sp|O81916|YC22_ARATH ----> Uncharacterized calcium-binding protein At1g02270
Intron 1 GTTCGAGTTT ... ATGGTCGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 91.45 | 20 | 214 | 8 |
| A2 | 90.27 | 32 | 297 | 9 |
| A3 | 86.78 | 48 | 315 | 6 |
| A4 | 92.02 | 17 | 196 | 11 |
| A5 | 89.33 | 19 | 159 | 6 |
| A6 | 91.2 | 352 | 3648 | 11 |
| A7 | 90.46 | 113 | 1071 | 15 |
| A8 | 91.78 | 120 | 1340 | 6 |
| A9 | 92.22 | 136 | 1612 | 10 |
| A10 | 89.75 | 54 | 473 | 6 |
>TRINITY_DN44083_c0_g1_i17 from sample A9 / Example spliced isoformCGATTTCAAATTCTATTTGTTACTTAGATCTCTGTATTTCAAATTGTAGATTCCTCAATTTTAATAGTGTGATGTCTATTATGTTAATTTGTTAGATTTCTCGATTTCGATTTCAAATTTCAAATTCTGTTAGTTTGTTTGATTTTTCGATTTCAAAACCTATTTATTAGCTAGATTTATCAATTTCAAATTGTCTTTTG
TCTTTGTTAATTAGATTTCTGAATTTCAACAGTTTTCCGTAGGTGAGAATTGCTATAATTCTGTCTGTTCTTTCGATTTCTCAATTTCAATAGCCGATGGGAAGGGCTCCGAATCATTTTTTTTCTTGCTGTACTAAATTTTGAAAATCAAAGCTTCCTGGCTATTACGAAACTCGAACAGATAGAAAGTGTGGCCGTTG
GAATGAGGCTTGAGTAAAGTCAGCATGACCCTTGAAGGAGCAGCTTGTTCCCTCAGCTCCTGTTCCCTGTATTTCTCTTAACGCCGACGCAGAGGAGTAATGTAGTCCGTGTACCCAACAACTTCTATTGCCACACACCAAATCATTGACACCAATAGTCTTACGGTTCTCTGAGACGCACTTCTCATGTGCCATTCCGG
TGATAAAACTGATAAATTCTGTGACGCACTGCTGCATCAACCCCTTGGTTTCTGTCGACACCTTCGCATTCTTGCCCAACACTTTCTTTCATTATTCTGCTCACGATGGCCGACGGCATATACAACTCATTGGGGTTGTTGCTGTAATTACCACCACTGTTGGTGTTATTGTTGTGTATTTCTTTAAATACCGAAGCCGA
GGAGCTATGCAACACTGCTATTCTTGTTAGATTTATGCGGAGTGAGGCATTGCTATTCTGTCTGCTGAATACCAAAGCCGAGGAATTAAGGCTGCGGAGTGAGGGACTGCTATTCTGGCGAGCATTGCTATTCTGTTTGTTTATTCGATTCCTCAATTTCAATGGCCGATGGGAACAGCTCCGAAACAACTAAAAACGAT
AACATCAACACTGACGGTGAATTAGATTTCTCAATTTCAATGGCTGAGAGCGGTTTCAAATGCACCGATCAACACAACAATAACACCAACACTGGTGGTGATTACAGAAACAACACCAATGAGCTGTATATGCCGTAGGCTAGAGTTTATCAGTTTTATCACCAAGAAGGTGCATGAGAAGTGTGCCACAGAGAGCCGTA
AGACTCTTGGGGTCGATGATTTATTTTGGGGCAGTAGAAGTTGTTGGGTGCACAGACTGCATCACTCCTCGGCGTCGGTATTTAGAGAAATACAGGGAACGGGAGTTGAGCGAGCAAGCTGCTCCTTTAGAGGGTCATGGTGGCTTTACTCAACCTCATTCCAACGGCCATACTTTTTAAATGTGGAATTGTCTCGTCAT
TTCATATGAGAGTTGATTCTCTGCCTCATCATTCTGGCACGAAATGAGAACCTACTTCTTGATGCAATCCTCCCAATTTACTTGCAAGCATTTTTGTAACAAGCTTTTAGCTGAGACCTTGTTGTAGTCAAGTAAGCAGTGTGTAAAAGAACAAGTTTTAAGAGGTTAAATCACTAATTTCTCAAATTTGGTCACTTTAC
TCAAGCAAGTTGTGACTCAGTTGGAGGCAACTACTGCAACATGGGTTAAGCTGGATGAACCATCTCTTGTAATGGATCTTGAGGCTCATAAATTGGAGGCCTTTTCCAAGGCATACTCTTACTGAGAAGGAG
>TRINITY_DN44083_c0_g1_i10 from sample A9 / Example unspliced isoform:CGATTTCAAATTCTATTTGTTACTTAGATCTCTGTATTTCAAATTGTAGATTCCTCAATTTTAATAGTGTGATGTCTATTATGTTAATTTGTTAGATTTCTCGATTTCGATTTCAAATTTCAAATTCTGTTAGTTTGTTTGATTTGTCGATTTCAAATTCTTTTTGTTAGTTAGATTTCTCATTTCAATGGGTTTTTTTT
GTAGATGAGCATTGCTATTCTGTCTGTTTGTTCGATTTCTCAATTTCAATGGCCGATGGGAACAGCTCCGAAACAACTAAAAACGATAACATCAACACTGACGGTGAATTAGATTTCTCAATTTCAATGGCTGAGAGCGGTTTCAAATGCACCGATCAACACAACAATAACACCAACACTGGTGGTGATTACAGAAACAA
CACCAATGAGCTGTATATGCCGTAGGCTAGAGTTTATCAGTTTTATCACCAAGAAGGTGCATGAGAAGTGTGCCACAGAGAGCCGTAAGACTCTTGGGGTCGATGATTTATTTTGGGGCAGTAGAAGTTGTTGGGTGCACAGACTGCATCACTCCTCGGCGTCGGTATTTAGAGAAATACAGGGAACGGGAGTTGAGCGA
GCAAGCTGCTCCTTTAGAGGGTCATGGTGGCTTTACTCAACCTCATTCCAACGGCCATACTTTTTAAATgttcgagtttctcaaaaattttgtacagtaggaagaaaatgataagggatttactgtcttgttaattgaatctcaaaacaatcaagggcattcaattttttgtgagggcattctattttttatgagctgaa
atggaattgggctgccttatttttaggcattccattttttttaactgacattcaactttttaactgcgctcacccatggtcgcagGTGGAATTGTCTCGTCATTTCATATGAGAGTTGATTCTCTGCCTCATCATTCTGGCACGAAATGAGAACCTACTTCTTGATGCAATCCTCCCAATTTACTTGCAAGCATTTTTGT
