sp|Q9LNU6|PPR53_ARATH ----> Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g20230


Intron 1 GTAACACTTG ... GGCTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A136.444.53.22
A223.811619
A345.45664
A463.64243
A50100
A642.86161113
A734.6217126
A846.67242022
A941.94181313
A1024.5923411



>TRINITY_DN43051_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoform
GCGATAAAAAGGGAGCAAGAGCCCGATGTTGTTGTATGCAGTGCACTGATAGACATGTATGCAAAATGCGGCAATGTAGGCATTGCTCGCAATGTGTTCAATAAAGTGTCTCATAGGAATGTTGTCTCGTGGAATGCTATGATTGCAGGATATGGAATACATGGTCAGGATGAAGACGCCCTCACTCTCTTTTACGAAAT
GCTAAGTGAAGGTGTTAAGCCAGATCACATCACCTTTATCGCTGTTCTATGTGCATGCACCCATGCAGGTCTGGTGGATGAGGGATTGGAATACTTTGATAGCATGATGAGGGATTATCACATTAAACCTAGAATGGAGCACTGCGTGCACTTGGTTAACCTCCTTGGCCGCACTGGGCGCCTAGATGACGCTCTTAACT
TCATTGAAAATATGCCATTACAGCCTGATGCTGGTGTCTGGGGTGCCTTGCTTGGTTCTTGTAAAATTCATTGTAATGTAGAGCTTGGAGAACATGCAGCAAGAAAGCTTTTTGAATTGGATCCAGAAAATGCTGCATATTATGTAATGTTATCAAACATATATGCTGTGGCAGGCAGGTGGAATGATGTAGTGAAGACA
AGAACAAAGATGAAAGAAAGGGGGTTGAAAAAGAATCCAGGTTGTAGCTGGATTGAGATCGATAACTGGGTTTATACATTTCTTGCAGGAGACAGGTCTCACCCACAGTCTGAGGAAATCTATGCATTCTTAGAGAGCATGGCTGACCAGATGAAGCAGGCTGGGTGCCTGCCTGACATGTCCTCTATGTTTCATGATGT
AAAAGAGGATGAGAGGGAACAAATACTCTGCGGGCACAGTGAGAAACTGGCAATTACTTTTGGGCTTCTAAACACATGTCCTGGAACACCTATTTTGGTCAACAAGAACCTTCGTGTTTGTGATCACTGCCACAGTGCTATCAAATTCATTTCCAATGTTGTCAGGCGAGAAATAATTCTCAGGGACATGAACCGCTTCC
ATCATTTTAAGGATGGACTTTGTTCATGTAGGGACTATTGGTGATGCTCTTTGAAACAAGCAACGGACAAGCTCTTGGCCGACATTAAGATAGGCATTCAGTTGTGCCTCACATTTGGAGCCAAGGACTAGGGGTATTATATTTCAACATTGCAAGCAGTCATCAACAGTTGATGCATATAGGCCTAGCCTCGGTGAGTG
AATAGTAATAGATGAAAATACCTCTTATAAGCTAGTATTCATTATTCATACATTCTCATAGAATATCTCGTGGGATGCTCACAGCAGTTGCGTGTATTGAAGTCAGAAACTTGTTGAATTTTTAGGTAGTGCAGTGATTTTACAATGTTGCTACCTATATTGGTTCTCTTGAAGGGATCATAGAATATTGAGGGCCATGC
TATGCATTGAGCGTGGTTTATAAGTTGCAAGGATTTATTATTTTCAGCAGAACTGCATTTAAGTTTGAAACGACACACCCAGTTTGTACCCCATTAAAGTTGGCACTGAACTTGCTGCATTTACGAACCAATGATAATCATTGATGGAAAACTTGTTTTTCTGTGCTTGCACATTTTGTTTCACCCCCAGTTGTCTGGGA
TGGCTTCATGCTTCAATGTCAAAAAATGTTACAAAACTACATGTTGAAAATATGAATGAGTCTGCTCTAAACACAGGATGATGTCAAGTCCAAGATGAGCTGTGGTTTTGGTTTAAGGTGATTTGAGGTAACTTCTTGATGTCTCAAAAAAATTTCACTGATATTTTCCGCTATCTCCTGTTCAAATGTCTGGATTTCCA
