sp|P54774|CDC48_SOYBN ----> Cell division cycle protein 48 homolog


Intron 1 GTATGAACTT ... ATTGGTGCAG

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A812.9413911.729.7
A914.9228845.355.7
A1015.7826333.365.3



>TRINITY_DN110722_c0_g2_i7 from sample A2 / Example spliced isoform
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AAAGAATTTTGCTCGCAGATTAGACGTTCTTCGAATCACAAGCATTTGTGAAACCATGACGGACAAGGGAGAGTCTTCAGAGCCGAAGGGAATCAAGAGGGATTACAGCACTGCTATTTTGGAGCGGAAGAAGGCTGCTAATCGTCTTGTTGTCGATGAAGCCATCAACGACGATAATTCTGTGGTCTGTCTGCATCCAG
ATACCATGGAAAAATTACAGCTGTTCCGCGGAGATACAATTCTCATCAAGGGAAAGAAGAGAAAGGATACGATTTGTATTGCTCTTGCCGATGAGACGTGCGAAGAGCCCAGGATTAGAATGAACAAGGTCGTGCGTTCGAATCTGAGGGTTCGGCTCGGTGATGTTGTTTCGGTTCACCAGTGCCCCGATGTAAAGTAC
GGCAAGCGTGTGCATATCCTGCCTATTGATGATAGCATCGAGGGCGTTACTGGGAATTTATTCGATGCTTATTTAAAGCCCTATTTCATGGAGGCCTATCGCCCAGTAAGGAAAGGAGACCTTTTCCTGGTTAGAGGTGGAATGCGCAGTGTAGAGTTCAAAGTAATTGAGACAGACCCTGGGGAATATTGTGTTGTTTC
TCCTGATACCGAGATCTTTTGTGAGGGAGAGCCTGTAAAGCGGGAGGATGAAGATAGATTGGATGAAATTGGTTATGACGATGTTGGTGGTGTAAGGAGGCAGATGGCCCAGATTCGTGAATTAGTTGAGCTTCCACTTAGGCACCCACAGCTCTTCAAATCAATTGGTGTGAAGCCACCAAAGGGTATTTTGCTCTTTG
GACCACCTGGTTCTGGAAAAACCTTAATTGCCAGGGCAGTAGCCAATGAAACTGGTGCCTTCTTTTTCTTAATTAATGGGCCTGAAATTATGTCAAAGTTGGCTGGAGAAAGTGAAAGCAATCTTAGGAAGGCGTTCGAGGAGGCTGAGAAGAATGCCCCATCGATTATTTTTATTGATGAAATTGATTCAATAGCACCC
AAAAGAGAAAAGACACATGGTGAGGTTGAGAGGCGAATTGTTTCTCAGCTTCTGACACTGATGGATGGGCTAAAATCTCGAGCCCATGTTATTGTGATGGGTGCAACAAACCGGCCAAATAGTATTGACCCAGCTCTTAGAAGGTTTGGAAGGTTTGACAGGGAAATTGATATTGGTGTTCCTGATGAAGTGGGACGGCT
GGAGGTCCTTCGTATCCATACAAAGAATATGAAGCTTTCTGAAGATGTTGATCTTGAACGAATTGCAAAGGATACACACGGATATGTTGGAGCTGATCTTGCAGCTCTTTGCACCGAGGCTGCGCTACAGTGCATTAGGGAAAAAATGGATGTTATTGACTTAGAAGACGAGACGATCGATGCTGAAATTCTTAATTCAA
TGGCTGTTACCAATGAGCACTTCCATACTGCGTTGGGCTCCAGTAACCCATCTGCACTGCGTGAAACTGTTGTTGAGGTGCCCAATGTTTCCTGGGAGGACATTGGTGGCTTGGAAAATGTCAAGAGGGAGCTTCAAGAGACTGTACAATATCCAGTGGAGCACCCTGAGAAATTTGAGAAGTTTGGCATGTCTCCTTCA