AACAAGCTTTTAGCTGAGACCTTGTTGTAGTCAAGTAAGCAGTGTGTAAAAGAACAAGTTTTAAGAGGTTAAATCACTAATTTCTCAAATTTGGTCACTTTACTCAAGCAAGTTGTGACTCAGTTGGAGGCAACTACTGCAACATGGGTTAAGCTGGATGAACCATCTCTTGTAATGGATCTTGAGGCTCATAAATTGGA
GGCCTTTTCCAAGGCATACTCTTACTGAGAAGGAG
Intron 2 GTAATTCTCA ... CTCTCTGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 90.48 | 1 | 11 | 8 |
| A2 | 81.82 | 1 | 1 | 8 |
| A3 | 100 | 0 | 11 | 4 |
| A4 | 50 | 2 | 4 | 0 |
| A5 | 57.14 | 3 | 6 | 2 |
| A6 | 87.01 | 5 | 36 | 31 |
| A7 | 70.97 | 9 | 30 | 14 |
| A8 | 67.12 | 12 | 25 | 24 |
| A9 | 64.1 | 7 | 18 | 7 |
| A10 | 82.86 | 3 | 19 | 10 |
>TRINITY_DN48300_c0_g1_i5 from sample A10 / Example spliced isoformAAAAAATATTAGACATGCTGTTGGAGAAAAGATCATCCAACATTTGTTTACAGGAGCTTTGGGTTGGAAATGAGGAACTGGTGGAAATGTATGAACGCAACTTGGGGAATAATGGTTATGAGATGTATAAACTTGGGCGCACAAATAACCATGAAGATGTTCTTCAAGAAACATGCCCCAAGGCGCTACATAGCAGATTT
CCTTTGGCTTGTGTGCTAGGTTTGTTTGAGAGGTATCCTTCCATCTTTATTAGCATCATAATGATTCTAATTAGGTACAAGGTTTGAATCTAATTAGGTACAAGGTTTGAACCAAAAAATTAAGGTTTCAAGTTGGAACTTATTTTCGTAAAGAATTA
>TRINITY_DN48300_c0_g1_i1 from sample A10 / Example unspliced isoform:TGGAGGAAGTCATATGTCTGGCACCACTAGCCAGCCCAAGGGAGTCCCATTTAGGCAACTAAATTTACTAGCATCTCCATACTATCACCCTCTGACCTTACTGTCGTTATCTTACCGCTCTTTCGAGTTATGCCCTTGTGGATCTAGCACTTGGGTGATATTGGATCCAATATGTTGGGCGCAATGATGCCAGAGGAAAG
TTTGGGGATTAAATCAAATACAGGTATTGTGGGCATGGGATCTTCTGATTGGAATAGTGCATTTGTGGATAAAAAACAAGCCCTGGATATCTCCAGAGCACAACAGAAGAGATTGAAGAGGGGATACATGGTATTGGGGGGATTGATGGGAAGGAAACTGATGATGAGAATATGAATTCCTGTGATTAATATGTTTCATG
CACCACTTTCAATATTCTTGCTCCAGTATACAAGCGTATCGATAACGAGAGCTGCAGTGAAAGCCAATTCAAAGATTGTTGGCGAAAGCGCAATCAAAAAATATTAGACATGCTGTTGGAGAAAAGATCATCCAACATTTGTTTACAGGAGCTTTGGGTTGGAAATGAGGAACTGGTGGAAATGTATGAACGCAACTTGG
GGAATAATGGTTATGAGATGTATAAACTTGGGCGCACAAATAACCATGAAGATGgtaattctcagtttcatttcttcttgctttatatggtttattaggaatgtaatttatattgaggggttttcttgttgttggatgatctctctcactctctgaagTTCTTCAAGAAACATGCCCCAAGGCGCTACATAGCAGATTTC
CTTTGGCTTGTGTGCTAGGTTTGTTTGAGAGGTATCCTTCCATCTTTATTAGCATCATAATGATTCTAATTAGGTACAAGGTTTGAATCTAATTAGGTACAAGGTTTGAACCAAAAAATTAAGGTTTCAAGTTGGAACTTATTTTCGTAAAGAATTA
Intron 3 GTAATCGCAG ... TTTTCTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 0.84 | 4245 | 0 | 36 |
| A2 | 1.14 | 6417 | 2 | 74 |
| A3 | 0.76 | 6825 | 2 | 52 |
| A4 | 0.56 | 5532 | 4 | 31 |
| A5 | 0.38 | 6308 | 0 | 24 |
| A6 | 15.06 | 846 | 12 | 150 |
| A7 | 20.36 | 223 | 9 | 57 |
| A8 | 17.61 | 248 | 1 | 53 |
| A9 | 19.57 | 370 | 9 | 90 |
| A10 | 26.19 | 62 | 2 | 22 |
>TRINITY_DN48300_c0_g1_i9 from sample A10 / Example spliced isoformATAGTTTTATGTCTATTTTGTTAATTTGTTAGATTTCTCGATTTCGATTTCAAATTTCAAATTCTGTTAGTTTGTTTGATTTTTCGATTTCAAAACCTATTTATTAGCTAGATTTATCAATTTCAAATTGTCTTTTGTCTTTGTTAATTAGATTTCTGAATTTCAACAGTTTTCCGTAGGTGAGAATTGCTATAATTCTG
TCTGTTCTTTCGATTTCTCAAGTTCAATAGCCGATGGGAAGGGCTCCGAATCATTTTTTTTCTTGCTGTACTAAATTTTGAAAATCAAAGCTTCCTGGCTATTACGAAACTCGAACAGATAGAAAGTGTGGCCGTTGGAATGAGGCTTGAGTAAAGTCAGCATGACCCTTGAAGGAGCAGCTTGTTCCCTCAGCTCCTGT
TCCCTGTATTTCTCTTAACGCCGACGCAGAGGAGTAATGTAGTCCGTGTACCCAACAACTTCTATTGCCACACACCAAATCATTGACACCAATAGTCTTACGGTTCTCTGAGACGCACTTCTCATGTGCCATTCCGGTGATAAAACTGATAAACTCTGTGACGCACTGCTGCATCAACCCCTTGGTTTCTGTCGACACCT
TCGCATTCTTGCCCAACACTTTCTTTCATTATTCTGCTCACGATGGCCGACGGCATATACAACTCATTGGGGTTGTTGCTGTAATTACCACCACTGTTGGTGTTATTGTTGTGTATTTCTTTAAATACCGAAGCCGAGGAGCTATGCAACACTGCTATTCTTGTTAGATTTCTGCGGAATGAGGCATTGCTATTCTGTCT
GCGGAATACCGAAGCCGAGGAATGAAGGCTGCGGAGTGAGGGACTGCTATTCTGATGAGCATTGCTATTCTGTCTGTTTGTTCGATTTCTCAATTTCAATGGCCGATTGGAACAGCTCCGAAACAACTAAAAACGGCAACATCAACACTGTCGGTGAGTTAGATTTCTCAAATTTCAATGGCTGATGAGAGCGGTTTCAA
