sp|Q9ZU91|E133_ARATH ----> Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3


Intron 1 GTAAGTTGGG ... TGTCTTGCAG

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>TRINITY_DN40488_c0_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoform
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TGCTGTTGCTATTGAATCTCGCGTCGTTCATGGCAGTCGCCCTTGGAGGGTCTTTTGTGGGAGTCAATATCGGCACGGATGTATCGAACATGCCTTCGGCGTCTGCGGTGGTGGCCTTGCTGAAGAGTCAGCAGATAACCCATGTACGCCTGTATGATGCCGACCGCCAGATGCTCACAGCGCTGGCTGATACTGGCATC
GAAGTGATTGTGAGCGTTCCCAACAATCAGATTCTGGGCGTCGGGCAGTCGCGATCGACGGCAGCGAATTGGGTGAACAAAAATGTCGCGGCCTACTTGCCCAATACCAACATCACAGCTATTGCTGTGGGCAGCGAGGTTCTTACAACAATCCCTAACGCTGCCCTCGTCCTGGTTAACGCTATGAGGTTCTTGCATTC
GGCTCTGGTGGCGGCCAATCTTGACGGGCAGGTCAAGGTATCGACTCCCCATGCGGCCGAAATCATCCTGGATTCGTTCCCGCCCTCGCAGGCCTTTTTCAACAGTTCTTGGAATAACGTGATGAAGCCGTTGCTGAGCTTCCTGCGCGACACAAAGTCCTATCTGATGCTCAATGTCTATCCCTATTACGTCTACATGC
AGGGCAATGGTGTCGTGTCGCTAGACTACGCTATCTTCCGACCACTGCCTCCCAACCAGGAGGCCGTTGACCCCAACACGTTGCTCCACTATACCAACGTCTTCGATGCCATGGTCGACGCCGCTTATTACGCCATGTCGTCGCTAAACTTCACCGATATTCCCGTGGTCGTGACGGAGACCGGGTGGCCCTCCATGGGC
GACGCCGACGAGCCCGACGCTACCGTCGACAACGCTGACACTTACAATAGCAATCTCGTCAGGCATGTGCTCAATAGCACCGGAACTCCCAAGCTCCCTGGCGTGGCTATCAACACCTACATCTACGAGCTCTTCAATGAGGACCTCAGGCCTGGCGCGACCTCGGAGAAAAACTGGGGGCTCTTCAATGTCAATGCCAC
GCCCATCTATGTTCTCCATCTCACCGGTGGGGGTTTGACTCTGGCCAACGACACTACTTCCCAGACCTTCTGTGTAGCCGTGTCTGGGGCTAATACTCAACTCCTCCAAGGGGCGTTGGATTGGGCCTGTGGCCCTGGGCAGGCTGATTGCTCTGCTATTCAGGCCGGCCAGAGCTGTTATAATCCCGATACCGTTCAAG
ACCACGCCTCTTATGCCTTCGACAGCTATTACCACAAGATGAACATGGCCTCCGGGTCCTGCGACTTCAATGGAGTTGCTACTATAACCACTACTGATCCAAGTCATGATTCTTGTATTTTCCTGGGCAGTGTTGGTGCAAATGGGACTTCTGTCAATAGTACTGTCTTTGGCAATACGACATTTCCTCTGACTGGGTCA
AATTCCACTTCTGTAAATAATTCTGCACCCCACCTTCATTCACAAGTTCATCCCATACTTTTTCCTCTTGTTGCCCTTCCCATTCTGCTTTGGAATCTGCCAATTTTGTAGGACAAGCAAGATATTATTGATATATCTTTGAAGAGAACAAGGAATGCTTCATTCTTTTCTTTTACAAAGTAAGATGTAAATGCAAAAGC
TGGATATATCTTTGGAGAGGGACAGGCTGTGGAAATGAAAATTTCATCAGCTGTAATTTTGGGGGAGGGAAAGCTAAAAATGTAATTTTTGCAGAGTATAGATTCATTGTTGTAGGTAAAATAGAGGCACCATAGTTTGCCACTATTCATTGATGGATATTCTATATATTTATTATGATCTGTGAACAACAGCTATCGCT