GTTCACTTTCCTGGGGTTTGTGTGGTTTCTGGGCATTTTCACAGGAAATTCACAAAAAAAATGTCAAACCATGTCTGTTAGAGTTATAAGCATCTATAATTGTTAACTCTGAACGTACATATATGTATGTATGGAGGTAAAGAGCCTCTCAATAGTTTTTTTTTTAAATTATTTGTGGGTACTTTTGCGTCACATGGAAG
GCTTTATATCAAATTCCGTATTGGCATCGCCTTGGTCGACACAAAGTAGACTGTTAGGCATTTCTATTATTAAGATTACAAGGAGCCC


>TRINITY_DN43051_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:
GCGATAAAAAGGGAGCAAGAGCCCGATGTTGTTGTATGCAGTGCACTGATAGACATGTATGCAAAATGCGGCAATGTAGGCATTGCTCGCAATGTGTTCAATAAAGTGTCTCATAGGAATGTTGTCTCGTGGAATGCTATGATTGCAGGATATGGAATACATGGTCAGGATGAAGACGCCCTCACTCTCTTTTACGAAAT
GCTAAGTGAAGGTGTTAAGCCAGATCACATCACCTTTATCGCTGTTCTATGTGCATGCACCCATGCAGGTCTGGTGGATGAGGGATTGGAATACTTTGATAGCATGATGAGGGATTATCACATTAAACCTAGAATGGAGCACTGCGTGCACTTGGTTAACCTCCTTGGCCGCACTGGGCGCCTAGATGACGCTCTTAACT
TCATTGAAAATATGCCATTACAGCCTGATGCTGGTGTCTGGGGTGCCTTGCTTGGTTCTTGTAAAATTCATTGTAATGTAGAGCTTGGAGAACATGCAGCAAGAAAGCTTTTTGAATTGGATCCAGAAAATGCTGCATATTATGTAATGTTATCAAACATATATGCTGTGGCAGGCAGGTGGAATGATGTAGTGAAGACA
AGAACAAAGATGAAAGAAAGGGGGTTGAAAAAGAATCCAGGTTGTAGCTGGATTGAGATCGATAACTGGGTTTATACATTTCTTGCAGGAGACAGGTCTCACCCACAGTCTGAGGAAATCTATGCATTCTTAGAGAGCATGGCTGACCAGATGAAGCAGGCTGGGTGCCTGCCTGACATGTCCTCTATGTTTCATGATGT
AAAAGAGGATGAGAGGGAACAAATACTCTGCGGGCACAGTGAGAAACTGGCAATTACTTTTGGGCTTCTAAACACATGTCCTGGAACACCTATTTTGGTCAACAAGAACCTTCGTGTTTGTGATCACTGCCACAGTGCTATCAAATTCATTTCCAATGTTGTCAGGCGAGAAATAATTCTCAGGGACATGAACCGCTTCC
ATCATTTTAAGGATGGACTTTGTTCATGTAGGGACTATTGGTGATGCTCTTTGAAACAAGCAACGGACAAGCTCTTGGCCGACATTAAGATAGGCATTCAGTTGTGCCTCACATTTGGAGCCAAGGACTAGGGGTATTATATTTCAACATTGCAAGCAGTCATCAACAGTTGATGCATATAGGCCTAGCCTCGGTGAGTG
AATAGTAATAGATGAAAATACCTCTTATAAGCTAGTATTCATTATTCATACATTCTCATAGAATATCTCGTGGGATGCTCACAGCAGTTGCGTGTATTGAAGTCAGAAACTTGTTGAATTTTTAGGTAGTGCAGTGATTTTACAATGTTGCTACCTATATTGGTTCTCTTGAAGGGATCATAGAATATTGAGGGCCATGC
TATGCATTGAGCGTGGTTTATAAGTTGCAAGGATTTATTATTTTCAGCAGgtaacacttgttgttacacattttaatgacttttagccatgagtttttatctcccgagttattgacagaaagcaacttactgtttgactcttgtggctttgcagAACTGCATTTAAGTTTGAAACGACACACCCAGTTTGTACCCCATTA
AAGTTGGCACTGAACTTGCTGCATTTACGAACCAATGATAATCATTGATGGAAAACTTGTTTTTCTGTGCTTGCACATTTTGTTTCACCCCCAGTTGTCTGGGATGGCTTCATGCTTCAATGTCAAAAAATGTTACAAAACTACATGTTGAAAATATGAATGAGTCTGCTCTAAACACAGGATGATGTCAAGTCCAAGAT
