NA ----> NA


Intron 1 GTTGGCTATA ... ATTTATGCAG

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>TRINITY_DN112042_c0_g2_i2 from sample A1 / Example spliced isoform
GAAATGAAATGGGAGGCAAATGAATCCGAAATTAAATGACGACACGCGGGGATTTAGTCTGCAAAATGTCCCGGAACGGAAGGGTTTGGTCACATGTAAAAGACTAAATATTCTTCTGGCAAAGAACGGAGGGAGAGCTGTTTGGCAGAAGGACTGATGCAGTTCAGAGTTCAGACTGTACTGTACGTCTGTTCATTCCA
ATAGAGGCTCAGGTTTAGGCTGAGTAAGAAGCCTAAAGTTGTATTTTGGTAACAGTGTCTGCTTGTCTTCAGAGAACGGCCTCGCCGTGGTTTTCATGAATCAGCTTTTGAAATTAGCAGAGATTTTATGTTTACCTAACCCCGGCTCGGTTATGTAATCCGGCGAGAGGTATCGAATTTTAGGTTTTGCGGAATGAGAA
TGGCGGCGCAAAGCAGCAGTAATAATCCGGCGGCCGTGCCGGTGAGCGAAGTGTATTGGAGCCTGGTGGAGAAGGCCGACAAGAAATTCGCCCGCGTTAGGGATTTGCCGGCCTACGGCCGGAGCAGGTACGACTCTTATTTCCACAAGGTCTTCAAGGTTTACACGAAATTGTGGAAATTTCAGCAGGAGAACAGGCAG
AAATTAGTGGAGGCGGGGCTCAAGCGCTGGGAGATCGGCGAAATTGCGTCCCGGATCGCTCAGCTTTATTACAGTCAGTACCAGAGAACGAGCGAGGCGAGTTATCTGTCTGAGTCTTATATCTTCTACGAGGCAATCTTGAGCCGCGAGTATTTCAAGGATAGCGGTCAGGATCTAGGCTTGGCTAACAAGCAGCTCCG
CTGTTATGCCCGCTTCATTCTCGTCTGCCTCATGCTTAATCGCAGGGAGATGGTCCAGCATCTTCTTAATCAGTTTCGGATGCTCGTCGATGAATACCGCCGGACTTTTCAGGAGACTGATGCTAAAGAATGGAAGCGGATAGTGCAAGAAATTATTCGTTTTGTGAAAGCAGATACTGCATTTCAGAACAGCAGGCCTT
TACGTTATAGTGTGCGGCTTGATCCCCATCCAAATTCACATCCTTCTGTTGCTAGCTTGGAAGGCAGGCAGGCTTTAACATTACGAGATGCATTATTGACAAGCTATCATCGTAATGAGATAAAGTTTGCTGAGGTTACTCTTGATACCTTCAGAATGCTCCAGTGTTTAGAATGGGAGCCAAGTGGGATATTCTACCAG
CCGCGAACATCAGAGTCAGGAATGAATGGATCATTCACTGGACAAAGTGGTTCAAGCCGCATGAACCCTATGGATGATATAACTGATCCAACTTTACCCCCAAATCCACGCAAAGCTATCCTATATCGGCCCACTGCTATGCATTTTCTAGCGGTATTAGCCACCATTTGTGAAGAGCTACCAGCTGATAGTGTCGTGCT
GTTGTATCTCTCAGCATCAGGGATGGCAAGTCGAGGTCCTCTTTCACTTTCTACACCTTCTGGCACTTATGGAGAGGCAGAATCTCATACAGATCGGCATGTTATAGATACAGCATCAGATGCAAACTCCATTTCTCCAATGAGCTCACCGCATGATAGCCCCACAATTCATAGAACTGCTGTTCATGAGAGGGGGCACT
TAATCAACAATGGTGGGGGTGGGCTATTGCTGAGTTCTCGAGGAAATAGAGGTATTCACAGATATGCAATTCTTAGTTCGGGCTTTGTATTCCACAGTTGAGATTATTGCTGGTTTTCTGTCAAAATTGTATCAGTAGCCTATTTCAGCTTGTTATTAGAAATATTTTTGTTTCAAGTTTTCCTTTTTATTACATACTCA
GCTTAAAAATAAGTTCTAATGCCAGCCAGGATCTATAAGTGGGTATGGCATGTGAAAAGTAATGTGTTCACTGTTGACTGAGATTAAACTGTCTAAACTTTAAATCAATGAAATTTTTTACTTCAAAAGTGTGAAGTTCTTCCCCATTTTCAGAGATTTGGATTCTAGAAGCTGGCACAGGAAGATTCTCAAAAGTCTGC
