NA ----> NA


Intron 1 GTATTTCTTT ... TGGAAGGCAG

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>TRINITY_DN132806_c1_g1_i11 from sample A1 / Example spliced isoform
GTACATGGCAGACTCTCGGACTGCTGCTCCACTTGCCCTTTCTATGCTAGAGCCCTCCAGTTGTTGCAAAGTGTGTATCCCTTCTCAAACGATATCTTTTTAGGTATACACCTAGAATAGAGACTCTAGAGCAGATTGATTTGTTTTGTGTGAATCTAATTACTGAGTGCAATGCCGTTACCAACAAGAAGGCTTCTCCA
TGGGTGCAGTCTGCTAACAGTCAGCATGTAGCATCAAATGTATCTGTCCAGTCATCTTCTCCAACCTCAACATCTGCGGCTTTTGCCTCAGAAGCTCTTGTTAAGTCATTGAATTATGTTCGTGGTTTGGTTTCACGACATATTCCAAGACATTCATTTCAGTCAGCACTGTTTTCTGGAAATTCTCATGCTACTAAGAG
ATTTTCTCCAACAATGTCATCTTTGAGGAGCAGATCGTTTGGTTCCCCACTCAGTCCAGGTGGCACTGTAAGCAGAGGTTCTCCTGAGAATAAAGAGGCTGCAAATTTGGTTATTTCAAATATATTAGGATTGGAAACAATTGATGAGGAGAACAATAATTATATTGCTCTTGATGTACTCAAATCAAGATGGATTGTGG
ATAGGTACCAGCAAAGTTGGACCCCGTCTCCTGTTATGACAGACAGTGGGGGCATAGCACGGCCACAAGTAGACAGCAAATATGATTTTCTAGAACATGGGGCTGCAGCATTGCTAATGAAAGGTACTGAACAAAAGAGTCAGCTGGGGAGGAGCACACATAGGAGACTAGCTTCTAGTGTTCGTAATGAGCAACTATTG
CAGCCTTCTACAGTCACAACTGTCACTGACACTGCATCTGCCCGTTCTCATTTGAGAGCTATAGCAGCTTCCAAGCGTTCTATCAGAACTGGAACTCATCAAGTCTGGGGGGATGTACCTCTGAGCACATGGCGTCGTCGACCACGCCCTCTTTTCCAATACAGATATTACAGTGAACAGCAACCTTTGAGACTGAGTAC
TGGTGAAGTGGAGGAGGTTATATCTGCTGTTTGTTCAGAGGGATCCGTGACAAATACCAATACAATGACACCAATGTCCTCATTGCTAAGTAATCAGACTGGAAGGCTAGCTGTGGAGACTGTTGATGCTGCAGCTAGTGTCCTTATCAAACTTGTTATTGACATGTACATGGCAGACTCTCGGACTGCTGCTCCACTTG
CCCTTTCTATGCTAGAGGGTATGCTGAGTTCTCCTCAATTGACAGCTAGAACCCGGGCTTTTGATTTGATTTTAAATCTTGGTATTCATGCTCATTTATTGGAACCTATGCTGAGTGACGATCAGTCTGCAGTGGTGGAAGAACCATCTTCTCAGCCTACCAATTTTAATAATGGAGATCAGTTTCTTGCTTTGGCAAAG
GGAGCTTTAAAATGCCACGACAAACTAGAAAATGGAACTCCGCGGGCAGTTAATGAATTTGAGATCTGGTTATTAAACATACTTTATGAGATACTACTTTTCCTTGTACAGATAGAAGAGAAAGAAGAAGCAGTCTGGGCATCTGCATTGAGTTGCTTAATGTATATGATCTGTGACAGAGGAAGGATCCAACGATGTCG
CTTGAATGGACTTGATATCAGGGTTTTAAAGGCACTTTTGGAGATTAGTAGAGAGAATTCATGGGCAGAAGAACTTCATTGCAGACTAATTCGTTTGCTATCAAATTTATTGTATTGTATTCCCACTGGGACGGAGAAGGCTAATCTCGGTACTCCCAGTTCTCATGTTATGGACATTCAACAACTGGAACTTCTTGGTG
GAATAGAATTTATTTGTCAAGAGTATGCAAGAGAAAATGCCTTGGAAGCAAAGAACAACTTATTTGGGGTTCTTTTTGACTATGTTTTGCATAAGCTCAAGAATGAGCACTTAGCTAGTGGAACTCCCTTACCCAGTTATGATGAAATTCAAGCTGTTGCAACAGTGCTTGCCCTTGCAGATGCACCAGTGGCCTTTGCT
GTCGCACTTAAACTAGGATTGCATGATGTTGGGGAGGAATTGAGAAATTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGAATTGAGAAATTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGTATGTATGCTGAGTTCTCCTCAATTGACAGC
TAGAACCCGGGCTTTTGATTTGATTTTAAATCTTGGTATTCATGCTCATTTATTGGAACCTATGCTGAGTGACGATCAGTCTGCAGTGGTGGAAGAACCA


