sp|A8MR93|ALG12_ARATH ----> Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase
Intron 1 GTCAGATTGA ... CTGGCTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 45.45 | 9 | 6 | 9 |
| A2 | 66.67 | 4 | 7 | 9 |
| A3 | 66.67 | 3 | 7 | 5 |
| A4 | 50.94 | 13 | 23 | 4 |
| A5 | 52.94 | 4 | 3 | 6 |
| A6 | 60.98 | 8 | 11 | 14 |
| A7 | 53.62 | 16 | 20 | 17 |
| A8 | 53.85 | 9 | 10 | 11 |
| A9 | 53.85 | 15 | 22 | 13 |
| A10 | 45 | 11 | 9 | 9 |
>TRINITY_DN41866_c1_g2_i2 from sample A9 / Example spliced isoformGTGTTTTCATCCCCTTGTCTGATCTTCGCCTGGTGGCGAGTCTAAGAAATTATATATTGTTGAACTAGAGATTTAATGGCATGCGAGTAGTGATGGTTTTCTTGCTGAAGGCCGGTAGGAGATTCTGGAGTGACAAAATCATGCTGGACAGATGGGATATGTTGTTAATGGCTATTGCAACATTTCATGTGTTCTTGGCT
CCTTACACAAAAGTTGAAGAGAGCTTCAATGTCCAGGCAATACATGATATCCTTTATCATCACTATCACTTAGAAAAGTATGATCATTTTGAATTTCCAGGAGTTGTACCCCGCACCTTCATAGGTGCTCTTATTGTATCTCTACTATCATCACCATTTATAGCAGCTATCAATCTCTTAAAACTACCAAAGCTGTATGG
AATTTTAATCGCTCGTCTGGTACTAGGGAGCATTGTATTGTCAGGTTTACATCTTTTTCGAATGCAGTAAACTTGGCATATGCTTTTTGGATAAACGGGCTCCCCTTTGCAACATTGAGATGCCTGGTTTTTTCGATGGTTGTGTTCAGATGTGATATTGTGTTGCTCCTGTGTCCTATTGGTTTACACTTTCTGCTGAC
TAGACAAGTTACGTTATTGAGCGCTGTAAGATGCTGTGCAACTACAGCTCTTTTGAGCATAGGGGCTACAATCCTGATTGACTCAATTATGTGGAAAAGGATCACATGGCCAGAAATGGAGGTTTTCTGGTTTAATTCTGTCTTGAACCGTAGCTCTGAATGGGGTGTATTTCCGGTGCATTGGTATTTTACATCAGCTC
TTCCACGATCAATGTTGGCGGCATTTCCACTGTGCTTTCTAGGTGTAATCCTTGAGAGAAGGATGCTAGAGTACATGTTACCTGTCTTTGCCTTTATTGTACTTTACTCCAAACTTCCACACAAGGAGCTCCGGTTTATAATTTTGGCAATTCCCATGCTGAACCTCTCTGCAGCAATTGCAGCTACAAGAATTTACAAC
AACAGGAAGAAAACAATCTGGAAGTGGGCATACATTGGCATGATTGGCTCACTCTTTGCAAGTTTAGGATTCTCTATGATTATGAGTGCTGCTTCATATGCAAACTACCCAGCTGGCTATGCACTAGATGCTCTTCACCATAAAGACTTTAACAGAACTTCCAGCTGTGTGGTTCACATTGATTCAATGGCAGCAATGAA
TGGTATTTCCCGCTTTTGTGAAAAGGATCTTCTTTGGAGGTATTCCAAGGAAGAACATATTTCTGATGAAGAAATCCTTGCCAAAAGTTTTACGTATCTGATCAATGAACGTTCAAGAATACCTGGCTTTAAATGCTTATTGGCTACCTCTGGATTTTCTAGGCTACTTGTTCAGCTCTCCTTCCCACCTGTTCGCCTGT