ATCATTGATTGTAAGGATTGGTGAAAATGACATCCTCTCATTTATTTGTTAGTTGTATGTCATTTGCTGACAGGTGAGACTGGGCCTTATTATAAAATTCACTCTTTGATGTATATATCTATGATGTATATAGCTATGGGTGGAAATGATATTCTCCTTCATCCTTTATCTGTTGGTTGTATATTATTTGCTGTTCAGTG
AGAATGGACCTATTATAAAATTGAC


>TRINITY_DN40488_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:
TGAGATCTATGATTTATGTCCTAAGAAAGTTCTGGCTGTGTCTAGCTTCGACTTTCTAGTTTTCGATTCAGTCTTTTGTGTGTGTTCTCTGTGTCTGAGATGGATAGTTGAGTGTTTTTTGATTAGAAGTAGAGTAAAATAAAGCTGATTCGTCTGTGGATTTCGGTAGAAAAGATCCATGAAGACCCTCAGCAGGTTAC
TGCTGTTGCTATTGAATCTCGCGTCGTTCATGGCAGTCGCCCTTGGAGGGTCTTTTGTGGGAGTCAATATCGGCACGGATGTATCGAACATGCCTTCGGCGTCTGCGGTGGTGGCCTTGCTGAAGAGTCAGCAGATAACCCATGTACGCCTGTATGATGCCGACCGCCAGATGCTCACAGCGCTGGCTGATACTGGCATC
GAAGTGATTGTGAGCGTTCCCAACAATCAGATTCTGGGCGTCGGGCAGTCGCGATCGACGGCAGCGAATTGGGTGAACAAAAATGTCGCGGCCTACTTGCCCAATACCAACATCACAGCTATTGCTGTGGGCAGCGAGGTTCTTACAACAATCCCTAACGCTGCCCTCGTCCTGGTTAACGCTATGAGGTTCTTGCATTC
GGCTCTGGTGGCGGCCAATCTTGACGGGCAGGTCAAGGTATCGACTCCCCATGCGGCCGAAATCATCCTGGATTCGTTCCCGCCCTCGCAGGCCTTTTTCAACAGTTCTTGGAATAACGTGATGAAGCCGTTGCTGAGCTTCCTGCGCGACACAAAGTCCTATCTGATGCTCAATGTCTATCCCTATTACGTCTACATGC
AGGGCAATGGTGTCGTGTCGCTAGACTACGCTATCTTCCGACCACTGCCTCCCAACCAGGAGGCCGTTGACCCCAACACGTTGCTCCACTATACCAACGTCTTCGATGCCATGGTCGACGCCGCTTATTACGCCATGTCGTCGCTAAACTTCACCGATATTCCCGTGGTCGTGACGGAGACCGGGTGGCCCTCCATGGGC
GACGCCGACGAGCCCGACGCTACCGTCGACAACGCTGACACTTACAATAGCAATCTCGTCAGGCATGTGCTCAATAGCACCGGAACTCCCAAGCTCCCTGGCGTGGCTATCAACACCTACATCTACGAGCTCTTCAATGAGGACCTCAGGCCTGGCGCGACCTCGGAGAAAAACTGGGGGCTCTTCAATGTCAATGCCAC
GCCCATCTATGTTCTCCATCTCACCGGTGGGGGTTTGACTCTGGCCAACGACACTACTTCCCAGACCTTCTGTGTAGCCGTGTCTGGGGCTAATACTCAACTCCTCCAAGGGGCGTTGGATTGGGCCTGTGGCCCTGGGCAGGCTGATTGCTCTGCTATTCAGGCCGGCCAGAGCTGTTATAATCCCGATACCGTTCAAG
ACCACGCCTCTTATGCCTTCGACAGCTATTACCACAAGATGAACATGGCCTCCGGGTCCTGCGACTTCAATGGAGTTGCTACTATAACCACTACTGATCCAAgtaagttggggatgtttttgtttttgttcttgtattctactcgaattttgcttttaaccgttgcgtcgtctctctattgaaaactgtttgattgttct
ctgctgctgtcgccattgaaaactgtttgatgggttctctgctgttgtcgccattgaaaactgtttgatgggttctctgctgttgtcgctgtgtcttgcag