>TRINITY_DN132806_c1_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CGTGCGTTCATTTCCCCTCCTTCATTCATGTTATGTTCGCATCATCACATTCACTCATCTAAACAAAAATAAATAAAATGCAGCAGCAAAAAGGGCAGCATCATCCTCGTCGTCATCCAATCACATTTAAGCACCAGGTAATCTCAGCGTCCAAACCCTCAGTTTTCCCTGCGAGTTCCTGGATTCTTCCGTCAAAGCTT
CCGACTGCGACCACCGGAGCTGGAAAATATCATTCACGGCGCTCTTTTGCGGCTCGCGGCAACGTTGTCCGTGTTCTGCAGGCCGAGATCTCTCGTGTGAGGTATTCTTCGCCTGATTTGATCCGGGATTGCTCCTATATTTAAACGACGGCGTGGTTTCACATCTGTTGGTCGTTCGGCTTGTGGAGTTGAGAGCATTG
TTCTTTACGCTCCGGAATTTGATCGGATTTGCAGAGAGGCCGGTCCAAAGGGTTTGTTGAAGTTAATTTTTTTATGTTTTTTATTTCATTTATGCGATGAATGCGGGGGATCTTCAGGATTCGCCAATAATTATCGAGTTGCAGTGTGATCGGAACCGGATTCGGGAGGGAACATTTAAAAGATTGATGTATTGAAGATA
GACAGATAAAGCCGTAGATAGCGAATGACTTTTGGAGCTTTTGATGGAGGTAATGCGTGAATCAGATACGCAGAGGGATTTTATTTAAATTCTTGATGTTAATATTGATGTTTTGAAGATAACGAGATCGATAGGCAAGGGGTGCAAAGAGATCATTAAATCCTTTGACGGAGATAATGCGGAAATTGAGATGCAGAGTG
ATTGTATATAAATTCTTGGGATTAAGATTGATGTTGTGAAGATAGATAGATACATGCGCCAGGGATGTAAAGTGTTGTTTAAAGCATAGAACGAGTCAATCAGAGCTGTGGAGGTGATTGCATTTAAATTCTCGATGTTTCAAAGATAGCATAGTTAGATATGCAGAGTTACGTTTAACAGGTCTTGAGATGTTATATTA
GGCTGGGGATGCAGAGTAATTTGGAAGGAGAATGGCAATGAGAAGAGAGGAGGTGTGAGGAGGAGAGCCAGTAGAGAGCTATGTCCTTTTCAGGTTCGGAGCTGGGGCGGGCGGGGAGAAAGTCTTCTGCTCCTTCCCAGGATGGTTTTGCGGGATCTCTTTCGAAGCCCAGAACTCCAAGGGGGAGTCCAGATGCTAAG
CAGAAGCCTGGCCCTTCTAGGCTGGCAATGGTTGCTTCACAGAAGCAACGACCTTTGCAGAGGAAGCCGCCGGAGCCTCTTCGACGTGCCGTGGCCGATTGTTTGTCTGCATCTCATCATGGGACCTCTGCATTCACGTCGGAAGCATTGCGAACACTTCAGGATTATTTGGCGAATGTATCAACTATTGACATTGGATA
TACTGTACTTTTAGAACACGCGCACGCAGAGAGGGACCGAAGCCCTCCAGTTGTTGCAAAGTGTGTATCCCTTCTCAAACGATATCTTTTTAGGTATACACCTAGAATAGAGACTCTAGAGCAGATTGATTTGTTTTGTGTGAATCTAATTACTGAGTGCAATGCCGTTACCAACAAGAAGGCTTCTCCATGGGTGCAGT
CTGCTAACAGTCAGCATGTAGCATCAAATGTATCTGTCCAGTCATCTTCTCCAACCTCAACATCTGCGGCTTTTGCCTCAGAAGCTCTTGTTAAGTCATTGAATTATGTTCGTGGTTTGGTTTCACGACATATTCCAAGACATTCATTTCAGTCAGCACTGTTTTCTGGAAATTCTCATGCTACTAAGAGATTTTCTCCA
ACAATGTCATCTTTGAGGAGCAGATCGTTTGGTTCCCCACTCAGTCCAGGTGGCACTGTAAGCAGAGGTTCTCCTGAGAATAAAGAGGCTGCAAATTTGGTTATTTCAAATATATTAGGATTGGAAACAATTGATGAGGAGAACAATAATTATATTGCTCTTGATGTACTCAAATCAAGATGGATTGTGGATAGGTACCA
GCAAAGTTGGACCCCGTCTCCTGTTATGACAGACAGgtatttctttggtttggatttgctgactctttttcaggtcaactagatacggcaagatgaacatgtaaataggctagatgatttcgctgcttgcaagttaaatgggctagatgaagccaatacttttgttgctttctgatgatgagattcatctatgtattgcc
cttttatttgctttaaaattctgtgccattggagcatgccgaagttgctttggctttatgatactataaattagattttctgaaattcaacttgtacaatttttgaataatttaataaaatgttttgtggaaggcagTGGGGGCATAGCACGGCCACAAGTAGACAGCAAATATGATTTTCTAGAACATGGGGCTGCAGC
ATTGCTAATGAAAGGTACTGAACAAAAGAGTCAGCTGGGGAGGAGCACACATAGGAGACTAGCTTCTAGTGTTCGTAATGAGCAACTATTGCAGCCTTCTACAGTCACAACTGTCACTGACACTGCATCTGCCCGTTCTCATTTGAGAGCTATAGCAGCTTCCAAGCGTTCTATCAGAACTGGAACTCATCAAGTCTGGG
GGGATGTACCTCTGAGCACATGGCGTCGTCGACCACGCCCTCTTTTCCAATACAGATATTACAGTGAACAGCAACCTTTGAGACTGAGTACTGGTGAAGTGGAGGAGGTTATATCTGCTGTTTGTTCAGAGGGATCCGTGACAAATACCAATACAATGACACCAATGTCCTCATTGCTAAGTAATCAGACTGGAAGGCTA
GCTGTGGAGACTGTTGATGCTGCAGCTAGTGTCCTTATCAAACTTGTTATTGACATGTACATGGCAGACTCTCGGACTGCTGCTCCACTTGCCCTTTCTATGCTAGAGGGTATGCTGAGTTCTCCTCAATTGACAGCTAGAACCCGGGCTTTTGATTTGATTTTAAATCTTGGTATTCATGCTCATTTATTGGAACCTAT
GCTGAGTGACGATCAGTCTGCAGTGGTGGAAGAACCATCTTCTCAGCCTACCAATTTTAATAATGGAGATCAGTTTCTTGCTTTGGCAAAGGGAGCTTTAAAATGCCACGACAAACTAGAAAATGGAACTCCGCGGGCAGTTAATGAATTTGAGATCTGGTTATTAAACATACTTTATGAGATACTACTTTTCCTTGTAC
AGATAGAAGAGAAAGAAGAAGCAGTCTGGGCATCTGCATTGAGTTGCTTAATGTATATGATCTGTGACAGAGGAAGGATCCAACGATGTCGCTTGAATGGACTTGATATCAGGGTTTTAAAGGCACTTTTGGAGATTAGTAGAGAGAATTCATGGGCAGAAGAACTTCATTGCAGACTAATTCGTTTGCTATCAAATTTA
TTGTATTGTATTCCCACTGGGACGGAGAAGGCTAATCTCGGTACTCCCAGTTCTCATGTTATGGACATTCAACAACTGGAACTTCTTGGTGGAATAGAATTTATTTGTCAAGAGTATGCAAGAGAAAATGCCTTGGAAGCAAAGAACAACTTATTTGGGGTTCTTTTTGACTATGTTTTGCATAAGCTCAAGAATGAGCA
CTTAGCTAGTGGAACTCCCTTACCCAGTTATGATGAAATTCAAGCTGTTGCAACAGTGCTTGCCCTTGCAGATGCACCAGTGGCCTTTGCTGTCGCACTTAAACTAGGATTGCATGATGTTGGGGAGGAATTGAGAAATTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGAATTGA
GAAATTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGTATGTATGCTGAGTTCTCCTCAATTGACAGCTAGAACCCGGGCTTTTGATTTGATTTTAAATCTTGGTATTCATGCTCATTTATTGGAACCTATGCTGAGTGACGATCAGTCTGCAGTGGTGGAAGAACCA



Intron 2 GTAATCTGTA ... TCTATTTCAG

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>TRINITY_DN132806_c1_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform
ATGGACCAAAAAGTGTGTTCTTGATACTGGAAATATTGCTGTGGAGTTTGAATCTGCTTATCTGGGAAGAAAAGTTATTATTATTTTATGATGCTGTTGATATTTCAGTTCTCATATTTGAAGATTTAAACAGAACTAACCTCAATTAGCTGCTGGTAATTGTTGCAGATGTGTGACCTTCTTTTTTCTCAACTTTGTTT
GAGAATATCTCCACCAATGGCATCTTCTATTTATAGTAATGCATATATAAGAGATAACACAGCCTTTGATAGTGTCAGCAATAGTTATGTTGGCTATGATAGCCCTGATAATTTACTGTTCAGTAATGAGCAAGGGGATAGACATTATGGAGATGATAGACATGCAATTAGATCTGTATTTGGAAGTGGTTCAATACCTT
CTAATTGTAATTCAACATCAATGGCAGCATTGCTACTAAGGGGTTATGCTGCAGCCCCTAGGCAACTAGTAAATTGCATTCCTACAGCTCTTTTGTATTGGCCACTGATTCAACTGGCTGGGGCGGCAACTGATGATATGGCATTAGGTAATGCTGTTGGTAGCAAGGGAAGAGGAAATATACCTGGTGGTGCTTCTGAC
ACCCGGGCAGCACTTCTATTGCTACTAATTGGAAAATGCGCTACAAACCAAGCTGCATTTCAAGAGGTTGGAGGCGAAGAATTTTTTAGGTCTTTATTAGATGATACAGATGCACGAGTCGCATATTATACCTCTGCATTTCTCTTGAAGAGAATGATGACAGAAGAGCCTGACAAGTACCAGCGTATGCTTCATAATCT
TGTCTTTAAGGCTCAACAGAGCAACAATGAGAAATTGTTAGAGAATCCGTATCTTCAAATGCGTGGTATACTTCAATTATCCAGTGATTTAGGGAGCCAATTGTCATTCCAGGAATGTTGATTCTTGCAAACTGGGTGTCATGTTCCATATTGGTTCAGAAAAGGGAAAATAATCATGTAACATTATCTTGAGCTGGTAT
CTCTTATGATTTCTACAACCCAAGGTACCCTTTGACCATATCTATGAAATCAGCCAGATTGGCCAGAAGATTCCAGCAGATGGTAGAAATTACAGGGCCAAATAACAATCGATTTGCATGCTGTAAGGCACAGAAATTATATTTTGGGATTCGTGTTCATAGATTAATACTTTTCTACAAATCTATTCATGACAAAGTCG
TTGGAGCAGTCTGAATGGATTATTTGATTTATCTTGTAAATCATCATTGCAACCACCAAGGGTTGCACAGATTAAATTTCATTTTTCAGGTATTTCTCTGTGGCACAATATTGCAGTAGGTTGGAATAACCTGTCTGCTTGTAAATTATACACATTCAGGCAGGAGCAAGAGTCTAGTGATGAACCTGTCCAGGAATGGC
AGTCTTCAGTCTTTTGTCTCAAACAAAATTTTCAAATGCTGAAGGCGGCACTCATGATTGTGGGAAGCAGAATGCCTTTCCATGGGCTGTTGTGCAAGGTTATTTCCAGATTTAATAAATTGAATTGGCTGGATGGTTCAATGATGTGACTAGGTAGCAACAGCAGTCAACTGTATTCTTACAAAATTTTGCGATAATGA
GTTGCATTGTATTAAACCAGCTTTCATAACATAGAGCTGTCATTATTATGTTGTAGATTTGTACAGATATTTATTCCCAATGGGTTTTATTTGTAAATTATAGCTTTTTTGCTTCAGTAATCTTTAAGCAAAAGCTCTTTGTCAAATTGGTCAACAATGCCCTTCACCTATTTGATAAGCTGCTGGAATACGGGGTCATG
TGATTTTTGCTTCTTATCGTATTAATC


