sp|F4JY11|CAND7_ARATH ----> Protein CANDIDATE G-PROTEIN COUPLED RECEPTOR 7

Intron 1 GTATTTCCAC ... ATTGCTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	74.6	8	20	27
A2	61.4	11	17	18
A3	78.26	5	18	18
A4	68.18	7	18	12
A5	100	0	4	6
A6	68.57	33	68	76
A7	62.65	31	53	51
A8	53.33	28	25	39
A9	64.18	24	52	34
A10	63.64	28	51	47

>TRINITY_DN45498_c0_g1_i3 from sample A10 / Example spliced isoform

ACACAACACACGCTATATATAAATATATATAGCCATCTCTCTCGTCGGATATTGTGGCTGTCATACACTGCTGAGTTCAATGTTGCCGCAGTTTTACTTGCAATGCACTAAGATCCTCCATCAATCTTCGCTAGAAGGCTCCAAACTCGGCTGGATCGATTTCTTCTCAAAGAAAACCGTGCTGAATCGGCCAATTTAAA
GCCATGATCGGCGAGTCGGGACAGTATGCAAAGGACTGGTTTGAATGGAAGCAATTGTTGCTTCTTATTGATATCATTTGTTGCAGTGCTGTTCTTTTTCCCATTGTTTGGTCAATCAAGCACTTGAAAGAGGCGGCTGTGACAGATGGCAAGGCAGCAGTAGTTTTGAGGAAGCTGACCCTGTTCAGGCACTATTACAT
TGTGGTGATCTCTTATATCTACTTTACTCGAGTAGTTGTCTTCGCTTTGTCGACAAGAACATCATTTAGGTATACGTGGACGAGCCATCTGGCCAGGGAATGCGCAACTCTCGGATTCTATGTTTTCACGGGATATAGGTTCAGGCCTGTTATGCACAATCCTTATTTGGTGATTGAGGATGAAGAGGAGGAAGCTGCAG
CTCAGGCCTTAAAGTTGGATGAAGATGATAATTTTGAGCTTTAACTTTGATGGCTTATTTGGAGAAAGATAAAGTCATTTTGGAAGTTTCTCTTCAGTGAAATAAATCTTAAATCTGTTTTAGTGCTGTTATTTTTCCTGTGGGAGTGAGAAACACAATGCCTGCTATTCCCCTGGGCTTTGAACTCTTTATCAAGTTGC
CAAACATTTTTATAAACTTATTGAATTTGGATATATGTAATGTTGTCTTTTGGTTGCTGTATAAACTCTCAGTGCAGTCGTTCCAAGCCACTGTGGGAAATTCTGAAGTTAAGAATTAGCTCTGAGTTTTACCAACTCAAAATCAACCCTTTTTTTGTTTATAGTTTCTTCGTATGATTATTGCATAATATCCTGCAGAT
TGTGCTTCTAGTAGAGCAGGGGAAGCAGCACATAGCTTGTACCAGAAAAATAGTATATTGTTTTACACTTTTCTGCTTGTCATGATATAGAGATGTGCTGTGCTCAGACAGGAATCATAAATAGACTATATCCTG

>TRINITY_DN45498_c0_g1_i5 from sample A10 / Example unspliced isoform:

ACACAACACACGCTATATATAAATATATATAGCCATCTCTCTCGTCGGATATTGTGGCTGTCATACACTGCTGAGTTCAATGTTGCCGCAGTTTTACTTGCAATGCACTAAGATCCTCCATCAATCTTCGCTAGAAGGCTCCAAACTCGGCTGGATCGATTTCTTCTCAAAGAAAACCGTGCTGAATCGGCCAATTTAAA
Ggtatttccacaatgggtagccattgtttgcaaacccttttaattattgttttattcggatgcattattccatcttccctcgcagaaattcgggagtctcagatccgctcagactcccgccctataatcctttttgatgaatttggcttcacagacagaggccatttagagatctatgtaacagaggcctcctataggct
caccgtggacaaaaaaatcaatcccgttcatatggggtttttggctaccacaagggatgcatggctccatgttttacagcaggtagagctgaggcaaattagatgcattcttgacagtaagctcgtcacagtgctcttcacatttgaagagattcaaaacaataatcattttaacaaaacatttagtccctcagattcca
accagtacagtgtactgtttgtgaattgtatagctgaccttcaggtttccatgaatgtgaagactgcaatgtacaatttagagggggattccaacattaaggattatttgcctataggtcaaacagtgatgccaaagttatactttggattttttgttatttatgcaactttggctggggtttgggtatacgtgtgtgtg
aagaataggctttctgcccataggatccatatattgatgggtgcattggtctgtttgaaggctttgaatctgatctgtgaggcagaggacaagtctttcattaaaagaacagggactgcccatgggtgggatgttgttttttatattttcaattttttcaagggtattatgctttttaccctaattgtcctgattggtac
tgggtggtccttcttgaggccttatcttcaagaaaaagataagaaggtgctcatgattgtcattcctctgcaagttgttgccaatattgctgcagCCATGATCGGCGAGTCGGGACAGTATGCAAAGGACTGGTTTGAATGGAAGCAATTGTTGCTTCTTATTGATATCATTTGTTGCAGTGCTGTTCTTTTTCCCATTG
TTTGGTCAATCAAGCACTTGAAAGAGGCGGCTGTGACAGATGGCAAGGCAGCAGTAGTTTTGAGGAAGCTGACCCTGTTCAGGCACTATTACATTGTGGTGATCTCTTATATCTACTTTACTCGAGTAGTTGTCTTCGCTTTGTCGACAAGAACATCATTTAGGTATACGTGGACGAGCCATCTGGCCAGGGAATGCGCA
ACTCTCGGATTCTATGTTTTCACGGGATATAGGTTCAGGCCTGTTATGCACAATCCTTATTTGGTGATTGAGGATGAAGAGGAGGAAGCTGCAGCTCAGGCCTTAAAGTTGGATGAAGATGATAATTTTGAGCTTTAACTTTGATGGCTTATTTGGAGAAAGATAAAGTCATTTTGGAAGTTTCTCTTCAGTGAAATAAA
TCTTAAATCTGTTTTAGTGCTGTTATTTTTCCTGTGGGAGTGAGAAACACAATGCCTGCTATTCCCCTGGGCTTTGAACTCTTTATCAAGTTGCCAAACATTTTTATAAACTTATTGAATTTGGATATATGTAATGTTGTCTTTTGGTTGCTGTATAAACTCTCAGTGCAGTCGTTCCAAGCCACTGTGGGAAATTCTGA
AGTTAAGAATTAGCTCTGAGTTTTACCAACTCAAAATCAACCCTTTTTTTGTTTATAGTTTCTTCGTATGATTATTGCATAATATCCTGCAGATTGTGCTTCTAGTAGAGCAGGGGAAGCAGCACATAGCTTGTACCAGAAAAATAGTATATTGTTTTACACTTTTCTGCTTGTCATGATATAGAGATGTGCTGTGCTCA
GACAGGAATCATAAATAGACTATATCCTG

Intron 2 GTATTTCCAC ... CCTCTGCAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	71.21	10	20	29.5
A2	57.37	14.5	17	22
A3	74.07	7	18	22
A4	63.93	11	18	21
A5	70	3	4	10
A6	68.93	40	68	109.5
A7	64.29	35	53	73
A8	63.16	21	25	47
A9	69.14	25	52	60
A10	65.56	31	51	67

>TRINITY_DN41265_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform

AAACTCTCCTCACACAACACACGCTATATAAATATATATAGCCATCTCTCTCGTCGGATATTGTGGCTGTCATACACTGCTGAGTTCAATGTTGCCGCAGTTTTACTTGCAATGCACTAAGATCCTCCATCAATCTTCGCTAGAAGGCTCCAAACTCGGCTGGATCGATTTCTTCTCAAAGAAAACCGTGCTGAATCGGC
CAATTTAAAGTTGTTGCCAATATTGCTGCAGCCATGATCGGCGAGTCGGGACCGTATGCAAAGGACTGGTTTGAATGGAAGCAATTGTTGCTTCTTATTGATATCATTTGTTGCAGTGCTGTTCTTTTTCCCATTGTTTGGTCAATCAAGCACTTGAAAGAGGCGGCTGTGACAGATGGCAAGGCAGCAGTAGTTTTGAG
GAAGCTGACCCTGTTCAGGCACTATTACATTGTGGTGATCTCTTATATCTACTTTACTCGAGTAGTTGTCTTCGCTTTGTCGACAAGAACATCATTTAGGTATACGTGGACGAGCCATCTGGCCAGGGAATGCGCAACTCTCGGATTCTATGTTTTCACGGGATATAGGTTCAGGCCTGTTATGCACAATCCTTATTTGG
TGATTGAGGATGAAGAGGAGGAAGCTGCAGCTCAGGCCTTAAAGTTGGATGAAGATGATAATTTTGAGCTTTAACTTTGATGGCTTATTTGGAGAAAGATAAAGTCATTTTGGAAGTTTCTCTTCAGTGAAATAAATCTTAAATCTGTTTTAGTGCTGTTATTTTTCCTGTGGGAGTGAGAAACACAATGCCTGCTATTC
CCCTGGGCTTTGAACTCTTTATCAAGTTGCCAAACATTTTTATAAACTTATTGAATTTGGATATATGTAATGTTGTCTTTTGGTTGTTGTATAAACTCTCAGTGCAGTCGTCCCAAGCCACTGTGGGAAATTCTGAAGTTAAGAATTAGCTCTGAGTTTTACCAACTCAAAATCAACCCTTTTTTTGTTTATAGTTTCTT
CGTATGATTATTGCATAATATCCTGCAGATTGTGCTTCTAGTAGAGCAGGGGAAGCAGCACATAGCTTGTACCAGAAAAATAGTATATTGTTTTACACTTTTCTGCTTGTCATGATATAGAGATGTGCTGTGCTCAGACAGGAATCATAAATAGACTATATCCTGATTATTGTGTGTAAGACTAATGTAGATAAATGTGT
CTACTAAATGTTTCTAGTTAATGGGGTCATTGAGTTGAGCTTTCAATATAATTTTTTTCTTTGTCAG