GAGCTGTGGTTTTGGTTTAAGGTGATTTGAGGTAACTTCTTGATGTCTCAAAAAAATTTCACTGATATTTTCCGCTATCTCCTGTTCAAATGTCTGGATTTCCAGTTCACTTTCCTGGGGTTTGTGTGGTTTCTGGGCATTTTCACAGGAAATTCACAAAAAAAATGTCAAACCATGTCTGTTAGAGTTATAAGCATCTA
TAATTGTTAACTCTGAACGTACATATATGTATGTATGGAGGTAAAGAGCCTCTCAATAGTTTTTTTTTTAAATTATTTGTGGGTACTTTTGCGTCACATGGAAGGCTTTATATCAAATTCCGTATTGGCATCGCCTTGGTCGACACAAAGTAGACTGTTAGGCATTTCTATTATTAAGATTACAAGGAGCCC



Intron 2 GTGAGTGAAT ... GAATTTTTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A127.27824
A255.56223
A363.64234
A44021.71
A50300
A652.639128
A735.8517712
A844.62181712
A940.5411510
A1028.571026



>TRINITY_DN43051_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform
GCGATAAAAAGGGAGCAAGAGCCCGATGTTGTTGTATGCAGTGCACTGATAGACATGTATGCAAAATGCGGCAATGTAGGCATTGCTCGCAATGTGTTCAATAAAGTGTCTCATAGGAATGTTGTCTCGTGGAATGCTATGATTGCAGGATATGGAATACATGGTCAGGATGAAGACGCCCTCACTCTCTTTTACGAAAT
GCTAAGTGAAGGTGTTAAGCCAGATCACATCACCTTTATCGCTGTTCTATGTGCATGCACCCATGCAGGTCTGGTGGATGAGGGATTGGAATACTTTGATAGCATGATGAGGGATTATCACATTAAACCTAGAATGGAGCACTGCGTGCACTTGGTTAACCTCCTTGGCCGCACTGGGCGCCTAGATGACGCTCTTAACT
TCATTGAAAATATGCCATTACAGCCTGATGCTGGTGTCTGGGGTGCCTTGCTTGGTTCTTGTAAAATTCATTGTAATGTAGAGCTTGGAGAACATGCAGCAAGAAAGCTTTTTGAATTGGATCCAGAAAATGCTGCATATTATGTAATGTTATCAAACATATATGCTGTGGCAGGCAGGTGGAATGATGTAGTGAAGACA
AGAACAAAGATGAAAGAAAGGGGGTTGAAAAAGAATCCAGGTTGTAGCTGGATTGAGATCGATAACTGGGTTTATACATTTCTTGCAGGAGACAGGTCTCACCCACAGTCTGAGGAAATCTATGCATTCTTAGAGAGCATGGCTGACCAGATGAAGCAGGCTGGGTGCCTGCCTGACATGTCCTCTATGTTTCATGATGT
AAAAGAGGATGAGAGGGAACAAATACTCTGCGGGCACAGTGAGAAACTGGCAATTACTTTTGGGCTTCTAAACACATGTCCTGGAACACCTATTTTGGTCAACAAGAACCTTCGTGTTTGTGATCACTGCCACAGTGCTATCAAATTCATTTCCAATGTTGTCAGGCGAGAAATAATTCTCAGGGACATGAACCGCTTCC
ATCATTTTAAGGATGGACTTTGTTCATGTAGGGACTATTGGTGATGCTCTTTGAAACAAGCAACGGACAAGCTCTTGGCCGACATTAAGATAGGCATTCAGTTGTGCCTCACATTTGGAGCCAAGGACTAGGGGTATTATATTTCAACATTGCAAGCAGTCATCAACAGTTGATGCATATAGGCCTAGCCTCGGTAGTGC
AGTGATTTTACAATGTTGCTACCTATATTGGTTCTCTTGAAGGGATCATAGAATATTGAGGGCCATGCTATGCATTGAGCGTGGTTTATAAGTTGCAAGGATTTATTATTTTCAGCAGGTAACACTTGTTGTTACACATTTTAATGACTTTTAGCCATGAGTTTTTATCTCCCGAGTTATTGACAGAAAGCAACTTACTG