AAAGGAGTGCTCTTTTATGGGCCACCTGGTTGTGGGAAGACTCTGCTTGCAAAAGCCATTGCTAATGAGTGCCAGGCCAATTTCATCAGTGTAAAAGGCCCAGAACTATTAACAATGTGGTTTGGAGAGAGTGAGGCTAATGTTCGAGAGATCTTCGACAAAGCTCGACAGTCAGCGCCATGTGTCTTGTTCTTTGATGA
ACTTGATTCTATTGCTACACAGCGTGGGAGTAGTGTCGGCGATGCAGGTGGTGCTGCGGATAGAGTTCTCAATCAGTTGCTAACAGAG


>TRINITY_DN110722_c0_g2_i4 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CCAATACGTTCAATTAGAAAAAGGAAAAGTATTTATCGACTACACTTTTGCTTTACTTCCTCTTCACGGAAAGTGCCTTGCATTAACCTCGCTAACATGAACTGACCTAGAACCACATATAGTTAAAGAGCAGAGAGAACCTCTATAAATATCCGCCCAACCTGTTAAGGTATTTCATTCTGTTCTTTATTTGCTCACAG
AAAGAATTTTGCTCGCAGATTAGACGTTCTTCGAATCACAAGCATTTGTGAAACCATGACGGACAAGGGAGAGTCTTCAGAGCCGAAGGGAATCAAGAGGGATTACAGCACTGCTATTTTGGAGCGGAAGAAGGCTGCTAATCGTCTTGTTGTCGATGAAGCCATCAACGACGATAATTCTGTGGTCTGTCTGCATCCAG
ATACCATGGAAAAATTACAGCTGTTCCGCGGAGATACAATTCTCATCAAGGGAAAGAAGAGAAAGGATACGATTTGTATTGCTCTTGCCGATGAGACGTGCGAAGAGCCCAGGATTAGAATGAACAAGGTCGTGCGTTCGAATCTGAGGGTTCGGCTCGGTGATGTTGTTTCGGTTCACCAGTGCCCCGATGTAAAGTAC
GGCAAGCGTGTGCATATCCTGCCTATTGATGATAGCATCGAGGGCGTTACTGGGAATTTATTCGATGCTTATTTAAAGCCCTATTTCATGGAGGCCTATCGCCCAGTAAGGAAAGGAGACCTTTTCCTGGTTAGAGGTGGAATGCGCAGTGTAGAGTTCAAAGTAATTGAGACAGACCCTGGGGAATATTGTGTTGTTTC
TCCTGATACCGAGATCTTTTGTGAGGGAGAGCCTGTAAAGCGGGAGGATGAAGATAGATTGGATGAAATTGGTTATGACGATGTTGGTGGTGTAAGGAGGCAGATGGCCCAGATTCGTGAATTAGTTGAGCTTCCACTTAGGCACCCACAGCTCTTCAAATCAATTGGTGTGAAGCCACCAAAGGGTATTTTGCTCTTTG
GACCACCTGGTTCTGGAAAAACCTTAATTGCTAGGGCAGTTGCCAATGAAACTGGTGCTTTCTTTTTCTTAATTAATGGGCCTGAAATTATGTCAAAGTTGGCTGGAGAAAGTGAAAGCAATCTAAGGAAAGCATTCGAGGAGGCTGAGAAGAATGCCCCATCGATTATTTTTATTGATGAAATTGATTCAATAGCACCC
AAAAGAGAAAAGACACATGGTGAGGTTGAGAGGCGAATTGTTTCTCAGCTTCTGACACTGATGGATGGGCTAAAATCTCGAGCCCATGTTATTGTGATTGGAGCAACAAACCGGCCAAATAGTATCGACCCAGCCCTTAGAAGGTTTGGAAGGTTTGACAGGGAAATCGATATTGGGGTTCCTGATGAAGTGGGACGGCT