ATGAACTGATCAACACAACAATAACACCAACACTGGTGGTGATTACAAAAACAACACCAATGAGCTGTTTATGCCGTCGGCCAACGTGACCAGAATAATGAGGAAAGTGTTGAGCGAGGATGCGAAGTTGTCGACAGAAGCCGAGGAGGTTGATGCAGCAGTGCGTGACAGAGTTTATGAGTTTTGTCACCGGGAAGGCG
CACGAGAAGTGCGCCACAGAGAGCCGTAAGACTCTTGGGGTCGATGATTTGTTTTGGGGCAGTAGAAGTTGTTGGGTACACGGACTGCATCATTCCTCTGCGTCGGTATTTATAGAAATACAGGAAACGGGAGCTGAGCAAACAAGCTGCTGCTTCAGAGGGTCATGGTGGCTTTACTCAACCTCATTCCAACGGCCATA
CTTTTTATCTGTTCGAGTTTCTCAAAATTTTTGTACAGCAGGAAGAAAATGATAGGTGATTTACTGTCTTGTTGATTGCATCTCAAAACAATCAAGGGCATTCAATTTTTTGTGAGGGCATTCTATTTTTTAATGAGCTGAAATGGAATTGGGATGCCTTATTTTAGGGCATTCAATTATTTTTAACGACATTCAACTTT
TTAAAGATTTTTCAGAAATGCTCAGATCCAACTTTTACCAATGTTCAAGAACAGATTCTTTAATTTTTAATTCAATTACATAGCTGAGTTCTTTCATGTCCTTGCTACTTTTTCACACAATAATGTCAATTCCTGAGTACTTTCATGTCCCCCTGAAAAAAAA
>TRINITY_DN48300_c0_g1_i10 from sample A10 / Example unspliced isoform:ACGGCAACATCAACACTGTCGgtaatcgcagcaacattcctaattccatttctcaatttcaaatactgctactttgtcaagtttttcattttcgaattcttatattagtttggaagatctttgaatttcaaaagttttctgtagGTGAGTTAGATTTCTCAAATTTCAATGGCTGATGAGAGCGGTTTCAAATGAACTGA
TCAACACAACAATAACACCAACACTGGTGGTGATTACAAAAACAACACCAATGAGCTGTTTATGCCGTCGGCCAACGTGACCAGAATAATGAGGAAAGTGTTGAGCGAGGATGCGAAGTTGTCGACAGAAGCCGAGGAGGTTGATGCAGCAGTGCGTGACAGAGTTTATGAGTTTTGTCACCGGGAAGGCGCACGAGAAG
TGCGCCACAGAGAGCCGTAAGACTCTTGGGGTCGATGATTTGTTTTGGGGCAGTAGAAGTTGTTGGGTACACGGACTGCATCATTCCTCTGCGTCGGTATTTATAGAAATACAGGAAACGGGAGCTGAGCAAACAAGCTGCTGCTTCAGAGGGTCATGGTGGCTTTACTCAACCTCATTCCAACGGCCATACTTTTTA
Intron 4 GTAATTCCAT ... TCTTCGCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 6 | 13 |
| A2 | 68.42 | 3 | 8 | 5 |
| A3 | 77.14 | 4 | 17 | 10 |
| A4 | 90.48 | 2 | 23 | 15 |
| A5 | 66.67 | 6 | 16 | 8 |
| A6 | 64.91 | 10 | 25 | 12 |
| A7 | 50 | 4 | 4 | 4 |
| A8 | 100 | 0 | 1 | 1 |
| A9 | 62.96 | 5 | 8 | 9 |
| A10 | 100 | 0 | 4 | 3 |
>TRINITY_DN46415_c0_g2_i4 from sample A7 / Example spliced isoformTGGAATAGTGCATTTGTGGATAAAAAACAAGCCCTGGATATCTCCAGAGCACAACAGAAGAGATTGAAGAGGGGATACATGGTATTGGGGGGATTGATGGGAAGGAAACTGATGATGAGAATATGAATTCCTGTGATTAATATGTTTCATGCACCACTTTCAATATTCTTGCTCCAGTATACAAGCGTATCGATAACGAG
AGCTGCAGTGAAAGCCAATTCAAAGATTGTTGGCGAAAGCGCAATCAAAAAATATTAGACATGCTGTTGGAGAAAAGATCATCCAACATTTGTTTACAGGAGCTTTGGGTTGGAAATGAGGAATTGGTGGAAATGTATGAACACAACTTGGGGAATAATGGTTATGAGATGTATAAACTTGGGCGCACAAATAACCGTGA
AGATGGGCTTTTCACTGCAGTTAGAAAGGATAATTTCAGAGTAGTAAGATCTCGGGAGTGGAGATTTAATGACCGTGGAGATCGTGTAGCTCAGCTACTACATGTTCAATCTGTATACAAAATCCTAGAGTATTTGGACACCTACAAGAAAGAATACAAGCTTCCTTCTGTCCCTATTATTCTCTGCGGGGATTGGAATG
GAAGCAAACGAGGGCACGTTTACAAATTCCTGCGGTCTCAAGGTTTTGTTTCTTCTTATGATACTGCTCACGACTATACAGACAGTGACGCCGATGCTCACAAGTGGGTTAGCCATCGCAATCACCGTGGCAATATTTGTGGAGTAGACTTCATTTGGCTCCTTAATCCCAACAACTGGAGGAAGCCTTTGAAGGATAGC
TGGAATGAAGCTGTATTTGGAATTATAAAGTCTAAATTGAATGAAGCTGGTTTGAAAGATAGAGATGCATTCCACTTCTTCAAGTCTGATAAATGCTGTGATAATTGGATAACATTCCCTGAATTTAAAGGTGCTCTCCAACAGGAGCGGTGTTTTGGCAGCCTTAATACCGACGAGATACAGGACTTGTTTGACTTGGC
TGACACTGATAGGAATGGAATTATTGACTATGAGGAGTTTCAGAGGATCTTGTTCCCGCTCTCTAAGCAGTCTGCTATCCATCCATTTGAAGGACAAGCTGCTGCAACAGGGAAATGGTTGGCATCACATTCTCCAGAAAATAGTGATCAGAAAGTGCCATCTGAGAAACCTAACTGTATTCCATCAACAATCAAACTTA
ATGGTGTTTTTGCTGGAGAACCCAGTGCTCCACTAGTGATGTTTGGACTTGATACGAAATTGCAGAACCTTGAAAACTTGCAAGAGGCCACCATTCGTTTTCATGTTAAAACAGCTTTTTTATTTCCCCCAGAGGTGGAGAGAGGCATGTGGCCTGAGAATTATGTTTTGTCTGACCACGCCCCCTTAACTGTTGTGTTT
GAAACATTGATCCAGTAGGGTTTCCAATGACACACGAGGCTGTACATTAGGCCTCTACTCACAGACAGCAGAAATCATTGTAACTGGTGTAGATGAAGTTAAAGATTGATCCAGCTGCGATAAGAAGTGTCACCATTTGGTTTGAATATTAAAATTGCAGGCATTCCTTTTCTGGATTGTCACAAGTTTAGTGTCTTGTA