TTTGACTCTTGTGGCTTTGCAGAACTACATTTAAGTTTGAAACGACACACCCAGTTTGTACCCCATTAAAGTTGGCACTGAACTTGCTGCATTTACGAACCAATGATAATCATTGATGGAAAACTTGTTTTTCTGTGCTTGCACATTTTGTTTCACCCCCAGTTGTCTGGGATGGCTTCATGCTTCAATGTCAAAAAATG
TTACAAAACTACATGTTGAAAATATGAATGAGTCTGCTCTAAACACAGGATGATGTCAAGTCCAAGATGAGCTGTGGTTTTGGTTTAAGGTGATTTGAGGTAACTTCTTGATGTCTCAAAAAAATTTCACTGATATTTTCCGCTATCTCCTGTTCAAATGTCTGGATTTCCAGTTCACTTTCCTGGGGTTTGTGTGGTTT
CTGGGCATTTTCACAGGAAATTCACAAAAAAAATGTCAAACCATGTCTGTTAGAGTTATAAGCATCTATAATTGTTAACTCTGAACGTACATATATGTATGTATGGAGGTAAAGAGCCTCTCAATAGTTTTTTTTTTAAATTATTTGTGGGTACTTTTGCGTCACATGGAAGGCTTTATATCAAATTCCGTATTGGCATC
GCCTTGGTCGACACAAAGTAGACTGTTAGGCATTTCTATTATTAAGATTACAAGGAGCCC


>TRINITY_DN43051_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:
GCGATAAAAAGGGAGCAAGAGCCCGATGTTGTTGTATGCAGTGCACTGATAGACATGTATGCAAAATGCGGCAATGTAGGCATTGCTCGCAATGTGTTCAATAAAGTGTCTCATAGGAATGTTGTCTCGTGGAATGCTATGATTGCAGGATATGGAATACATGGTCAGGATGAAGACGCCCTCACTCTCTTTTACGAAAT
GCTAAGTGAAGGTGTTAAGCCAGATCACATCACCTTTATCGCTGTTCTATGTGCATGCACCCATGCAGGTCTGGTGGATGAGGGATTGGAATACTTTGATAGCATGATGAGGGATTATCACATTAAACCTAGAATGGAGCACTGCGTGCACTTGGTTAACCTCCTTGGCCGCACTGGGCGCCTAGATGACGCTCTTAACT
TCATTGAAAATATGCCATTACAGCCTGATGCTGGTGTCTGGGGTGCCTTGCTTGGTTCTTGTAAAATTCATTGTAATGTAGAGCTTGGAGAACATGCAGCAAGAAAGCTTTTTGAATTGGATCCAGAAAATGCTGCATATTATGTAATGTTATCAAACATATATGCTGTGGCAGGCAGGTGGAATGATGTAGTGAAGACA
AGAACAAAGATGAAAGAAAGGGGGTTGAAAAAGAATCCAGGTTGTAGCTGGATTGAGATCGATAACTGGGTTTATACATTTCTTGCAGGAGACAGGTCTCACCCACAGTCTGAGGAAATCTATGCATTCTTAGAGAGCATGGCTGACCAGATGAAGCAGGCTGGGTGCCTGCCTGACATGTCCTCTATGTTTCATGATGT
AAAAGAGGATGAGAGGGAACAAATACTCTGCGGGCACAGTGAGAAACTGGCAATTACTTTTGGGCTTCTAAACACATGTCCTGGAACACCTATTTTGGTCAACAAGAACCTTCGTGTTTGTGATCACTGCCACAGTGCTATCAAATTCATTTCCAATGTTGTCAGGCGAGAAATAATTCTCAGGGACATGAACCGCTTCC
ATCATTTTAAGGATGGACTTTGTTCATGTAGGGACTATTGGTGATGCTCTTTGAAACAAGCAACGGACAAGCTCTTGGCCGACATTAAGATAGGCATTCAGTTGTGCCTCACATTTGGAGCCAAGGACTAGGGGTATTATATTTCAACATTGCAAGCAGTCATCAACAGTTGATGCATATAGGCCTAGCCTCGgtgagtg
aatagtaatagatgaaaatacctcttataagctagtattcattattcatacattctcatagaatatctcgtgggatgctcacagcagttgcgtgtattgaagtcagaaacttgttgaatttttagGTAGTGCAGTGATTTTACAATGTTGCTACCTATATTGGTTCTCTTGAAGGGATCATAGAATATTGAGGGCCATGC