ATCATTCTGGATCTTTGATCTTGAATGGGTTATTATTGCATTTCCTTCTCTTCCAAGTTTTTCCAGGTAGCATTATTTGCCAAGTGATGCTTAGAATACAGTGCAGCTTGTCACAGAGATAGGCATCAGCTTACTAGCCTTGACAGGTAGATTGGGCCTTATGTGGATTCAAATTTTTGACCATTATCCCTCTAAAACTG
CAACAAAATCTTAATCAGGGTTTATCAGCTTCAAAATTTATATTGACCTGGTTTATCTTAATGTCACCTTCCATCCTTTACTTTCTATGGGGTATAAGGTGTTGATGTTTGTAGCATTGGACATGTACTTCCACATGGTTTTGTGTCTAACAGGTGGAAGTTGTCACTAGTACCTCTCAGACATAGGAAATTCACTTTAA
TTAGGTGAAATGTTTTTAGATTAATTTGAGAGATTAATTTAAGT


>TRINITY_DN112042_c0_g2_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CTGTTGTATCTCTCAGCATCAGgttggctatatgttgtcactatcattttttgtttggctctcctacagagttgcacatggtcttgtttgtcatgtcaatgaaaaatttatgcagGGATGGCAAGTCGAGGTCCTCTTTCACTTTCTACACCTTCTGGCACTTATGGAGAGGCAGAATCTCATACAGATCGGCATGTTAT
AGATACAGCATCAGATGCAAACTCCATTTCTCCAATGAGCTCACCGCATGATAGCCCCACAATTCATAGAACTGCTGTTCATGAGAGGGGGCACTTAATCAACAATGGTGGGGGTGGGCTATTGCTGAGTTCTCGAGGAAATAGAGGTTTGAACACTGTTTACCCAGGCGATATCATTCCCTTCACAAGAAAGCCTCTCT
TCATTATTATTGAGAGTGACAACAGTAATATGTTCAAGGTCATCAGCGGTGCAGAGCGAGGGGAGCCAGCTGTATTATTCCTTTCCCCGATGGTGCAACCTCCCTGTGTAAGCACACCTACAGATTCTTCTCGTTATCAAAATAATGGGAGTCTTTTTACATTTTTCCTTACAGCTCCCTTACTGGCTTTCTGCCGACTG
GTTGGTCTGTCAGCAACGAATTTAGGGATGGGTGTATACGACCGAGCAGACAAATTGCTTTCCTCTTTCTTTTCAGAATGGGGAGAGGCGCTCACAATGTCTAACTCACTTGACTTGGTGTGGGCACGCCTTCTCTCTGATCCTTTCTTAAAGCGCCTGATTCTCAGGTTCATTTTCTGTCGGGCATGCTTTTCTCTGTA
TTCCCCATCTTCCAAAAAGAAGGAATGTATACCAGATTGTCTACCTCAACTTCCAGAGGAGTTCATGCCAGTTTCATCAACTGTAGAAGCTTGCATATCTCAACTCGCAAGCAGCCTTAAAGTAGGAAAGCATTTTAGATTTTCTGCAAGCATGTCCATTTCAGAAGACAGTGGAGCTGAAAGCCAGCAGGATGCTGATT
TTGCTTCCAGTGAATATAGCAGAAACAAAACTTCGGATGTGAATACTGGGGAGATTGAAGAACAGCAGTTTGTGGAAGAAAATGGCCACTAGGCATACTATTGAATAGATAATTGATGAATTAAAAGTGCTCGGAGTTGTATGTTTCCAGGAATACTGGGGGATTTTAGCTCATTCATAGAATCACAACACTGCAAGGAT
GGATTGCAGGCATTGTTGACTGGATGAATCTTGAAAGAGATTATCAGGGTTTTATACAGCCATTATTTGTTACCATACTTGAAACTGCCTACTGTGCAAACCTATTTTGGAAAATCTATTATCATTTGACCGCTGCTGAGACTGTCTGGTGATTGATTCTCTGAAAATGAAGCTTAAATGACTTGGTTGGATTCATGGGT
GTATCAGGACATGGAAAGCAGTTTGGGTACAAACTAAGTTGATGGTGTTAGATTCAAAGCACAGAACAGATATCAAGGATTTGGGTTTGGTCCGACTTTTACAACTTCATGATCACAAGTTACAACGTTGAACATATTTCCTTTTCCTGTTCATCATGGTCTAAGTTCTAACAGGCTTTAATAGAAGATCGTTTAGTGAT
CTTGAACATTGTTAAACTATTTCTTATTTGTTCACAGGATTAAGCGTTCATACAGGCTGAGGGCTTATCAGCCAAGATGTTGGATGGTTACAAAATCACATCTTTTCTAAGCTTTGTTTGAGGGGAGAGTGTAGCGTTCTTCTCAACTGTCAGTCTGAACTGTTGAGAATGTGTTATGTTGGTGCCATTATTTGGAAGTC