CCATAGCTTAACTTCTGCAAAAGTTTAATGGCATGTCCTGCTGATTTATTACATAAGCTTCAGCATCCTCCTGGAATTAAACATTTTGATGGACATGAAATATGAAAATATTGGAGACGGTCCATCTGTAATATATACACACACTTGCAGTGATGGGATGTTAGCCAACAGTTAAATGATCTTATTGCCCTTTCTCAGGG
CAACATTTTTGTTGTACTGTCTGTCCTGTTGGCATTTTCTTTAACAAGATTTACTATTATTGGATTTTTGTGAACAAGCTTCTCATAATACCC
>TRINITY_DN46415_c0_g2_i8 from sample A7 / Example unspliced isoform:AGACTATTTCAAGTCTCAATTTATAGCAGAATTGGTGAATTTCTCTGGATTTTGTTGTGAAATTGATGATTAATGGATGATTCAAGTCGTGGGCTTCTCAGGGATTCAGGTTGCAGTATTTGTTGTTGATTGCTATGGCTATGGCGTCTCAGCGTGTTTGGGATTTCAGTGCAATATGTATTCTCTGTTGTCGTTGTTGC
TATTTTTATAACGTGCAAAAAGGGCCTGAGAAAAAAGTATAATTTCTGCTTTCGGTGCTTTCGGTTAATGGTATCGGTTTACAATGGGAATATAGGTAGGTGGTATTCTGTATACTATAATTTTCTAGCAGGCGGGGTTCTCAATTTTGCTTGGGATGCGGGTATCTGCTTTTCAGATTAACAGAATAGATTTTGATTCT
GGGATTATCTGATTCTGATTACTACTATTTATTCGAGTAGTGATGATCCTATACTTGTGCATTCAACTGTCAATCCTGAGGCTTGCTTGGTGTTGGTTCTAATAATCCTACTTCTAGTTCTGCCCTTGTGGATCTAGCTCTTGGGTTGATATTGGATCCAATATGTTGGGCACAGTGATGCCAGAGGAAAGTTTGGGGTT
TAAATCAAATACAGGTGTTGTGGGCATGGGATCTTCTGATTGGAATAGTGCATTTGTGGATAAAAAACAAGCCCTGGATATCTCCAGAGCACAACAGAAGAGATTGAAGAGGGGATACATGGTATTGGGGGGATTGATGGGAAGGAAACTGATGATGAGAATATGAATTCCTGTGATTAATATGTTTCATGCACCACTTT
CAATATTCTTGCTCCAGTATACAAGCGTATCGATAACGAGAGCTGCAGTGAAAGCCAATTCAAAGATTGTTGGCGAAAGCGCAATCAAAAAATATTAGACATGCTGTTGGAGAAAAGATCATCCAACATTTGTTTACAGGAGCTTTGGGTTGGAAATGAGGAATTGGTGGAAATGTATGAACACAACTTGGGGAATAATG
GTTATGAGATGTATAAACTTGGGCGCACAAATAACCGTGAAGATGGGCTTTTCACTGCAGTTAGAAAGGATAATTTCAGAGTAGTAAGATCTCGGGAGTGGAGATTTAATGACCGTGGAGATCGTGTAGCTCAGCTACTACATGTTCAATCTgtaattccatttccacaaagtcaaactggaattattcggcaagaaact
cttgttgtcaatacgcacttgatgtttcctcataattcaaatgtttgtcttgttcgtcttcgccagGTATACAAAATCCTAGAGTATTTGGACACCTACAAGAAAGAATACAAGCTTCCTTCTGTCCCTATTATTCTCTGCGGGGATTGGAATGGAAGCAAACGAGGGCACGTTTACAAATTCCTGCGGTCTCAAGGTTT
TGTTTCTTCTTATGATACTGCTCACGACTATACAGACAGTGACGCCGATGCTCACAAGTGGGTTAGCCATCGCAATCACCGTGGCAATATTTGTGGAGTAGACTTCATTTGGCTCCTTAATCCCAACAACTGGAGGAAGCCTTTGAAGGATAGCTGGAATGAAGCTGTATTTGGAATTATAAAGTCTAAATTGAATGAAG
CTGGTTTGAAAGATAGAGATGCATTCCACTTCTTCAAGTCTGATAAATGCTGTGATAATTGGATAACATTCCCTGAATTTAAAGGTGCTCTCCAACAGGAGCGGTGTTTTGGCAGCCTTAATACCGACGAGATACAGGACTTGTTTGACTTGGCTGACACTGATAGGAATGGAATTATTGACTATGAGGAGTTTCAGAGG
ATCTTGTTCCCGCTCTCTAAGCAGTCTGCTATCCATCCATTTGAAGGACAAGCTGCTGCAACAGGGAAATGGTTGGCATCACATTCTCCAGAAAATAGTGATCAGAAAGTGCCATCTGAGAAACCTAACTGTATTCCATCAACAATCAAACTTAATGGTGTTTTTGCTGGAGAACCCAGTGCTCCACTAGTGATGTTTGG
ACTTGATACGAAATTGCAGAACCTTGAAAACTTGCAAGAGGCCACCATTCGTTTTCATGTTAAAACAGCTTTTTTATTTCCCCCAGAGGTGGAGAGAGGCATGTGGCCTGAGAATTATGTTTTGTCTGACCACGCCCCCTTAACTGTTGTGTTTGAAACATTGATCCAGTAGGGTTTCCAATGACACACGAGGCTGTACA
TTAGGCCTCTACTCACAGACAGCAGAAATCATTGTAACTGGTGTAGATGAAGTTAAAGATTGATCCAGCTGCGATAAGAAGTGTCACCATTTGGTTTGAATATTAAAATTGCAGGCATTCCTTTTCTGGATTGTCACAAGTTTAGTGTCTTGTACCATAGCTTAACTTCTGCAAAAGTTTAATGGCATGTCCTGCTGATT
TATTACATAAGCTTCAGCATCCTCCTGGAATTAAACATTTTGATGGACATGAAATATGAAAATATTGGAGACGGTCCATCTGTAATATATACACACACTTGCAGTGATGGGATGTTAGCCAACAGTTAAATGATCTTATTGCCCTTTCTCAGGGCAACATTTTTGTTGTACTGTCTGTCCTGTTGGCATTTTCTTTAACA
AGATTTACTATTATTGGATTTTTGTGAACAAGCTTCTCATAATACCC
Intron 5 GTACTTCACT ... AATGGAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 13.33 | 13 | 3 | 1 |
| A2 | 46.67 | 4 | 4 | 3 |
| A3 | 31.03 | 10 | 9 | 0 |
| A4 | 28.57 | 15 | 11 | 1 |
| A5 | 23.81 | 8 | 1 | 4 |
| A6 | 17.24 | 12 | 4 | 1 |
| A7 | 27.27 | 4 | 1 | 2 |
| A8 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| A9 | 30.77 | 9 | 3 | 5 |
| A10 | 33.33 | 3 | 3 | 0 |