TATGCATTGAGCGTGGTTTATAAGTTGCAAGGATTTATTATTTTCAGCAGGTAACACTTGTTGTTACACATTTTAATGACTTTTAGCCATGAGTTTTTATCTCCCGAGTTATTGACAGAAAGCAACTTACTGTTTGACTCTTGTGGCTTTGCAGAACTGCATTTAAGTTTGAAACGACACACCCAGTTTGTACCCCATTA
AAGTTGGCACTGAACTTGCTGCATTTACGAACCAATGATAATCATTGATGGAAAACTTGTTTTTCTGTGCTTGCACATTTTGTTTCACCCCCAGTTGTCTGGGATGGCTTCATGCTTCAATGTCAAAAAATGTTACAAAACTACATGTTGAAAATATGAATGAGTCTGCTCTAAACACAGGATGATGTCAAGTCCAAGAT
GAGCTGTGGTTTTGGTTTAAGGTGATTTGAGGTAACTTCTTGATGTCTCAAAAAAATTTCACTGATATTTTCCGCTATCTCCTGTTCAAATGTCTGGATTTCCAGTTCACTTTCCTGGGGTTTGTGTGGTTTCTGGGCATTTTCACAGGAAATTCACAAAAAAAATGTCAAACCATGTCTGTTAGAGTTATAAGCATCTA
TAATTGTTAACTCTGAACGTACATATATGTATGTATGGAGGTAAAGAGCCTCTCAATAGTTTTTTTTTTAAATTATTTGTGGGTACTTTTGCGTCACATGGAAGGCTTTATATCAAATTCCGTATTGGCATCGCCTTGGTCGACACAAAGTAGACTGTTAGGCATTTCTATTATTAAGATTACAAGGAGCCC



Intron 3 GTGAGTGAAT ... ATGCTCACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A1100020
A233.33523
A3100034
A4100020
A5-1000
A677.783129
A757.14679
A893.111710
A940653
A1033.33624



>TRINITY_DN42156_c5_g2_i3 from sample A9 / Example spliced isoform
GCTACAGCTGAAGGGCCTGCGTTAGGTGTGGTGGGAGGTTTCCAATGCAGCCGATTTGACGGAGAGTTTCCGGTAGCCGGAGTCGATAACTGTAGTGGAGGGGCATCGATGGATGCCATCCTCATGGCATGAAGGATGGATGGTTTTAGCACCCGACAGGCGAGCCTTAAATGTAAATTTACAGTTTGCATGGCGGCCGT
GGTTTCCAATTACTAATTAGAAGGCTCATCTACAAAGCACTACTAGAAATTGGGTTTAAGAGAACTTTCCCGGCTTAATTCCTCTACATGGTTTCTTAAGTACTGATCTCTAAAACAATCCAACCAAGTAAGTTTGCCGGCCATTACATTGACTCTATGGATCAGATGCCGAGCCGAACTAGAAATGCTGAAAGCAATAT
CTCACGTAATATGCCCTTCTAAACTATGGGTGACTGCTGCGAAATCCACTGTCATTCCATTTTCAACTTTCCTCCTCACTGCAATAACACAACCCACATTCAGTGGAGGCGCTCAATTCCAGCCTTCGATACCCGTTGAGTCTACAATCTACGATTCTCTCGTGGAGGCAACTGCAGACATACGATCGCTATCTCAAGGT
AAGCAAGTCCACAGCCTCTTGCTCGTAACCGGCCTCGATCAGAACGTTTTCTTTGGAACCAAACTCGTGAGAACCTACGCTATTTTTGGTGATTTGGAAGATGCCCGCCTCGTCTTTGACAGAATTTCAGAGCGAAATGTGTTCATTTGGAATGCTATGATTAGAGGATATGCCAGAAAAGGTCATCGCAACGAAACATT
TTCTCTCTATGATCAAATGCAGCAGACGGGTATTCGGCTTGATAAGTTCACGTTTGCCTGCGTTCTTGGGGTTTGCACAGATTGGCAACAGGGGAAGGATATTCATGAGCATATTGTTAGATGTGGGACCGAGGTGGACGCCCATTTGGGTAGTGCTCTTATATCAATGTATGGAAAGTGTGGGTGTGTGAAGGATGCCC