GTCATGATTCTTGTATTTTCCTGGGCAGGTAAGGGAGCAATACATCAACCTTTCTACATTATTTATTTTTAGACTGCTGACAAGTTAGCATCTATATAT
TACCAAATTCAAGATAACGTGTCTTTTTCTTAGTTTACAGCATCTGTTATATTCATATTCAATGATAGCTTGTGCATCATAACGTATCAGGGTGCCTTTTTAATATTATTTCAAGTATATGTCCAGAAGCCCTCTTTTCTTTTATTGCTCTGTTTTCTTTCCACATGCCCTGTTTCTTGTTCTGTTCCCATTTCGTCTTC
AGTTTCAGGGTTCTTGTGACTTGTTTGTGTTTGTAGTCATTTTCTTGGGTTCTCACAACAGTGAAAACATGCATTGAGCTCTTTGTAGTTTCTTACCACTATAGTAATAGTGACATTCCCATTCTGAGTATTACAATGTAATGCATTGGTCTTATAACACTGGGATAAAGTATATGTTCAGCTGGGATGCCATGGGTAAG
GTATCAATTCAACCAAAACCATCCAAGACTTGCATCTAACCCCAGACTACTTACACAGGTAAAATTCCAACAAAGATTGCAAGTGGAAAATTCCCTATGGGGATTGTGAACCTGACTGCCATCTAACCAAAACCCCGTTGAATTTTTTGTTTTATACTTTTGGTTGGAATCTATTGATGATTTGAATAGGCATGCACGGT
TGCTATATGAGCCATTTTACAAAAGAGCTGCAGAAGTAGATTTCTGCTTTGGCATTATTAGGCATATATGTCCCTATGGATATTGAAGCTTTAATGCCTTGTCTCTAATTAGTGCAGAAGTAGATTTCTGCTTTGGCATTATTAGGCATATATGTCCCTATGGGTATTGAAGCTTTAATGCCTTGACTCTAATTAGTGCT
CAGCATTCATAAATTTATTAGTTATTGTTACTGCAGGATTAGTTATTTGCTCTTTACTAATATATAGATGGACTACAACCAAAACTGGCAGACCTGTTTCTGTGGGAACTGAGCACAGATCATGCAAATCTGATATTTTCGTCTTATTTAGCTATGATCTGCATTCTTTCATCTGTCAGTGCGCTGGCCTTACATTCTCT
CTCAACTTGTAGGATACTTTCCTTCCACACAAATTAGTCTTCTTTATCGTAATGTTTTCTCCCTTGGTAGTCTATTAATATGTATTAGGGCATGTTTTCTCCCTTGGTAGTCTAGTAAAATGTTTTAATGTTTTAGGATAGATATGAGTGCAAAATTTACAGTGACAAATTTCTGTCGGGCTATTCTTCATCTGCATAAC
TGTGTTGTTGCTTGCTGATTTATGGCTATCCTAGCACCTTGGTTAGTGCATATCTCCTAACAAGCCATGGTTATATATTGGGTGCTAATAAGCCATAGATTTGTGCTTGAGCCCTGAGTCTGCCAGGTCAAAATAGGAAAACGTGGAGTTTGTAAAATTCACTTTTCACCTTGTTGCAAATCAGACAACCAGTCACCAAC
TTTCCTCGTTGATGGATCTCCTTTGCAGCCTAACAGATTATTCTTTTTATTATATGACTGGCTTAGCTTTTTAAAAGTCTTGTAGATCAGTTTTGGTATCTCCTTAGAATTTCATAACAATGTAAGAGTTTATTAAGTATTTAATTGCTGACCTGGCATCATGGACTTGTAGATCTGTTCCTCTAAATTTAAATCAAGTG
CATATTAGGTATACAGATAAAGATCTTTATTCCTAAATTGTTGTAATCTGGATTCTGACAGTTTGTCTTGTTTATTGCAGTGTTGGTGCAAATGGGACTTCTGTCAATAGTACTGTCTTTGGCAATACGACATTTCCTCTGACTGGGTCAAATTCCACTTCTGTAAATAATTCTGCACCCCACCTTCATTCACAAGTTCA
TCCCATACTTTTTCCTCTTGTTGCCCTTCCCATTCTGCTTTGGAATCTGCCAATTTTGTAGGACAAGCAAGATATTATTGATATATCTTTGAAGAGAACAAGGAATGCTTCATTCTTTTCTTTTACAAAGTAAGATGTAAATGCAAAAGCTGGATATATCTTTGGAGAGGGACAGGCTGTGGAAATGAAAATTTCATCAG