>TRINITY_DN41265_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:

AAACTCTCCTCACACAACACACGCTATATAAATATATATAGCCATCTCTCTCGTCGGATATTGTGGCTGTCATACACTGCTGAGTTCAATGTTGCCGCAGTTTTACTTGCAATGCACTAAGATCCTCCATCAATCTTCGCTAGAAGGCTCCAAACTCGGCTGGATCGATTTCTTCTCAAAGAAAACCGTGCTGAATCGGC
CAATTTAAAGgtatttccacaatgggtagccattgtttgcaaacccttttaattattgttttattcggatgcattattccatcttccctcgcagaaattcgggagtctcagatccgctcagactcccgccctataatcctttttgatgaatttggcttcacagacagaggccatttagagatctatgtaacagaggcctc
ctataggctcaccgtggacaaaaaaatcaatcccgttcatatggggtttttggctaccacaagggatgcatggctccatgttttacagcaggtagagctgaggcaaattagatgcattcttgacagtaagctcgtcacagtgctcttcacatttgaagagattcaaaacaataatcattttaacaaaacatttagtccct
cagattccaaccagtacagtgtactgtttgtgaattgtatagctgaccttcaggtttccatgaatgtgaagactgcaatgtacaatttagagggggattccaacattaaggattatttgcctataggtcaaacagtgatgccaaagctatactttggattttttgttatttatgcaactttggctggggtttgggtatac
gtgtgtgtgaagaataggctttctgcccataggatccatatattgatgggtgcattggtctgtttgaaggctttgaatctgatctgtgaggcagaggacaagtctttcattaaaagaacagggactgcccatgggtgggatgttgttttttatattttcaattttttcaagggtattatgctctttaccctaattgtcct
gattggtactgggtggtccttcttgaggccttatcttcaagaaaaagataagaaggtgctcatgattgtcattcctctgcaagTTGTTGCCAATATTGCTGCAGCCATGATCGGCGAGTCGGGACCGTATGCAAAGGACTGGTTTGAATGGAAGCAATTGTTGCTTCTTATTGATATCATTTGTTGCAGTGCTGTTCTTT
TTCCCATTGTTTGGTCAATCAAGCACTTGAAAGAGGCGGCTGTGACAGATGGCAAGGCAGCAGTAGTTTTGAGGAAGCTGACCCTGTTCAGGCACTATTACATTGTGGTGATCTCTTATATCTACTTTACTCGAGTAGTTGTCTTCGCTTTGTCGACAAGAACATCATTTAGGTATACGTGGACGAGCCATCTGGCCAGG
GAATGCGCAACTCTCGGATTCTATGTTTTCACGGGATATAGGTTCAGGCCTGTTATGCACAATCCTTATTTGGTGATTGAGGATGAAGAGGAGGAAGCTGCAGCTCAGGCCTTAAAGTTGGATGAAGATGATAATTTTGAGCTTTAACTTTGATGGCTTATTTGGAGAAAGATAAAGTCATTTTGGAAGTTTCTCTTCAG
TGAAATAAATCTTAAATCTGTTTTAGTGCTGTTATTTTTCCTGTGGGAGTGAGAAACACAATGCCTGCTATTCCCCTGGGCTTTGAACTCTTTATCAAGTTGCCAAACATTTTTATAAACTTATTGAATTTGGATATATGTAATGTTGTCTTTTGGTTGTTGTATAAACTCTCAGTGCAGTCGTCCCAAGCCACTGTGGG
AAATTCTGAAGTTAAGAATTAGCTCTGAGTTTTACCAACTCAAAATCAACCCTTTTTTTGTTTATAGTTTCTTCGTATGATTATTGCATAATATCCTGCAGATTGTGCTTCTAGTAGAGCAGGGGAAGCAGCACATAGCTTGTACCAGAAAAATAGTATATTGTTTTACACTTTTCTGCTTGTCATGATATAGAGATGTG
CTGTGCTCAGACAGGAATCATAAATAGACTATATCCTGATTATTGTGTGTAAGACTAATGTAGATAAATGTGTCTACTAAATGTTTCTAGTTAATGGGGTCATTGAGTTGAGCTTTCAATATAATTTTTTTCTTTGTCAG