sp|Q9FJI2|MTHD_ARATH ----> 3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase, mitochondrial


Intron 1 GCCATTTATT ... CACTTAACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A125632517
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A421.2139138
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A921.43662016
A1022.92742123



>TRINITY_DN44018_c2_g2_i14 from sample A8 / Example spliced isoform
CATGTACAATAAAAAAATTCGACGAGGAGCAAAAAAACTCGCACCCATACAAATATCGCAGGAGCTGGAAATAGCACCAAAAAACGTCGAAGAACTAGGAGGAGTCGCGCACAACTCTCGATAATTAAAGCCTCAGGATCGAATCCCGTCATTTACAAAAAATACATATTGGGATGGTTGAACCCGAATTTGTACAGAAA
ATAGTTTACCGGGGGTTGATCCTGGCTCAGCAGTTAATGGAGTCTTCTTCCTCTTCATTTGGCGGCTTCAGCAACATGAACCGGAAGAACAGTGTGACCGGAACTACGGTGGTGATCACGGCCATAGCTGGCTTGGCAGTGGCTGCAGCGATCGGCGGAGCTCTGGTTTACTCCAGGAGAGGTCATTTCAGATCTGCTTG
GGCTTGGAGAAGGAAGCATCGTCCTCTTTCACCACAGCAATGGTCACGTGCATTTTCACCTGATGGACGGCTTATTGATGGTGGACTCAAGGTTTTGAAAATAATTCGCAGTGGGGGCATCGACCCAAGTATAAGAGCAGAAGTTTGGCCATTTCTTCTCGGAGTATATGACTTGATGAGTTCCAAGGAAGAAAGGGATC
TTGAAAGAATTCACAAGAGAGAGGAGTATGAGAAATTGAGACAACAGTGTGAGTTTCTGCAAAGTGAACAGGAAAATGATGAGACTAGCAGTGAGGTAATTGATTGCAGCGTAGAAGAAAAGAGACTTGGATCAGAACAAGATAATGCACTTGCTGCATCTTCTAAAGATGTGGGAAGATCCAGTGAATCTATTTTTATA
GAATCAGAAATTACAGATGAAAAGGATTCTAAGTTGTTAGAGCCTTTGCCTACTGGTAACAATTTGCAGAGAACAGATGAAGCCTCTTCGGACTGTGAATCCATTGTTGAAGATGATTCTGTGATGGTCAACTATTCTGTTAGTGATGAGGATAGGCACAGAGAAATTGAGTCCTGTTTGGATGGTGACTTCACAGATGA
ATATAATCTCATTCCAATCGAGTCCTCTGTTACTGCTAGTGATGGACACACACAAGATAGAAAGTCTTCAAACATTGAAGACAAGTATGACAAGATAGAGAACCTGAAGGAAAGGGGTCCTAAGGCATTGGAAGATTTCAGTACATGGCAGAGAATAATTCGTCTTGATGCAGTACGCATGAATGCTGAATGGATCCCAT
ATTCCCCTTCACAGGCAAATGTTTCAGAAGAAGAGGCATTGGTGTTAGGTTGTCATGTTGGATTAAAAAATGATGAGCACTTAGAACCATGTCGTAAGCATCATGCTGCAAGATTAGTTGCAATCCTTGAGACATATGCTCTGTATGATTCTGACATTGGATATTGCCAAGGAATGAGTGATCTTCTGTCTCCTTTTGTT
GCATTGATGGATGATGACTATGAAGCATTTTGGTGCTTTGTCCACTTTATGCACATTGCGCGTGATAATTTCAGATTAGATGAATTGGGTATCCGCAGACAACTGGATATTGTTGCCAAAATTATTAAAGCAAAGGATCCACAATTATATAAACATTTACAGAAACTCCAGGCAGAAGATTGCTTCTTTGTATACAGGAT
GGTGGTGGTGCTTTTTAGGAGAGAGCTCACGTTTGATCAGACTCTCTGTTTGTGGGAGGTCATTTGGGCCAATCAAGCAGCTATTAGGGCAGGTATAGGGAAAGCAGCTTGGAAGAAGGGTAAACAGAGGGCTCCTCCCACTAGTGACTTGTTATTGTATGCTATAGCAGCATCTGTGTTGCAAAAGAGGAAGCTTATAA