CTGTAATTTTGGGGGAGGGAAAGCTAAAAATGTAATTTTTGCAGAGTATAGATTCATTGTTGTAGGTAAAATAGAGGCACCATAGTTTGCCACTATTCATTGATGGATATTCTATATATTTATTATGATCTGTGAACAACAGCTATCGCTATCATTGATTGTAAGGATTGGTGAAAATGACATCCTCTCATTTATTTGTT
AGTTGTATGTCATTTGCTGACAGGTGAGACTGGGCCTTATTATAAAATTCACTCTTTGATGTATATATCTATGATGTATATAGCTATGGGTGGAAATGATATTCTCCTTCATCCTTTATCTGTTGGTTGTATATTATTTGCTGTTCAGTGAGAATGGACCTATTATAAAATTGAC




Intron 2 GTAAGGGAGC ... TTTATTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A125.559.322
A2013.720
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A731.07138158
A831.87173.3774
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>TRINITY_DN40488_c0_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoform
TGAGATCTATGATTTATGTCCTAAGAAAGTTCTGGCTGTGTCTAGCTTCGACTTTCTAGTTTTCGATTCAGTCTTTTGTGTGTGTTCTCTGTGTCTGAGATGGATAGTTGAGTGTTTTTTGATTAGAAGTAGAGTAAAATAAAGCTGATTCGTCTGTGGATTTCGGTAGAAAAGATCCATGAAGACCCTCAGCAGGTTAC
TGCTGTTGCTATTGAATCTCGCGTCGTTCATGGCAGTCGCCCTTGGAGGGTCTTTTGTGGGAGTCAATATCGGCACGGATGTATCGAACATGCCTTCGGCGTCTGCGGTGGTGGCCTTGCTGAAGAGTCAGCAGATAACCCATGTACGCCTGTATGATGCCGACCGCCAGATGCTCACAGCGCTGGCTGATACTGGCATC
GAAGTGATTGTGAGCGTTCCCAACAATCAGATTCTGGGCGTCGGGCAGTCGCGATCGACGGCAGCGAATTGGGTGAACAAAAATGTCGCGGCCTACTTGCCCAATACCAACATCACAGCTATTGCTGTGGGCAGCGAGGTTCTTACAACAATCCCTAACGCTGCCCTCGTCCTGGTTAACGCTATGAGGTTCTTGCATTC
GGCTCTGGTGGCGGCCAATCTTGACGGGCAGGTCAAGGTATCGACTCCCCATGCGGCCGAAATCATCCTGGATTCGTTCCCGCCCTCGCAGGCCTTTTTCAACAGTTCTTGGAATAACGTGATGAAGCCGTTGCTGAGCTTCCTGCGCGACACAAAGTCCTATCTGATGCTCAATGTCTATCCCTATTACGTCTACATGC
AGGGCAATGGTGTCGTGTCGCTAGACTACGCTATCTTCCGACCACTGCCTCCCAACCAGGAGGCCGTTGACCCCAACACGTTGCTCCACTATACCAACGTCTTCGATGCCATGGTCGACGCCGCTTATTACGCCATGTCGTCGCTAAACTTCACCGATATTCCCGTGGTCGTGACGGAGACCGGGTGGCCCTCCATGGGC
GACGCCGACGAGCCCGACGCTACCGTCGACAACGCTGACACTTACAATAGCAATCTCGTCAGGCATGTGCTCAATAGCACCGGAACTCCCAAGCTCCCTGGCGTGGCTATCAACACCTACATCTACGAGCTCTTCAATGAGGACCTCAGGCCTGGCGCGACCTCGGAGAAAAACTGGGGGCTCTTCAATGTCAATGCCAC
GCCCATCTATGTTCTCCATCTCACCGGTGGGGGTTTGACTCTGGCCAACGACACTACTTCCCAGACCTTCTGTGTAGCCGTGTCTGGGGCTAATACTCAACTCCTCCAAGGGGCGTTGGATTGGGCCTGTGGCCCTGGGCAGGCTGATTGCTCTGCTATTCAGGCCGGCCAGAGCTGTTATAATCCCGATACCGTTCAAG