GGAGGTCCTTCGTATCCATACAAAGAATATGAAGCTTTCTGAAGATgtatgaactttactgctttgtgaattttctctcttcatgtttttccaggcaattcgtttgtattttgattttatatatcatgtttttgaccattggtgcagGTTGATCTTGAACGAATTGCAAAGGATACACACGGATATGTTGGAGCTGATCT
TGCAGCTCTTTGCACCGAGGCTGCGCTACAGTGCATTAGGGAAAAAATGGATGTTATTGACTTAGAAGACGAGACGATCGATGCTGAAATTCTTAATTCAATGGCTGTTACCAATGAGCACTTCCATACTGCGTTGGGCTCCAGTAACCCATCTGCACTGCGTGAAACTGTTGTTGAGGTGCCCAATGTTTCCTGGGAGG
ACATTGGTGGCTTGGAAAATGTCAAGAGGGAGCTTCAAGAGACTGTACAATATCCAGTGGAGCACCCTGAGAAATTTGAGAAGTTTGGCATGTCTCCTTCAAAAGGAGTGCTCTTTTATGGGCCACCTGGTTGTGGGAAGACTCTGCTTGCAAAAGCCATTGCTAATGAGTGCCAGGCCAATTTCATCAGTGTAAAAGGC
CCAGAACTATTAACAATGTGGTTTGGAGAGAGTGAGGCTAATGTTCGAGAGATCTTCGACAAAGCTCGACAGTCAGCGCCATGTGTCTTGTTCTTTGATGAACTTGATTCTATTGCTACACAGCGTGGGAGTAGTGTCGGCGATGCAGGTGGTGCTGCGGATAGAGTTCTCAATCAGTTGCTAACAGAG




Intron 2 GTTAGTAATA ... TATGATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A113.27851610
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A81935810365
A918.543479959
A1017.32085730



>TRINITY_DN45882_c0_g2_i1 from sample A8 / Example spliced isoform
CCTCGCTAACATGAACTGACCTAGAACCACATATAGTTAAAGAGCAGAGAGAACCTCTATAAATATCCGCCCAACCTGTTAAGGTATTTCATTCTGTTCTTTATTTGCTCACAGAAAGAATTTTGCTCGCAGATTAGACGTTCTTCGAATCACAAGCATTTGTGAAACCATGACGGACAAGGGAGAGTCTTCAGAGCCGA
AGGGAATCAAGAGGGATTACAGCACTGCTATTTTGGAGCGGAAGAAGGCTGCTAATCGTCTTGTTGTCGATGAAGCCATCAACGACGATAATTCTGTGGTCTGTCTGCATCCAGATACCATGGAAAAATTACAGCTGTTCCGCGGAGATACAATTCTCATCAAGGGAAAGAAGAGAAAGGATACGATTTGTATTGCTCTT
GCCGATGAGACGTGCGAAGAGCCCAGGATTAGAATGAACAAGGTCGTGCGTTCGAATCTGAGGGTTCGGCTCGGTGATGTTGTTTCGGTTCACCAGTGCCCCGATGTAAAGTACGGCAAGCGTGTGCATATCCTGCCTATTGATGATAGCATCGAGGGCGTTACTGGGAATTTATTCGATGCTTATTTAAAGCCCTATTT
CATGGAGGCCTATCGCCCAGTAAGGAAAGGAGACCTTTTCCTGGTTAGAGGTGGAATGCGCAGTGTAGAGTTCAAAGTAATTGAGACAGACCCTGGGGAATATTGTGTTGTTTCTCCTGATACCGAGATCTTTTGTGAGGGAGAGCCTGTAAAGCGGGAGGATGAAGATAGATTGGATGAAATTGGTTATGACGATGTTG
