NA ----> NA


Intron 1 GTATGCTAAC ... TTTTATGCAG

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>TRINITY_DN108043_c1_g1_i4 from sample A2 / Example spliced isoform
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AGACGAGGAATAAAATACAAAACCACCTTTCATACGGAAAACGAAGGAATTTGACTGCATTTATTCGTTACTTCAAAGGAAGACGACTAGATCTGCCTGAGCGACGAACTGTCCCGGAAGAAAATCAGCTAAAAAATCCGTATGACGAGCGATGCCACACGTCGGCGGTGGTCATAGCTGCCGAAGAAGGAGCACACGAG
AGTCTGGTTTCGCCCCGGCACTTAATATTGCAAATTCCACATTAAAGGGCATCCCGCCGTACCCCCATGAGCCACCCTGTTTTATACTCCCGAATCGAATACCATGAAATTGGCATGCCTCCCAGACTATATTTTCACCGATTGTGGGGCCTCTCAGGCAAGCCGATCGTCAATTGCTGCAGGAAGCTCAGGAATTCCTA
TTGCAGATGGAGGCCAGTGCCGATATATTTGTCACCCAATTGTCCAAATTATTCTCAGCTATGGCGAGCCAGTGAGAATTATTTAAAGCTCGGTGGCAGGAGCAACGGCATGGCGGAGATTTTTGCGAAGGCGAAGAATGTGAGGGTGGTGTTCCTGATCTTAGGGGTTTTACATGTGTTGATGCTTGTTGGGGTCGCAC
TTGTTTGCCATGGATGCCCCAGCGAATTGGTGGTTCCTGCGGCCATAATCGGGACTGCTTCGGCGGTGCGGTTATTTTGGATGTTTGGCAGCGGCATTGCTCAGGCGGCCACGGCGTCCACTATGTTGGTTCAGCAGAGAGACAATACTGTTGTCGATAATGCCTTACGACACCGGCGCCGGATTATATACAAACGTTGG
CTTTGGTGGAGTAGAATTGGAATACTTGTGATGGCAATGCAAATTGTAGGAGCAACTTATCTGGCTATTGTTGTTATTAAGAAAGCAATGAATGGGCATAATTCATCTAGTTGCTATCCAGGTCATGATGGTCATGTGGGAGAGCGGAAGCAGATTCTAGTTGTTTTCCTTCTGATTATGGCATGGATTTCAGCAATTGC
ACAATGCTGTGCTGGATCAAATGTTTTAGCATGGAGGTCATTTTATGCAACACATGATGGAGCTTGGAAAGCCCATTACCGTGAAATTTTTGACCATGGTATTCGAGAAGTATTATGCTGCCTTGGAAGGGCCCAATATTTGAGTGCTTTGGAGGAGGATGAAGTTCACTCCGTGGCCGGACTTTTGGGTGACCTTGTAG
CATATCGTGCAGCTGGTGCTGGCCATTTGGAGTTTCTTGCAGGAATTGCTCTGCTGCAGAGACAGACAACAACATTGCCTTCATTGGAGAATTTGGAGCAGTTTATCGAGGCACCTGAAGACCAAATTCAAGAAGCTGTAGTCCTGCATCCTTTTGCTGAAGCTGCGTATACTGGTCCCCTGCTGGATGTTGGAAGGAAT
CCGATTATATTTCCATGTGCATGGCTATATCGGCAGGGAGTTTTGACCCCTTGGAGCCGGAACAGGAGACCTATATTGCAAGGTGACAATTGGTGGCGGGGTCACGCGGCAGCATATCTGAAATTTGTTAGTCTACCTCCTGATGCCCTGCGCAAAGGGCGTGTTCATCAAGCACAACGGGAAGCTGCATATTTTGCTGT
GGTTGTGCACCACTTACAGTGTGTTGTCATTGCGGTTAGAGGAACTGAAACTCCCGAAGATCTTTTGACAGATGTTCTCTGTAGGGAATGTGTGCTGTCAGAAGCAGACTTGGATGGACTGCTTAATAGCAATATCTTGGATGATAATGTAAAGCAACGTGTTGCCACAACATTCCCCCATTTTGGGCATTCAGGCATAG
TTGAAGCAGCTAGGGAGCTTTGTATGCAATTAGACGGAAACATGGAAGATGTAGATCAGATACCTTTAGATCAAACCTGTGAGAGTAACAATGTACCTGGAGGTTCTCAAGATGCATCATCTCATCGAACAAAAGGATTCCTTTCTTCTATATTGGAGCCTGGTGGAGAGTGTCATGGGTATGCATTGCGATTTGTTGGG
CATTCTTTGGGTGGTGCAATTGGTGCGTTAGCAGGGATAATGTTACACAAACGGTACCCAAACTTGCATGTGTATACATATGGTGTACTCCCCTGTGTAGATGCAGTCATAGCTGATGCATGTTCGAGCTTTGTAACAAGTATCATTTATAATGATGAGTTCTCGTCACGGCTTTCGGTGACTTCAATGCTTCGTTTGCG
AGCAGCAGCACTTGCAGCACTTGCAGCAGATTCTTCTACAGATTCTGCTATGATATCAAAACTTGCCAGGCGCCTTTTGCATGCAAATAAATATCTTTGGGGTACAAACTGTAAGGAGGATTCTGTGCAGACATCCCAATCAGGCACCATGCAGACATCCCAATCAGGTTCCATGGTCCCAAGGGGTAAGAATTGGAGAC
AGAAGCAGAGACATTTTAAGTACAAGATAAAAGGTGGGATCTTCCTCTGTATCCATGCAACTTCGTGCATGGCGAAAATGTCAAATCATAGTTCTACTCATCCTAGGAGGAATCCTGTTAAGTTTAAATTGCATACATCATTTGAGGGCGATTTGCTGAATGATGGAAAACATTGTGATATAATTGTTGATGCTGCACAG
ATTGAAGGGTGCCTATCTTTTGAGAATAAAACACCCAAGCATGCAAGTAGTTCTGATAAACAGACATCTGCATTGGCTGCAGGTGCTGAAGCAAGGGACAAAATTTCCTTTGATGAGTGTACAGTGTTAATTGAGGATTCTGACACAGAGAATCATGGCAACAATCAGCAAGATGCTAGCTATAAAGACGATGTTTATTC
TAATGAGTTGCATGTGCACTCTACAGAGTTAACAACAGAGAATGCCACTTATGGAGATTCAATAACCCAACATGCAGATACAAATGTGGGCCCCGATGTGTCAGAGATAGAGCCAGTAGAGATGTTTGTTCCTGGCTTGGTTATCCATATCATTCCAGAAGCTAAGCAGACTGTATGGCCGTCATGGAAAAATCTGAACT
GGCTTCATCGTAAGGATGCATCTCACAGAGCTATTTTAAGAGATAGGGAAAGCTTCAAGGACATTATCGTTTCACCCTCCATGTTTCTTGACCATGTGCCATGGAGGTGTCACTATGCAATGCAAAAGGTTCTAGAAACATGGAAGTTAAAAGACCATAACAGCAATGACAGGTTGGATGCCAGCCATTTAGTTTGATTC
TTGCTTGTATGGTTGTAGTAGGCAGGCATTCCAGTTTCGTAACTGTGTTATGTGCTTTGGACTCAAGAATTGCTGCTCCTCCAAAGCTTCAAGGTAACTGTTAAGTTGCTTGCATCGAGACATCAACACTTGGCAGAATTCCAATCCAATTAATGATTTCCTCACAGGTGTTTTTTGAAGTGTTCAGGTTAAAATTATGT
ATAATAGCTTTTGTGGATAGGCATTCATGAAATTTGGAATCTCTGATTTGCATTGGTAAGATTGCAAAGAACTAATTTTCCTTATGAGGTACCTTGTATCAGTTGTAGGAAAGATTTGCAAATAATGGATGAGTTGTAGGCACTATTTTCAGCTCTGTTTACAACTCAAGATCTATTATAACAAGGTTTAGCAGAGATTT
GGACGTGTTTGTATATCTCTTAGTCCAATCTGCAGCTCTGTTGGTATAAGTACATTTGGAAGGCCTTTTATTTTCAGAATGCTTTGACAAAGGCATAGTTCATGTAAGAAACTTTTTCATGACCATTGATAAATGTTGTAAGAACATACCAATAAAGGAACAATACATTCCTGTGCTCAAAGGGAGCGTTTTTTGTTCTT
GTAATATTCACATTTATTTCATCAGCCTGCATATATGAGCAGGTTGTGTCATATCTGAAATGAGAAAACTTGATTTGTTTACAATTTTGCATACTTATGTGAACACTGTTACTAATAAAGGCAAACGAGAGACAAAACAGCAAGCTGGTTTGGATTGAAATGGAAAATCTCAAGTTTCTGAATAAGAAATATTTTAGAGT
TTTTGCTACATATGCAAAATTACACACACAAATACCAGTTGGTATATTTACGACATAGATGGCATTGTACTGTATCAAAGTATGGGAGTAAAAGACTCGGAACACTGGTTTCTCATGGCAATCAGCGTGATTTTTGCTGTTTATATGACTAATTCAATGCCATTGCTGACATTAAATGGC


