NA ----> NA

Intron 1 GTATGTATGG ... CACAATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	30.34	301.7	85.7	177
A2	35.4	208	83	145
A3	36.9	203.3	79.7	158
A4	30.22	254	71	149
A5	29.93	87	24.3	50
A6	19.74	80	4.3	35
A7	29.81	393.7	81.3	253
A8	28.58	349	89.3	190
A9	25.32	230	37	119
A10	27.98	220	38	133

>TRINITY_DN124803_c1_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform

GTGGGTTTATGGCTAACGCAGATTCCGCCGATATATATGTATGGCTAAAGGCGGAGTGGTCGGGGAAATTAAGGCTTTCGAACCTATTTTGTGGATATAGACAAGTGCAATGGGTGAAGGTGAAGTTTTAGGTGGGAAAGAAATGTGTATTGAAATATCTATGTAAGAGAGATTGTAGTATACTATGCAGAAGCAAAGGC
ATTGGTTGAAATATCTATGCAAGAGAGATTGTAGTATACTATGCAGAAGCAAAGGCATTGGTCAAAAGCATTGCTTGGTATCAATCCAAAGGAGCTAGACAATGAAGCTCGTGCTTTAATCCTTTATCACATTGAGGCTCGTGTTTATGTTGGGGTCGATGTTTGCGAGGATCTATAACAATTGTCAAACAAAGATGTTT
GCAGCTTGGTATCAATCCAAAGGAGCTAGACAATGAAGCTCGTGCTTTAATCCTTTATCACATTGAGGCTCGTGTTTATGTTGGGGTCGATGTTTGCGAGGATCTATAACAATTGTCAAACAAAGATGACTATGATGGTTAGACGATGATGGATACTGGGC

>TRINITY_DN124803_c1_g1_i15 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GTGGGTTTATGGCTAACGCAGATTCCGCCGATATATATGTATGGCTAAAGGCGGAGTGGTCGGGGAAATTAAGGCTTTCGAACCTATTTTGTGGATATAGACAAGTGCAATGGGTGAAGGTGAAGTTTTAGGTGgtatgtatggttccatgtatgtctgttaaattagagacattttatgttatttgtcatttatttaat
tcttgagtccaatgcacaatgcagGGAAAGAAATGTGTATTGAAATATCTATGTAAGAGAGATTGTAGTATACTATGCAGAAGCAAAGGCATTGGTTGAAATATCTATGCAAGAGAGATTGTAGTATACTATGCAGAAGCAAAGGCATTGGTCAAAAGCATTGCTTGGTATCAATCCAAAGGAGCTAGACAATGAAGCTC
GTGCTTTAATCCTTTATCACATTGAGGCTCGTGTTTATGTTGGGGTCGATGTTTGCGAGGATCTATAACAATTGTCAAACAAAGATGTTTGCAGCTTGGTATCAATCCAAAGGAGCTAGACAATGAAGCTCGTGCTTTAATCCTTTATCACATTGAGGCTCGTGTTTATGTTGGGGTCGATGTTTGCGAGGATCTATAAC
AATTGTCAAACAAAGATGACTATGATGGTTAGACGATGATGGATACTGGGC