GTGGTGTAAGGAGGCAGATGGCCCAGATTCGTGAATTAGTTGAGCTTCCACTTAGGCACCCACAGCTCTTCAAATCAATTGGTGTGAAGCCACCAAAGGGTATTTTGCTCTTTGGACCACCTGGTTCTGGAAAAACCTTAATTGCCAGGGCAGTAGCCAATGAAACTGGTGCCTTCTTTTTCTTAATTAATGGGCCTGAA
ATTATGTCAAAGTTGGCTGGAGAAAGTGAAAGCAATCTTAGGAAGGCGTTCGAGGAGGCTGAGAAGAATGCCCCATCGATTATTTTTATTGATGAAATTGATTCAATAGCACCCAAAAGAGAAAAGACACATGGTGAGGTTGAGAGGCGAATTGTTTCTCAGCTTCTGACACTGATGGATGGGCTAAAATCTCGAGCCCA
TGTTATTGTGATGGGTGCAACAAACCGGCCAAATAGTATTGACCCAGCTCTTAGAAGGTTTGGAAGGTTTGACAGGGAAATTGATATTGGTGTTCCTGATGAAGTGGGACGGCTGGAGGTCCTTCGTATCCATACAAAGAATATGAAGCTTTCTGAAGATGTTGATCTTGAACGAATTGCAAAGGATACACACGGATATG
TTGGAGCTGATCTTGCAGCTCTTTGCACCGAGGCTGCGCTACAGTGCATTAGGGAAAAAATGGATGTTATTGACTTAGAAGACGAGACGATCGATGCTGAAATTCTTAATTCAATGGCTGTTACCAATGAGCACTTCCAGACTGCGTTGGGCTCCAGTAACCCATCTGCCCTGCGTGAAACTGTTGTTGAGGTGCCCAAT
GTTTCTTGGGAGGACATTGGTGGTTTGGAAAATGTCAAGAGGGAGCTTCAAGAGACTGTACAATATCCAGTGGAGCACCCTGAGAAATTTGAGAAGTTTGGCATGTCTCCTTCAAAAGGAGTGCTCTTTTATGGGCCACCTGGTTGTGGGAAGACTCTGCTTGCAAAAGCCATTGCTAATGAGTGCCAGGCCAATTTCAT
CAGTGTAAAAGGCCCAGAACTATTAACAATGTGGTTTGGAGAAAGTGAGGCTAATGTTCGAGAGATCTTCGACAAAGCTCGACAGTCAGCGCCATGTGTCTTGTTCTTTGATGAACTTGATTCTATTGCTACACAGCGTGGGAGTAGTGTCGGCGATGCAGGTGGTGCTGCGGATAGAGTTCTCAATCAGTTGCTAACAG
AGATGGATGGAATGTCAGCCAAGAAAACTGTTTTCATTATTGGGGCTACAAATAGGCCAGATATCCTTGATTCTGCGTTGCTAAGGCCTGGTCGTCTTGACCAGTTAATTTACATACCATTACCCGATGAGAGTTCACGCCATCAAATTTTTAAATCTTGCTTGAGAAAGTCACCGGTTTCTAAGGATGTTGATCTGCTT
GCTTTAGCCCGTTATACCCAAGGGTTTAGTGGAGCTGATATTACAGAAATTTGTCAGCGGGCTTGCAAATATGCCATCCGAGAAAACATCGAGCAGGATATTGAACGTGAAAGGAAGATAAAAGAAAACCCTGAAGCAATGGAAGAGGATGATTCTGAAGAGGTCGCTGAAATAAAAGCGGCTCACTTTGAGGAGTCCAT
GAAATATGCCCGAAGAAGTGTCAGTGATGCTGATATTAGAAAATATCAAGCATTTGCACAGACGCTTCAGCAGTCTCGAGGTTTTGGTTCCGAATTCCGATTTGCAGACAGGCCAGCTAGTACAACGGCTGCGGCTTCAGATCCTTTTACTACAGCAGATACTAAAGAAGACGATGACTTGTATAGCTGATAGGTTTTGT
AGCGTTCACATTGCCTGATTAAAGTGGACAGATTTATCTTCTTCTGGGCGACTAAAGCCTATTTCCTGATACACTGAAAATAATTTATTTAGGTTACTCTAGAGAAAGAGAATATTGTTCACAAGGGTAGTCAATGCTATGGAAATCTGTTTTTTTCTTTGACGTGTAGAATTTTGTCTTGATATTAACTCTTTTTCCTT