>TRINITY_DN108043_c1_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CGAGGATCCAAGGTGATTCGGTACACCAACTACCAGACGAAATTTAAGATCATAATGAAACCCTGACTAGATTTGAAAATTTGTGCCAATTCTTGCGAGGAAAAAACAATGCTTTTGTTCCAAATGGACCGTCATTCATTAGAAAATATGGGCAATAAAATTCAAAACCACCATACAAAACCACCTTCGTCGGAATTCAA
AGACGAGGAATAAAATACAAAACCACCTTTCATACGGAAAACGAAGGAATTTGACTGCATTTATTCGTTACTTCAAAGGAAGACGACTAGATCTGCCTGAGCGACGAACTGTCCCGGAAGAAAATCAGCTAAAAAATCCGTATGACGAGCGATGCCACACGTCGGCGGTGGTCATAGCTGCCGAAGAAGGAGCACACGAG
AGTCTGGTTTCGCCCCGGCACTTAATATTGCAAATTCCACATTAAAGGGCATCCCGCCGTACCCCCATGAGCCACCCTGTTTTATACTCCCGAATCGAATACCATGAAATTGGCATGCCTCCCAGACTATATTTTCACCGATTGTGGGGCCTCTCAGGCAAGCCGATCGTCAATTGCTGCAGGAAGCTCAGGAATTCCTA
TTGCAGATGGAGGCCAGTGCCGATATATTTGTCACCCAATTGTCCAAATTATTCTCAGCTATGGCGAGCCAGTGAGAATTATTTAAAGCTCGGTGGCAGGAGCAACGGCATGGCGGAGATTTTTGCGAAGGCGAAGAATGTGAGGGTGGTGTTCCTGATCTTAGGGGTTTTACATGTGTTGATGCTTGTTGGGGTCGCAC
TTGTTTGCCATGGATGCCCCAGCGAATTGGTGGTTCCTGCGGCCATAATCGGGACTGCTTCGGCGGTGCGGTTATTTTGGATGTTTGGCAGCGGCATTGCTCAGGCGGCCACGGCGTCCACTATGTTGGTTCAGCAGAGAGACAATACTGTTGTCGATAATGCCTTACGACACCGGCGCCGGATTATATACAAACGTTGG
CTTTGGTGGAGTAGAATTGGAATACTTGTGATGGCAATGCAAATTGTAGGAGCAACTTATCTGGCTATTGTTGTTATTAAGAAAGCAATGAATGGGCATAATTCATCTAGTTGCTATCCAGGTCATGATGGTCATGTGGGAGAGCGGAAGCAGATTCTAGTTGTTTTCCTTCTGATTATGGCATGGATTTCAGCAATTGC
ACAATGCTGTGCTGGATCAAATGTTTTAGCATGGAGGTCATTTTATGCAACACATGATGGAGCTTGGAAAGCCCATTACCGTGAAATTTTTGACCATGGTATTCGAGAAGTATTATGCTGCCTTGGAAGGGCCCAATATTTGAGTGCTTTGGAGGAGGATGAAGTTCACTCCGTGGCCGGACTTTTGGGTGACCTTGTAG
CATATCGTGCAGCTGGTGCTGGCCATTTGGAGTTTCTTGCAGGAATTGCTCTGCTGCAGAGACAGACAACAACATTGCCTTCATTGGAGAATTTGGAGCAGTTTATCGAGGCACCTGAAGACCAAATTCAAGAAGCTGTAGTCCTGCATCCTTTTGCTGAAGCTGCGTATACTgtatgctaactttatgtataatatatt
cgaatccaagcaaactagcaaatttatgtgtggaaagacatatttctgagggcctgttttatgcagGGTCCCCTGCTGGATGTTGGAAG



Intron 2 GTCATGATGG ... TGGATTTCAG

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>TRINITY_DN108043_c1_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoform
CGAGGATCCAAGGTGATTCGGTACACCAACTACCAGACGAAATTTAAGATCATAATGAAACCCTGACTAGATTTGAAAATTTGTGCCAATTCTTGCGAGGAAAAAACAATGCTTTTGTTCCAAATGGACCGTCATTCATTAGAAAATATGGGCAATAAAATTCAAAACCACCATACAAAACCACCTTCGTCGGAATTCAA
AGACGAGGAATAAAATACAAAACCACCTTTCATACGGAAAACGAAGGAATTTGACTGCATTTATTCGTTACTTCAAAGGAAGACGACTAGATCTGCCTGAGCGACGAACTGTCCCGGAAGAAAATCAGCTAAAAAATCCGTATGACGAGCGATGCCACACGTCGGCGGTGGTCATAGCTGCCGAAGAAGGAGCACACGAG
AGTCTGGTTTCGCCCCGGCACTTAATATTGCAAATTCCACATTAAAGGGCATCCCGCCGTACCCCCATGAGCCACCCTGTTTTATACTCCCGAATCGAATACCATGAAATTGGCATGCCTCCCAGACTATATTTTCACCGATTGTGGGGCCTCTCAGGCAAGCCGATCGTCAATTGCTGCAGGAAGCTCAGGAATTCCTA
TTGCAGATGGAGGCCAGTGCCGATATATTTGTCACCCAATTGTCCAAATTATTCTCAGCTATGGCGAGCCAGTGAGAATTATTTAAAGCTCGGTGGCAGGAGCAACGGCATGGCGGAGATTTTTGCGAAGGCGAAGAATGTGAGGGTGGTGTTCCTGATCTTAGGGGTTTTACATGTGTTGATGCTTGTTGGGGTCGCAC
TTGTTTGCCATGGATGCCCCAGCGAATTGGTGGTTCCTGCGGCCATAATCGGGACTGCTTCGGCGGTGCGGTTATTTTGGATGTTTGGCAGCGGCATTGCTCAGGCGGCCACGGCGTCCACTATGTTGGTTCAGCAGAGAGACAATACTGTTGTCGATAATGCCTTACGACACCGGCGCCGGATTATATACAAACGTTGG
CTTTGGTGGAGTAGAATTGGAATACTTGTGATGGCAATGCAAATTGTAGGAGCAACTTATCTGGCTATTGTTGTTATTAAGAAAGCAATGAATGGGCATAATTCATCTAGTTGCTATCCAGCAATTGCACAATGCTGTGCTGGATCAAATGTTTTAGCATGGAGGTCATTTTATGCAACACATGATGGAGCTTGGAAAGC
CCATTACCGTGAAATTTTTGACCATGGTATTCGAGAAGTATTATGCTGCCTTGGAAGGGCCCAATATTTGAGTGCTTTGGAGGAGGATGAAGTTCACTCCGTGGCCGGACTTTTGGGTGACCTTGTAGCATATCGTGCAGCTGGTGCTGGCCATTTGGAGTTTCTTGCAGGAATTGCTCTGCTGCAGAGACAGACAACAA
CATTGCCTTCATTGGAGAATTTGGAGCAGTTTATCGAGGCACCTGAAGACCAAATTCAAGAAGCTGTAGTCCTGCATCCTTTTGCTGAAGCTGCGTATACTGGTCCCCTGCTGGATGTTGGAAGGAATCCGATTATATTTCCATGTGCATGGCTATATCGGCAGGGAGTTTTGACCCCTTGGAGCCGGAACAGGAGACCT
ATATTGCAAGGTGACAATTGGTGGCGGGGTCACGCGGCAGCATATCTGAAATTTGTTAGTCTACCTCCTGATGCCCTGCGCAAAGGGCGTGTTCATCAAGCACAACGGGAAGCTGCATATTTTGCTGTGGTTGTGCACCACTTACAGTGTGTTGTCATTGCGGTTAGAGGAACTGAAACTCCCGAAGATCTTTTGACAGA
TGTTCTCTGTAGGGAATGTGTGCTGTCAGAAGCAGACTTGGATGGACTGCTTAATAGCAATATCTTGGATGATAATGTAAAGCAACGTGTTGCCACAACATTCCCCCATTTTGGGCATTCAGGCATAGTTGAAGCAGCTAGGGAGCTTTGTATGCAATTAGACGGAAACATGGAAGATGTAGATCAGATACCTTTAGATC
AAACCTGTGAGAGTAACAATGTACCTGGAGGTTCTCAAGATGCATCATCTCATCGAACAAAAGGATTCCTTTCTTCTATATTGGAGCCTGGTGGAGAGTGTCATGGGTATGCATTGCGATTTGTTGGGCATTCTTTGGGTGGTGCAATTGGTGCGTTAGCAGGGATAATGTTACACAAACGGTACCCAAACTTGCATGTG
TATACATATGGTGTACTCCCCTGTGTAGATGCAGTCATAGCTGATGCATGTTCGAGCTTTGTAACAAGTATCATTTATAATGATGAGTTCTCGTCACGGCTTTCGGTGACTTCAATGCTTCGTTTGCGAGCAGCAGCACTTGCAGCACTTGCAGCAGATTCTTCTACAGATTCTGCTATGATATCAAAACTTGCCAGGCG
CCTTTTGCATGCAAATAAATATCTTTGGGGTACAAACTGTAAGGAGGATTCTGTGCAGACATCCCAATCAGGCACCATGCAGACATCCCAATCAGGTTCCATGGTCCCAAGGGGTAAGAATTGGAGACAGAAGCAGAGACATTTTAAGTACAAGATAAAAGGTGGGATCTTCCTCTGTATCCATGCAACTTCGTGCATGG