TAACTGAGCCCAAAGTTTTTGTCCATGGCAATATAAGAAGTGAAGGTATTGAAGATATAAGATGGCCTGGTTGTCCTTACTCCTAGCAGGAGAACCACACAGCTGTCAACTTATCCAATAATATTACTAGAGTTGAAGTGTTTAATCTTAATTGTCCAAGAATGGTATTCTTCCAGCATTGCAGTGGAAGATTGCAATGC
TTGAATCACATTTAAGGGTTATTCTTTTGTATATGGAACCCTGCCATATCTAAGCATAGGTGTTTTTTATCATAATAACATTTAATTTATTTTATTTTCACTGTGTTTAAATCATAGGCTGTATTGACATTTCCTGTATGGAAATTCAGACCATGTTTAAAATACGGTGAATATTCGGCATAGTTCAAATACGATACATT
CAACAAATCCTTGGCCAAATTCTACTATGGCCACTTTATTTATTTATAAAAACACTCATTTAAAAAAACACATTTTGAATTTTTAATTAATTTCTACTACATTATCATGAG
>TRINITY_DN41866_c1_g2_i9 from sample A9 / Example unspliced isoform:GTGTTTTCATCCCCTTGTCTGATCTTCGCCTGGTGGCGAGTCTAAGAAATTATATATTGTTGAACTAGAGATTTAATGGCATGCGAGTAGTGATGGTTTTCTTGCTGAAGGCCGGTAGGAGATTCTGGAGTGACAAAATCATGCTGGACAGATGGGATATGTTGTTAATGGCTATTGCAACATTTCATGTGTTCTTGGCT
CCTTACACAAAAGTTGAAGAGAGCTTCAATGTCCAGGCAATACATGATATCCTTTATCATCACTATCACTTAGAAAAGTATGATCATTTTGAATTTCCAGGAGTTGTACCCCGCACCTTCATAGGTGCTCTTATTGTATCTCTACTATCATCACCATTTATAGCAGCTATCAATCTCTTAAAACTACCAAAGCTGTATGG
AATTTTAATCGCTCGTCTGGTACTAGGGAGCATTGTATTGTCAGGTTTACATCTTTTTCGAATGCAGgtcagattgaagtttggtcaacaggtctccaacttatttgcaataatgatagctctgcagttccatcttttattttactgttcaagaccacttccaaatatttttgctctggctgtagTAAACTTGGCATATG
CTTTTTGGATAAACGGGCTCCCCTTTGCAACATTGAGATGCCTGGTTTTTTCGATGGTTGTGTTCAGATGTGATATTGTGTTGCTCCTGTGTCCTATTGGTTTACACTTTCTGCTGACTAGACAAGTTACGTTATTGAGCGCTGTAAGATGCTGTGCAACTACAGCTCTTTTGAGCATAGGGGCTACAATCCTGATTGAC
TCAATTATGTGGAAAAGGATCACATGGCCAGAAATGGAGGTTTTCTGGTTTAATTCTGTCTTGAACCGTAGCTCTGAATGGGGTGTATTTCCGGTGCATTGGTATTTTACATCAGCTCTTCCACGATCAATGTTGGCGGCATTTCCACTGTGCTTTCTAGGTGTAATCCTTGAGAGAAGGATGCTAGAGTACATGTTACC
TGTCTTTGCCTTTATTGTACTTTACTCCAAACTTCCACACAAGGAGCTCCGGTTTATAATTTTGGCAATTCCCATGCTGAACCTCTCTGCAGCAATTGCAGCTACAAGAATTTACAACAACAGGAAGAAAACAATCTGGAAGTGGGCATACATTGGCATGATTGGCTCACTCTTTGCAAGTTTAGGATTCTCTATGATTA
TGAGTGCTGCTTCATATGCAAACTACCCAGCTGGCTATGCACTAGATGCTCTTCACCATAAAGACTTTAACAGAACTTCCAGCTGTGTGGTTCACATTGATTCAATGGCAGCAATGAATGGTATTTCCCGCTTTTGTGAAAAGGATCTTCTTTGGAGGTATTCCAAGGAAGAACATATTTCTGATGAAGAAATCCTTGCC