ATAAAATTTTCAGCACTCGCAAACAGCTGCAATTGTAGTTTACTAGATATAATGTGAAGTGCATTTTTTGGTCTTTTATTTTATTTCTGAAGTTTAAAAAACTAGACAGAAAGGCTTTCTTAACTGATCGCCTATACTGAATTTTACAGTGCGTAAGGACAGCAGAGATGATCATAAGAGATTCACCCTTAAAAATCCCC
TTGTGATGGGTTGGATCGGACATGATTTGTGGAAGTGTTTGGTAGAATGCTATATCAAATTGCTTGGAGTATCAGATGGACAATGGCTTCTTTACAGGTTAACATTCCATGGTGTTATGCCATTTGCCATG




Intron 2 GTTTTAAGCT ... ATATATTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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>TRINITY_DN31638_c0_g1_i1 from sample A9 / Example spliced isoform
GATGAAATGAAATGGGAGGCAAATGAATCCGAAATTAAATGACGACACGCGGGGATTTAGTCTGCAAAATGTCCCGGAACGGAAGGGTTTGGTCACATGTAAAAGACTAAATATTCTTCTGGCAAAGAACGGAGGGAGAGCTGTTTGGCAGAAGGACTGATGCAGTTCAGAGTTCAGACTGTACTGTACGTCTGTTCATT
CCAATAGAGGCTCAGGTTTAGGCTGAGTAAGAAGCCTAAAGTTGTATTTTGGTAACAGTGTCTGCTTGTCTTCAGAGAACGGCCTCGCCGTGGTTTTCATGAATCAGCTTTTGAAATTAGCAGAGATTTTATGTTTACCTAACCCCGGCTCGGTTATGTAATCCGGCGAGAGGTATCGAATTTTAGGTTTTGCGGAATGA
GAATGGCGGCGCAAAGCAGCAGTAATAATCCGGCGGCCGTGCCGGTGAGCGAAGTGTATTGGAGCCTGGTGGAGAAGGCCGACAAGAAATTCGCCCGCGTTAGGGATTTGCCGGCCTACGGCCGGAGCAGGTACGACTCTTATTTCCACAAGGTCTTCAAGGTTTACACGAAATTGTGGAAATTTCAGCAGGAGAACAGG
CAGAAATTAGTGGAGGCGGGGCTCAAGCGCTGGGAGATCGGCGAAATTGCGTCCCGGATCGCTCAGCTTTATTACAGTCAGTACCAGAGAACGAGCGAGGCGAGTTATCTGTCTGAGTCTTATATCTTCTACGAGGCAATCTTGAGCCGCGAGTATTTCAAGGATAGCGGTCAGGATCTAGGCTTGGCTAACAAGCAGCT
CCGCTGTTATGCCCGCTTCATTCTCGTCTGCCTCATGCTTAATCGCAGGGAGATGGTCCAGCATCTTCTTAATCAGTTTCGGATGCTCGTCGATGAATACCGCCGGACTTTTCAGGAGACTGATGCTAAAGAATGGAAGCGGATAGTGCAAGAAATTATTCGTTTTGTGAAAGCAGATACTGCATTTCAGAACAGCAGGC
CTTTACGTTATAGTGTGCGGCTTGATCCCCATCCAAATTCACATCCTTCTGTTGCTAGCTTGGAAGGCAGGCAGGCTTTAACATTACGAGATGCATTATTGACAAGCTATCATCGTAATGAGATAAAGTTTGCTGAGGTTACTCTTGATACCTTCAGAATGCTCCAGTGTTTAGAATGGGAGCCAAGTGGGATATTCTAC
CAGCCGCGAACATCAGAGTCAGGAATGAATGGATCATTCACTGGACAAAGTGGTTCAAGCCGCATGAACCCTATGGATGATATAACTGATCCAACTTTACCCCCAAATCCACGCAAAGCTATCCTATATCGGCCCACTGCTATGCATTTTCTAGCGGTATTAGCCACCATTTGTGAAGAGCTACCAGCTGATAGTGTCGT
GCTGTTGTATCTCTCAGCATCAGGGATGGCAAGTCGAGGTCCTCTTTCACTTTCTACACCTTCTGGCACTTATGGAGAGGCAGAATCTCATACAGATCGGCATGTTATAGATACAGCATCAGATGCAAACTCCATTTCTCCAATGAGCTCACCGCATGATAGCCCCACAATTCATAGAACTGCTGTTCATGAGAGGGGGC
ACTTAATCAACAATGGTGGGGGTGGGCTATTGCTGAGTTCTCGAGGAAATAGAGGTTTGAACACTGTTTACCCAGGCGATATCATTCCCTTCACAAGAAAGCCTCTCTTCATTATTATTGAGAGTGACAACAGTAATATGTTCAAGGTCATCAGCGGTGCAGAGCGAGGGGAGCCAGCTGTATTATTCCTTTCCCCGATG