CGAAAATGTCAAATCATAGTTCTACTCATCCTAGGAGGAATCCTGTTAAGTTTAAATTGCATACATCATTTGAGGGCGATTTGCTGAATGATGGAAAACATTGTGATATAATTGTTGATGCTGCACAGATTGAAGGGTGCCTATCTTTTGAGAATAAAACACCCAAGCATGCAAGTAGTTCTGATAAACAGACATCTGCA
TTGGCTGCAGGTGCTGAAGCAAGGGACAAAATTTCCTTTGATGAGTGTACAGTGTTAATTGAGGATTCTGACACAGAGAATCATGGCAACAATCAGCAAGATGCTAGCTATAAAGACGATGTTTATTCTAATGAGTTGCATGTGCACTCTACAGAGTTAACAACAGAGAATGCCACTTATGGAGATTCAATAACCCAACA
TGCAGATACAAATGTGGGCCCCGATGTGTCAGAGATAGAGCCAGTAGAGATGTTTGTTCCTGGCTTGGTTATCCATATCATTCCAGAAGCTAAGCAGACTGTATGGCCGTCATGGAAAAATCTGAACTGGCTTCATCGTAAGGATGCATCTCACAGAGCTATTTTAAGAGATAGGGAAAGCTTCAAGGACATTATCGTTT
CACCCTCCATGTTTCTTGACCATGTGCCATGGAGGTGTCACTATGCAATGCAAAAGGTTCTAGAAACATGGAAGTTAAAAGACCATAACAGCAATGACAGGTTGGATGCCAGCCATTTAGTTTGATTCTTGCTTGTATGGTTGTAGTAGGCAGGCATTCCAGTTTCGTAACTGTGTTATGTGCTTTGGACTCAAGAATTG
CTGCTCCTCCAAAGCTTCAAGGTAACTGTTAAGTTGCTTGCATCGAGACATCAACACTTGGCAGAATTCCAATCCAATTAATGATTTCCTCACAGGTGTTTTTTGAAGTGTTCAGGTTAAAATTATGTATAATAGCTTTTGTGGATAGGCATTCATGAAATTTGGAATCTCTGATTTGCATTGGTAAGATTGCAAAGAAC
TAATTTTCCTTATGAGGTACCTTGTATCAGTTGTAGGAAAGATTTGCAAATAATGGATGAGTTGTAGGCACTATTTTCAGCTCTGTTTACAACTCAAGATCTATTATAACAAGGTTTAGCAGAGATTTGGACGTGTTTGTATATCTCTTAGTCCAATCTGCAGCTCTGTTGGTATAAGTACATTTGGAAGGCCTTTTATT
TTCAGAATGCTTTGACAAAGGCATAGTTCATGTAAGAAACTTTTTCATGACCATTGATAAATGTTGTAAGAACATACCAATAAAGGAACAATACATTCCTGTGCTCAAAGGGAGCGTTTTTTGTTCTTGTAATATTCACATTTATTTCATCAGCCTGCATATATGAGCAGGTTGTGTCATATCTGAAATGAGAAAACTTG
ATTTGTTTACAATTTTGCATACTTATGTGAACACTGTTACTAATAAAGGCAAACGAGAGACAAAACAGCAAGCTGGTTTGGATTGAAATGGAAAATCTCAAGTTTCTGAATAAGAAATATTTTAGAGTTTTTGCTACATATGCAAAATTACACACACAAATACCAGTTGGTATATTTACGACATAGATGGCATTGTACTG
TATCAAAGTATGGGAGTAAAAGACTCGGAACACTGGTTTCTCATGGCAATCAGCGTGATTTTTGCTGTTTATATGACTAATTCAATGCCATTGCTGACATTAAATGGC


>TRINITY_DN108043_c1_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CGAGGATCCAAGGTGATTCGGTACACCAACTACCAGACGAAATTTAAGATCATAATGAAACCCTGACTAGATTTGAAAATTTGTGCCAATTCTTGCGAGGAAAAAACAATGCTTTTGTTCCAAATGGACCGTCATTCATTAGAAAATATGGGCAATAAAATTCAAAACCACCATACAAAACCACCTTCGTCGGAATTCAA
AGACGAGGAATAAAATACAAAACCACCTTTCATACGGAAAACGAAGGAATTTGACTGCATTTATTCGTTACTTCAAAGGAAGACGACTAGATCTGCCTGAGCGACGAACTGTCCCGGAAGAAAATCAGCTAAAAAATCCGTATGACGAGCGATGCCACACGTCGGCGGTGGTCATAGCTGCCGAAGAAGGAGCACACGAG
AGTCTGGTTTCGCCCCGGCACTTAATATTGCAAATTCCACATTAAAGGGCATCCCGCCGTACCCCCATGAGCCACCCTGTTTTATACTCCCGAATCGAATACCATGAAATTGGCATGCCTCCCAGACTATATTTTCACCGATTGTGGGGCCTCTCAGGCAAGCCGATCGTCAATTGCTGCAGGAAGCTCAGGAATTCCTA
TTGCAGATGGAGGCCAGTGCCGATATATTTGTCACCCAATTGTCCAAATTATTCTCAGCTATGGCGAGCCAGTGAGAATTATTTAAAGCTCGGTGGCAGGAGCAACGGCATGGCGGAGATTTTTGCGAAGGCGAAGAATGTGAGGGTGGTGTTCCTGATCTTAGGGGTTTTACATGTGTTGATGCTTGTTGGGGTCGCAC
TTGTTTGCCATGGATGCCCCAGCGAATTGGTGGTTCCTGCGGCCATAATCGGGACTGCTTCGGCGGTGCGGTTATTTTGGATGTTTGGCAGCGGCATTGCTCAGGCGGCCACGGCGTCCACTATGTTGGTTCAGCAGAGAGACAATACTGTTGTCGATAATGCCTTACGACACCGGCGCCGGATTATATACAAACGTTGG
CTTTGGTGGAGTAGAATTGGAATACTTGTGATGGCAATGCAAATTGTAGGAGCAACTTATCTGGCTATTGTTGTTATTAAGAAAGCAATGAATGGGCATAATTCATCTAGTTGCTATCCAGgtcatgatggtcatgtgggagagcggaagcagattctagttgttttccttctgattatggcatggatttcagCAATTGC
ACAATGCTGTGCTGGATCAAATGTTTTAGCATGGAGGTCATTTTATGCAACACATGATGGAGCTTGGAAAGCCCATTACCGTGAAATTTTTGACCATGGTATTCGAGAAGTATTATGCTGCCTTGGAAGGGCCCAATATTTGAGTGCTTTGGAGGAGGATGAAGTTCACTCCGTGGCCGGACTTTTGGGTGACCTTGTAG
CATATCGTGCAGCTGGTGCTGGCCATTTGGAGTTTCTTGCAGGAATTGCTCTGCTGCAGAGACAGACAACAACATTGCCTTCATTGGAGAATTTGGAGCAGTTTATCGAGGCACCTGAAGACCAAATTCAAGAAGCTGTAGTCCTGCATCCTTTTGCTGAAGCTGCGTATACTGTATGCTAACTTTATGTATAATATATT
CGAATCCAAGCAAACTAGCAAATTTATGTGTGGAAAGACATATTTCTGAGGGCCTGTTTTATGCAGGGTCCCCTGCTGGATGTTGGAAG



Intron 3 GTTCATTTAG ... GCATTTGAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A129.45103043
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A1031.14157071



>TRINITY_DN112470_c0_g2_i2 from sample A3 / Example spliced isoform
AATCTCATTATGTACAAAAATTTAATATATGATATCTCAAGAGTTTAGTGCAATGATGGATGCAATTTGACAATGGATATAATAGTTGTTCCTGAAGTATGGCTTTCCAACTACAATTATATATCCAAACCACAACCTATAACACTATTACATTTTAACATTACCCATTTGATTGGTATACTTTTGCACCATAACCGGCA
ATTACTAGTTACTTTGCTTGCTTGGTTTCTTGGATTTGGTTTAACAATGCTAAAAAGACAATGGTTTATCTCATAAAAATTGTTTTCATCTCATGTATTTCATTTCTTTGGAACAGATTATATACAAACGTTGGCTTTGGTGGAGTAGAATTGGAATACTTGTGATGGCAATGCAAATTGTAGGAGCAACTTATCTGGCT
ATTGTTGTTATTAAGAAAGCAATGAATGGGCATAATTCATCTAGTTGCTATCCAGGTCATGATGGTCATGTGGGAGAGCGGAAGCAGATTCTAGTTGTTTTCCTTCTGATTATGGCATGGATTTCAGCAATTGCACAATGCTGTGCTGGATCAAATGTTTTAGCATGGAGGTCATTTTATGCAACACATGATGGAGCTTG