>TRINITY_DN110106_c0_g2_i4 from sample A2 / Example spliced isoformGAGAAATTGGTGATTAATGGATGATTCAAGTCGTGGGCTTCTCAGGGATTCAGGTTGCAGTATTTGTTGTTGATTGCTATGGCTATGGCGTCTGCGTGTTTGGGATTTCAGTGCAATATGTATTCTCTGTTGTCGTTGTTGCTATCTTTATAACGTGCAGAAAGGGCCTGAGAAAAAAGTATAATTTCTGCTTTCGGTGC
TTTCGGTTAATGGTATCGGTTTACAATGGGAATATAGGTAGGTGGTATTCTGGATACTATAATTTTCTAGCAGGCGGGGTTCTCAATTTTGCTTGGGATGCGGGTATCTGCTTTTCAGATTAACAGAATAGATTTTGATTCTGGGATTATCTGATTCTGATTACTACTATTTATTCGAGTAGTGATGATCCTATACTTGT
GCATTCAACTGTCAATCCTGAGGCTTGCTTGGTGTTGGTTCTAATAATCCTACTTCTAGTTCTGCCCTTGTGGATCTAGCTCTTGGGTTGATATTGGATCCAATATGTTGGGCACAGTGATGCCAGAGGAAAGTTTGGGGTTTAAATCAAATACAGGTGTTGTGGGCATGGGATCTTCTGATTGGAATAGTGCATTTGTG
GATAAAAAACAGGCCCTGGATATCTCCAGAGCACAGCAGAAGAGATTGAAGAGGGGGATACATCATGGTATTGGGGTGATTGATGGGAAGGCAACTGATGATGAGGATATGAATTCCTGTGATTCATCTGTTTCATGCACCACTTTCAATATTCTTGCTCCAATATACAAGCGTATCGATAGCGAGGGCTGCCGTGAAAG
CCAGTTCAGAGACTGTTGGCGGAAGCGCAATGAAAAAATATTAGACATGCTGCTGGAGAAAAGATCATCCATCATTTGTTTACAGGAGCTTTGGGTTGGAAATGAGGAACTGGTGGAAATGTATGAACGCAACTTGGGGAATAATGGTTATGAGATGTATAAACTTGGGCGCACAAATAACCGTGAAGATGGGCTTTTCA
CTGCAGTTAGAAAGGATAATTTCAGAGTAGTAAGATCTCGGGAGTGGAGATTTAATGACCGTGGAGATCGTGTAGCTCAGCTACTACATGTTCAATCTGTAATTCCATTTCCACAAAGTCAAACTGGAATTATTCGGCAAGAAACTCTTGTTGTCAATACGCACTTGATGTTTCCTCATAATTCAAATGTTTGTCTTGTT
CGTCTTCGCCAGGTATACAAAATCCTAGAGTATTTGGACACCTACAAGAAAGAATACAAGCTTCCTTCTGTCCCTATTATTCTCTGCGGGGATTGGAATGGAAGCAAACGAGGGCACGTTTACAAATTCCTGCGGTCTCAAGGTTTTGTTTCTTCTTATGATACTGCTCACGACTATACAGACAGTGACGCCGATGCTCA
CAAGTGGGTTAGCCATCGCAATCACCGTGGCAATATTTGTGGAGTAGACTTCATTTGGCTCCTTAATCCCAACAACTGGAGGAAGCCTTTGAAGGATAGCTGGAATGAAGCTGTATTTGGAATTATAAAGTCTAAATTGAATGAAGCTGGTTTGAAAGATAGAGATGCATTCCACTTCTTCAAGTCTGATAAATGCTGTG
ATAATTGGATAACATTCCCTGAATTTAAAGGTGCTCTCCAACAGGAGCGGTGTTTTGGCAGCCTTAATACCGACGAGATACAGGACTTGTTTGACTTGGCTGACACTGATAGGAATGGAATTATTGACTATGAGGAGTTTCAGAGGATCTTGTTCCCGCTCTCTAAGCAGTCTGCTATCCATCCATTTGAAGGACAAGCT
>TRINITY_DN110106_c0_g2_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:GAGAAATTGGTGATTAATGGATGATTCAAGTCGTGGGCTTCTCAGGGATTCAGGTTGCAGTATTTGTTGTTGATTGCTATGGCTATGGCGTCTGCGTGTTTGGGATTTCAGTGCAATATGTATTCTCTGTTGTCGTTGTTGCTATCTTTATAACGTGCAGAAAGGGCCTGAGAAAAAAGTATAATTTCTGCTTTCGGTGC
TTTCGGTTAATGGTATCGGTTTACAATGGGAATATAGGTAGGTGGTATTCTGGATACTATAATTTTCTAGCAGGCGGGGTTCTCAATTTTGCTTGGGATGCGGGTATCTGCTTTTCAGATTAACAGAATAGATTTTGATTCTGGGATTATCTGATTCTGATTACTACTATTTATTCGAGTAGTGATGATCCTATACTTGT
GCATTCAACTGTCAATCCTGAGGCTTGCTTGGTGTTGGTTCTAATAATCCTACTTCTAGTTCTGCCCTTGTGGATCTAGCTCTTGGGTTGATATTGGATCCAATATGTTGGGCACAGTGATGCCAGAGGAAAGTTTGGGGTTTAAATCAAATACAGGTGTTGTGGGCATGGGATCTTCTGATTGGAATAGTGCATTTGTG
GATAAAAAACAGGCCCTGGATATCTCCAGAGCACAGCAGAAGAGATTGAAGAGGGGGATACATCATGGTATTGGGGTGATTGATGGGAAGGCAACTGATGATGAGGATATGAATTCCTGTGATTCATCTGTTTCATGCACCACTTTCAATATTCTTGCTCCAATATACAAGCGTATCGATAGCGAGGGCTGCCGTGAAAG
CCAGTTCAGAGACTGTTGGCGGAAGCGCAATGAAAAAATATTAGACATGCTGCTGGAGAAAAGATCATCCATCATTTGTTTACAGGAGCTTTGGGTTGGAAATGAGGAACTGGTGGAAATGTATGAACGCAACTTGGGGAATAATGGTTATGAGATGTATAAACTTGGGCGCACAAATAACCGTGAAGATGGGCTTTTCA
CTGCAGTTAGAAAGGATAATTTCAGAGTAGTAAGATCTCGGGAGTGGAGATTTAATGACCGTGGAGATCGTGTAGCTCAGCTACTACATGTTCAATCTGTAATTCCATTTCCACAAAGTCAAACTGGAATTATTCGGCAAGAAACTCTTGTTGTCAATACGCACTTGATGTTTCCTCATAATTCAAATGTTTGTCTTGTT
CGTCTTCGCCAGgtacttcacttttcttctacttatttgttgtttatagtgatccaggtcttagaatttggctccagttgcattttttattttctaattttacaatgagatgttgtgggttctatctcttgaagcctaagcacattctttttcatatccattggttttattcaagaatccagtcttaagtttctaatgga