GTGCAACCTCCCTGTGTAAGCACACCTACAGATTCTTCTCGTTATCAAAATAATGGGAGTCTTTTTACATTTTTCCTTACAGCTCCCTTACTGGCTTTCTGCCGACTGGTTGGTCTGTCAGCAACGAATTTAGGGATGGGTGTATACGACCGAGCAGACAAATTGCTTTCCTCTTTCTTTTCAGAATGGGGAGAGGCGCT
CACAATGTCTAACTCACTTGACTTGGTGTGGGCACGCCTTCTCTCTGATCCTTTCTTAAAGCGCCTGATTCTCAGGTTCATTTTCTGTCGGGCATGCTTTTCTCTGTATTCCCCATCTTCCAAAAAGAAGGAATGTATACCAGATTGTCTACCTCAACTTCCAGAGGAGTTCATGCCAGTTTCATCAACTGTAGAAGCTT
GCATATCTCAACTCGCAAGCAGCCTTAAAGTAGGAAAGCATTTTAGATTTTCTGCAAGCATGTCCATTTCAGAAGACAGTGGAGCTGAAAGCCAGCAGGATGCTGATTTTGCTTCCAGTGAATATAGCAGAAACAAAACTTCGGATGTGAATACTGGGGAGATTGAAGAACAGCAGTTTGTGGAAGAAAATGGCCACTAG
GCATACTATTGAATAGATAATTGATGAATTAAAAGTGCTCGGAGTTGTATGTTTCCAGGAATACTGGGGGATTTTAGCTCATTCATAGAATCACAACACTGCAAGGATGGATTGCAGGCATTGTTGACTGGATGAATCTTGAAAGAGATTATCAGGGTTTTATACAGCCATTATTTGTTACCATACTTGAAACTGCCTAC
TGTGCAAACCTATTTTGGAAAATCTATTATCATTTGACCGCTGCTGAGACTGTCTGGTGATTGATTCTCTGAAAATGAAGCTTAAATGACTTGGTTGGATTCATGGGTGTATCAGTACATGGAAAGCAGTTTGGGTACAAACTAAGTTGATGGTGTTAGATTCAAAGCACAGAACAGATATCAAGGATTTGGGTTTGGTC
CGACTTTTACAACTTCATGATCACAAGTTACAACGTTGAACATATTTCCTTTTCCTGTTCATCATGGTCTAAGTTCTAACAGGCTTTAATAGAAGATCGTTTAGTGATCTTGAACATTGTTAAACTATTTCTTATTTGTTCACAGGATTAAGCGTTCATACAGGCTGAGGGCTTATCAGCCAAGATGTTGGATGGTTACA
AAATCACATCTTTTCTAAGCTTTGTTTGAGGGGAGAGTGTAGCGTTCTTCTCAACTGTCAGTCTGAACTGTTGAGAATGTGTTATGTTGGTGCCATTATTTGGAAGTCATAAAATTTTCAGCACTCGCAAACAGCTGCAATTGTAGTTTACTAGATATAATGTGAAGTGCATTTTTTGGTCTTTTATTTTATTTCTGAAG
TTTAAAAAACTAGACAGAAAGGCTTTCTTAACTGATCGCCTATACTGAATTTTACAGTGCGTAAGGACAGCAGAGATGATCATAAGAGATTCACCCTTAAAAATCCCCTTGTGATGGGTTGGATCGGACATGATTTGTGGAAGTGTTTGGTAGAATGCTATATCAAATTGCTTGGAGTATCAGATGGACAATGGCTTCTT
TACAGGTTAACATTCCATGGTTTTATGCCATTTTCCATGGCGAGAATATGCTTATGCAGTCTATAGGAAGTCCATCGTTACCTTTACTTTCAGTGTCACAACCCTTGACTAGACCTGCATTTCCATAATAAAGAAGTAATGAACTCTACTGATGGATAGGATTAATAAAATATTTAATTAAATGTTTTTATGGATAATTA
ATGTTATTTAGGAGGCAGACTTTGTATTTAGACATTATTAAACCTAATTATCAAGTGCACCGATGGTGTTTACGTATGTAACATGCGTTTTTCTTTGCG


>TRINITY_DN31638_c0_g1_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:
GATGAAATGAAATGGGAGGCAAATGAATCCGAAATTAAATGACGACACGCGGGGATTTAGTCTGCAAAATGTCCCGGAACGGAAGGGTTTGGTCACATGTAAAAGACTAAATATTCTTCTGGCAAAGAACGGAGGGAGAGCTGTTTGGCAGAAGGACTGATGCAGTTCAGAGTTCAGACTGTACTGTACGTCTGTTCATT