GATATTAACTATCACAGGCACTTAATTTGTGTGGTTGGTACGTGTTCCTGGTTGAAGCTTGTTTTCTGCAGATCTTATTTTGTTTTCATGCTCATGCCTAACCCTTCATTTCCATATACATTTCCACATACACGTACTTTCCGAGTTGATTTTCTGTTCTATTCAACAGCAATTGAACGGATATTGACAGCCTTTTAGCC
AGTCATACTTTCCGTGTTGATTTTTTTTTCTATTCAACAGCAATTGAACGGATATTGACAGCCTTTTAGCCAGTCATACTTTCCGTGTTGATTTTTTTTTCTATTCAACAGCAATTGAACG


>TRINITY_DN45882_c0_g2_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:
CCTCGCTAACATGAACTGACCTAGAACCACATATAGTTAAAGAGCAGAGAGAACCTCTATAAATATCCGCCCAACCTGTTAAGGTATTTCATTCTGTTCTTTATTTGCTCACAGAAAGAATTTTGCTCGCAGATTAGACGTTCTTCGAATCACAAGCATTTGTGAAACCATGACGGACAAGGGAGAGTCTTCAGAGCCGA
AGGGAATCAAGAGGGATTACAGCACTGCTATTTTGGAGCGGAAGAAGGCTGCTAATCGTCTTGTTGTCGATGAAGCCATCAACGACGATAATTCTGTGGTCTGTCTGCATCCAGATACCATGGAAAAATTACAGCTGTTCCGCGGAGATACAATTCTCATCAAGGGAAAGAAGAGAAAGGATACGATTTGTATTGCTCTT
GCCGATGAGACGTGCGAAGAGCCCAGGATTAGAATGAACAAGGTCGTGCGTTCGAATCTGAGGGTTCGGCTCGGTGATGTTGTTTCGGTTCACCAGTGCCCCGATGTAAAGTACGGCAAGCGTGTGCATATCCTGCCTATTGATGATAGCATCGAGGGCGTTACTGGGAATTTATTCGATGCTTATTTAAAGCCCTATTT
CATGGAGGCCTATCGCCCAGTAAGGAAAGGAGACCTTTTCCTGGTTAGAGGTGGAATGCGCAGTGTAGAGTTCAAAGTAATTGAGACAGACCCTGGGGAATATTGTGTTGTTTCTCCTGATACCGAGATCTTTTGTGAGGGAGAGCCTGTAAAGCGGGAGGATGAAGATAGATTGGATGAAATTGGTTATGACGATGTTG
GTGGTGTAAGGAGGCAGATGGCCCAGATTCGTGAATTAGTTGAGCTTCCACTTAGGCACCCACAGCTCTTCAAATCAATTGGTGTGAAGCCACCAAAGGGTATTTTGCTCTTTGGACCACCTGGTTCTGGAAAAACCTTAATTGCCAGGGCAGTAGCCAATGAAACTGGTGCCTTCTTTTTCTTAATTAATGGGCCTGAA
ATTATGTCAAAGTTGGCTGGAGAAAGTGAAAGCAATCTTAGGAAGGCGTTCGAGGAGGCTGAGAAGAATGCCCCATCGATTATTTTTATTGATGAAATTGATTCAATAGCACCCAAAAGAGAAAAGACACATGGTGAGGTTGAGAGGCGAATTGTTTCTCAGCTTCTGACACTGATGGATGGGCTAAAATCTCGAGCCCA
TGTTATTGTGATGGGTGCAACAAACCGGCCAAATAGTATTGACCCAGCTCTTAGAAGGTTTGGAAGGTTTGACAGGGAAATTGATATTGGTGTTCCTGATGAAGTGGGACGGCTGGAGGTCCTTCGTATCCATACAAAGAATATGAAGCTTTCTGAAGATGTTGATCTTGAACGAATTGCAAAGGATACACACGGATATG