AAAAGTTTTACGTATCTGATCAATGAACGTTCAAGAATACCTGGCTTTAAATGCTTATTGGCTACCTCTGGATTTTCTAGGCTACTTGTTCAGCTCTCCTTCCCACCTGTTCGCCTGTTAACTGAGCCCAAAGTTTTTGTCCATGGCAATATAAGAAGTGAAGGTATTGAAGATATAAGATGGCCTGGTTGTCCTTACTC
CTAGCAGGAGAACCACACAGCTGTCAACTTATCCAATAATATTACTAGAGTTGAAGTGTTTAATCTTAATTGTCCAAGAATGGTATTCTTCCAGCATTGCAGTGGAAGATTGCAATGCTTGAATCACATTTAAGGGTTATTCTTTTGTATATGGAACCCTGCCATATCTAAGCATAGGTGTTTTTTATCATAATAACATT
TAATTTATTTTATTTTCACTGTGTTTAAATCATAGGCTGTATTGACATTTCCTGTATGGAAATTCAGACCATGTTTAAAATACGGTGAATATTCGGCATAGTTCAAATACGATACATTCAACAAATCCTTGGCCAAATTCTACTATGGCCACTTTATTTATTTATAAAAACACTCATTTAAAAAAACACATTTTGAATTT
TTAATTAATTTCTACTACATTATCATGAG
Intron 2 GTATATTATT ... TTGTTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.23 | 10.5 | 0 | 2 |
| A2 | 35.41 | 7.5 | 0 | 4 |
| A3 | 16.27 | 20.6 | 0 | 4 |
| A4 | 63.64 | 4 | 0 | 7 |
| A5 | 0 | 7 | 0 | 0 |
| A6 | 18.76 | 43.4 | 0 | 10 |
| A7 | 9.56 | 47.6 | 0 | 5 |
| A8 | 20.13 | 79.5 | 1 | 20 |
| A9 | 19.3 | 50.3 | 0 | 12 |
| A10 | 13.2 | 19.8 | 0 | 3 |
>TRINITY_DN41866_c1_g2_i4 from sample A9 / Example spliced isoformGTCTAAACGGAATAGTTTAGGACCGAGGTGACATTGGGTTTTACACTCATAGTTGCCCTCAGGAACACACATAGTGGTTGGGAAACTTACCTGCGATCAAGTGTGTTTTAGGCGGCAACAGTATCCAAATATGCAGGTTGGTCTTTGCACAAGGAAGATGCCTGTCCATTCTCTTGCCATTATTGCTAACACATAAGAAC
CATCTGACTTATTCTTCATGGGTACTTGATGTTTGCTTCAAGGATGACCTGGTTCTTGTCTGAAGTATGCAAGCTAGAAAAAGACTGCTATGTATCAAGTGGATTGGATTCTTCTCTGTATCATCAGGCTTGAAAACTGTTTATGTAGAGCTATTAGTTATTCCATTTTCTCACAAAGTTTGATGTTTTAGAATGGAAAT
GAGCTAAATTGTAACAATTGTGGTACCTTTGTTGTTAATGACAGCTAGGTGTAATCCTTGAGAGAAGGATGCTAGAGTACATGTTACCTGTCTTTGCCTTTATTGTACTTTACTCCAAACTTCCACACAAGGAGCTCCGGTTTATAATTTTGGCAATTCCCATGCTGAACCTCTCTGCAGCAATTGCAGCTACAAGAATT
TACAACAACAGGAAGAAAACAATCTGGAAGTGGGCATACATTGGCATGATTGGCTCACTCTTTGCAAGTTTAGGATTCTCTATGATTATGAGTGCTGCTTCATATGCAAACTACCCAGCTGGCTATGCACTAGATGCTCTTCACCATAAAGACTTTAACAGAACTTCCAGCTGTGTGGTTCACATTGATTCAATGGCAGC