CCAATAGAGGCTCAGGTTTAGGCTGAGTAAGAAGCCTAAAGTTGTATTTTGGTAACAGTGTCTGCTTGTCTTCAGAGAACGGCCTCGCCGTGGTTTTCATGAATCAGCTTTTGAAATTAGCAGAGATTTTATGTTTACCTAACCCCGGCTCGGTTATGTAATCCGGCGAGAGGTATCGAATTTTAGGTTTTGCGGAATGA
GAATGGCGGCGCAAAGCAGCAGTAATAATCCGGCGGCCGTGCCGGTGAGCGAAGTGTATTGGAGCCTGGTGGAGAAGGCCGACAAGAAATTCGCCCGCGTTAGGGATTTGCCGGCCTACGGCCGGAGCAGGTACGACTCTTATTTCCACAAGGTCTTCAAGGTTTACACGAAATTGTGGAAATTTCAGCAGGAGAACAGG
CAGAAATTAGTGGAGGCGGGGCTCAAGCGCTGGGAGATCGGCGAAATTGCGTCCCGGATCGCTCAGCTTTATTACAGTCAGTACCAGAGAACGAGCGAGGCGAGTTATCTGTCTGAGTCTTATATCTTCTACGAGGCAATCTTGAGCCGCGAGTATTTCAAGGATAGCGGTCAGGATCTAGGCTTGGCTAACAAGCAGCT
CCGCTGTTATGCCCGCTTCATTCTCGTCTGCCTCATGCTTAATCGCAGGGAGATGGTCCAGCATCTTCTTAATCAGTTTCGGATGCTCGTCGATGAATACCGCCGGACTTTTCAGGAGACTGATGCTAAAGAATGGAAGCGGATAGTGCAAGAAATTATTCGTTTTGTGAAAGCAGATACTGCATTTCAGAACAGCAGGC
CTTTACGTTATAGTGTGCGGCTTGATCCCCATCCAAATTCACATCCTTCTGTTGCTAGCTTGGAAGGCAGGCAGGCTTTAACATTACGAGATGCATTATTGACAAGCTATCATCGTAATGAGATAAAGTTTGCTGAGGTTACTCTTGATACCTTCAGAATGCTCCAGTGTTTAGAATGGGAGCCAAGTGGGATATTCTAC
CAGCCGCGAACATCAGAGTCAGGAATGAATGGATCATTCACTGGACAAAGTGGTTCAAGCCGCATGAACCCTATGGATGATATAACTGATCCAACTTTACCCCCAAATCCACGCAAAGCTATCCTATATCGGCCCACTGCTATGCATTTTCTAGCGGTATTAGCCACCATTTGTGAAGAGCTACCAGCTGATAGTGTCGT
GCTGTTGTATCTCTCAGCATCAGGGATGGCAAGTCGAGGTCCTCTTTCACTTTCTACACCTTCTGGCACTTATGGAGAGGCAGAATCTCATACAGATCGGCATGTTATAGATACAGCATCAGATGCAAACTCCATTTCTCCAATGAGCTCACCGCATGATAGCCCCACAATTCATAGAACTGCTGTTCATGAGAGGGGGC
ACTTAATCAACAATGGTGGGGGTGGGCTATTGCTGAGTTCTCGAGGAAATAGAGGTTTGAACACTGTTTACCCAGGCGATATCATTCCCTTCACAAGAAAGCCTCTCTTCATTATTATTGAGAGTGACAACAGTAATATGTTCAAGGTCATCAGCGGTGCAGAGCGAGGGGAGCCAGCTGTATTATTCCTTTCCCCGATG
GTGCAACCTCCCTGTGTAAGCACACCTACAGATTCTTCTCGTTATCAAAATAATGGGAGTCTTTTTACATTTTTCCTTACAGCTCCCTTACTGGCTTTCTGCCGACTGGTTGGTCTGTCAGCAACGAATTTAGGGATGGGTGTATACGACCGAGCAGACAAATTGCTTTCCTCTTTCTTTTCAGAATGGGGAGAGGCGCT
CACAATGTCTAACTCACTTGACTTGGTGTGGGCACGCCTTCTCTCTGATCCTTTCTTAAAGCGCCTGATTCTCAGgttttaagctcaaactgatcttgtgggatgcaatgctagcatgaatatgctttgcttttgtattttttagtaactgcctaattttatatattcagGTTCATTTTCTGTCGGGCATGCTTTTCTCT
GTATTCCCCATCTTCCAAAAAGAAGGAATGTATACCAGATTGTCTACCTCAACTTCCAGAGGAGTTCATGCCAGTTTCATCAACTGTAGAAGCTTGCATATCTCAACTCGCAAGCAGCCTTAAAGTAGGAAAGCATTTTAGATTTTCTGCAAGCATGTCCATTTCAGAAGACAGTGGAGCTGAAAGCCAGCAGGATGCTG