TAGAGAAGTATACTGGCGTGGATGACATTCTTAGAGAGTGCAACAACATGGCAGGTCATCTGGATGTTTGGAAACTTCTAGATGATGCTTATGACTTAGTGGCTGCCCTTCATAATAAAATATAATATAATTATTATCTTAGGTCAGATTGTACACTTTCTTAAATGTCATCATGATGAGGAGTAGCTTATGAACCCTAC
CTGTAGTTGCATGCTTCTTTTACAAATATTACTTTCTTTGGTTCTAAGTGATGTTTTTCGGTAACCATTTGCTTGGACAGTCAAACTATCCCGTGACATTTTGACCAAATTATGACTTGTTAGATTAGCTGCAACAACATATAGTTCAAGCTCAGTTTTTTTGAAATATGTACCTCGTTTTGAAAGATTTTATTTTTGGC
AATCCTTGATATAGTTCAATGCGAGGTAGTAAAATATCTCAACTACAAGGCACTATGGCTTATGACTTTTCATCTCTTTTTATGAGATTCTGGATTGTTTCCCACAGGTCTCTAAATTAAGCTAACAGCCTAAGTAGCTTTGCATTGCATCTTGTCAAGCATAACTCTTAAACAATTTCAATTAAATTCTGCAGTTTTTA
AAATACCTTGGGCCTACTTTAAAGAATCCTAGTTTAACATAATCTGCCAGCTGCTTCATTTAATATGTACCTAAAATGATATGTAAATCAGCCTTCAGTGTGTGAAGAATGCATCATAGTGCATTTGAGCATATGGAGCACAATAATTTATGTTGATTGTCTAAGATGGTGAACACTGAGGAATCTATTCTGTTAGTTCC
CATCTCGTAAAAGTGGTAAATTGTATTTCCTCAAAAAGTGAGTCAGAGTGAATATCGAAAGTTTCAAGAGTTTTTGAACTACAGCTGTAAGGCTCTTTTTCATTGGTGCTTTTAACAGTGCTAGTTAAGTAACTATCAGTAAAGGCC


>TRINITY_DN44018_c2_g2_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:
CATGTACAATAAAAAAATTCGACGAGGAGCAAAAAAACTCGCACCCATACAAATATCGCAGGAGCTGGAAATAGCACCAAAAAACGTCGAAGAACTAGGAGGAGTCGCGCACAACTCTCGATAATTAAAGCCTCAGGATCGAATCCCGTCATTTACAAAAAATACATATTGGGATGGTTGAACCCGAATTTGTACAGAAA
ATAGTTTACCGGGGGTTGATCCTGGCTCAGCAGTTAATGGAGTCTTCTTCCTCTTCATTTGGCGGCTTCAGCAACATGAACCGGAAGAACAGTGTGACCGGAACTACGGTGGTGATCACGGCCATAGCTGGCTTGGCAGTGGCTGCAGCGATCGGCGGAGCTCTGGTTTACTCCAGGAGgccatttatttcgtaaatgat
attactagaggagactgaaatgtctatgccccagtatagcttcaaagctggccaggctatacctctaatcacacttaacagAGGTCATTTCAGATCTGCTTGGGCTTGGAGAAGGAAGCATCGTCCTCTTTCACCACAGCAATGGTCACGTGCATTTTCACCTGATGGACGGCTTATTGATGGTGGACTCAAGGTTTTGA
AAATAATTCGCAGTGGGGGCATCGACCCAAGTATAAGAGCAGAAGTTTGGCCATTTCTTCTCGGAGTATATGACTTGATGAGTTCCAAGGAAGAAAGGGATCTTGAAAGAATTCACAAGAGAGAGGAGTATGAGAAATTGAGACAACAGTGTGAGTTTCTGCAAAGTGAACAGGAAAATGATGAGACTAGCAGTGAGGTA
ATTGATTGCAGCGTAGAAGAAAAGAGACTTGGATCAGAACAAGATAATGCACTTGCTGCATCTTCTAAAGATGTGGGAAGATCCAGTGAATCTATTTTTATAGAATCAGAAATTACAGATGAAAAGGATTCTAAGTTGTTAGAGCCTTTGCCTACTGGTAACAATTTGCAGAGAACAGATGAAGCCTCTTCGGACTGTGA
ATCCATTGTTGAAGATGATTCTGTGATGGTCAACTATTCTGTTAGTGATGAGGATAGGCACAGAGAAATTGAGTCCTGTTTGGATGGTGACTTCACAGATGAATATAATCTCATTCCAATCGAGTCCTCTGTTACTGCTAGTGATGGACACACACAAGATAGAAAGTCTTCAAACATTGAAGACAAGTATGACAAGATAG