AATGAATGGTATTTCCCGCTTTTGTGAAAAGGATCTTCTTTGGAGGTATTCCAAGGAAGAACATATTTCTGATGAAGAAATCCTTGCCAAAAGTTTTACGTATCTGATCAATGAACGTTCAAGAATACCTGGCTTTAAATGCTTATTGGCTACCTCTGGATTTTCTAGGCTACTTGTTCAGCTCTCCTTCCCACCTGTTC
GCCTGTTAACTGAGCCCAAAGTTTTTGTCCATGGCAATATAAGAAGTGAAGGTATTGAAGATATAAGATGGCCTGGTTGTCCTTACTCCTAGCAGGAGAACCACACAGCTGTCAACTTATCCAATAATATTACTAGAGTTGAAGTGTTTAATCTTAATTGTCCAAGAATGGTATTCTTCCAGCATTGCAGTGGAAGATTG
CAATGCTTGAATCACATTTAAGGGTTATTCTTTTGTATATGGAACCCTGCCATATCTAAGCATAGGTGTTTTTTATCATAATAACATTTAATTTATTTTATTTTCACTGTGTTTAAATCATAGGCTGTATTGACATTTCCTGTATGGAAATTCAGACCATGTTTAAAATACGGTGAATATTCGGCATAGTTCAAATACGA
TACATTCAACAAATCCTTGGCCAAATTCTACTATGGCCACTTTATTTATTTATAAAAACACTCATTTAAAAAAACACATTTTGAATTTTTAATTAATTTCTACTACATTATCATGAG
>TRINITY_DN41866_c1_g2_i3 from sample A9 / Example unspliced isoform:TCTCCTTCCCACCTGTTCGCCTGgtatattattttggtttagccattgtttttcattatgatatttggtgaagtttaaagtccaaaatgtattaagcgttttgttgccacaccagtttagctcctaattgtttatgtttcttgtttacagTTAACTGAGCCCAAAGTTTTTGTCCATGGCAATATAAGAAGTGAAGGTAT
TGAAGATATAAGATGGCCTGGTTGTCCTTACTCCTAGCAGGAGAACCACACAGCTGTCAACTTATCCAATAATATTACTAGAGTTGAAGTGTTTAATCTTAATTGTCCAAGAATGGTATTCTTCCAGCATTGCAGTGGAAGATTGCAATGCTTGAATCACATTTAAGGGTTATTCTTTTGTATATGGAACCCTGCCATAT
CTAAGCATAGGTGTTTTTTATCATAATAACATTTAATTTATTTTATTTTCACTGTGTTTAAATCATAGGCTGTATTGACATTTCCTGTATGGAAATTCAGACCATGTTTAAAATACGGTGAATATTCGGCATAGTTCAAATACGATACATTCAACAAATCCTTGGCCAAATTCTACTATGGCCACTTTATTTATTTATAA
AAACACTCATTTAAAAAAACACATTTTGAATTTTTAATTAATTTCTACTACATTATCATGAG
Intron 3 GTATCTTCTT ... TGAATTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 66.42 | 8.3 | 1.7 | 16 |
| A2 | 34.39 | 11.7 | 0.3 | 6 |
| A3 | 77.75 | 5 | 3.7 | 16 |
| A4 | 63.09 | 7.3 | 0.7 | 12 |
| A5 | 71.45 | 4.7 | 3 | 11.7 |
| A6 | 0 | 4 | 0.3 | 0 |
| A7 | 38.89 | 5 | 0.3 | 3 |
| A8 | 27.08 | 13.7 | 0.3 | 5 |
| A9 | 60.28 | 5.7 | 0 | 7 |
| A10 | 27.78 | 2.7 | 0 | 1 |