GGGATGTGTTTGACAAAATATCTCAGAGGGATGTTGTTTCATGGAATGCCATGATTGCAGGCTACGCTCAGAATGGTTTTTCGGTTGAGGCGTTGGAAGTCTTTCGTGAAATGGAATCTGCTGGTATAAAGCCGGATGCGTTTAGTGTTGCGAGCGTGATTCCGGCTTGCAGCCATTTGGCAGCTCTGCAACAGGGTCAG
GAGATTCATGGGTATGCTATTAGGAATGGGTTTGAATCAAATGTTCATGTGATCAGTGCCCTTGTAGCCATGTATCCTAAATGTGGGCTGATCGATTTTGCATGTCATATGTTTGACAAAATGCCTGAGAGAGACTTGGCTTCTTGGAGTGCCATGATTGCTGGGTTTACACAGGCGGGAGAATCGGTTGAGGCTTTGGA
TTTCTTTAGGCAAATGCAGCGAGTAGGCATTAAGCCGGATCCAGTTGCGCTTTCTAGTGTTCTTCCTGCATGTACCCACTTAACAGCTCTGCAGCAGGGCAAGGAGATCCATTGTTATGCGATAAAAAGGGAGCAAGAGTCCGATGTTGTTGTATGTAGTGCACTGATAGACATGTATGCAAAATGCGGCAATGTAGGCA
TTGCTCGCAATGTGTTCAATAAAGTGTCTCATAGGAATGTTGTCTCGTGGAATGCTATGATTGCAGGATATGGAATACATGGTCAGGATGAAGACGCCCTCACTCTCTTTTACGAAATGCTAAGTGAAGGTGTTAAGCCAGATCACATCACCTTTATCGCTGTTCTATGTGCATGCACCCATGCAGGTCTGGTGGATGAG
GGATTGGAATACTTTGATAGCATGATGAGGGATTATCACATTAAACCTAGAATGGAGCACTGCGTGCACTTGGTTAACCTCCTTGGCCGCACTGGGCGCCTAGATGACGCTCTTAACTTCATTGAAAATATGCCATTACAGCCTGATGCTGGTGTCTGGGGTGCCTTGCTTGGTTCTTGTAAAATTCATTGTAATGTAGA
GCTTGGAGAACATGCAGCAAGAAAGCTTTTTGAATTGGATCCAGAAAATGCTGCATATTATGTAATGTTATCAAACATATATGCTGTGGCAGGCAGGTGGAATGATGTAGTGAAGACAAGAACAAAGATGAAAGAAAGGGGGTTGAAAAAGAATCCAGGTTGTAGCTGGATTGAGATCGATAACTGGGTTTATACATTTC
TTGCAGGAGACAGGTCTCACCCACAGTCTGAGGAAATCTATGCATTCTTAGAGAGCATGGCTGACCAGATGAAGCAGGCTGGGTGCCTGCCTGACATGTCCTCTTTGTTTCATGATGTAAAAGAGGATGAGAGGGAACAAATACTCTGCGGGCACAGTGAGAAACTGGCAATTACTTTTGGGCTTCTAAACACATGTCCT
GGAACACCTATTTTGGTCAACAAGAACCTTCGTGTTTGTGATCACTGCCACATTGCTATCAAATTCATTTCCAATGTTGTCAGGCGAGAAATAATTCTCAGGGACATGAACCGCTTCCATCATTTTAAGGATGGACTTTGTTCATGTAGGGACTATTGGTGATGCTCTTTGAAACAAGCAACGGACAAGCTCTTGGCCGA
CATTAAGATAGGCATTCAGTTGTGCCTCGCATTTGGAGCCAAGGACTAGGGGTATTATATTTCAACATTGCAAGCAGTCATCAACAGTTGATGCATATAGGCCTAGCCTCGCAGTTGCGTGTATTGAAGTCAGAAACTTGTTGAATTTTTAGGTAGTGCAGTGATTTTACAATGTTGCTACCTATATTGGTTCTCTTGAA
GGGATCATAGAATATTGAGGGCCATGCTATGCATTGAGCGTGGTTTATAAGTTGCAAGGATTTATTATTTTCAGCAGAACTGCATTTAAGTTTGAAACGACACACCCAGTTTGTACCCCATTAAAGTTGGCACTGAACTTGCTGCATTTACGAACCAATGATAATCATTGATGGAAAACTTGTTTTTCTGTGCTTGCACA
TTTTGTTTCACCCCCAGTTGTCTGGGATGGCTTCATGCTTCAATGTCAAAAAATGTTACAAAACTACATGTTGAAAATATGAATGAGTCTGCTCTAAACACAGGATGATGTCAAGTCCAAGATGAGCTGTGGTTTTGGTTTAAGGTGATTTGAGGTAACTTCTTGATGTCTCAAAAAAATTTCACTGATATTTTCCGCTA