AGAACCTGAAGGAAAGGGGTCCTAAGGCATTGGAAGATTTCAGTACATGGCAGAGAATAATTCGTCTTGATGCAGTACGCATGAATGCTGAATGGATCCCATATTCCCCTTCACAGGCAAATGTTTCAGAAGAAGAGGCATTGGTGTTAGGTTGTCATGTTGGATTAAAAAATGATGAGCACTTAGAACCATGTCGTAAG
CATCATGCTGCAAGATTAGTTGCAATCCTTGAGACATATGCTCTGTATGATTCTGACATTGGATATTGCCAAGGAATGAGTGATCTTCTGTCTCCTTTTGTTGCATTGATGGATGATGACTATGAAGCATTTTGGTGCTTTGTCCACTTTATGCACATTGCGCGTGATAATTTCAGATTAGATGAATTGGGTATCCGCAG
ACAACTGGATATTGTTGCCAAAATTATTAAAGCAAAGGATCCACAATTATATAAACATTTACAGAAACTCCAGGCAGAAGATTGCTTCTTTGTATACAGGATGGTGGTGGTGCTTTTTAGGAGAGAGCTCACGTTTGATCAGACTCTCTGTTTGTGGGAGGTCATTTGGGCCAATCAAGCAGCTATTAGGGCAGGTATAG
GGAAAGCAGCTTGGAAGAAGGGTAAACAGAGGGCTCCTCCCACTAGTGACTTGTTATTGTATGCTATAGCAGCATCTGTGTTGCAAAAGAGGAAGCTTATAATAGAGAAGTATACTGGCGTGGATGACATTCTTAGAGAGTGCAACAACATGGCAGGTCATCTGGATGTTTGGAAACTTCTAGATGATGCTTATGACTTA
GTGGCTGCCCTTCATAATAAAATATAATATAATTATTATCTTAGGTCAGATTGTACACTTTCTTAAATGTCATCATGATGAGGAGTAGCTTATGAACCCTACCTGTAGTTGCATGCTTCTTTTACAAATATTACTTTCTTTGGTTCTAAGTGATGTTTTTCGGTAACCATTTGCTTGGACAGTCAAACTATCCCGTGACA
TTTTGACCAAATTATGACTTGTTAGATTAGCTGCAACAACATATAGTTCAAGCTCAGTTTTTTTGAAATATGTACCTCGTTTTGAAAGATTTTATTTTTGGCAATCCTTGATATAGTTCAATGCGAGGTAGTAAAATATCTCAACTACAAGGCACTATGGCTTATGACTTTTCATCTCTTTTTATGAGATTCTGGATTGT
TTCCCACAGGTCTCTAAATTAAGCTAACAGCCTAAGTAGCTTTGCATTGCATCTTGTCAAGCATAACTCTTAAACAATTTCAATTAAATTCTGCAGTTTTTAAAATACCTTGGGCCTACTTTAAAGAATCCTAGTTTAACATAATCTGCCAGCTGCTTCATTTAATATGTACCTAAAATGATATGTAAATCAGCCTTCAG
TGTGTGAAGAATGCATCATAGTGCATTTGAGCATATGGAGCACAATAATTTATGTTGATTGTCTAAGATGGTGAACACTGAGGAATCTATTCTGTTAGTTCCCATCTCGTAAAAGTGGTAAATTGTATTTCCTCAAAAAGTGAGTCAGAGTGAATATCGAAAGTTTCAAGAGTTTTTGAACTACAGCTGTAAGGCTCTTT
TTCATTGGTGCTTTTAACAGTGCTAGTTAAGTAACTATCAGTAAAGGCC



Intron 2 GTTTCATTTT ... TATTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A1-1000
A238.46441
A331.581366
A40500
A520402
A615.7956615
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A919.1940514
A1018.921507



>TRINITY_DN44018_c2_g2_i8 from sample A8 / Example spliced isoform
GTCACCGAGAAAAATCTGTTTATTCATTGTGAATCGTTTTTTGATTTCGAAAGGATGCGTTCGATGTTAATGAAAGCATTTCGGAGCACCCCTCTCTGCATCTCATCTTTATTTGCCCCGTCCATCACAGTAACAATTACACGAGCATTTCTCTCGACCTCGTTGAATACCCAGTTAAAGGAAGGGGACACTCTGAGGGT
TGAAAGGGCTTTTAGCCATGAAGAAGTATTGACTTATTCACAGCTTAGCCATGATAGCAACCCCATTCATTTGGACACTTCAAGTGCTCAGAGGGCAGGATTCAAAGACACAGTGGTTCACGGAATGCTCTATGCTGGCCTTTTCCCCAGTCTAATAGCCTCCCACTTCTTGGGATCCTATTTGGATAGTTATATGCAGT