>TRINITY_DN132806_c1_g1_i10 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TATGCAAGAGAAAATGCCTTGGAAGCAAAGAACAACTTATTTGGGGTTCTTTTTGACTATGTTTTGCATAAGCTCAAGAATGAGCACTTAGCTAGTGGAACTCCCTTACCCAGTTATGATGAAATTCAAGCTGTTGCAACAGTGCTTGCCCTTGCAGATGCACCAGTGGCCTTTGCTGTCGCACTTAAACTAGGATTGCA
TGATGTTGGGGAGGAATTGAGAAATTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGAATTGAGAAATTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGTATGATTCTGGGATGCAGTTGTATAAGGCTGAAAGTCAAAGATTTCATTCAGAT
TCAAAATAAAAGGATACTGTGCATTTTAATTTATTTAGAAGTATCATTGATTTATAATAAGTTTTGCAAGATTTCAAAGGTGGACAGATTTTGTAGTTTTAGTAATTCAGATGTTGATGATATTGTTTCTTCATTGTATTTGTGTTCCTTGAATAACAAAACTTATAATGTTGCAGGTATTGAATGACATAGTCAAATTA
CTGGATTCTGTAATAGCAACATATAACCATTTAGAAGATGAGTTTTCAGAGATGCTTCATATTACAATGGTGAGCGAGGGTCTTACTCACATTCAGAAGGGCCGCTTAGAGCAGGAGATCATAGGAGATTCAAATAGAGTTTCAGAGGCTTGGAACACTTTGAGTTCTCTTCTGCACTCTCCAAGAGCTACTTATCGTCA
AAATGGTTATTGCTGGCTCGTTGAACTGCTATTTGCTGAAATGTTTAGGGAGAGCAATAAGGTCAATATTCAGCATTTGCAACAGCAACTTGGACGTTTAGGAAGTTCTGAAAAATCCGATCCAGATCATTCGGAGGACCAAACGTTGCGTGGAGTTTCTTCATCTGTTCAACTATTCTCAGGACTTTTGAAATCAAAAT
ATAATTATGTAAGGTGTGGATTTATTATTGTGTTAGAAAGGCTTCTTCTGCGATGTCAGCTGTCAGTGTTGGATGACCATGAACTTGACCAAGGAGCAGTTGACAGAGAATTTAGGCTGGATGGCAGTGACAGCTCATACATCCAGGAAAAAGCAAATGCTGTAATTGTCTTGATGAATGGAGCATTGTCACAAATATTT
CTGGCAAACGAGACTAACCCTATCAATATTTTGAAGATGTGTGACCTTCTTTTTTCTCAACTTTGTTTGAGAATATCTCCACCAATGGCATCTTCTATTTATAGTAATGCATATATAAGAGATAACACAGCCTTTGATAGTGTCAGCAATAGTTATGTTGGCTATGATAGCCCTGATAATTTACTGTTCAGTAATGAGCA
AGGGGATAGACATTATGGAGATGATAGACATGCAATTAGATCTGTATTTGGAAGTGGTTCAATACCTTCTAATTGTAATTCAACATCAATGGCAGCATTGCTACTAAGGGGTTATGCTGCAGCCCCTAGGCAACTAGTAAATTGCATTCCTACAGCTCTTTTGTATTGGCCACTGATTCAACTGGCTGGGGCGGCAACTG
ATGATATGGCATTAGGTAATGCTGTTGGTAGCAAGGGAAGAGGAAATATACCTGGTGGTGCTTCTGACACCCGGGCAGCACTTCTATTGCTACTAATTGGAAAATGCGCTACAAACCAAGCTGCATTTCAAGAGGTTGGAGGCGAAGAATTTTTTAGGTCTTTATTAGATGATACAGATGCACGAGTCGCATATTATACC
TCTGCATTTCTCTTGAAGAGAATGATGACAGAAGAGCCTGACAAGTACCAGCGTATGCTTCATAATCTTGTCTTTAAGGCTCAACAGAGCAACAATGAGAAATTGTTAGAGAATCCGTATCTTCAAATGCGTGGTATACTTCAATTATCCAGTGATTTAGGGAGCCAATTGTCATTCCAGGAATGTTGATTCTTGCAAAC
TGGGTGTCATGTTCCATATTGGTTCAGAAAAGGGAAAATAATCATGTAACATTATCTTGAGCTGGTATCTCTTATGATTTCTACAACCCAAGGTACCCTTTGACCATATCTATGAAATCAGCCAGATTGGCCAGAAGATTCCAGCAGATGGTAGAAATTACAGGGCCAAATAACAATCGATTTGCATGCTGTAAGgtaat
ctgtacaattttatcaagtatttgtctaccctgtaaccttgagtgttgaagttttatttagttatttatttatttttgttagttgcccaatactggcacagaattaattgcaagtgcctaatctgatctatttcagGCACAGAAATTATATTTTGGGATTCGTGTTCATAGATTAATACTTTTCTACAAATCTATTCATG
ACAAAGTCGTTGGAGCAGTCTGAATGGATTATTTGATTTATCTTGTAAATCATCATTGCAACCACCAAGGGTTGCACAGATTAAATTTCATTTTTCAGGTATACTCGACCTTTTTGTCATTACTTTCTGCAGTGTTTATTATGTTTTCCACGGATTATAGATATTTTCTTTCTTTCTCATAGATTTGCAAGAGCATTTGG
TAAGGGTTTACTCGACAGGTAATAAAAAAATGGGCTATTTTTGTTAAGTTTTGATCAGATGATCTGATATTCATTGACAACTTCCAAAAATAAAGTTGCACAGGTGTATTAGAGAAACATGCCGCGC