GAAAGCCCATTACCGTGAAATTTTTGACCATGGTATTCGAGAAGTATTATGCTGCCTTGGAAGGGCCCAATATTTGAGTGCTTTGGAGGAGGATGAAGTTCACTCCGTGGCCGGACTTTTGGGTGACCTTGTAGCATATCGTGCAGCTGGTGCTGGCCATTTGGAGTTTCTTGCAGGAATTGCTCTGCTGCAGAGACAGA
CAACAACATTGCCTTCATTGGAGAATTTGGAGCAGTTTATCGAGGCACCTGAAGACCAAATTCAAGAAGCTGTAGTCCTGCATCCTTTTGCTGAAGCTGCGTATACTGGTCCCCTGCTGGATGTTGGAAGGAATCCGATTATATTTCCATGTGCATGGCTATATCGGCAGGGAGTTTTGACCCCTTGGAGCCGGAACAGG
AGACCTATATTGCAAGGTGACAATTGGTGGCGGGGTCACGCGGCAGCATATCTGAAATTTGTTAGTCTACCTCCTGATGCCCTGCGCAAAGGGCGTGTTCATCAAGCACAACGGGAAGCTGCATATTTTGCTGTGGTTGTGCACCACTTACAGTGTGTTGTCATTGCGGTTAGAGGAACTGAAACTCCCGAAGATCTTTT
GACAGATGTTCTCTGTAGGGAATGTGTGCTGTCAGAAGCAGACTTGGATGGACTGCTTAATAGCAATATCTTGGATGATAATGTAAAGCAACGTGTTGCCACAACATTCCCCCATTTTGGGCATTCAGGCATAGTTGAAGCAGCTAGGGAGCTTTGTATGCAATTAGACGGAAACATGGAAGATGTAGATCAGATACCTT
TAGATCAAACCTGTGAGAGTAACAATGTACCTGGAGGTTCTCAAGATGCATCATCTCATCGAACAAAAGGATTCCTTTCTTCTATATTGGAGCCTGGTGGAGAGTGTCATGGGTATGCATTGCGATTTGTTGGGCATTCTTTGGGTGGTGCAATTGGTGCGTTAGCAGGGATAATGTTACACAAACGGTACCCAAACTTG
CATGTGTATACATATGGTGTACTCCCCTGTGTAGATGCAGTCATAGCTGATGCATGTTCGAGCTTTGTAACAAGTATCATTTATAATGATGAGTTCTCGTCACGGCTTTCGGTGACTTCAATGCTTCGTTTGCGAGCAGCAGCACTTGCAGCACTTGCAGCAGATTCTTCTACAGATTCTGCTATGATATCAAAACTTGC
CAGGCGCCTTTTGCATGCAAATAAATATCTTTGGGGTACAAACTGTAAGGAGGATTCTGTGCAGACATCCCAATCAGGCACCATGCAGACATCCCAATCAGGTTCCATGGTCCCAAGGGGTAAGAATTGGAGACAGAAGCAGAGACATTTTAAGTACAAGATAAAAGGTGGGATCTTCCTCTGTATCCATGCAACTTCGT
GCATGGCGAAAATGTCAAATCATAGTTCTACTCATCCTAGGAGGAATCCTGTTAAGTTTAAATTGCATACATCATTTGAGGGCGATTTGCTGAATGATGGAAAACATTGTGATATAATTGTTGATGCTGCACAGATTGAAGGGTGCCTATCTTTTGAGAATAAAACACCCAAGCATGCAAGTAGTTCTGATAAACAGACA
TCTGCATTGGCTGCAGGTGCTGAAGCAAGGGACAAAATTTCCTTTGATGAGTGTACAGTGTTAATTGAGGATTCTGACACAGAGAATCATGGCAACAATCAGCAAGATGCTAGCTATAAAGACGATGTTTATTCTAATGAGTTGCATGTGCACTCTACAGAGTTAACAACAGAGAATGCCACTTATGGAGATTCAATAAC
CCAACATGCAGATACAAATGTGGGCCCCGATGTGTCAGAGATAGAGCCAGTAGAGATGTTTGTTCCTGGCTTGGTTATCCATATCATTCCAGAAGCTAAGCAGACTGTATGGCCGTCATGGAAAAATCTGAACTGGCTTCATCGTAAGGATGCATCTCACAGAGCTATTTTAAGAGATAGGGAAAGCTTCAAGGACATTA
TCGTTTCACCCTCCATGTTTCTTGACCATGTGCCATGGAGGTGTCACTATGCAATGCAAAAGGTTCTAGAAACATGGAAGTTAAAAGACCATAACAGCAATGACAGGTTGGATGCCAGCCATTTAGTTTGATTCTTGCTTGTATGGTTGTAGTAGGCAGGCATTCCAGTTTCGTAACTGTGTTATGTGCTTTGGACTCAA
GAATTGCTGCTCCTCCAAAGCTTCAAGGTAACTGTTAAGTTGCTTGCATCGAGACATCAACACTTGGCAGAATTCCAATCCAATTAATGATTTCCTCACAGGTGTTTTTTGAAGTGTTCAGGTTAAAATTATGTATAATAGCTTTTGTGGATAGGCATTCATGAAATTTGGAATCTCTGATTTGCATTGGTAAGATTGCA
AAGAACTAATTTTCCTTATGAGGTACCTTGTATCAGTTGTAGGAAAGATTTGCAAATAATGGATGAGTTGTAGGCACTATTTTCAGCTCTGTTTACAACTCAAGATCTATTATAACAAGGTTTAGCAGAGATTTGGACGTGTTTGTATATCTCTTAGTCCAATCTGCAGCTCTGTTGGTATAAGTACATTTGGAAGGCCT
TTTATTTTCAGAATGCTTTGACAAAGGCATAGTTCATGTAAGAAACTTTTTCATGACCATTGATAAATGTTGTAAGAACATACCAATAAAGGAACAATACATTCCTGTGCTCAAAGGGAGCGTTTTTTGTTCTTGTAATATTCACATTTATTTCATCAGCCTGCATATATGAGCAGGTTGTGTCATATCTGAAATGAGAA
AACTTGATTTGTTTACAATTTTGCATACTTATGTGAACACTGTTACTAATAAAGGCAAACGAGAGACAAAACAGCAAGCTGGTTTGGATTGAAATGGAAAATCTCAAGTTTCTGAATAAGAAATATTTTAGAGTTTTTGCTACATATGCAAAATTACACACACAAATACCAGTTGGTATATTTACGACATAGATGGCATT
GTACTGTATCAAAGTATGGGAGTAAAAGACTCGGAACACTGGTTTCTCATGG


>TRINITY_DN112470_c0_g2_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:
AGGTGATTCGGTACACCAACTACCAGACGAAATTTAAGATCATAATGAAACCCTGACTAGATTTGAAAATTTGTGCCAATTCTTGCGAGGAAAAAACAATGCTTTTGTTCCAAATGGACCGTCATTCATTAGAAAATATGGGCAATAAAATTCAAAACCACCATACAAAACCACCTTCGTCGGAATTCAAAGACGAGGAA
TAAAATACAAAACCACCTTTCATACGGAAAACGAAGGAATTTGACTGCATTTATTCGTTACTTCAAAGGAAGACGACTAGATCTGCCTGAGCGACGAACTGTCCCGGAAGAAAATCAGCTAAAAAATCCGTATGACGAGCGATGCCACACGTCGGCGGTGGTCATAGCTGCCGAAGAAGGAGCACACGAGAGTCTGGTTT
CGCCCCGGCACTTAATATTGCAAATTCCACATTAAAGGGCATCCCGCCGTACCCCCATGAGCCACCCTGTTTTATACTCCCGAATCGAATACCATGAAATTGGCATGCCTCCCAGACTATATTTTCACCGATTGTGGGGCCTCTCAGGCAAGCCGATCGTCAATTGCTGCAGGAAGCTCAGGAATTCCTATTGCAGATGG
AGGCCAGTGCCGATATATTTGTCACCCAATTGTCCAAATTATTCTCAGCTATGGCGAGCCAGTGAGAATTATTTAAAGCTCGGTGGCAGGAGCAACGGCATGGCGGAGATTTTTGCGAAGGCGAAGAATGTGAGGGTGGTGTTCCTGATCTTAGGGGTTTTACATGTGTTGATGCTTGTTGGGGTCGCACTTGTTTGCCA
TGGATGCCCCAGCGAATTGGTGGTTCCTGCGGCCATAATCGGGACTGCTTCGGCGGTGCGGTTATTTTGGATGTTTGGCAGCGGCATTGCTCAGGCGGCCACGGCGTCCACTATGTTGGTTCAGCAGAGAGACAATACTGTTGTCGATAATGCCTTACGACACCGGCGCCGGATTATATACAAACGTTGGCTTTGGTGGA
GTAGAATTGGAATACTTGTGATGGCAATGCAAATTGTAGGAGCAACTTATCTGGCTATTGTTGTTATTAAGAAAGCAATGAATGGGCATAATTCATCTAGTTGCTATCCAGGTCATGATGGTCATGTGGGAGAGCGGAAGCAGATTCTAGTTGTTTTCCTTCTGATTATGGCATGGATTTCAGCAATTGCACAATGCTGT
GCTGGATCAAATGTTTTAGCATGGAGGTCATTTTATGCAACACATGATGGAGCTTGGAAAGCCCATTACCGTGAAATTTTTGACCATGGTATTCGAGAAGTATTATGCTGCCTTGGAAGGGCCCAATATTTGAGTGCTTTGGAGGAGGATGAAGTTCACTCCGTGGCCGGACTTTTGGGTGACCTTGTAGCATATCGTGC