ATTTTGCTTCCAGTGAATATAGCAGAAACAAAACTTCGGATGTGAATACTGGGGAGATTGAAGAACAGCAGTTTGTGGAAGAAAATGGCCACTAGGCATACTATTGAATAGATAATTGATGAATTAAAAGTGCTCGGAGTTGTATGTTTCCAGGAATACTGGGGGATTTTAGCTCATTCATAGAATCACAACACTGCAAG
GATGGATTGCAGGCATTGTTGACTGGATGAATCTTGAAAGAGATTATCAGGGTTTTATACAGCCATTATTTGTTACCATACTTGAAACTGCCTACTGTGCAAACCTATTTTGGAAAATCTATTATCATTTGACCGCTGCTGAGACTGTCTGGTGATTGATTCTCTGAAAATGAAGCTTAAATGACTTGGTTGGATTCATG
GGTGTATCAGTACATGGAAAGCAGTTTGGGTACAAACTAAGTTGATGGTGTTAGATTCAAAGCACAGAACAGATATCAAGGATTTGGGTTTGGTCCGACTTTTACAACTTCATGATCACAAGTTACAACGTTGAACATATTTCCTTTTCCTGTTCATCATGGTCTAAGTTCTAACAGGCTTTAATAGAAGATCGTTTAGT
GATCTTGAACATTGTTAAACTATTTCTTATTTGTTCACAGGATTAAGCGTTCATACAGGCTGAGGGCTTATCAGCCAAGATGTTGGATGGTTACAAAATCACATCTTTTCTAAGCTTTGTTTGAGGGGAGAGTGTAGCGTTCTTCTCAACTGTCAGTCTGAACTGTTGAGAATGTGTTATGTTGGTGCCATTATTTGGAA
GTCATAAAATTTTCAGCACTCGCAAACAGCTGCAATTGTAGTTTACTAGATATAATGTGAAGTGCATTTTTTGGTCTTTTATTTTATTTCTGAAGTTTAAAAAACTAGACAGAAAGGCTTTCTTAACTGATCGCCTATACTGAATTTTACAGTGCGTAAGGACAGCAGAGATGATCATAAGAGATTCACCCTTAAAAATC
CCCTTGTGATGGGTTGGATCGGACATGATTTGTGGAAGTGTTTGGTAGAATGCTATATCAAATTGCTTGGAGTATCAGATGGACAATGGCTTCTTTACAGGTTAACATTCCATGGTTTTATGCCATTTTCCATGGCGAGAATATGCTTATGCAGTCTATAGGAAGTCCATCGTTACCTTTACTTTCAGTGTCACAACCCT
TGACTAGACCTGCATTTCCATAATAAAGAAGTAATGAACTCTACTGATGGATAGGATTAATAAAATATTTAATTAAATGTTTTTATGGATAATTAATGTTATTTAGGAGGCAGACTTTGTATTTAGACATTATTAAACCTAATTATCAAGTGCACCGATGGTGTTTACGTATGTAACATGCGTTTTTCTTTGCG




Intron 3 GTGAGTTTTG ... AATCATGTAG

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A124.51975310
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>TRINITY_DN37145_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoform
GCCGGCCCAGATGAAATGAAATGGGAGGCAAATGAATCCGAAATTAAATGACGACACGCGGGGATTTAGTCTGCAAAATGTCCCGGAACGGAAGGGTTTGGTCACATGTAAAAGACTAAATATTCTTCTGGCAAAGAACGGAGGGAGAGCTGTTTGGCAGAAGGACTGATGCAGTTCAGAGTTCAGACTGTACTGTACGT
CTGTTCATTCCAATAGAGGCTCAGGTTTAGGCTGAGTAAGAAGCCTAAAGTTGTATTTTGGTAACAGTGTCTGCTTGTCTTCAGAGAACGGCCTCGCCGTGGTTTTCATGAATCAGCTTTTGAAATTAGCAGAGATTTTATGTTTACCTAACCCCGGCTCGGTTATGTAATCCGGCGAGAGGTATCGAATTTTAGGTTTT
GCGGAATGAGAATGGCGGCGCAAAGCAGCAGTAATAATCCGGCGGCCGTGCCGGTGAGCGAAGTGTATTGGAGCCTGGTGGAGAAGGCCGACAAGAAATTCGCCCGCGTTAGGGATTTGCCGGCCTACGGCCGGAGCAGGTACGACTCTTATTTCCACAAGGTCTTCAAGGTTTACACGAAATTGTGGAAATTTCAGCAG
GAGAACAGGCAGAAATTAGTGGAGGCGGGGCTCAAGCGCTGGGAGATCGGCGAAATTGCGTCCCGGATCGCTCAGCTTTATTACAGTCAGTACCAGAGAACGAGCGAGGCGAGTTATCTGTCTGAGTCTTATATCTTCTACGAGGCAATCTTGAGCCGCGAGTATTTCAAGGATAGCGGTCAGGATCTAGGCTTGGCTAA