TCTCCTGTTCAAATGTCTGGATTTCCAGTTCACTTTCCTGGGGTTTGTGTGGTTTCTGGGCATTTTCACAGGAAATTCACAAAAAAAATGTCAAACCATGTCTGTTAGAGTTATAAGCATCTATAATTGTTAACTCTGAACGTACATATATGTATGTATGGAGGTAAAGAGCCTCTCCATAGTTTTTTTTAAAATTATTT
GTGGGTACTTTTGCGTCACATGGAAGGCTTTATATCAAATTCCGTATTGGCGTCGCCTTGGTCGACACAAAGTAGACTGTTAGGCATTTCTATTATTAAGATTACAAGGAGCCCCTTGATACATGGTTTATCGAATGCTTGATATCCTTGGACATATTTGTTTACAAGAATCAAACTAAATACCATCATCAATCCATGAG
AAAATAATTCATGTCTCATTGATATTCAACAATGAATTTAAATTGGAGATTCAGTG


>TRINITY_DN42156_c5_g2_i4 from sample A9 / Example unspliced isoform:
GCTACAGCTGAAGGGCCTGCGTTAGGTGTGGTGGGAGGTTTCCAATGCAGCCGATTTGACGGAGAGTTTCCGGTAGCCGGAGTCGATAACTGTAGTGGAGGGGCATCGATGGATGCCATCCTCATGGCATGAAGGATGGATGGTTTTAGCACCCGACAGGCGAGCCTTAAATGTAAATTTACAGTTTGCATGGCGGCCGT
GGTTTCCAATTACTAATTAGAAGGCTCATCTACAAAGCACTACTAGAAATTGGGTTTAAGAGAACTTTCCCGGCTTAATTCCTCTACATGGTTTCTTAAGTACTGATCTCTAAAACAATCCAACCAAGTAAGTTTGCCGGCCATTACATTGACTCTATGGATCAGATGCCGAGCCGAACTAGAAATGCTGAAAGCAATAT
CTCACGTAATATGCCCTTCTAAACTATGGGTGACTGCTGCGAAATCCACTGTCATTCCATTTTCAACTTTCCTCCTCACTGCAATAACACAACCCACATTCAGTGGAGGCGCTCAATTCCAGCCTTCGATACCCGTTGAGTCTACAATCTACGATTCTCTCGTGGAGGCAACTGCAGACATACGATCGCTATCTCAAGGT
AAGCAAGTCCACAGCCTCTTGCTCGTAACCGGCCTCGATCAGAACGTTTTCTTTGGAACCAAACTCGTGAGAACCTACGCTATTTTTGGTGATTTGGAAGATGCCCGCCTCGTCTTTGACAGAATTTCAGAGCGAAATGTGTTCATTTGGAATGCTATGATTAGAGGATATGCCAGAAAAGGTCATCGCAACGAAACATT
TTCTCTCTATGATCAAATGCAGCAGACGGGTATTCGGCTTGATAAGTTCACGTTTGCCTGCGTTCTTGGGGTTTGCACAGATTGGCAACAGGGGAAGGATATTCATGAGCATATTGTTAGATGTGGGACCGAGGTGGACGCCCATTTGGGTAGTGCTCTTATATCAATGTATGGAAAGTGTGGGTGTGTGAAGGATGCCC
GGGATGTGTTTGACAAAATATCTCAGAGGGATGTTGTTTCATGGAATGCCATGATTGCAGGCTACGCTCAGAATGGTTTTTCGGTTGAGGCGTTGGAAGTCTTTCGTGAAATGGAATCTGCTGGTATAAAGCCGGATGCGTTTAGTGTTGCGAGCGTGATTCCGGCTTGCAGCCATTTGGCAGCTCTGCAACAGGGTCAG
GAGATTCATGGGTATGCTATTAGGAATGGGTTTGAATCAAATGTTCATGTGATCAGTGCCCTTGTAGCCATGTATCCTAAATGTGGGCTGATCGATTTTGCATGTCATATGTTTGACAAAATGCCTGAGAGAGACTTGGCTTCTTGGAGTGCCATGATTGCTGGGTTTACACAGGCGGGAGAATCGGTTGAGGCTTTGGA
TTTCTTTAGGCAAATGCAGCGAGTAGGCATTAAGCCGGATCCAGTTGCGCTTTCTAGTGTTCTTCCTGCATGTACCCACTTAACAGCTCTGCAGCAGGGCAAGGAGATCCATTGTTATGCGATAAAAAGGGAGCAAGAGTCCGATGTTGTTGTATGTAGTGCACTGATAGACATGTATGCAAAATGCGGCAATGTAGGCA