acagGTATACAAAATCCTAGAGTATTTGGACACCTACAAGAAAGAATACAAGCTTCCTTCTGTCCCTATTATTCTCTGCGGGGATTGGAATGGAAGCAAACGAGGGCACGTTTACAAATTCCTGCGGTCTCAAGGTTTTGTTTCTTCTTATGATACTGCTCACGACTATACAGACAGTGACGCCGATGCTCACAAGTGGG
TTAGCCATCGCAATCACCGTGGCAATATTTGTGGAGTAGACTTCATTTGGCTCCTTAATCCCAACAACTGGAGGAAGCCTTTGAAGGATAGCTGGAATGAAGCTGTATTTGGAATTATAAAGTCTAAATTGAATGAAGCTGGTTTGAAAGATAGAGATGCATTCCACTTCTTCAAGTCTGATAAATGCTGTGATAATTGG
ATAACATTCCCTGAATTTAAAGGTGCTCTCCAACAGGAGCGGTGTTTTGGCAGCCTTAATACCGACGAGATACAGGACTTGTTTGACTTGGCTGACACTGATAGGAATGGAATTATTGACTATGAGGAGTTTCAGAGGATCTTGTTCCCGCTCTCTAAGCAGTCTGCTATCCATCCATTTGAAGGACAAGCT
Intron 6 GTAGGTGGTA ... TAAAAAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 71.43 | 8 | 15 | 25 |
| A2 | 57.58 | 21 | 28 | 29 |
| A3 | 67.27 | 9 | 9 | 28 |
| A4 | 75 | 5 | 10 | 20 |
| A5 | 78.57 | 3 | 11 | 11 |
| A6 | 83.78 | 3 | 4 | 27 |
| A7 | 72.97 | 5 | 6 | 21 |
| A8 | 81.82 | 3 | 1 | 26 |
| A9 | 74.6 | 8 | 7 | 40 |
| A10 | 77.14 | 4 | 12 | 15 |
>TRINITY_DN108967_c0_g1_i3 from sample A3 / Example spliced isoformGAATTTCTTTGGATTTTGTTGAGAAATTGGTGATTAATGGATGATTCAAGTCGTGGGCTTCTCAGGGATTCAGGTTGCAGTATTTGTTGTTGATTGCTATGGCTATGGCGTCTGCGTGTTTGGGATTTCAGTGCAATATGTATTCTCTGTTGTCGTTGTTGCTATCTTTATAACGTGCAGAAAGGGCCTGAGAAAAAAGT
ATAATTTCTGCTTTCGGTGCTTTCGGTTAATGGTATCGGTTTACAATGGGAATATAGGCCCTGGATATCTCCAGAGCACAGCAGAAGAGATTGAAGAGGGGGATACATCATGGTATTGGGGTGATTGATGGGAAGGCAACTGATGATGAGGATATGAATTCCTGTGATTCATCTGTTTCATGCACCACTTTCAATATTCT
TGCTCCA
>TRINITY_DN108967_c0_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:GAATTTCTTTGGATTTTGTTGAGAAATTGGTGATTAATGGATGATTCAAGTCGTGGGCTTCTCAGGGATTCAGGTTGCAGTATTTGTTGTTGATTGCTATGGCTATGGCGTCTGCGTGTTTGGGATTTCAGTGCAATATGTATTCTCTGTTGTCGTTGTTGCTATCTTTATAACGTGCAGAAAGGGCCTGAGAAAAAAGT
ATAATTTCTGCTTTCGGTGCTTTCGGTTAATGGTATCGGTTTACAATGGGAATATAGgtaggtggtattctggatactataattttctagcaggcggggttctcaattttgcttgggatgcgggtatctgcttttcagattaacagaatagattttgattctgggattatctgattctgattactactatttattcgagt
agtgatgatcctatacttgtgcattcaactgtcaatcctgaggcttgcttggtgttggttctaataatcctacttctagttctgcccttgtggatctagctcttgggttgatattggatccaatatgttgggcacagtgatgccagaggaaagtttggggtttaaatcaaatacaggtgttgtgggcatgggatcttctg
attggaatagtgcatttgtggataaaaaacagGCCCTGGATATCTCCAGAGCACAGCAGAAGAGATTGAAGAGGGGGATACATCATGGTATTGGGGTGATTGATGGGAAGGCAACTGATGATGAGGATATGAATTCCTGTGATTCATCTGTTTCATGCACCACTTTCAATATTCTTGCTCCAATATACAAGCGTATCGAT
AGCGAGGGCTGCCGTGAAAGCCAGTTCAGAGACTGTTGGCGGAAGCGCAATGAAAAAATATTAGACATGCTGCTGGAGAAAAGATCATCCATCATTTGTTTACAGGAGCTTTGGGTTGGAAATGAGGAATTGGTGGAAATGTATGAACACAACTTGGGGAATAATGGTTATGAGATGTATAAACTTGGGCGCACAAATAA
CCGTGAAGATGGGCTTTTCACTGCAGTTAGAAAGGATAATTTCAGAGTAGTAAGATCTCGGGAGTGGAGATTTAATGACCGTGGAGATCGTGTAGCTCAGCTACTACATGTTCAATCTGTAATTCCATTTCCACAAAGTCAAACTGGAATTATTCGGCAAGAAACTCTTGTTGTCAATACGCACTTGATGTTTCCTCATA
ATTCAAATGTTTGTCTTGTTCGTCTTCGCCAGGTATACAAAATCCTAGAGTATTTGGACACCTACAAGAAAGAATACAAGCTTCCTTCTGTCCCTATTATTCTCTGCGGGGATTGGAATGGAAGCAAA
Intron 7 GTGAGTGCCT ... CCATAATTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25 | 9 | 3 | 3 |
| A2 | 11.11 | 8 | 2 | 0 |
| A3 | 28.81 | 21 | 9 | 8 |
| A4 | 57.89 | 4 | 0 | 11 |
| A5 | 31.71 | 14 | 9 | 4 |
| A6 | 11.76 | 30 | 4 | 4 |
| A7 | 17.78 | 37 | 6 | 10 |
| A8 | 19.51 | 33 | 8 | 8 |
| A9 | 4.88 | 39 | 4 | 0 |
| A10 | 26.09 | 17 | 4 | 8 |
>TRINITY_DN108967_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoformGAATTTCTTTGGATTTTGTTGAGAAATTGGTGATTAATGGATGATTCAAGTCGTGGGCTTCTCAGGGATTCAGGTTGCAGTATTTGTTGTTGATTGCTATGGCTATGGCGTCTGCGTGTTTGGGATTTCAGTGCAATATGTATTCTCTGTTGTCGTTGTTGCTATCTTTATAACGTGCAGAAAGGGCCTGAGAAAAAAGT