Intron 3 GTATACTCGA ... TTTGTAATAG

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A939.62322112
A1045.2423194



>TRINITY_DN43051_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoform
ATCCTATTGAAGAAGCCGCAACCTCATACACAGAAGACGTCACCCTCATTCTAGGGCTGCATACATGCCAAATAAAAGGGCGTGATTTGTCAGACTCTTCTCATTGGGCATTGATTGCACTCTCATCCCATCTATGTCATTTCTAAGGATCAGTACAAGCTGTAACAGCGATCATCTGGGCATTAACATCATTGTTTAAG
CCTGGACATTTCCTGAAGCAGAAACTCAGTCTTCTTGTGTTGGGAGAAAAATATATATATCAGATCTACTGTCAAAAACATTCCTGTGTTATTATCAGATTTCTGGTTGTTTCTATTGTCTGGGATTATATGCAAAACTCGTGAAGCAAACGAGCTTGAGTTCTGGGTATTTATCGTCACCTACAGGCATCCCACAAGGC
AAGGTACATGGCAGACTCTCGGACTGCTGCTCCACTTGCCCTTTCTATGCTAGAGGGTATGCTGAGTTCTCCTCAATTGACAGCTAGAACCCGGGCTTTTGATTTGATTTTAAATCTTGGTATTCATGCTCATTTATTGGAACCTATGCTGAGTGACGATCAGTCTGCAGTGGTGGAAGAACCATCTTCTCAGCCTACCA
ATTTTAATAATGGAGATCAGTTTCTTGCTTTGGCAAAGGGAGCTTTAAAATGCCACGACAAACTAGAAAATGGAACTCCGCGGGCAGTTAATGAATTTGAGATCTGGTTATTAAACATACTTTATGAGATACTACTTTTCCTTGTACAGATAGAAGAGAAAGAAGAAGCAGTCTGGGCATCTGCATTGAGTTGCTTAATG
TATATGATCTGTGACAGAGGAAGGATCCAACGATGTCGCTTGAATGGACTTGATATCAGGGTTTTAAAGGCACTTTTGGAGATTAGTAGAGAGAATTCATGGGCAGAAGAACTTCATTGCAGACTAATTCGTTTGCTATCAAATTTATTGTATTGTATTCCCACTGGGACGGAGAAGGCTAATCTCGGTACTCCCAGTTC
TCATGTTATGGACATTCAACAACTGGAACTTCTTGGTGGAATAGAATTTATTTGTCAAGAGTATGCAAGAGAAAATGCCTTGGAAGCAAAGAACAACTTATTTGGGGTTCTTTTTGACTATGTTTTGCATAAGCTCAAGAATGAGCACTTAGCTAGTGGAACTCCCTTACCCAGTTATGATGAAATTCAAGCTGTTGCAA
CAGTGCTTGCCCTTGCAGATGCACCAGTGGCCTTTGCTGTCGCACTTAAACTAGGATTGCATGATGTTGGGGAGGAATTGAGAAATTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGTATTGAATGACATAGTCAAATTACTGGATTCTGTAATAGCAACATATAACCATTTAGAA
GATGAGTTTTCAGAGATGCTTCATATTACAATGGTGAGCGAGGGTCTTACTCACATTCAGAAGGGCCGCTTAGAGCAGGAGATCATAGGAGATTCAAATAGAGTTTCAGAGGCTTGGAACACTTTGAGTTCTCTTCTGCACTCTCCAAGAGCTACTTATCGTCAAAATGGTTATTGCTGGCTCGTTGAACTGCTATTTGC
TGAAATGTTTAGGGAGAGCAATAAGGTCAATATTCAGCATTTGCAACAGCAACTTGGACGTTTAGGAAGTTCTGAAAAATCCGATCCAGATCATTCGGAGGACCAAACGTTGCGTGGAGTTTCTTCATCTGTTCAACTATTCTCAGGACTTTTGAAATCAAAATATAATTATGTAAGGTGTGGATTTATTATTGTGTTAG
AAAGGCTTCTTCTGCGATGTCAGCTGTCAGTGTTGGATGACCATGAACTTGACCAAGGAGCAGTTGACAGAGAATTTAGGCTGGATGGCAGTGACAGCTCATACATCCAGGAAAAAGCAAATGCTGTTATTGTCTTGATGAATGGAGCATTGTCACAAATATTTCTGGCAAACGAGACTAACCCTATCAATATTTTGAAG
ATGTGTGACCTTCTTTTTTCTCAACTTTGTTTGAGAATATCTCCACCAATGGCATCTTCTATTTATAGTAATGCATATATAAGAGATAACACAGCCTTTGATAGTGTCAGCAATAGTTATGTTGGCTATGATAGCCCTGATAATTTACTGTTCAGTAATGAGCAAGGGGATAGACATTATGGAGATGATAGACATGCAAT
TAGATCTGTATTTGGAAGTGGTTCAATACCTTCTAATTGTAATTCAACATCAATGGCAGCATTGCTACTAAGGGGTTATGCTGCAGCCCCTAGGCAACTAGTAAATTGCATTCCTACAGCTCTTTTGTATTGGCCACTGATTCAACTGGCTGGGGCGGCAACTGATGATATGGCATTAGGTAATGCTGTTGGTAGCAAGG
GAAGAGGAAATATACCTGGTGGTGCTTCTGACACCCGGGCAGCACTTCTATTGCTACTAATTGGAAAATGCGCTACAAACCAAGCTGCATTTCAAGAGGTTGGAGGCGAAGAATTTTTTAGGTCTTTATTAGATGATACAGATGCACGAGTCGCATATTATACCTCTGCATTTCTCTTGAAGAGAATGATGACAGAAGAG
CCTGACAAGTACCAGCGTATGCTTCATAATCTTGTCTTTAAGGCTCAACAGAGCAACAATGAGAAATTGTTAGAGAATCCGTATCTTCAAATGCGTGGTATACTTCAATTATCCAGTGATTTAGGGAGCCAATTGTCATTCCAGGAATGTTGATTCTTGCAAACTGGGTGTCATGTTCCATATTGGTTCAGAAAAGGGAA
AATAATCATGTAACATTATCTTGAGCTGGTATCTCTTATGATTTCTACAACCCAAGGTACCCTTTGACCATATCTATGAAATCAGCCAGATTGGCCAGAAGATTCCAGCAGATGGTAGAAATTACAGGGCCAAATAACAATCGATTTGCATGCTGTAAGGCACAGAAATTATATTTTGGGATTCGTGTTCATAGATTAAT
ACTTTTCTACAAATCTATTCATGACAAAGTCGTTGGAGCAGTCTGAATGGATTATTTGATTTATCTTGTAAATCATCATTGCAACCACCAAGGGTTGCACAGATTAAATTTCATTTTTCAGGTATTTCTCTGTGGCACAATATTGCAGTAGGTTGGAATAACCTGTCTGCTTGTAAATTATACACATTCAGGCAGGAGCA
AGAGTCTAGTGATGAACCTGTCCAGGAATGGCAGTCTTCAGTCTTTTGTCTCAAACAAAATTTTCAAATGCTGAAGGCGGCACTCATGATTGTGGGAAGCAGAATGCCTTTCCATGGGCTGTTGTGCAAGGTTATTTCCAGATTTAATAAATTGAATTGGCTGGATGGTTCAATGATGTGACTAGGTAGCAACAGCAGTC
AACTGTATTCTTACAAAATTTTGCGATAATGAGTTGCATTGTATTAAACCAGCTTTCATAACATAGAGCTGTCATTATTATGTTGTAGATTTGTACAGATATTTATTCCCAATGGGTTTTATTTGTAAATTATAGCTTTTTTGCTTCAGTAATCTTTAAGCAAAAGCTCTTTGTCAAATTGGTCAACAATGCCCTTCACC
TATTTGATAAGCTGCTGGAATACGGGGTCATGTGATTTTTGCTTCTTATCGTATTAATCTATGTCTGATATTTTTTATTTCCACATGTTCTTATATTGTCTTAATTGTACAGTGGATGTGTATCAGGCAAAGGTTTTCAAATTTCAGTTTGTCTAGGGTGTTGTTACATTATCATATTCTACTGGATTTATTCCATAAAG
CAGTCTATATTGCCTGTAATGGTTATTCTTGGCACCACTAGCAGATCCTCGTGATTAAACATATGACACAAGCCATGGACCGCCCCATCCATGATGGTATATTTTATAATGGTTGAGATAAGCAATATTATTATACTCCCATAC


