sp|O24146|4CL2_TOBAC ----> 4-coumarate--CoA ligase 2

Intron 1 GTATGAATTT ... ATTGATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	50	7	5	9
A2	100	0	3	2
A3	57.14	3	3	5
A4	55.56	2	1	4
A5	71.43	2	6	4
A6	60	8	11	13
A7	61.9	4	9	4
A8	60.98	8	11	14
A9	57.58	7	8	11
A10	38.89	11	6	8

>TRINITY_DN46176_c0_g5_i5 from sample A7 / Example spliced isoform

CTTGCTCATTGAACCAATGGAATGCAACCACGTTTACTCCTACCGCCATATATTATCATGTTGTAGAAGATACCTGTTGAAGTTTGGTTTTACCATGGAAGACAAAAGTCACTTCAGGTTATTAACTTCGCATTTCTTGTGGCCAAATCGTGGAGCAACTTGAGCATTGTTGGAGGGCGCAGGGTCCTGAACATTTCTGC
CATTACTGCTGCCATATTCTACTGTAGGAAGAGGGCGAGTTCACTACAGGTGTATGTCTCAGCTGTTCGTTTTGTGTGTGCGCACTTCTTCTGTCAAATCGTGAAGAGTTGGGAAGCACGAGTCTGGTGTTGGAGGACATATTCTCATCTTCTCTCACAGCTGGGCGTTCTTCTCTATTTATGAATTTGTACTCACCTCC
AAATAGTCAACAAGGGCACAAACTAAGCTCAGTTTGGGCACCAAGTTAGTGGTTACTCCTGGTAATATACATCTGCTGTTATGACTGGTGCTCCGGAGGGGTTAATACATTTATTGGTTCTGGCAGAGGCCGACGAGAATGAGATACCCATTGTCCTAACAACGAGATGGGTCTGCCTTATTCATCTGGAACGACCAGGC
TTCCTAAGGGTGTTATGCTCACGCACAAGGGCCCTTTTTGGCTTCTTACTTCTTTAGGTTTTAGCCGACAGCTCTTGTTCAATTGTTCGCAGCTGATATACCTCACTAGGTCTCGGTTTGGGAATCGATCCCATCTTCAATTGAAGATTTGACACCTTGTGGAACAAGCATCCAGAGCAGTATAGAAGGTGACTGGTTCA
CACACAACATAGTTGGATAATGGTGCAAGTCGTGGTCGTATCCAGACAGCCTACAGGGGTGTACTGTATGTCTTTGTAAAAGTTTACAAGGAGAGCAGCTTACGTGGTCTTTACCATGGAGTAGGTAGGCACTGAGAATTGGTATCTTGGTCTTTTTTGATATGAACACTTTCTCTTACGAATATATGTGTGGGCATTTC
TTTGAGATTACCGAATAAGAAAAACCCTAAAGCTGAAGAATAGTTTCCAATCTCTTTGGATTGGTTCTCTGCTATATTGGCAGTATAACATGTCAGCTTGACATCTTCTTAATGTAAAACATATTTTGCAAGGGTGGTGTTGGTATTTGAAAACTCTTTTAACTTTTAAACCTAAAGTGCTATCATACCTTATTGGATGC
TTTTTTCAATAGTTTCCAATCTCTTTGGCTTGGTTCTCTGCTATAGTAGCAGTATAACATTTCACCTTGACATCTTCCTAATGTAAAACATATTTTGCAAG

>TRINITY_DN46176_c0_g5_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:

CTTGCTCATTGAACCAATGGAATGCAACCACGTTTACTCCTACCGCCATATATTATCATGTTGTAGAAGATACCTGTTGAAGTTTGGTTTTACCATGGAAGACAAAAGTCACTTCAGGTTATTAACTTCGCATTTCTTGTGGCCAAATCGTGGAGCAACTTGAGCATTGTTGGAGGGCGCAGGGTCCTGAACATTTCTGC
CATTACTGCTGCCATATTCTACTGTAGGAAGAGGGCGAGTTCACTACAGGTGTATGTCTCAGCTGTTCGTTTTGTGTGTGCGCACTTCTTCTGTCAAATCGTGAAGAGTTGGGAAGCACGAGTCTGGTGTTGGAGGACATATTCTCATCTTCTCTCACAGCTGGGCATTCTTCTCTATTTTTGAATTTGTACTCACCTCC
AAACAATCAACAAGGGCACAGACTGAGCTCAGTTTGGGCACCAAGTTAGTGGTTACTCCTGGTAATATACATCTGCTGTTATGACTGgtatgaatttacagtaagttatgtatgtgtaagaacaattttgtggtcttaatagcaactatagagctcctgagtgccttgcactactggagctttggactctagcttgagga
ttttggattgtttaacactctacaatatacatattttggatttgtttgttacgatctcaacatcccagttcaggttattagaattgatgcagGTGCTCCGGAGGGGTTAATACATTTATTGGTTCTGGCAGAGGCCGACGAGAATGAGATACCCATTGTCCTAACAACGAGATGGGTCTGCCTTATTCATCTGGAACGAC
CAGGCTTCCTAAGGGTGTTATGCTCACGCACAAGGGCCTTTTTTGGCTGCTTACTTCTTTAGGTTTTAGCCGACAGCTCTTGTTCAATTGTTCGCAGCTGATATACCTCACTAGGTCTCGGTTTGGGAATCGATCCCATCTTCAATTGAAGATTTGACACCTTGTGGAACAAGCATCCAGAGCAGTATAGAAGGTGACTG
GTTCACACACAACATAGTTGGATAATGGTGCAAGTCGTGGTCGTATCCAGACAGCCTACAGGGGTGTACTGTATGTCTTTGTAAAAGTTTACAAGGAGAGCAGCTTACGTGGTCTTTACCATGGAGTAGGTAGGCACTGAGAATTGGTATCTTGGTCTTTTTTGATATGAACACTTTCTCTTACGAATATATGTGTGGGC
ATTTCTTTGAGATTACCGAATAAGAAAAACCCTAAAGCTGAAGAATAGTTTCCAATCTCTTTGGATTGGTTCTCTGCTATATTGGCAGTATAACATGTCAGCTTGACATCTTCTTAATGTAAAACATATTTTGCAAGGGTGGTGTTGGTATTTGAAAACTCTTTTAACTTTTAAACCTAAAGTGCTATCATACCTTATTG
GATGCTTTTTTCAATAGTTTCCAATCTCTTTGGCTTGGTTCTCTGCTATAGTAGCAGTATAACATTTCACCTTGACATCTTCCTAATGTAAAACATATTTTGCAAG

Intron 2 GTAATATACA ... ATTGATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	39.68	19	16	9
A2	36.36	7	6	2
A3	42.37	7.5	6	5
A4	39.39	4	1	4
A5	60	4	8	4
A6	41.05	25.5	22.5	13
A7	36.84	18	17	4
A8	46.64	18	17.5	14
A9	42.67	21.5	21	11
A10	34.86	21.5	15	8

>TRINITY_DN46176_c0_g5_i2 from sample A7 / Example spliced isoform

CTTGCTCATTGAACCAATGGAATGCAACCACGTTTACTCCTACCGCCATATATTATCATGTTGTAGAAGATACCTGTTGAAGTTTGGTTTTACCATGGAAGACAAAAGTCACTTCAGGTTATTAACTTCGCATTTCTTGTGGCCAAATCGTGGAGCAACTTGAGCATTGTTGGAGGGCGCAGGGTCCTGAACATTTCTGC
CATTACTGCTGCCATATTCTACTGTAGGAAGAGGGCGAGTTCACTACAGGTGTATGTCTCAGCTGTTCGTTTTGTGTGTGCGCACTTCTTCTGTCAAATCGTGAAGAGTTGGGAAGCACGAGTCTGGTGTTGGAGGACATATTCTCATCTTCTCTCACAGCTGGGCATTCTTCTCTATTTTTGAATTTGTACTCACCTCC
AAACAATCAACAAGGGCACAGACTGAGCTCAGTTTGGGCACCAAGTTAGTGGTTACTCCTGGTGCTCCGGAGGGGTTAATACATTTATTGGTTCTGGCAGAGGCCGACGAGAATGAGATACCCATTGTCCTAACAACGAGATGGGTCTGCCTTATTCATCTGGAACGACCAGGCTTCCTAAGGGTGTTATGCTCACGCAC
AAGGGCCTTTTTTGGCTGCTTACTTCTTTAGGTTTTAGCCGACAGCTCTTGTTCAATTGTTCGCAGCTGATATACCTCACTAGGTCTCGGTTTGGGAATCGATCCCATCTTCAATTGAAGATTTGACACCTTGTGGAACAAGCATCCAGAGCAGTATAGAAGGTGACTGGTTCACACACAACATAGTTGGATAATGGTGC
AAGTCGTGGTCGTATCCAGACAGCCTACAGGGGTGTACTGTATGTCTTTGTAAAAGTTTACAAGGAGAGCAGCTTACGTGGTCTTTACCATGGAGTAGGTAGGCACTGAGAATTGGTATCTTGGTCTTTTTTGATATGAACACTTTCTCTTACGAATATATGTGTGGGCATTTCTTTGAGATTACCGAATAAGAAAAACC
CTAAAGCTGAAGAATAGTTTCCAATCTCTTTGGATTGGTTCTCTGCTATATTGGCAGTATAACATGTCAGCTTGACATCTTCTTAATGTAAAACATATTTTGCAAGGGTGGTGTTGGTATTTGAAAACTCTTTTAACTTTTAAACCTAAAGTGCTATCATACCTTATTGGATGCTTTTTTCAATAGTTTCCAATCTCTTT
GGCTTGGTTCTCTGCTATAGTAGCAGTATAACATTTCACCTTGACATCTTCCTAATGTAAAACATATTTTGCAAG