>TRINITY_DN118921_c8_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformGAATGAAAGGCCTAAGCTTTGATCTGTCCAAAGAGCCTCAGACTACCAAGAAGATGAAGAGCTCCAGCGTGGAGACCAAATTGAGGCCTCTCAGATGGTGCTCTCAATTCTTTCTTTCCTTCACATTGACTCTCACCTCAGGCCTTATCCTCTGCTCATGCAAGTTCATTGCCTGTAGCTAGCCAGCCATCACAATGCTC
CAATAACTACGACTTCTTGGCAGGCAACTCATAGTTTGGATTGCCTGGGATATCCCAAATAAGGCGGGAATGCGCGCTTGGGCTTTCGGGGACAGGTAAGGAAAACATCCCATATGCATGTGAAGGAACACGATGGCTGATCTTTGCTTTTGTATATTACAGGGTGGATACCTCAGAAACAGAGGACATGAATGAATATC
TTCACGGACCTAATTGAGTAGTGCTTTGCCTCTCATGAGCATGAAATCCACTCTCTCTGGGAAAAACTACAGAGGAAGAAGAAACAGAGAGCAAGCGTCAAGTCTCGAAACCGATCAATCAGTTCTATGTTATAAGTATCAAGTCGCCACAGGTATCTTTTATCTCCGAAGGAAATCTTCTCCGGCAATAAATATTAAAC
ACGGCAATAAATATTAAACACAACAGTGGTTGTTCCATTGATATGGATGAGTTCGTTTTATTTTGCTTTTTTTATGTCTCTTGTTATTAACCAGCATAAATCCATCTTAAATCCAGATCTATCAAGCACCAAGAGGGATTAAATATCAAGCACCAAGGG
>TRINITY_DN118921_c8_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:GAATGAAAGGCCTAAGCTTTGATCTGTCCAAAGAGCCTCAGACTACCAAGAAGATGAAGAGCTCCAGCGTGGAGACCAAATTGAGGCCTCTCAGATGGTGCTCTCAATTCTTTCTTTCCTTCACATTGACTCTCACCTCAGGCCTTATCCTCTGCTCATGCAAGTTCATTGCCTGTAGCTAGCCAGCCATCACAATGCTC
CAATAACTACGACTTCTTGGCAGGCAACTCATAGTTTGGATTGCCTGGGATATCCCAAATAAGGCGGGAATGCGCGCTTGGGCTTTCGGGGACAGGTAAGGAAAACATCCCATATGCATGTGAAGGAACACGATGGCTGATCTTTGCTTTTGTATATTACAGGGTGGATACCTCAGAAACAGAGGACATGAATGAATATC
TTCACGGACCTAATTGAGTAGTGCTTTGCCTCTCATGAGCATGAAATCCACTCTCTCTGgtatcttcttaccctatgcttgttttttttttcagtttttaaaggcattatgaaatagggcagtgctggtttgcacatatgttgtctttattaggaagaatgctagtgtgcattcaatacagaaaatacaaaggtgggata
catatgatttgaaaatgcaaaggtgggatacaacatatgatgcgagatgaaagagtccacttaccatgtgcaaagcatcttagcatggcaaggaattcaaatattgatctctaattctaaattgaatttcagGGAAAAACTACAGAGGAAGAAGAAACAGAGAGCAAGCGTCAAGTCTCGAAACCGATCAATCAGTTCTA
TGTTATAAGTATCAAGTCGCCACAGGTACCTTTTATCTCTAAAGGAAATCTTCTCCGGCAATAAATATTAAACACGGCAATAAATATTAAACACAACAGTGGTTGTTCCATTGATATGGATGAGTTCGTTTTATTTTGCTTTTTTTATGTCTCTTGTTATTAACCAGCATAAATCCATCTTAAATCCAGATCTATCAAGC
ACCAAGAGGGATTAAATATCAAGCACCAAGGG