TTGGAGCTGATCTTGCAGCTCTTTGCACCGAGGCTGCGCTACAGTGCATTAGGGAAAAAATGGATGTTATTGACTTAGAAGACGAGACGATCGATGCTGAAATTCTTAATTCAATGGCTGTTACCAATGAGCACTTCCAGACTGCGTTGGGCTCCAGTAACCCATCTGCCCTGCGTGAAACTGTTGTTGAGGTGCCCAAT
GTTTCTTGGGAGGACATTGGTGGTTTGGAAAATGTCAAGAGGGAGCTTCAAGAGACTGTACAATATCCAGTGGAGCACCCTGAGAAATTTGAGAAGTTTGGCATGTCTCCTTCAAAAGGAGTGCTCTTTTATGGGCCACCTGGTTGTGGGAAGACTCTGCTTGCAAAAGCCATTGCTAATGAGTGCCAGGCCAATTTCAT
CAGTGTAAAAGGCCCAGAACTATTAACAATGTGGTTTGGAGAAAGTGAGGCTAATGTTCGAGAGATCTTCGACAAAGCTCGACAGTCAGCGCCATGTGTCTTGTTCTTTGATGAACTTGATTCTATTGCTACACAGCGTGGGAGTAGTGTCGGCGATGCAGGTGGTGCTGCGGATAGAGTTCTCAATCAGTTGCTAACAG
AGATGGATGGAATGTCAGCCAAGAAAACTGTTTTCATTATTGGGGCTACAAATAGGCCAGATATCCTTGATTCTGCGTTGCTAAGGCCTGGTCGTCTTGACCAGTTAATTTACATACCATTACCCGATGAGAGTTCACGCCATCAAATTTTTAAATCTTGCTTGAGAAAGTCACCGGTTTCTAAGGATGTTGATCTGCTT
GCTTTAGCCCGTTATACCCAAGGGTTTAGTGGAGCTGATATTACAGAAATTTGTCAGCGGGCTTGCAAATATGCCATCCGAGAAAACATCGAGCAGgttagtaatagcatccatgttacattttgtggttggagctccatgggactacctacgtttctgagatatttctagcagacacccaataacttgagctctctcta
aatctgtgttcatatgttacagcctcaaatatcttttttattatgatgcag
GATATTGAACGTGAAAGGAAGATAAAAGAAAACCCTGAAGCAATGGAAGAGGATGATTCTGAAGAGGTCGCTGAAATAAAAGCGGCTCACTTTGAGGAGTCCATGAAATATGCCCGAAGAAGTGTCAGTGATGCTGATATTAGAAAATA
TCAAGCATTTGCACAGACGCTTCAGCAGTCTCGAGGTTTTGGTTCCGAATTCCGATTTGCAGACAGGCCAGCTAGTACAACGGCTGCGGCTTCAGATCCTTTTACTACAGCAGATACTAAAGAAGACGATGACTTGTATAGCTGATAGGTTTTGTAGCGTTCACATTGCCTGATTAAAGTGGACAGATTTATCTTCTTCT
GGGCGACTAAAGCCTATTTCCTGATACACTGAAAATAATTTATTTAGGTTACTCTAGAGAAAGAGAATATTGTTCACAAGGGTAGTCAATGCTATGGAAATCTGTTTTTTTCTTTGACGTGTAGAATTTTGTCTTGATATTAACTCTTTTTCCTTGATATTAACTATCACAGGCACTTAATTTGTGTGGTTGGTACGTGT
TCCTGGTTGAAGCTTGTTTTCTGCAGATCTTATTTTGTTTTCATGCTCATGCCTAACCCTTCATTTCCATATACATTTCCACATACACGTACTTTCCGAGTTGATTTTCTGTTCTATTCAACAGCAATTGAACGGATATTGACAGCCTTTTAGCCAGTCATACTTTCCGTGTTGATTTTTTTTTCTATTCAACAGCAATT
GAACGGATATTGACAGCCTTTTAGCCAGTCATACTTTCCGTGTTGATTTTTTTTTCTATTCAACAGCAATTGAACG