>TRINITY_DN43051_c0_g1_i11 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TCTAAACAAAAATAAATAAAATGCAGCAGCAAAAAGGGCAGCATCATCCTCGTCGTCATCCAATCACATTTAAGCACCAGGTAATCTCAGCGTCCAAACCCTCAGTTTTCCCTGCGAGTTCCTGGATTCTTCCGTCAAAGCTTCCGACTGCGACCACCGGAGCTGGAAAATATCATTCACGGCGCTCTTTTGCTGCTCGC
GGCAACGTTGTCCGTGTTCTGCAGGCCGAGATCTCTCGTGTGAGGTATTCTTCGCCTGATTTGATCCGGGATTGCTCCTATATTTAAACGACGGCGTGGTTTCACATCTGTTGGTCGTTCGGCTTGTGGAGTTGAGAGCATTGTTCTTTACGCTCCGGAATTTGATCGGATTTGCAGAGAGGCCGGTCCAAAGGGTTTGT
TGAAGTTAATTTTTTTATGTTTTTTATTTCATTTATGCGATGAATGCGGGGGATCTTCAGGATTCGCCAATAATTATCGAGTTGCAGTGTGATCGGAACCGGATTCGGGAGGGAACATTTAAAAGATTGATGTATTGAAGATAGACAGATAAAGCCGTAGATAGCGAATGACTTTTGGAGCTTTTGATGGAGGTAATGCG
TGAATCAGATACGCAGAGGGATTTTATTTAAATTCTTGATGTTAATATTGATGTTTTGAAGATAACGAGATCGATAGGCAAGGGGTGCAAAGAGATCATTAAATCCTTTGACGGAGATAATGCGGAAATTGAGATGCAGAGTGATTGTATATAAATTCTTGGGATTAAGATTGATGTTGTGAAGATAGATAGATACATGC
GCCAGGGATGTAAAGTGTTGTTTAAAGCATAGAACGAGTCAATCAGAGCTGTGGAGGTGATTGCATTTAAATTCTCGATGTTTCAAAGATAGCATAGTTAGATATGCAGAGTTACGTTTAACAGGTCTTGAGATGTTATATTAGGCTGGGGATGCAGAGTAATTTGGAAGGAGAATGGCAATGAGAAGAGAGGAGGTGTG
AGGAGGAGAGCCAGTAGAGAGCTATGTCCTTTTCAGGTTCGGAGCTGGGGCGGGCGGGGAGAAAGTCTTCTGCTCCTTCCCAGGATGGTTTTGCGGGATCTCTTTCGAAGCCCAGAACTCCAAGGGGGAGTCCAGATGCTAAGCAGAAGCCTGGCCCTTCTAGGCTGGCAATGGTTGCTTCACAGAAGCAACGACCTTTG
CAGAGGAAGCCGCCGGAGCCTCTTCGACGTGCCGTGGCCGATTGTTTGTCTGCATCTCATCATGGGACCTCTGCATTCACGTCGGAAGCATTGCGAACACTTCAGGATTATTTGGCGAATGTATCAACTATTGACATTGGATATACTGTACTTTTAGAACACGCGCACGCAGAGAGGGACCGAAGCCCTCCAGTTGTTGC
AAAGTGTGTATCCCTTCTCAAACGATATCTTTTTAGGTATACACCTAGAATAGAGACTCTAGAGCAGATTGATTTGTTTTGTGTGAATCTAATTACTGAGTGCAATGCCGTTACCAACAAGAAGGCTTCTCCATGGGTGCAGTCTGCTAACAGTCAGCATGTAGCATCAAATGTATCTGTCCAGTCATCTTCTCCAACCT
CAACATCTGCGGCTTTTGCCTCAGAAGCTCTTGTTAAGTCATTGAATTATGTTCGTGGTTTGGTTTCACGACATATTCCAAGACATTCATTTCAGTCAGCACTGTTTTCTGGAAATTCTCATGCTACTAAGAGATTTTCTCCAACAATGTCATCTTTGAGGAGCAGATCGTTTGGTTCCCCACTCAGTCCAGGTGGCACT
GTAAGCAGAGGTTCTCCTGAGAATAAAGAGGCTGCAAATTTGGTTATTTCAAATATATTAGGATTGGAAACAATTGATGAGGAGAACAATAATTATATTGCTCTTGATGTACTCAAATCAAGATGGATTGTGGATAGGTACCAGCAAAGTTGGACCCCGTCTCCTGTTATGACAGACAGTGGGGGCATAGCACGGCCACA
AGTAGACAGCAAATATGATTTTCTAGAACATGGGGCTGCAGCATTGCTAATGAAAGGTACTGAACAAAAGAGTCAGCTGGGGAGGAGCACACATAGGAGACTAGCTTCTAGTGTTCGTAATGAGCAACTATTGCAGCCTTCTACAGTCACAACTGTCACTGACACTGCATCTGCCCGTTCTCATTTGAGAGCTATAGCAG
CTTCCAAGCGTTCTATCAGAACTGGAACTCATCAAGTCTGGGGGGATGTACCTCTGAGCACATGGCGTCGTCGACCACGCCCTCTTTTCCAATACAGATATTACAGTGAACAGCAACCTTTGAGACTGAGTACTGGTGAAGTGGAGGAGGTTATATCTGCTGTTTGTTCAGAGGGATCCGTGACAAATACCAATACAATG
ACACCAATGTCCTCATTGCTAAGTAATCAGACTGGAAGGCTAGCTGTGGAGACTGTTGATGCTGCAGCTAGTGTCCTTATCAAACTTGTTATTGACATGTACATGGCAGACTCTCGGACTGCTGCTCCACTTGCCCTTTCTATGCTAGAGGGTATGCTGAGTTCTCCTCAATTGACAGCTAGAACCCGGGCTTTTGATTT
GATTTTAAATCTTGGTATTCATGCTCATTTATTGGAACCTATGCTGAGTGACGATCAGTCTGCAGTGGTGGAAGAACCATCTTCTCAGCCTACCAATTTTAATAATGGAGATCAGTTTCTTGCTTTGGCAAAGGGAGCTTTAAAATGCCACGACAAACTAGAAAATGGAACTCCGCGGGCAGTTAATGAATTTGAGATCT
GGTTATTAAACATACTTTATGAGATACTACTTTTCCTTGTACAGATAGAAGAGAAAGAAGAAGCAGTCTGGGCATCTGCATTGAGTTGCTTAATGTATATGATCTGTGACAGAGGAAGGATCCAACGATGTCGCTTGAATGGACTTGATATCAGGGTTTTAAAGGCACTTTTGGAGATTAGTAGAGAGAATTCATGGGCA
GAAGAACTTCATTGCAGACTAATTCGTTTGCTATCAAATTTATTGTATTGTATTCCCACTGGGACGGAGAAGGCTAATCTCGGTACTCCCAGTTCTCATGTTATGGACATTCAACAACTGGAACTTCTTGGTGGAATAGAATTTATTTGTCAAGAGTATGCAAGAGAAAATGCCTTGGAAGCAAAGAACAACTTATTTGG
GGTTCTTTTTGACTATGTTTTGCATAAGCTCAAGAATGAGCACTTAGCTAGTGGAACTCCCTTACCCAGTTATGATGAAATTCAAGCTGTTGCAACAGTGCTTGCCCTTGCAGATGCACCAGTGGCCTTTGCTGTCGCACTTAAACTAGGATTGCATGATGTTGGGGAGGAATTGAGAAATTCGATTGTTCAAGCTATGT
CTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGTATTGAATGACATAGTCAAATTACTGGATTCTGTAATAGCAACATATAACCATTTAGAAGATGAGTTTTCAGAGATGCTTCATATTACAATGGTGAGCGAGGGTCTTACTCACATTCAGAAGGGCCGCTTAGAGCAGGAGATCATAGGAGATTCAAATAGAGTT
TCAGAGGCTTGGAACACTTTGAGTTCTCTTCTGCACTCTCCAAGAGCTACTTATCGTCAAAATGGTTATTGCTGGCTCGTTGAACTGCTATTTGCTGAAATGTTTAGGGAGAGCAATAAGGTCAATATTCAGCATTTGCAACAGCAACTTGGACGTTTAGGAAGTTCTGAAAAATCCGATCCAGATCATTCGGAGGACCA
AACGTTGCGTGGAGTTTCTTCATCTGTTCAACTATTCTCAGGACTTTTGAAATCAAAATATAATTATGTAAGGTGTGGATTTATTATTGTGTTAGAAAGGCTTCTTCTGCGATGTCAGCTGTCAGTGTTGGATGACCATGAACTTGACCAAGGAGCAGTTGACAGAGAATTTAGGCTGGATGGCAGTGACAGCTCATACA
TCCAGGAAAAAGCAAATGCTGTTATTGTCTTGATGAATGGAGCATTGTCACAAATATTTCTGGCAAACGAGACTAACCCTATCAATATTTTGAAGATGTGTGACCTTCTTTTTTCTCAACTTTGTTTGAGAATATCTCCACCAATGGCATCTTCTATTTATAGTAATGCATATATAAGAGATAACACAGCCTTTGATAGT
GTCAGCAATAGTTATGTTGGCTATGATAGCCCTGATAATTTACTGTTCAGTAATGAGCAAGGGGATAGACATTATGGAGATGATAGACATGCAATTAGATCTGTATTTGGAAGTGGTTCAATACCTTCTAATTGTAATTCAACATCAATGGCAGCATTGCTACTAAGGGGTTATGCTGCAGCCCCTAGGCAACTAGTAAA
TTGCATTCCTACAGCTCTTTTGTATTGGCCACTGATTCAACTGGCTGGGGCGGCAACTGATGATATGGCATTAGGTAATGCTGTTGGTAGCAAGGGAAGAGGAAATATACCTGGTGGTGCTTCTGACACCCGGGCAGCACTTCTATTGCTACTAATTGGAAAATGCGCTACAAACCAAGCTGCATTTCAAGAGGTTGGAG
GCGAAGAATTTTTTAGGTCTTTATTAGATGATACAGATGCACGAGTCGCATATTATACCTCTGCATTTCTCTTGAAGAGAATGATGACAGAAGAGCCTGACAAGTACCAGCGTATGCTTCATAATCTTGTCTTTAAGGCTCAACAGAGCAACAATGAGAAATTGTTAGAGAATCCGTATCTTCAAATGCGTGGTATACTT
CAATTATCCAGTGATTTAGGGAGCCAATTGTCATTCCAGGAATGTTGATTCTTGCAAACTGGGTGTCATGTTCCATATTGGTTCAGAAAAGGGAAAATAATCATGTAACATTATCTTGAGCTGGTATCTCTTATGATTTCTACAACCCAAGGTACCCTTTGACCATATCTATGAAATCAGCCAGATTGGCCAGAAGATTC
CAGCAGATGGTAGAAATTACAGGGCCAAATAACAATCGATTTGCATGCTGTAAGGCACAGAAATTATATTTTGGGATTCGTGTTCATAGATTAATACTTTTCTACAAATCTATTCATGACAAAGTCGTTGGAGCAGTCTGAATGGATTATTTGATTTATCTTGTAAATCATCATTGCAACCACCAAGGGTTGCACAGATT
AAATTTCATTTTTCAGgtatactcgacctttttgtcattactttctgcagtgtttattatgttttccacggattatagatattttctttctttctcatagatttgcaagagcatttggtaagggtttactcgacaggtaataaaaaaatgggctatttttgttaagttttgatcagatgatctgatattcattgacaact
tccaaaaataaagttgcacaggtgtattagagaaacatgccgcgtagtttatagctgatgcatatactaagaatttgaatatttcaatgtgaaatggtggagagcagcatgtattggttatattgtaaatgattctagaattttccagtgtatatttgtgatgcctggagatattgactttaaccttgtttaaatgataa
ataaaagcacacatgcactatttttggcatgtaaattgtcattaatttctagggagatggaaataagggagatccatgcatttccctctatattctgaaaacggctcccaaggattttttggggggggagttcatgttcttggaacttatttttctgcttgttagactaatgttctggaacgttttgcacatttattctt
ttagtgaagatcggttctgctatggtcatctatttttctttagttgtatggttatttgtcaaataccaattcttcaataaagtttcgttctttgtaatagGTATTTCTCTGTGGCACAATATTGCAGTAGGTTGGAATAACCTGTCTGCTTGTAAATTATACACATTCAGGCAGGAGCAAGAGTCTAGTGATGAACCTGT
CCAGGAATGGCAGTCTTCAGTCTTTTGTCTCAAACAAAATTTTCAAATGCTGAAGGCGGCACTCATGATTGTGGGAAGCAGAATGCCTTTCCATGGGCTGTTGTGCAAGGTTATTTCCAGATTTAATAAATTGAATTGGCTGGATGGTTCAATGATGTGACTAGGTAGCAACAGCAGTCAACTGTATTCTTACAAAATTT
TGCGATAATGAGTTGCATTGTATTAAACCAGCTTTCATAACATAGAGCTGTCATTATTATGTTGTAGATTTGTACAGATATTTATTCCCAATGGGTTTTATTTGTAAATTATAGCTTTTTTGCTTCAGTAATCTTTAAGCAAAAGCTCTTTGTCAAATTGGTCAACAATGCCCTTCACCTATTTGATAAGCTGCTGGAAT
ACGGGGTCATGTGATTTTTGCTTCTTATCGTATTAATCTATGTCTGATATTTTTTATTTCCACATGTTCTTATATTGTCTTAATTGTACAGTGGATGTGTATCAGGCAAAGGTTTTCAAATTTCAGTTTGTCTAGGGTGTTGTTACATTATCATATTCTACTGGATTTATTCCATAAAGCAGTCTATATTGCCTGTAATG
GTTATTCTTGGCACCACTAGCAGATCCTCGTGATTAAACATATGACACAAGCCATGGACCGCCCCATCCATGATGGTATATTTTATAATGGTTGAGATAAGCAATATTATTATACTCCCATAC