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AATTCCACTTCTGTAAATAATTCTGCACCCCACCTTCATTCACAAGTTCATCCCATACTTTTTCCTCTTGTTGCCCTTCCCATTCTGCTTTGGAATCTGCCAATTTTGTAGGACAAGCAAGATATTATTGATATATCTTTGAAGAGAACAAGGAATGCTTCATTCTTTTCTTTTACAAAGTAAGATGTAAATGCAAAAGC
TGGATATATCTTTGGAGAGGGACAGGCTGTGGAAATGAAAATTTCATCAGCTGTAATTTTGGGGGAGGGAAAGCTAAAAATGTAATTTTTGCAGAGTATAGATTCATTGTTGTAGGTAAAATAGAGGCACCATAGTTTGCCACTATTCATTGATGGATATTCTATATATTTATTATGATCTGTGAACAACAGCTATCGCT
ATCATTGATTGTAAGGATTGGTGAAAATGACATCCTCTCATTTATTTGTTAGTTGTATGTCATTTGCTGACAGGTGAGACTGGGCCTTATTATAAAATTCACTCTTTGATGTATATATCTATGATGTATATAGCTATGGGTGGAAATGATATTCTCCTTCATCCTTTATCTGTTGGTTGTATATTATTTGCTGTTCAGTG
AGAATGGACCTATTATAAAATTGAC


>TRINITY_DN40488_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:
TGAGATCTATGATTTATGTCCTAAGAAAGTTCTGGCTGTGTCTAGCTTCGACTTTCTAGTTTTCGATTCAGTCTTTTGTGTGTGTTCTCTGTGTCTGAGATGGATAGTTGAGTGTTTTTTGATTAGAAGTAGAGTAAAATAAAGCTGATTCGTCTGTGGATTTCGGTAGAAAAGATCCATGAAGACCCTCAGCAGGTTAC
TGCTGTTGCTATTGAATCTCGCGTCGTTCATGGCAGTCGCCCTTGGAGGGTCTTTTGTGGGAGTCAATATCGGCACGGATGTATCGAACATGCCTTCGGCGTCTGCGGTGGTGGCCTTGCTGAAGAGTCAGCAGATAACCCATGTACGCCTGTATGATGCCGACCGCCAGATGCTCACAGCGCTGGCTGATACTGGCATC
GAAGTGATTGTGAGCGTTCCCAACAATCAGATTCTGGGCGTCGGGCAGTCGCGATCGACGGCAGCGAATTGGGTGAACAAAAATGTCGCGGCCTACTTGCCCAATACCAACATCACAGCTATTGCTGTGGGCAGCGAGGTTCTTACAACAATCCCTAACGCTGCCCTCGTCCTGGTTAACGCTATGAGGTTCTTGCATTC
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GCCCATCTATGTTCTCCATCTCACCGGTGGGGGTTTGACTCTGGCCAACGACACTACTTCCCAGACCTTCTGTGTAGCCGTGTCTGGGGCTAATACTCAACTCCTCCAAGGGGCGTTGGATTGGGCCTGTGGCCCTGGGCAGGCTGATTGCTCTGCTATTCAGGCCGGCCAGAGCTGTTATAATCCCGATACCGTTCAAG
ACCACGCCTCTTATGCCTTCGACAGCTATTACCACAAGATGAACATGGCCTCCGGGTCCTGCGACTTCAATGGAGTTGCTACTATAACCACTACTGATCCAAGTAAGTTGGGGATGTTTTTGTTTTTGTTCTTGTATTCTACTCGAATTTTGCTTTTAACCGTTGCGTCGTCTCTCTATTGAAAACTGTTTGATTGTTCT
CTGCTGCTGTCGCCATTGAAAACTGTTTGATGGGTTCTCTGCTGTTGTCGCCATTGAAAACTGTTTGATGGGTTCTCTGCTGTTGTCGCTGTGTCTTGCAGGTCATGATTCTTGTATTTTCCTGGGCAGgtaagggagcaatacatcaacctttctacattatttatttttagactgctgacaagttagcatctatatat