CAAGCAGCTCCGCTGTTATGCCCGCTTCATTCTCGTCTGCCTCATGCTTAATCGCAGGGAGATGGTCCAGCATCTTCTTAATCAGTTTCGGATGCTCGTCGATGAATACCGCCGGACTTTTCAGGAGACTGATGCTAAAGAATGGAAGCGGATAGTGCAAGAAATTATTCGTTTTGTGAAAGCAGATACTGCATTTCAGA
ACAGCAGGCCTTTACGTTATAGTGTGCGGCTTGATCCCCATCCAAATTCACATCCTTCTGTTGCTAGCTTGGAAGGCAGGCAGGCTTTAACATTACGAGATGCATTATTGACAAGCTATCATCGTAATGAGATAAAGTTTGCTGAGGTTACTCTTGATACCTTCAGAATGCTCCAGTGTTTAGAATGGGAGCCAAGTGGG
ATATTCTACCAGCCGCGAACATCAGAGTCAGGAATGAATGGATCATTCACTGGACAAAGTGGTTCAAGCCGCATGAACCCTATGGATGATATAACTGATCCAACTTTACCCCCAAATCCACGCAAAGCTATCCTATATCGGCCCACTGCTATGCATTTTCTAGCGGTATTAGCCACCATTTGTGAAGAGCTACCAGCTGA
TAGTGTCGTGCTGTTGTATCTCTCAGCATCAGGGATGGCAAGTCGAGGTCCTCTTTCACTTTCTACACCTTCTGGCACTTATGGAGAGGCAGAATCTCATACAGATCGGCATGTTATAGATACAGCATCAGATGCAAACTCCATTTCTCCAATGAGCTCACCGCATGATAGCCCCACAATTCATAGAACTGCTGTTCATG
AGAGGGGGCACTTAATCAACAATGGTGGGGGTGGGCTATTGCTGAGTTCTCGAGGAAATAGAGGTTTGAACACTGTTTACCCAGGCGATATCATTCCCTTCACAAGAAAGCCTCTCTTCATTATTATTGAGAGTGACAACAGTAATATGTTCAAGGTCATCAGCGGTGCAGAGCGAGGGGAGCCAGCTGTATTATTCCTT
TCCCCGATGGTGCAACCTCCCTGTGTAAGCACACCTACAGATTCTTCTCGTTATCAAAATAATGGGAGTCTTTTTACATTTTTCCTTACAGCTCCCTTACTGGCTTTCTGCCGACTGGTTGGTCTGTCAGCAACGAATTTAGGGATGGGTGTATACGACCGAGCAGACAAATTGCTTTCCTCTTTCTTTTCAGAATGGGG
AGAGGCGCTCACAATGTCTAACTCACTTGACTTGGTGTGGGCACGCCTTCTCTCTGATCCTTTCTTAAAGCGCCTGATTCTCAGGTTCATTTTCTGTCGGGCATGCTTTTCTCTGTATTCCCCATCTTCCAAAAAGAAGGAATGTATACCAGATTGTCTACCTCAACTTCCAGAGGAGTTCATGCCAGTTTCATCAACTG
TAGAAGCTTGCATATCTCAACTCGCAAGCAGCCTTAAAGTAGGAAAGCATTTTAGATTTTCTGCAAGCATGTCCATTTCAGAAGACAGTGGAGCTGAAAGCCAGCAGGATGCTGATTTTGCTTCCAGTGAATATAGCAGAAACAAAACTTCGGATGTGAATACTGGGGAGATTGAAGAACAGCAGTTTGTGGAAGAAAAT
GGCCACTAGGCATACTATTGAATAGATAATTGATGAATTAAAAGTGCTCGGAGTTGTATGTTTCCAGGAATACTGGGGGATTTTAGCTCATTCATAGAATCACAACACTGCAAGGATGGATTGCAGGCATTGTTGACTGGATGAATCTTGAAAGAGATTATCAGGGTTTTATACAGCCATTATTTGTTACCATACTTGAA
ACTGCCTACTGTGCAAACCTATTTTGGAAAATCTATTATCATTTGACCGCTGCTGAGACTGTCTGGTGATTGATTCTCTGAAAATGAAGCTTAAATGACTTGGTTGGATTCATGGGTGTATCAGGACATGGAAAGCAGTTTGGGTACAAACTAAGTTGATGGTGTTAGATTCAAAGCACAGAACAGATATCAAGGATTTG
GGTTTGGTCCGACTTTTACAACTTCATGATCACAAGTTACAACGTTGAACATATTTCCTTTTCCTGTTCATCATGGTCTAAGTTCTAACAGGCTTTAATAGAAGATCGTTTAGTGATCTTGAACATTGTTAAACTATTTCTTATTTGTTCACAGGATTAAGCGTTCATACAGGCTGAGGGCTTATCAGCCAAGATGTTGG