Intron 4 GTGTGTTGCA ... TACTTTTCAG

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>TRINITY_DN115916_c4_g1_i13 from sample A2 / Example spliced isoform
TTTCTGGAAATTTTTCTCAAGGAAAAGTTGGATGTACTCTTCTGTATAAGCTGTTATCTGATACACTTTTTCAAGTACACCTTCCATCATTTGGATATAAATTGAAGTACGGTATATGAAGTATGTGTTTTTGTTGCTGTTGATGCGCACATAAGAGACCTGAAAATTTGGGTATGCTGAGTTCTCCTCAATTGACAGCT
AGAACCCGGGCTTTTGATTTGATTTTAAATCTTGGTATTCATGCTCATTTATTGGAACCTATGCTGAGTGACGATCAGTCTGCAGTGGTGGAAGAACCATCTTCTCAGCCTACCAATTTTAATAATGGAGATCAGTTTCTTGCTTTGGCAAAGGGAGCTTTAAAATGCCACGACAAACTAGAAAATGGAACTCCGCGGGC
AGTTAATGAATTTGAGATCTGGTTATTAAACATACTTTATGAGATACTACTTTTCCTTGTACAGATAGAAGAGAAAGAAGAAGCAGTCTGGGCATCTGCATTGAGTTGCTTAATGTATATGATCTGTGACAGAGGAAGGATCCAACGATGTCGCTTGAATGGACTTGATATCAGGGTTTTAAAGGCACTTTTGGAGATTA
GTAGAGAGAATTCATGGGCAGAAGAACTTCATTGCAGACTAATTCGTTTGCTATCAAATTTATTGTATTGTATTCCCACTGGGACGGAGAAGGCTAATCTCGGTACTCCCAGTTCTCATGTTATGGACATTCAACAACTGGAACTTCTTGGTGGAATAGAATTTATTTGTCAAGAGTATGCAAGAGAAAATGCCTTGGAA
GCAAAGAACAACTTATTTGGGGTTCTTTTTGACTATGTTTTGCATAAGCTCAAGAATGAGCACTTAGCTAGTGGAACTCCCTTACCCAGTTATGATGAAATTCAAGCTGTTGCAACAGTGCTTGCCCTTGCAGATGCACCAGTGGCCTTTGCTGTCGCACTTAAACTAGGATTGCATGATGTTGGGGAGGAATTGAGAAA
TTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGTATTGAATGACATAGTCAAA


>TRINITY_DN115916_c4_g1_i16 from sample A2 / Example unspliced isoform:
TTTCTGGAAATTTTTCTCAAGGAAAAGTTGGATGTACTCTTCTGTATAAGCTGTTATCTGATACACTTTTTCAAGTACACCTTCCATCATTTGGATATAAATTGAAGTACGGTATATGAAGTATGTGTTTTTGTTGCTGTTGATGCGCACATAAGAGACCTGAAAATTTGgtgtgttgcatttacacgttacatattttg
ataaatatattattgttgggaagttttaagttgaaatactctatgaatgactatatttgtaaatttgaaaatacttttcagGGTATGCTGAGTTCTCCTCAATTGACAGCTAGAACCCGGGCTTTTGATTTGATTTTAAATCTTGGTATTCATGCTCATTTATTGGAACCTATGCTGAGTGACGATCAGTCTGCAGTGGT
GGAAGAACCATCTTCTCAGCCTACCAATTTTAATAATGGAGATCAGTTTCTTGCTTTGGCAAAGGGAGCTTTAAAATGCCACGACAAACTAGAAAATGGAACTCCGCGGGCAGTTAATGAATTTGAGATCTGGTTATTAAACATACTTTATGAGATACTACTTTTCCTTGTACAGATAGAAGAGAAAGAAGAAGCAGTCT
GGGCATCTGCATTGAGTTGCTTAATGTATATGATCTGTGACAGAGGAAGGATCCAACGATGTCGCTTGAATGGACTTGATATCAGGGTTTTAAAGGCACTTTTGGAGATTAGTAGAGAGAATTCATGGGCAGAAGAACTTCATTGCAGACTAATTCGTTTGCTATCAAATTTATTGTATTGTATTCCCACTGGGACGGAG
AAGGCTAATCTCGGTACTCCCAGTTCTCATGTTATGGACATTCAACAACTGGAACTTCTTGGTGGAATAGAATTTATTTGTCAAGAGTATGCAAGAGAAAATGCCTTGGAAGCAAAGAACAACTTATTTGGGGTTCTTTTTGACTATGTTTTGCATAAGCTCAAGAATGAGCACTTAGCTAGTGGAACTCCCTTACCCAG
TTATGATGAAATTCAAGCTGTTGCAACAGTGCTTGCCCTTGCAGATGCACCAGTGGCCTTTGCTGTCGCACTTAAACTAGGATTGCATGATGTTGGGGAGGAATTGAGAAATTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGTATTGAATGACATAGTCAAA



Intron 5 GTATGATTCT ... AATGTTGCAG

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>TRINITY_DN132806_c1_g1_i29 from sample A1 / Example spliced isoform
GGTTTTAAAGGCACTTTTGGAGATTAGTAGAGAGAATTCATGGGCAGAAGAACTTCATTGCAGACTAATTCGTTTGCTATCAAATTTATTGTATTGTATTCCCACTGGGACGGAGAAGGCTAATCTCGGTACTCCCAGTTCTCATGTTATGGACATTCAACAACTGGAACTTCTTGGTGGAATAGAATTTATTTGTCAAG
AGTATGCAAGAGAAAATGCCTTGGAAGCAAAGAACAACTTATTTGGGGTTCTTTTTGACTATGTTTTGCATAAGCTCAAGAATGAGCACTTAGCTAGTGGAACTCCCTTACCCAGTTATGATGAAATTCAAGCTGTTGCAACAGTGCTTGCCCTTGCAGATGCACCAGTGGCCTTTGCTGTCGCACTTAAACTAGGATTG
CATGATGTTGGGGAGGAATTGAGAAATTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGAATTGAGAAATTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGTATTGAATGACATAGTCAAATTACTGGATTCTGTAATAGCAACATATAACCA
TTTAGAAGATGAGTTTTCAGAGATGCTTCATATTACAATGGTGAGCGAGGGTCTTACTCACATTCAGAAGGGCCGCTTAGAGCAGGAGATCATAGGAGATTCAAATAGAGTTTCAGAGGCTTGGAACACTTTGAGTTCTCTTCTGCACTCTCCAAGAGCTACTTATCGTCAAAATGGTTATTGCTGGCTCGTTGAACTGC
TATTTGCTGAAATGTTTAGGGAGAGCAATAAGGTCAATATTCAGCATTTGCAACAGCAACTTGGACGTTTAGGAAGTTCTGAAAAATCCGATCCAGATCATTCGGAGGACCAAACGTTGCGTGGAGTTTCTTCATCTGTTCAACTATTCTCAGGACTTTTGAAATCAAAATATAATTATGTAAGGTGTGGATTTATTATT
GTGTTAGAAAGGCTTCTTCTGCGATGTCAGCTGTCAGTGTTGGATGACCATGAACTTGACCAAGGAGCAGTTGACAGAGAATTTAGGCTGGATGGCAGTGACAGCTCATACATCCAGGAAAAAGCAAATGCTGTAATTGTCTTGATGAATGGAGCATTGTCACAAATATTTCTGGCAAACGAGACTAACCCTATCAATAT
TTTGAAGGTACGTAGACAATATATCACCATTTTATATAATATTATTGGTTAATAAAAATTATTGAGACCATGGTTAACTCTTCTTGATAGATGGGGGGCTGTTAAAAAACATTGCTTTTCTTTTTCTTGAATAACCAACAATGACTTTTAATCTTTCAAATTAGGAGTCTAACTGGTTATGTCCGAAATAGATTATTCAA
TTAATCTCTATTATGATGCTGTATAAATATAAACTCGATAGCTTGTTTGCCAATATCAGTTTACCTGTTTTGGACAAACCATTTTTATTAGCCTTTAATTTTATACCTTCACTACCATGCATTGGAGGGGTTATCCAATCTTTCTCTATAAATATTATAATAGCTGTGCACGAGATTGACTCTCCTTT


>TRINITY_DN132806_c1_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TATGCAAGAGAAAATGCCTTGGAAGCAAAGAACAACTTATTTGGGGTTCTTTTTGACTATGTTTTGCATAAGCTCAAGAATGAGCACTTAGCTAGTGGAACTCCCTTACCCAGTTATGATGAAATTCAAGCTGTTGCAACAGTGCTTGCCCTTGCAGATGCACCAGTGGCCTTTGCTGTCGCACTTAAACTAGGATTGCA
TGATGTTGGGGAGGAATTGAGAAATTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGGAATTGAGAAATTCGATTGTTCAAGCTATGTCTCGAGATGTGAACAGTGGTCGTCTTAATACTGAGgtatgattctgggatgcagttgtataaggctgaaagtcaaagatttcattcagat
tcaaaataaaaggatactgtgcattttaatttatttagaagtatcattgatttataataagttttgcaagatttcaaaggtggacagattttgtagttttagtaattcagatgttgatgatattgtttcttcattgtatttgtgttccttgaataacaaaacttataatgttgcagGTATTGAATGACATAGTCAAATTA
CTGGATTCTGTAATAGCAACATATAACCATTTAGAAGATGAGTTTTCAGAGATGCTTCATATTACAATGGTGAGCGAGGGTCTTACTCACATTCAGAAGGGCCGCTTAGAGCAGGAGATCATAGGAGATTCAAATAGAGTTTCAGAGGCTTGGAACACTTTGAGTTCTCTTCTGCACTCTCCAAGAGCTACTTATCGTCA
AAATGGTTATTGCTGGCTCGTTGAACTGCTATTTGCTGAAATGTTTAGGGAGAGCAATAAGGTCAATATTCAGCATTTGCAACAGCAACTTGGACGTTTAGGAAGTTCTGAAAAATCCGATCCAGATCATTCGGAGGACCAAACGTTGCGTGGAGTTTCTTCATCTGTTCAACTATTCTCAGGACTTTTGAAATCAAAAT
ATAATTATGTAAGGTGTGGATTTATTATTGTGTTAGAAAGGCTTCTTCTGCGATGTCAGCTGTCAGTGTTGGATGACCATGAACTTGACCAAGGAGCAGTTGACAGAGAATTTAGGCTGGATGGCAGTGACAGCTCATACATCCAGGAAAAAGCAAATGCTGTAATTGTCTTGATGAATGGAGCATTGTCACAAATATTT
CTGGCAAACGAGACTAACCCTATCAATATTTTGAAGATGTGTGACCTTCTTTTTTCTCAACTTTGTTTGAGAATATCTCCACCAATGGCATCTTCTATTTATAGTAATGCATATATAAGAGATAACACAGCCTTTGATAGTGTCAGCAATAGTTATGTTGGCTATGATAGCCCTGATAATTTACTGTTCAGTAATGAGCA
AGGGGATAGACATTATGGAGATGATAGACATGCAATTAGATCTGTATTTGGAAGTGGTTCAATACCTTCTAATTGTAATTCAACATCAATGGCAGCATTGCTACTAAGGGGTTATGCTGCAGCCCCTAGGCAACTAGTAAATTGCATTCCTACAGCTCTTTTGTATTGGCCACTGATTCAACTGGCTGGGGCGGCAACTG
ATGATATGGCATTAGGTAATGCTGTTGGTAGCAAGGGAAGAGGAAATATACCTGGTGGTGCTTCTGACACCCGGGCAGCACTTCTATTGCTACTAATTGGAAAATGCGCTACAAACCAAGCTGCATTTCAAGAGGTTGGAGGCGAAGAATTTTTTAGGTCTTTATTAGATGATACAGATGCACGAGTCGCATATTATACC
TCTGCATTTCTCTTGAAGAGAATGATGACAGAAGAGCCTGACAAGTACCAGCGTATGCTTCATAATCTTGTCTTTAAGGCTCAACAGAGCAACAATGAGAAATTGTTAGAGAATCCGTATCTTCAAATGCGTGGTATACTTCAATTATCCAGTGATTTAGGGAGCCAATTGTCATTCCAGGAATGTTGATTCTTGCAAAC
TGGGTGTCATGTTCCATATTGGTTCAGAAAAGGGAAAATAATCATGTAACATTATCTTGAGCTGGTATCTCTTATGATTTCTACAACCCAAGGTACCCTTTGACCATATCTATGAAATCAGCCAGATTGGCCAGAAGATTCCAGCAGATGGTAGAAATTACAGGGCCAAATAACAATCGATTTGCATGCTGTAAGGCACA
GAAATTATATTTTGGGATTCGTGTTCATAGATTAATACTTTTCTACAAATCTATTCATGACAAAGTCGTTGGAGCAGTCTGAATGGATTATTTGATTTATCTTGTAAATCATCATTGCAACCACCAAGGGTTGCACAGATTAAATTTCATTTTTCAGGTATACTCGACCTTTTTGTCATTACTTTCTGCAGTGTTTATTA
TGTTTTCCACGGATTATAGATATTTTCTTTCTTTCTCATAGATTTGCAAGAGCATTTGGTAAGGGTTTACTCGACAGGTAATAAAAAAATGGGCTATTTTTGTTAAGTTTTGATCAGATGATCTGATATTCATTGACAACTTCCAAAAATAAAGTTGCACAGGTGTATTAGAGAAACATGCCGCGC



Intron 6 GTATACACCT ... ATGGGTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A748.7210712
A8100032
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A1065.525109