GCAGTTCTACCTGGGTTTTCACTTTCACTACGGAAATCGGAAGAATATGACGAAACCATATTCTCTGGTGAAAAATAGGTGGACTTCCTAGTCCTTGAACACATTGATGCAATAGAACTGGGGCATAGCAACGATACCTTGCCATGGTTACAGCACGGAAGGATGACAAATTACATAGTTGAAATGAGAAGCAAGGGACT
GCATTCCCACACCAAGCTTAGTATTGCCGAGGCAGTAACCTTGATGGCTTGCATAATTTTTTCCAAGCCAGGAGCTATTTATGTATCTCAAACATTGCAGTTTAAAGCTCCTGTTTGCATTGGAGATAAACTACTCACTGAAGTGCAGGCACTAGAACTCAGGGAGTACAGGAAAAAATACAGAGTGAAGTTTGCAACAA
AATGCTTTAAGAAGGAAGGGATGCTCCTTGTCCTTGATGGTGAAGCTGTAGCATTGTTGCCCAGTTTATAATACAGTGTATGAAATCGATTACCAAACTGCATTATGCTGGGGATTGAAGTTGGCGTGATCTTGTGGATTTCTTCATTAAGAAAGGGAAAATATGATTATTTGTGCCACTTCATTTAATTTTTTGCAGAC
ATCTAATAGAATCCTCGTATGCAATTATTTTTTACTTTAATAAACGTGCAATTGTTATTGACAGTATATAGACAATTGTTCTCAAGTTTCCACCATATATATGCTGTAAAAACAAGCATGTAAATGCTTATTTGTGGAAGAATTTTCAAGAAGGGGGTTCAACGCAGTGCTAACAGCTTGAATCCGCTGTCTGAGATCTT
TGACCAAAACTGATCAGAATTGATTGTTGACTTTCGCCTAGAGGCTGAGTCAACACCTGATATTGCCTAACTCGTCTGAGTCAACCTTTGAGATGGCCAAGTCACCAAAACATTGACTTGACTAAGTCTGCATCTGCTGACATGGATGCTTAGTTGGGGCAAGTATGAAAAATAATGAAAATAAAAGGACCCTAAGCTCT
CGAAAACCTAAGATCAATATGGTTTTCATGTTAATGCTTAGCTTATAATGTTAATTCCTAAAGTCGATGTGACTTGAATTTTAAATGACATACATTTTAACAATAGAAGTTAAATTAAAA


>TRINITY_DN44018_c2_g2_i16 from sample A8 / Example unspliced isoform:
TGTGTATGTTTAGCCAGGAGCTATTTATGTATCTCAAACATTGCAGTTTAAAGCTCCTGTTTGCATTGGAGATAAACTACTCACTGAAGTGCAGGCACTAGAACTCAGGGAGTACAGGAAAAAATACAGgtttcatttttgaattctctctctctctctcactctctctccaggtatagatgaataaatgaatgaagata
ttgtcttattgtttaactaatgtctgtgaaagtaaataaatgagactatatgttagagaaatcagttataaagactttccatcttgattcaactaagaatgtctctgtattttgcagAGTGAAGTTTGCAACAAAATGCTTTAAGAAGGAAGGGATGCTCCTTGTCCTTGATGGTGAAGCTGTAGCATTGTTGCCCAGTT
TATAATACAGTGTATGAAATCGATTACCAAACTGCATTATGCTGGGGATTGAAGTTGGCGTGATCTTGTGGATTTCTTCATTAAGAAAGGGAAAATATGATTATTTGTGCCACTTCATTTAATTTTTTGCAGACATCTAATAGAATCCTCGTATGCAATTATTTTTTACTTTAATAAACGTGCAATTGTTATTGACAGTA
TATAGACAATTGTTCTCAAGTTTCCACCATATATATGCTGTAAAAACAAGCATGTAAATGCTTATTTGTGGAAGAATTTTCAAGAAGGGGGTTCAACGCAGTGCTAACAGCTTGAATCCGCTGTCTGAGATCTTTGACCAAAACTGATCAGAATTGATTGTTGACTTTCGCCTAGAGGCTGAGTCAACACCTGATATTGC
CTAACTCGTCTGAGTCAACCTTTGAGATGGCCAAGTCACCAAAACATTGACTTGACTAAGTCTGCATCTGCTGACATGGATGCTTAGTTGGGGCAAGTATGAAAAATAATGAAAATAAAAGGACCCTAAGCTCTCGAAAACCTAAGATCAATATGGTTTTCATGTTAATGCTTAGCTTATAATGTTAATTCCTAAAGTCG
ATGTGACTTGAATTTTAAATGACATACATTTTAACAATAGAAGTTAAATTAAAA