>TRINITY_DN46176_c0_g5_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:

CTTGCTCATTGAACCAATGGAATGCAACCACGTTTACTCCTACCGCCATATATTATCATGTTGTAGAAGATACCTGTTGAAGTTTGGTTTTACCATGGAAGACAAAAGTCACTTCAGGTTATTAACTTCGCATTTCTTGTGGCCAAATCGTGGAGCAACTTGAGCATTGTTGGAGGGCGCAGGGTCCTGAACATTTCTGC
CATTACTGCTGCCATATTCTACTGTAGGAAGAGGGCGAGTTCACTACAGGTGTATGTCTCAGCTGTTCGTTTTGTGTGTGCGCACTTCTTCTGTCAAATCGTGAAGAGTTGGGAAGCACGAGTCTGGTGTTGGAGGACATATTCTCATCTTCTCTCACAGCTGGGCATTCTTCTCTATTTTTGAATTTGTACTCACCTCC
AAACAATCAACAAGGGCACAGACTGAGCTCAGTTTGGGCACCAAGTTAGTGGTTACTCCTGgtaatatacatctgctgttatgactggtatgaatttacagtaagttatgtatgtgtaagaacaattttgtggtcttaatagcaactatagagctcctgagtgccttgcactactggagctttggactctagcttgagga
ttttggattgtttaacactctacaatatacatattttggatttgtttgttacgatctcaacatcccagttcaggttattagaattgatgcagGTGCTCCGGAGGGGTTAATACATTTATTGGTTCTGGCAGAGGCCGACGAGAATGAGATACCCATTGTCCTAACAACGAGATGGGTCTGCCTTATTCATCTGGAACGAC
CAGGCTTCCTAAGGGTGTTATGCTCACGCACAAGGGCCTTTTTTGGCTGCTTACTTCTTTAGGTTTTAGCCGACAGCTCTTGTTCAATTGTTCGCAGCTGATATACCTCACTAGGTCTCGGTTTGGGAATCGATCCCATCTTCAATTGAAGATTTGACACCTTGTGGAACAAGCATCCAGAGCAGTATAGAAGGTGACTG
GTTCACACACAACATAGTTGGATAATGGTGCAAGTCGTGGTCGTATCCAGACAGCCTACAGGGGTGTACTGTATGTCTTTGTAAAAGTTTACAAGGAGAGCAGCTTACGTGGTCTTTACCATGGAGTAGGTAGGCACTGAGAATTGGTATCTTGGTCTTTTTTGATATGAACACTTTCTCTTACGAATATATGTGTGGGC
ATTTCTTTGAGATTACCGAATAAGAAAAACCCTAAAGCTGAAGAATAGTTTCCAATCTCTTTGGATTGGTTCTCTGCTATATTGGCAGTATAACATGTCAGCTTGACATCTTCTTAATGTAAAACATATTTTGCAAGGGTGGTGTTGGTATTTGAAAACTCTTTTAACTTTTAAACCTAAAGTGCTATCATACCTTATTG
GATGCTTTTTTCAATAGTTTCCAATCTCTTTGGCTTGGTTCTCTGCTATAGTAGCAGTATAACATTTCACCTTGACATCTTCCTAATGTAAAACATATTTTGCAAG