>TRINITY_DN117254_c0_g1_i19 from sample A3 / Example spliced isoform
CGCCGGGTGGGGATCGTGCGTTCATTTCCCCTCCTTCATTCATGTTATGTTCGCATCATCACATTCACTCATCTAAACAAAAATAAATAAAATGCAGCAGCAAAAAGGGCAGCATCATCCTCGTCGTCATCCAATCACATTTAAGCACCAGGTAATCTCAGCGTCCAAACCCTCAGTTTTCCCTGCGAGTTCCTGGATTC
TTCCGTCAAAGCTTCCGACTGCGACCACCGGAGCTGGAAAATATCATTCACGGCGCTCTTTTGCGGCTCGCGGCAACGTTGTCCGTGTTCTGCAGGCCGAGATCTCTCGTGTGAGGTATTCTTCGCCTGATTTGATCCGGGATTGCTCCTATATTTAAACGACGGCGTGGTTTCACATCTGTTGGTCGTTCGGCTTGTGG
AGTTGAGAGCATTGTTCTTTACGCTCCGGAATTTGATCGGATTTGCAGAGAGGCCGGTCGAAAGGGTTTGTTGAAGTTAATTTTTTTATGTTTTTTATTTCATTTATGCGATGAATGCGGGGGATCTTCAGGATTCGCCAATAATTATCGAGTTGCAGTGTGATCGGAACCGGATTCGGGAGGGAACATTTAAAAGATTG
ATGTATTGAAGATAGACAGATAAAGCCGTAGATAGCGAATGACTTTTGGAGCTTTTGATGGAGGTAATGCGTGAATCAGATACGCAGAGGGATTTTATTTAAATTCTTGATGTTAATATTGATGTTTTGAAGATAACGAGATCGATAGGCAAGGGGTGCAAAGAGATCATTAAATCCTTTGACGGAGATAATGCGGAAAT
TGAGATGCAGAGTGATTGTATATAAATTCTTGGGATTAAGATTGATGTTGTGAAGATAGATAGATACATGCGCCAGGGATGTAAAGTGTTGTTTAAAGCATAGAACGAGTCAATCAGAGCTGTGGAGGTGATTGCATTTAAATTCTCGATGTTTCAAAGATAGCATAGTTAGATATGCAGAGTTACGTTTAACAGGTCTT
GAGATGTTATATTAGGCTGGGGATGCAGAGTAATTTGGAAGGAGAATGGCAATGAGAAGAGAGGAGGTGTGAGGAGGAGAGCCAGTAGAGAGCTATGTCCTTTTCAGGTTCGGAGCTGGGGCGGGCGGGGAGAAAGTCTTCTGCTCCTTCCCAGGATGGTTTTGCGGGATCTCTTTCGAAGCCCAGAACTCCAAGGGGGA
GTCCAGATGCTAAGCAGAAGCCTGGCCCTTCTAGGCTGGCAATGGTTGCTTCACAGAAGCAACGACCTTTGCAGAGGAAGCCGCCGGAGCCTCTTCGACGTGCCGTGGCCGATTGTTTGTCTGCATCTCATCATGGGACCTCTGCATTCACGTCGGAAGCATTGCGAACACTTCAGGATTATTTGGCGAATGTATCAACT
ATTGACATTGGATATACTGTACTTTTAGAACACGCGCACGCAGAGAGGGACCGAAGCCCTCCAGTTGTTGCAAAGTGTGTATCCCTTCTCAAACGATATCTTTTTAGTCTGCTAACAGTCAGCATGTAGCATCAAATGTATCTGTCCAGTCATCTTCTCCAACCTCAACATCTGCGGCTTTTGCCTCAGAAGCTCTTGTT
AAGTCATTGAATTATGTTCGTGGTTTGGTTTCACGACATATTCCAAGACATTCATTTCAGTCAGCACTGTTTTCTGGAAATTCTCATGCTACTAAGAGATTTTCTCCAACAATGTCATCTTTGAGGAGCAGATCGTTTGGTTCCCCACTCAGTCCAGGTGGCACTGTAAGCAGAGGTTCTCCTGAGAATAAAGAGGCTGC
AAATTTGGTTATTTCAAATATATTAGGATTGGAAACAATTGATGAGGAGAACAATAATTATATTGCTCTTGATGTACTCAAATCAAGATGGATTGTGGATAGGTACCAGCAAAGTTGGACCCCGTCTCCTGTTATGACAGACAG


>TRINITY_DN117254_c0_g1_i14 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CGCCGGGTGGGGATCGTGCGTTCATTTCCCCTCCTTCATTCATGTTATGTTCGCATCATCACATTCACTCATCTAAACAAAAATAAATAAAATGCAGCAGCAAAAAGGGCAGCATCATCCTCGTCGTCATCCAATCACATTTAAGCACCAGGTAATCTCAGCGTCCAAACCCTCAGTTTTCCCTGCGAGTTCCTGGATTC
TTCCGTCAAAGCTTCCGACTGCGACCACCGGAGCTGGAAAATATCATTCACGGCGCTCTTTTGCGGCTCGCGGCAACGTTGTCCGTGTTCTGCAGGCCGAGATCTCTCGTGTGAGGTATTCTTCGCCTGATTTGATCCGGGATTGCTCCTATATTTAAACGACGGCGTGGTTTCACATCTGTTGGTCGTTCGGCTTGTGG
AGTTGAGAGCATTGTTCTTTACGCTCCGGAATTTGATCGGATTTGCAGAGAGGCCGGTCGAAAGGGTTTGTTGAAGTTAATTTTTTTATGTTTTTTATTTCATTTATGCGATGAATGCGGGGGATCTTCAGGATTCGCCAATAATTATCGAGTTGCAGTGTGATCGGAACCGGATTCGGGAGGGAACATTTAAAAGATTG
ATGTATTGAAGATAGACAGATAAAGCCGTAGATAGCGAATGACTTTTGGAGCTTTTGATGGAGGTAATGCGTGAATCAGATACGCAGAGGGATTTTATTTAAATTCTTGATGTTAATATTGATGTTTTGAAGATAACGAGATCGATAGGCAAGGGGTGCAAAGAGATCATTAAATCCTTTGACGGAGATAATGCGGAAAT
TGAGATGCAGAGTGATTGTATATAAATTCTTGGGATTAAGATTGATGTTGTGAAGATAGATAGATACATGCGCCAGGGATGTAAAGTGTTGTTTAAAGCATAGAACGAGTCAATCAGAGCTGTGGAGGTGATTGCATTTAAATTCTCGATGTTTCAAAGATAGCATAGTTAGATATGCAGAGTTACGTTTAACAGGTCTT
GAGATGTTATATTAGGCTGGGGATGCAGAGTAATTTGGAAGGAGAATGGCAATGAGAAGAGAGGAGGTGTGAGGAGGAGAGCCAGTAGAGAGCTATGTCCTTTTCAGGTTCGGAGCTGGGGCGGGCGGGGAGAAAGTCTTCTGCTCCTTCCCAGGATGGTTTTGCGGGATCTCTTTCGAAGCCCAGAACTCCAAGGGGGA
GTCCAGATGCTAAGCAGAAGCCTGGCCCTTCTAGGCTGGCAATGGTTGCTTCACAGAAGCAACGACCTTTGCAGAGGAAGCCGCCGGAGCCTCTTCGACGTGCCGTGGCCGATTGTTTGTCTGCATCTCATCATGGGACCTCTGCATTCACGTCGGAAGCATTGCGAACACTTCAGGATTATTTGGCGAATGTATCAACT
ATTGACATTGGATATACTGTACTTTTAGAACACGCGCACGCAGAGAGGGACCGAAGCCCTCCAGTTGTTGCAAAGTGTGTATCCCTTCTCAAACGATATCTTTTTAGgtatacacctagaatagagactctagagcagattgatttgttttgtgtgaatctaattactgagtgcaatgccgttaccaacaagaaggcttc
tccatgggtgcagTCTGCTAACAGTCAGCATGTAGCATCAAATGTATCTGTCCAGTCATCTTCTCCAACCTCAACATCTGCGGCTTTTGCCTCAGAAGCTCTTGTTAAGTCATTGAATTATGTTCGTGGTTTGGTTTCACGACATATTCCAAGACATTCATTTCAGTCAGCACTGTTTTCTGGAAATTCTCATGCTACTA
AGAGATTTTCTCCAACAATGTCATCTTTGAGGAGCAGATCGTTTGGTTCCCCACTCAGTCCAGGTGGCACTGTAAGCAGAGGTTCTCCTGAGAATAAAGAGGCTGCAAATTTGGTTATTTCAAATATATTAGGATTGGAAACAATTGATGAGGAGAACAATAATTATATTGCTCTTGATGTACTCAAATCAAGATGGATT
GTGGATAGGTACCAGCAAAGTTGGACCCCGTCTCCTGTTATGACAGACAGGTATTTCTTTGGTTTGGATTTGCTGACTCTTTTTCAGGTCAACTAGATACGGCAAGATGAACATGTAAATAGGCTAGATGATTTCGCCG