACTCTTGCCATTTTGCTAGATTCACGC
AGCGAGCTCCCAATTAAGGCTCGAAGTTATCTCCGCAACACGCAATTGCCAAACTTTCATCTGCAATACGATCTCCACCCTAAATCAGGCCTTAAGCTACCATGGATGGACCTGCAGCGCCTGAGCCTGTAAGTTACATTTGTGGAGACTGTGGAGCTGAGAATTCACTAAAGCCTGGTGATGTAATTCAGTGCAGAGAA
TGTGGTTATCGCATCCTGTACAAGAAACGTACTAGAAGAATTGTTCAATATGAAGCTCGCTGAGATAATTTTGTAATGATCACACTGAACATTGAGAGCATGCTTTGGAACATTTCTAGATTCGGGGATGGATGTGAATGTAAACTTTGATGTCACACTACGGAAACTTAAAAGACTTTTAGTTGATAGTTCTGTTTTTG
TTGCCACTTCATACATATTTGAGTTGGTTTGAAGAACATTATTATATTATGTAAATCAGGTTGCTTGTTCAATGTTTTTAGAAGAACTTGTACAAAGAATTTCAGTTGATAATTTCAGTTGATAATTTTATCTTTGTTAGTTTTTGTACTGACTTTGTTTATTTCTAAGAATTAGTACTAAATCATTTGAAGTAGCGAAC
AGGGTAAATCTCTTCATGTAAGATATATCAATGAATGGCTTATCTTTAGGAATTCACGAGGAAATTTCCAAAATGATTTAATACAATGTGCATCAACGAAATTTTTGTTACGTATAGTTGGCTTTTATTATTCAAGAACTGAATCTTGTCTCTGTTTAAGTCTGAGGTGAATGGAAAATTGA

>TRINITY_DN40393_c0_g1_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CGAAGTTGAAAGAAAAGGGTAAATTTCATCTTGTTTGAAAAAAATTAGGTAAATTTCACCCCAAACAAAAATCCTCAAACGATGAACGGAATTCTTGAGCGCTTAAGTTTGACGAGTCATTAGAGTGGAAGCTTCGAGTGATAAACTATGCTATAAATTGAGAAATTTAGATCACTCTTGCCATTTTGCTAGATTCACGC
AGCGAGCTCCCAATTAAGGCTCGAAGTTATCTCCGCAACACGCAATTGCCAAACTTTCATCTGCAATACGATCTCCACCCTAAATCAGgtatgtcatttactactcatatttttgtccgtgatacctacttccaagatattgttcttcataattttcttaaggttaccggatttctgagctcttaagccctgagactagg
ctgcacttctattctctcagtttgatagaccactgtgagaattcttctattcaatagacagtgtttaaagtttattcttaccgctagcaggtgcagagcaaaagGCCTTAAGCTACCATGGATGGACCTGCAGCGCCTGAGCCTGTAAGTTACATTTGTGGAGACTGTGGAGCTGAGAATTCACTAAAGCCTGGTGATGT
AATTCAGTGCAGAGAATGTGGTTATCGCATCCTGTACAAGAAACGTACTAGAAGAA

Intron 7 GTTAGTAGGT ... TATCCTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	50.79	31	2	32
A2	45.83	26	2	22
A3	51.56	31	0	33
A4	48.33	31	7	29
A5	50	12	0	12
A6	49.92	304	4	303
A7	48.77	229	5	218
A8	50.24	208	6	210
A9	49.63	269	11	265
A10	50.15	167	9	168