ATAATTTCTGCTTTCGGTGCTTTCGGTTAATGGTATCGGTTTACAATGGGAATATAGGTAGGTGGTATTCTGGATACTATAATTTTCTAGCAGGCGGGGTTCTCAATTTTGCTTGGGATGCGGGTATCTGCTTTTCAGATTAACAGAATAGATTTTGATTCTGGGATTATCTGATTCTGATTACTACTATTTATTCGAGT
AGTGATGATCCTATACTTGTGCATTCAACTGTCAATCCTGAGGCTTGCTTGGTGTTGGTTCTAATAATCCTACTTCTAGTTCTGCCCTTGTGGATCTAGCTCTTGGGTTGATATTGGATCCAATATGTTGGGCACAGTGATGCCAGAGGAAAGTTTGGGGTTTAAATCAAATACAGGTGTTGTGGGCATGGGATCTTCTG
ATTGGAATAGTGCATTTGTGGATAAAAAACAGGCCCTGGATATCTCCAGAGCACAGCAGAAGAGATTGAAGAGGGGGATACATCATGGTATTGGGGTGATTGATGGGAAGGCAACTGATGATGAGGATATGAATTCCTGTGATTCATCTGTTTCATGCACCACTTTCAATATTCTTGCTCCAATATACAAGCGTATCGAT
AGCGAGGGCTGCCGTGAAAGCCAGTTCAGAGACTGTTGGCGGAAGCGCAATGAAAAAATATTAGACATGCTGCTGGAGAAAAGATCATCCATCATTTGTTTACAGGAGCTTTGGGTTGGAAATGAGGAATTGGTGGAAATGTATGAACACAACTTGGGGAATAATGGTTATGAGATGTATAAACTTGGGCGCACAAATAA
CCGTGAAGATGGGCTTTTCACTGCAGTTAGAAAGGATAATTTCAGAGTAGTAAGATCTCGGGAGTGGAGATTTAATGACCGTGGAGATCGTGTAGCTCAGCTACTACATGTTCAATCTGTAATTCCATTTCCACAAAGTCAAACTGGAATTATTCGGCAAGAAACTCTTGTTGTCAATACGCACTTGATGTTTCCTCATA
ATTCAAATGTTTGTCTTGTTCGTCTTCGCCAGGTATACAAAATCCTAGAGTATTTGGACACCTACAAGAAAGAATACAAGCTTCCTTCTGTCCCTATTATTCTCTGCGGGGATTGGAATGGAAGCAAA
>TRINITY_DN108967_c0_g1_i5 from sample A3 / Example unspliced isoform:GAATTTCTTTGGATTTTGTTGAGAAATTGGTGATTAATGGATGATTCAAGTCGTGGGCTTCTCAGGGATTCAGGTTGCAGTATTTGTTGTTGATTGCTATGGCTATGGCGTCTGCGTGTTTGGGATTTCAGTGCAATATGTATTCTCTGTTGTCGTTGTTGCTATCTTTATAACGTGCAGAAAGGGCCTGAGAAAAAAGT
ATAATTTCTGCTTTCGGTGCTTTCGGTTAATGGTATCGGTTTACAATGGGAATATAGGTAGGTGGTATTCTGGATACTATAATTTTCTAGCAGGCGGGGTTCTCAATTTTGCTTGGGATGCGGGTATCTGCTTTTCAGATTAACAGAATAGATTTTGATTCTGGGATTATCTGATTCTGATTACTACTATTTATTCGAGT
AGTGATGATCCTATACTTGTGCATTCAACTGTCAATCCTGAGGCTTGCTTGGTGTTGGTTCTAATAATCCTACTTCTAGTTCTGCCCTTGTGGATCTAGCTCTTGGGTTGATATTGGATCCAATATGTTGGGCACAGTGATGCCAGAGGAAAGTTTGGGGTTTAAATCAAATACAGGTGTTGTGGGCATGGGATCTTCTG
ATTGGAATAGTGCATTTGTGGATAAAAAACAGGCCCTGGATATCTCCAGAGCACAGCAGAAGAGATTGAAGAGGGGGATACATCATGGTATTGGGGTGATTGATGGGAAGGCAACTGATGATGAGGATATGAATTCCTGTGATTCATCTGTTTCATGCACCACTTTCAATATTCTTGCTCCAATATACAAGCGTATCGAT
AGCGAGGGCTGCCGTGAAAGCCAGTTCAGAGACTGTTGGCGGAAGCGCAATGAAAAAATATTAGACATGCTGCTGGAGAAAAGATCATCCATCATTTGTTTACAGgtgagtgcctaaaatctcttttgaacgtgtgattcgagtgtttgtttcttgctcgcaggtagattctattctcatctaaaagttccagttaggac
tatgcacttccgcacagattttgttttaatttcaacatgcaattagggctttctatactgtcaggaaatcctagggtttgccaattcagaaagggtctgcacagtgttgtttccccagctttttgaagctgattttttttttttttttttgtgtcttctctccataattagGAGCTTTGGGTTGGAAATGAGGAATTGGT
GGAAATGTATGAACACAACTTGGGGAATAATGGTTATGAGATGTATAAACTTGGGCGCACAAATAACCGTGAAGATGGTAATTCTCAGTTTCATTTCTTCTTGCTTTATATGGTTTATTAGGAATGTAATTTATATTGAGGGGTTTTCTTGTTGTTGGATGATCTTTCTCACTCTCTGAAGTTCTTAAAGAAACATGCCC
CAATGTGCTACACAATAGATTTCCTTTGGCTTAGGTGCTAGGTCTGTCTGAGAGGTATCCTTCCATCTTCATTAGCATCATAATGATTCTATTTAG
Intron 8 GTACTAGTTT ... TTTTTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21.4 | 3219 | 878 | 875 |
| A2 | 20.61 | 5525 | 1595 | 1273 |
| A3 | 20.41 | 5949 | 1800 | 1251 |
| A4 | 20.58 | 4790 | 1442 | 1040 |
| A5 | 20.75 | 6556 | 2290 | 1144 |
| A6 | 21.76 | 694 | 196 | 190 |
| A7 | 23.38 | 177 | 52 | 56 |
| A8 | 21.61 | 205 | 53 | 60 |
| A9 | 24.28 | 290 | 95 | 91 |
| A10 | 20.54 | 89 | 33 | 13 |
>TRINITY_DN44083_c0_g1_i14 from sample A9 / Example spliced isoformCGATTTCAAATTCTATTTGTTACTTAGATCTCTGTATTTCAAATTGTAGATTCCTCAATTTTAATAGTGTGATGTCTATTATGTTAATTTGTTAGATTTCTCGATTTCGATTTCAAATTTCAAATTCTGTTAGTTTGTTTGATTTTTCGATTTCAAAACCTATTTATTAGCTAGATTTATCAATTTCAAATTGTCTTTTG