AGCTGGTGCTGGCCATTTGGAGTTTCTTGCAGGAATTGCTCTGCTGCAGAGACAGACAACAACATTGCCTTCATTGGAGAATTTGGAGCAGTTTATCGAGGCACCTGAAGACCAAATTCAAGAAGCTGTAGTCCTGCATCCTTTTGCTGAAGCTGCGTATACTGTATGCTAACTTTATGTATAATATATTCGAATCCAAG
CAAACTAGCAAATTTATGTGTGGAAAGACATATTTCTGAGGGCCTGTTTTATGCAGGGTCCCCTGCTGGATGTTGGAAGGAATCCGATTATATTTCCATGTGCATGGCTATATCGGCAGGGAGTTTTGACCCCTTGGAGCCGGAACAGgttcatttagtttcatctctggcaccggtcattttagttttaaaagatttgt
tgtcttctgagaaagactgatgagcatatttgatttgcatgatttccattgcttaaatgtttattgaaatcattgtccaatgattattgtgcgtttgtttacttgttgcttgcatatactgcatttgaagGAGACCTATATTGCAAGGTGACAATTGGTGGCGGGGTCACGCGGCAGCATATCTGAAATTTGTTAGTCTA
CCTCCTGATGCCCTGCGCAAAGGGCGTGTTCATCAAGCACAACGGGAAGCTGCATATTTTGCTGTGGTTGTGCACCACTTACAGTGTGTTGTCATTGCGGTTAGAGGAACTGAAACTCCCGAAGATCTTTTGACAGATGTTCTCTGTAGGGAATGTGTGCTGTCAGAAGCAGACTTGGATGGACTGCTTAATAGCAATAT
CTTGGATGATAATGTAAAGCAACGTGTTGCCACAACATTCCCCCATTTTGGGCATTCAGGCATAGTTGAAGCAGCTAGGGAGCTTTGTATGCAATTAGACGGAAACATGGAAGATGTAGATCAGATACCTTTAGATCAAACCTGTGAGAGTAACAATGTACCTGGAGGTTCTCAAGATGCATCATCTCATCGAACAAAAG
GATTCCTTTCTTCTATATTGGAGCCTGGTGGAGAGTGTCATGGGTATGCATTGCGATTTGTTGGGCATTCTTTGGGTGGTGCAATTGGTGCGTTAGCAGGGATAATGTTACACAAACGGTACCCAAACTTGCATGTGTATACATATGGTGTACTCCCCTGTGTAGATGCAGTCATAGCTGATGCATGTTCGAGCTTTGTA
ACAAGTATCATTTATAATGATGAGTTCTCGTCACGGCTTTCGGTGACTTCAATGCTTCGTTTGCGAGCAGCAGCACTTGCAGCACTTGCAGCAGATTCTTCTACAGATTCTGCTATGATATCAAAACTTGCCAGGCGCCTTTTGCATGCAAATAAATATCTTTGGGGTACAAACTGTAAGGAGGATTCTGTGCAGACATC
CCAATCAGGCACCATGCAGACATCCCAATCAGGTTCCATGGTCCCAAGGGGTAAGAATTGGAGACAGAAGCAGAGACATTTTAAGTACAAGATAAAAGGTGGGATCTTCCTCTGTATCCATGCAACTTCGTGCATGGCGAAAATGTCAAATCATAGTTCTACTCATCCTAGGAGGAATCCTGTTAAGTTTAAATTGCATA
CATCATTTGAGGGCGATTTGCTGAATGATGGAAAACATTGTGATATAATTGTTGATGCTGCACAGATTGAAGGGTGCCTATCTTTTGAGAATAAAACACCCAAGCATGCAAGTAGTTCTGATAAACAGACATCTGCATTGGCTGCAGGTGCTGAAGCAAGGGACAAAATTTCCTTTGATGAGTGTACAGTGTTAATTGAG
GATTCTGACACAGAGAATCATGGCAACAATCAGCAAGATGCTAGCTATAAAGACGATGTTTATTCTAATGAGTTGCATGTGCACTCTACAGAGTTAACAACAGAGAATGCCACTTATGGAGATTCAATAACCCAACATGCAGATACAAATGTGGGCCCCGATGTGTCAGAGATAGAGCCAGTAGAGATGTTTGTTCCTGG
CTTGGTTATCCATATCATTCCAGAAGCTAAGCAGACTGTATGGCCGTCATGGAAAAATCTGAACTGGCTTCATCGTAAGGATGCATCTCACAGAGCTATTTTAAGAGATAGGGAAAGCTTCAAGGACATTATCGTTTCACCCTCCATGTTTCTTGACCATGTGCCATGGAGGTGTCACTATGCAATGCAAAAGGTTCTAG
AAACATGGAAGTTAAAAGACCATAACAGCAATGACAGGTTGGATGCCAGCCATTTAGTTTGATTCTTGCTTGTATGGTTGTAGTAGGCAGGCATTCCAGTTTCGTAACTGTGTTATGTGCTTTGGACTCAAGAATTGCTGCTCCTCCAAAGCTTCAAGGTAACTGTTAAGTTGCTTGCATCGAGACATCAACACTTGGCA
GAATTCCAATCCAATTAATGATTTCCTCACAGGTGTTTTTTGAAGTGTTCAGGTTAAAATTATGTATAATAGCTTTTGTGGATAGGCATTCATGAAATTTGGAATCTCTGATTTGCATTGGTAAGATTGCAAAGAACTAATTTTCCTTATGAGGTACCTTGTATCAGTTGTAGGAAAGATTTGCAAATAATGGATGAGTT
GTAGGCACTATTTTCAGCTCTGTTTACAACTCAAGATCTATTATAACAAGGTTTAGCAGAGATTTGGACGTGTTTGTATATCTCTTAGTCCAATCTGCAGCTCTGTTGGTATAAGTACATTTGGAAGGCCTTTTATTTTCAGAATGCTTTGACAAAGGCATAGTTCATGTAAGAAACTTTTTCATGACCATTGATAAATG
TTGTAAGAACATACCAATAAAGGAACAATACATTCCTGTGCTCAAAGGGAGCGTTTTTTGTTCTTGTAATATTCACATTTATTTCATCAGCCTGCATATATGAGCAGGTTGTGTCATATCTGAAATGAGAAAACTTGATTTGTTTACAATTTTGCATACTTATGTGAACACTGTTACTAATAAAGGCAAACGAGAGACAA
AACAGCAAGCTGGTTTGGATTGAAATGGAAAATCTCAAGTTTCTGAATAAGAAATATTTTAGAGTTTTTGCTACATATGCAAAATTACACACACAAATACCAGTTGGTATATTTACGACATAGATGGCATTGTACTGTATCAAAGTATGGGAGTAAAAGACTCGGAACACTGGTTTCTCATGG



Intron 4 GTGGGATCTT ... TTGGCTGCAG

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>TRINITY_DN114523_c0_g2_i4 from sample A1 / Example spliced isoform
GTTTTTCGAGGATCCAAGGTGATTCGGTACACCAACTACCAGACGAAATTTAAGATCATAATGAAACCCTGACTAGATTTGAAAATTTGTGCCAATTCTTGCGAGGAAAAAACAATGCTTTTGTTCCAAATGGACCGTCATTCATTAGAAAATATGGGCAATAAAATTCAAAACCACCATACAAAACCACCTTCGTCGGA
ATTCAAAGACGAGGAATAAAATACAAAACCACCTTTCATACGGAAAACGAAGGAATTTGACTGCATTTATTCGTTACTTCAAAGGAAGACGACTAGATCTGCCTGAGCGACGAACTGTCCCGGAAGAAAATCAGCTAAAAAATCCGTATGACGAGCGATGCCACACGTCGGCGGTGGTCATAGCTGCCGAAGAAGGAGCA
CACGAGAGTCTGGTTTCGCCCCGGCACTTAATATTGCAAATTCCACATTAAAGGGCATCCCGCCGTACCCCCATGAGCCACCCTGTTTTATACTCCCGAATCGAATACCATGAAATTGGCATGCCTCCCAGACTATATTTTCACCGATTGTGGGGCCTCTCAGGCAAGCCGATCGTCAATTGCTGCAGGAAGCTCAGGAA
TTCCTATTGCAGATGGAGGCCAGTGCCGATATATTTGTCACCCAATTGTCCAAATTATTCTCAGCTATGGCGAGCCAGTGAGAATTATTTAAAGCTCGGTGGCAGGAGCAACGGCATGGCGGAGATTTTTGCGAAGGCGAAGAATGTGAGGGTGGTGTTCCTGATCTTAGGGGTTTTACATGTGTTGATGCTTGTTGGGG
TCGCACTTGTTTGCCATGGATGCCCCAGCGAATTGGTGGTTCCTGCGGCCATAATCGGGACTGCTTCGGCGGTGCGGTTATTTTGGATGTTTGGCAGCGGCATTGCTCAGGCGGCCACGGCGTCCACTATGTTGGTTCAGCAGAGAGACAATACTGTTGTCGATAATGCCTTACGACACCGGCGCCGGATTATATACAAA