>TRINITY_DN40393_c0_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoform

CGAAGTTGAAAGAAAAGGGTAAATTTCATCTTGTTTGAAAAAAATTAGGTAAATTTCACCCCAAACAAAAATCCTCAAACGATGAACGGAATTCTTGAGCGCTTAAGTTTGACGAGTCATTAGAGTGGAAGCTTCGAGTGATAAACTATGCTATAAATTGAGAAATTTAGATCACTCTTGCCATTTTGCTAGATTCACGC
AGCGAGCTCCCAATTAAGGCTCGAAGTTATCTCCGCAACACGCAATTGCCAAACTTTCATCTGCAATACGATCTCCACCCTAAATCAGGTATGTCATTTACTACTCATATTTTTGTCCGTGATACCTACTTCCAAGATATTGTTCTTCATAATTTTCTTAAGGTTACCGGATTTCTGAGCTCTTAAGCCCTGAGACTAGG
CTGCACTTCTATTCTCTCAGTTTGATAGACCACTGTGAGAATTCTTCTATTCAATAGACAGTGTTTAAAGTTTATTCTTACCGCTAGCAGGTGCAGAGCAAAAGGCCTTAAGCTACCATGGATGGACCTGCAGCGCCTGAGCCTGTAAGTTACATTTGTGGAGACTGTGGAGCTGAGAATTCACTAAAGCCTGGTGATGT
AATTCAGTGCAGAGAATGTGGTTATCGCATCCTGTACAAGAAACGTACTAGAAGAA

>TRINITY_DN40393_c0_g1_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CGAAGTTGAAAGAAAAGGGTAAATTTCATCTTGTTTGAAAAAAATTAGGTAAATTTCACCCCAAACAAAAATCCTCAAACGATGAACGGAATTCTTGAGCGCTTAAGTTTGACGAGTCATTAGAGTGGAAGCTTCGAGTGATAAACTATGCTATAAATTGAGAAATTTAGATCACTCTTGCCATTTTGCTAGATTCACGC
AGCGAGCTCCCAATTAAGGCTCGAAGTTATCTCCGCAACACGCAATTGCCAAACTTTCATCTGCAATACGATCTCCACCCTAAATCAGGTATGTCATTTACTACTCATATTTTTGTCCGTGATACCTACTTCCAAGATATTGTTCTTCATAATTTTCTTAAGGTTACCGGATTTCTGAGCTCTTAAGCCCTGAGACTAGG
CTGCACTTCTATTCTCTCAGTTTGATAGACCACTGTGAGAATTCTTCTATTCAATAGACAGTGTTTAAAGTTTATTCTTACCGCTAGCAGGTGCAGAGCAAAAGgttagtaggtttgagttagggtttttaagtggtagggtttgatgcgatcttcaattgctagttggggtttgttttccccctcttcttaaaatacct
tcactattctttattggtctgaaacaaagtagaattctcactcttcttgttttttggttcttcaaaattttcctgtttttgcttcaggtgataacttgcattttgaggtcacaattccatttaattatattctttatggaattgtaattgtagcgtaatgatttctgtcatttgtaattgtagcgtaatgatttctgtca
ttgtatcctacagGCCTTAAGCTACCATGGATGGACCTGCAGCGCCTGAGCCTGTAAGTTACATTTGTGGAGACTGTGGAGCTGAGAATTCACTAAAGCCTGGTGATGTAATTCAGTGCAGAGAATGTGGTTATCGCATCCTGTACAAGAAACGTACTAGAAGAATTGTTCAATATGAAGCTCGCTGAGATAATTTTGTA
ATGATCACACTGAACATTGAGAGCATGCTTTGGAACATTTCTAGATTCGGGGATGGATGTGAATGTAAACTTTGATGTCACACTACGGAAACTTAAAAGACTTTTAGTTGATAGTTCTGTTTTTGTTGCCACTTCATACATATTTGAGTTGGTTTGAAGAACATTATTATATTATGTAAATCAGGTTGCTTGTTCAATGT
TTTTAGAAGAACTTGTACAAAGAATTTCAGTTGATAATTTCAGTTGATAATTTTATCTTTGTTAGTTTTTGTACTGACTTTGTTTATTTCTAAGAATTAGTACTAAATCATTTGAAGTAGCGAACAGGGTAAATCTCTTCATGTAAGATATATCAATGAATGGCTTATCTTTAGGAATTCACGAGGAAATTTCCAAAATG
ATTTAATACAATGTGCATCAACGAAATTTTTGTTACGTATAGTTGGCTTTTATTATTCAAGAACTGAATCTTGTCTCTGTTTAAGTCTGAGGTGAATGGAAAATTGA