ATGGTTACAAAATCACATCTTTTCTAAGCTTTGTTTGAGGGGAGAGTGTAGCGTTCTTCTCAACTGTCAGTCTGAACTGTTGAGAATGTGTTATGTTGGTGCCATTATTTGGAAGTCATAAAATTTTCAGCACTCGCAAACAGCTGCAATTGTAGTTTACTAGATATAATGTGAAGTGCATTTTTTGGTCTTTTATTTTA
TTTCTGAAGTTTAAAAAACTAGACAGAAAGGCTTTCTTAACTGATCGCCTATACTGAATTTTACAGTGCGTAAGGACAGCAGAGATGATCATAAGAGATTCACCCTTAAAAATCCCCTTGTGATGGGTTGGATCGGACATGATTTGTGGAAGTGTTTGGTAGAATGCTATATCAAATTGCTTGGAGTATCAGATGGACAA
TGGCTTCTTTACAGGTTAACATTCCATGGTTTTATGCCATTTTCCATGGCGAGAATATGCTTATGCAGTCTATAGGAAGTCCATCGTTACCTTTACTTTCAGTGTCACAACCCTTGACTAGACCTGCATTTCCATAATAAAGAAGTAATGAACTCTACTGATGGATAGGATTAATAAAATATTTAATTAAATGTTTTTAT
GGATAATTAATGTTATTTAGGAGGCAGACTTTGTATTTAGACATTATTAAACCTAATTATCAAGTGCACCGATGGTGTTTACGTATGC


>TRINITY_DN37145_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:
GCCGGCCCAGATGAAATGAAATGGGAGGCAAATGAATCCGAAATTAAATGACGACACGCGGGGATTTAGTCTGCAAAATGTCCCGGAACGGAAGGGTTTGGTCACATGTAAAAGACTAAATATTCTTCTGGCAAAGAACGGAGGGAGAGCTGTTTGGCAGAAGGACTGATGCAGTTCAGAGTTCAGACTGTACTGTACGT
CTGTTCATTCCAATAGAGGCTCAGGTTTAGGCTGAGTAAGAAGCCTAAAGTTGTATTTTGGTAACAGTGTCTGCTTGTCTTCAGAGAACGGCCTCGCCGTGGTTTTCATGAATCAGCTTTTGAAATTAGCAGAGATTTTATGTTTACCTAACCCCGGCTCGGTTATGTAATCCGGCGAGAGGTATCGAATTTTAGGTTTT
GCGGAATGAGAATGGCGGCGCAAAGCAGCAGTAATAATCCGGCGGCCGTGCCGGTGAGCGAAGTGTATTGGAGCCTGGTGGAGAAGGCCGACAAGAAATTCGCCCGCGTTAGGGATTTGCCGGCCTACGGCCGGAGCAGGTACGACTCTTATTTCCACAAGGTCTTCAAGGTTTACACGAAATTGTGGAAATTTCAGCAG
GAGAACAGGCAGAAATTAGTGGAGGCGGGGCTCAAGCGCTGGGAGATCGGCGAAATTGCGTCCCGGATCGCTCAGCTTTATTACAGTCAGTACCAGAGAACGAGCGAGGCGAGTTATCTGTCTGAGTCTTATATCTTCTACGAGGCAATCTTGAGCCGCGAGTATTTCAAGGATAGCGGTCAGGATCTAGGCTTGGCTAA
CAAGCAGCTCCGCTGTTATGCCCGCTTCATTCTCGTCTGCCTCATGCTTAATCGCAGGGAGATGGTCCAGCATCTTCTTAATCAGTTTCGGATGCTCGTCGATGAATACCGCCGGACTTTTCAGGAGACTGATGCTAAAGAATGGAAGCGGATAGTGCAAGAAATTATTCGTTTTGTGAAAGCAGATACTGCATTTCAGA
ACAGCAGGCCTTTACGTTATAGTGTGCGGCTTGATCCCCATCCAAATTCACATCCTTCTGTTGCTAGCTTGGAAGGCAGGCAGGCTTTAACATTACGAGATGCATTATTGACAAGCTATCATCGTAATGAGATAAAGTTTGCTGAGGTTACTCTTGATACCTTCAGAATGCTCCAGTGTTTAGAATGGGAGCCAAGTGGG
ATATTCTACCAGCCGCGAACATCAGAGTCAGGAATGAATGGATCATTCACTGGACAAAGTGGTTCAAGCCGCATGAACCCTATGGATGATATAACTGATCCAACTTTACCCCCAAATCCACGCAAAGCTATCCTATATCGGCCCACTGCTATGCATTTTCTAGCGGTATTAGCCACCATTTGTGAAGAGCTACCAGCTGA
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