TCTTTGTTAATTAGATTTCTGAATTTCAACAGTTTTCCGTAGGTGAGAATTGCTATAATTCTGTCTGTTCTTTCGATTTCTCAATTTCAATAGCCGATGGGAAGGGCTCCGAATCATTTTTTTTCTTGCTGTACTAAATTTTGAAAATCAAAGCTTCCTGGCTATTACGAAACTCGAACAGATAGAAAGTGTGGCCGTTG
GAATGAGGCTTGAGTAAAGTCAGCATGACCCTTGAAGGAGCAGCTTGTTCCCTCAGCTCCTGTTCCCTGTATTTCTCTTAACGCCGACGCAGAGGAGTAATGTAGTCCGTGTACCCAACAACTTCTATTGCCACACACCAAATCATTGACACCAATAGTCTTACGGTTCTCTGAGACGCACTTCTCATGTGCCATTCCGG
TGATAAAACTGATAAATTCTGTGACGCACTGCTGCATCAACCCCTTGGTTTCTGTCGACACCTTCGCATTCTTGCCCAACACTTTCTTTCATTATTCTGCTCACGATGGCCGACGGCATATACAACTCATTGGGGTTGTTGCTGTAATTACCACCACTGTTGGTGTTATTGTTGTGTATTTCTTTAAATACCGAAGCCGA
GGAGCTATGCAACACTGCTATTCTTGTTAGATTTCTGCGGAATGAGGCATTGCTATTCTGTCTGCGGAATACCGAAGCCGAGGAATGAAGGCTGCGGAGTGAGGGACTGCTATTCTGATGAGCATTGCTATTCTGTCTGTTTGTTCGATTTCTCAATTTCAATGGCCGATTGGAACAGCTCCGAAACAACTAAAAACGGC
AACATCAACACTGTGAGTTAGATTTCTCAAATTTCAATGGCTGATGAGAGCGGTTTCAAATGAACTGATCAACACAACAATAACACCAACACTGGTGGTGATTACAAAAACAACACCAATGAGCTGTTTATGCCGTCGGCCAACGTGACCAGAATAATGAGGAAAGTGTTGAGCGAGGATGCGAAGTTGTCGACAGAAGC
CGAGGAGGTTGATGCAGCAGTGCGTGACAGAGTTTATGAGTTTTGTCACCGGGAAGGCGCACGAGAAGTGCGCCACAGAGAGCCGTAAGACTCTTGGGGTCGATGATTTATTTTGGGGCAGTAGAAGTTGTTGGGTACACGGACTGCATCATTCCTCTGCGTCGGTATTTATAGAAATACAGGAAACGGGAGCTGAGCAA
ACAAGCTGCTGCTTCAGAGGGTCATGGTGGCTTTACTCAACCTCATTCCAACGGCCATACTTTTTATCTGTTCGAGTTTCTCAAAATTTTTGTACAGCAGGAAGAAAATGATAGGTGATTTACTGTCTTGTTGATTGCATCTCAAAACAATCAAGGGCATTCAATTTTTTGTGAGGGCATTCTATTTTTTAATGAGCTGA
AATGGAATTGGGATGCCTTATTTTAGGGCATTCAATTATTTTTAACGACATTCAACTTTTTAAAGATTTTTCAGAAATGCTCAGATCCAACTTTTACCAATGTTCAAGAACAGATTCTTTAATTTTTAATTCAATTACATAGCTGAGTTCTTTCATGTCCA
>TRINITY_DN44083_c0_g1_i8 from sample A9 / Example unspliced isoform:CGATTTCAAATTCTATTTGTTACTTAGATCTCTGTATTTCAAATTGTAGATTCCTCAATTTTAATAGTGTGATGTCTATTATGTTAATTTGTTAGATTTCTCGATTTCGATTTCAAATTTCAAATTCTGTTAGTTTGTTTGATTTTTCGATTTCAAAACCTATTTATTAGCTAGATTTATCAATTTCAAATTGTCTTTTG
TCTTTGTTAATTAGATTTCTGAATTTCAACAGTTTTCCGTAGGTGAGAATTGCTATAATTCTGTCTGTTCTTTCGATTTCTCAATTTCAATAGCCGATGGGAAGGGCTCCGAATCATTTTTTTTCTTGCTGTACTAAATTTTGAAAATCAAAGCTTCCTGGCTATTACGAAACTCGAACAGATAGAAAGTGTGGCCGTTG
GAATGAGGCTTGAGTAAAGTCAGCATGACCCTTGAAGGAGCAGCTTGTTCCCTCAGCTCCTGTTCCCTGTATTTCTCTTAACGCCGACGCAGAGGAGTAATGTAGTCCGTGTACCCAACAACTTCTATTGCCACACACCAAATCATTGACACCAATAGTCTTACGGTTCTCTGAGACGCACTTCTCATGTGCCATTCCGG
TGATAAAACTGATAAATTCTGTGACGCACTGCTGCATCAACCCCTTGGTTTCTGTCGACACCTTCGCATTCTTGCCCAACACTTTCTTTCATTATTCTGCTCACGATGGCCGACGGCATATACAACTCATTGGGGTTGTTGCTGTAATTACCACCACTGTTGGTGTTATTGTTGTGTATTTCTTTAAATACCGAAGCCGA
GGAGCTATGCAACACTGCTATTCTTGTTAGATTTCTGCGGAATGAGGCATTGCTATTCTGTCTGCGGAATACCGAAGCCGAGGAATGAAGGCTGCGGAGTGAGGGACTGCTATTCTGgtactagtttgttagatttcaaattctgttaggttgtttgatttgtcgatttcaaattctttttgttagttagatttctcaat
ttcaatggttttttttgtagATGAGCATTGCTATTCTGTCTGTTTGTTCGATTTCTCAATTTCAATGGCCGATTGGAACAGCTCCGAAACAACTAAAAACGGCAACATCAACACTGTGAGTTAGATTTCTCAAATTTCAATGGCTGATGAGAGCGGTTTCAAATGAACTGATCAACACAACAATAACACCAACACTGGTG
GTGATTACAAAAACAACACCAATGAGCTGTTTATGCCGTCGGCCAACGTGACCAGAATAATGAGGAAAGTGTTGAGCGAGGATGCGAAGTTGTCGACAGAAGCCGAGGAGGTTGATGCAGCAGTGCGTGACAGAGTTTATGAGTTTTGTCACCGGGAAGGCGCACGAGAAGTGCGCCACAGAGAGCCGTAAGACTCTTGG
GGTCGATGATTTATTTTGGGGCAGTAGAAGTTGTTGGGTACACGGACTGCATCATTCCTCTGCGTCGGTATTTATAGAAATACAGGAAACGGGAGCTGAGCAAACAAGCTGCTGCTTCAGAGGGTCATGGTGGCTTTACTCAACCTCATTCCAACGGCCATACTTTTTATCTGTTCGAGTTTCTCAAAATTTTTGTACAG
CAGGAAGAAAATGATAGGTGATTTACTGTCTTGTTGATTGCATCTCAAAACAATCAAGGGCATTCAATTTTTTGTGAGGGCATTCTATTTTTTAATGAGCTGAAATGGAATTGGGATGCCTTATTTTAGGGCATTCAATTATTTTTAACGACATTCAACTTTTTAAAGATTTTTCAGAAATGCTCAGATCCAACTTTTAC
CAATGTTCAAGAACAGATTCTTTAATTTTTAATTCAATTACATAGCTGAGTTCTTTCATGTCCA