Intron 3 GTGCTCCGGA ... GTTCTGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	58.87	11	16.2	5.2
A2	50	7	7	3.2
A3	71.09	3	7.4	4.2
A4	64.57	2	3.8	2.8
A5	60	2	3.2	1.2
A6	38.87	33.6	21.8	19
A7	44.36	21	16.8	7.4
A8	36.54	25	14.8	11.8
A9	40.06	28.8	19.4	12.8
A10	38.81	27.8	18	13.8

>TRINITY_DN94034_c0_g1_i1 from sample A4 / Example spliced isoform

AAATCGTGGAGCAACTTGAGCATTGTTGGAGGGCGCAGGGGTCCTGAACATTTCTGCCATTACTGCTGCCATATTCTACCGTAGGAAGAGGGCGAGTTCACTACAGGTGTATGTCTCAGCTGTTCGTTTTGTGTGTGCACACTTCTTCTGTCAAATCGTGAAGAGTTGGGAAGCACCAGTCTGGTATTGGAGGACATATT
CTCATCTTCTCTCACAGCTGGGCATTCTTCTCTATTTTTGAATTTGTACTCACCTCCAAACAATCAACAAGGGCACAGACTGAGCTCAGTTTGGGCACCAAGTTAGTGGTTACTCCTGAGGCCGACGAGAATGAGATACCCATTGTCCTAACAACGAGATGGGTCTGCCTTATTCATCTGGAACGACCAGGCTTCCTAAG
GGTGTTATGCTCACGCACAAGGGCCCTTTTTGGCTTCTTACTTCTTTAGGTTTTAGCCGACAGCTCTTGTTCAATTGTTCGCAGCTGATATACCTCACTAGCTCTCGGTTTGGGAATCGATCCCATCTTCAATTGAAGATTTGACACCTTGTGGAGCAAGCATCCAGAGCAGTATAGAAGGTGGGTTATAGATCCCGTCT
TCAATAATTATAAACCCATAGTAATTTCCATGGCTAATGTGTGTATATTTATCTGGTTCAATGATTTAATCGGTGTATTGATGCAAATAAAGGTTTTTCTTTGAAATGGGTTTATAACTATTGTTATTAGATGACATGGGTTTCTTTTGTTCTTTCTCCTCTGAAGTAATTTATGGAAGTTCATTGGGTTGCGGGTTTTG
AAGTGAATAATGGCAGTCGTAGGTGTTTTTGTGTGTTCAGGAGTGCCAGGGTTTTAGTCGGGTTTGAAATGCTCACAAGGGAAGCTATTGTTCCTTTCCATGTTGTAATTGGTGAAGCAAGTCCGTGACAAGTGTTAAACCCACTGAAGGCAGAGTATGGTCTTTTGGTCCTTCCGATGAGGTATTTAAATGAAGTATGG
TATTATGGTCCTTTCGATGAGGTATTGAAATGAATAAGAGGGAATTGTTTCTATTTTATACAAATTGCTATAGATGTCGTGCACCACAAATAACTTGTTTACACGAGTAAAACAACCCTCCACTTTCGATTGGCTAAGCTGCCAGGACTGGGGTGCTTTTCTTTAAAAATCAACCAGGGCTTGCACCTGACCGCAACTTC
TTATTCACGCCTTCGATGGACTTGAACCTTGGTGTGTGGTTTTTCAACCATGGTTATGCCAGCAATGTTAGGGCACTTGCAGCCATTTTATAATTTCATGGATGGAGTGAGGTTGTTGTGAATTTTTCAAATTGATCACTACAATTGGGATGGAGAATGCTATTTTATTGTTGAGTTACTAGCATAGACCGGGCCCTTCA
TATTTTTACAACATATATTTTCTCAAATAATGGCCACTGCCGAGAGTATTTGGATCCAGTCTTATAGCTTTCGCCTTAC

>TRINITY_DN94034_c0_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:

AAATCGTGGAGCAACTTGAGCATTGTTGGAGGGCGCAGGGGTCCTGAACATTTCTGCCATTACTGCTGCCATATTCTACCGTAGGAAGAGGGCGAGTTCACTACAGGTGTATGTCTCAGCTGTTCGTTTTGTGTGTGCACACTTCTTCTGTCAAATCGTGAAGAGTTGGGAAGCACCAGTCTGGTATTGGAGGACATATT
CTCATCTTCTCTCACAGCTGGGCATTCTTCTCTATTTTTGAATTTGTACTCACCTCCAAACAATCAACAAGGGCACAGATTGAGCTCAGTTTGGGAACCAAGTTAGTGGTTACTCCTGgtgctccggaggggttaatacatttattggttctggcagAGGCCGACGAGAATGAGATACC

Intron 4 GTAATATACA ... GTTCTGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	53.19	11	16	9
A2	39.13	7	6	3
A3	66.67	3	6	6
A4	50	2	1	3
A5	71.43	2	8	2
A6	41.63	34	22.5	26
A7	38.24	21	17	9
A8	42.18	25	17.5	19
A9	41.67	28	21	19
A10	36.47	27	15	16

>TRINITY_DN46176_c0_g5_i3 from sample A7 / Example spliced isoform

CTTGCTCATTGAACCAATGGAATGCAACCACGTTTACTCCTACCGCCATATATTATCATGTTGTAGAAGATACCTGTTGAAGTTTGGTTTTACCATGGAAGACAAAAGTCACTTCAGGTTATTAACTTCGCATTTCTTGTGGCCAAATCGTGGAGCAACTTGAGCATTGTTGGAGGGCGCAGGGTCCTGAACATTTCTGC
CATTACTGCTGCCATATTCTACTGTAGGAAGAGGGCGAGTTCACTACAGGTGTATGTCTCAGCTGTTCGTTTTGTGTGTGCGCACTTCTTCTGTCAAATCGTGAAGAGTTGGGAAGCACGAGTCTGGTGTTGGAGGACATATTCTCATCTTCTCTCACAGCTGGGCATTCTTCTCTATTTTTGAATTTGTACTCACCTCC
AAACAATCAACAAGGGCACAGACTGAGCTCAGTTTGGGCACCAAGTTAGTGGTTACTCCTGAGGCCGACGAGAATGAGATACCCATTGTCCTAACAACGAGATGGGTCTGCCTTATTCATCTGGAACGACCAGGCTTCCTAAGGGTGTTATGCTCACGCACAAGGGCCTTTTTTGGCTGCTTACTTCTTTAGGTTTTAGC
CGACAGCTCTTGTTCAATTGTTCGCAGCTGATATACCTCACTAGGTCTCGGTTTGGGAATCGATCCCATCTTCAATTGAAGATTTGACACCTTGTGGAACAAGCATCCAGAGCAGTATAGAAGGTGACTGGTTCACACACAACATAGTTGGATAATGGTGCAAGTCGTGGTCGTATCCAGACAGCCTACAGGGGTGTACT
GTATGTCTTTGTAAAAGTTTACAAGGAGAGCAGCTTACGTGGTCTTTACCATGGAGTAGGTAGGCACTGAGAATTGGTATCTTGGTCTTTTTTGATATGAACACTTTCTCTTACGAATATATGTGTGGGCATTTCTTTGAGATTACCGAATAAGAAAAACCCTAAAGCTGAAGAATAGTTTCCAATCTCTTTGGATTGGT
TCTCTGCTATATTGGCAGTATAACATGTCAGCTTGACATCTTCTTAATGTAAAACATATTTTGCAAGGGTGGTGTTGGTATTTGAAAACTCTTTTAACTTTTAAACCTAAAGTGCTATCATACCTTATTGGATGCTTTTTTCAATAGTTTCCAATCTCTTTGGCTTGGTTCTCTGCTATAGTAGCAGTATAACATTTCAC
CTTGACATCTTCCTAATGTAAAACATATTTTGCAAG

>TRINITY_DN46176_c0_g5_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:

CTTGCTCATTGAACCAATGGAATGCAACCACGTTTACTCCTACCGCCATATATTATCATGTTGTAGAAGATACCTGTTGAAGTTTGGTTTTACCATGGAAGACAAAAGTCACTTCAGGTTATTAACTTCGCATTTCTTGTGGCCAAATCGTGGAGCAACTTGAGCATTGTTGGAGGGCGCAGGGTCCTGAACATTTCTGC
CATTACTGCTGCCATATTCTACTGTAGGAAGAGGGCGAGTTCACTACAGGTGTATGTCTCAGCTGTTCGTTTTGTGTGTGCGCACTTCTTCTGTCAAATCGTGAAGAGTTGGGAAGCACGAGTCTGGTGTTGGAGGACATATTCTCATCTTCTCTCACAGCTGGGCATTCTTCTCTATTTTTGAATTTGTACTCACCTCC
AAACAATCAACAAGGGCACAGACTGAGCTCAGTTTGGGCACCAAGTTAGTGGTTACTCCTGgtaatatacatctgctgttatgactggtatgaatttacagtaagttatgtatgtgtaagaacaattttgtggtcttaatagcaactatagagctcctgagtgccttgcactactggagctttggactctagcttgagga
ttttggattgtttaacactctacaatatacatattttggatttgtttgttacgatctcaacatcccagttcaggttattagaattgatgcaggtgctccggaggggttaatacatttattggttctggcagAGGCCGACGAGAATGAGATACCCATTGTCCTAACAACGAGATGGGTCTGCCTTATTCATCTGGAACGAC
CAGGCTTCCTAAGGGTGTTATGCTCACGCACAAGGGCCTTTTTTGGCTGCTTACTTCTTTAGGTTTTAGCCGACAGCTCTTGTTCAATTGTTCGCAGCTGATATACCTCACTAGGTCTCGGTTTGGGAATCGATCCCATCTTCAATTGAAGATTTGACACCTTGTGGAACAAGCATCCAGAGCAGTATAGAAGGTGACTG
GTTCACACACAACATAGTTGGATAATGGTGCAAGTCGTGGTCGTATCCAGACAGCCTACAGGGGTGTACTGTATGTCTTTGTAAAAGTTTACAAGGAGAGCAGCTTACGTGGTCTTTACCATGGAGTAGGTAGGCACTGAGAATTGGTATCTTGGTCTTTTTTGATATGAACACTTTCTCTTACGAATATATGTGTGGGC
ATTTCTTTGAGATTACCGAATAAGAAAAACCCTAAAGCTGAAGAATAGTTTCCAATCTCTTTGGATTGGTTCTCTGCTATATTGGCAGTATAACATGTCAGCTTGACATCTTCTTAATGTAAAACATATTTTGCAAGGGTGGTGTTGGTATTTGAAAACTCTTTTAACTTTTAAACCTAAAGTGCTATCATACCTTATTG
GATGCTTTTTTCAATAGTTTCCAATCTCTTTGGCTTGGTTCTCTGCTATAGTAGCAGTATAACATTTCACCTTGACATCTTCCTAATGTAAAACATATTTTGCAAG

Intron 5 GTAATATACA ... GTTCTGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	41.95	11	9	7
A2	33.33	7	5	2
A3	57.14	3	5	3
A4	42.86	2	1	2
A5	50	2	2	2
A6	35.51	34	15	22.5
A7	33.75	21	14	7.5
A8	35.86	25	12.5	15.5
A9	35.57	29	14	18
A10	36.73	28	16.5	16