TTGCTCGCAATGTGTTCAATAAAGTGTCTCATAGGAATGTTGTCTCGTGGAATGCTATGATTGCAGGATATGGAATACATGGTCAGGATGAAGACGCCCTCACTCTCTTTTACGAAATGCTAAGTGAAGGTGTTAAGCCAGATCACATCACCTTTATCGCTGTTCTATGTGCATGCACCCATGCAGGTCTGGTGGATGAG
GGATTGGAATACTTTGATAGCATGATGAGGGATTATCACATTAAACCTAGAATGGAGCACTGCGTGCACTTGGTTAACCTCCTTGGCCGCACTGGGCGCCTAGATGACGCTCTTAACTTCATTGAAAATATGCCATTACAGCCTGATGCTGGTGTCTGGGGTGCCTTGCTTGGTTCTTGTAAAATTCATTGTAATGTAGA
GCTTGGAGAACATGCAGCAAGAAAGCTTTTTGAATTGGATCCAGAAAATGCTGCATATTATGTAATGTTATCAAACATATATGCTGTGGCAGGCAGGTGGAATGATGTAGTGAAGACAAGAACAAAGATGAAAGAAAGGGGGTTGAAAAAGAATCCAGGTTGTAGCTGGATTGAGATCGATAACTGGGTTTATACATTTC
TTGCAGGAGACAGGTCTCACCCACAGTCTGAGGAAATCTATGCATTCTTAGAGAGCATGGCTGACCAGATGAAGCAGGCTGGGTGCCTGCCTGACATGTCCTCTTTGTTTCATGATGTAAAAGAGGATGAGAGGGAACAAATACTCTGCGGGCACAGTGAGAAACTGGCAATTACTTTTGGGCTTCTAAACACATGTCCT
GGAACACCTATTTTGGTCAACAAGAACCTTCGTGTTTGTGATCACTGCCACATTGCTATCAAATTCATTTCCAATGTTGTCAGGCGAGAAATAATTCTCAGGGACATGAACCGCTTCCATCATTTTAAGGATGGACTTTGTTCATGTAGGGACTATTGGTGATGCTCTTTGAAACAAGCAACGGACAAGCTCTTGGCCGA
CATTAAGATAGGCATTCAGTTGTGCCTCGCATTTGGAGCCAAGGACTAGGGGTATTATATTTCAACATTGCAAGCAGTCATCAACAGTTGATGCATATAGGCCTAGCCTCGgtgagtgaatagtaatagatgaaaatacctcttataagctagtattcattattcatacattctcatagaatatctcgtgggatgctcac
agCAGTTGCGTGTATTGAAGTCAGAAACTTGTTGAATTTTTAGGTAGTGCAGTGATTTTACAATGTTGCTACCTATATTGGTTCTCTTGAAGGGATCATAGAATATTGAGGGCCATGCTATGCATTGAGCGTGGTTTATAAGTTGCAAGGATTTATTATTTTCAGCAGAACTGCATTTAAGTTTGAAACGACACACCCAG
TTTGTACCCCATTAAAGTTGGCACTGAACTTGCTGCATTTACGAACCAATGATAATCATTGATGGAAAACTTGTTTTTCTGTGCTTGCACATTTTGTTTCACCCCCAGTTGTCTGGGATGGCTTCATGCTTCAATGTCAAAAAATGTTACAAAACTACATGTTGAAAATATGAATGAGTCTGCTCTAAACACAGGATGAT
GTCAAGTCCAAGATGAGCTGTGGTTTTGGTTTAAGGTGATTTGAGGTAACTTCTTGATGTCTCAAAAAAATTTCACTGATATTTTCCGCTATCTCCTGTTCAAATGTCTGGATTTCCAGTTCACTTTCCTGGGGTTTGTGTGGTTTCTGGGCATTTTCACAGGAAATTCACAAAAAAAATGTCAAACCATGTCTGTTAGA
GTTATAAGCATCTATAATTGTTAACTCTGAACGTACATATATGTATGTATGGAGGTAAAGAGCCTCTCCATAGTTTTTTTTAAAATTATTTGTGGGTACTTTTGCGTCACATGGAAGGCTTTATATCAAATTCCGTATTGGCGTCGCCTTGGTCGACACAAAGTAGACTGTTAGGCATTTCTATTATTAAGATTACAAGG
AGCCCCTTGATACATGGTTTATCGAATGCTTGATATCCTTGGACATATTTGTTTACAAGAATCAAACTAAATACCATCATCAATCCATGAGAAAATAATTCATGTCTCATTGATATTCAACAATGAATTTAAATTGGAGATTCAGTG