CGTTGGCTTTGGTGGAGTAGAATTGGAATACTTGTGATGGCAATGCAAATTGTAGGAGCAACTTATCTGGCTATTGTTGTTATTAAGAAAGCAATGAATGGGCATAATTCATCTAGTTGCTATCCAGGTCATGATGGTCATGTGGGAGAGCGGAAGCAGATTCTAGTTGTTTTCCTTCTGATTATGGCATGGATTTCAGC
AATTGCACAATGCTGTGCTGGATCAAATGTTTTAGCATGGAGGTCATTTTATGCAACACATGATGGAGCTTGGAAAGCCCATTACCGTGAAATTTTTGACCATGGTATTCGAGAAGTATTATGCTGCCTTGGAAGGGCCCAATATTTGAGTGCTTTGGAGGAGGATGAAGTTCACTCCGTGGCCGGACTTTTGGGTGACC
TTGTAGCATATCGTGCAGCTGGTGCTGGCCATTTGGAGTTTCTTGCAGGAATTGCTCTGCTGCAGAGACAGACAACAACATTGCCTTCATTGGAGAATTTGGAGCAGTTTATCGAGGCACCTGAAGACCAAATTCAAGAAGCTGTAGTCCTGCATCCTTTTGCTGAAGCTGCGTATACTGGTCCCCTGCTGGATGTTGGA
AGGAATCCGATTATATTTCCATGTGCATGGCTATATCGGCAGGGAGTTTTGACCCCTTGGAGCCGGAACAGGAGACCTATATTGCAAGGTGACAATTGGTGGCGGGGTCACGCGGCAGCATATCTGAAATTTGTTAGTCTACCTCCTGATGCCCTGCGCAAAGGGCGTGTTCATCAAGCACAACGGGAAGCTGCATATTT
TGCTGTGGTTGTGCACCACTTACAGTGTGTTGTCATTGCGGTTAGAGGAACTGAAACTCCCGAAGATCTTTTGACAGATGTTCTCTGTAGGGAATGTGTGCTGTCAGAAGCAGACTTGGATGGACTGCTTAATAGCAATATCTTGGATGATAATGTAAAGCAACGTGTTGCCACAACATTCCCCCATTTTGGGCATTCAG
GCATAGTTGAAGCAGCTAGGGAGCTTTGTATGCAATTAGACGGAAACATGGAAGATGTAGATCAGATACCTTTAGATCAAACCTGTGAGAGTAACAATGTACCTGGAGGTTCTCAAGATGCATCATCTCATCGAACAAAAGGATTCCTTTCTTCTATATTGGAGCCTGGTGGAGAGTGTCATGGGTATGCATTGCGATTT
GTTGGGCATTCTTTGGGTGGTGCAATTGGTGCGTTAGCAGGGATAATGTTACACAAACGGTACCCAAACTTGCATGTGTATACATATGGTGTACTCCCCTGTGTAGATGCAGTCATAGCTGATGCATGTTCGAGCTTTGTAACAAGTATCATTTATAATGATGAGTTCTCGTCACGGCTTTCGGTGACTTCAATGCTTCG
TTTGCGAGCAGCAGCACTTGCAGCACTTGCAGCAGATTCTTCTACAGATTCTGCTATGATATCAAAACTTGCCAGGCGCCTTTTGCATGCAAATAAATATCTTTGGGGTACAAACTGTAAGGAGGATTCTGTGCAGACATCCCAATCAGGCACCATGCAGACATCCCAATCAGGTTCCATGGTCCCAAGGGGTAAGAATT
GGAGACAGAAGCAGAGACATTTTAAGTACAAGATAAAAGGTGCTGAAGCAAGGGACAAAATTTCCTTTGATGAGTGTACAGTGTTAATTGAGGATTCTGACACAGAGAATCATGGCAACAATCAGCAAGATGCTAGCTATAAAGACGATGTTTATTCTAATGAGTTGCATGTGCACTCTACAGAGTTAACAACAGAGAAT
GCCACTTATGGAGATTCAATAACCCAACATGCAGATACAAATGTGGGCCCCGATGTGTCAGAGATAGAGCCAGTAGAGATGTTTGTTCCTGGCTTGGTTATCCATATCATTCCAGAAGCTAAGCAGACTGTATGGCCGTCATGGAAAAATCTGAACTGGCTTCATCGTAAGGATGCATCTCACAGAGCTATTTTAAGAGA
TAGGGAAAGCTTCAAGGACATTATCGTTTCACCCTCCATGTTTCTTGACCATGTGCCATGGAGGTGTCACTATGCAATGCAAAAGGTTCTAGAAACATGGAAGTTAAAAGACCATAACAGCAATGACAGGTTGGATGCCAGCCATTTAGTTTGATTCTTGCTTGTATGGTTGTAGTAGGCAGGCATTCCAGTTTCGTAAC
TGTGTTATGTGCTTTGGACTCAAGAATTGCTGCTCCTCCAAAGCTTCAAGGTAACTGTTAAGTTGCTTGCATCGAGACATCAACACTTGGCAGAATTCCAATCCAATTAATGATTTCCTCACAGGTGTTTTTTGAAGTGTTCAGGTTAAAATTATGTATAATAGCTTTTGTGGATAGGCATTCATGAAATTTGGAATCTC
TGATTTGCATTGGTAAGATTGCAAAGAACTAATTTTCCTTATGAGGTACCTTGTATCAGTTGTAGGAAAGATTTGCAAATAATGGATGAGTTGTAGGCACTATTTTCAGCTCTGTTTACAACTCAAGATCTATTATAACAAGGTTTAGCAGAGATTTGGACGTGTTTGTATATCTCTTAGTCCAATCTGCAGCTCTGTTG
GTATAAGTACATTTGGAAGGCCTTTTATTTTCAGAATGCTTTGACAAAGGCATAGTTCATGTAAGAAACTTTTTCATGACCATTGATAAATGTTGTAAGAACATACCAATAAAGGAACAATACATTCCTGTGCTCAAAGGGAGCGTTTTTTGTTCTTGTAATATTCACATTTATTTCATCAGCCTGCATATATGAGCAGG
TTGTGTCATATCTGAAATGAGAAAACTTGATTTGTTTACAATTTTGCATACTTATGTGAACACTGTTACTAATAAAGGCAAACGAGAGACAAAACAGCAAGCTGGTTTGGATTGAAATGGAAAATCTCAAGTTTCTGAATAAGAAATATTTTAGAGTTTTTGCTACATATGCAAAATTACACACACAAATACCAGTTGGT
ATATTTACGACATAGATGGCATTGTACTGTATCAAAGTATGGGAGTAAAAGACTCGGAACACTGGTTTCTCA


>TRINITY_DN114523_c0_g2_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CTGTATGCTAACTTTATGTATAATATATTCGAATCCAAGCAAACTAGCAAATTTATGTGTGGAAAGACATATTTCTGAGGGCCTGTTTTATGCAGGGTCCCCTGCTGGATGTTGGAAGGAATCCGATTATATTTCCATGTGCATGGCTATATCGGCAGGGAGTTTTGACCCCTTGGAGCCGGAACAGGAGACCTATATTG
CAAGGTGACAATTGGTGGCGGGGTCACGCGGCAGCATATCTGAAATTTGTTAGTCTACCTCCTGATGCCCTGCGCAAAGGGCGTGTTCATCAAGCACAACGGGAAGCTGCATATTTTGCTGTGGTTGTGCACCACTTACAGTGTGTTGTCATTGCGGTTAGAGGAACTGAAACTCCCGAAGATCTTTTGACAGATGTTCT
CTGTAGGGAATGTGTGCTGTCAGAAGCAGACTTGGATGGACTGCTTAATAGCAATATCTTGGATGATAATGTAAAGCAACGTGTTGCCACAACATTCCCCCATTTTGGGCATTCAGGCATAGTTGAAGCAGCTAGGGAGCTTTGTATGCAATTAGACGGAAACATGGAAGATGTAGATCAGATACCTTTAGATCAAACCT
GTGAGAGTAACAATGTACCTGGAGGTTCTCAAGATGCATCATCTCATCGAACAAAAGGATTCCTTTCTTCTATATTGGAGCCTGGTGGAGAGTGTCATGGGTATGCATTGCGATTTGTTGGGCATTCTTTGGGTGGTGCAATTGGTGCGTTAGCAGGGATAATGTTACACAAACGGTACCCAAACTTGCATGTGTATACA
TATGGTGTACTCCCCTGTGTAGATGCAGTCATAGCTGATGCATGTTCGAGCTTTGTAACAAGTATCATTTATAATGATGAGTTCTCGTCACGGCTTTCGGTGACTTCAATGCTTCGTTTGCGAGCAGCAGCACTTGCAGCACTTGCAGCAGATTCTTCTACAGATTCTGCTATGATATCAAAACTTGCCAGGCGCCTTTT
GCATGCAAATAAATATCTTTGGGGTACAAACTGTAAGGAGGATTCTGTGCAGACATCCCAATCAGGCACCATGCAGACATCCCAATCAGGTTCCATGGTCCCAAGGGGTAAGAATTGGAGACAGAAGCAGAGACATTTTAAGTACAAGATAAAAGgtgggatcttcctctgtatccatgcaacttcgtgcatggcgaaaa
tgtcaaatcatagttctactcatcctaggaggaatcctgttaagtttaaattgcatacatcatttgagggcgatttgctgaatgatggaaaacattgtgatataattgttgatgctgcacagattgaagggtgcctatcttttgagaataaaacacccaagcatgcaagtagttctgataaacagacatctgcattggct