>TRINITY_DN46176_c0_g5_i3 from sample A7 / Example spliced isoform

CTTGCTCATTGAACCAATGGAATGCAACCACGTTTACTCCTACCGCCATATATTATCATGTTGTAGAAGATACCTGTTGAAGTTTGGTTTTACCATGGAAGACAAAAGTCACTTCAGGTTATTAACTTCGCATTTCTTGTGGCCAAATCGTGGAGCAACTTGAGCATTGTTGGAGGGCGCAGGGTCCTGAACATTTCTGC
CATTACTGCTGCCATATTCTACTGTAGGAAGAGGGCGAGTTCACTACAGGTGTATGTCTCAGCTGTTCGTTTTGTGTGTGCGCACTTCTTCTGTCAAATCGTGAAGAGTTGGGAAGCACGAGTCTGGTGTTGGAGGACATATTCTCATCTTCTCTCACAGCTGGGCATTCTTCTCTATTTTTGAATTTGTACTCACCTCC
AAACAATCAACAAGGGCACAGACTGAGCTCAGTTTGGGCACCAAGTTAGTGGTTACTCCTGAGGCCGACGAGAATGAGATACCCATTGTCCTAACAACGAGATGGGTCTGCCTTATTCATCTGGAACGACCAGGCTTCCTAAGGGTGTTATGCTCACGCACAAGGGCCTTTTTTGGCTGCTTACTTCTTTAGGTTTTAGC
CGACAGCTCTTGTTCAATTGTTCGCAGCTGATATACCTCACTAGGTCTCGGTTTGGGAATCGATCCCATCTTCAATTGAAGATTTGACACCTTGTGGAACAAGCATCCAGAGCAGTATAGAAGGTGACTGGTTCACACACAACATAGTTGGATAATGGTGCAAGTCGTGGTCGTATCCAGACAGCCTACAGGGGTGTACT
GTATGTCTTTGTAAAAGTTTACAAGGAGAGCAGCTTACGTGGTCTTTACCATGGAGTAGGTAGGCACTGAGAATTGGTATCTTGGTCTTTTTTGATATGAACACTTTCTCTTACGAATATATGTGTGGGCATTTCTTTGAGATTACCGAATAAGAAAAACCCTAAAGCTGAAGAATAGTTTCCAATCTCTTTGGATTGGT
TCTCTGCTATATTGGCAGTATAACATGTCAGCTTGACATCTTCTTAATGTAAAACATATTTTGCAAGGGTGGTGTTGGTATTTGAAAACTCTTTTAACTTTTAAACCTAAAGTGCTATCATACCTTATTGGATGCTTTTTTCAATAGTTTCCAATCTCTTTGGCTTGGTTCTCTGCTATAGTAGCAGTATAACATTTCAC
CTTGACATCTTCCTAATGTAAAACATATTTTGCAAG

>TRINITY_DN46176_c0_g5_i5 from sample A7 / Example unspliced isoform:

CTTGCTCATTGAACCAATGGAATGCAACCACGTTTACTCCTACCGCCATATATTATCATGTTGTAGAAGATACCTGTTGAAGTTTGGTTTTACCATGGAAGACAAAAGTCACTTCAGGTTATTAACTTCGCATTTCTTGTGGCCAAATCGTGGAGCAACTTGAGCATTGTTGGAGGGCGCAGGGTCCTGAACATTTCTGC
CATTACTGCTGCCATATTCTACTGTAGGAAGAGGGCGAGTTCACTACAGGTGTATGTCTCAGCTGTTCGTTTTGTGTGTGCGCACTTCTTCTGTCAAATCGTGAAGAGTTGGGAAGCACGAGTCTGGTGTTGGAGGACATATTCTCATCTTCTCTCACAGCTGGGCGTTCTTCTCTATTTATGAATTTGTACTCACCTCC
AAATAGTCAACAAGGGCACAAACTAAGCTCAGTTTGGGCACCAAGTTAGTGGTTACTCCTGgtaatatacatctgctgttatgactggtgctccggaggggttaatacatttattggttctggcagAGGCCGACGAGAATGAGATACCCATTGTCCTAACAACGAGATGGGTCTGCCTTATTCATCTGGAACGACCAGGC
TTCCTAAGGGTGTTATGCTCACGCACAAGGGCCCTTTTTGGCTTCTTACTTCTTTAGGTTTTAGCCGACAGCTCTTGTTCAATTGTTCGCAGCTGATATACCTCACTAGGTCTCGGTTTGGGAATCGATCCCATCTTCAATTGAAGATTTGACACCTTGTGGAACAAGCATCCAGAGCAGTATAGAAGGTGACTGGTTCA
CACACAACATAGTTGGATAATGGTGCAAGTCGTGGTCGTATCCAGACAGCCTACAGGGGTGTACTGTATGTCTTTGTAAAAGTTTACAAGGAGAGCAGCTTACGTGGTCTTTACCATGGAGTAGGTAGGCACTGAGAATTGGTATCTTGGTCTTTTTTGATATGAACACTTTCTCTTACGAATATATGTGTGGGCATTTC
TTTGAGATTACCGAATAAGAAAAACCCTAAAGCTGAAGAATAGTTTCCAATCTCTTTGGATTGGTTCTCTGCTATATTGGCAGTATAACATGTCAGCTTGACATCTTCTTAATGTAAAACATATTTTGCAAGGGTGGTGTTGGTATTTGAAAACTCTTTTAACTTTTAAACCTAAAGTGCTATCATACCTTATTGGATGC
TTTTTTCAATAGTTTCCAATCTCTTTGGCTTGGTTCTCTGCTATAGTAGCAGTATAACATTTCACCTTGACATCTTCCTAATGTAAAACATATTTTGCAAG