taccaaattcaagataacgtgtctttttcttagtttacagcatctgttatattcatattcaatgatagcttgtgcatcataacgtatcagggtgcctttttaatattatttcaagtatatgtccagaagccctcttttcttttattgctctgttttctttccacatgccctgtttcttgttctgttcccatttcgtcttc
agtttcagggttcttgtgacttgtttgtgtttgtagtcattttcttgggttctcacaacagtgaaaacatgcattgagctctttgtagtttcttaccactatagtaatagtgacattcccattctgagtattacaatgtaatgcattggtcttataacactgggataaagtatatgttcagctgggatgccatgggtaag
gtatcaattcaaccaaaaccatccaagacttgcatctaaccccagactacttacacaggtaaaattccaacaaagattgcaagtggaaaattccctatggggattgtgaacctgactgccatctaaccaaaaccccgttgaattttttgttttatacttttggttggaatctattgatgatttgaataggcatgcacggt
tgctatatgagccattttacaaaagagctgcagaagtagatttctgctttggcattattaggcatatatgtccctatggatattgaagctttaatgccttgtctctaattagtgcagaagtagatttctgctttggcattattaggcatatatgtccctatgggtattgaagctttaatgccttgactctaattagtgct
cagcattcataaatttattagttattgttactgcaggattagttatttgctctttactaatatatagatggactacaaccaaaactggcagacctgtttctgtgggaactgagcacagatcatgcaaatctgatattttcgtcttatttagctatgatctgcattctttcatctgtcagtgcgctggccttacattctct
ctcaacttgtaggatactttccttccacacaaattagtcttctttatcgtaatgttttctcccttggtagtctattaatatgtattagggcatgttttctcccttggtagtctagtaaaatgttttaatgttttaggatagatatgagtgcaaaatttacagtgacaaatttctgtcgggctattcttcatctgcataac
tgtgttgttgcttgctgatttatggctatcctagcaccttggttagtgcatatctcctaacaagccatggttatatattgggtgctaataagccatagatttgtgcttgagccctgagtctgccaggtcaaaataggaaaacgtggagtttgtaaaattcacttttcaccttgttgcaaatcagacaaccagtcaccaac
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TGTTGGTGCAAATGGGACTTCTGTCAATAGTACTGTCTTTGGCAATACGACATTTCCTCTGACTGGGTCAAATTCCACTTCTGTAAATAATTCTGCACCCCACCTTCATTCACAAGTTCA
TCCCATACTTTTTCCTCTTGTTGCCCTTCCCATTCTGCTTTGGAATCTGCCAATTTTGTAGGACAAGCAAGATATTATTGATATATCTTTGAAGAGAACAAGGAATGCTTCATTCTTTTCTTTTACAAAGTAAGATGTAAATGCAAAAGCTGGATATATCTTTGGAGAGGGACAGGCTGTGGAAATGAAAATTTCATCAG
CTGTAATTTTGGGGGAGGGAAAGCTAAAAATGTAATTTTTGCAGAGTATAGATTCATTGTTGTAGGTAAAATAGAGGCACCATAGTTTGCCACTATTCATTGATGGATATTCTATATATTTATTATGATCTGTGAACAACAGCTATCGCTATCATTGATTGTAAGGATTGGTGAAAATGACATCCTCTCATTTATTTGTT
AGTTGTATGTCATTTGCTGACAGGTGAGACTGGGCCTTATTATAAAATTCACTCTTTGATGTATATATCTATGATGTATATAGCTATGGGTGGAAATGATATTCTCCTTCATCCTTTATCTGTTGGTTGTATATTATTTGCTGTTCAGTGAGAATGGACCTATTATAAAATTGAC