gcagGTGCTGAAGCAAGGGACAAAATTTCCTTTGATGAGTGTACAGTGTTAATTGAGGATTCTGACACAGAGAATCATGGCAACAATCAGCAAGATGCTAGCTATAAAGACGATGTTTATTCTAATGAGTTGCATGTGCACTCTACAGAGTTAACAACAGAGAATGCCACTTATGGAGATTCAATAACCCAACATGCAGA
TACAAATGTGGGCCCCGATGTGTCAGAGATAGAGCCAGTAGAGATGTTTGTTCCTGGCTTGGTTATCCATATCATTCCAGAAGCTAAGCAGACTGTATGGCCGTCATGGAAAAATCTGAACTGGCTTCATCGTAAGGATGCATCTCACAGAGCTATTTTAAGAGATAGGGAAAGCTTCAAGGACATTATCGTTTCACCCT
CCATGTTTCTTGACCATGTGCCATGGAGGTGTCACTATGCAATGCAAAAGGTTCTAGAAACATGGAAGTTAAAAGACCATAACAGCAATGACAGGTTGGATGCCAGCCATTTAGTTTGATTCTTGCTTGTATGGTTGTAGTAGGCAGGCATTCCAGTTTCGTAACTGTGTTATGTGCTTTGGACTCAAGAATTGCTGCTC
CTCCAAAGCTTCAAGGTAACTGTTAAGTTGCTTGCATCGAGACATCAACACTTGGCAGAATTCCAATCCAATTAATGATTTCCTCACAGGTGTTTTTTGAAGTGTTCAGGTTAAAATTATGTATAATAGCTTTTGTGGATAGGCATTCATGAAATTTGGAATCTCTGATTTGCATTGGTAAGATTGCAAAGAACTAATTT
TCCTTATGAGGTACCTTGTATCAGTTGTAGGAAAGATTTGCAAATAATGGATGAGTTGTAGGCACTATTTTCAGCTCTGTTTACAACTCAAGATCTATTATAACAAGGTTTAGCAGAGATTTGGACGTGTTTGTATATCTCTTAGTCCAATCTGCAGCTCTGTTGGTATAAGTACATTTGGAAGGCCTTTTATTTTCAGA
ATGCTTTGACAAAGGCATAGTTCATGTAAGAAACTTTTTCATGACCATTGATAAATGTTGTAAGAACATACCAATAAAGGAACAATACATTCCTGTGCTCAAAGGGAGCGTTTTTTGTTCTTGTAATATTCACATTTATTTCATCAGCCTGCATATATGAGCAGGTTGTGTCATATCTGAAATGAGAAAACTTGATTTGT
TTACAATTTTGCATACTTATGTGAACACTGTTACTAATAAAGGCAAACGAGAGACAAAACAGCAAGCTGGTTTGGATTGAAATGGAAAATCTCAAGTTTCTGAATAAGAAATATTTTAGAGTTTTTGCTACATATGCAAAATTACACACACAAATACCAGTTGGTATATTTACGACATAGATGGCATTGTACTGTATCAA
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>TRINITY_DN37464_c0_g2_i5 from sample A7 / Example spliced isoform
CGAGGATCCAAGGTGATTCGGTACACCAACTACCAGACGAAATTTAAGATCATAATGAAACCCTGACTAGATTTGAAAATTTGTGCCAATTCTTGCGAGGAAAAAACAATGCTTTTGTTCCAAATGGACCGTCATTCATTAGAAAATATGGGCAATAAAATTCAAAACCACCATACAAAACCACCTTCGTCGGAATTCAA
AGACGAGGAATAAAATACAAAACCACCTTTCATACGGAAAACGAAGGAATTTGACTGCATTTATTCGTTACTTCAAAGGAAGACGACTAGATCTGCCTGAGCGACGAACTGTCCCGGAAGAAAATCAGCTAAAAAATCCGTATGACGAGCGATGCCACACGTCGGCGGTGGTCATAGCTGCCGAAGAAGGAGCACACGAG
AGTCTGGTTTCGCCCCGGCACTTAATATTGCAAATTCCACATTAAAGGGCATCCCGCCGTACCCCCATGAGCCACCCTGTTTTATACTCCCGAATCGAATACCATGAAATTGGCATGCCTCCCAGACTATATTTTCACCGATTGTGGGGCCTCTCAGGCAAGCCGATCGTCAATTGCTGCAGGAAGCTCAGGAATTCCTA
TTGCAGATGGAGGCCAGTGCCGATATATTTGTCACCCAATTGTCCAAATTATTCTCAGCTATGGCGAGCCAGTGAGAATTATTTAAAGCTCGGTGGCAGGAGCAACGGCATGGCGGAGATTTTTGCGAAGGCGAAGAATGTGAGGGTGGTGTTCCTGATCTTAGGGGTTTTACATGTGTTGATGCTTGTTGGGGTCGCAC
TTGTTTGCCATGGATGCCCCAGCGAATTGGTGGTTCCTGCGGCCATAATCGGGACTGCTTCGGCGGTGCGGTTATTTTGGATGTTTGGCAGCGGCATTGCTCAGGCGGCCACGGCGTCCACTATGTTGGTTCAGCAGAGAGACAATACTGTTGTCGATAATGCCTTACGACACCGGCGCCGGATTATATACAAACGTTGG
CTTTGGTGGAGTAGAATTGGAATACTTGTGATGGCAATGCAAATTGTAGGAGCAACTTATCTGGCTATTGTTGTTATTAAGAAAGCAATGAATGGGCATAATTCATCTAGTTGCTATCCAGGTCATGATGGTCATGTGGGAGAGCGGAAGCAGATTCTAGTTGTTTTCCTTCTGATTATGGCATGGATTTCAGCAATTGC
ACAATGCTGTGCTGGATCAAATGTTTTAGCATGGAGGTCATTTTATGCAACACATGATGGAGCTTGGAAAGCCCATTACCGTGAAATTTTTGACCATGGTATTCGAGAAGTATTATGCTGCCTTGGAAGGGCCCAATATTTGAGTGCTTTGGAGGAGGATGAAGTTCACTCCGTGGCCGGACTTTTGGGTGACCTTGTAG
CATATCGTGCAGCTGGTGCTGGCCATTTGGAGTTTCTTGCAGGAATTGCTCTGCTGCAGAGACAGACAACAACATTGCCTTCATTGGAGAATTTGGAGCAGTTTATCGAGGCACCTGAAGACCAAATTCAAGAAGCTGTAGTCCTGCATCCTTTTGCTGAAGCTGCGTATACTGGTCCCCTGCTGGATGTTGGAAGGAAT
CCGATTATATTTCCATGTGCATGGCTATATCGGCAGGGAGTTTTGACCCCTTGGAGCCGGAACAGGAGACCTATATTGCAAGGTGACAATTGGTGGCGGGGTCACGCGGCAGCATATCTGAAATTTGTTAGTCTACCTCCTGATGCCCTGCGCAAAGGGCGTGTTCATCAAGCACAACGGGAAGCTGCATATTTTGCTGT
GGTTGTGCACCACTTACAGTGTGTTGTCATTGCGGTTAGAGGAACTGAAACTCCCGAAGATCTTTTGACAGATGTTCTCTGTAGGGAATGTGTGCTGTCAGAAGCAGACTTGGATGGACTGCTTAATAGCAATATCTTGGATGATAATGTAAAGCAACGTGTTGCCACAACATTCCCCCATTTTGGGCATTCAGGCATAG
TTGAAGCAGCTAGGGAGCTTTGTATGCAATTAGACGGAAACATGGAAGATGTAGATCAGATACCTTTAGATCAAACCTGTGAGAGTAACAATGTACCTGGAGGTTCTCAAGATGCATCATCTCATCGAACAAAAGGATTCCTTTCTTCTATATTGGAGCCTGGTGGAGAGTGTCATGGGTATGCATTGCGATTTGTTGGG
CATTCTTTGGGTGGTGCAATTGGTGCGTTAGCAGGGATAATGTTACACAAACGGTACCCAAACTTGCATGTGTATACATATGGTGTACTCCCCTGTGTAGATGCAGTCATAGCTGATGCATGTTCGAGCTTTGTAACAAGTATCATTTATAATGATGAGTTCTCGTCACGGCTTTCGGTGACTTCAATGCTTCGTTTGCG
AGCAGCAGCACTTGCAGCACTTGCAGCAGATTCTTCTACAGATTCTGCTATGATATCAAAACTTGCCAGGCGCCTTTTGCATGCAAATAAATATCTTTGGGGTACAAACTGTAAGGAGGATTCTGTGCAGACATCCCAATCAGGCACCATGCAGACATCCCAATCAGGTTCCATGGTCCCAAGGGGTAAGAATTGGAGAC
AGAAGCAGAGACATTTTAAGTACAAGATAAAAGGTGGGATCTTCCTCTGTATCCATGCAACTTCGTGCATGGCGAAAATGTCAAATCATAGTTCTACTCATCCTAGGAGGAATCCTGTTAAGTTTAAATTGCATACATCATTTGAGGGCGATTTGCTGAATGATGGAAAACATTGTGATATAATTGTTGATGCTGCACAG
ATTGAAGGGTGCCTATCTTTTGAGAATAAAACACCCAAGCATGCAAGTAGTTCTGATAAACAGACATCTGCATTGGCTGCAGGTGCTGAAGCAAGGGACAAAATTTCCTTTGATGAGTGTACAGTGTTAATTGAGGATTCTGACACAGAGAATCATGGCAACAATCAGCAAGATGCTAGCTATAAAGACGATGTTTATTC
TAATGAGTTGCATGTGCACTCTACAGAGTTAACAACAGAGAATGCCACTTATGGAGATTCAATAACCCAACATGCAGATACAAATGTGGGCCCCGATGTGTCAGAGATAGAGCCAGTAGAGATGTTTGTTCCTGGCTTGGTTATCCATATCATTCCAGAAGCTAAGCAGACTGTATGGCCGTCATGGAAAAATCTGAACT
GGCTTCATCGTAAGGATGCATCTCACAGAGCTATTTTAAGAGATAGGGAAAGCTTCAAGGACATTATCGTTTCACCCTCCATGTTTCTTGACCATGTGCCATGGAGGTGTCACTATGCAATGCAAAAGGTTCTAGAAACATGGAAGTTAAAAGACCATAACAGCAATGACAGGTTGGATGCCAGCCATTTAGTTTGATTC
TTGCTTGTATGGTTGTAGTAGGCAGGCATTCCAGTTTCGTAACTGTGTTATGTGCTTTGGACTCAAGAATTGCTGCTCCTCCAAAGCTTCAAGGTTAAAATTATGTATAATAGCTTTTGTGGATAGGCATTCATGAAATTTGGAATCTCTGATTTGCATTGGTAAGATTGCAAAGAACTAATTTTCCTTATGAGGTACCT
TGTATCAGTTGTAGGAAAGATTTGCAAATAATGGATGAGTTGTAGGCACTATTTTCAGCTCTGTTTACAACTCAAGATCTATTATAACAAGGTTTAGCAGAGATTTGGACGTGTTTGTATATCTCTTAGTCCAATCTGCAGCTCTGTTGGTATAAGTACATTTGGAAGGCCTTTTATTTTCAGAATGCTTTGACAAAGGC
ATAGTTCATGTAAGAAACTTTTTCATGACCATTGATAAATGTTGTAAGAACATACCAATAAAGGAACAATACATTCCTGTGCTCAAAGGGAGCGTTTTTTGTTCTTGTAATATTCACATTTATTTCATCAGCCTGCATATATGAGCAGGTTGTGTCATATCTGAAATGAGAAAACTTGATTTGTTTACAATTTTGCATAC
TTATGTGAACACTGTTACTAATAAAGGCAAACGAGAGACAAAACAGCAAGCTGGTTTGGATTGAAATGGAAAATCTCAAGTTTCTGAATAAGAAATATTTTAGAGTTTTTGCTACATATGCAAAATTACACACACAAATACCAGTTGGTATATTTACGACATAGATGGCATTGTACTGTATCAAAGTATGGGAGTAAAAG
ACTCGGAACACTGGTTTCTCATGGCAATCAGCGTGATTTTTGCTGTTTATATGACTAATTCAATGCCATTGCTGACATTAAATGGCAAAATGTAAATATGGTACTCCAAACTCTGTTGAAGAAATGCTTCTGCTATGCATCCAAGTTGCAAGAGTTGATAAAAAATCCTGTATTATGGAATTACATGCAACTTCAACAAG
TTTTGATAGAGATTGGCAAATGATCTTAAGCTTCTGCTCGTCCATTGATCCAACTTCAATACAATAATTTTGTGTCTCGTATGGGATGATGATATCTGATTATCTATAAACTATGTTGGATGAATACGAATG


>TRINITY_DN37464_c0_g2_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:
AGAGACTTGAACCTTTGTGAAGGCTTTAGCAAATTCATGATCCAACAAGCCACTGTTGACATTGATTATATACAAACGTTGGCTTTGGTGGAGTAGAATTGGAATACTTGTGATGGCAATGCAAATTGTAGGAGCAACTTATCTGGCTATTGTTGTTATTAAGAAAGCAATGAATGGGCATAATTCATCTAGTTGCTATC
CAGGTCATGATGGTCATGTGGGAGAGCGGAAGCAGATTCTAGTTGTTTTCCTTCTGATTATGGCATGGATTTCAGCAATTGCACAATGCTGTGCTGGATCAAATGTTTTAGCATGGAGGTCATTTTATGCAACACATGATGGAGCTTGGAAAGCCCATTACCGTGAAATTTTTGACCATGGTATTCGAGAAGTATTATGC
TGCCTTGGAAGGGCCCAATATTTGAGTGCTTTGGAGGAGGATGAAGTTCACTCCGTGGCCGGACTTTTGGGTGACCTTGTAGCATATCGTGCAGCTGGTGCTGGCCATTTGGAGTTTCTTGCAGGAATTGCTCTGCTGCAGAGACAGACAACAACATTGCCTTCATTGGAGAATTTGGAGCAGTTTATCGAGGCACCTGA
AGACCAAATTCAAGAAGCTGTAGTCCTGCATCCTTTTGCTGAAGCTGCGTATACTGGTCCCCTGCTGGATGTTGGAAGGAATCCGATTATATTTCCATGTGCATGGCTATATCGGCAGGGAGTTTTGACCCCTTGGAGCCGGAACAGGAGACCTATATTGCAAGGTGACAATTGGTGGCGGGGTCACGCGGCAGCATATC
TGAAATTTGTTAGTCTACCTCCTGATGCCCTGCGCAAAGGGCGTGTTCATCAAGCACAACGGGAAGCTGCATATTTTGCTGTGGTTGTGCACCACTTACAGTGTGTTGTCATTGCGGTTAGAGGAACTGAAACTCCCGAAGATCTTTTGACAGATGTTCTCTGTAGGGAATGTGTGCTGTCAGAAGCAGACTTGGATGGA
CTGCTTAATAGCAATATCTTGGATGATAATGTAAAGCAACGTGTTGCCACAACATTCCCCCATTTTGGGCATTCAGGCATAGTTGAAGCAGCTAGGGAGCTTTGTATGCAATTAGACGGAAACATGGAAGATGTAGATCAGATACCTTTAGATCAAACCTGTGAGAGTAACAATGTACCTGGAGGTTCTCAAGATGCATC
ATCTCATCGAACAAAAGGATTCCTTTCTTCTATATTGGAGCCTGGTGGAGAGTGTCATGGGTATGCATTGCGATTTGTTGGGCATTCTTTGGGTGGTGCAATTGGTGCGTTAGCAGGGATAATGTTACACAAACGGTACCCAAACTTGCATGTGTATACATATGGTGTACTCCCCTGTGTAGATGCAGTCATAGCTGATG
CATGTTCGAGCTTTGTAACAAGTATCATTTATAATGATGAGTTCTCGTCACGGCTTTCGGTGACTTCAATGCTTCGTTTGCGAGCAGCAGCACTTGCAGCACTTGCAGCAGATTCTTCTACAGATTCTGCTATGATATCAAAACTTGCCAGGCGCCTTTTGCATGCAAATAAATATCTTTGGGGTACAAACTGTAAGGAG
GATTCTGTGCAGACATCCCAATCAGGCACCATGCAGACATCCCAATCAGGTTCCATGGTCCCAAGGGGTAAGAATTGGAGACAGAAGCAGAGACATTTTAAGTACAAGATAAAAGGTGGGATCTTCCTCTGTATCCATGCAACTTCGTGCATGGCGAAAATGTCAAATCATAGTTCTACTCATCCTAGGAGGAATCCTGT
TAAGTTTAAATTGCATACATCATTTGAGGGCGATTTGCTGAATGATGGAAAACATTGTGATATAATTGTTGATGCTGCACAGATTGAAGGGTGCCTATCTTTTGAGAATAAAACACCCAAGCATGCAAGTAGTTCTGATAAACAGACATCTGCATTGGCTGCAGGTGCTGAAGCAAGGGACAAAATTTCCTTTGATGAGT
GTACAGTGTTAATTGAGGATTCTGACACAGAGAATCATGGCAACAATCAGCAAGATGCTAGCTATAAAGACGATGTTTATTCTAATGAGTTGCATGTGCACTCTACAGAGTTAACAACAGAGAATGCCACTTATGGAGATTCAATAACCCAACATGCAGATACAAATGTGGGCCCCGATGTGTCAGAGATAGAGCCAGTA
GAGATGTTTGTTCCTGGCTTGGTTATCCATATCATTCCAGAAGCTAAGCAGACTGTATGGCCGTCATGGAAAAATCTGAACTGGCTTCATCGTAAGGATGCATCTCACAGAGCTATTTTAAGAGATAGGGAAAGCTTCAAGGACATTATCGTTTCACCCTCCATGTTTCTTGACCATGTGCCATGGAGGTGTCACTATGC
AATGCAAAAGGTTCTAGAAACATGGAAGTTAAAAGACCATAACAGCAATGACAGGTTGGATGCCAGCCATTTAGTTTGATTCTTGCTTGTATGGTTGTAGTAGGCAGGCATTCCAGTTTCGTAACTGTGTTATGTGCTTTGGACTCAAGAATTGCTGCTCCTCCAAAGCTTCAAGgtaactgttaagttgcttgcatcga
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